GPATCH2L
GPATCH2L (জি-প্যাচ ডোমেইন কনটেইনিং 2 লাইক) হল একটি প্রোটিন যা 14q24.3 এ অবস্থিত GPATCH2L মানব জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। মানুষের মধ্যে, GPATCH2L (NM _ 07926)-এ mRNA-র দৈর্ঘ্য হল 14,021 বেস জোড়া এবং chr14:76,151,922-76,214,343-এর মধ্যে জিন স্প্যান বেস হল 62,422 nt। GPATCH2L পজিটিভ স্ট্র্যান্ডে রয়েছে। আই. এফ. টি. 43 হল পজিটিভ স্ট্র্যান্ডে জি. পি. এ. টি. সি. এইচ. 2. এল-এর ঠিক আগের জিন এবং এল. ও. সি. 105370575 হল নেগেটিভ স্ট্র্যান্ডের বৈশিষ্ট্যহীন জিন, যা জি. পি. এ. টি. সি. এইচ. 2. এল-এর প্রায় দেড় আকারের। GPATCH2L-এর পরিচিত উপনামে C14orf118, FLJ20689, FLJ10033 এবং KIAA1152 রয়েছে। GPATCH2L 28টি স্বতন্ত্র ইন্ট্রন (27 জি. টি-এ. জি, 1 জি. সি-এ. জি), 17টি ভিন্ন এম. আর. এন. এ, 14টি বিকল্পভাবে বিভক্ত রূপ এবং 3টি অব্যবহৃত রূপ তৈরি করে। এর 5টি সম্ভাব্য বিকল্প প্রবর্তক, 7টি বৈধ পলিঅ্যাডেনাইলেশন সাইট এবং বিভিন্ন দৈর্ঘ্যের 6টি ভবিষ্যদ্বাণীকৃত প্রবর্তক রয়েছে। প্রতিলিপি বৈচিত্র্য GPATCH2L হোমো স্যাপিয়েন্সে 23টি ভিন্ন প্রতিলিপি বৈচিত্র্য রয়েছে। সবচেয়ে সাধারণ হল প্রতিলিপি বৈকল্পিক 1 এবং প্রতিটি প্রতিলিপি বৈকল্পিক বিভিন্ন এক্সন ব্যবহার করে। প্রোটিন জি. পি. এ. টি. সি. এইচ. 2এল মানব প্রোটিনের (এন. পি. 060396) আণবিক ওজন 54,260 ডি. এ এবং এতে 482টি অ্যামিনো অ্যাসিড রয়েছে যার একটি পূর্বাভাসকৃত আইসোইলেক্ট্রিক পয়েন্ট 8.77। এর 17টি ভিন্ন আইসোফর্ম রয়েছে এবং সবচেয়ে সাধারণ হল আইসোফর্ম 1। প্রতিটি মানব GPATCH2L আইসোফর্মের একটি GPATCH2L ডোমেন রয়েছে, তবে নীচের পরিকল্পিত চিত্রে দেখা যায় এমন অন্য কোনও উল্লেখযোগ্য ছোট পুনরাবৃত্তি পাওয়া যায়নি। এছাড়াও, হিউম্যান প্রোটিন অ্যাটলাস থেকে আই. এইচ. সি-তে হিউম্যান প্রোস্টেট জি. পি. এ. টি. সি. এইচ2এল অ্যান্টিবডি (এইচ. পি. এ018856)-এর ইমিউনোহিস্টোকেমিক্যাল স্টেনিং অনুসারে, প্রোস্টেট টিস্যুতে মানব জি. পি. এ. টি. সি. এইচ2এল প্রোটিন গ্রন্থির কোষে স্বতন্ত্র ইতিবাচকতা প্রকাশ করে। মাধ্যমিক এবং তৃতীয় কাঠামো দুটি পরিসংখ্যান আলফাফোল্ড থেকে GPATCH2L মানব প্রোটিনের ভবিষ্যদ্বাণীকৃত তৃতীয় কাঠামো দেখায়। চারটি আলফা হেলিক্স বান্ডিল এবং দুটি বিটা শীট পর্যবেক্ষণযোগ্য এবং এগুলি ধারণাগত অনুবাদে ব্যাখ্যা করা হয়েছে। আন্তঃক্রিয়াশীল প্রোটিন জিপিএটিসিএইচ2এল মানব প্রোটিন নিউক্লিওলাস এবং নিউক্লিয়াসের মধ্যে কেআরআর1, ডিডিএক্স10 এবং এনওএল6-এর সাথে মিথস্ক্রিয়া করে বলে জানা যায়। জিন স্তর নিয়ন্ত্রণ প্রোমোটার GPATCH2L মানব জিনের একটি প্রোমোটার [GXP _ 207451] ch 14:76150912-76151972-এ অবস্থিত। প্রবর্তকের দৈর্ঘ্য 1061 বিপি। ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর বাইন্ডিং সাইটগুলি নীচের সারণিতে, 5টি ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর [কে. এল. এফ. এস, এইচ. ও. এম. এফ, এস. পি1এফ, জেড. এফ02 এবং এন. এফ. কে. বি] ট্রান্সক্রিপশন নিয়ন্ত্রক অঞ্চলের একটি সংরক্ষিত বিভাগের মধ্যে আবদ্ধ হওয়ার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। টেবিলের 19টি ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরের বিপরীতে, এমএজেডএফ শুধুমাত্র কার্টিলেজ এবং কঙ্কাল টিস্যুতে বিশেষভাবে সক্রিয়। এছাড়াও, পি. এল. এ. জি শুধুমাত্র অস্থি মজ্জা কোষ, পরিপাকতন্ত্র, ভ্রূণ কাঠামো, অন্তঃস্রাবী তন্ত্র, জীবাণু কোষ এবং হেমাটোপোয়েটিক সিস্টেমে বিশেষভাবে সক্রিয়। বেশিরভাগ ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর ডিম্বাশয়, ফুসফুস, মস্তিষ্ক, প্রস্টেট, অস্থি মজ্জা কোষে সক্রিয়, যা এনসিবিআই-এর জিন ডাটাবেস রেকর্ড থেকে আরএনএ-সেকিউ ডেটাতে সর্বোচ্চ মান দেখায়। এনসিবিআই-এ টিস্যু-নির্দিষ্ট প্রোটিন-কোডিং জিন সনাক্ত করতে 27টি বিভিন্ন টিস্যুর প্রতিনিধিত্বকারী 95 জন মানুষের টিস্যু নমুনার উপর ট্রান্সক্রিপ্ট স্তর নিয়ন্ত্রণ এক্সপ্রেশন প্যাটার্ন আরএনএ-সেকিউ করা হয়েছিল। জি. পি. এ. টি. সি. এইচ2এল মানব এম. আর. এন. এ-তে অস্থি মজ্জা, অণ্ডকোষ এবং মস্তিষ্কের টিস্যুর মধ্যে আর. এন. এ-এস. কিউ তথ্য উচ্চ অভিব্যক্তি দেখায়। নিম্ন অভিব্যক্তি সহ টিস্যুগুলি হল অগ্ন্যাশয়, যকৃত এবং লালা গ্রন্থি। সমস্ত টিস্যু জুড়ে এনসিবিআই জিইও প্রোফাইল টিস্যুতে উল্লেখযোগ্যভাবে বিভিন্ন জিন অভিব্যক্তি এনসিবিআই জিইও থেকে জিপিএটিসিএইচ2এল হোমো স্যাপিয়েন্সে একটি মাইক্রো অ্যারে-মূল্যায়ন টিস্যু এক্সপ্রেশন প্যাটার্নে (জিডিএস 596) দেখানো হয়েছে। জি. ডি. এস 596-এ সেরিবেলাম, ভ্রূণের মস্তিষ্ক, অস্থি মজ্জা, ডিম্বাশয়, প্রস্টেট এবং ফুসফুসের টিস্যুতে উচ্চ জিন অভিব্যক্তি অত্যন্ত কম। যাইহোক, লিভার, অগ্ন্যাশয়, লালা গ্রন্থি এবং ভ্রূণের লিভার টিস্যুতে জিন অভিব্যক্তি প্রতিটি জিন ডাটাবেস রেকর্ডে কম থাকে। এনসিবিআই জিইও-তে একটি গ্রাফকে নিম্নরূপ ব্যাখ্যা করা যেতে পারেঃ একটি 'একক চ্যানেল' নমুনার অর্থ হল একটি সংকরকরণ যেখানে একটি জৈব উৎস থেকে প্রাপ্ত সিডিএনএ অ্যারের সাথে মিলিত হয়। এই পদ্ধতিটি সাধারণত রেডিওনিউক্লিওটাইড লেবেল সহ মেমব্রেন (ফিল্টার) অ্যারে এবং ফ্লুরোসেন্ট লেবেল সহ উচ্চ ঘনত্বের অলিগোনিউক্লিওটাইড অ্যারেগুলির জন্য ব্যবহৃত হয়। এই পরীক্ষার ধরণটি জিন অভিব্যক্তির পরিমাপ করে, যা স্কেল করা/স্বাভাবিক সংকেত গণনা মান হিসাবে সংজ্ঞায়িত করা হয় যা নীচের টেবিল এবং সঠিক পরিসংখ্যানে "মান" এর সাথে মিলে যায়। মানব জি. পি. এ. টি. সি. এইচ. 2 এল (5 'ইউ. টি. আর)-এর নিউক্লিক অ্যাসিড গৌণ কাঠামো একটি স্টেম-লুপ, ইনফ্রেম স্টপ কোডন, স্টার্ট কোডন এবং এক্সন সীমানা দেখায়। এই স্টেম-লুপে, জি এবং জি সংযুক্ত নয়। যাইহোক, এগুলি এই স্টেম-লুপ অঞ্চলের একাধিক ক্রম বিন্যাসে সংরক্ষিত রয়েছে। 3 'ইউটিআর চিত্রে, 10টি স্টেম-লুপ রয়েছে এবং এগুলি অন্য চিত্রে জুম করা হয়েছে। যদিও 3-3), 3-6), 3-9) অদ্ভুত কাঠামো দেখায় (3: সিসিটিটি, 6: সিএটি, টিটিসি, 9: জিটিজি), প্রতিটি অক্ষর তার একাধিক ক্রম বিন্যাসে সংরক্ষিত থাকে। বিশেষত, 3-8) এর স্টেম-লুপে এইচ. এস. এ-এম. আই. আর. এন. এ-205 অন্তর্ভুক্ত রয়েছে এবং এইচ. এস. এ-এম. আই. আর. এন. এ-205-এর প্রতিটি অক্ষর একাধিক ক্রম বিন্যাসে সংরক্ষিত রয়েছে। প্রোটিন স্তর নিয়ন্ত্রণ ইমিউনোকেমিস্ট্রি (আই. এইচ. সি) জি. পি. এ. টি. সি. এইচ2এল প্রোটিন হাড়ের মজ্জার টিস্যুতে অত্যন্ত প্রকাশ পায়, দ্য হিউম্যান প্রোটিন অ্যাটলাস থেকে আই. এইচ. সি-তে হাড়ের মজ্জার টিস্যু জি. পি. এ. টি. সি. এইচ2এল অ্যান্টিবডি (এইচ. পি. এ018856)-এ মানব হেমাটোপোয়েটিক কোষের ইমিউনোহিস্টোকেমিক্যাল স্টেনিং অনুসারে। এছাড়াও, এটি দেখিয়েছে যে GPATCH2L প্রোটিন ব্রঙ্কাস টিস্যুতে মানব শ্বাসযন্ত্রের এপিথেলিয়াল কোষ এবং এন্ডোমেট্রিয়াল স্ট্রোমায় মানব কোষ এবং এন্ডোমেট্রিয়াম টিস্যুতে গ্রন্থিযুক্ত কোষে অত্যন্ত প্রকাশিত হয়। হিউম্যান প্রোটিন অ্যাটলাস এবং থার্মো ফিশার সায়েন্টিফিকের জিপিএটিসিএইচ2এল অ্যান্টিবডি স্টেনিং অনুসারে, প্রোটিনের স্থানীয়করণ এবং প্রাচুর্য জিপিএটিসিএইচ2এল হোমো স্যাপিয়েন্স প্রোটিন মূলত নিউক্লিওপ্লাজমের সাথে স্থানীয়করণ করা হয়। এছাড়াও, এক্সপাসির পি. এস. ও. আর. টি 2 এবং পি. আই/এম. ডব্লিউ টুল অনুসারে, জি. পি. এ. টি. সি. এইচ 2 এল মানব প্রোটিনের <আই. ডি 1> নিউক্লিয়াসে অবস্থিত হওয়ার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। অন্যান্য মানব প্রোটিনের তুলনায় জি. পি. এ. টি. সি. এইচ2এল মানব প্রোটিন আইসোলিউসিন দরিদ্র (আই-), সেরিন সমৃদ্ধ (এস +) এবং আর্জিনিন সমৃদ্ধ (আর +)। অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তন সাইটগুলি [ও-গ্যালএনএসি (মিউসিন-টাইপ) গ্লাইকোসাইলেশন, 0-(বিটা)-জিএলসিএনএসি, এন-গ্লাইকোসাইলেশন, ও-গ্লাইকোসাইলেশন এবং ফসফোরাইলেশন] ধারণাগত অনুবাদে উল্লেখ করা হয়েছে। উইকিপিডিয়ার ধারণাগত অনুবাদ পরিসংখ্যানে কেবল 1,560 বিপি এমআরএনএ এবং 482 অ্যামিনো অ্যাসিড রয়েছে। হোমোলজি এবং বিবর্তন অর্থোলগস এবং প্যারালগস জিপিএটিসিএইচ2এল হোমো সেপিয়েন্সের স্তন্যপায়ী প্রাণী, সরীসৃপ, উভচর প্রাণী, মলুস্কা, আর্থ্রোপোডা, অ্যাভে, ফিশ এবং অমেরুদণ্ডী প্রাণীতে অর্থোলগস রয়েছে। গ্রুপটি হোমো স্যাপিয়েন্স থেকে আরও দূরবর্তী অর্থোলগে পরিবর্তিত হওয়ার সাথে সাথে মানগুলি [অনুসন্ধান কভার মান (%), ক্রম পরিচয় (%), এবং ক্রমের সাদৃশ্য (%)] হ্রাস পায়, যেমন অমেরুদণ্ডী প্রাণী। যাইহোক, ব্যাঙগুলি অস্বাভাবিক কারণ তাদের খুব কম অনুক্রম পরিচয় (36.8%-38.0%) রয়েছে। এছাড়াও, ছত্রাক এবং ব্যাকটেরিয়ার যে শ্রেণীতে GPATCH2L হোমোলোগ রয়েছে তা NCBI হোমোলোগিন ব্যবহার করে খুঁজে পাওয়া যায়নি। এনসিবিআই হোমোলজিন ব্যবহার করে জিপিএটিসিএইচ2এল হোমো স্যাপিয়েন্সের প্যারালগগুলি পাওয়া গেছে। নীচের সারণিতে, এমওয়াইএ মানে "মিলিয়ন ইয়ারস অ্যাগো" এবং সংশোধিত বিচ্যুতির সমীকরণ [এম] হল 100 * (-এলএন (ক্রমের সাদৃশ্য (%))। বিবর্তন GPATCH2L ফাইব্রিনোজেন আলফা চেইনের তুলনায় আরও ধীরে ধীরে বিবর্তিত হয় তবে সাইটোক্রোম সি-এর চেয়ে দ্রুত। GPATCH2L প্রোটিনের শিকড়হীন গাছে, শুধুমাত্র একটি স্তন্যপায়ী (মানুষ) অন্তর্ভুক্ত করা হয় কারণ স্তন্যপায়ী প্রাণীর প্রতিটি প্রজাতি একে অপরের সাথে খুব ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত, যা বিভিন্ন সংক্ষিপ্ত রেখা দেখায়। অমেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে আর্থ্রোপোডা দীর্ঘতম রেখা দেখায়, যার অর্থ তারা দীর্ঘতম বিচ্ছিন্ন হয়েছে। দূরবর্তী হোমোলোগস জিপিএটিসিএইচ2এল নেই এমন নিকটতম জীবগুলি নিম্নরূপঃ সরীসৃপে, কুমির, কচ্ছপ, সাপ, গিরগিটি, গেকোতে জিপিএটিসিএইচ2এল হোমোলোগগুলি এনসিবিআই ব্লাস্ট ব্যবহার করে পাওয়া গেছে, যেখানে স্কিঙ্ক, গিরগিটি এবং ইগুয়ানায় কোনও হোমোলোগ ছিল না। উভচর প্রাণীদের মধ্যে, এনসিবিআই ব্লাস্ট ব্যবহার করে ব্যাঙ, টোড এবং সালামান্ডারে জিপিএটিসিএইচ2এল হোমোলগ পাওয়া গেছে, অন্যদিকে অন্যান্য ধরনের উভচর প্রাণী, যেমন সিসিলিয়ান, মাইক্রোসরিয়া এবং ল্যাবিরিন্থোডন্টিয়ায় জিপিএটিসিএইচ2এল জিন নেই। অমেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে, এনসিবিআই ব্লাস্ট দেখায় যে স্ক্যালপ, স্টারফিশ, অক্টোপাস, মাকড়সার জিপিএটিসিএইচ2এল জিন রয়েছে, তবে স্পঞ্জ এবং জেলিফিশের নেই। সবশেষে, এনসিবিআই ব্লাস্টের মতে, ছত্রাক এবং ব্যাকটেরিয়ায় কোনও জিপিএটিসিএইচ2এল হোমোলগ নেই। ফাংশন এবং বায়োকেমিস্ট্রি GPATCH2L-এর ফাংশন এখনও অজানা; তবে, প্যারালগ GPATCH3 স্তন্যপায়ী প্রাণীর মধ্যে সহজাত ইমিউন প্রতিক্রিয়ায় অংশগ্রহণ করতে দেখা গেছে। জিপিএটিসিএইচ 3 নেতিবাচকভাবে আরএলআর-মধ্যস্থ সহজাত অ্যান্টিভাইরাল প্রতিক্রিয়া নিয়ন্ত্রণ করে, যা ভিসা সিগন্যালোসোম সমাবেশকে ব্যাহত করে। এটি চক্ষু এবং ক্র্যানিওফেশিয়াল বিকাশেও অংশগ্রহণ করতে দেখা গেছে। বৈধতা গোষ্ঠী অনুসারে, মানব জিপিএটিসিএইচ2এল অঞ্চলের মধ্যে একটি এসএনপি (আরএস935332) স্ক্লেরোডার্মা রেনাল ক্রাইসিসের (এসআরসি) সাথে সম্পর্কিত। রেনাল বায়োপসি বিভাগের ইমিউনোস্টেনিং সম্পর্কিত এসএনপি-র জন্য কোনও জেনেটিক প্রতিলিপির অনুপস্থিতি সত্ত্বেও জিপিএটিসিএইচ2এল-এর টিউবুলার এক্সপ্রেশন বৃদ্ধি দেখায়। রেটিনাইটিস পিগমেন্টোসা 24 এই জিনের সাথে যুক্ত রোগগুলির মধ্যে একটি। ক্যান্সারে জি. পি. এ. টি. সি. এইচ. 2. এল-এর অভিব্যক্তি নিম্নরূপঃ অগ্ন্যাশয়ের ক্যান্সারের কয়েকটি ক্ষেত্রে শক্তিশালী ইমিউনোরিয়েক্টিভিটি প্রদর্শিত হয়, যেখানে ম্যালিগন্যান্ট লিম্ফোমা, কোলোরেক্টাল, স্তন এবং প্রস্টেট ক্যান্সারগুলি নেতিবাচক বা দুর্বলভাবে দাগযুক্ত ছিল। বেশিরভাগ স্তন ক্যান্সারের ক্ষেত্রে জি. পি. এ. টি. সি. এইচ 2 অতিরিক্তভাবে প্রকাশিত হয় কারণ এটি একটি পারমাণবিক উপাদানকে এনকোড করে যা স্তন ক্যান্সার এবং শুক্রাণু উৎপাদনের সময় টিউমার বৃদ্ধির জন্য গুরুত্বপূর্ণ হতে পারে। এইচ. পি. আর. পি. 43 (একটি আর. এন. এ-নির্ভর এ. টি. পি. এস) এবং জি. পি. এ. টি. সি. এইচ. 2 প্রোটিনের মিথস্ক্রিয়া এইচ. পি. আর. পি. 43-এর এ. টি. পি. এস ক্রিয়াকলাপকে ব্যাপকভাবে উন্নত করে এবং স্তন্যপায়ী কোষের উপর বৃদ্ধি-প্রচারকারী প্রভাব সৃষ্টি করে। যেহেতু GPATCH2 উপন্যাস ক্যান্সার/টেস্টিস অ্যান্টিজেন হতে পারে, সাধারণ মানব অঙ্গগুলির নর্দান ব্লট বিশ্লেষণ অনুসারে, GPATCH2-কে লক্ষ্য করা বা hPrp43 এবং GPATCH2-এর মধ্যে মিথস্ক্রিয়া প্রতিরোধ করা স্তন ক্যান্সারের জন্য একটি থেরাপিউটিক কৌশল হতে পারে। রেফারেন্স মানব ক্রোমোজোমের উপর জিন 14