Pyrobaculum
পাইরোবাকুলাম হল থার্মোপ্রোটেসিয়ার একটি প্রজাতি। বর্ণনা এবং তাৎপর্য যেমন এর ল্যাটিন নাম পাইরোবাকুলাম ("ফায়ার স্টিক") থেকে বোঝা যায়, আর্কিয়নটি রড-আকৃতির এবং উচ্চ তাপমাত্রার অবস্থান থেকে বিচ্ছিন্ন। এটি গ্রাম-নেগেটিভ এবং এর কোষগুলি প্রোটিন সাবইউনিটের একটি এস-স্তর দ্বারা বেষ্টিত। পি. অ্যারোফিলাম একটি হাইপারথার্মোফিলিক এবং বিপাকীয়ভাবে বহুমুখী জীব। অন্যান্য হাইপারথার্মোফাইল থেকে আলাদা, এটি অক্সিজেনের উপস্থিতিতে বাঁচতে পারে এবং মাইক্রোএরোবিক পরিস্থিতিতে দক্ষতার সাথে বৃদ্ধি পায়। পাইরোব্যাকুলাম ইয়েলোস্টোনেনসিস স্ট্রেন ডব্লিউ. পি. 30 মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রের ইয়েলোস্টোন ন্যাশনাল পার্কে (ওয়াই. এন. পি) একটি মৌলিক সালফার পলল (জোসেফের কোট হট স্প্রিং [জে. সি. এইচ. এস], 80 ডিগ্রি সেলসিয়াস, পিএইচ 6.1,135 মাইক্রোমিটার এ. এস) থেকে প্রাপ্ত হয়েছিল এবং এটি একটি কেমোরগানোহেটেরোট্রফ এবং একটি ইলেক্ট্রন গ্রহণকারী হিসাবে মৌলিক সালফার এবং/অথবা আর্সেনেট প্রয়োজন। মৌলিক সালফার এবং আর্সেনেটের উপস্থিতিতে বৃদ্ধির ফলে থাইয়ার্সেনেট এবং পলিসালফাইড তৈরি হয়। এই জীবের সম্পূর্ণ জিনোম ক্রমবদ্ধ করা হয়েছিল (1.99 এমবি, 58 শতাংশ জি + সি সামগ্রী), যা কার্বোহাইড্রেট, অ্যামিনো অ্যাসিড এবং লিপিডের অবক্ষয়ের জন্য অসংখ্য বিপাকীয় পথ প্রকাশ করে। একাধিক ডাইমিথাইল সালফক্সাইড-মলিবডোপ্টেরিন (ডি. এম. এস. ও-এম. পি. টি) অক্সিডোরিডাক্টেজ জিন চিহ্নিত করা হয়েছে, যা সালফার এবং আর্সেনিক হ্রাসে জড়িত। প্রায় সমস্ত প্রয়োজনীয় কোফ্যাক্টর এবং মেটাবোলাইটের ডি নভো সংশ্লেষণের পথ চিহ্নিত করা হয়েছিল। পি. ইয়েলোস্টোনেনসিসের তুলনামূলক জিনোমিক্স এবং জেসিএইচএস থেকে একত্রিত মেটাজেনম সিকোয়েন্স দেখায় যে এই জীবটি সিটু জনসংখ্যার সাথে অত্যন্ত সম্পর্কিত (~95% গড় নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্স পরিচয়)। পি. ইয়েলোস্টোনেনসিসের শারীরবৃত্তীয় বৈশিষ্ট্য এবং বিপাকীয় ক্ষমতা ওয়াইএনপিতে এই জনসংখ্যার বিতরণ এবং কার্যকারিতা সম্পর্কে বোঝার জন্য একটি গুরুত্বপূর্ণ ভিত্তি প্রদান করে। জিনোম কাঠামো পাইরোব্যাকুলামের প্রথম প্রজাতি ছিল পি. অ্যারোফিলাম। এর বৃত্তাকার জিনোম সিকোয়েন্স দৈর্ঘ্যে 2,222,430 বিপি এবং এতে 2605 প্রোটিন-এনকোডিং সিকোয়েন্স (সিডিএস) রয়েছে। কোষের কাঠামো এবং বিপাক অ্যানেরোবিক অবস্থার অধীনে, আর্কিয়ন ডিনাইট্রিফিকেশন পথের মাধ্যমে নাইট্রেটকে আণবিক নাইট্রোজেনে হ্রাস করে। বেশিরভাগ প্রজাতি সালফার হ্রাসের মাধ্যমে কেমোলিথোআটোট্রোফিক্যালি বা সালফার শ্বাস-প্রশ্বাসের মাধ্যমে বা গাঁজন দ্বারা অর্গানোট্রোফিক্যালি বৃদ্ধি পায়। কোষগুলি প্রায় আয়তক্ষেত্রাকার প্রান্ত সহ রড-আকৃতির এবং প্রায় 1.5-8 * 0.5-0.6 মাইক্রোমিটার। পাইরোব্যাকুলাম পেরিট্রিচাস বা বাইপোলার পলিট্রিচাস ফ্ল্যাজেলেশনের কারণে গতিশীল এবং এর উপনিবেশগুলি গোলাকার এবং ধূসর থেকে সবুজ কালো। প্রজাতিগুলি হয় ফ্যাকুলেটিভভাবে অ্যারোবিক বা কঠোরভাবে অ্যানেরোবিক। ইস্ট এক্সট্র্যাক্ট, পেপটোন, মাংসের এক্সট্র্যাক্টে বৃদ্ধি লক্ষ্য করা গেছে, তবে গ্যালাকটোজ, গ্লুকোজ, মাল্টোজ, স্টার্চ গ্লাইকোজেন, ইথানল, মিথানল, ফর্মামাইড, ফরমেট, ম্যালেট, প্রোপিওনেট, ল্যাকটেট, অ্যাসিটেট এবং ক্যাসামিনো অ্যাসিডে নয়। জেনেটিক্যালি সিকোয়েন্স করা পাইরোব্যাকুলাম প্রজাতির মধ্যে প্রথম, পি. অ্যারোফিলাম (রড-আকৃতির, 3-8 * 0.6 মাইক্রোমিটার), একটি আর্কিয়নের জন্য একটি বিরল বৈশিষ্ট্য রয়েছে কারণ এটি অ্যারোবিক শ্বাস-প্রশ্বাসে সক্ষম (অ্যারোফিলাম = "বায়ু-প্রেমী")। এটি এই সত্য থেকে স্পষ্ট যে, নাইট্রেট অনুপস্থিত থাকলে শুধুমাত্র অক্সিজেনের উপস্থিতিতে আর্কিয়নের বৃদ্ধি ঘটে। এটি গোলাকার এবং ধূসর হলুদ রঙের উপনিবেশ তৈরি করে। এটি জৈব এবং বায়বীয় শ্বাস-প্রশ্বাসের সময় অজৈব যৌগ উভয়ই ব্যবহার করে (জটিল জৈব পদার্থ যেমন ইস্ট এক্সট্র্যাক্ট, মাংস এক্সট্র্যাক্ট, ট্রিপ্টোন এবং পেপটোন সাবস্ট্রেট হিসাবে সর্বাধিক কোষের ঘনত্ব পর্যবেক্ষণ করা হয়েছিল)। এছাড়াও, বৃদ্ধির জন্য মৌলিক সালফারের ব্যবহার লক্ষ্য করা গেছে। উপরন্তু, পি. অ্যারোফিলাম 100 ডিগ্রি সেলসিয়াসে সর্বোত্তম বৃদ্ধির তাপমাত্রা সহ 75 থেকে 104 ডিগ্রি সেলসিয়াসের মধ্যে বৃদ্ধি পায়। স্থির পর্যায় সংস্কৃতিতে, পাইরোব্যাকুলাম ক্যালিডিফন্টিস কোষগুলিকে একত্রিত হতে দেখা গেছে। একত্রীকরণটি সম্ভবত আর্কিয়াল বান্ডলিং পিলি (এবিপি) দ্বারা মধ্যস্থতা করা হয়, যা অত্যন্ত ক্রমযুক্ত বাইপোলার বান্ডিলগুলিতে একত্রিত হয়। এই বান্ডিলগুলির দ্বিপদী প্রকৃতি সম্ভবত কমপক্ষে দুই বা ততোধিক ভিন্ন কোষ থেকে ফিলামেন্টের সংযোগ থেকে উদ্ভূত হয়। উপাদান প্রোটিন, এ. বি. পি. এ, ক্রম এবং কাঠামোগত উভয় স্তরে, ব্যাকটেরিয়াল প্রোটিন টি. এ. এস-এর সমরূপতা দেখায়, যা ব্যাকটেরিয়াল বায়োফিল্মগুলিতে এক্সট্রাসেলুলার ম্যাট্রিক্সের একটি প্রধান উপাদান, যা বায়োফিল্ম স্থায়িত্বে অবদান রাখে। বাস্তুতন্ত্র আজ অবধি, পাইরোব্যাকুলামের প্রজাতিগুলি নিরপেক্ষ থেকে সামান্য ক্ষারীয় ফুটন্ত দ্রবণীয় জল এবং অগভীর সামুদ্রিক জলবিদ্যুৎ ব্যবস্থায় বিচ্ছিন্ন করা হয়েছে। পি. অ্যারোফিলাম ইতালির ইসচিয়ার মারোন্তি সৈকতে একটি ফুটন্ত সামুদ্রিক জলের গর্ত থেকে বিচ্ছিন্ন করা হয়েছিল। আরও গবেষণায় দেখা গেছে যে পি. অ্যারোফিলাম ইলেক্ট্রন গ্রহণকারী হিসাবে নাইট্রেট সহ কঠোরভাবে অ্যানেরোবিক পরিস্থিতিতে বৃদ্ধি পায়। ফাইলোজেনি বর্তমানে গৃহীত শ্রেণীবিন্যাসটি স্ট্যান্ডিং ইন নোমেনক্লেচার (এল. পি. এস. এন) এবং ন্যাশনাল সেন্টার ফর বায়োটেকনোলজি ইনফরমেশন (এন. সি. বি. আই) সহ প্রোক্যারিওটিক নামগুলির তালিকার উপর ভিত্তি করে তৈরি করা হয়েছে আরও দেখুন পাইরোব্যাকুলাম এ. এস. আর. 3 ছোট আর. এন. এ।