Rubicon homology domain
রুবিকন হোমোলজি ডোমেন (আর. এইচ ডোমেন নামেও পরিচিত) প্রায় 250টি অ্যামিনো অ্যাসিডের একটি বিবর্তনীয়ভাবে সংরক্ষিত প্রোটিন ডোমেন যা প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়ার মধ্যস্থতা করে। অটোফ্যাগি এবং এন্ডোসোমাল পাচার নিয়ন্ত্রণের সাথে জড়িত বেশ কয়েকটি মানব প্রোটিনে আর. এইচ ডোমেন উপস্থিত রয়েছে। যদিও সমস্ত আর. এইচ. ক্ষেত্রগুলি চিহ্নিত করা হয়নি, মানব রুবিকন এবং পি. এল. ই. কে. এইচ. এম. 1-এর ক্ষেত্রগুলি ছোট জি. টি. পিজ র্যাব 7-এর সাথে মিথস্ক্রিয়ার মধ্যস্থতা করে, যা শেষের এন্ডোসোম এবং অটোফ্যাগোসোমে পাওয়া যায়। আর. এইচ ডোমেনে 16টি সংরক্ষিত সিস্টিন এবং হিস্টিডিনের অবশিষ্টাংশ রয়েছে যা দস্তা পরমাণুগুলিকে আবদ্ধ করে এবং কমপক্ষে 4টি দস্তা আঙুলের মোটিফ তৈরি করে। রুবিকনের আর. এইচ ডোমেনের সি-টার্মিনাসের দিকে অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ র্যাব 7-এর সাথে মিথস্ক্রিয়ার জন্য প্রয়োজনীয় বলে প্রমাণিত হয়েছে। কাঠামো এক্স-রে স্ফটিকবিদ্যা দ্বারা র্যাব 7-এর সাথে জটিল রুবিকন আরএইচ ডোমেনের 3ডি পারমাণবিক কাঠামো নির্ধারণ করা হয়েছে। আর. এইচ ডোমেনের কাঠামোর একটি "এল" আকৃতি রয়েছে, যার "এল" এর ভিত্তি র্যাব 7-এর সুইচ অঞ্চলের সাথে যোগাযোগ করে। কাঠামোটি মূলত আলফা হেলিকাল, দস্তা আঙুলের মোটিফের আশেপাশে ছোট বিটা স্ট্র্যান্ড অঞ্চল উপস্থিত রয়েছে। রুবিকন আরএইচ ডোমেনের এন-টার্মিনাল অঞ্চলটি একটি এফওয়াইভিই ডোমেনের অনুরূপ, তবে পিআই3পি-র ক্যানোনিকাল এফওয়াইভিই ডোমেন বাইন্ডিংয়ের জন্য প্রয়োজনীয় মৌলিক অবশিষ্টাংশগুলি উপস্থিত নেই। একটি আর. এইচ ডোমেইন আর. এইচ ডোমেইন ধারণকারী প্রোটিনগুলি বেশ কয়েকটি প্রোটিনে পাওয়া যায়, যার মধ্যে রয়েছে (মানুষের মধ্যে): রুবিকন, আর. এইচ ডোমেইন-ধারণকারী প্রোটিন পরিবারের সংজ্ঞায়িত সদস্য এবং অটোফ্যাগি পি. এল. ই. কে. এইচ. এম1-এর একটি নেতিবাচক নিয়ন্ত্রক, অস্টিওপেট্রোসিস পেসারে জড়িত একটি প্রোটিন, অটোফ্যাগি ডি. ই. এফ8-এর একটি ইতিবাচক নিয়ন্ত্রক, লাইসোসোম পেরিফেরাল ডিস্ট্রিবিউশন পি. এল. ই. কে. এইচ. এম3-এর একটি নিয়ন্ত্রক, যা কঙ্কালের পেশী পার্থক্যের সাথে জড়িত।