Andrimid
অ্যান্ড্রিমিড একটি অ্যান্টিবায়োটিক প্রাকৃতিক পণ্য যা সামুদ্রিক ব্যাকটেরিয়া ভিব্রিও কোরালিলিটিকাস দ্বারা উত্পাদিত হয়। অ্যাসিটাইল-কোএ কারবক্সিলেস (এসিসি)-এর কারবক্সিল স্থানান্তর প্রতিক্রিয়াকে অবরুদ্ধ করে অ্যান্ড্রিমিড ফ্যাটি অ্যাসিড জৈব সংশ্লেষণের একটি প্রতিরোধক। অ্যান্ড্রিমিডে একটি সিউডোপেপটাইড মেরুদণ্ড থাকে এবং এটি পলিকেটাইড সিন্থেস (পিকেএস) এবং নন-রাইবোসোমাল পেপটাইড সিন্থেটেস (এনআরপিএস) পথের মাধ্যমে সংশ্লেষিত হয়। অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি এনআরপিএস পথ দ্বারা যুক্ত হয় যা আণবিক সমাবেশ লাইনের সময় ক্রমবর্ধমান শৃঙ্খলে অ্যামিনো অ্যাসিড মনোমার ইউনিটগুলিকে লোড করে। জৈবসংশ্লেষণ সংক্ষিপ্তসারঃ কেটোসিনথেস (কেএস), চেইন লেংথ ফ্যাক্টর (সিএলএফ), ডিহাইড্রোজেনেস (ডিএইচ), কেটোরেডাক্টেস (কেআর), থাইওলেশন (টি), ট্রান্সগ্লুটামিনেস (টিজি), অ্যাডেনাইলেশন (এ), ঘনীভবন (সি), থাইওএস্টেরেস (টিই)। অ্যান্ড্রিমিড তিনটি অ্যামিনো অ্যাসিড থেকে উদ্ভূত হয় যা হল ফেনিল্যালানাইন, ভ্যালাইন এবং গ্লাইসিন। ফেনিল্যালানাইন তার অন্যান্য গঠনে রূপান্তরিত হয়, অন্যদিকে ভ্যালাইন এবং গ্লাইসিনের অবশিষ্টাংশগুলি ম্যালোনিল ইউনিট দ্বারা প্রাপ্ত দুটি কার্বন দ্বারা প্রসারিত হয়। অ্যান্ড্রিমিডের জৈব সংশ্লেষণে ফেনিল্যালানাইন অংশকে অন্তর্ভুক্ত করতে, এল-ফে-কে প্রথমে অ্যামিনোমুটেজ এ. ডি. এম. এইচ দ্বারা (এস)-বিটা-ফে-তে রূপান্তরিত করতে হবে। (এস)-বিটা-ফে এটিপি-র সাথে সক্রিয় (এস)-বিটা-ফে-এএমপি-তে প্রতিক্রিয়া জানায় এ ডোমেইন এ. ডি. এম. জে দ্বারা যা (এস)-বিটা-ফে-কে হোলো-এ. ডি. এম. আই (এইচ. এস-এ. ডি. এম. আই)-এ অন্তর্ভুক্ত করে, (এস)-বিটা-ফে-এস-এ. ডি. এম. আই গঠন করে। এ. ডি. এম. এফ তার সক্রিয় সাইট সিস্টিনের অ্যাসিলেশন দ্বারা অক্টাট্রিয়েনয়ল-বিটা-ফে-এস-এ. ডি. এম. আই গঠন করে অক্টাট্রিয়েনয়ল চেইন এবং আলফা-ফেনিল্যালানাইনের অ্যামাইন গ্রুপের গঠনকে অনুঘটক করে। প্রাকৃতিক পণ্য অ্যান্ড্রিমিড গঠনের জন্য চূড়ান্ত সেলাইয়ের আগে সংকর জৈব সংশ্লেষণ ছয়টি টি ডোমেনের মধ্য দিয়ে যায়। অ্যান্ড্রিমিড অ্যাসেম্বলি লাইনের অতিরিক্ত বৈশিষ্ট্যগুলি হল প্রারম্ভিক এনজাইম যেমন অ্যামিনোমুটেজ ধারণকারী এ. ডি. এম. এইচ, এ. ডি. এম. জে যা β-ফে অ্যাডেনাইলেশন (এ) ডোমেইন ধারণ করে যা ট্রান্সগ্লুটামিনেজ হোমোলগ এ. ডি. এম. এফ দ্বারা কোন সুগন্ধি অ্যামিনো অ্যাসিড ব্যবহার করা হয় তা নির্ধারণের জন্য জৈব সংশ্লেষণের দ্বাররক্ষী হিসাবে কাজ করে। অ্যাডমএফ অ্যাসাইল এস-টি ডোমেন এবং β-অ্যামিনোঅ্যাসিল-এস-টি ডোমেন ব্যবহার করে অ্যামাইন বন্ধন গঠন করে। উপরন্তু, অ্যান্ড্রিমিতে ব্যবহৃত তিনটি অ্যামিনো অ্যাসিড এ. ডি. এম. এইচ এবং এ. ডি. এম. জে দ্বারা সমাবেশ লাইনে অন্তর্ভুক্ত করা হয়। (এস)-বিটা-ফে এ. ডি. এম. এইচ দ্বারা উৎপন্ন হয় এবং এ. ডি. এম. জে দ্বারা অন্তর্ভুক্ত হয়। অন্য দুটি অ্যামিনো অ্যাসিড যা ভ্যালাইন এবং গ্লাইসিন, তাদের প্রথমে পিকেএস মডিউল অ্যাডমও এবং অ্যাডমএম দ্বারা দুটি কার্বন যোগ করতে হবে। চেইন ইনিশিয়েশন ধাপ তৈরি করতে অ্যান্ড্রিমিড বায়োসিন্থেসিসের জন্য মোট পাঁচটি প্রোটিন ব্যবহার করা হয় যা হল এ. ডি. এম. এ, এ. ডি. এন. আই, এ. ডি. এন. জে, এ. ডি. এম. এফ এবং এ. ডি. এম. এইচ। পিকেএস II পথের সময়, ম্যালোনিল-কোএ অ্যাসাইল ক্যারিয়ার প্রোটিনে (এসিপি) লোড করা হয় যা কেটোসিনথেস (কেএস)-এর সক্রিয় স্থানে স্থানান্তরিত হয়, ম্যালোনিল-কোএ তৈরি করতে অ্যাসিটিল কোএ মুক্ত করে। এই বিক্রিয়াটি কিটোরিডাক্টেজ (সি. এল. এফ, ডি. এইচ এবং কে. আর) অনুসরণ করে ম্যালোনিল-কোএনজাইম এ (সি. ও. এ) ব্যবহার করে শৃঙ্খল সম্প্রসারণের মধ্য দিয়ে যায়। লক্ষ্য করুন, পিকেএস II পথটি একটি নিয়মতান্ত্রিক পরিকল্পনা, যেহেতু পর্যাপ্ত গবেষণা নেই যা ফ্যাটি অ্যাসিড জৈব সংশ্লেষণের এই শৃঙ্খল সম্প্রসারণ ধাপের জন্য ব্যবহৃত এনজাইমগুলির একটি স্পষ্ট পথ প্রদর্শন করে। তথ্যসূত্র সুকিনিমাইডস ডিপেপটাইডস