MFSD6L
মেজর ফেসিলিটেটর সুপারফ্যামিলি ডোমেনে 6 লাইক (এম. এফ. এস. ডি. 6এল) রয়েছে যা মানুষের মধ্যে এম. এফ. এস. ডি. 6এল জিন দ্বারা এনকোড করা একটি প্রোটিন। এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিন হল একটি ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন যা প্রধান ফেসিলিটেটর সুপারফ্যামিলির (এম. এফ. এস) অংশ যা কোষের ঝিল্লি জুড়ে ছোট ছোট দ্রবণ পরিবহনের সুবিধার্থে কেমিওসমোটিক গ্রেডিয়েন্ট ব্যবহার করে। মানব জিনোমে, এম. এফ. এস. ডি. 6এল জিন ক্রোমোজোম 17 (<আই. ডি. 1>)-এ অবস্থিত। পলিপেপটাইডকে এনকোডিং করা ডিএনএ সিকোয়েন্সটি 8,797,110 বিপি থেকে শুরু করে 8,799,365 বিপি পর্যন্ত 2,256 টি ক্ষারকে অন্তর্ভুক্ত করে। উপরন্তু, জিন ক্রম মাইনাস স্ট্র্যান্ডে থাকে। এম. এফ. এস. ডি. 6এল জিনের একটি উপনাম রয়েছে যার নাম এফ. এল. জে. 35773। এনকোডিং ডি. এন. এ সিকোয়েন্সের ফলে অনুবাদিত এম. আর. এন. এ সিকোয়েন্সে শুধুমাত্র একটি এক্সন থাকে। টিউমার দমনকারী জিন টিপি53 17p13.1-এ এমএফএসডি6এল-এর জিনের আশেপাশেও পাওয়া গেছে। এম. এফ. এস. ডি. 6এল এনকোডিং সিকোয়েন্সে শুধুমাত্র একটি এক্সনের উপস্থিতির কারণে এম. এফ. এস. ডি. 6এল জিনের অন্যান্য আইসোফর্ম পাওয়া যায়নি। প্রোটিন এম. এফ. এস. ডি. 6. এল প্রোটিনের পূর্ববর্তী আণবিক ওজন প্রায় 64 কে. ডি. এ, যা 586টি অ্যামিনো অ্যাসিড নিয়ে গঠিত। গ্লাইকোসাইলেশনের মতো অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তনের পরে, পরিপক্ক এম. এফ. এস. ডি. 6. এল প্রোটিনের আণবিক ওজন 72 কে. ডি. এ-তে বৃদ্ধি পায়। এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিন সমন্বিত অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে, অন্যান্য মানুষের প্রোটিনের তুলনায় লিউসিনের মাত্রা বৃদ্ধি পেয়েছে বলে দেখা গেছে। লিউসিনের এই বৃদ্ধি বাড়ির ইঁদুর এবং শিম্পাঞ্জির এম. এফ. এস. ডি6এল প্রোটিনেও উপস্থিত থাকে। প্রোটিনের একটি আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দুও রয়েছে 8.87 পি. আই। পেপটাইড সিকোয়েন্সে 11টি ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চল রয়েছে যা প্লাজমা ঝিল্লি অতিক্রম করে। উপরন্তু, 28তম এবং 368তম এনকোডিং অ্যামিনো অ্যাসিড থেকে শুরু করে দুটি এম. এফ. এস অঞ্চল রয়েছে। এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিনের গৌণ কাঠামোর জন্য, 16টি পূর্বাভাসকৃত আলফা হেলিস এবং 3টি পূর্বাভাসকৃত বিটা শীট রয়েছে। এম. এফ. এস. ডি. 6. এল-এর কাঠামোর মধ্যে প্রচুর পরিমাণে আলফা হেলিসের জন্য প্রোটিনকে একটি ট্রান্সমেম্ব্রেন সলিউট ট্রান্সপোর্টার হিসাবে দায়ী করা যেতে পারে কারণ আলফা হেলিস সাধারণত প্রোটিনের কাঠামোর অংশ যা কোষের ঝিল্লির মধ্যে অবস্থিত। তৃতীয় কাঠামোর মধ্যে, 29তম এবং 311তম অ্যামিনো অ্যাসিডে দুটি সিস্টিনের মধ্যে একটি ডাইসালফাইড বন্ধনের পূর্বাভাস ছিল। অভিব্যক্তি এবং নিয়ন্ত্রণ জিন স্তর জিনোম্যাটিক্স জিন2প্রোমোটার ডাটাবেস ব্যবহার করে এম. এফ. এস. ডি6এল-এর জন্য শুধুমাত্র একটি প্রবর্তক অঞ্চল ছিল, যা 1,107 বিপি বিস্তৃত ছিল। এম. এফ. এস. ডি. 6এল জিনের 5 'ইউ. টি. আর-এর শুরুর নিকটতম প্রবর্তক অঞ্চলের অংশের জন্য, বেশ কয়েকটি ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর বাইন্ডিং সাইট পাওয়া গেছে। পি53 টিউমার দমনকারী প্রোটিনের জন্য একটি ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর বাইন্ডিং সাইট ছিল। এম. এফ. এস. ডি. 6. এল জিনটি অগ্ন্যাশয়, লালা গ্রন্থি এবং থাইরয়েডে অত্যন্ত প্রকাশিত হতে দেখা গেছে। এম. এফ. এস. ডি. 6এল জিনের ইন-সিটু হাইব্রিডাইজেশন এক্সপ্রেশন পরিদর্শন করে দেখা যায় যে জিনটি বিশেষভাবে তাদের নিজ নিজ টিস্যুর মধ্যে গ্রন্থিযুক্ত কোষের মধ্যে প্রকাশিত হয়। গ্লুকোজ অনাহারের ফলে এম. এফ. এস. ডি. 6. এল-এর অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রিত হতে দেখা গেছে। ট্রান্সক্রিপ্ট স্তর যেহেতু এম. এফ. এস. ডি. 6এল জিনের মধ্যে শুধুমাত্র একটি এক্সন থাকে এবং কোনও ইন্ট্রন থাকে না, তাই এম. এফ. এস. ডি. 6এল এম. আর. এন. এ-তে কোনও স্প্লাইসিং করা হয় না। এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিনের অনুবাদ 5 'ইউ. টি. আর-এর শেষে শুরু হয়, যা এম. এফ. এস. ডি. 6এল এম. আর. এন. এ-র প্রথম 245টি নিউক্লিওটাইড। স্তন্যপায়ী অর্থোলোগ জুড়ে সংরক্ষিত স্টেম-লুপ অঞ্চল রয়েছে, যা সম্ভাব্য এমআইআরএনএ বাঁধাই সাইটগুলি অনুমান করে। প্রোটিন স্তর এম. এফ. এস. ডি. 6. এল প্রোটিনের উপকোষীয় স্থানীয়করণ ডিপলক টুলের মাধ্যমে কোষের ঝিল্লির মধ্যে হওয়ার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। এটি এম. এফ. এস প্রোটিনের মতো একটি দ্রবণীয় সিমপোর্টর হওয়ার দ্বারা সমর্থিত। অনুবাদিত এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিনের প্রথম 28টি অ্যামিনো অ্যাসিডে সিগন্যাল পেপটাইড থাকে। উপরন্তু, প্রোটিন ক্রমের 110তম, 129তম এবং 224তম অ্যামিনো অ্যাসিডে এন-গ্লাইকোসাইলেশন সাইটগুলির পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। 429তম অ্যামিনো অ্যাসিডে একটি সেরিন ফসফোরিলেশন সাইটের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল এবং অন্যান্য স্তন্যপায়ী অর্থোলগের মধ্যে উপস্থিতি দ্বারা যাচাই করা হয়েছিল। বিবর্তন প্যারালগ এম. এফ. এস. ডি. 6 প্রোটিন মানব এম. এফ. এস. ডি. 6 এল প্রোটিনের একমাত্র প্যারালগ হিসাবে পাওয়া গেছে। অর্থোলগস ব্লাস্ট সিকোয়েন্স বিশ্লেষণের মাধ্যমে, এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিনের অনেক স্তন্যপায়ী প্রজাতির মধ্যে অর্থোলগস পাওয়া গেছে, বিশেষ করে প্রাইমেট এবং উড়ন্ত শিয়ালের মধ্যে। সরীসৃপ এবং উভচর শ্রেণীতে কিছু অর্থোলগ পাওয়া গেছে, যদিও স্তন্যপায়ী প্রাণীর মতো সংখ্যায় খুব বেশি নয়। মাছের মধ্যে, কার্টিলাজিনস মাছের তুলনায় রে-ফিনড মাছের মধ্যে উল্লেখযোগ্যভাবে বেশি অর্থোলগ পাওয়া গেছে। উপরন্তু, চোয়ালবিহীন মাছ, সি ল্যাম্প্রে, একটি অর্থোলগ হিসাবেও পাওয়া গেছে। অমেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে একাধিক অর্থোলগ পাওয়া গেছে, যেমন ইচিনোডার্ম এবং মোলাস্ক। পোকামাকড়ের মধ্যে এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিনের কোনও উল্লেখযোগ্য অর্থোলগ পাওয়া যায়নি; তবে ব্যাকটেরিয়ায় অর্থোলগ পাওয়া গেছে। বিশেষত, থার্মোফিলিক ব্যাকটেরিয়া ধারণকারী অ্যানেরোলিনিয়া গণের মানব প্রোটিনের সাথে অর্থোলগ পাওয়া গেছে কারণ এর এম. এফ. এস অঞ্চলগুলি মানব প্রোটিনে পাওয়া এম. এফ. এস অঞ্চলের অনুরূপ। নিম্নলিখিত টেবিলটি মানব এম. এফ. এস. ডি. 6এল-এর অর্থোলগের কিছু উদাহরণ দেখায়। এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিনের মধ্যে পাওয়া প্রধান সমজাতীয় ক্ষেত্রগুলি হল এম. এফ. এস অঞ্চল। যেহেতু এম. এফ. এস এর সুপারফ্যামিলির মধ্যে প্রচুর পরিমাণে দ্রবণীয় পরিবাহক প্রোটিন রয়েছে, তাই অনেক এম. এফ. এস প্রোটিন রয়েছে যার একই সমজাতীয় এম. এফ. এস ডোমেন রয়েছে। বি. এল. এ. এস. টি সিকোয়েন্স বিশ্লেষণের মাধ্যমে, সবচেয়ে দূরবর্তী হোমোলোগগুলি ছিল সিনিডারিয়া ফাইলামের মধ্যে থাকা জীব, যা মূলত জেলিফিশ, সামুদ্রিক অ্যানিমোন এবং প্রবাল নিয়ে গঠিত। পুরোনো ডাইভারজিং ফাইলামে এম. এফ. এস. ডি. 6এল জিনের জন্য ব্লাস্টের সাথে অনুসন্ধান করে, পেরিফেরা কোনও সমজাতীয় এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিন প্রকাশ করেনি। অনুমিত উত্থানের তারিখ সিনিডারিয়ায় এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিনের উপস্থিতি এবং পোরিফেরায় অনুপস্থিতির ফলে, এম. এফ. এস. ডি. 6এল জিনের আনুমানিক উত্থানের তারিখ 687 থেকে 777 এম. ওয়াই. এ-এর মধ্যে থাকে, যা টাইমট্রি থেকে পাওয়া বিচ্যুতির তারিখ। হোমো সেপিয়েন্স এম. এফ. এস. ডি. 6 প্যারালগের সংশোধিত% বিচ্যুতি চার্ট এবং সঠিক% বিচ্যুতি গণনা থেকে, এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিনের উত্থানের আনুমানিক তারিখ প্রায় 736 এম. ওয়াই. এ পাওয়া গেছে। আন্তঃক্রিয়াশীল প্রোটিন এম. এফ. এস. ডি. 6. এল প্রোটিনের কোনও পরীক্ষামূলক-যাচাইকৃত প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া পাওয়া যায়নি। ফাংশন পলিপেপটাইড ক্রমটিতে অনেকগুলি ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চল রয়েছে, যা একটি কোষের প্লাজমা ঝিল্লি জুড়ে দ্রবণ পরিবহনের জন্য এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিনকে ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন হিসাবে চিহ্নিত করে। তৃতীয় কাঠামো পূর্বাভাস সরঞ্জামগুলি পরামর্শ দেয় যে এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিনের কাঠামো 1পি. ভি. 6এ-এর অনুরূপ, একটি বিটা-গ্যালাক্টোসাইড সিমপোর্টর যা দ্রবণ পরিবহনের জন্য প্রোটন গ্রেডিয়েন্ট ব্যবহার করে। ফলস্বরূপ, এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিনের কার্যকারিতা সম্ভবত একটি চিনির সিম্পোর্টর হতে পারে। এটি অতিরিক্তভাবে এই সত্য দ্বারা সমর্থিত যে গ্লুকোজ অনাহারের কারণে এম. এফ. এস. ডি. 6. এল-এর অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রিত হয়েছিল। ক্লিনিকাল তাৎপর্য ডিজিজ অ্যাসোসিয়েশন এম. এফ. এস. ডি. 6. এল জিনের সাথে যুক্ত একটি রোগ হল টেট্রালজি অফ ফ্যালট, যা চারটি জন্মগত হৃৎপিণ্ডের ত্রুটির একটি সিরিজ যা রক্তের কম অক্সিজেনের কারণ হতে পারে। এটি একটি ভেন্ট্রিকুলার সেপ্টাল ত্রুটির কারণে হয় যা হৃৎপিণ্ডের বাম ভেন্ট্রিকলের মধ্যে অক্সিজেনযুক্ত এবং ডিঅক্সিজেনেটেড রক্তের মিশ্রণ ঘটায়। এম. এফ. এস. ডি. 6এল জিনটি পেডিয়াট্রিক ছানি রোগে অংশ নেওয়া একটি প্রার্থী জিন হিসাবেও পাওয়া গেছে। মিউটেশন নীচে দেখানো এম. এফ. এস. ডি. 6এল প্রোটিন সিকোয়েন্সের এনকোডিং সিকোয়েন্সের মধ্যে বিভিন্ন এস. এন. পি পাওয়া গেছে। তথ্যসূত্র