Interferon-inducible GTPase 5
ইন্টারফেরন-ইনডিউসিবল জিটিপিজ 5, যা ইমিউনিটি-রিলেটেড জিটিপিজ সিনেমা 1 (আইআরজিসি1) নামেও পরিচিত, একটি এনজাইম যা মানুষের মধ্যে আইআরজিসি জিন দ্বারা কোড করা হয়। এটি পি47-জিটিপি-এর মতো এবং আইআরজি পরিবারের অন্যান্য প্রোটিনের মতো আচরণ করবে বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। এটি অণ্ডকোষে সবচেয়ে বেশি প্রকাশ পায়। জিন আই. আর. জি. সি ক্রোমোজোম 19-এ <আই. ডি1> অবস্থানে অবস্থিত এবং এতে দুটি এক্সন রয়েছে। এটি ফস্ফোলাইপেজ এ2 ইনহিবিটর এবং লাই6/পিএলএআর ডোমেইন-ধারণকারী প্রোটিন-লাইকের (এলওসি105372412) উপরের দিকে এবং ননসেন্স মিডিয়েটেড এমআরএনএ ডিকে ফ্যাক্টরের (এসএমজি9) নীচের দিকে অবস্থিত। আই. আর. জি. সি-র জন্য আই. আর. জি. এম নামে একটি প্যারালগ রয়েছে। আইআরজিএম, বা অনাক্রম্যতা সম্পর্কিত জিটিপেজ এম, আন্তঃকোষীয় প্রতিরক্ষার সাথে যুক্ত। উভয়ই পি47-জিটিপিএস-সদৃশ পরিবার এবং পি-লুপ এনটিপিএস ডোমেইন সুপারফ্যামিলির অংশ। প্যারালগের আই. আর. জি. সি-র 12 শতাংশ পরিচয় রয়েছে। আর্থোলগ আই. আর. জি. সি সমস্ত মেরুদণ্ডী প্রাণীর মধ্যে সংরক্ষিত বলে লক্ষ্য করা গেছে। জিটিপি/ম্যাগনেসিয়াম এবং পলিপেপটাইড বাঁধাই অঞ্চল এবং একটি ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চল প্রজাতির মধ্যে মোটামুটিভাবে সংরক্ষিত। 500 মিলিয়ন বছরেরও বেশি সময় ধরে প্রতিটি জিনের জন্য একই প্রজাতির শতাংশ পরিচয়ের তুলনা করার সময় বিবর্তন আইআরজিসি সাইটোক্রোম সি এবং বিটা-হিমোগ্লোবিনের চেয়ে আরও দ্রুত বিবর্তিত হয়েছে বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। সম্ভবত আই. আর. জি. সি এবং আই. আর. জি. এম 350 থেকে 375 মিলিয়ন বছর আগে বিচ্ছিন্ন হয়েছিল। ট্রান্সক্রিপশন প্রোমোটার একটি প্রোমোটার অঞ্চল ছিল, জিএক্সপি _ 311825, ক্রোমোজোম 19-এ আইআরজিসি-র জন্য পাওয়া গেছে। এটি 1521 বেস জোড়া লম্বা এবং বেস জোড়া 43714694 থেকে শুরু হয়। এটি পরীক্ষিত 7টি অর্থোলোগাস সিকোয়েন্সের সবকটিতেই সংরক্ষিত এবং 8.090 টিপিএম-এ টেস্টিসের সাথে সবচেয়ে বেশি সম্পর্ক রয়েছে। ছয়টি সম্ভাব্য প্রতিলিপির মধ্যে, GXT _ 26231691-এর সবচেয়ে বেশি CAGE ট্যাগ ছিল। টেস্টিসকে 873টি সিএজিই ট্যাগের মধ্যে 839টিতে লেবেল করা হয়েছিল। এম. আর. এন. এ আই. আর. জি. সি-র জন্য সবচেয়ে সাধারণ প্রতিলিপি হল 1596 বেস জোড়া দীর্ঘ এবং এর সংযোজন সংখ্যা এন. এম. _ 019612। অন্যান্য প্রতিলিপিগুলির মধ্যে রয়েছে আইসোফর্ম এক্স1, এক্সএম _005259058, আইসোফর্ম এক্স2, এক্সএম _ 011527118, এবং আইসোফর্ম এক্স3, এক্সএম _ 006723283। প্রোটিন বায়োকেমিস্ট্রি ইন্টারফেরন-ইনডিউসিবল জিটিপিজ 5 463 অ্যামিনো অ্যাসিড দীর্ঘ, এর আণবিক ওজন 50.3 কেডিএ এবং একটি পূর্বাভাসকৃত আইসোইলেক্ট্রিক পয়েন্ট 5.22। সিগন্যাল পেপটাইড থাকার সম্ভাবনা কম। একটি ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চল 364 এবং 384 অবশিষ্টাংশের মধ্যে অত্যন্ত পূর্বাভাস দেওয়া হয়, যার মধ্যে অনুক্রমের প্রথম অংশটি ঝিল্লির বাইরে এবং দ্বিতীয় অংশটি ঝিল্লির মধ্যে থাকে। সেকেন্ডারি স্ট্রাকচার প্রোটিনের সেকেন্ডারি স্ট্রাকচারে বিটা শিটের তুলনায় বেশি আলফা হেলিস থাকবে বলে আশা করা হয়, ক্লোজ অর্থোলগগুলিতে অত্যন্ত অনুরূপ সেকেন্ডারি স্ট্রাকচার দেখা গেছে। তৃতীয় কাঠামো সংশ্লিষ্ট এক্স-রে স্ফটিকবিদ্যা কাঠামোর মাধ্যমে তৃতীয় কাঠামোর পূর্বাভাস দেওয়া যেতে পারে। প্রোটিনের জন্য একটি আঘাত ছিল, লিগপি1 [মাস মাসকুলাস], যার ই-মান ছিল 2ই-76 এবং প্রোটিন অনুক্রমের 82 শতাংশের উপরে 34 শতাংশ পরিচয় ছিল। অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তনগুলি প্রোটিনটি জিটিপি এবং ম্যাগনেসিয়াম বাইন্ডিং হবে বলে আশা করা হচ্ছে কারণ এতে বেশ কয়েকটি সম্পর্কিত বাইন্ডিং সাইট রয়েছে। এটি 153 এবং 163 অবশিষ্টাংশের মধ্যে পলিপেপটাইড বাঁধনের জন্য হোমোডিমার ইন্টারফেস অঞ্চলের পূর্বাভাস দিয়েছে। সের247 এবং সের304-এ দুটি সম্ভাব্য ফসফিনের মিথস্ক্রিয়া স্থল রয়েছে। পুরো ক্রম জুড়ে সেরিন এবং কয়েকটি থ্রেওনিনের মধ্যে ফসফোরাইলেশন সাধারণ হবে বলে আশা করা হচ্ছে, যদিও অবশিষ্টাংশ 330-এর পরে আরও বেশি হওয়ার সম্ভাবনা রয়েছে। কয়েকটি গ্লাইওসাইলেশন এবং গ্লাইকেশন সাইটের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে, যদিও কিছু ভবিষ্যদ্বাণী সম্ভাব্য ফসফোরাইলেশন সাইটের সাথে ওভারল্যাপ করে। উপকোষীয় অবস্থান প্রোটিন অ-সাইটোপ্লাজমিক হতে পারে যদিও এই সময়ে আরও স্থানীয়করণ অজানা। ক্লিনিকাল সিগ্নিফিকেন্স এক্সপ্রেশন ইন্টারফেরন-ইনডিউসিবল জিটিপিজ 5 অণ্ডকোষের মধ্যে সবচেয়ে বেশি প্রকাশ পায়। দুটি অ্যান্টিবডির ব্যবহার (এইচপিএ046769 এবং এইচপিএ060064) গোলাকার শুক্রাণুর তুলনায় দীর্ঘায়িত শুক্রাণুর মধ্যে উচ্চতর অভিব্যক্তি প্রদর্শন করে। লেইডিগ কোষ, স্পার্মাটোগোনিয়া এবং প্রিলেপ্টোটিন স্পার্মাটোসাইটের অভিব্যক্তি কম বলে জানা গেছে। ডুওডেনাম, ছোট অন্ত্র, অ্যাপেন্ডিক্স এবং কিডনিতে উভয় অ্যান্টিবডির সাথে কম থেকে মাঝারি অভিব্যক্তি লক্ষ্য করা গেছে। মায়োসাইট এবং থাইরয়েড, প্যারাথাইরয়েড এবং অ্যাড্রিনাল গ্রন্থিগুলিতে কিছু অভিব্যক্তি থাকতে পারে। প্যাথলজি এক্সপ্রেশন ক্যান্সারের পরিস্থিতিতে হ্রাস পেতে দেখা গেছে। 3 'এবং 5' ইউটিআর এবং কোডিং অঞ্চলের মধ্যে প্রতিলিপি বৈচিত্র্যের সাথে অজানা ক্লিনিকাল সম্পর্ক রয়েছে। তথ্যসূত্র আরও পড়া ইসি 3.6.5