TEDDM1
ট্রান্সমেম্ব্রেন এপিডিডাইমাল প্রোটিন 1 হল একটি ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন যা টিইডিডিএম1 জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। টিইডিডিএম1 সাধারণত টিএমইএম45সি নামেও পরিচিত এবং 273টি অ্যামিনো অ্যাসিডকে এনকোড করে যার মধ্যে ছয়টি আলফা-হেলিক্স ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চল রয়েছে। প্রোটিনটিতে অজানা কার্যকারিতার 118টি অ্যামিনো অ্যাসিড দৈর্ঘ্যের পরিবার রয়েছে। যদিও টিইডিডিএম1-এর সঠিক কার্যকারিতা বোঝা যায় না, এটি প্লাজমা ঝিল্লির একটি অবিচ্ছেদ্য উপাদান বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়। জিন লোকাস টিইডিডিএম1 ক্রোমোজোম 1-এ অবস্থিত যা বিয়োগ প্রান্তে 1q25.3-এ পাওয়া যায়। টিইডিডিএম1 একটি একক এক্সন নিয়ে গঠিত। টিইডিডিএম1-এর জিন এলাকার মধ্যে রয়েছে গ্লুটামেট-অ্যামোনিয়া লাইগেজ (জিএলইউএল), লং ইন্টারজেনিক নন-প্রোটিন কোডিং আরএনএ 272 (এলআইএনসি00272) এবং শার্পার-এমপিআরএ নিয়ন্ত্রক অঞ্চল 13543 (এলওসি122149321)। অভিব্যক্তি টিইডিডিএম1 বেশিরভাগ প্রধান টিস্যুতে প্রকাশিত হয়। টিইডিডিএম1 এক্সপ্রেশন সহ অন্যান্য সমস্ত টিস্যুর তুলনায় জিনটি অণ্ডকোষের উচ্চ স্তরে এবং হৃদপিণ্ডে নিম্ন স্তরে প্রকাশিত হয়। মস্তিষ্কে, টিইডিডিএম1 অ্যামিগডালা, হিপ্পোক্যাম্পাস এবং স্ট্রিয়াটামে প্রকাশিত হয়। ইঁদুরের মস্তিষ্কে, একটি আর. এন. এ প্রোব ব্যবহার করে সাধারণ অভিব্যক্তি সহ টি. ই. ডি. ডি. এম1 আবিষ্কৃত হয়েছিল। কোষের মধ্যে, টিইডিডিএম1 প্রাথমিকভাবে প্লাজমা ঝিল্লিতে প্রকাশিত হয়। অন্যান্য ঝিল্লি-আবদ্ধ প্রোটিনের মতো, টিইডিডিএম1 প্রোটিনে একটি পূর্বাভাস সংকেত পেপটাইড থাকে, যদিও সংকেত পেপটাইডের ধরন অজানা। যেহেতু টিইডিডিএম1 অন্যান্য ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিনের সাথে অনেক বৈশিষ্ট্য ভাগ করে নেয়, তাই এটি পরামর্শ দেয় যে সিগন্যাল ট্রান্সডাকশন এবং প্রোটিন পাচারের মতো বিভিন্ন কোষ প্রক্রিয়াতে প্রোটিনের ভূমিকা থাকতে পারে। জিন স্তর নিয়ন্ত্রণ টি. ই. ডি. ডি. এম1-এর অভিব্যক্তি প্যাটার্ন সর্বব্যাপী ছিল। মানুষের মধ্যে টি. ই. ডি. ডি. এম. 1 এম. আর. এন. এ প্রাচুর্য মাঝারি থেকে কম ছিল। প্রোটিন টিইডিডিএম1 প্রোটিনের আণবিক ওজন প্রায় 31.3 কেডিএ এবং টিইডিডিএম1-এর তাত্ত্বিক আইসোইলেক্ট্রিক পয়েন্ট (পিআই) 8.02। উল্লেখযোগ্যভাবে, এটি অন্যান্য প্রোটিনের গড় পি. আই-এর থেকে আলাদা কারণ তাদের পি. আই 4-7 এর পি. এইচ পরিসরে পড়ে। এর থেকে বোঝা যায় যে টিইডিডিএম1 প্রোটিনে বেশিরভাগ প্রোটিনের তুলনায় মৌলিক অ্যামিনো অ্যাসিড বেশি থাকে। টিইডিডিএম1 ডোমেনের ডিইউএফ716 নামে অজানা ফাংশনের একটি একক প্রধান ডোমেন রয়েছে। এই ক্ষেত্রটি প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিড অবস্থান 95 থেকে 219 পর্যন্ত বিস্তৃত। ডিইউএফ716-এ বেশিরভাগ লিউসিন জিপার থাকে যা সাধারণত প্রোটিনের ডাইমেরাইজেশনের সাথে যুক্ত। ডিইউএফ716-এ প্রোটিনের ছয়টি ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চলের মধ্যে তিনটি রয়েছে এবং এতে উচ্চ সংরক্ষণের অ্যামিনো অ্যাসিড বিভাগ রয়েছে, যা পরামর্শ দেয় যে ডিইউএফ716 সম্ভবত টিইডিডিএম1 প্রোটিন ফাংশনে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। পোস্ট ট্রান্সলেশনাল পরিবর্তনগুলি টি. ই. ডি. ডি. এম1 বেশ কয়েকটি পোস্ট ট্রান্সলেশনাল পরিবর্তন সাপেক্ষে। আঠারোটি পূর্বাভাসকৃত ফসফোরাইলেশন সাইট রয়েছে। অন্যান্য নির্দিষ্ট স্থানগুলির মধ্যে রয়েছে একটি এন-গ্লাইকোসাইলেশন সাইট, একটি কেসিন কাইনেজ II ফসফোরাইলেশন সাইট, একটি লিউসিন জিপার প্যাটার্ন, দুটি এন-মাইরিস্টাইলেশন সাইট এবং তিনটি প্রোটিন কাইনেজ সি ফসফোরাইলেশন সাইট। এন-গ্লাইকোসাইলেশন ঝিল্লি প্রোটিনের আরেকটি সাধারণ বৈশিষ্ট্য এবং এটি নিঃসরণ এবং সাইটোস্কেলিটাল সংগঠনের সাথে জড়িত। কেসিন কাইনেজ 2 প্রোটিনের স্থায়িত্ব এবং কোষ সংকেত প্রতিক্রিয়ার সাথে জড়িত। লিউসিন জিপার হল ক্রম মোটিফ যা প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়াকে সহজতর করে। এন-মাইরিস্টিলেশন সাইটগুলি লিগ্যান্ড বাঁধাই এবং প্রোটিন গতিশীলতার সাথে জড়িত। প্রোটিন কাইনেজ সি ফসফোরিলেশন কোষের বিস্তার এবং জিন অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণের সাথে সম্পর্কিত। কাঠামো টিইডিডিএম1-এর গৌণ কাঠামোটি এন-টার্মিনাসের মুক্ত এলোমেলো কয়েল এবং একটি একক আলফা হেলিক্স দিয়ে শুরু হয়। টিইডিডিএম1-এর ছয়টি ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিনকে কাঠামোগতভাবে অনুরূপ আলফা হেলিসেস হিসাবে চিহ্নিত করা হয়। প্রোটিনের এই অঞ্চলটি এন-টার্মিনাসের তুলনায় বেশ ঘনীভূত। আলফা হেলিসেসগুলিতে সাধারণত প্রধানত হাইড্রোফোবিক অবশিষ্টাংশ থাকে, যা প্লাজমা ঝিল্লির মধ্যে অবস্থিত এই অঞ্চলগুলির সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ। আলফা হেলিসগুলি সাধারণত ডিএনএ বাঁধাই মোটিফের সাথেও যুক্ত। হোমোলজি/ইভোলিউশন প্যারালগস টিইডিডিএম1-এর দুটি পরিচিত প্যারালগ রয়েছে, টিএমইএম45এ এবং টিএমইএম45বি। মানব জিন টি. ই. ডি. ডি. এম1-এর জন্য 100টিরও বেশি অর্থোলগ রয়েছে। এই পরিচিত অর্থোলোগগুলির মধ্যে এগুলি শুধুমাত্র স্তন্যপায়ী প্রাণী, উভচর প্রাণীদের মধ্যে বিদ্যমান ছিল এবং পাওয়া সমস্ত অর্থোলোগের fish.The বিচ্যুতির তারিখকে হোমো স্যাপিয়েন্সের সাথে তুলনা করা হয়েছিল। মাছের টি. ই. ডি. ডি. এম1 হল মানব টি. ই. ডি. ডি. এম1-এর সাথে সবচেয়ে দূরবর্তীভাবে সম্পর্কিত অর্থোলগ, যার বিচ্যুতির সর্বাধিক মধ্যমা তারিখ 4 কোটি 64 লক্ষ বছর আগে। যদিও টিইডিডিএম1-এর অর্থোলগ হাড়ের মাছের মধ্যে বিদ্যমান, যা প্রোটোপটেরাস অ্যানেক্টেন্সে এর অস্তিত্ব থেকে প্রমাণিত হয়, কার্টিলাজিনাস মাছের মধ্যে জিনের অর্থোলগ অনেক বেশি পাওয়া যায়। বিবর্তন টিইডিডিএম1-এর আণবিক বিবর্তনের আপেক্ষিক হার ছিল ফাইব্রিনোজেন আলফার অনুরূপ এবং সাইটোক্রোম সি-এর বিবর্তনের হারের তুলনায় অনেক বেশি দ্রুত। ইন্টারঅ্যাক্টিং প্রোটিনগুলি স্ট্রিংয়ের মাধ্যমে পাওয়া টিইডিডিএম1 প্রোটিনের কার্যকরী অংশীদারদের পূর্বাভাস দেয়। ক্লিনিকাল তাৎপর্য পূর্ববর্তী ক্যান্সার গবেষণা অনুসারে, জিন-ভিত্তিক অ্যাসোসিয়েশন বিশ্লেষণগুলি আবিষ্কার করেছে যে জিএলইউএল-এর সাথে টিইডিডিএম1 হল দুটি জিন যা হেপাটাইটিস বি ভাইরাস সম্পর্কিত হেপাটোসেলুলার কার্সিনোমার সাথে সবচেয়ে উল্লেখযোগ্যভাবে সম্পর্কযুক্ত, যা লিভার ক্যান্সারের সবচেয়ে সাধারণ রূপ। কেরাটিনোসাইটের সাথে জড়িত থাকার কারণে এবং ভ্রূণ স্থাপন ও বিকাশের একটি গুরুত্বপূর্ণ নিয়ন্ত্রক মাইক্রোআরএনএ-31-এর প্রতিরোধের কারণে টিইডিডিএম1-এর উল্লেখযোগ্য ক্লিনিকাল তাৎপর্য রয়েছে। তথ্যসূত্র