C11orf98
C11orf98 হল অজানা কার্যকারিতার মানুষের মধ্যে ক্রোমোজোম 11-এ একটি প্রোটিন-এনকোডিং জিন। এটি অন্যথায় c11orf48 নামে পরিচিত। জিনটি ক্রোমোজোমাল লোকাসকে 62,662,817-62,665,210 থেকে বিস্তৃত করে। 4টি এক্সোন রয়েছে। এটি ডি. এন. এ-র 2,394 বেস জোড়া জুড়ে বিস্তৃত এবং একটি এম. আর. এন. এ তৈরি করে যা 646 বেস জোড়া দীর্ঘ। জিন অভিব্যক্তি এই জিনটি খুব উচ্চ স্তরে প্রকাশ করা হয়, যা গড় জিনের 4.4 গুণ। সি11ওআরএফ98 প্রোটিন টিস্যুগুলির একটি বিস্তৃত বিন্যাসে প্রকাশিত হয়। আর. এন. এ-সেক ডট দেখিয়েছে যে এই জিনটি অ্যাপেন্ডিক্স, লিম্ফ নোড এবং থাইমাসে সর্বাধিক প্রকাশিত হয়েছে। পি. এস. ও. আর. টি-2-এর মাধ্যমে করা একটি বিশ্লেষণে এই সিদ্ধান্তে উপনীত হয় যে, সি11ও. আর. এফ98 জিন পণ্যটি নিউক্লিয়াস <আই. ডি1>-এর নির্ভরযোগ্যতায় স্থানীয়কৃত। এই পারমাণবিক স্থানীয়করণ থেকে বোঝা যায় যে সি11ওআরএফ98 প্রোটিনের নিউক্লিয়াসে জিনের অভিব্যক্তি এবং নিয়ন্ত্রণের সাথে সম্পর্কিত একটি ফাংশন থাকতে পারে। নিয়ন্ত্রণ সি11ওআরএফ98 জিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করার জন্য বেশ কয়েকটি ভিন্ন প্রতিলিপি কারণের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। জিনোম্যাটিক্স ব্যবহার করে জিনে পাওয়া ডিএনএ সিকোয়েন্সের উপর ভিত্তি করে এই ট্রান্সক্রিপশন কারণগুলির পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল যা নাম এবং বিবরণও সরবরাহ করেছিল। প্রোটিন c11orf98 জিন একটি প্রোটিনকে এনকোড করে যা 123 অ্যামিনো অ্যাসিড দীর্ঘ। প্রোটিনের আনুমানিক আণবিক ওজন 14.2 কেডিএ। বেসাল আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দু 11.53 হিসাবে নির্ধারিত হয়েছিল। প্রোটিনের উপকোষীয় স্থানীয়করণ নিউক্লিয়াসে থাকার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। ডোমেন c11orf98 প্রোটিনে অজানা ফাংশনের একটি অঞ্চল (DUF5564) রয়েছে যা অ্যামিনো অ্যাসিড 1-98 থেকে বিস্তৃত। প্রোটিনের মধ্যে 2টি বিশৃঙ্খল অঞ্চল রয়েছে যা অ্যামিনো অ্যাসিড 1-21 এবং 32-123 থেকে বিস্তৃত। C11orf98-এ 4টি দ্বিদলীয় পারমাণবিক স্থানীয়করণ সংকেত (NLS _ BP) রয়েছে যা নির্দেশ করে যে প্রোটিনটি পারমাণবিক পরিবহনের মাধ্যমে কোষের নিউক্লিয়াসে আমদানির জন্য 'ট্যাগ' করা হবে। এনএলএস _ বিপি ক্রমটি সাধারণত ধনাত্মক আধানযুক্ত আর্জিনাইন নিয়ে গঠিত, যা আর্জিনাইন সমৃদ্ধ অঞ্চল (এআরজি _ রিচ)-কেও ব্যাখ্যা করবে। কাঠামো সি11ওআরএফ98 প্রোটিনের গৌণ কাঠামোতে একাধিক আলফা হেলিসেসের পাশাপাশি বিটা শীট থাকার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। তৃতীয় কাঠামোর পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল আলফাফোল্ড পোস্ট-ট্রান্সলেশনাল পরিবর্তনগুলি ব্যবহার করে C11orf98 প্রোটিন অনুবাদের পরে পরিবর্তনের মধ্য দিয়ে যায়। সি11ওআরএফ98 প্রোটিনের একটি ইমিডেশন সাইট থাকার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। এটি একটি সক্রিয় পেপটাইড অগ্রদূত ক্লিভেজ সাইট হিসাবে কাজ করে। এরপরে, একটি সিএএমপি-এবং সিজিএমপি-নির্ভর প্রোটিন কাইনেজ ফসফোরিলেশন সাইটের পাশাপাশি অন্যান্য ফসফোরিলেশন সাইট যেমন কেসিন কাইনেজ II ফসফোরিলেশন সাইট এবং একটি প্রোটিন কাইনেজ সি ফসফোরিলেশন সাইটের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। একটি এন-মিরিস্টয়লেশন সাইটেরও পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। ফসফরিলেশন গুরুত্বপূর্ণ কারণ সাইটে একটি ফসফরিল গ্রুপ যুক্ত করা হয়, যা শুধুমাত্র নিউক্লিয়াসে বা সাইটোসোলে ঘটতে পারে। মাইরিস্টয়লেশন গুরুত্বপূর্ণ কারণ একটি মাইরিস্টয়েল গ্রুপ (ফ্যাটি অ্যাসিড গ্রুপ) সাইটে যুক্ত করা হয় যা ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন বা সাইটোসোলিক প্রোটিনকে ঝিল্লিতে নোঙ্গর করতে সহায়তা করে। বারোটি পূর্বাভাসকৃত ও-বিটা-জিএলসিএনএসি গ্লাইকোসাইলেশন সাইট ছিল। এটি তাৎপর্যপূর্ণ কারণ এই পরিবর্তনটি শুধুমাত্র ঝিল্লি প্রোটিন এবং সিক্রেটরি প্রোটিনের পরিবর্তে নিউক্লিয়ার এবং সাইটোপ্লাজমিক প্রোটিনে পাওয়া যায়। একটি সুময়লেশন সাইটের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। সুময়লেশন হল একটি অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তন যা পারমাণবিক-সাইটোসোলিক পরিবহন, প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রণ, অ্যাপোপটোসিস, প্রোটিন স্থিতিশীলতা, চাপের প্রতিক্রিয়া এবং কোষ চক্রের মধ্য দিয়ে অগ্রগতির সাথে জড়িত। মিথস্ক্রিয়া সমসংস্থান এবং বিবর্তন অর্থোলগস সি11ওআরএফ98 জিনের 148টি অর্থোলগস রয়েছে। প্রাচীনতম অর্থোলগ অমেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে আবির্ভূত হয়েছিল। অন্যান্য অর্থোলগ পাখি, সরীসৃপ, উভচর, মাছ এবং অমেরুদণ্ডী প্রাণীর মধ্যে পাওয়া গেছে। বিবর্তনের হার c11orf98-এর আপেক্ষিক বিবর্তনের হার ফাইব্রিনোজেন আলফার হারের তুলনায় ধীর, তবে সাইটোক্রোমের তুলনায় দ্রুত। এটি ডানদিকে ফাইলোজেনেটিক গাছের গ্রাফ-এ দেখানো হয়েছে। ডানদিকে একটি ফাইলোজেনেটিক গাছ রয়েছে যা জিনের বিবর্তনীয় ইতিহাস প্রদর্শন করে। বর্তমানে, c11orf98 জিনটি কোনও রোগ বা চিকিৎসা সংক্রান্ত অবস্থার সঙ্গে যুক্ত নয়। তথ্যসূত্র