Rubicon (protein)
রুবিকন (রান ডোমেইন বেক্লিন-1-ইন্টারেক্টিং এবং সিস্টিন সমৃদ্ধ ডোমেইন-ধারণকারী প্রোটিন) হল একটি প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে আরইউবিসিএন জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। রুবিকন অটোফাগির কয়েকটি পরিচিত নেতিবাচক নিয়ন্ত্রকগুলির মধ্যে একটি, একটি সেলুলার প্রক্রিয়া যা অপ্রয়োজনীয় বা ক্ষতিগ্রস্ত সেলুলার উপাদানগুলিকে হ্রাস করে। ছোট জিটিপিজ র্যাব7-এর সাথে মিথস্ক্রিয়ার মাধ্যমে রুবিকনকে তার কর্মস্থলে নিয়োগ করা হয় এবং পিআই3কেসি3-সি2 (ক্লাস III ফসফ্যাটিডিলিনোসিটোল 3-কিনেজ কমপ্লেক্স 2)-এর প্রতিরোধের মাধ্যমে অটোফ্যাগির অটোফ্যাগোসোম-লাইসোসোম ফিউশন ধাপকে ক্ষতিগ্রস্ত করে। রুবিকনের নেতিবাচক মড্যুলেশন বার্ধক্য হ্রাস এবং বার্ধক্য-সম্পর্কিত রোগের সাথে যুক্তঃ রুবিকনের নকআউট গোলকৃমি এবং মহিলা ফলের মাছিগুলির আয়ু বাড়ায় এবং ইঁদুরের মধ্যে কিডনি ফাইব্রোসিস এবং α-সিনিউক্লিন জমা হ্রাস পায়। অটোফ্যাগি নিয়ন্ত্রণের পাশাপাশি, এলসি3-সম্পর্কিত ফাগোসাইটোসিস (এলএপি) এবং এলসি3-সম্পর্কিত এন্ডোসাইটোসিসের (ল্যান্ডো) জন্য রুবিকনের প্রয়োজন দেখা গেছে। একাধিক ডাউনস্ট্রিম নিয়ন্ত্রক অণুর সাথে সরাসরি মিথস্ক্রিয়ার মাধ্যমে রুবিকন সহজাত ইমিউন প্রতিক্রিয়াকে নেতিবাচকভাবে নিয়ন্ত্রণ করতেও দেখানো হয়েছে। কাঠামো রুবিকন 972টি অ্যামিনো অ্যাসিড নিয়ে গঠিত এবং এর একটি এন-টার্মিনাল রান ডোমেন, একটি মধ্য অঞ্চল (এমআর) এবং একটি সি-টার্মিনাল রুবিকন হোমোলজি (আরএইচ) ডোমেন রয়েছে। রুবিকন হোমোলজি ডোমেইন সিস্টিনের অবশিষ্টাংশে সমৃদ্ধ এবং কমপক্ষে 4টি ডাইভ্যালেন্ট জিঙ্ক আয়নকে আবদ্ধ করে, যা জিঙ্ক ফিঙ্গার মোটিফ তৈরি করে। রুবিকন এবং জিটিপি-আবদ্ধ র্যাব 7-এর মধ্যে মিথস্ক্রিয়ার কাঠামোগত ভিত্তি পরীক্ষামূলকভাবে নির্ধারণ করা হয়েছে (পিডিবি আইডিঃ 6ডব্লিউসিডব্লিউ)। ফাংশন এন-টার্মিনাল রান ডোমেনের ফাংশন অজানা, তবে অটোফ্যাগি দমন করার জন্য এটি প্রয়োজন। মধ্য অঞ্চলে পিআই3কে-বাইন্ডিং ডোমেন (পিআইকেবিডি) রয়েছে, যা পিআই3কেসি3-সি2 প্রতিরোধের মধ্যস্থতা করে। সি-টার্মিনাল রুবিকন হোমোলজি ডোমেনটি র্যাব 7-এর সাথে মিথস্ক্রিয়ার মধ্যস্থতা করে এবং পি. এল. ই. কে. এইচ. এম 1 এবং পেসার (যা আর. ইউ. বি. সি. এন. এল, রুবিকনের মতো অটোফ্যাগি এনহ্যান্সার নামেও পরিচিত) সহ অন্যান্য আর. এইচ ডোমেন-ধারণকারী অটোফ্যাগি নিয়ন্ত্রক প্রোটিন দ্বারা ভাগ করা হয়। অটোফ্যাগি-নির্ভর রুবিকন পিআই3কেসি3-সি2-এর সাথে সংযোগ এবং প্রতিরোধের মাধ্যমে অটোফ্যাগিকে দমন করে। বিশেষত, রুবিকন সরাসরি পিআই3কেসি3-সি2-কে আবদ্ধ করে এবং বেক্লিন-1 সাবইউনিটের গঠনমূলক মড্যুলেশনের মাধ্যমে ঝিল্লিতে পিআই3কেসি3-সি2-এর নিয়োগকে বাধা দেয়। এই ক্রিয়াকলাপ অটোফ্যাগোসোম ঝিল্লিতে পিআই3কেসি3-নির্দেশিত ফসফ্যাটিডিলিনোসিটোল 3-ফসফেট (পিআই3পি) উৎপাদনে বাধা দেয় এবং এর ফলে অটোফ্যাগোসোম-লাইসোসোম ফিউশন পরিচালনাকারী যন্ত্রপাতি নিয়োগ করতে ব্যর্থ হয়। রব 7-এর সাথে সরাসরি মিথস্ক্রিয়ার মাধ্যমে রুবিকনকে তার কর্মস্থলে লক্ষ্য করা হয়, যা দেরিতে এন্ডোসোম এবং দেরিতে অটোফাগোসোমগুলিকে সজ্জিত করে। এলসি3-সম্পর্কিত ফাগোসাইটোসিস (এলএপি) এবং এলসি3-সম্পর্কিত এন্ডোসাইটোসিসের (ল্যান্ডো) জন্য অটোফ্যাগি-স্বাধীন রুবিকনের প্রয়োজন হয়। রুবিকন ফাগোসোমে পিআই3কেসি3 স্থানীয়করণে ভূমিকা পালন করে, যা ঝিল্লিতে পিআই3পি উৎপাদন এবং এনওএক্স2 সহ ডাউনস্ট্রিম প্রভাবক নিয়োগের জন্য গুরুত্বপূর্ণ। রুবিকন সহজাত ইমিউন প্রতিক্রিয়া দমন করতে এবং কিছু ক্ষেত্রে ভাইরাল প্রতিলিপি তীব্রতর করতে দেখা গেছে। রুবিকন এন. এফ-কে. বি এসেনশিয়াল মড্যুলেটর (এন. ই. এম. ও), ইন্টারফেরন রেগুলেটরি ফ্যাক্টর 3 (আই. আর. এফ 3) এবং ক্যাসপেস রিক্রুটমেন্ট ডোমেইন-ধারণকারী প্রোটিন 9 (সি. এ. আর. ডি 9)-এর সঙ্গে মিথস্ক্রিয়ার মাধ্যমে সাইটোকাইনের প্রতিক্রিয়াকে দমন করে। বার্ধক্যজনিত রোগ এবং রোগে ভূমিকা বার্ধক্যজনিত রোগ রুবিকন এক্সপ্রেশন মাত্রা ইঁদুর এবং অন্যান্য মডেল জীবের বয়সের সাথে বৃদ্ধি পায়, যা পরামর্শ দেয় যে রুবিকন বয়স-সম্পর্কিত অটোফাগির হ্রাস ঘটাতে পারে। যেহেতু অটোফ্যাগি হ্রাস বার্ধক্য এবং বয়স-সম্পর্কিত রোগের সাথে যুক্ত, তাই রুবিকনের মড্যুলেশনকে একটি সম্ভাব্য থেরাপিউটিক লক্ষ্য হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছে। ইঁদুরের ক্ষেত্রে, রুবিকন নকআউট মস্তিষ্কে α-সিঙ্কুক্লিন জমা হওয়া হ্রাস করে এবং কিডনিতে ইন্টারস্টিশিয়াল ফাইব্রোসিস হ্রাস করে। বার্ধক্যজনিত রুবিকন নকআউট অটোফাগির মড্যুলেশনের মাধ্যমে গোলকৃমির (সি. এলিগ্যানস) আয়ু বাড়ায় এবং মহিলা ফল মাছিদের (ডি. মেলানোগাস্টার) আয়ুও বাড়ায়। নন-অ্যালকোহলিক ফ্যাটি লিভার ডিজিজ (এন. এ. এফ. এল. ডি)-এর মাউস মডেলগুলিতে রুবিকনের মাত্রা বৃদ্ধি পায়। হেপাটোসাইটগুলিতে রুবিকনের নকআউট লিভার স্টেটোসিস এবং অটোফাগির উন্নতি করে, যা পরামর্শ দেয় যে রুবিকন এনএএফএলডি প্যাথোজেনেসিসে অবদান রাখে। বিপাকীয় রোগ অ্যাডিপোজ টিস্যুতে রুবিকন এক্সপ্রেশনের বয়স-নির্ভর হ্রাস অত্যধিক অটোফ্যাগিক ক্রিয়াকলাপের কারণে বিপাকীয় ব্যাধিগুলিকে বাড়িয়ে তুলতে পারে। সালিহ অ্যাটাক্সিয়া (এসসিএআর15) রুবিকনের মধ্যে একটি একক নিউক্লিওটাইড অপসারণ মিউটেশন সালিহ অ্যাটাক্সিয়ার (ওএমআইএম আইডিঃ 615705) কারণ। সালিহ অ্যাটাক্সিয়া (স্পিনোসেরেবেলার অ্যাটাক্সিয়া, অটোসোমাল রিসেসিভ 15 বা এসসিএআর15 নামেও পরিচিত) হল স্পিনোসেরেবেলার অ্যাটাক্সিয়ার একটি রূপ যা হাত, হাঁটাচলা, কথা বলা এবং চোখের চলাফেরার সমন্বয় হ্রাস দ্বারা চিহ্নিত করা হয়। অ্যালানাইন 875 থেকে শুরু করে রুবিকন-কোডিং জিনে একটি ফ্রেমশিফ্ট মিউটেশন এবং একটি ভুল ওপেন রিডিং ফ্রেম সৃষ্টি করে একটি মিউটেশন (c.2624delC p.Ala875ValfsX146) বহনকারী শিশুদের মধ্যে এই রোগটি আবিষ্কৃত হয়েছিল। সি-টার্মিনাল ডোমেনের ফলস্বরূপ ব্যাঘাতটি রব 7 এবং দেরী এন্ডোসোমের সাথে রুবিকন উপকোষীয় স্থানীয়করণকে ব্যাহত করে। আরও দেখুন পি. এল. ই. কে. এইচ. এম1 আর. ইউ. বি. সি. এন. এল (রুবিকনের মতো) আর. এ. বি7এ বেক্লিন-1 রেফারেন্স