Rhodococcus fascians
রোডোকোকাস ফ্যাসিয়ানস (1984 সাল পর্যন্ত কোরিনেব্যাকটেরিয়াম ফ্যাসিয়ান নামে পরিচিত) একটি গ্রাম পজিটিভ ব্যাকটেরিয়াল ফাইটোপ্যাথোজেন যা পাতাযুক্ত পিত্তের রোগ সৃষ্টি করে। আর. ফ্যাসিয়ানস হল রোডোকোকাস গণের একমাত্র ফাইটোপ্যাথোজেনিক সদস্য; এর হোস্ট পরিসরে ডাইকোটাইলডোনস এবং মনোকোটাইলডোনস হোস্ট উভয়ই রয়েছে। যেহেতু এটি সাধারণত তামাক (নিকোটিয়ানা) গাছগুলিকে প্রভাবিত করে, এটি একটি কৃষিগতভাবে গুরুত্বপূর্ণ প্যাথোজেন। ফিজিওলজি এবং মরফোলজি আর. ফ্যাসিয়ান হল অ্যাক্টিনোমাইসেটসের একটি অ্যারোবিক, প্লিওমর্ফিক ব্যাকটেরিয়া যা অ-গতিশীল এবং বীজাণু গঠন করে না। যখন একটি আগর প্লেটের পৃষ্ঠে জন্মায়, উপনিবেশগুলি কমলা রঙের হয় এবং মসৃণ বা রুক্ষ উভয়ই দেখায়। ভাইরুলেন্স আর. ফ্যাসিয়ানস উদ্ভিদের একটি প্যাথোজেন হতে পারে, অ্যাঞ্জিওস্পার্ম বা জিমনোস্পার্ম উভয়ই। সংক্রামিত গাছগুলিতে পাতার বিকৃতি, ডাইনি ঝাড়ু এবং পাতার পিত্তের মতো সাধারণ লক্ষণ দেখা যায়, যা উদ্ভিদের কাল্টিভার, উদ্ভিদের বয়স এবং ব্যাকটেরিয়ার স্ট্রেনের উপর নির্ভর করে। পাতার বিকৃতি প্যারেনকাইমা সম্প্রসারণ এবং ভাস্কুলার সিস্টেমের বৃদ্ধি নিয়ে গঠিত, যার ফলে ল্যামিনে কুঁচকে যায় এবং শিরা প্রশস্ত হয়। পাতাযুক্ত পিত্ত হল এমন একটি পিত্ত যা একটি কুঁড়ি থেকে উদ্ভূত হয় যা স্বাভাবিক পরিস্থিতিতে বিকশিত হয় না। আর. ফ্যাসিয়ানদের সংক্রমণ থেকে আসা সমস্ত প্রভাব উদ্ভিদ কোষের রূপান্তরের উপর নির্ভর করে না (যেমন তারা অ্যাগ্রোব্যাকটেরিয়াম টিউমেফ্যাসিয়েন্স বা অ্যাগ্রোব্যাকটেরিয়াম রাইজোজিনেসের উপর নির্ভর করে), তবে ব্যাকটেরিয়ার ভাইরাস-সম্পর্কিত জিনের অভিব্যক্তি এবং যৌগের উৎপাদনের উপর নির্ভর করে যা উদ্ভিদের স্বাভাবিক বৃদ্ধি এবং বিকাশে হস্তক্ষেপ করতে পারে। সংক্রমণের সময়, আর. ফ্যাসিয়ানরা সাধারণত উদ্ভিজ্জ টিস্যুর বাইরে, উদ্ভিদের কোষ প্রাচীরের একটি জংশন বা গহ্বরের কাছে থাকে, সম্ভবত পরিবেশগত চাপ এড়াতে। কোষের অভ্যন্তরে (পাতা বা গলগুলিতে) এবং এমনকি কোষের দেয়ালের অভ্যন্তরেও আর. ফ্যাসিয়ানদের উপস্থিতি লক্ষ্য করা গেছে। সংক্রামিত উদ্ভিদে আর. ফ্যাসিয়ানদের উপস্থিতি কেবল সংক্রমণের সূচনার জন্যই নয়, তার রক্ষণাবেক্ষণের জন্যও প্রয়োজনীয়। আর. ফ্যাসিয়ানদের মধ্যে ভাইরাসজনিত জিন ভাইরাস একটি প্লাজমিডের উপর জিন দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয় (প্লাজমিডের অভাবযুক্ত স্ট্রেনগুলি মারাত্মক নয়) এবং ক্রোমোজোমের উপর। মুছে ফেলার মিউটেশন ব্যবহার করে, প্লাজমিডের উপর তিনটি লোকাই সনাক্ত করা সম্ভব হয়েছিলঃ ফাস, অ্যাট এবং হাইপ, এবং ক্রোমোজোমের উপর একটি লোকাস, ভিক। এফ. এ. এস হল ছয়টি জিন (ও. আর. এফ 1-6) এবং একটি নিয়ন্ত্রক জিন, এফ. এ. এস. আর দিয়ে তৈরি একটি অপেরন। যেহেতু কিছু এফ. এ. এস জিন মুছে ফেলা একটি অ-ভাইরাল ফেনোটাইপ দেয়, কারণ এফ. এ. এস-এর জন্য ভাইরাসজনিত একটি প্রধান ভূমিকা প্রস্তাব করা হয়েছিল। জিন এফ. এ. এস. আর একটি এ. আর. এ. সি-সদৃশ প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রক। এর প্রতিলিপি নির্দিষ্ট কার্বন উৎস (যেমন গ্লুকোজ, সুক্রোজ, আরাবিনোজ, গ্লিসারল, পাইরুভেট, ম্যানিতোল, ম্যানোজ) বা নাইট্রোজেন উৎস (যেমন হিস্টিডিন) ধারণকারী সংস্কৃতিতে ইন ভিট্রোতে প্ররোচিত হতে পারে এবং কালচার পিএইচ এবং অপটিক্যাল ঘনত্ব দ্বারা প্রভাবিত হয়। এছাড়াও, মারাত্মক স্ট্রেন দ্বারা তৈরি পিত্তের নির্যাস দ্বারা এফ. এ. এস. আর প্ররোচিত হতে পারে। অপেরন সাইটোকিনিন সংশ্লেষণ এবং অবক্ষয়ের (ওআরএফ 4,5,6) সাথে জড়িত জিনের জন্য সংহিতাবদ্ধ করে, বিশেষ করে একটি আইসোপেন্টেনিল ট্রান্সফারেজ, একটি সাইটোকিনিন অক্সিডেস এবং একটি গ্লুটেশন-এস ট্রান্সফারেজের জন্য। ওআরএফ 1,2,3 একটি সাইটোক্রোম 450-এর জন্য প্রতিলিপি করে, একটি ফেরিডক্সিন যা একটি পাইরুভেট ডিহাইড্রোজেনেস আলফা-সদৃশ ডোমেন এবং একটি পাইরুভেট ডিহাইড্রোজেনেস বিটা সাবইউনিট ধারণ করে। মনে করা হয় যে প্রথম তিনটি জিন অপেরনের শেষ তিনটি জিন দ্বারা সঞ্চালিত সাইটোকিনিনের সংশ্লেষণ এবং অবক্ষয়ের জন্য শক্তি সরবরাহ করেঃ আর. ফ্যাসিয়ানরা আসলে জেটিন এবং আইসোপেন্টেনিল অ্যাডেনিন উৎপাদন এবং অবনমিত করতে পারে। যৌগ সাইটোকিন অক্সিডেস (ও. আর. এফ. 4) 6 নম্বর অবস্থানে প্রতিক্রিয়াশীল নাইট্রোজেনের সাথে অ্যাডেনিন তৈরি করতে পারে, যা অন্যান্য পার্শ্বীয় শৃঙ্খলের সাথে বিক্রিয়া করে সাইটোকিনিনের মতো যৌগ তৈরি করতে পারে, যা উদ্ভিদ টিস্যু বৃদ্ধিতে আরও কার্যকর। এটি নয়টি জিন নিয়ে গঠিত একটি অপেরনঃ একটি প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রক, ট্রান্সমেম্ব্রেন স্থানীয়করণের জন্য ডোমেন সহ একটি জিন (সম্ভবত অন্যান্য অ্যাট জিন দ্বারা তৈরি যৌগগুলির রফতানির জন্য প্রয়োজনীয়), এবং বেশ কয়েকটি জিন অ্যাটা-। অনেক বিন্দু এবং Δatt মিউট্যান্ট একটি ক্ষয়প্রাপ্ত ভাইরাস দেখায়। জিন একটি হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স মোটিফ সহ একটি প্রতিলিপিগত উপাদান। এর প্রতিলিপি একই কারণগুলির দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয় যা এফ. এ. এস. আর প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রণ করে, তবে উচ্চতর তীব্রতার সাথে, এটি পরামর্শ দেয় যে, অ্যাট মিউট্যান্টগুলিতে ভাইরাস হ্রাসের সাথে, এটি এফ. এ. এস প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রণ করতে পারে। অ্যাট অপেরনের প্রতিলিপি একটি কোরাম-সংবেদনশীল প্রক্রিয়া দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয়ঃ প্রকৃতপক্ষে, সংস্কৃতির ঘনত্ব এর প্রতিলিপিকে প্রভাবিত করতে পারে এবং অ্যাট মিউট্যান্ট স্ট্রেন দ্বারা তৈরি গল থেকে আসা পাতাযুক্ত পিত্তের নির্যাস এর প্রতিলিপিতে কম কার্যকর। জিন অ্যাটা-এবং এর প্রতিলিপির জন্য প্রয়োজনীয় যৌগগুলির সংশ্লেষণে জড়িত থাকতে পারে। প্রকৃতপক্ষে, এ. টি. এ, এ. টি. ডি এবং এগুলি বিটাল্যাক্টামেজ সংশ্লেষণে জড়িত, তবে কালচার সুপারনেট্যান্টগুলিতে এই যৌগগুলির কোনও চিহ্ন পাওয়া যায়নি। হাইপ একটি আর. এন. এ-হেলিকেজের জন্য সংহিতাবদ্ধ করে; এই জিনের মিউট্যান্টগুলি হাইপারভাইরুলেন্ট। এছাড়াও, হাইপ ভাইরাস-সম্পর্কিত জিনের প্রতিলিপি-পরবর্তী নিয়ন্ত্রণে জড়িত, সম্ভবত এফ. এ. এস পণ্যগুলিতে। অপেরন ভিক হল পাঁচটি জিন দিয়ে তৈরি একটি অপেরন, যা ব্যাকটেরিয়ার ক্রোমোসোমে অবস্থিত। একমাত্র পরিচিত জিন হল ভিকা, অপেরনের চতুর্থ জিন, যার পণ্য হল একটি মাস হোমোলগ, একটি প্রোটিন যা সাইট্রিক অ্যাসিড চক্র থেকে গ্লাইকোসিলেট চক্রে পরিবর্তনের জন্য প্রয়োজনীয়, উভয়ই বিপাকীয় কারণে এবং গ্লাইকোসিলেট জমা এড়ানোর জন্য, যা ব্যাকটেরিয়ার জন্য বিষাক্ত। ভি. আই. সি. এ-তে মিউটেশনগুলি গ্লাইঅক্সিলেট জমা প্রতিরোধ করতে আর. ফ্যাসিয়ানদের অক্ষমতার কারণে ভাইরাসকে হ্রাস করে। সংক্রামিত উদ্ভিদে প্রতিলিপির প্রবণতা তামাকের মধ্যে, আর. ফ্যাসিয়ানদের সংক্রমণ একটি সাইটোক্রোম পি450-এর হাইপারেক্সপ্রেশনের দিকে পরিচালিত করে, একটি জিব্বেরেলিক অ্যাসিড অক্সিডেসের আরাবিডোপসিস থালিয়ানায় অ্যাবসিসিক অ্যাসিডের নিষ্ক্রিয়তার সাথে জড়িত জিনের সমরূপ, যা এই হরমোন এবং এর পূর্ববর্তীগুলিকে নিষ্ক্রিয় করে, একটি প্রোলিন ডিহাইড্রোজেনেস, যার প্রতিলিপি সাইটোকিনিন দ্বারা প্ররোচিত হয় এবং প্রোলিনকে গ্লুটামিক অ্যাসিডে পরিণত করে এবং মলিবডেনাম কোফ্যাক্টরের সাথে জড়িত একটি ফ্যাক্টর, যা সালফার, কার্বন এবং নাইট্রোজেন বিপাক নিয়ন্ত্রণ এবং অ্যাবসিসিক অ্যাসিড সংশ্লেষণের জন্য প্রয়োজনীয়। সংক্রমণের সময় ফাইটোহরমোনের ভূমিকা আর. ফ্যাসিয়ান সংক্রমণের সমস্ত প্রভাব হরমোন হাইপারডোজের জন্য দায়ী করা যেতে পারে। বিশেষত, বেশিরভাগ প্রভাব অক্সিন এবং সাইটোকিনিনের সাথে যুক্ত, যেমনঃ পাতায় সবুজ দ্বীপের গঠন, ল্যামিনের কুঁচকানো, কুঁড়ি বিস্তার, বার্ধক্যের বিলম্ব এবং পার্শ্বীয় শিকড়ের প্রতিরোধ। প্রকৃতপক্ষে, আর. ফ্যাসিয়ানরা নিজেই সাইটোকিনিন বা সাইটোকিনিনের মতো যৌগ তৈরি করতে পারেঃ ফাস অপেরনে ওআরএফ4 এবং ওআরএফ5 ব্যবহার করে, এটি সংক্রামিত গাছগুলিকে সাইটোকিনিন তৈরি করতে উদ্দীপিত করতে পারে এবং এটি ট্রিপ্টোফান থেকে শুরু করে 3-ইনডল-পিরুভিক অ্যাসিড এবং 3-ইনডল-অ্যাসিটালডাইড উৎপাদনের মধ্য দিয়ে যাওয়ার পথ ব্যবহার করে ইন্ডোল-3-অ্যাসিটিক অ্যাসিড নিজেই তৈরি করতে পারে। R.fascians সাইটোকিনিন/অক্সিন অনুপাতকে প্রভাবিত করতে সাইটোকিনিনকে হ্রাস করতে পারে। সাইটোকিনিন এবং অক্সিন ছাড়াও, আর. ফ্যাসিয়ানরা অন্যান্য হরমোনের উপর কাজ করেঃ বিশেষ করে, এটি সংক্রামিত উদ্ভিদের অ্যাবসিসিক অ্যাসিড এবং গিব্বেরেলিক অ্যাসিড সংশ্লেষণকে বাধা দিতে পারে। অ্যাবসিসিক অ্যাসিড বৃদ্ধি দমন করে, তাই পাতাযুক্ত গলগুলিতে কোষের বিস্তারের অনুমতি দেওয়ার জন্য উৎপাদনের একটি ব্লক প্রয়োজন। গিব্বেরেলিক অ্যাসিড কোষীয় পৃথকীকরণ নিয়ন্ত্রণ করে, তাই মেরিস্টেমেটিক কোষগুলির রক্ষণাবেক্ষণ এবং তাদের বিস্তারের জন্য এর ব্লকের প্রয়োজন হয়। উদ্ভিদের রোগ আর. ফ্যাসিয়ানরা তামাক, ছোট ফল (কেনবেরি, স্ট্রবেরি) এবং শোভাময় গাছ (প্রজাপতি ফুল, প্রিমুলা, কালানচোজ, ইম্পেটিয়েন্স, জেরানিয়াম, কার্নেশন) সহ বেশ কয়েকটি পোষক উদ্ভিদে রোগ সৃষ্টি করে বাহ্যিক লিঙ্ক ব্যাকডাইভে রোডোকোকাস ফ্যাসিয়ানদের টাইপ স্ট্রেন-ব্যাকটেরিয়াল ডাইভারসিটি মেটাডেটাবেস মাইকোব্যাকটেরিয়ালস ব্যাকটেরিয়াল উদ্ভিদ প্যাথোজেন এবং রোগ তামাক রোগ ছোট ফলের রোগ ব্যাকটেরিয়াল স্ট্রবেরি রোগ আলংকারিক উদ্ভিদ প্যাথোজেন এবং রোগ