BEAST 2
বিইএএসটি 2 হল আণবিক ক্রমের বায়েসিয়ান বিশ্লেষণের জন্য একটি ক্রস-প্ল্যাটফর্ম প্রোগ্রাম। এটি বিভিন্ন বিকল্প এবং ঘড়ির মডেল এবং বিভিন্ন ধরনের ট্রি প্রাইওর ব্যবহার করে শিকড়যুক্ত, সময়োপযোগী ফাইলোজেনিগুলি অনুমান করে। স্ট্যান্ডার্ড বিশ্লেষণ স্থাপনের জন্য বিইউটিআই নামে একটি সম্পর্কিত সরঞ্জাম রয়েছে (যা এক্সএমএল ব্যবহার করে নির্দিষ্ট করা হয়)। বিইএএসটি 2 হল পূর্ববর্তী (এখনও সক্রিয়ভাবে বিকশিত) বিইএএসটি প্রোগ্রামের একটি সম্পূর্ণ পুনর্লিখন এবং এইভাবে কাজের একটি বড় অংশকে আকর্ষণ করে। বিইএএসটি 2-এর একটি উল্লেখযোগ্য বৈশিষ্ট্য হল প্যাকেজিং ব্যবস্থা যা নতুন মডেল বাস্তবায়নের প্রক্রিয়াটিকে সহজ করেছে। টেমিং দ্য বিস্ট হল একটি সম্প্রদায় চালিত সম্পদ যা বিস্ট 2 এবং সম্পর্কিত ফাইলোজেনেটিক সফ্টওয়্যার ব্যবহার শেখায়। বিইউটি বিইউটির অর্থ "বায়েসিয়ান বিবর্তনমূলক বিশ্লেষণ উপযোগিতা"। এটি একটি গ্রাফিকাল ইউজার ইন্টারফেস (জিইউআই) যা বিইএএসটি 2-এর জন্য ইনপুট ফাইল তৈরি করতে ব্যবহৃত হয়। এটি ব্যবহারকারীদের তাদের ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণের জন্য বিভিন্ন বিকল্প এবং সেটিংস সহজেই নির্দিষ্ট করার অনুমতি দেয়, যেমন ডেটা ফাইল, আণবিক বিবর্তনের মডেল এবং মডেল পরামিতিগুলির পূর্ববর্তী বিতরণ। বি. ই. এ. ইউ. টি ব্যবহারকারীদের এম. সি. এম. সি বিশ্লেষণের জন্য চেইনের দৈর্ঘ্য এবং স্যাম্পলিং ফ্রিকোয়েন্সির মতো পরামিতিগুলি নির্দিষ্ট করার অনুমতি দেয়। এটি বিইএএসটি 2 চালানোর একটি ব্যবহারকারী-বান্ধব উপায় করে তোলে, কারণ এটি ব্যবহারকারীদের এক্সএমএল ইনপুট ফাইলগুলি ম্যানুয়ালি সম্পাদনা করার প্রয়োজনীয়তা দূর করে। বিইউটি ব্যবহারকারীদের সহজেই বিভিন্ন প্যাকেজ ইনস্টল এবং পরিচালনা করার অনুমতি দেয়, যেমন আণবিক বিবর্তনের মডেল বা কোয়ালেসেন্ট মডেল। এই প্যাকেজগুলি সরাসরি বি. ই. এ. ইউ. টি থেকে ইনস্টল করা যেতে পারে। এটি ম্যানুয়ালি প্যাকেজগুলি ডাউনলোড এবং ইনস্টল করার প্রয়োজন ছাড়াই বিশ্লেষণে নতুন কার্যকারিতা যুক্ত করা সহজ করে তোলে। সি. বি. এ. এন কম্প্রিহেনসিভ বিস্ট আর্কাইভ নেটওয়ার্ক (সি. বি. এ. এন) হল বিস্ট 2 প্যাকেজের সরকারি ভান্ডার। সি. বি. এ. এন-এ প্যাকেজগুলি বাক্সের বাইরে বি. এ. ইউ. টি-র মাধ্যমে ইনস্টল করা যেতে পারে। লিঙ্গুয়া ফাইলো এ সম্পর্কিত প্রকল্প হল লিঙ্গুয়া ফাইলো (এল. পি. ফাই)। ওপেনবিইউজিএস-এর মতো একটি বাক্যবিন্যাস সহ ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণ সংজ্ঞায়িত করার জন্য এলফাই একটি সম্ভাব্য প্রোগ্রামিং ভাষা। এটি হাত দিয়ে এক্স. এম. এল লেখার প্রয়োজন ছাড়াই বি. ই. এ. এস. টি 2 এক্স. এম. এল ফাইল (এবং অন্যান্য ফাইলোজেনেটিক্স প্যাকেজের জন্য অনুরূপ মডেল নির্দিষ্টকরণ) তৈরি করার একটি উপায় প্রদান করে। রেফারেন্স বাহ্যিক লিঙ্ক ফাইলোজেনেটিক্স সফ্টওয়্যার