Human Metabolome Database
হিউম্যান মেটাবলোম ডেটাবেস (এইচ. এম. ডি. বি) হল মানবদেহে পাওয়া ছোট অণু বিপাকের একটি বিস্তৃত, উচ্চমানের, অবাধে অ্যাক্সেসযোগ্য, অনলাইন ডাটাবেস। এটি জিনোম কানাডা দ্বারা অর্থায়িত হিউম্যান মেটাবোলোম প্রজেক্ট দ্বারা তৈরি করা হয়েছে এবং এটি প্রথম ডেডিকেটেড মেটাবোলোমিক্স ডেটাবেসগুলির মধ্যে একটি। এইচ. এম. ডি. বি এন. এম. আর স্পেকট্রোস্কোপি, জি. সি-এম. এস স্পেকট্রোমেট্রি এবং এল. সি/এম. এস স্পেকট্রোমেট্রি ব্যবহার করে মানব বিপাকীয় পদার্থের সনাক্তকরণ এবং বৈশিষ্ট্যকরণ সহ মানব বিপাকীয় গবেষণাকে সহজতর করে। এই আবিষ্কার প্রক্রিয়ায় সহায়তা করার জন্য, এইচ. এম. ডি. বি-তে তিন ধরনের তথ্য রয়েছেঃ 1) রাসায়নিক তথ্য, 2) ক্লিনিকাল তথ্য, এবং 3) আণবিক জীববিজ্ঞান/জৈব রসায়ন তথ্য (চিত্র। 1-3)। রাসায়নিক তথ্যের মধ্যে প্রায় 10,000 এন. এম. আর, জি. সি-এম. এস এবং এল. সি/এম. এস বর্ণালী সহ বিস্তারিত বিবরণ সহ 41,514টি বিপাকীয় কাঠামো রয়েছে। ক্লিনিকাল ডেটাতে> 10,000 মেটাবোলাইট-বায়োফ্লুইড ঘনত্ব এবং মেটাবোলাইট ঘনত্বের তথ্য 600 টিরও বেশি বিভিন্ন মানব রোগের তথ্য অন্তর্ভুক্ত রয়েছে। জৈব রাসায়নিক তথ্যের মধ্যে রয়েছে 5,688 টি প্রোটিন (এবং ডিএনএ) ক্রম এবং 5,000 টিরও বেশি জৈব রাসায়নিক প্রতিক্রিয়া যা এই বিপাকীয় প্রবেশের সাথে যুক্ত। এইচ. এম. ডি. বি-তে প্রতিটি মেটাবোলাইট এন্ট্রিতে 110টিরও বেশি ডেটা ফিল্ড রয়েছে যার মধ্যে দুই-তৃতীয়াংশ তথ্য রাসায়নিক/ক্লিনিকাল ডেটাতে নিবেদিত এবং বাকি এক-তৃতীয়াংশ এনজাইম্যাটিক বা বায়োকেমিক্যাল ডেটাতে নিবেদিত। অনেক ডেটা ক্ষেত্র অন্যান্য ডেটাবেসের (কেইজিজি, মেটাসাইক, পাবচেম, প্রোটিন ডেটা ব্যাংক, চিইবিআই, সুইস-প্রোট এবং জেনব্যাঙ্ক) সাথে হাইপারলিঙ্ক করা থাকে এবং বিভিন্ন কাঠামো এবং পথ দেখার অ্যাপলেট রয়েছে। এইচ. এম. ডি. বি ডাটাবেস ব্যাপক পাঠ্য, ক্রম, বর্ণালী, রাসায়নিক কাঠামো এবং সম্পর্কিত প্রশ্ন অনুসন্ধানকে সমর্থন করে। এটি বিপাকবিদ্যা, ক্লিনিকাল রসায়ন, বায়োমার্কার আবিষ্কার এবং সাধারণ জৈব রসায়ন শিক্ষায় ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়েছে। চারটি অতিরিক্ত ডাটাবেস, ড্রাগব্যাঙ্ক, টি3ডিবি, এস. এম. পি. ডি. বি এবং এফ. ও. ডি. বি-ও এইচ. এম. ডি. বি-র ডাটাবেসের অংশ। ড্রাগব্যাঙ্কে ~ 1,600 ড্রাগ এবং ড্রাগ মেটাবোলাইট সম্পর্কে সমতুল্য তথ্য রয়েছে, টি3ডিবি-তে 3,100 সাধারণ টক্সিন এবং পরিবেশ দূষণকারী সম্পর্কিত তথ্য রয়েছে, এসএমপিডিবি-তে 700 মানুষের বিপাকীয় এবং রোগের পথের পথচিত্র রয়েছে, যেখানে এফওউডিবি-তে ~ 28,000 খাদ্য উপাদান এবং খাদ্য সংযোজন সম্পর্কে সমতুল্য তথ্য রয়েছে। সংস্করণের ইতিহাস এইচএমডিবি-র প্রথম সংস্করণটি 2007 সালের 1লা জানুয়ারি মুক্তি পায়, তারপরে পরবর্তী দুটি সংস্করণ আসে 2009 সালের 1লা জানুয়ারি (সংস্করণ 2), 2009 সালের 1লা আগস্ট (সংস্করণ 2), 2012 সালের 18ই সেপ্টেম্বর (সংস্করণ 3) এবং 2013 সালের 1লা জানুয়ারি (সংস্করণ 3), 2017 (সংস্করণ 4), 2022 (সংস্করণ 5)। এইচ. এম. ডি. বি-র প্রতিটি প্রধান সংস্করণের বিবরণ (5ম সংস্করণ পর্যন্ত) টেবিল 1-এ দেওয়া হয়েছে। সুযোগ এবং প্রবেশাধিকার এইচএমডিবি-র সমস্ত তথ্য অ-মালিকানাধীন বা একটি অ-মালিকানাধীন উৎস থেকে উদ্ভূত। এটি বিনামূল্যে অ্যাক্সেসযোগ্য এবং যে কারও জন্য উপলব্ধ। উপরন্তু, প্রায় প্রতিটি তথ্য আইটেম সম্পূর্ণরূপে ট্রেসযোগ্য এবং স্পষ্টভাবে মূল উৎসের সাথে উল্লেখ করা হয়। এইচ. এম. ডি. বি-র তথ্য একটি পাবলিক ওয়েব ইন্টারফেস এবং ডাউনলোডের মাধ্যমে পাওয়া যায়। আরও দেখুন কে. ই. জি. জি. ড্রাগব্যাঙ্ক এস. এম. পি. ডি. বি. মেটাসাইক বোভাইন মেটাবোলোম ডাটাবেস মেটাবোলোম মেটাবোলোমিক্স জীববিজ্ঞান ডেটাবেসের তালিকা তথ্যসূত্র মেটাবোলোমিক ডেটাবেস মেডিকেল ডেটাবেস বায়োলজিকাল ডেটাবেস ফুড ডেটাবেস হিউম্যান মেটাবোলাইট