C5orf49
ক্রোমোজোম 5 ওপেন রিডিং ফ্রেম ঊনচল্লিশ, যা C5orf49 নামেও পরিচিত, একটি প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে C5orf49 জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। C5orf49-এর বিকল্পগুলির মধ্যে রয়েছে ক্রোমোজোম 5 ওপেন রিডিং ফ্রেম 49, বৈশিষ্ট্যহীন প্রোটিন C5orf49 এবং LOC134121। C5orf49 সিলিয়ায় স্থানীয়করণ এবং সিলিয়ারি ফাংশন রয়েছে বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। জিন সি5ওআরএফ49 ক্রোমোজোম 5-এ পাওয়া যায়, সাইটোব্যান্ড পি15 বেস জোড়া 7,830,378 এবং 7,851,151-এর মধ্যে পাওয়া যায়, যার অর্থ এর দৈর্ঘ্য 20,774 বেস জোড়া। এই জিনের দুটি স্প্লাইস ফর্ম রয়েছে, যার মধ্যে একটি দৈর্ঘ্যে 147 টি অ্যামিনো অ্যাসিড এবং অন্যটি দৈর্ঘ্যে 145 টি অ্যামিনো অ্যাসিড। C5orf49 মাইনাস স্ট্র্যান্ডের উপর অবস্থিত। C5orf49-এর পার্শ্ববর্তী জিনের মধ্যে রয়েছে, ফাস্টকেডি3, এমটিআরআর এবং এডিসিওয়াই2। জিন-স্তরের নিয়ন্ত্রণ প্রবর্তক C5orf49-এর একটি আপস্ট্রিম প্রবর্তক রয়েছে, GXP _ 1271072, যা উভয় প্রাথমিক প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রণ করে। জিএক্সপি _ 1271072 দৈর্ঘ্যে 1,396 টি বেস জোড়া, যা ক্রোমোজোম 5-এ বেস জোড়া 7,851,094 থেকে বেস জোড়া 7,852,489 পর্যন্ত বিস্তৃত। 147টি অ্যামিনো অ্যাসিডের দীর্ঘতম প্রতিলিপির জন্য প্রতিলিপি শুরুর অঞ্চলটি ক্রোমোজোম 5-এর বেস পেয়ার 7,851,148 থেকে বেস পেয়ার 7,851,164 পর্যন্ত বিস্তৃত। প্রোটিন স্ট্রাকচার C5orf49 প্রোটিন ডোমেইন DUF4541 এর উপস্থিতি দ্বারা চিহ্নিত করা হয়। এই প্রোটিন ডোমেনের মধ্যে, একটি সংরক্ষিত কে. এল. এইচ. আর. ডি. আর ক্রম মোটিফ এবং একটি সম্পূর্ণ সংরক্ষিত অবশিষ্টাংশ ওয়াই রয়েছে যা কার্যকরীভাবে গুরুত্বপূর্ণ হতে পারে। ডোমেনটি টীকাকৃত ধারণাগত অনুবাদে দেখানো হয়েছে। বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণ ব্যবহার করে C5orf49-এর নিম্নলিখিত বৈশিষ্ট্যগুলির পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিলঃ আণবিক ওজনঃ 17 kDa আইসোইলেক্ট্রিক পয়েন্টঃ 7.0 অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তনঃ 14টি অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তনের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছেঃ প্রোটিন অনুক্রমের 8,9,11,80,100,135 এবং 147 অবস্থানে সাতটি ফসফরিলেশন সাইট 16,39,69,104,137-এ ছয়টি সর্বব্যাপী সাইট। 39 এবং 104-এ দুটি অ্যাসিটাইলেশন সাইট। টিস্যু বিতরণ এক্সপ্রেশন ডেটা ফুসফুস, মস্তিষ্ক এবং মেরুদণ্ডের টিস্যুতে সবচেয়ে উল্লেখযোগ্যভাবে অভিব্যক্তি নির্দেশ করে। বাইন্ডিং অংশীদার সিডিকেএন2ডি, এইচএসএফ2বিপি, কেআরটি31 এবং কেআরটি34 দুটি হাইব্রিড প্রি পুলিং পদ্ধতি এবং দুটি হাইব্রিড অ্যারে দ্বারা সি5ওআরএফ49-এর বাইন্ডিং অংশীদার হিসাবে পাওয়া গেছে। প্রজাতি বিতরণ C5orf49 স্তন্যপায়ী প্রাণীর মাধ্যমে সংরক্ষণ দেখায় এবং ফ্ল্যাটওয়ার্ম এবং সামুদ্রিক অ্যানিমোনে অর্থোলগ পাওয়া যায়। ডানদিকের টেবিলটি ব্লাস্ট ব্যবহার করে পাওয়া কিছু অর্থোলগের বিস্তার দেখায়। C5orf49 স্পঞ্জগুলিতে পাওয়া যায় না, যা 77.7 কোটি বছর আগে (এম. আই. এ) গড় তারিখে বিচ্ছিন্ন হয়েছিল এবং এটি তার সবচেয়ে দূরবর্তী অর্থোলগ 736 এম. আই. এ-তে পাওয়া যায়। অতএব, C5orf49 777 এম. আই. এ এবং 736 এম. আই. এ-এর মধ্যে একটি জিন হিসাবে বিচ্ছিন্ন হয়। সাইটোক্রোম সি এবং ফাইব্রিনোজেন আলফার তুলনায় বিবর্তন সি5ওআরএফ49 সময়ের সাথে সাথে দ্রুত বা ধীর বিবর্তনের হার দেখায় না। এটি ডানদিকে প্রোটিন ডাইভারজেন্স গ্রাফ দ্বারা দেখানো হয়েছে। রেফারেন্স মানব ক্রোমোজোমের উপর জিন 5