Non-stop decay
নন-স্টপ ডিকে (এন. এস. ডি) হল এম. আর. এন. এ নজরদারির একটি সেলুলার প্রক্রিয়া যা স্টপ কোডনের অভাবযুক্ত এম. আর. এন. এ অণুগুলি সনাক্ত করতে এবং এই এম. আর. এন. এগুলিকে অনুবাদ থেকে প্রতিরোধ করতে পারে। অবিরাম ক্ষয়ের পথটি রাইবোজোমগুলি ছেড়ে দেয় যা একটি এমআরএনএর সুদূর 3 'প্রান্তে পৌঁছেছে এবং এমআরএনএকে এক্সোজোম কমপ্লেক্সে বা ব্যাকটেরিয়ায় নির্বাচিত অবক্ষয়ের জন্য আরএনএজ আর-এ গাইড করে। ননসেন্স-মিডিয়েটেড ক্ষয় (এন. এম. ডি)-এর বিপরীতে, পলিপেপটাইডগুলি রাইবোজোম থেকে মুক্তি পায় না এবং এইভাবে, এন. এস. ডি এন. এম. ডি থেকে পৃথক এম. আর. এন. এ ক্ষয়ের কারণগুলির সাথে জড়িত বলে মনে হয়। নন-স্টপ ডিকে (এন. এস. ডি) হল একটি সেলুলার পাথওয়ে যা একটি সঠিক স্টপ কোডন ধারণ করে না এমন অস্বাভাবিক এম. আর. এন. এ প্রতিলিপিগুলি সনাক্ত করে এবং অবনমিত করে। স্টপ কোডন হল বার্তাবাহক আর. এন. এ-তে সংকেত যা প্রোটিনের সংশ্লেষণ শেষ হওয়ার সংকেত দেয়। আবেরান্ট প্রতিলিপিগুলি অনুবাদের সময় চিহ্নিত করা হয় যখন রাইবোজোমটি এমআরএনএর 3 'প্রান্তে পলি এ লেজে রূপান্তরিত হয়। একটি নন-স্টপ ট্রান্সক্রিপ্ট ঘটতে পারে যখন পয়েন্ট মিউটেশন স্বাভাবিক স্টপ কোডনের ক্ষতি করে। উপরন্তু, কিছু প্রতিলিপিগত ঘটনা নির্দিষ্ট রাজ্যে কম মাত্রায় জিন অভিব্যক্তি সংরক্ষণ করার সম্ভাবনা বেশি। এন. এস. ডি পথটি এম. আর. এন. এ-র 3 'প্রান্তে আটকে থাকা রাইবোজোমগুলিকে নির্গত করে এবং এম. আর. এন. এ-কে ইউক্যারিওটসে এক্সোজোম জটিল বা ব্যাকটেরিয়ায় আর. এন. এ. এস. আর-এর দিকে পরিচালিত করে। একবার তাদের উপযুক্ত স্থানে নির্দেশিত হলে, প্রতিলিপিগুলি তখন অবনমিত করা হয়। এনএসডি পদ্ধতির জন্য স্কি কমপ্লেক্সের সাথে আরএনএ এক্সোজোমের মিথস্ক্রিয়া প্রয়োজন, একটি বহু-প্রোটিন কাঠামো যার মধ্যে স্কি2পি হেলিকেজ এবং (উল্লেখযোগ্যভাবে) স্কি7পি রয়েছে। এই প্রোটিনগুলির সংমিশ্রণ এবং পরবর্তী জটিল গঠন অস্বাভাবিক এম. আর. এন. এ-র অবক্ষয়কে সক্রিয় করে। স্কি7পি এম. আর. এন. এ পলি (এ) লেজের 3 'প্রান্তে আটকে থাকা রাইবোজোমকে আবদ্ধ করে এবং অস্বাভাবিক এম. আর. এন. এ-কে অবনমিত করার জন্য এক্সোজোম নিয়োগ করে বলে মনে করা হয়। তবে স্তন্যপায়ী কোষে স্কি7পি পাওয়া যায় না এবং এমনকি এনএসডি পদ্ধতির উপস্থিতিও তুলনামূলকভাবে অস্পষ্ট রয়ে গেছে। এইচবিএস1এল (এইচবিএস1এলভি3)-এর সংক্ষিপ্ত স্প্লাইসিং আইসোফর্মটি স্কি7পি-এর দীর্ঘ-চাওয়া মানব সমরূপ হিসাবে পাওয়া গেছে, যা এক্সোজোম এবং এসকেআই কমপ্লেক্সগুলিকে সংযুক্ত করে। সম্প্রতি, জানা গেছে যে এনএসডি স্তন্যপায়ী কোষেও ঘটে, যদিও কিছুটা ভিন্ন পদ্ধতির মাধ্যমে। স্তন্যপায়ী প্রাণীদের মধ্যে, স্কি7-এর অনুপস্থিতির কারণে, জিটিপিজ এইচবিএস1, পাশাপাশি এর বন্ধনকারী অংশীদার ডম34-কে ক্ষয়ের সম্ভাব্য নিয়ন্ত্রক হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছিল। একসাথে, এইচবিএস1/ডম34 একটি ভুল-নিয়ন্ত্রিত এমআরএনএর 3 'প্রান্তে বাঁধতে সক্ষম, যা অনুবাদ প্রক্রিয়াটি পুনরায় শুরু করার জন্য ত্রুটিপূর্ণ বা নিষ্ক্রিয় রাইবোজোমের বিচ্ছিন্নতা সহজতর করে। উপরন্তু, একবার এইচবিএস1/ডম34 কমপ্লেক্স একটি রাইবোজোমকে বিচ্ছিন্ন ও পুনর্ব্যবহার করেছে, এটি এক্সোজোম/স্কি কমপ্লেক্স নিয়োগ করতেও দেখানো হয়েছে। ব্যাকটেরিয়ায়, ট্রান্স-ট্রান্সলেশন, একটি অত্যন্ত সংরক্ষিত প্রক্রিয়া, অবিরাম আরএনএ সঞ্চয়ের সরাসরি পাল্টা হিসাবে কাজ করে, ক্ষয়কে প্ররোচিত করে এবং অনিয়ন্ত্রিত রাইবোজোমকে মুক্ত করে। মূলত এসচেরিচিয়া কোলাইতে আবিষ্কৃত, ট্রান্স-ট্রান্সলেশন প্রক্রিয়াটি ট্রান্সফার-মেসেঞ্জার আরএনএ (টি. এম. আর. এন. এ) এবং কোফ্যাক্টর প্রোটিন এস. এম. পি. বি-এর মধ্যে মিথস্ক্রিয়া দ্বারা সম্ভব হয়, যা টি. এম. আর. এন. এ-কে স্থবির রাইবোজোমের সাথে স্থিতিশীল বাঁধনের অনুমতি দেয়। বর্তমান টি. এম. আর. এন. এ মডেলে বলা হয়েছে যে টি. এম. আর. এন. এ এবং এস. এম. পি. বি টি. আর. এন. এ অনুকরণ করার জন্য একসাথে যোগাযোগ করে। এস. এম. পি. বি প্রোটিন থেমে যাওয়ার বিন্দুটি শনাক্ত করে এবং টি. এম. আর. এন. এ-কে রাইবোসোমাল এ সাইটের সাথে আবদ্ধ হওয়ার নির্দেশ দেয়। একবার আবদ্ধ হয়ে গেলে, এস. এম. পি. বি চার্জযুক্ত অ্যালানাইন দানের মাধ্যমে অনুপযুক্তভাবে কার্যকরী পলিপেপটাইড চেইনের সাথে একটি ট্রান্সপেপ্টিডেশন প্রতিক্রিয়ায় জড়িত হয়। এই প্রক্রিয়ার মাধ্যমে, স্থগিত এবং ত্রুটিযুক্ত এম. আর. এন. এ ক্রমটি এস. এম. পি. বি আর. এন. এ ক্রম দ্বারা প্রতিস্থাপিত হয়, যা এম. আর. এন. এ-র সি-টার্মিনাসের উপর একটি 11টি অ্যামিনো অ্যাসিড ট্যাগ যোগ করার জন্য এনকোড করে, যা অবক্ষয়কে উৎসাহিত করে। অ্যামিনো অ্যাসিড ট্যাগ সহ আর. এন. এ-র পরিবর্তিত অংশটি অনুবাদ করা হয় এবং অসম্পূর্ণ বৈশিষ্ট্য প্রদর্শন করে, সতর্ক করে এবং ইন্ট্রাসেলুলার প্রোটিজগুলিকে এই ক্ষতিকারক প্রোটিনের টুকরোগুলি অপসারণ করার অনুমতি দেয়, যার ফলে ক্ষতিগ্রস্ত এম. আর. এন. এ-তে আটকে থাকা রাইবোজোমগুলি আবার কাজ শুরু করে। এম. আর. এন. এ অবক্ষয় অনেক এনজাইম এবং প্রোটিন এম. আর. এন. এ অবক্ষয়ে ভূমিকা পালন করে। উদাহরণস্বরূপ, এসচেরিচিয়া কোলাইতে তিনটি এনজাইম রয়েছেঃ আরএনএজ II, পিএনপিজ এবং আরএনএজ আর. আরএনএজ আর হল একটি 3 '-5' এক্সোরিবোন্যুক্লিয়াস যা একটি ত্রুটিযুক্ত এমআরএনএ হ্রাস করার জন্য নিয়োগ করা হয়। আরএনএজ আর-এর দুটি কাঠামোগত ক্ষেত্র রয়েছে, একটি এন-টার্মিনাল পুটেটিভ হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স (এইচটিএইচ) এবং একটি সি-টার্মিনাল লাইসিন (কে-সমৃদ্ধ) ক্ষেত্র। এই দুটি ক্ষেত্র আরএনএজ আর-এর জন্য অনন্য, এবং প্রোটিনের নির্বাচন এবং নির্দিষ্টতার জন্য নির্ধারণকারী কারণ হিসাবে দায়ী করা হয়। প্রমাণ দেখানো হয়েছে যে কে-সমৃদ্ধ অঞ্চলটি অবিরাম এমআরএনএ-র অবক্ষয়ের সাথে জড়িত। এই ডোমেনগুলি অন্যান্য আরএনএসে উপস্থিত নেই। RNase II এবং RNase R উভয়ই RNR পরিবারের সদস্য, এবং তারা প্রাথমিক ক্রম এবং ডোমেন আর্কিটেকচারে একটি উল্লেখযোগ্য মিল ভাগ করে নেয়। যাইহোক, আরএনএজ আর-এর এমআরএনএ-কে দক্ষতার সাথে হ্রাস করার ক্ষমতা রয়েছে, অন্যদিকে আরএনএজ 2-এর অবক্ষয় প্রক্রিয়ায় কম দক্ষতা রয়েছে। তা সত্ত্বেও, আর. এন. এস. আর-এর মাধ্যমে এম. আর. এন. এ-কে অবনমিত করার নির্দিষ্ট যান্ত্রিকতা একটি রহস্য হিসাবে রয়ে গেছে। রেফারেন্স বাহ্যিক লিঙ্ক ইস্ট এমআরএনএ ক্যাটাবোলিজম জিন এক্সপ্রেশন ডিঃ ননসেন্স-মিডিয়েটেড এমআরএনএ ক্ষয়