Tandem mass tag
ট্যান্ডেম মাস ট্যাগ (টিএমটি) হল একটি রাসায়নিক লেবেল যা মাস স্পেকট্রোমেট্রি (এমএস)-ভিত্তিক পরিমাপ এবং প্রোটিন, পেপটাইড এবং নিউক্লিক অ্যাসিডের মতো জৈবিক ম্যাক্রোমোলিকুল সনাক্তকরণে নমুনা মাল্টিপ্লেক্সিংকে সহজতর করে। টিএমটি আইসোবারিক ভর ট্যাগ হিসাবে পরিচিত বিকারকগুলির একটি পরিবারের অন্তর্গত যা একই ভরযুক্ত অণুগুলির একটি সেট, তবে খণ্ডিত হওয়ার পরে বিভিন্ন ভরের রিপোর্টার আয়ন উৎপন্ন করে। পরিমাপ করা রিপোর্টার আয়নগুলির আপেক্ষিক অনুপাত ট্যাগ করা অণুর আপেক্ষিক প্রাচুর্যের প্রতিনিধিত্ব করে, যদিও আয়ন দমন নির্ভুলতার উপর ক্ষতিকারক প্রভাব ফেলে। এই জটিলতা সত্ত্বেও, টিএমটি-ভিত্তিক প্রোটিওমিক্স লেবেল-মুক্ত পরিমাপের তুলনায় উচ্চতর নির্ভুলতা বহন করতে দেখা গেছে। প্রোটিনের পরিমাণ নির্ধারণে সহায়তা করার পাশাপাশি, টিএমটি ট্যাগগুলি আরপিএলসি-এমএস বিশ্লেষণে ফসফোপেপটাইডের মতো কিছু উচ্চ হাইড্রোফিলিক বিশ্লেষকের সনাক্তকরণ সংবেদনশীলতাও বাড়িয়ে তুলতে পারে। বর্তমানে টিএমটির ছয়টি প্রকার রয়েছেঃ টিএমটি জিরো, একটি অ-আইসোটোপিকাল প্রতিস্থাপিত মূল কাঠামো; টিএমটি ডুপ্লেক্স, একক আইসোটোপিক প্রতিস্থাপন সহ ভর ট্যাগের একটি আইসোবারিক জোড়া; টিএমটি সিক্সপ্লেক্স, পাঁচটি আইসোটোপিক প্রতিস্থাপন সহ ছয়টি ভর ট্যাগের একটি আইসোবারিক সেট; টিএমটি 10-প্লেক্স-10টি আইসোটোপিক ভর ট্যাগের একটি সেট যা টিএমটি সিক্সপ্লেক্স রিপোর্টার অঞ্চল ব্যবহার করে, তবে 0.0063 ডিএর ভর পার্থক্য তৈরি করতে বিভিন্ন মৌলিক আইসোটোপ ব্যবহার করে, টিএমটিপ্রো মূল টিএমটি এবং টিএমটিপ্রো জিরোর চেয়ে আলাদা রিপোর্টার এবং ভর নরমালাইজার সহ একটি 16 প্লেক্স সংস্করণ। ট্যাগগুলিতে চারটি অঞ্চল রয়েছে, যথা একটি মাস রিপোর্টার অঞ্চল (এম), একটি ক্লিভেবল লিঙ্কার অঞ্চল (এফ), একটি ভর স্বাভাবিকীকরণ অঞ্চল (এন) এবং একটি প্রোটিন প্রতিক্রিয়াশীল গোষ্ঠী (আর)। সমস্ত ট্যাগের রাসায়নিক কাঠামো অভিন্ন তবে প্রত্যেকটিতে বিভিন্ন অবস্থানে প্রতিস্থাপিত আইসোটোপ রয়েছে, যেমন ভর রিপোর্টার এবং ভর স্বাভাবিকীকরণ অঞ্চলে প্রতিটি ট্যাগে বিভিন্ন আণবিক ভর থাকে। ট্যাগগুলির সম্মিলিত এম-এফ-এন-আর অঞ্চলের মোট আণবিক ওজন এবং কাঠামো একই থাকে যাতে ক্রোমাটোগ্রাফিক বা ইলেক্ট্রোফোরেটিক পৃথকীকরণের সময় এবং একক এমএস মোডে, বিভিন্ন ট্যাগ সহ লেবেলযুক্ত অণুগুলি অবিচ্ছেদ্য হয়। এমএস/এমএস মোডে খণ্ডিত হওয়ার পরে, পেপটাইডের পিঠের হাড়ের খণ্ডিতকরণ থেকে ক্রমের তথ্য পাওয়া যায় এবং পরিমাণের তথ্য একই সাথে ট্যাগগুলির খণ্ডিতকরণ থেকে প্রাপ্ত হয়, যা গণ রিপোর্টার আয়নগুলির জন্ম দেয়। লেবেলযুক্ত পেপটাইডের পরিমাণ নির্ধারণ টিএমটি ট্যাগগুলির কাঠামো unimod.org-এ ইউনিমোড ডাটাবেসের মাধ্যমে সর্বজনীনভাবে উপলব্ধ এবং তাই ম্যাসকটের মতো মাস স্পেকট্রোমেট্রি সফ্টওয়্যার ট্যাগ ভরের জন্য অ্যাকাউন্ট করতে সক্ষম। উপরন্তু, সংস্করণ 2.2 অনুযায়ী, মাস্কটের অতিরিক্ত সফ্টওয়্যার ব্যবহার না করে টিএমটি এবং অন্যান্য আইসোবারিক ভর ট্যাগ ব্যবহার করে পরিমাপ করার ক্ষমতা রয়েছে। স্বজ্ঞাতভাবে, একটি প্রোটিন পরিমাপের সাথে সম্পর্কিত বিশ্বাস বিভিন্ন পেপটাইড থেকে অনুপাতের সাদৃশ্য এবং এই পরিমাপের সংকেত স্তরের উপর নির্ভর করে। বি. এ. সি. আই. কিউ নামে একটি গাণিতিকভাবে কঠোর পদ্ধতি আবির্ভূত হয়েছে, যা পেপটাইডের তীব্রতা এবং পেপটাইড-পরিমাপ চুক্তিকে প্রোটিন অনুপাতের জন্য আত্মবিশ্বাসের ব্যবধানের মধ্যে সংহত করে। টি. কে. ও মানটি হস্তক্ষেপ মূল্যায়ন করতে ব্যবহার করা যেতে পারে আইসোবারিক ক্যারিয়ার ধারণা টি. এম. টি ট্যাগগুলি সাধারণত সমান প্রাচুর্যের নমুনাগুলিকে লেবেল করতে ব্যবহৃত হয়। যদি লেবেলযুক্ত নমুনাগুলির মধ্যে একটি বেশি পরিমাণে থাকে, তবে এটি সমস্ত নমুনার জন্য বিশ্লেষণের সংবেদনশীলতা বাড়িয়ে তুলতে পারে। এই ধরনের আইসোবারিক লেবেলযুক্ত নমুনাগুলিকে আইসোবারিক বাহক হিসাবে উল্লেখ করা হয়। এগুলি ভর স্পেকট্রোমেট্রি দ্বারা একক-কোষ প্রোটিন বিশ্লেষণের জন্য চালু করা হয়েছিল এবং অন্যান্য অনেক প্রয়োগ খুঁজে পেয়েছে। তথ্যসূত্র বায়োকেমিস্ট্রি সনাক্তকরণ পদ্ধতি বায়োটেকনোলজি মাস স্পেকট্রোমেট্রি