Viperin
র্যাডিক্যাল এস-অ্যাডেনোসিল মেথিওনাইন ডোমেন-ধারণকারী প্রোটিন 2 হল একটি প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে আরএসএডি2 জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। আরএসএডি2 হল ভাইরাল প্রক্রিয়াগুলিতে একটি বহুমুখী প্রোটিন যা একটি ইন্টারফেরন উদ্দীপিত জিন। জানা গেছে যে আইএফএন-নির্ভর বা আইএফএন-স্বাধীন পথ দ্বারা ভাইপেরিন প্ররোচিত হতে পারে এবং কিছু ভাইরাস তাদের সংক্রামকতা বাড়ানোর জন্য ভাইপেরিন ব্যবহার করতে পারে। এই প্রোটিনকে আগে ভাইরাস প্রতিরোধক প্রোটিন, এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলাম-সম্পর্কিত, ইন্টারফেরন-ইনডিউসিবল (ভাইপেরিন) বলা হত। নিউক্লিওটাইড এনালগ উত্পাদনকারী সমজাতীয় প্রোক্যারিওটিক এনজাইমগুলি বর্ণনা করার জন্য এর অনুপযুক্ত ব্যবহারের কারণে ভাইপেরিন নামটি সংশোধন করা হয়েছে। এনসি-আইইউবিএমবি সুপারিশ ব্যবহার করে জীবনের সমস্ত ক্ষেত্র জুড়ে এনজাইমগুলির নাম পরিবর্তন করে এসএএম-নির্ভর নিউক্লিওটাইড ডিহাইড্রেটেজ (এসএএনডি) করা হয়। ফাংশন ভাইপেরিন একটি ইন্টারফেরন-উদ্দীপিত জিন যার অভিব্যক্তি সি. আই. কে. ভি, এইচ. সি. এম. ভি, এইচ. সি. ভি, ডি. ই. এন. ভি, ডব্লিউ. এন. ভি, এস. আই. এন. ভি, ইনফ্লুয়েঞ্জা এবং এইচ. আই. ভি সহ অনেক ডি. এন. এ এবং আর. এন. এ ভাইরাসকে বাধা দেয়। প্রাথমিকভাবে হিউম্যান সাইটোমেগালোভাইরাস (এইচসিএমভি) সংক্রামিত ম্যাক্রোফেজে একটি আইএফএন-জিএম প্ররোচিত অ্যান্টিভাইরাল প্রোটিন হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছিল, এটি রিপোর্ট করা হয়েছিল যে ফাইব্রোব্লাস্টগুলিতে এইচসিএমভি গ্লাইকোপ্রোটিন বি দ্বারা ভাইপেরিন প্ররোচিত হতে পারে, তবে এইচসিএমভি ভাইরাল সংক্রমণকে বাধা দেয় এবং ভাইরাল কাঠামোগত প্রোটিনগুলিকে ডাউন-রেগুলেট করে। ভাইরাস প্রোটিন কেন নিজের বিরুদ্ধে ভাইপেরিনকে প্ররোচিত করবে তার কারণ এখনও স্পষ্ট নয়; তবে, ভাইপেরিন-এর ভাইরাল প্ররোচিত পুনর্বণ্টন ভাইরাসটির অ্যান্টিভাইরাল ক্রিয়াকলাপ এড়ানোর প্রক্রিয়াকে প্রতিফলিত করতে পারে। সেলুলার বিপাককে ব্যাহত করে ভাইরাল সংক্রামকতা বাড়ানোর জন্য ভাইপেরিন এইচসিএমভি ভাইরাল প্রোটিনের সাথে প্ররোচিত এবং মিথস্ক্রিয়া করতে পারে এবং এইচসিএমভি ভাইরাল সংক্রামিত কোষে মাইটোকন্ড্রিয়ায় স্থানান্তরিত হতে পারে। ভাইপেরিন হল একটি র্যাডিকেল এসএএম এনজাইম যা চেইন টার্মিনেটর ডিডিএইচসিটিপি (3Â-ডিঅক্সি-3Â, 4Â-ডাইডিহাইড্রো-সিটিপি) তৈরি করতে সক্ষম, যা ভাইরাল আরএনএ নির্ভর আরএনএ পলিমারেজকে (আরডিআরপি) বাধা দেয়। ডিডিএইচসিটিপি অ্যামিনো অ্যাসিড এবং মাইটোকন্ড্রিয়াল শ্বাসযন্ত্রের বিপাককে বিলুপ্ত করে বলে মনে হয়। ইনফ্লুয়েঞ্জা ভাইরাসের উদীয়মান এবং মুক্ত হওয়ার প্রতিরোধে, ভাইপেরিনকে আইসোপ্রিনয়েড জৈবসংশ্লেষণ পথের একটি প্রয়োজনীয় উৎসেচক ফার্নেসিল ডাইফসফেট সিন্থেস (এফপিপিএস)-এর উৎসেচক ক্রিয়াকলাপকে আবদ্ধ করে এবং হ্রাস করে কোষের প্লাজমা ঝিল্লিতে লিপিড রাফ্টগুলিকে ব্যাহত করার পরামর্শ দেওয়া হয়। হোস্ট এইচভিএপি-33 এবং ভাইরাল এনএস5এ-এর সাথে মিথস্ক্রিয়ার মাধ্যমে এইচসিভির ভাইরাল প্রতিলিপি প্রতিরোধ করার এবং প্রতিলিপি জটিল গঠনে ব্যাঘাত ঘটানোর জন্য ভাইপেরিনকে পরামর্শ দেওয়া হয়েছিল। কাঠামো হিউম্যান ভাইপেরিন হল 361টি অ্যামিনো অ্যাসিডের একটি একক পলিপেপটাইড যার আনুমানিক আণবিক ওজন 42 কেডিএ। ভাইপেরিন-এর এন-টার্মিনাল 42টি অ্যামিনো অ্যাসিড অ্যাম্ফিপ্যাথিক আলফা-হেলিক্স গঠন করে, যা বিভিন্ন প্রজাতিতে তুলনামূলকভাবে কম সংরক্ষিত এবং ভাইপেরিন-এর অ্যান্টিভাইরাল ক্রিয়াকলাপের উপর সামান্য প্রভাব ফেলে। ইআর এবং লিপিড ড্রপলেটগুলিতে স্থানীয়করণের জন্য ভাইপেরিন-এর এন-টার্মিনাল ডোমেনের প্রয়োজন হয়। ভাইপরিনের অ্যামিনো অ্যাসিড 77-209 র্যাডিকেল এস-অ্যাডেনোসিল মেথিওনাইন (এসএএম) ডোমেন গঠন করে, যার মধ্যে চারটি সংরক্ষিত মোটিফ রয়েছে। মোটিফ 1-এ তিনটি সংরক্ষিত সিস্টিনের অবশিষ্টাংশ রয়েছে, সিএক্সএক্সসিএক্সসি, যা ফে-এস বাঁধাই মোটিফ এবং অ্যান্টিভাইরাল ক্রিয়াকলাপের জন্যও প্রয়োজনীয়। ভাইপেরিন-এর সি-টার্মিনাল 218-361 অ্যামিনো অ্যাসিড বিভিন্ন প্রজাতিতে অত্যন্ত সংরক্ষিত এবং ভাইপেরিন ডাইমেরাইজেশনের জন্য প্রয়োজনীয়। সি-টার্মিনাল লেজ এইচসিভির বিরুদ্ধে অ্যান্টিভাইরাল ক্রিয়াকলাপের জন্য গুরুত্বপূর্ণ বলে মনে হয় কারণ ভাইপারিন ট্যাগ করা একটি সি-টার্মিনাল ফ্ল্যাগ তার অ্যান্টিভাইরাল ক্রিয়াকলাপ হারিয়ে ফেলে। যখন ভাইপেরিন এসএএম-এর সাথে আবদ্ধ থাকে এবং সাইটিডিন ট্রাইফসফেট (সিটিপি) বা ইউরিডিন ট্রাইফসফেট (ইউটিপি) একটি স্তর হিসাবে ব্যবহার করা হয়, তখন বিভিন্ন গতিগত পরামিতি অর্জন করা হয়। এটি পূর্বাভাস দেওয়া হয় যে সি. টি. পি সাবস্ট্রেটটি সাবস্ট্রেটের কম কিলোমিটার মানের কারণে ভাইপেরিন-এর সাথে আরও শক্তভাবে আবদ্ধ হয়। তবে, ইউ. টি. পি-এবং সি. টি. পি-আবদ্ধ যৌগগুলির সামগ্রিক কাঠামো একই রকম। পার্থক্যটি হ 'ল ইউরাসিল অংশটি বাইন্ডিং এবং অর্ডার করার সময় সাইটোসিন অংশটি এ এবং বি পরিণত হওয়ার চেয়ে কম কার্যকর। নিউক্লিওটাইড-মুক্ত ভাইপারিনে একটি (βα) 6 আংশিক ব্যারেল থাকে এবং একটি বিশৃঙ্খল এন-টার্মিনাল এক্সটেনশন এবং আংশিকভাবে অর্ডার করা সি-টার্মিনাল এক্সটেনশন থাকে। যখন সি-টার্মিনাল লেজটি অর্ডার করা হয়, তখন একটি ছয়-অবশিষ্টাংশ α-হেলিক্স, একটি আট-অবশিষ্টাংশ পি-লুপ (যা সিটিপির γ-ফসফেটকে আবদ্ধ করে) এবং একটি 310-হেলিক্স প্রকাশিত হয়। সেলুলার স্থানীয়করণ ভাইপেরিন সাধারণত তার এন-টার্মিনাল ডোমেনের মাধ্যমে এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলামে (ইআর) স্থানীয়করণ করা হয় এবং লিপিড ফোঁটাতেও স্থানীয়করণ করা হয়, যা ইআর থেকে উদ্ভূত হয়। তবে, এটি এইচসিএমভি সংক্রমিত ফাইব্রোব্লাস্টের মাইটোকন্ড্রিয়াতেও পাওয়া যায়। তথ্যসূত্র বাইরের লিঙ্ক