ORF6
ও. আর. এফ. 6 একটি জিন যা সার্স-কোভ এবং সার্স-কোভ-2 সহ সাবজেনাস সারবেকোভাইরাসের করোনভাইরাসগুলিতে একটি ভাইরাল আনুষঙ্গিক প্রোটিনকে এনকোড করে। এটি এম. ই. আর. এস-সি. ও. ভি-তে উপস্থিত নেই। এটি ইন্টারফেরন অ্যান্টাগোনিজমের মাধ্যমে ভাইরাল সংক্রমণের প্রতিরোধ ব্যবস্থার প্রতিক্রিয়া হ্রাস করে বলে মনে করা হয়। গঠন ও. আর. এফ. 6 প্রোটিন সারস-সি. ও. ভি-তে 63টি অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ এবং সারস-সি. ও. ভি-2-এ 61টিতে মোটামুটি ছোট। ও. আর. এফ. 6 ক্রমটি ভালভাবে সংরক্ষিত নয় এবং দুটি ভাইরাসের মধ্যে এটির তুলনামূলকভাবে কম ক্রমের পরিচয় প্রায় 66 শতাংশ। এটিতে একটি অ্যাম্ফিপ্যাথিক এন-টার্মিনাল আলফা হেলিক্স রয়েছে যা ঝিল্লির সাথে যুক্ত হয়, তবে এটি একটি ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন নয়। এর প্রায় 20-অবশিষ্টাংশের সি-টার্মিনাল লেজটি মেরু এবং সাইটোসোল পর্যন্ত প্রসারিত এবং এতে প্রোটিন পাচারের জন্য সংকেত ক্রম রয়েছে। অভিব্যক্তি এবং স্থানীয়করণ অন্যান্য আনুষঙ্গিক প্রোটিনের জিনের মতো, ও. আর. এফ. 6 জিনটি করোনভাইরাস আর. এন. এ জিনোমের 5 'প্রান্তে কাঠামোগত প্রোটিনগুলিকে এনকোড করার কাছাকাছি অবস্থিত। ও. আর. এফ. 7এ, ও. আর. এফ. 7বি এবং ও. আর. এফ. 8-এর পাশাপাশি ও. আর. এফ. 6 ঝিল্লি (এম) এবং নিউক্লিওক্যাপসিড (এন) জিনের মধ্যে অবস্থিত। এটি এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলাম এবং গলগি যন্ত্রের সাথে স্থানীয়করণ করা হয়েছে, SARS-CoV-2-এর গবেষণায় অটোফ্যাগোসোম এবং লাইসোসোমগুলির মতো ভেসিকলগুলির সাথেও সংযোগের ইঙ্গিত দেওয়া হয়েছে। ফাংশন ও. আর. এফ. 6 প্রোটিনের প্রাথমিক কাজটি ইমিউনোমডুলেশন এবং ইন্টারফেরন অ্যান্টাগোনিজম বলে মনে করা হয়। ভাইরাল প্রতিলিপির জন্য এটি অপরিহার্য নয়, যদিও এর অনুপস্থিতি প্রতিলিপির দক্ষতা হ্রাস করে বলে মনে হয়। সার্স-কোভ-এ ভাইরাল প্রোটিনের মিথস্ক্রিয়া অধ্যয়নের থেকে জানা যায় যে ওআরএফ6 প্রোটিন আরেকটি ভাইরাল আনুষঙ্গিক প্রোটিন, ওআরএফ9বি প্রোটিনের সাথে প্রোটিন-প্রোটিনের মিথস্ক্রিয়া প্রদর্শন করে। SARS-CoV-তে, তবে রিকম্বিনেন্ট মুরাইন হেপাটাইটিস ভাইরাসে নয়, ORF6 প্রোটিন ভাইরাসের মতো কণা এবং পরিপক্ক ভিরিওনে সনাক্ত করা হয়েছে, যা পরামর্শ দেয় যে এটি একটি ছোট ভাইরাল কাঠামোগত প্রোটিন হতে পারে। রোগ প্রতিরোধ ক্ষমতা প্রভাব SARS-CoV এবং SARS-CoV-2 উভয়ের থেকে ORF6 প্রোটিন একটি ইন্টারফেরন বিরোধী এবং রোগ প্রতিরোধ ক্ষমতা ফাঁকি দেওয়ার সাথে জড়িত বলে মনে করা হয়। পোষক কোষের প্রোটিনের সাথে বেশ কয়েকটি প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া এই প্রভাবের মধ্যস্থতা করার জন্য বর্ণনা করা হয়েছে। এটি ইন্টারফেরন সক্রিয়করণকে বাধা দিয়ে স্ট্যাট ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরের পারমাণবিক আমদানি রোধ করে বলে জানা গেছে। SARS-CoV রিপোর্টের গবেষণায় এটি ক্যারিওফেরিনের সাথে ORF6 প্রোটিনের বন্ধন দ্বারা মধ্যস্থতা করা যেতে পারে। SARS-CoV-2-এ, ORF6 প্রোটিনটি আর. এ. ই. 1 এবং এন. ইউ. পি. 98-এর সাথে মিথস্ক্রিয়া করে বলে জানা গেছে, যা ক্যারিওফেরিন মিথস্ক্রিয়াকে বাধা দেয়। তথ্যসূত্র করোনাভাইরাস প্রোটিন