TMEM211
ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন 211 (টিএমইএম211, bA9F11.1, কিউ6আইসিআই0, এলএইচএফএলপি7) হল এলএইচএফপিএল উপপরিবারের অধীনে একটি টেট্রাস্প্যান ঝিল্লি প্রোটিন। এটি প্রাথমিকভাবে শব্দের উপলব্ধিতে ভূমিকা পালন করে তবে ইনসুলিন সিগন্যালিংয়ে এর গৌণ ভূমিকা থাকতে পারে। এটি টি. এম. ই. এম. 211 জিন দ্বারা এনকোড করা হয় এবং প্রায় সমস্ত প্রাণীর মধ্যে পাওয়া যায়। অভিব্যক্তি এবং স্থানীয়করণ হিউম্যান টি. এম. ই. এম. 211 আর. এন. এ তুলনামূলকভাবে নিম্ন মাত্রায় প্রকাশিত হয়, তবে মস্তিষ্ক, পাকস্থলী, ফুসফুস, স্তন, ডিম্বাশয়, প্রস্টেট, শ্বাসনালী এবং লালা গ্রন্থিগুলির টিস্যুতে স্পষ্ট স্পাইক প্রদর্শন করে। ভ্রূণের মধ্যে, টি. এম. ই. এম. 211 আর. এন. এ আবার মস্তিষ্ক এবং পেটে প্রকাশিত হয়, তবে অন্ত্রেও প্রকাশিত হয়। টি. এম. ই. এম. 211 ত্বকে প্রকাশ করা হয়, সূর্য-উন্মুক্ত ত্বকের তুলনায় সূর্য-উন্মুক্ত ত্বকে উল্লেখযোগ্যভাবে বেশি পরিমাণে এবং ট্রিপল-নেগেটিভ স্তন ক্যান্সারে অতিরিক্তভাবে প্রকাশ করা হয়। সুস্থ কুকুরের টিস্যুগুলির একটি সংকলনে, টি. এম. ই. এম. 211 অগ্ন্যাশয়ে সর্বোচ্চ অভিব্যক্তি প্রদর্শন করেছে (চিত্র 1)। অগ্ন্যাশয়ের মধ্যে, টি. এম. ই. এম. 211 ল্যাঙ্গারহান দ্বীপপুঞ্জে অত্যন্ত পক্ষপাতদুষ্ট প্রাচুর্য প্রদর্শন করে এবং অন্যান্য অগ্ন্যাশয়ের টিস্যু থেকে অনুপস্থিত (চিত্র 2)। টি. এম. ই. এম. 211 তার চারটি ট্রান্সমেম্ব্রেন হেলিসেসের ফলে প্লাজমা ঝিল্লিতে স্থানীয়করণ করা হয়। জরায়ু, ডিম্বাশয় এবং বুকের দুধে প্রোটিনের স্থানীয়করণ সত্ত্বেও, মেনোপজ মহিলাদের কাছে এস্ট্র্যাডিওলের মৌখিক প্রয়োগ টি. এম. ই. এম. 211 অভিব্যক্তির স্তরে উল্লেখযোগ্য পরিবর্তন আনে না। তবে, এটি নমুনার মধ্যে টি. এম. ই. এম. 211-এর পরিবর্তনশীলতা উল্লেখযোগ্যভাবে হ্রাস করেছে, যা ইঙ্গিত করে যে এস্ট্রোজেন টি. এম. ই. এম. 211-এর উপর একটি নিয়ন্ত্রণকারী প্রভাব প্রয়োগ করে, সম্ভবত একটি পরোক্ষ পদ্ধতির মাধ্যমে (চিত্র 3)। টি. এম. ই. এম. 211 স্থূল ব্যক্তিদের মধ্যে উচ্চ মাত্রায় প্রকাশ করা হয়েছে (চিত্র 4)। এই ফলাফলটি এই অনুসন্ধানের দ্বারা ব্যাখ্যা করা যেতে পারে যে স্থূলতা, বিশেষত অ-ডায়াবেটিক স্থূলতা, ল্যাঙ্গারহান দ্বীপপুঞ্জের আয়তন এবং সংখ্যা উভয়ের বৃদ্ধির সাথে সম্পর্কযুক্ত। আলঝেইমারের রোগীরাও একইভাবে অ-আলঝেইমারের ব্যক্তিদের তুলনায় উচ্চতর টি. এম. ই. এম211 অভিব্যক্তি প্রদর্শন করেছিলেন, যেমন পুরুষদের তুলনায় মহিলারা করেছিলেন (চিত্র 5)। অনুবাদ এবং সমরূপ চিত্র 6 টি. এম. ই. এম. 211 মানব প্রোটিন ক্রমের আগ্রহের নির্বাচিত অঞ্চলগুলি প্রদর্শন করে। সবচেয়ে উল্লেখযোগ্যভাবে, এটি ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চল এবং এক্সন সীমানার অবস্থান এবং উপস্থিতি দেখায়। আর. এন. এ প্রতিলিপি চারটি এক্সন দিয়ে তৈরি, তবে এই এক্সনগুলির মধ্যে মাত্র দুটিতে কোডিং সিকোয়েন্স রয়েছে। অনন্যভাবে, প্রোটিনের দুটি স্টার্ট কোডন রয়েছে, যা উভয়ই অনুবাদ শুরু করতে পারে এবং প্রোটিন পণ্যের দিকে নিয়ে যেতে পারে। এটি টি. এম. ই. এম. 211 আইসোফর্মের প্রধান কারণ। অর্থোলগ স্পেস টি. এম. ই. এম. 211 বেশিরভাগ প্রাণী প্রজাতিতে উপস্থিত রয়েছে, তবে প্রাণীদের বাইরে বিদ্যমান নেই (চিত্র 7)। জীবের প্রাচীনতম গোষ্ঠী যেখানে জিনটি সর্বব্যাপী পাওয়া যায় তা হল অ্যানিমোন, যা 824 মিলিয়ন বছর আগে মানুষের থেকে বিচ্ছিন্ন হয়েছিল। জিনটি 934 মিলিয়ন বছর আগে বিচ্ছিন্ন হওয়া জীবের মধ্যে পাওয়া যায় না, যা ইঙ্গিত করে যে জিনটি 824 থেকে 934 মিলিয়ন বছরের মধ্যে পুরানো। বিবর্তনের পরে, জিনটি মাছ, উভচর, সরীসৃপ, পাখি এবং স্তন্যপায়ী প্রাণীদের মধ্যে পাওয়া যায়। যাইহোক, একটি ভিন্ন প্যাটার্ন সহ একটি ক্লেড রয়েছে, আর্থ্রোপড। জিনটি সহজেই ক্রাস্টাসিয়ানদের মধ্যে পাওয়া যায়, তবে অন্যান্য সমস্ত আর্থ্রোপড থেকে অনুপস্থিত। অজানা কারণে, সামুদ্রিক আর্থ্রোপডরা টি. এম. ই. এম. 211 জিন বজায় রাখে এবং স্থলজ আর্থ্রোপডরা এটি হারিয়ে ফেলে। এর একটি সম্ভাব্য ব্যতিক্রম রয়েছে, সাদা প্রজাপতি পরজীবী। মানুষের টি. এম. ই. এম. 211 অনুসন্ধানের সময় এই জিনটি বি. এল. এ. এস. টি দ্বারা পাওয়া যায় এবং হোয়াইট বাটারফ্লাই প্যারাসাইটের টি. এম. ই. এম. 211 সিকোয়েন্স অনুসন্ধানের ফলে অন্যান্য পরজীবী বাম্পের ফলাফল পাওয়া যায়, যা ইঙ্গিত করে যে এটি সম্ভবত একটি সিকোয়েন্সিং বা দূষণ ত্রুটি ছিল না। এই ছোট ক্লেডটি সম্ভবত জিনটি সংরক্ষণ করেছে এবং বাকি স্থলজ আর্থ্রোপডগুলি এটি হারিয়েছে। যাইহোক, এই ক্লেডের মধ্যে পাওয়া টি. এম. ই. এম. 211 জিনগুলি মানুষের থেকে একই পূর্বপুরুষের দূরত্ব সহ অন্যান্য জীবের তুলনায় উল্লেখযোগ্যভাবে কম অনুরূপ। যদিও জিনটি একটি অর্থোলগ হতে পারে, এটি এই বাম্প গোষ্ঠীর জন্য একটি নতুন ফাংশনও পরিবেশন করতে পারে, যে কারণে এই ক্লেডটি জিনটি ধরে রেখেছিল এবং অন্যান্য পোকামাকড় এটি হারিয়েছিল। এটি উচ্চ শতাংশের বিচ্যুতিকেও ব্যাখ্যা করবে। একইভাবে, এটি সম্ভব যে এই গোষ্ঠীটি জিনটি প্রকাশ করে না, যার অর্থ হবে যে কোনও বিবর্তনীয় শক্তি তার রূপান্তরের বিরুদ্ধে কাজ করে না, এটি এমন জীবের তুলনায় দ্রুত পরিবর্তন করতে দেয় যেখানে জিনটি অবশ্যই একটি কার্যকরী প্রোটিনের জন্য একটি টেমপ্লেট হিসাবে কাজ করবে। পরিশেষে, এটি প্রমাণিত হয়েছে যে শুঁয়োপোকা প্রজাতি যা এই বাম্পের গোষ্ঠী শিকার করে একটি এনটোমোপ্যাথোজেনিক প্রতিরক্ষা ব্যবস্থা ব্যবহার করে। এই ভাইরাসটি শুঁয়োপোকাটিকে অসুস্থতা সৃষ্টি করে না, তবে বাম্পের ডিম এবং বাম্পের লার্ভা সংক্রামিত করে এবং অনুভূমিক জিন স্থানান্তরের কারণ হিসাবে দেখানো হয়েছে। এটি সহজেই যুক্তিসঙ্গত যে টি. এম. ই. এম. 211 জিনটি এই ভাইরাসগুলির মধ্যে একটি দ্বারা বাম্পের এই উপসেটকে দেওয়া হয়েছিল। তারপর, যেহেতু জিনটি জিনোমে কৃত্রিমভাবে তৈরি করা হয়েছিল এবং এটি কোনও প্রকৃত উদ্দেশ্য সাধন করে না, তাই এটি অবাধে পরিবর্তিত হয়, যা পর্যবেক্ষণকৃত বিচ্যুতির দিকে পরিচালিত করে যা প্রত্যাশার চেয়ে বেশি। এই ব্যাখ্যাটি এই সত্য দ্বারা সমর্থিত যে প্রোটিনের দুটি অংশকে পৃথক করে এমন ইন্ট্রন অনুপস্থিত। বিকল্পভাবে, ব্লাস্ট ফলাফল বিভ্রান্তিকর হতে পারে, এবং যা টি. এম. ই. এম. 211 হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছে তা আসলে প্যারালগাস এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের সদস্য, যা বাম্প এবং শুঁয়োপোকা উভয় ক্ষেত্রেই পাওয়া যায় বলে জানা যায়, এবং টি. এম. ই. এম. 211 ইন্ট্রন ভাগ করে না এমন সদস্যদের অন্তর্ভুক্ত করে। ক্রম বিন্যাস দূরবর্তী অর্থোলগের এম. এস. এ বেশ কয়েকটি সংরক্ষিত অঞ্চল তুলে ধরে (চিত্র 8)। যাইহোক, মানুষের জিন এই সংরক্ষণের বেশিরভাগ অংশ গ্রহণ করে না, অন্য স্তন্যপায়ী প্রাণীরাও করে না। এটি বুকের দুধে প্রোটিনের উপস্থিতির সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ; অ-স্তন্যপায়ী প্রজাতির বুকের দুধ নেই, এবং এইভাবে স্তন্যপায়ী এবং অ-স্তন্যপায়ীদের মধ্যে প্রোটিনের সামান্য ভিন্ন কার্যকারিতা থাকতে পারে। প্রোটিনের বেশিরভাগ পরিচয় যা মিলে যায় তা ছড়িয়ে ছিটিয়ে দেখা যায়, তবে সর্বোচ্চ সংরক্ষণের একটি স্পষ্ট অঞ্চল রয়েছে। মানুষের মধ্যে, এই অঞ্চলটি অ্যামিনো অ্যাসিড 132-150 বিস্তৃত। মানুষের দ্বারা ভাগ করা উচ্চ সংরক্ষণ সহ অন্য দুটি অঞ্চল অ্যামিনো অ্যাসিড 59-71 এবং 110-117 বিস্তৃত। সমস্ত প্রজাতি জুড়ে সম্পূর্ণ সংরক্ষণ সহ মাত্র ছয়টি অ্যামিনো অ্যাসিড রয়েছে, সিস27, গ্লাই 65, জিএলএন100, প্রো115, সিস127, সিস138। সম্পূর্ণরূপে সংরক্ষিত অ্যামিনো অ্যাসিডের অর্ধেক হল সিস্টিন, সুতরাং সিস্টিনের সালফহাইড্রিল গ্রুপ এবং ডাইসালফাইড ব্রিজ এবং সমযোজী বন্ধন গঠনের ক্ষমতা প্রোটিনের কাঠামো এবং/অথবা কার্যকারিতার জন্য গুরুত্বপূর্ণ হতে পারে। সামগ্রিকভাবে, মানুষের ক্রমের ক্ষেত্রে সর্বোচ্চ সংরক্ষণ সহ অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি হল টাইরোসিন (81 শতাংশ) এবং ট্রিপ্টোফান (72 শতাংশ)। এই দুটি অ্যামিনো অ্যাসিড ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিনের জন্য অত্যাবশ্যক কারণ তারা কোষের ভিতরে বা বাইরে হাইড্রোফোবিক ঝিল্লি এবং জলীয় পরিবেশ উভয়ের সাথেই যোগাযোগ করতে পারে এবং এইভাবে, এটি যৌক্তিক যে এই অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি অত্যন্ত সংরক্ষিত। স্তন্যপায়ী প্রাণীদের সারিবদ্ধকরণের দিকে তাকালে, বেশিরভাগ প্রোটিন সংরক্ষিত থাকে (চিত্র 9)। প্রকৃতপক্ষে, প্রতিটি প্রোটিন যা সম্পূর্ণরূপে অসংরক্ষিত থাকে তা ঝিল্লির মধ্যে এম্বেড করা থাকে, যেখানে সঠিক পরিচয় সম্ভবত প্রোটিনের কার্যকারিতার জন্য কম গুরুত্বপূর্ণ। এই প্যাটার্নটি অর্থোলোগের বিস্তৃত এম. এস. এ-তে সত্য, যেখানে ন্যূনতম সংরক্ষণের অঞ্চলগুলি বেশিরভাগই ঝিল্লির ভিতরে থাকে। এই সংরক্ষণ বজায় রাখার সময়, টি. এম. ই. এম. 211 বিবর্তিত হয়েছে এবং এটি বহনকারী জীবের সাথে পরিবর্তিত হয়েছে। প্রতিটি জীবের জিনের বিচ্যুতি স্বাভাবিক ফাইলোজেনি অনুসরণ করে (চিত্র 10)। সংরক্ষিত অঞ্চল এমন প্রমাণ রয়েছে যা পরামর্শ দেয় যে ট্রান্সমেম্ব্রেন বিভাগগুলি প্রোটিনের অন্যান্য অংশের তুলনায় কম পরিমাণে সংরক্ষিত থাকে, এই অঞ্চলের মধ্যে ছোট, অ-মেরু অ্যামিনো অ্যাসিডের ঘন ঘন অদলবদল দ্বারা সমর্থিত একটি ধারণা। এই অনুমানটি পরীক্ষা করার জন্য, প্রোটিনের মধ্যে প্রতিটি অবস্থানের জন্য শ্যানন ভেরিয়েবিলিটি বিট গণনা করা হয়েছিল (চিত্র 11)। যদিও এই পারস্পরিক সম্পর্কটি প্রকৃতপক্ষে পর্যবেক্ষণ করা হয়, তবে সম্পর্কটি চূড়ান্ত হওয়ার পক্ষে যথেষ্ট নয়। শ্যানন বিট ব্যবহার করে, চিত্র 12 টীকা দেওয়া ধারণাগত অনুবাদকে একটি টীকা দেওয়া উপস্থাপনায় রূপান্তরিত করে যা ত্রিমাত্রিক স্থানে সংরক্ষিত অঞ্চল এবং অ্যামিনো অ্যাসিডের সান্নিধ্যকে আরও ভালভাবে তুলে ধরে। প্রথম এবং তৃতীয় সংরক্ষিত অঞ্চলগুলি প্রোটিনের বহির্মুখী দিকে একে অপরের সংলগ্ন অবস্থিত, সম্ভবত একটি সক্রিয় স্থান তৈরি করে। ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেনের অভিযোজন বেশ কয়েকটি সিস্টিনকে কাছাকাছি নিয়ে আসে, যার ফলে তারা ডাইসালফাইড সেতু তৈরি করতে পারে। প্যারালগস মানব জিনোমের মধ্যে মানব টি. এম. ই. এম. 211 ক্রমের একটি ব্লাস্ট অনুসন্ধান কোনও ফলাফল দেয় না। এটি ইঙ্গিত করে বলে মনে হয় যে মানুষের কোনও সমতুল্য নেই। যাইহোক, প্রশ্ন হিসাবে অ-স্তন্যপায়ী টি. এম. ই. এম. 211 ক্রম জমা দেওয়া হোমো স্যাপিয়েন্স লিপোমা উচ্চ-গতিশীলতা গ্রুপ আই সি প্রোটিন ফিউশন অংশীদার-মত টেট্রাস্প্যান উপপরিবারের সদস্য 3 প্রোটিন আইসোফর্ম 2 (এল. এইচ. এফ. পি. এল. 3) প্রদান করে। উপরন্তু, অ-স্তন্যপায়ী টি. এম. ই. এম. 211 ক্রমের ব্লাস্ট প্রশ্নগুলি সেই জীবের জিনোমের মধ্যে অনুসন্ধান করে এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের মধ্যে অসংখ্য ফলাফল প্রদান করে। এই প্রোটিনটি টি. এম. ই. এম. 211-এর অনুরূপ কারণ এটি একটি টেট্রাস্প্যান মেমব্রেন প্রোটিন। এই চারটি ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চল উচ্চ সাদৃশ্যের কারণ কিনা তা মূল্যায়নের জন্য, মানব টি. এম. ই. এম211 এবং মানব এল. এইচ. এফ. পি. এল3-এর মধ্যে একটি বিশ্বব্যাপী প্রান্তিককরণ তৈরি করা হয়েছিল (চিত্র 13)। সাদৃশ্যটি ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চলে সীমাবদ্ধ বলে মনে হয় না, যা ইঙ্গিত করে যে এই দুটি প্রোটিন সমতুল্য হতে পারে। উপরন্তু, টি. এম. ই. এম211 অর্থোলগে সম্পূর্ণরূপে সংরক্ষিত 6টি অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে 4টি টি. এম. ই. এম211 এবং এল. এইচ. এফ. পি. এল3-এর মধ্যে সারিবদ্ধ করা হয়, যা প্রমাণ করে যে এই প্রোটিনগুলি প্যারালগ (পি <. 01)। এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের পরিচিত কার্যকারিতা রয়েছে; পরিবারের সদস্যরা মস্তিষ্কে প্রোটিন বন্ধনকে সহায়তা করে এবং শব্দের উপলব্ধির জন্য গুরুত্বপূর্ণ। এই পরিবারের সদস্যদের নকআউট বা ফাংশন মিউটেশন হারানো মানুষ এবং ইঁদুরের মধ্যে সম্পূর্ণ বা আংশিক বধিরতা সৃষ্টি করে যা পরে একটি অটোসোমাল রিসেসিভ প্যাটার্নে উত্তরাধিকারসূত্রে পাওয়া যায়। এল. এইচ. এফ. পি. এল-এর অন্যান্য রূপান্তরগুলি টিউমার, অটিজম, আলঝেইমার এবং অন্যান্য স্নায়বিক অবস্থার সাথে যুক্ত করা হয়েছে। টি. এম. ই. এম. 211-এ সংরক্ষিত সিস্টিনের অবশিষ্টাংশ ইঙ্গিত দেয় যে এটি টি. এম. ই. এম. 211-এর জন্যও একটি সম্ভাব্য কাজ হতে পারে। সংরক্ষিত অঞ্চলগুলি যা ত্রিমাত্রিক স্থানে সারিবদ্ধ হয় তা একটি বাঁধাই সাইট গঠন করতে পারে যা সংরক্ষিত সিস্টাইন অবশিষ্টাংশগুলি ব্যবহার করে স্তরগুলি সনাক্ত এবং বাঁধতে পারে। টি. এম. ই. এম. 211-এর মতো, এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের সদস্যরা মস্তিষ্ক এবং লালা গ্রন্থিগুলিতে পক্ষপাতদুষ্ট অভিব্যক্তি দেখায়। এল. এইচ. এফ. পি. এল অগ্ন্যাশয়ে প্রকাশ করা হয়নি, তবে পূর্বোক্ত আলোচনা অনুসারে, অগ্ন্যাশয়ের নমুনা থেকে ল্যাঙ্গারহানসের দ্বীপপুঞ্জ বাদ দিলে এই ফলাফল পাওয়া যাবে। টি. এম. ই. এম. 211-এর মতো এল. এইচ. এফ. পি. এল আর. এন. এ, জিআই ট্র্যাক্ট, কিডনি, প্রস্টেট, থাইরয়েড এবং যৌন অঙ্গগুলির নিম্ন স্তরে উপস্থিত ছিল। টি. এম. ই. এম. 211-এর তুলনায় এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের সদস্যদের নিয়ে বেশি গবেষণা করা হয়েছে এবং প্রোটিনের প্রাচুর্য তথ্য দেখায় যে এল. এইচ. এফ. পি. এল. 2 বাদে পরিবারের প্রতিটি সদস্য মস্তিষ্কের সুস্থ টিস্যুতে তার সর্বোচ্চ প্রাচুর্য স্তর প্রদর্শন করে। মস্তিষ্কের অন্যান্য প্রোটিনের তুলনায় মস্তিষ্কের টিস্যুতে এখনও উচ্চ ঘনত্বে পাওয়া গেলেও, এল. এইচ. এফ. পি. এল. 2 প্লেটলেটের প্রাচুর্য প্রদর্শন করে যা প্লেটলেট প্রোটিনের শীর্ষ 10 শতাংশের মধ্যে 60 গুণ বেশি। টি. এম. ই. এম211-এর মতো পরিবারের প্রতিটি সদস্য ফুসফুসের ক্যান্সার কোষের লাইনে প্রচুর পরিমাণে প্রদর্শন করেছিলেন। এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের বেশ কয়েকজন সদস্যকে বুকের দুধেও পাওয়া গেছে, তবে টি. এম. ই. এম211-এর তুলনায় অনেক কম পরিমাণে। শ্রবণ এবং শব্দ উপলব্ধির সাথে সম্পর্ক থাকা সত্ত্বেও, টি. এম. ই. এম. 211 বা এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের কোনও সদস্যই থ্যালামাস, টেম্পোরাল লোব বা শ্রবণ কর্টেক্সের প্রতি পক্ষপাতদুষ্ট স্থানীয়করণের একটি প্যাটার্ন দেখায় না। ফাইব্রিনোজেন আলফা একটি দ্রুত বিবর্তিত প্রোটিন হিসাবে বোঝা যায়, অন্যদিকে সাইটোক্রোম সি ধীরে ধীরে বিবর্তিত প্রোটিনের একটি মডেল। টি. এম. ই. এম. 211-এর সংশোধিত বিচ্যুতির জন্য রৈখিক প্রবণতা রেখা সাইটোক্রোম সি-এর তুলনায় ফাইব্রিনোজেন আলফা চেইনের কাছাকাছি (চিত্র 14)। তথ্যের দিকে তাকালে, টি. এম. ই. এম. 211 এবং ফাইব্রিনোজেন আলফা চেইন গত 400 মিলিয়ন বছর ধরে প্রায় একই হারে বিচ্ছিন্ন হয়েছে। সুতরাং, টি. এম. ই. এম. 211 একটি দ্রুত পরিবর্তনশীল প্রোটিনও। এটি আগে দেখা নিদর্শনগুলির কারণে হতে পারে, যেখানে ঝিল্লির অভ্যন্তরে প্রোটিনের অংশগুলিকে খুব স্বাধীনভাবে পরিবর্তন করতে দেওয়া হয়। এটিও সম্ভব যে 200 মিলিয়ন বছর আগে প্রথম স্তন্যপায়ী প্রাণীর উত্থানের সাথে সাথে বিচ্যুতি ত্বরান্বিত হয়েছিল, ধরে নেওয়া যায় যে বুকের দুধে প্রোটিনের অস্তিত্ব বিভিন্ন কার্যকারিতার ইঙ্গিত দেয়। পরিশেষে, মানুষের এল. এইচ. এফ. পি. এল3 জিনটি মানুষের টি. এম. ই. এম211-এর সাথে <আই. ডি1> পরিচয় ভাগ করে নেয়, যা <আই. ডি2>-এর একটি সংশোধিত বিচ্যুতির সাথে মিলে যায়। এই বিচ্যুতি টি. এম. ই. এম. 211 জিন ভাগ করে নেওয়ার জন্য সবচেয়ে দূরবর্তী মানব পূর্বপুরুষ অ্যানিমোনগুলির সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ, এমন কিছু যা প্রত্যাশিত হবে যদি দুটি জিন একই পূর্বপুরুষের জিন থেকে জন্ম নেওয়া প্যারালগ হয়। এল. এইচ. এফ. পি. এল-এর বিচ্যুতির তারিখের পূর্বাভাস দেওয়ার জন্য ট্রেন্ডলাইন ব্যবহার করার ফলে <আই. ডি1> মায়ার (95 শতাংশ আত্মবিশ্বাসের ব্যবধান) অনুমান করা হয়। এটি মিলিয়ন বছর আগে টি. এম. ই. এম. 211 জিনের উত্থানের আনুমানিক পরিসরকে ওভারল্যাপ করে, এই ধারণাকে সমর্থন করে যে দুটি সমান্তরাল। ট্রান্সক্রিপশন প্রোমোটার টিএমইএম211 জিএক্সপি _ 6044388 প্রোমোটারের নিয়ন্ত্রণে রয়েছে বলে বোঝা যায় (চিত্র 15)। জিএক্সপি _ 6044388 প্রবর্তক প্রজাতি জুড়ে ব্যাপকভাবে পাওয়া যায় এবং সংরক্ষণের স্বতন্ত্র অঞ্চলগুলি বজায় রাখে (চিত্র 16)। মানুষের মধ্যে, এই প্রবর্তক এবং টি. এম. ই. এম. 211 আর. এন. এ প্রতিলিপির প্রথম এক্সনের মধ্যে একটি 40 বেস জোড়া ওভারল্যাপ রয়েছে, যদিও এই এক্সন সরাসরি ফলস্বরূপ প্রোটিন ক্রমে অবদান রাখে না। টি. এম. ই. এম. 211 ছাড়া অন্য কোনও কিছুর অভিব্যক্তি প্রভাবিত করার জন্য প্রবর্তক অন্যান্য জিনের কাছাকাছি উপস্থিত হয় না। এই প্রবর্তক ক্রমের জন্য অর্থোলগগুলি বহু প্রজাতির টি. এম. ই. এম. 211 অর্থোলগের আগে পাওয়া যায়। ক্রোমোজোম 5,6,7,13,14,15,16,17,18,19,20 এবং Y-তে পাওয়া GXP _ 6044388 প্রবর্তক অনুক্রমের সাথে উচ্চ ভাগ করা পরিচয়ের ক্রম রয়েছে, যদিও এই ক্রমগুলির মধ্যে অনেকগুলি অন্যান্য জিনের কাছাকাছি অবস্থিত নয় এবং প্রকাশ করা নাও হতে পারে। মজার বিষয় হল, জিএক্সপি _ 6044388 এলএইচএফপিএল পরিবারের সদস্যদের 6 জন প্রবর্তকের সাথে গড় 43.83% পরিচয় ভাগ করে নেয়। এই যৌথ পরিচয়টি এই উপসংহারে পৌঁছানোর জন্য যথেষ্ট যে এই প্রোমোটাররা সমধর্মী। ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর FEZF1.02 এবং VDR_RXR.03 টি. এম. ই. এম. 211 জিন অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করতে পারে। FEZF1.02 একটি সম্ভাব্য প্রার্থী হিসাবে নির্বাচিত হয়েছিল কারণ এটি মস্তিষ্কের জন্য নির্দিষ্ট হওয়ার একমাত্র চিহ্নিত সম্ভাব্য প্রতিলিপি ফ্যাক্টর ছিল, যেখানে টিএমইএম211 অভিব্যক্তির অন্যান্য সাইটের তুলনায় উচ্চ পরিমাণে প্রকাশ করা হয় বলে জানা যায়। FEZF1.02 প্রতিলিপি বৃদ্ধি করে এবং VDR_RXR.03 এর বিপরীতে আবদ্ধ হয়, যা একটি হেটেরোডাইমার প্রতিলিপি সহ-সক্রিয়কারী যা ক্যালসিট্রিয়লের উপর নির্ভরশীল। ক্যালসিট্রিয়ল হল ভিটামিন ডি-এর একটি রূপ যা সূর্যালোকের প্রতিক্রিয়ায় ত্বকে আংশিকভাবে উৎপাদিত হয়, যা সূর্য-উন্মুক্ত ত্বকের তুলনায় সূর্য-উন্মুক্ত ত্বকে টি. এম. ই. এম. 211-এর উচ্চতর অভিব্যক্তি ব্যাখ্যা করবে। উপরন্তু, ক্যাল্সিট্রিয়াল উৎপাদনের প্রধান স্থান হল কিডনি, যা থাইরয়েড গ্রন্থিকে সংকেত করে এমন একটি হরমোন হিসাবে ব্যবহার করা হয় এবং এই উভয় অবস্থানই টি. এম. ই. এম. 211 অভিব্যক্তির সর্বোচ্চ ক্ষেত্রগুলির মধ্যে ছিল। বুকের দুধে স্তন্যদানকারী মায়েদের কাছ থেকেও ক্যালসিট্রিয়ল প্রেরণ করা হয়। উপরন্তু, ইস্ট্রোজেনের মৌখিক প্রয়োগ খাওয়া ক্যালসিট্রিয়লের জৈব প্রাপ্যতা বৃদ্ধি করে এবং সঞ্চালনে উচ্চ মাত্রার ক্যালসিট্রিয়লের দিকে পরিচালিত করে। সুতরাং, VDR_RXR.03 টিএমইএম211 অভিব্যক্তির উপর মৌখিক ইস্ট্রোজেন প্রশাসনের প্রভাব ব্যাখ্যা করতে পারে। ক্যালসিট্রিয়ল এমন একটি অণু যা সঠিক কার্যকারিতার জন্য ফুসফুসের উপর নির্ভর করে। অবশেষে, টি. এম. ই. এম. 211 অগ্ন্যাশয়ের টিস্যুতে ল্যাঙ্গারহান দ্বীপপুঞ্জের স্থানীয়করণের একটি চরম প্যাটার্ন প্রদর্শন করে। অগ্ন্যাশয়ের বিটা কোষগুলি ক্যাল্সিট্রিয়াল সিগন্যালিংয়ে অংশ নেয় বলে জানা যায়, যা ল্যাঙ্গারহ্যান দ্বীপপুঞ্জ থেকে ইনসুলিন নিঃসরণ বৃদ্ধি এবং কোষীয় চাপের বিরুদ্ধে প্রতিরোধের সাথে সাড়া দেয়। সামগ্রিকভাবে, VDR_RXR.03 এককভাবে অধিকাংশ TMEM211 অভিব্যক্তি এবং স্থানীয়করণ ব্যাখ্যা করতে পারে। এটিও আগ্রহের বিষয় যে ক্যালসিট্রিয়াল চিকিত্সা এল. এইচ. এফ. পি. এল আর. এন. এ-র অভিব্যক্তি বৃদ্ধি করতে দেখা গেছে। এম. আর. এন. এ টি. এম. ই. এম. 211-এর 5 'ইউ. টি. আর কোডিং সিকোয়েন্সের তুলনায় কম পরিমাণে সংরক্ষিত রয়েছে (চিত্র 17)। 3 'ইউটিআর মোটেও সংরক্ষিত নয়, এতটাই যে ব্লাস্ট অন্যান্য অর্থোলোগাস সিকোয়েন্স সনাক্ত করতে পারে না। এর কারণ হতে পারে 3 'ইউটিআর তাপগতিবিদ্যার দিক থেকে অনুকূল নয় এবং প্রতিটি প্রজাতির মধ্যে অনেক সম্ভাব্য গঠন রয়েছে। সুতরাং, নোটের একমাত্র কাঠামোগত উপাদানগুলি 5 'ইউটিআর-এ উপস্থিত রয়েছে। এম. আর. এন. এ-তে একটি স্থিতিশীল, অত্যন্ত সংরক্ষিত স্টেম-লুপ উপস্থিত রয়েছে যা অনুবাদের শুরুর কাছাকাছি অবস্থিত যা স্টেরিকভাবে অনুবাদকে বাধা দিতে পারে, বা, বিপরীতভাবে, দীক্ষা কারণ বা পরিবহন প্রোটিন দ্বারা স্বীকৃত হতে পারে (চিত্র 18, বামে)। একটি কাঠামোগত উপাদান রয়েছে যা ক্রম এবং কাঠামো উভয় ক্ষেত্রেই অর্থোলগ জুড়ে সংরক্ষিত, সংলগ্ন, অত্যন্ত স্থিতিশীল স্টেম-লুপগুলির একটি জোড়া (চিত্র 18, মাঝখানে)। এই কাঠামোটি রৈখিক ক্রম বরাবর অন্যান্য স্থান থেকে অনেক দূরে অবস্থিত, তবে পরিবহন প্রোটিন বা সংকেত পথ দ্বারা স্বীকৃত হতে পারে। পরিশেষে, 5 'ইউটিআর-এর 5' প্রান্তে একটি কম স্থিতিশীল স্টেম-লুপ উপস্থিত রয়েছে (চিত্র 18, ডানদিকে)। যদিও এই স্টেম-লুপ অন্যান্য কাঠামোগত উপাদানগুলির তুলনায় কম স্থিতিশীল, লুপের ক্রম এবং কাঠামো নিজেই স্টেম থেকে বেরিয়ে আসা সাইটোসিন সহ অর্থোলোগ জুড়ে সম্পূর্ণরূপে সংরক্ষিত থাকে। এর থেকে বোঝা যায় যে এই কাঠামোটি কিছু প্রোটিন দ্বারা স্বীকৃত এবং আবদ্ধ, যেখানে স্টেম বরাবর বেস-পেয়ারিংয়ের নিম্ন স্তরটি কাঠামোটিকে সহজেই পূর্বাবস্থায় ফিরিয়ে আনতে এবং এমআরএনএকে প্রোটিনের সাথে আবদ্ধ থাকতে দেয়। প্রকৃতপক্ষে, সংরক্ষিত এবং উন্মুক্ত লুপটি MEIS1.01 দ্বারা একটি বাঁধাই সাইট হিসাবে স্বীকৃত, যা স্নায়বিক ক্রেস্ট বিকাশ এবং স্নায়বিক পার্থক্যের সাথে জড়িত একটি হোমিওবক্স প্রোটিন। উপরন্তু, এম. ই. আই. এস1-এর ঘাটতি ইঁদুরের শ্রবণশক্তি হ্রাস করে, যা এল. এইচ. এফ. পি. এল প্যারালগগুলি কার্যকারিতা হারানোর সময়ও দেখা যায়। কাঠামো অভ্যন্তরীণ পুনরাবৃত্তি টি. এম. ই. এম211-এর মধ্যে শুধুমাত্র দুটি স্থানীয় সারিবদ্ধকরণ রয়েছে যা ইতিবাচক স্কোর তৈরি করে (চিত্র 19)। এই সারিবদ্ধকরণগুলির কোনওটিই চিত্তাকর্ষকভাবে অনুরূপ নয় এবং সম্ভবত এলোমেলো সুযোগের ফলাফল। এই বরখাস্তটি এই সত্য দ্বারা সমর্থিত যে এই পুনরাবৃত্তির কোনওটিই অন্যান্য প্রাণীদের মধ্যে সংরক্ষিত নয়। গঠন মানব টি. এম. ই. এম. 211-এর আণবিক ওজন 20.4 কে. ডি এবং একটি আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দু 9.64। এই মেগাওয়াট গড় মানব প্রোটিনের চেয়ে ছোট, যেখানে পি. আই মানুষের প্রোটিনের গড় পি. আই-এর (6.5) তুলনায় অনেক বেশি, তবে এখনও একটি ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিনের জন্য স্বাভাবিক সীমার মধ্যে রয়েছে। এই উচ্চতর পি. আই থাকা সত্ত্বেও কোনও ক্লাস্টার অফ চার্জ নেই। প্রোটিন ক্রমটি তার অ্যামিনো অ্যাসিড গঠনে গড় মানব প্রোটিন থেকে উল্লেখযোগ্যভাবে বিচ্যুত হয় না (চিত্র 20)। মানব টি. এম. ই. এম. 211 প্রোটিন ক্রমটি কাঠামোগত উপাদান, ডোমেন এবং স্থানীয়করণের তথ্যের সন্ধানের জন্য বেশ কয়েকটি সফ্টওয়্যার দ্বারা বিশ্লেষণ করা হয়েছে। চারটি ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেনের উপস্থিতি পি. এস. ও. আর. টি 2, ইউক্যারিওটিক লিনিয়ার মোটিফ এবং ইন্টারপ্রো দ্বারা নিশ্চিত করা হয়েছিল। এই সফ্টওয়্যারগুলি ঝিল্লির মধ্যে প্রোটিনের অভিযোজন এবং এর স্থানীয়করণকেও নিশ্চিত করেছে। উপরন্তু, পি. এস. ও. আর. টি II এবং পি. আর. ও. এস. আই. টি. ই 56তম অবস্থান থেকে শুরু করে একটি লিউসিন জিপার প্যাটার্ন চিহ্নিত করেছে। সবচেয়ে উল্লেখযোগ্যভাবে, মাইহিটস মোটিফ স্ক্যান এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের বিস্তৃত অবস্থান <আই. ডি1>-এর সাথে ভাগ করা একটি ডোমেন চিহ্নিত করেছে। একইভাবে, মোটিফফাইন্ডার টি. এম. ই. এম211 এবং এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের মধ্যে ভাগ করা একটি ডোমেনের কথাও জানিয়েছে, যদিও এটি এই ভাগ করা অঞ্চলটিকে <আই. ডি1> অবস্থানে প্রসারিত করেছে। এই সম্প্রসারণে এখন পূর্বে চিহ্নিত লিউসিন জিপার প্যাটার্ন অন্তর্ভুক্ত রয়েছে। অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তনগুলি অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তনের সাইটগুলি অনুসন্ধান করার জন্য একাধিক সফ্টওয়্যারের সাহায্যে মানব টি. এম. ই. এম. 211 প্রোটিন ক্রম বিশ্লেষণ করা হয়েছে। প্রথমত, ইউক্যারিওটিক লিনিয়ার মোটিফ সরঞ্জামটি বেশ কয়েকটি পরিসংখ্যানগতভাবে উল্লেখযোগ্য ফসফোরিলেশন সাইট এবং একটি গ্লাইকোসামিনোগ্লাইকান সংযুক্তি সাইট চিহ্নিত করেছে, তবে সবগুলিই ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেনের মধ্যে ছিল যেখানে অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম এই কারণগুলির সংস্পর্শে আসবে না। উপরন্তু, এই অবস্থানগুলি অর্থোলগ জুড়ে সংরক্ষিত নয়, এমনকি অন্যান্য স্তন্যপায়ী প্রাণীদের মধ্যেও নয়। একইভাবে মার্কোয়িল, সালফিনেটর, ফসফোসাইটপ্লাস, জিপিএস-এসইউএমও, নেটএনগ্লাইক এবং নেটওগ্লাইক থেকেও নেতিবাচক ফলাফল পাওয়া গেছে। নেটফস খুব দৃঢ়ভাবে ভবিষ্যদ্বাণী করেছে যে এস93 ফসফরিলেটেড হবে, তবে এই সেরিনটি প্রাইমেটের বাইরে অর্থোলগে বিদ্যমান নেই। যাইহোক, এটা সম্ভব যে এটি একটি স্তন্যপায়ী-নির্দিষ্ট কাজের অংশ। এই সেরিনটি অনুমান করা সক্রিয় স্থান থেকে ঝিল্লির বিপরীত দিকে থাকে, তাই এটি প্রোটিনের ক্রিয়াকলাপকে সংশোধন করে এমন সম্ভাবনা কম। এই ফসফোরিলেশন সাইটটি একটি সংকেত পথের অংশ হতে পারে যা প্রোটিন পরিচালনা করে। ডায়ানা সি127 এবং সি138-এর মধ্যে একটি ডাইসালফাইড বন্ধনের সম্ভাব্য গঠনের উপর আলোকপাত করে ফলাফলও খুঁজে পায়। কোষের ঝিল্লি জুড়ে একটি বন্ধন জড়িত অন্যান্য ফলাফলগুলি বাতিল করা হয়েছিল। ভবিষ্যদ্বাণীকৃত বন্ধনের সিস্টাইনগুলি এম. এস. এ-র সমস্ত জীবের মধ্যে সম্পূর্ণরূপে সংরক্ষিত থাকে এবং এইভাবে, এই বন্ধনটি টি. এম. ই. এম211-এর গঠন এবং ফলস্বরূপ কার্যকারিতার জন্য সম্ভবত গুরুত্বপূর্ণ। মানব টি. এম. ই. এম. 211-এর পূর্ববর্তী মডেলে চিহ্নিত আগ্রহের ক্ষেত্রগুলি যোগ করা হয়েছে (চিত্র 21)। লিউসিন জিপার প্যাটার্নটি প্রোটিনের একটি অত্যন্ত সংরক্ষিত অংশে ঘটে, যা উভয়ই এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের সাথে ভাগ করা প্রসারিত ডোমেনের অন্তর্ভুক্ত। এই সম্প্রসারিত ক্ষেত্রটি পূর্বাভাসকৃত সক্রিয় স্থানের সম্পূর্ণতাকে অন্তর্ভুক্ত করে, যার সবগুলিই প্রজাতি জুড়ে অত্যন্ত সংরক্ষিত। সংক্ষিপ্ত ভাগ করা ডোমেনটি স্বচ্ছতার জন্য প্রদর্শিত হয়, তবে এই সংক্ষিপ্ত ডোমেনটি সক্রিয় সাইটের বেশিরভাগ অংশকে ওভারল্যাপ করে এবং অত্যন্ত সংরক্ষিত। যদিও লিউসিন জিপারগুলি আন্তঃকোষীয় ক্রিয়াকলাপ সম্পর্কে আরও ভালভাবে বোঝা যায়, বহির্মুখী লিউসিন জিপারগুলি প্রোটিন বাঁধনে সহায়তা করে এবং সংকেত রিসেপ্টরগুলির কার্যকরী উপাদান হিসাবে দেখানো হয়েছে। এগুলি উভয়ই এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের চিহ্নিত ফাংশন এবং টি. এম. ই. এম211-এর জন্য ফাংশন হতে পারে। ট্রান্সমেম্ব্রেন ক্ষেত্রগুলি বেশিরভাগ হাইড্রোফোবিক অবশিষ্টাংশের গঠন ছাড়াও প্রোটিনের ক্রম, পরিবর্তন বা গৌণ কাঠামো দ্বারা প্রতিটি জায়গায় ধরে রাখা হয়। প্রথম ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেনটি ধনাত্মক চার্জযুক্ত আর্জিনাইনের অবশিষ্টাংশ দ্বারা আন্তঃকোষীয় দিকে রাখা হয় যা ডোমেনটিকে ঝিল্লিতে পিছলে যেতে বাধা দেয়। ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন 1 এবং 2 উভয়ই তাদের মধ্যে ক্রম অনুসারে বিটা শীট গঠনের মাধ্যমে বহির্মুখী দিকে স্থিতিশীল হয়। এই কাঠামোটি ঝিল্লির মধ্য দিয়ে যেতে সক্ষম হবে না। আন্তঃকোষীয় দিকে, আধানযুক্ত আর্জিনাইন অবশিষ্টাংশ এবং মেরু সেরিন অবশিষ্টাংশ দ্বারা ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন 2 চলাচল করতে বাধা পায়। এই অবশিষ্টাংশগুলি ভবিষ্যদ্বাণীকৃত ফসফোরিলেশন সাইটও, যা ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেনের চলাচলকে আরও বাধা দেবে। ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন 3 সম্ভবত বহির্মুখী স্থানের দিকে আরও সরে যেতে পারে, কারণ এর আগের সাতটি অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম সম্পূর্ণরূপে হাইড্রোফোবিক। এর কিছু পরেই, একটি থ্রেওনাইন অবশিষ্টাংশ এবং একটি সম্পূর্ণ সংরক্ষিত গ্লুটামিন অবশিষ্টাংশ ক্রমটিকে ঝিল্লির মধ্যে আরও অগ্রসর হতে বাধা দেবে। ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন 3-এর অপর পাশে সম্পূর্ণরূপে সংরক্ষিত সি127-এর জন্য ঝিল্লি থেকে বেরিয়ে আসার জন্য এবং সি138-এর সাথে পূর্বাভাসকৃত ডাইসালফাইড বন্ধন গঠনের জন্য সাতটি অবস্থানের প্রয়োজন হয়। একবার গঠিত হলে, এই বন্ধনটি ডোমেনটিকে তার মূল অবস্থানে ফিরে যেতে বাধা দেবে। ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন 4 সম্ভবত আরও অবাধে স্থানান্তরিত হতে পারে, কারণ এর অবস্থান যাই হোক না কেন, এটি কিছু পরিমাণে চার্জযুক্ত বা মেরু অবশিষ্টাংশকে ঝিল্লিতে বাধ্য করবে। এটি c138 এর ডাইসালফাইড বন্ধনের মুখোমুখি না হওয়া পর্যন্ত সমস্ত পথে স্লাইড করতে সক্ষম হতে পারে, কারণ এই অবস্থানটি ন্যূনতম সংখ্যক মেরু এবং চার্জযুক্ত অ্যামিনো অ্যাসিডকে ঝিল্লিতে বাধ্য করে। হাইড্রোফোবিক ঝিল্লির অভ্যন্তরে মেরু এবং চার্জযুক্ত অবশিষ্টাংশের এই অঞ্চলটি প্রোটিনের সবচেয়ে কম সংরক্ষিত অঞ্চলগুলির মধ্যে একটি, সম্ভবত এটি অস্থিতিশীল এবং সক্রিয় স্থান থেকে দূরে। তৃতীয় কাঠামো টি. এম. ই. এম. 211-এর কাঠামো খুব উচ্চ আত্মবিশ্বাসের সাথে পূর্বাভাস দেওয়া যেতে পারে (চিত্র 22)। কম আত্মবিশ্বাসের একমাত্র অঞ্চল হল সি-টার্মিনাসের পূর্ববর্তী অঞ্চল, যা অত্যন্ত অ-সংরক্ষিত এবং অস্থির। এটি প্রোটিনের কাঠামোর একমাত্র প্রধান অংশ যা বিভিন্ন প্রজাতির মধ্যে পরিবর্তিত হয়। প্রদর্শিত হিসাবে, চারটি ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন একসাথে গুচ্ছবদ্ধ হয়, তবে স্পেস-ফিলিং মডেলগুলি স্পষ্টভাবে দেখায় যে তারা একটি পাসযোগ্য চ্যানেল গঠন করে না। যদিও রৈখিক টি. এম. ই. এম. 211 ক্রমে চার্জের কোনও গুচ্ছ সনাক্ত করা যায়নি, তবে বাঁধাই স্থানের ভিতরে ধনাত্মক এবং ঋণাত্মক চার্জের একটি স্পষ্ট গুচ্ছ রয়েছে (চিত্র 23)। এটি টি. এম. ই. এম. 211 সক্রিয় স্থানটিকে তার লিগ্যান্ডের সাথে আয়নিকভাবে মিথস্ক্রিয়া করার অনুমতি দেবে, পাশাপাশি প্রোটিনকে শুধুমাত্র কাঠামোর চেয়ে আরও স্তর নির্দিষ্টতা প্রদান করবে। গুরুত্বপূর্ণভাবে, টি. এম. ই. এম. 211-এর পূর্বাভাসকৃত বাঁধাই স্থানটি দ্রাবক অ্যাক্সেসযোগ্য, বাকি প্রোটিনের তুলনায় বেশি (চিত্র 23)। এই অ্যাক্সেসযোগ্যতা লিগ্যান্ডকে প্রোটিনের সাথে প্রবেশ এবং মিথস্ক্রিয়া করার অনুমতি দেবে। চার্জ, কাঠামো এবং সংরক্ষিত সিস্টিনের অবশিষ্টাংশের সংমিশ্রণ সম্ভবত টি. এম. ই. এম. 211-কে লিগ্যান্ডের সাথে আবদ্ধ হতে সহায়তা করে। এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের সদস্যদের বন্ধন স্থানগুলি অন্যান্য প্রোটিনগুলিকে আবদ্ধ করে, তবে টি. এম. ই. এম211-এর জন্য কোনও কার্যকরী প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া আবিষ্কৃত হয়নি। হেপাটাইটিস ডেল্টার টি. এম. ই. এম. 211 এবং পি29996-এর মধ্যে একমাত্র মিথস্ক্রিয়া লক্ষ্য করা গেছে। যাইহোক, পি29996 বিভিন্ন ধরনের 156টি অন্যান্য মানব প্রোটিনের সাথে মিথস্ক্রিয়া করার জন্য পরিচিত, এবং টি. এম. ই. এম. 211 সম্ভবত এই স্বচ্ছলতার মধ্যে ধরা পড়ে এবং কোনও নির্দিষ্ট কার্যকরী ভূমিকার জন্য লক্ষ্যবস্তু নয়। পরিবর্তন নীরব মিউটেশন বাদে, টি. এম. ই. এম. 211 জিনের মানব জনসংখ্যায় হেটেরোজাইগোসিটি সহ 7টি এস. এন. পি রয়েছে বলে জানা যায়। এই রূপান্তরগুলি টি. এম. ই. এম. 211-এর উপস্থাপনায় যোগ করা হয়েছিল (চিত্র 25)। মিউটেশন ডাব্লু67আর, 50 শতাংশ হেটেরোজাইগোসিটি উপস্থাপন করে, যা ইঙ্গিত করে যে এই মিউটেশন সম্ভবত প্রোটিন ফাংশনের উপর খুব কম বা কোনও প্রভাব ফেলে না। যাইহোক, অন্যান্য বেশ কয়েকটি বৈচিত্র্যের ফেনোটাইপের সাথে উল্লেখযোগ্য সম্পর্ক রয়েছে। জি140-এর বৈচিত্র্য, যা আর বা এ হয়ে যায়, বি. এম. আই-এর নিদর্শনগুলির সঙ্গে যুক্ত। যদি এই পরিবর্তনগুলি প্রোটিনের কার্যকারিতাকে প্রভাবিত করে, যা ল্যাঙ্গারহ্যান দ্বীপপুঞ্জে বিদ্যমান বলে জানা যায়, তবে এটি নিঃসৃত ইনসুলিনের মাত্রায় পরিবর্তনের মাধ্যমে বিএমআই-এর উপর প্রভাব ফেলতে পারে। বৈচিত্র্য এম145আই আলঝেইমারের বর্ধিত ঝুঁকির সাথে যুক্ত, যা এল. এইচ. এফ. পি. এল-এর পরিচিত বৈচিত্র্যের সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ যা আলঝেইমারের ঝুঁকিও বাড়ায়। সবচেয়ে উল্লেখযোগ্যভাবে, C127W বৈচিত্র্য বধিরতা এবং শ্রবণশক্তি হ্রাসের সাথে যুক্ত। সি127 বাঁধাই পকেটে অবস্থিত এবং সি138-এর সাথে একটি ডাইসালফাইড বন্ধন গঠনের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। ট্রিপ্টোফান একটি ডাইসালফাইড বন্ধনে জড়িত হতে সক্ষম হবে না এবং সম্ভবত বাঁধাই সাইটের কার্যকরী ক্ষমতাকে পরিবর্তন করবে। সি127ডাব্লু সম্ভবত ফাংশন মিউটেশনের ক্ষতি, যা তখন এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের সদস্যদের মধ্যে ফাংশন মিউটেশনের ক্ষতির ফলে বধিরতা এবং শ্রবণশক্তি হ্রাসকে সঠিকভাবে প্রতিফলিত করে। সাদৃশ্যকে আরও বাড়িয়ে, সিস্টিনের এই জোড়া সম্পূর্ণরূপে এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবার জুড়ে সংরক্ষিত। সম্ভাব্য প্রতিলিপি উপাদানগুলির বাইন্ডিং সাইটগুলির মধ্যে বা এমআরএনএ কাঠামোগত উপাদানগুলির মধ্যে কোনও মিউটেশন ঘটেনি, তবে এই সিদ্ধান্তে পৌঁছানোর জন্য পর্যাপ্ত তথ্য উপলব্ধ ছিল না যে এটি এই ক্রমগুলির প্রয়োজনীয় সংরক্ষণের কারণে। ফাংশন বর্তমানে, টি. এম. ই. এম. 211-এর কোনও পরিচিত ফাংশন নেই। একটি তথ্যমূলক পরীক্ষা হবে ইঁদুরের উপর নকআউট পরীক্ষা, যেখানে সি. আর. আই. এস. পি. আর ব্যবহার করে টি. এম. ই. এম. 211 জিন অপসারণ বা প্রতিস্থাপন করা হয়। যদি ধরে নেওয়া হয় যে প্রোটিনটি কিছু কাজ করছে, তাহলে মাউসের কিছু দিক থেকে ঘাটতি হবে। শব্দ সম্পর্কে ইঁদুরের উপলব্ধির প্রতি নির্দিষ্ট মনোযোগ দেওয়া উচিত, কারণ এটি এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের সদস্যদের উপর নকআউট পরীক্ষার ফলাফল। যদিও এই পরীক্ষাটি সম্ভবত টি. এম. ই. এম211-এর নির্দিষ্ট কার্যকারিতা প্রমাণ করবে না, এটি ভবিষ্যতের পরীক্ষাগুলিতে ফোকাস করার জন্য অঞ্চল বা পথ চিহ্নিত করতে পারে। এটি অগ্ন্যাশয়, স্তন, মস্তিষ্ক এবং যৌন অঙ্গ টিস্যুতে প্রোটিনের প্রাচুর্য দ্বারা প্রস্তাবিত সম্ভাব্য ক্রিয়াকলাপের ক্ষেত্রকে সংকীর্ণ করবে। ইনসুলিন কোষীয় গ্লুকোজ গ্রহণের একটি গুরুত্বপূর্ণ দিক এবং মানবদেহের বেশিরভাগ কোষের জন্য এটি প্রয়োজন। এটি উচ্চ রক্তে গ্লুকোজের মাত্রার প্রতিক্রিয়ায় মুক্তি পায়। অ্যান্টিবডি স্টেনিং দেখিয়েছে যে টি. এম. ই. এম. 211 অগ্ন্যাশয়ের টিস্যুতে ল্যাঙ্গারহানসের ইনসুলিন নিঃসরণকারী দ্বীপপুঞ্জের স্থানীয়করণের জন্য একটি চরম পক্ষপাত প্রদর্শন করে এবং টি. এম. ই. এম. 211 এবং এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের একটি প্রস্তাবিত ফাংশন হল সংকেত রিলে। সুতরাং, টি. এম. ই. এম. 211-এর বহির্মুখী বন্ধন স্থানের একটি সম্ভাব্য কাজ হতে পারে গ্লুকোজের সাথে আবদ্ধ হওয়া এবং রক্ত প্রবাহে গ্লুকোজ উপস্থিত থাকার একটি সংকেত রিলে করা। এটি একটি অ্যাডেনোসিন ট্রাইফসফেট-সংবেদনশীল কে + চ্যানেলের পরিচিত কাজ, তবে সংকেত পথগুলি প্রায়শই অপ্রয়োজনীয় এবং মানবদেহের পক্ষে জীবনের জন্য অত্যাবশ্যক এমন একটি প্রক্রিয়ার জন্য অপ্রয়োজনীয়তা বিকাশ করা যৌক্তিক হবে। এই অনুমানটি পরীক্ষা করার জন্য, স্থিতিশীল টি. এম. ই. এম. 211 এবং গ্লুকোজ দ্রবণ ব্যবহার করে একটি পৃষ্ঠ প্লাজমন অনুরণন পরীক্ষা করা উচিত। পরীক্ষার এই পদ্ধতিটি ছোট লিগ্যান্ড এবং ঝিল্লি প্রোটিনের মধ্যে বন্ধন মূল্যায়নে কার্যকর। যদি বাঁধাইয়ের হার নির্ধারণ করা হয় অ-শূন্য, তবে গ্লুকোজ সম্ভবত সক্রিয় স্থানের সাথে আবদ্ধ। যদি বাঁধাইয়ের হার শূন্য হয়, তবে পরীক্ষাটি অ-গ্লুকোজ পুষ্টিগুলির সাথে পুনরাবৃত্তি করা উচিত যা ইনসুলিন নিঃসরণকে প্রভাবিত করে, যেমন মুক্ত ফ্যাটি অ্যাসিড এবং মুক্ত অ্যামিনো অ্যাসিড, এবং মেলাটোনিন, ইস্ট্রোজেন, লেপটিন, বৃদ্ধি হরমোন সহ ইনসুলিন নিঃসরণকে প্রভাবিত করে এমন হরমোনগুলির সাথে পুনরাবৃত্তি করা উচিত। যদি এর মধ্যে কোনওটির ফলে অ-শূন্য বাঁধাইয়ের হার হয়, তবে সেই মিথস্ক্রিয়াটি ইনসুলিন নিঃসরণের সংকেত দেওয়ার জন্য দায়ী কিনা তা নির্ধারণ করার জন্য একটি পরীক্ষা করা যেতে পারে। এটিও সম্ভব যে, গ্লুকোজ পথের বিপরীতে, টি. এম. ই. এম. 211-এর বন্ধন এবং ফলস্বরূপ সংকেত ইনসুলিন নিঃসরণকে দমন করে। এই পরীক্ষার ফলাফল অন্য কোথাও প্রয়োগ করা যেতে পারে। টি. এম. ই. এম. 211 সহ অন্যান্য অনেক কোষ এবং টিস্যুও গ্লুকোজ বা হরমোনের প্রতি সাড়া দেয় এবং যদিও সংকেতটি প্রতিটি কোষের প্রকারের মধ্যে একটি ভিন্ন প্রতিক্রিয়া সৃষ্টি করতে পারে, বাহ্যিক কোষীয় বাঁধাই সাইটটি তার লিগ্যান্ডের জন্য তার নির্দিষ্টতা বজায় রাখতে হবে টিস্যুর প্রকার যাই হোক না কেন। উদাহরণস্বরূপ, লালা গ্রন্থি গ্লুকোজের উপস্থিতিতে অতিরিক্ত লালা উৎপাদন করে এবং টি. এম. ই. এম. 211-এর উচ্চ অভিব্যক্তি রয়েছে। যদি অগ্ন্যাশয়ের পরীক্ষার ফলাফলগুলি দেখায় যে টি. এম. ই. এম. 211 গ্লুকোজের মাত্রা সনাক্ত করছে এবং সংকেত দিচ্ছে, তবে এটি অনুমান করা যেতে পারে যে টি. এম. ই. এম. 211 লালা গ্রন্থিটিতে লালা উৎপাদনকে নিয়ন্ত্রণ করছে। পরিশেষে, টি. এম. ই. এম. 211 বা এল. এইচ. এফ. পি. এল পরিবারের কোনও সদস্যই শ্রবণ প্রক্রিয়াকরণের সাথে যুক্ত মস্তিষ্কের অংশগুলির জন্য পক্ষপাতদুষ্ট প্রাচুর্য দেখায়নি, তবুও মিউটেশনগুলি কোনও জীবের শোনার ক্ষমতাকে প্রভাবিত করে। যাইহোক, টি. এম. ই. এম. 211 এম. আর. এন. এ-এর 5 'ইউ. টি. আর অত্যন্ত সংরক্ষিত এবং স্নায়বিক পার্থক্যের সাথে জড়িত একটি ভ্রূণ প্রোটিন <আই. ডি. 1> দ্বারা আবদ্ধ। এটি সম্ভব যে এই জিনগুলিতে মিউটেশনগুলি শব্দের উপলব্ধির পথ ভেঙে বধিরতা বা শ্রবণশক্তি হ্রাস করে না, তবে শ্রবণ সংকেতগুলি প্রক্রিয়া করার জন্য প্রয়োজনীয় কাঠামোর যথাযথ বিকাশকে বাধা দেয়। মিউটেশনগুলি বিকাশের সময় শ্রবণ পথের কিছু দিককে সঠিকভাবে একত্রিত বা পার্থক্য করতে বাধা দিতে পারে। এটি এমন একটি প্রক্রিয়া যার মাধ্যমে অন্যান্য অভ্যন্তরীণ কানের ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিনে রূপান্তর বধিরতা সৃষ্টি করে। এই মিউটেশনগুলি ইঁদুরের মধ্যে প্ররোচিত হতে পারে, যা টি. এম. ই. এম. 211 মিউটেশনযুক্ত ইঁদুর, এল. এইচ. এফ. পি. এল মিউটেশনযুক্ত ইঁদুর এবং নিয়ন্ত্রণকারী ইঁদুরের মধ্যে কাঠামো এবং শব্দ প্রক্রিয়াকরণের পার্থক্য পরীক্ষা করার অনুমতি দেয়। এফএমআরআই গবেষকদের পর্যবেক্ষণ করতে সাহায্য করবে যে শ্রবণ প্রক্রিয়াকরণ পথে ত্রুটিটি কোথায় ঘটছে। এই প্রক্রিয়াগুলিকে পৃথক করার জন্য, পরীক্ষামূলক ইঁদুরগুলিকে বন্য ধরনের ইঁদুরের সাথে প্রজনন করা উচিত যাতে ইঁদুরের একটি প্রজন্ম তৈরি করা যায় যা রূপান্তরের জন্য ভিন্নধর্মী। এই ইঁদুরগুলি এখনও শ্রবণ প্রক্রিয়াকরণের কিছু দিক দেখায় এবং গবেষকদের রূপান্তর দ্বারা সৃষ্ট পথের নির্দিষ্ট ভাঙ্গনের দিকে পরিচালিত করতে পারে। এই অধ্যয়নের মধ্যে অভ্যন্তরীণ কানের শারীরিক পরীক্ষা অন্তর্ভুক্ত করা উচিত। শ্রবণ পথের ক্রিয়াটি সেই নিদর্শনগুলিও ব্যাখ্যা করে যেখানে জীবগুলি জিনের অধিকারী। সিনিডারিয়া ছিল প্রথম প্রাণী যারা তাদের দেহের চারপাশের তরলে কম্পন সনাক্ত করতে সক্ষম হয়েছিল। অ্যানিমোন এমনকি চুলের মতো কাঠামো ব্যবহার করে যা মানুষের অভ্যন্তরীণ কানের অনুরূপ, এমন একটি কাঠামো যা সম্ভবত আধুনিক কানের জন্ম দিয়েছে। মেরুদণ্ডী প্রাণী এবং আর্থ্রোপড হল একমাত্র প্রাণী যাদের কান হিসাবে চিহ্নিত করা হবে, তবে অনেক অমেরুদণ্ডী প্রাণী এখনও অ্যানিমনের মতো কাঠামো ব্যবহার করে। এটি বিচ্যুতি গ্রাফের বিন্দুটি ব্যাখ্যা করে যেখানে জিনটি দ্রুত পরিবর্তন হতে শুরু করে, যা স্থলজ প্রাণীদের উত্থানের সাথে ঠিক সামঞ্জস্যপূর্ণ। জিনটি দ্রুত পরিবর্তিত হতে শুরু করে যখন জীবগুলি জলের পরিবর্তে বাতাসে শব্দ উপলব্ধির সাথে খাপ খাইয়ে নিতে শুরু করে। এটি আরও ব্যাখ্যা করে যে কেন উভচর প্রাণীরা তাদের বিচ্যুতির তারিখের উপর ভিত্তি করে মানুষের টি. এম. ই. এম. 211-এর সাথে অনেক কম পরিচয় প্রদর্শন করে; তাদের প্রোটিনের জলজ পরিবেশে থাকার মতো পরিবর্তনের প্রয়োজন ছিল না। টেরেস্ট্রিয়াল আর্থ্রোপডদের কান থাকলেও TMEM211 থাকে না। তবে, স্থলজ মেরুদণ্ডী প্রাণী এবং স্থলজ আর্থ্রোপডদের কোনও স্থলজ পূর্বপুরুষ নেই। মেরুদণ্ডী প্রাণীরা ভূমিতে টেট্রাপড হিসাবে বসবাসের জন্য বিবর্তিত হয়েছিল, যারা বাতাসে শব্দ প্রক্রিয়াকরণের অনুমতি দেওয়ার জন্য টি. এম. ই. এম. 211 জিনকে অভিযোজিত করেছিল। টেরেস্ট্রিয়াল আর্থ্রোপডগুলি সামুদ্রিক আর্থ্রোপড থেকে উদ্ভূত হয়েছিল এবং যদিও তারা কান হিসাবে লেবেলযুক্ত কিছু তৈরি করেছিল, এটি অভিন্ন বিবর্তনের পণ্য, ভাগ করা পূর্বপুরুষ নয়। বাতাসে শব্দ অনুধাবন করার জন্য একটি বিকল্প পথ খুঁজে পাওয়ায় আর্থ্রোপডদের কানের বিবর্তন টিএমইএম211 জিন ব্যবহার করা বন্ধ করে দিতে পারত। তথ্যসূত্র