Formate dehydrogenase
ফরমেট ডিহাইড্রোজেনেস হল এনজাইমের একটি সেট যা ফরমেটের জারণকে কার্বন ডাই অক্সাইডে অনুঘটক করে, ইলেকট্রনগুলিকে একটি দ্বিতীয় স্তরকে দান করে, যেমন এন. এ. ডি + ফরমেটেঃ এন. এ. ডি + অক্সিডোরিডাক্টেস () অথবা ফরমেটে একটি সাইটোক্রোমেঃ ফেরিসাইটোক্রোম-বি1 অক্সিডোরিডাক্টেস ()। এনজাইমের এই পরিবারটি বিশ্ব উষ্ণায়নের সাথে প্রাসঙ্গিক কার্বন ডাই অক্সাইড স্থিরকরণের পদ্ধতির অনুপ্রেরণা বা দিকনির্দেশনা হিসাবে দৃষ্টি আকর্ষণ করেছে। মিথাইলট্রফিক ইস্ট এবং ব্যাকটেরিয়ায় ফাংশন এন. এ. ডি-নির্ভর ফরমেট ডিহাইড্রোজেনেস গুরুত্বপূর্ণ, যা মিথানল-এর মতো সি1 যৌগের ক্যাটাবোলিজমে গুরুত্বপূর্ণ। প্রোক্যারিওটগুলিতে এনারোবিক বিপাকের ক্ষেত্রে সাইটোক্রোম-নির্ভর এনজাইমগুলি বেশি গুরুত্বপূর্ণ। উদাহরণস্বরূপ, ই. কোলাই-তে, ফরমেটঃ ফেরিসাইটোক্রোম-বি1 অক্সিডোরিডাক্টেস হল দুটি সাবইউনিট সহ একটি অভ্যন্তরীণ ঝিল্লি প্রোটিন এবং এটি অ্যানেরোবিক নাইট্রেট শ্বাসক্রিয়ায় জড়িত। এনএডি-নির্ভর প্রতিক্রিয়া গঠন + এনএডি + সিও2 + এনএডিএইচ + এইচ + সাইটোক্রোম-নির্ভর প্রতিক্রিয়া গঠন + 2 ফেরিসাইটোক্রোম বি1 সিও2 + 2 ফেরোসাইটোক্রোম বি1 + 2 এইচ + মলিবডোপ্টেরিন, মলিবডেনাম এবং সেলেনিয়াম নির্ভরতা ধাতু-নির্ভর এফডিএইচ-এর বৈশিষ্ট্য তাদের সক্রিয় স্থানে মো বা ডাব্লু। এই সক্রিয় স্থানগুলি ডি. এম. এস. ও রিডাক্টেজ-এ দেখা মোটিফের অনুরূপ, দুটি মলিবডোপ্টেরিন কোফ্যাক্টর মো/ডাব্লু-এর সাথে দ্বিমুখীভাবে আবদ্ধ। পঞ্চম এবং ষষ্ঠ লিগ্যান্ডগুলি হল সালফাইড এবং সিস্টিনেট বা সেলেনোসিস্টিনেট। ক্রিয়ার প্রক্রিয়াটি ধাতব কেন্দ্রগুলির 2e রেডক্সের সাথে জড়িত বলে মনে হয়, যা ফরমেট থেকে হাইড্রাইড স্থানান্তর এবং কার্বন ডাই অক্সাইডের নিঃসরণ দ্বারা প্ররোচিত হয়ঃ এই পরিকল্পনায়, দুটি ডাইথিওলিন কোফ্যাক্টর, মলিবডোপ্টেরিন দ্বারা প্রদত্ত চারটি থাইওলেটের মতো লিগ্যান্ডকে উপস্থাপন করে। ডাইথিওলিন এবং সিস্টিনিল/সেলেনোসিস্টিনিল লিগ্যান্ডগুলি রেডক্স-ইনোসেন্ট। আণবিক বিবরণের পরিপ্রেক্ষিতে, অসংখ্য তদন্ত সত্ত্বেও প্রক্রিয়াটি অনিশ্চিত রয়ে গেছে। বেশিরভাগ প্রক্রিয়া ধরে নেয় যে সাধারণ মো/ডাব্লু অক্সো-স্থানান্তরের (যেমন, ডিএমএসও রিডাক্টেজ) বিপরীতে ফরমেট মো/ডাব্লু-এর সাথে সমন্বয় করে না। একটি জনপ্রিয় যান্ত্রিক প্রস্তাবে এইচ-কে ফরমেট থেকে এম. ও/ডব্লিউ. ভি. আই = এস গ্রুপে স্থানান্তর করা হয়। ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন ফরমেট ডিহাইড্রোজেনেস দুটি ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন নিয়ে গঠিত; β-সাবইউনিটের তিনটি α-হেলিস এবং গামা-সাবইউনিট থেকে চারটি ট্রান্সমেম্ব্রেন হেলিস। ফরমেট ডিহাইড্রোজিনেসের β-সাবইউনিট পেরিপ্লাজমে উপস্থিত থাকে এবং β-সাবইউনিটকে অভ্যন্তরীণ-ঝিল্লি পৃষ্ঠে নোঙর করে ঝিল্লি জুড়ে একটি একক ট্রান্সমেম্ব্রেন α-হেলিক্স থাকে। β-সাবইউনিটের দুটি সাবডোমেন রয়েছে, যেখানে প্রতিটি সাবডোমেইনের দুটি [4Fe-4S] ফেরেডক্সিন ক্লাস্টার রয়েছে। সাবইউনিটের মধ্য দিয়ে একটি শৃঙ্খলে [4Fe-4S] ক্লাস্টারগুলির বিচক্ষণ প্রান্তিককরণের পৃথকীকরণের দূরত্ব কম, যা [4Fe-4S]-1, [4Fe-4S]-4, [4Fe-4S]-2, এবং [4Fe-4S]-3 এর মধ্য দিয়ে γ-সাবইউনিটের পেরিপ্লাজমিক হেম বি-তে দ্রুত ইলেক্ট্রন প্রবাহকে অনুমতি দেয়। ইলেক্ট্রন প্রবাহ তারপর ঝিল্লি জুড়ে γ-সাবইউনিটের একটি সাইটোপ্লাজমিক হেম বি-তে পরিচালিত হয়। ফরমেট ডিহাইড্রোজিনেসের γ-সাবইউনিট হল একটি ঝিল্লি-আবদ্ধ সাইটোক্রোম বি যা চারটি ট্রান্সমেম্ব্রেন হেলিস এবং দুটি হেম বি গ্রুপ নিয়ে গঠিত যা একটি চার-হেলিক্স বান্ডিল তৈরি করে যা হেম বাঁধনে সহায়তা করে। গামা সাবইউনিটের সাথে আবদ্ধ হেম বি কোফ্যাক্টরগুলি সাবইউনিটের মাধ্যমে ইলেকট্রনগুলিকে লাফিয়ে ওঠার অনুমতি দেয়। ট্রান্সমেম্ব্রেন হেলিসগুলি হেম বি গ্রুপ উভয়ই বজায় রাখে, যেখানে মাত্র তিনটি হেম লিগ্যান্ড সরবরাহ করে যার ফলে ফে-হেম নোঙর করে। পেরিপ্লাজমিক হিম বি গ্রুপ β-সাবইউনিটের পেরিপ্লাজমিক ডোমেনের [4Fe-4S]-3 ক্লাস্টার থেকে ইলেকট্রন গ্রহণ করে। সাইটোপ্লাজমিক হিম বি গ্রুপ পেরিপ্লাজমিক হিম বি গ্রুপ থেকে ইলেকট্রন গ্রহণ করে, যেখানে ইলেকট্রন প্রবাহ তারপর গামা সাবইউনিটের ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেনে উপস্থিত মেনাকুইনোন (ভিটামিন কে) হ্রাস সাইটের দিকে পরিচালিত হয়। γ-সাবইউনিটের মেনাকুইনোন হ্রাসকারী স্থানটি সাইটোপ্লাজমিক হিম বি-এর একটি হিস্টিডাইন লিগ্যান্ডের বন্ধনের মাধ্যমে ইলেকট্রন গ্রহণ করে। আরও দেখুন ফর্ম্যাট ডিহাইড্রোজেনেস (সাইটোক্রোম) ফর্ম্যাট ডিহাইড্রোজেনেস (সাইটোক্রোম-সি-553) ফর্ম্যাট ডিহাইড্রোজেনেস (এনএডিপি +) মাইক্রোবিয়াল মেটাবলিজম অতিরিক্ত পঠন রেফারেন্স বাহ্যিক লিঙ্ক ইসি 1.2.2.1 ইএনজেডওয়াইএমই লিঙ্ক ইসি 1.2.1.2 সেলুলার শ্বাসযন্ত্রের জন্য মেটাবলিজম ইসি 1.2.2 ইসি 1.2.1