Morphobank
মরফোব্যাঙ্ক হল সহযোগিতামূলক বিবর্তনীয় গবেষণার জন্য একটি ওয়েব অ্যাপ্লিকেশন, বিশেষ করে ফাইলোজেনেটিক সিস্টেম্যাটিক্স বা ক্ল্যাডিস্টিক্স, ফেনোটাইপে। ঐতিহাসিকভাবে, ফাইলোজেনেটিক পদ্ধতিবিদ্যার উপর গবেষণা পরিচালনাকারী বিজ্ঞানীরা স্বতন্ত্রভাবে বা ছোট গোষ্ঠীতে ম্যাকক্লেড, মেসকুইট এবং নেক্সাস ডেটা এডিটরের মতো ঐতিহ্যবাহী একক-ব্যবহারকারী সফ্টওয়্যার অ্যাপ্লিকেশন ব্যবহার করে কাজ করেছেন। যেহেতু অধ্যয়নরত অনুমানগুলি আরও জটিল হয়ে উঠেছে, বড় গবেষণা দলগুলি আনুমানিক <আইডি1 মিলিয়ন জীবিত প্রজাতি এবং জীবাশ্ম থেকে জানা আরও হাজার হাজার বিলুপ্ত প্রজাতির জন্য ট্রি অফ লাইফ আবিষ্কারের সমস্যা মোকাবেলার জন্য একত্রিত হয়েছে। যেহেতু ফেনোটাইপ মৌলিকভাবে দৃশ্যমান, এবং যেহেতু ফেনোটাইপ-ভিত্তিক ফাইলোজেনেটিক গবেষণা আকারে বৃদ্ধি অব্যাহত রেখেছে, তাই পর্যবেক্ষণগুলি লেবেলযুক্ত চিত্র দ্বারা ব্যাক আপ করা গুরুত্বপূর্ণ হয়ে ওঠে। বর্তমানে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত ঐতিহ্যবাহী ডেস্কটপ সফ্টওয়্যার অ্যাপ্লিকেশনগুলি দল-ভিত্তিক গবেষণা বা ইমেজ ম্যানিপুলেশন এবং স্টোরেজের জন্য শক্তিশালী সমর্থন প্রদান করে না। ফেনোমিক্সের ক্রমবর্ধমান বৈজ্ঞানিক ক্ষেত্রের জন্য মরফোব্যাঙ্ক একটি বিশেষ গুরুত্বপূর্ণ হাতিয়ার। মরফোব্যাঙ্কের উন্নয়ন, যা 2001 সালে শুরু হয়েছিল, জাতীয় বিজ্ঞান ফাউন্ডেশনের ভূবিজ্ঞান, জৈবিক বিজ্ঞান এবং কম্পিউটার ও তথ্য বিজ্ঞান ও প্রকৌশল অধিদপ্তর দ্বারা অর্থায়ন করা হয়েছে। মরফোব্যাঙ্কের উপর বৈজ্ঞানিক কাজের তাৎপর্য অন্যান্য প্রকাশনার মধ্যে নিউ ইয়র্ক টাইমসে (এখানে এবং এখানে) তুলে ধরা হয়েছে। উপকারিতা জীবন বৃক্ষ তৈরির জন্য ফাইলোজেনেটিক্স অধ্যয়নরত বিজ্ঞানীদের দলগুলি প্রজাতি সম্পর্কে পর্যবেক্ষণের বড় স্প্রেডশিট একত্রিত করে ("ম্যাট্রিক্স" হিসাবে উল্লেখ করা হয়)। এই দলগুলির বৈজ্ঞানিক গবেষণা প্রকল্পের সময় দলের প্রতিটি সদস্যের দ্বারা দলের তথ্যের একটি একক এবং সুরক্ষিত অনুলিপিতে একযোগে প্রবেশাধিকার প্রয়োজন। তথ্য সংগ্রহের পর্যায়ে তথ্যের এই একক অনুলিপিটিও প্রচুর ফ্রিকোয়েন্সির সাথে পরিবর্তিত হয়। সমতাত্ত্বিক বিবৃতি নথিভুক্ত করার জন্য যে চিত্রগুলি খুব সহায়ক হতে পারে সেগুলি অবশ্যই প্রদর্শিত, লেবেলযুক্ত এবং সমতাত্ত্বিক বিবৃতি বিকাশের সাথে ভাগ করা উচিত। এটি শুধুমাত্র একটি ডেস্কটপ সফ্টওয়্যার প্যাকেজ দিয়ে সুন্দরভাবে সম্পন্ন করা যায় না কারণ একটি ডেস্কটপ পরিবেশে প্রতিটি সহযোগী প্রকল্পের তথ্যের নিজস্ব ব্যক্তিগত অনুলিপিতে কাজ করছে। একজন অংশগ্রহণকারীর দ্বারা করা পরিবর্তনগুলি স্বয়ংক্রিয়ভাবে অন্যদের কাছে প্রচার করতে পারে না, সহযোগীদের একে অপরের ডেটা সম্পাদনাগুলি দেখতে বাধা দেয় যতক্ষণ না তারা ম্যানুয়ালি (এবং জড়িত প্রচেষ্টার কারণে, প্রায়শই পর্যায়ক্রমে) একটি একক "সত্য" ডেটাসেটে একীভূত হয়। দলগুলির মধ্যে সবচেয়ে ছোট এবং সবচেয়ে শৃঙ্খলাবদ্ধ দলগুলি ছাড়া, ফাইল সংস্করণ নিয়ন্ত্রণ এবং তথ্যের একাধিক অনুলিপিতে করা পরিবর্তনের পুনর্মিলন দ্রুত উত্পাদনশীলতার উপর উল্লেখযোগ্য টান হিসাবে আবির্ভূত হয়। মর্ফোব্যাঙ্ক হল আয়াক্স, ওয়েব পরিষেবা স্তর এবং সমৃদ্ধ ওয়েব অ্যাপ্লিকেশন সহ ওয়েবের সর্বব্যাপীতা এবং আধুনিক ওয়েব-ভিত্তিক অ্যাপ্লিকেশন কৌশলগুলি ব্যবহার করে ফাইলোজেনেটিক গবেষণার জন্য একটি সম্পূর্ণ বৈশিষ্ট্যযুক্ত, নেট-অ্যাক্সেসযোগ্য সহযোগিতামূলক কর্মক্ষেত্র প্রদানের মাধ্যমে এই সমস্যাগুলি সমাধান করার একটি প্রচেষ্টা। বিশেষত, মরফোব্যাঙ্ক এটিকে সহজ করে তোলেঃ ভৌগোলিকভাবে পৃথক দলের সদস্যদের সাথে সমস্ত ধরণের ডেটা ভাগ করে নেওয়া, যার মধ্যে ট্যাক্সোনমি, চরিত্র এবং নমুনা ডেটা, মিডিয়া (চিত্র, ভিডিও এবং অডিও সহ), ফাইলোজেনেটিক ম্যাট্রিক্স (ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত নেক্সাস এবং টিএনটি ফর্ম্যাটের ডেটা সহ) এবং অন্যান্য ডেটা যেমন নথি এবং জেনেটিক সিকোয়েন্স। একটি ওয়েব-ভিত্তিক চিত্র টীকা অ্যাপ্লিকেশন ব্যবহার করে উচ্চ-রেজোলিউশনের চিত্রগুলিকে লেবেল করুন। একটি অন্তর্নির্মিত ওয়েব-ভিত্তিক ম্যাট্রিক্স সম্পাদক ব্যবহার করে ফাইলোজেনেটিক ম্যাট্রিক্সের মতো প্রকল্পের তথ্য সহযোগিতামূলকভাবে সম্পাদনা করুন। সম্পাদক একটি ম্যাট্রিক্সের পৃথক কোষে লেবেলযুক্ত চিত্রগুলির সংযোগের অনুমতি দেয়। প্রকল্পের ডেটাতে প্রবেশাধিকার পরিচালনা করুন। দলের সদস্যদের জন্য পূর্ণ প্রবেশাধিকার থেকে শুরু করে সম্ভাব্য পর্যালোচকদের জন্য বেনামী পঠনযোগ্য প্রবেশাধিকার পর্যন্ত প্রবেশাধিকারের পরিসর রয়েছে। একটি স্থায়ী ইউ. আর. এল সহ একটি প্রকাশিত কাগজের সমর্থনে ওয়েবে সম্পূর্ণ প্রকল্পের তথ্য প্রকাশ করুন। ট্যাক্সনের উদাহরণস্বরূপ ছবিগুলির জন্য দ্য এনসাইক্লোপিডিয়া অফ লাইফ অনুসন্ধান করুন। উচ্চ রেজোলিউশনের সি. টি. তথ্য সংরক্ষণ করুন ম্যাট্রিক্স কোষগুলিকে হালনাগাদ এবং জনবহুল করার জন্য অ্যান্টোলজি তৈরি করুন। বেশিরভাগ বিদ্যমান সফ্টওয়্যার অ্যাপ্লিকেশনগুলিতে এই কাজগুলি কঠিন বা অসম্ভব। 2001 সালে ন্যাশনাল সায়েন্স ফাউন্ডেশন (এনএসএফ) নিউইয়র্কের আমেরিকান মিউজিয়াম অফ ন্যাচারাল হিস্ট্রিতে একটি কর্মশালার পৃষ্ঠপোষকতা করে, যাতে রূপতাত্ত্বিক ফাইলোজেনেটিক্সের জন্য একটি সহযোগী, মিডিয়া-সমৃদ্ধ গবেষণা সরঞ্জামের জন্য একটি ওয়েব-ভিত্তিক ব্যবস্থার রূপরেখা তৈরি করা যায়। কর্মশালায় উপস্থাপিত একটি অ্যাপ্লিকেশন প্রোটোটাইপ পরে কর্মশালার প্রতিক্রিয়া দিয়ে পরিমার্জন করা হয়েছিল এবং মরফোব্যাঙ্ক সংস্করণ 1-এ পরিণত হয়েছিল। মার্কিন জাতীয় মহাসাগরীয় ও বায়ুমণ্ডলীয় প্রশাসনের একটি অনুদান 2005 সালে প্রকাশিত সংস্করণ 2-এর ফলে আরও সংশোধনের জন্য অর্থায়ন করে। এন. এস. এফ-এর বর্তমান সহায়তা মরফোব্যাঙ্কের বর্তমান বৈশিষ্ট্যের উন্নতির জন্য অর্থায়ন করছে। মরফোব্যাঙ্ক 2021 সালের অক্টোবরের শেষ পর্যন্ত স্টনি ব্রুক বিশ্ববিদ্যালয় দ্বারা হোস্ট করা হয়েছিল এবং আমেরিকান মিউজিয়াম অফ ন্যাচারাল হিস্ট্রি থেকে ব্যাক আপ সমর্থন পেয়েছিল। বর্তমান সংস্করণটি হল 3। ক্ল্যাডিস্টিক্স জার্নালে সফ্টওয়্যারটির যৌক্তিকতা বর্ণনা করা হয়েছে। মরফোব্যাঙ্ক এনইএসসিইএনটি এবং সান দিয়েগো সুপার কম্পিউটার সেন্টার থেকেও সমর্থন পেয়েছে। 2018 সাল থেকে, মরফোব্যাঙ্ক ফিনিক্স বায়োইনফরম্যাটিক্স দ্বারা আংশিকভাবে সমর্থিত হয়েছে, যা মৌলিক বিজ্ঞানের জন্য ডাটাবেস বজায় রাখার জন্য প্রতিষ্ঠিত একটি অলাভজনক সংস্থা। 2021 সালের অক্টোবরের শেষের দিকে স্টনি ব্রুক বিশ্ববিদ্যালয় থেকে ফিনিক্স বায়োইনফরম্যাটিক্সে মরফোব্যাঙ্কের একটি স্থায়ী স্থানান্তর সম্পন্ন হয়। সান দিয়েগো সুপার কম্পিউটার সেন্টার এর আগে মরফোব্যাঙ্ক প্রকল্পে প্রযুক্তিগত এবং হোস্টিং সংস্থান সরবরাহ করেছে। ইউসেজ মরফোব্যাঙ্ক ফেনোটাইপগুলির উপর পিয়ার-পর্যালোচিত বৈজ্ঞানিক গবেষণার পণ্যগুলি হোস্ট করে। পদ্ধতিগত তথ্যের ক্রমবর্ধমান পরিমাণ "জন্মগত ডিজিটাল" এবং মরফোব্যাঙ্ক এই ধরনের উপাদান পরিচালনা করার জন্য উপযুক্ত। 2007 সালের 24শে আগস্ট মরফোব্যাঙ্ক 62টি সক্রিয় গবেষণা প্রকল্পের পাশাপাশি 6টি সম্পূর্ণ (এবং প্রকাশিত) প্রকল্পের আয়োজন করে। 2017 সালের মধ্যে 2000 এরও বেশি বিজ্ঞানী এবং তাদের ছাত্র নিবন্ধিত বিষয়বস্তু নির্মাতা ছিলেন (ব্যবহারকারীদের নিবন্ধনের প্রয়োজন নেই এবং এমনকি আরও বেশি সংখ্যক) এবং প্রায় 80,000 চিত্র সহ 500 টিরও বেশি সর্বজনীনভাবে উপলব্ধ প্রকল্প রয়েছে যা বৈজ্ঞানিক গবেষণার পণ্য। মরফোব্যাঙ্ক 1,500টিরও বেশি সক্রিয় গবেষণা প্রকল্প পরিচালনা করে। সফ্টওয়্যারটি স্তন্যপায়ী প্রাণী, বাদুড় থেকে তিমি, বাইভালভ মোলাস্ক, আরাক্নিড, জীবাশ্ম উদ্ভিদ এবং জীবিত এবং বিলুপ্ত অ্যামনিয়োটের মতো গোষ্ঠীগুলির উপর ফাইলোজেনেটিক গবেষণা একত্রিত করতে ব্যবহৃত হয়েছে। লেসুইং পোকামাকড় গেকোস, র্যাপ্টর পাখি, ডাইনোসর, ব্যাঙ এবং নেমাটোডের উপর প্রকাশিত গবেষণার সাথে যুক্ত কিউরেটেড চিত্রগুলি হোস্ট করার জন্য এটি বিবর্তনীয় এবং প্যালিওন্টোলজিকাল গবেষণায় আরও বিস্তৃতভাবে ব্যবহৃত হয়েছে। পেলিওবায়োলজি ডাটাবেসের সাথে মর্ফোব্যাঙ্ক ক্রমবর্ধমানভাবে ব্যবহৃত হচ্ছে। উদাহরণ প্রকাশিত প্রকল্পঃ প্রকল্প 1097: ফাঁকা সিই, 2013 মিঠা জলের পরিবেশে সালোকসংশ্লেষক ইউক্যারিওটের উৎপত্তি এবং প্রাথমিক বিবর্তন-বৈশিষ্ট্য বিবর্তনের আলোকে প্রোটেরোজোয়িক প্যালিওবায়োলজি এবং জৈব-ভূ-রাসায়নিক প্রক্রিয়াগুলির পুনর্বিবেচনা প্রকল্প 2520: কারভালহো, টি. পি., আর. ই. রেইস এবং জে. পি. ফ্রিয়েল, 2017 ভেনিজুয়েলার মারাকাইবো অববাহিকা থেকে হপলোমাইজনের একটি নতুন প্রজাতি (সিলুরিফর্মসঃ অ্যাসপ্রেডিনিডি): উচ্চ-রেজোলিউশন প্রকল্প 2651 ব্যবহার করে অস্টিওলজিকাল বিবরণঃ ব্যারন, এম. জি., নরম্যান, ডি. বি., ব্যারেট, পি. এম., 2017 ডাইনোসর সম্পর্কের একটি নতুন অনুমান এবং প্রাথমিক ডি মরফোব্যাঙ্ক এই ধরনের প্রকল্পগুলির জন্য উপযুক্ত কারণ এর ট্যাক্সোনমিক, চরিত্র এবং ম্যাট্রিক্স-ভিত্তিক তথ্যের পাশাপাশি এর সহযোগিতামূলক বৈশিষ্ট্যগুলি একত্রিত করার সরঞ্জাম রয়েছে। এই গবেষণার হাইলাইটগুলির মধ্যে রয়েছে সায়েন্সে প্রকাশিত স্তন্যপায়ী বিবর্তনের উপর একটি সহযোগী ম্যাট্রিক্স যার মধ্যে 80 টিরও বেশি প্রজাতির জন্য 4,000 টিরও বেশি ফেনোমিক অক্ষর, প্রায় 600 টি চিত্র সমন্বিত বিদ্যমান ব্যালেন তিমির উপর একটি ম্যাট্রিক্স এবং আরও অনেক কিছু অন্তর্ভুক্ত ছিল। তথ্যসূত্র উদ্ধৃতি। বাহ্যিক লিঙ্ক মরফোব্যাঙ্কের হোম পেজ মডার্নাইজিং দ্য ট্রি অফ লাইফ, সায়েন্স, 10 জুন 2003,300:1692-1697। জীববৈচিত্র্যের মূল্যায়ন সহজতর ও ত্বরান্বিত করার জন্য মরফোব্যাঙ্ক সহ প্রকল্পগুলির প্রচেষ্টা নিয়ে আলোচনা করা নিবন্ধ। "মর্ফোলজিঃ দ্য শেপ অফ থিংস টু কাম", পল ডি. থ্যাকার, বায়োসায়েন্স, জুন 2003, খণ্ড। 53 নং। 6, 544। মরফোব্যাঙ্ক সহ রূপতাত্ত্বিক গবেষণার সমসাময়িক উদ্যোগের উপর একটি প্রতিবেদন। ওয়েব অ্যাপ্লিকেশন বায়োইনফরম্যাটিক্স সফ্টওয়্যার প্যালিওন্টোলজি বিবর্তন অঙ্গসংস্থান (জীববিজ্ঞান) শ্রেণীবিন্যাস প্রজাতি জীবাশ্ম