Transcription factor II B
ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর II বি (টি. এফ. আই. আই. বি) একটি সাধারণ ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর যা আর. এন. এ পলিমারেজ II প্রি-ইনিশিয়েশন কমপ্লেক্স (পি. আই. সি) গঠনে জড়িত এবং ট্রান্সক্রিপশন সূচনাকে উদ্দীপিত করতে সহায়তা করে। টি. এফ. আই. আই. বি নিউক্লিয়াসে স্থানীয়করণ করা হয় এবং ডি. এন. এ-টিবিপি (টাটা-বাইন্ডিং প্রোটিন) কমপ্লেক্সকে বাঁধাই ও স্থিতিশীল করে এবং আর. এন. এ পলিমারেজ II এবং অন্যান্য প্রতিলিপি উপাদান নিয়োগ করে পি. আই. সি গঠনের জন্য একটি প্ল্যাটফর্ম সরবরাহ করে। এটি জিন দ্বারা এনকোড করা হয় এবং আর্কিয়াল ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর বি-এর সমতুল্য এবং ব্যাকটেরিয়াল সিগমা ফ্যাক্টরের অনুরূপ। কাঠামো টিএফআইআইবি হল একটি একক 33কেডিএ পলিপেপটাইড যা 316টি অ্যামিনো অ্যাসিড নিয়ে গঠিত। টিএফআইআইবি চারটি কার্যকরী অঞ্চল নিয়ে গঠিতঃ সি-টার্মিনাল কোর ডোমেন; বি লিঙ্কার; বি রিডার এবং অ্যামিনো টার্মিনাল দস্তা ফিতা। টি. এফ. আই. আই. বি ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর আই. আই. ডি-এর টাটা-বাইন্ডিং প্রোটিন (টি. বি. পি) সাবইউনিট এবং আর. এন. এ পলিমারেজ 2-এর আর. পি. বি 1 সাবইউনিটের সাথে প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া তৈরি করে। টি. এফ. আই. আই. বি বি স্বীকৃতি উপাদান (বি. আর. ই)-এর সাথে ক্রম-নির্দিষ্ট প্রোটিন-ডি. এন. এ মিথস্ক্রিয়া তৈরি করে, যা টাটা উপাদানের পার্শ্ববর্তী একটি প্রবর্তক উপাদান। কার্যপ্রণালী পি. আই. সি গঠন এবং প্রতিলিপি সূচনার ক্ষেত্রে টি. এফ. আই. আই. বি ক্রিয়া প্রক্রিয়ার ছয়টি ধাপ রয়েছেঃ আর. এন. এ পলিমারেজ II টি. এফ. আই. আই. বি বি কোর এবং বি ফিতার মাধ্যমে ডি. এন. এ-তে নিয়োগ করা হয়। আর. এন. এ পলিমারেজ II ডি. এন. এ-কে শিথিল করে, টি. এফ. আই. আই. বি বি লিঙ্কার এবং বি রিডার (উন্মুক্ত জটিল গঠন) দ্বারা সহায়তা করে। আর. এন. এ পলিমারেজ II টি. এফ. আই. আই. বি বি রিডারের সহায়তায় একটি ট্রান্সক্রিপশন স্টার্ট সাইট নির্বাচন করে। আর. এন. এ পলিমারেজ 2 প্রথম ফসফডিয়েস্টার বন্ধন গঠন করে। আর. এন. এ পলিমারেজ 2 নবজাতক আর. এন. এ এবং টি. এফ. আই. আই. বি বি রিডার লুপের মধ্যে সংঘর্ষের কারণে সংক্ষিপ্ত অকার্যকর প্রতিলিপি তৈরি করে। টি. এফ. আই. আই. বি-এর সাথে আরও সংঘর্ষের কারণে নবজাতক আর. এন. এ-র <আই. ডি1> নিউক্লিওটাইডগুলিতে সম্প্রসারণ টি. এফ. আই. আই. বি-এর নির্গমনের দিকে পরিচালিত করে। আর. এন. এ পলিমারেজ II-এর সাথে মিথস্ক্রিয়া টি. এফ. আই. আই. বি-এর প্রতিটি কার্যকরী অঞ্চল আর. এন. এ পলিমারেজ II-এর বিভিন্ন অংশের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে। অ্যামিনো টার্মিনাল বি ফিতাটি আরএনএ পলিমারেজ II-এর ডক ডোমেনে অবস্থিত এবং সক্রিয় স্থানের দিকে ফাটল পর্যন্ত প্রসারিত। বি ফিতা প্রসারিত করা হল বি রিডার যা আরএনএ প্রস্থান সুড়ঙ্গের মাধ্যমে ডিএনএ-আরএনএ সংকরের বাঁধাই স্থানে এবং সক্রিয় স্থানের দিকে প্রসারিত হয়। বি লিঙ্কার হল বি রিডার এবং বি কোরের মধ্যবর্তী অঞ্চল যা আরএনএ পলিমারেজ II-এর ফাটলে পাওয়া যায় এবং রডার এবং ক্ল্যাম্প কয়েল-কয়েল দ্বারা চলতে থাকে যতক্ষণ না এটি সি টার্মিনাল বি কোর পর্যন্ত পৌঁছায় যা আরএনএ পলিমারেজ II-এর প্রাচীরের উপরে পাওয়া যায়। বি রিডার এবং বি লিঙ্কার অত্যন্ত সংরক্ষিত অবশিষ্টাংশ নিয়ে গঠিত যা আরএনএ পলিমারেজ II সুড়ঙ্গের মাধ্যমে সক্রিয় স্থানের দিকে অবস্থিত এবং এই মূল অবশিষ্টাংশ বিচ্ছিন্নতা ছাড়াই শক্ত বন্ধন নিশ্চিত করে। এই দুটি ক্ষেত্র আর. এন. এ পলিমারেজ-2-এর আরও নমনীয় কিছু অংশের অবস্থানকে সামঞ্জস্য করবে বলে মনে করা হয় যাতে ডি. এন. এ-র সুনির্দিষ্ট অবস্থান নির্ধারণ করা যায় এবং নতুন আর. এন. এ শৃঙ্খলে নতুন এন. টি. পি যোগ করা যায়। আর. এন. এ পলিমারেজ II বাঁধলে, বি রিডার এবং বি লিঙ্কার আর. এন. এ পলিমারেজ II-এর প্রোট্রুশন ডোমেনের সামান্য পুনর্বিন্যাস ঘটায় যা একটি প্রয়োজনীয় দ্বিতীয় ম্যাগনেসিয়াম আয়নকে সক্রিয় স্থানে বাঁধতে দেয়। এটি একটি বিটা শীট এবং একটি অর্ডারড লুপ গঠন করে যা প্রতিলিপি শুরু করার সময় কাঠামোর স্থিতিশীলতায় সহায়তা করে। খোলা এবং বন্ধ কমপ্লেক্সগুলি খোলা এবং বন্ধ গঠনগুলি ডি. এন. এ-র অবস্থা এবং পি. আই. সি-র মধ্যে নন-টেমপ্লেট স্ট্র্যান্ড থেকে টেমপ্লেট স্ট্র্যান্ডটি পৃথক করা হয়েছে কিনা তা বোঝায়। যে জায়গায় বুদ্বুদ গঠনের জন্য ডিএনএ খোলে তা একটি সুড়ঙ্গের উপরে অবস্থিত যা বি-কোর, বি-লিঙ্কার এবং বি-রিডারের পাশাপাশি আরএনএ পলিমারেজ II-এর অংশ দ্বারা রেখাযুক্ত। বি লিঙ্কারটি ডিএনএ যে বিন্দুতে খোলে তার সাথে সরাসরি সারিবদ্ধ অবস্থায় পাওয়া যায় এবং খোলা কমপ্লেক্সে এটি দুটি ডিএনএ স্ট্র্যান্ডের মধ্যে পাওয়া যায়, যা পরামর্শ দেয় যে প্রবর্তক গলনে এর ভূমিকা রয়েছে, তবে অনুঘটক আরএনএ সংশ্লেষণে এর কোনও ভূমিকা নেই। যদিও টি. এফ. আই. আই. বি উভয় বিন্যাসে একই কাঠামো রাখে, ডি. এন. এ খোলার সময় কোর এবং বি রিডারের মধ্যে কিছু আন্তঃআণবিক মিথস্ক্রিয়া ব্যাহত হয়। ডিএনএ গলানোর পরে ট্রান্সক্রিপশন ইনিশিয়েটর (আইএনআর) অবশ্যই ডিএনএতে অবস্থিত হতে হবে যাতে আরএনএ পলিমারেজ II দ্বারা টিএসএস সনাক্ত করা যায় এবং ট্রান্সক্রিপশন শুরু করা যায়। এটি 'টেমপ্লেট টানেল' এর মধ্য দিয়ে ডি. এন. এ পাস করে করা হয় এবং ডি. এন. এ স্ক্যান করা হয়, ইনার অনুসন্ধান করে এবং এটি এমন একটি অবস্থানে স্থাপন করা হয় যা নিশ্চিত করে যে ট্রান্সক্রিপশন স্টার্ট সাইটটি আর. এন. এ পলিমারেজ সক্রিয় সাইট দ্বারা সঠিক জায়গায় অবস্থিত। টি. এফ. আই. আই. বি-এর বি রিডারটি টেমপ্লেট টানেলে পাওয়া যায় এবং ইনার সনাক্ত করতে গুরুত্বপূর্ণ, বি রিডারের মিউটেশনগুলি টি. এস. এস-এর পরিবর্তন ঘটায় এবং তাই ভুল প্রতিলিপি ঘটে (যদিও পি. আই. সি গঠন এবং ডি. এন. এ গলন এখনও ঘটে)। খামির এই সারিবদ্ধকরণের একটি বিশেষ ভাল উদাহরণ কারণ খামির ইনার মোটিফের 28তম অবস্থানে একটি কঠোরভাবে সংরক্ষিত এ অবশিষ্টাংশ রয়েছে এবং উন্মুক্ত জটিল মডেলে বি রিডার হেলিক্সে একটি পরিপূরক টি অবশিষ্টাংশ পাওয়া যায়। যখন এই টি অবশিষ্টাংশটি পরিবর্তিত হয়, তখন বি পাঠকের ভূমিকার উপর জোর দিয়ে প্রতিলিপি উল্লেখযোগ্যভাবে কম কার্যকর ছিল। বি রিডার লুপ সক্রিয় স্থানে এন. টি. পি-কে স্থিতিশীল করে বলে মনে করা হয় এবং এর নমনীয়তার কারণে, আর. এন. এ অণুর প্রাথমিক সংশ্লেষণের সময় নিউক্লিক অ্যাসিডগুলিকে সংস্পর্শে থাকতে দেয়। ক্রমবর্ধমান আর. এন. এ-ডি. এন. এ সংকরকে স্থিতিশীল করে) মুক্তি যখন আর. এন. এ প্রতিলিপি 7টি নিউক্লিওটাইড দীর্ঘতায় পৌঁছায়, তখন প্রতিলিপি দীর্ঘায়িত পর্যায়ে প্রবেশ করে, যার শুরুতে ডি. এন. এ বুদ্বুদের পতন এবং টি. এফ. আই. আই. বি-এর নির্গমন দ্বারা চিহ্নিত করা হয়। মনে করা হয় যে, 6টি বেস দীর্ঘ হলে নবজাতক আরএনএ বি লিঙ্কার হেলিক্সের সাথে সংঘর্ষ করে এবং 12-13 বেসে আরও দীর্ঘায়িত হলে এটি বি-রিডার এবং বি-রিবনের সাথে সংঘর্ষ করে যা বিচ্ছিন্নতার দিকে পরিচালিত করে। ডি. এন. এ ডুপ্লেক্সটি রডারের উপরে বি লিঙ্কারের সাথেও সংঘর্ষ করে (ডি. এন. এ-কে একটি ডাবল হেলিক্সে পুনর্বিন্যস্ত করার কারণে)। ফসফরিলেশন টিএফআইআইবি সেরিন 65-এ ফসফরিলেটেড হয় যা বি রিডার ডোমেনে পাওয়া যায়। এই ফসফোরিলেশন ছাড়া, প্রতিলিপির সূচনা ঘটে না। এটি প্রস্তাব করা হয়েছে যে সাধারণ ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর টিএফআইআইএইচ এই ফসফোরিলেশনের জন্য কাইনেজ হিসাবে কাজ করতে পারে যদিও এটি সমর্থন করার জন্য আরও প্রমাণ প্রয়োজন। যদিও টি. এফ. আই. আই. বি দীর্ঘায়িত হওয়ার সময় ডি. এন. এ বরাবর আর. এন. এ পলিমারেজ II কমপ্লেক্সের সাথে ভ্রমণ করে না, সম্প্রতি এটি পরামর্শ দেওয়া হয়েছে যে জিন লুপিংয়ে এটির একটি ভূমিকা রয়েছে যা প্রোমোটারকে জিনের টার্মিনেটরের সাথে সংযুক্ত করে। তবে, সাম্প্রতিক গবেষণায় দেখা গেছে যে টি. এফ. আই. আই. বি-তে হ্রাস কোষের জন্য মারাত্মক নয় এবং প্রতিলিপির মাত্রা উল্লেখযোগ্যভাবে প্রভাবিত হয় না। এর কারণ হল 90 শতাংশেরও বেশি স্তন্যপায়ী প্রোমোটারদের মধ্যে একটি বি. আর. ই (বি স্বীকৃতি উপাদান) বা টাটা বক্স সিকোয়েন্স থাকে না যা টি. এফ. আই. আই. বি-এর বাঁধনের জন্য প্রয়োজনীয়। এছাড়াও, টি. এফ. আই. আই. বি-র মাত্রা বিভিন্ন ধরনের কোষে এবং কোষ চক্রের বিভিন্ন বিন্দুতে ওঠানামা করতে দেখা গেছে, যা এই প্রমাণকে সমর্থন করে যে এটি সমস্ত আর. এন. এ পলিমারেজ II প্রতিলিপির জন্য প্রয়োজনীয় নয়। জিন লুপিং নির্ভর করে আরএনএ পলিমারেজ II-এর সি টার্মিনাল ডোমেনে পাওয়া ফসফরিলেটেড সেরিন অবশিষ্টাংশ এবং পলিঅ্যাডেনাইলেশন ফ্যাক্টরের মধ্যে মিথস্ক্রিয়ার উপর। এস. এস. ইউ. 72 এবং সি. এস. টি. এফ-64-এর মতো এই পলিঅ্যাডেনাইলেশন ফ্যাক্টরগুলির সঙ্গে প্রোমোটারদের মিথস্ক্রিয়ার জন্য টি. এফ. আই. আই. বি-এর প্রয়োজন। এটিও পরামর্শ দেওয়া হয়েছে যে জিন লুপ গঠন এবং ডিএনএ বুদ্বুদের পতন উভয়ই টিএফআইআইবি ফসফোরিলেশনের ফল; তবে, এই জিন লুপ গঠন প্রতিলিপি সূচনার কারণ বা পরিণতি কিনা তা স্পষ্ট নয়। অন্যান্য ট্রান্সক্রিপশন কমপ্লেক্স আর. এন. এ পলিমারেজ III-এর মধ্যে সাদৃশ্যগুলি বি. আর. এফ (টি. এফ. আই. আই. বি-সম্পর্কিত ফ্যাক্টর) নামে টি. এফ. আই. আই. বি-এর অনুরূপ একটি উপাদান ব্যবহার করে যার মধ্যে একটি সংরক্ষিত দস্তা ফিতা এবং সি টার্মিনাল কোর রয়েছে। যাইহোক, কাঠামোটি আরও নমনীয় সংযোগকারী অঞ্চলে বিচ্ছিন্ন হয়ে যায় যদিও বি. আর. এফ-এ এখনও বি রিডার এবং বি লিঙ্কারের মতো একই অবস্থানে অত্যন্ত সংরক্ষিত ক্রম রয়েছে। এই সংরক্ষিত অঞ্চলগুলি সম্ভবত টি. এফ. আই. আই. বি-র ডোমেনগুলির মতো একই কাজ করে। আর. এন. এ পলিমারেজ I টি. এফ. আই. আই. বি-এর অনুরূপ কোনও ফ্যাক্টর ব্যবহার করে না; তবে, মনে করা হয় যে অন্য একটি অজানা ফ্যাক্টর একই কাজ সম্পাদন করে। ব্যাকটেরিয়া সিস্টেমে টি. এফ. আই. আই. বি-এর জন্য কোনও সরাসরি সমরূপতা নেই তবে এমন প্রোটিন রয়েছে যা কোনও ক্রমের সাদৃশ্য ছাড়াই ব্যাকটেরিয়া পলিমারেজকে একইভাবে আবদ্ধ করে। বিশেষত ব্যাকটেরিয়াল প্রোটিন σ70-এ এমন ডোমেন রয়েছে যা বি-লিঙ্কার, বি-রিবন এবং বি-কোরের মতো একই বিন্দুতে পলিমারেজকে আবদ্ধ করে। এটি বিশেষ করে σ3 অঞ্চল এবং অঞ্চল 4 সংযোগকারীতে স্পষ্ট যা পলিমারেজ সক্রিয় স্থানে ডিএনএকে স্থিতিশীল করতে পারে। ক্লিনিকাল তাৎপর্য অ্যান্টিভাইরাল ক্রিয়াকলাপ সাম্প্রতিক গবেষণায় দেখা গেছে যে টিএফআইআইবি মাত্রা হ্রাস কোষের মধ্যে প্রতিলিপির মাত্রা প্রভাবিত করে না, এটি আংশিকভাবে মনে করা হয় কারণ স্তন্যপায়ী প্রোমোটারদের 90 শতাংশেরও বেশি একটি বিআরই বা টাটা বাক্স ধারণ করে না। যাইহোক, এটি দেখানো হয়েছে যে টিএফআইআইবি ইন ভিট্রো ট্রান্সক্রিপশন এবং হারপিস সিম্প্লেক্স ভাইরাসের নিয়ন্ত্রণের জন্য গুরুত্বপূর্ণ। এটি টি. এফ. আই. আই. বি-এর সাইক্লিন এ-এর সাদৃশ্যের কারণে বলে মনে করা হয়। প্রতিলিপির মধ্য দিয়ে যাওয়ার জন্য, ভাইরাসগুলি প্রায়শই সাইক্লিন এবং অন্যান্য প্রোটিন ব্যবহার করে কোষ চক্রের মাধ্যমে পোষক কোষের অগ্রগতি বন্ধ করে দেয়। যেহেতু টি. এফ. আই. আই. বি-র কাঠামো সাইক্লিন এ-এর অনুরূপ, তাই পরামর্শ দেওয়া হয়েছে যে টি. এফ. আই. আই. বি-এর হ্রাসপ্রাপ্ত মাত্রায় অ্যান্টিভাইরাল প্রভাব থাকতে পারে। নিউরোডিজেনারেশন স্টাডিজ দেখিয়েছে যে টি. বি. পি-র সাথে টি. এফ. আই. আই. বি-এর বন্ধন টি. বি. পি-তে পলিগ্লুটামিন ট্র্যাক্টের দৈর্ঘ্য দ্বারা প্রভাবিত হয়। নিউরোডিজেনারেটিভ রোগে পাওয়া পলিগ্লুটামিন ট্র্যাক্টের মতো বর্ধিত পলিগ্লুটামিন ট্র্যাক্টগুলি টি. এফ. আই. আই. বি-এর সাথে মিথস্ক্রিয়া বৃদ্ধি করে। এটি এই রোগগুলিতে প্রতিলিপি প্রভাবিত করে বলে মনে করা হয় কারণ এটি মস্তিষ্কের অন্যান্য প্রবর্তকদের কাছে টিএফআইআইবি-র প্রাপ্যতা হ্রাস করে কারণ টিএফআইআইবি পরিবর্তে প্রসারিত পলিগ্লুটামিন ট্র্যাক্টের সাথে মিথস্ক্রিয়া করছে। তথ্যসূত্র বাহ্যিক যোগসূত্র আণবিক জেনেটিক্স প্রোটিন জিন অভিব্যক্তি প্রতিলিপি কারণ