Sticky and blunt ends
ডিএনএ প্রান্তগুলি রৈখিক ডিএনএ অণুগুলির প্রান্তের বৈশিষ্ট্যগুলিকে বোঝায়, যা আণবিক জীববিজ্ঞানে টার্মিনাসের পরিপূরক স্ট্র্যান্ডের আকৃতির উপর ভিত্তি করে "আঠালো" বা "ভোঁতা" হিসাবে বর্ণনা করা হয়। আঠালো প্রান্তে, একটি স্ট্র্যান্ড অন্যটির তুলনায় দীর্ঘ হয় (সাধারণত কমপক্ষে কয়েকটি নিউক্লিওটাইড দ্বারা), যাতে দীর্ঘ স্ট্র্যান্ডের ঘাঁটি থাকে যা জোড়া ছাড়া থাকে। ভোঁতা প্রান্তে, উভয় স্ট্র্যান্ডের দৈর্ঘ্য সমান-অর্থাৎ। তারা একই বেস অবস্থানে শেষ হয়, উভয় স্ট্র্যান্ডে কোনও অপ্রচলিত ঘাঁটি রাখে না। ধারণাটি আণবিক জীববিজ্ঞানে, ক্লোনিংয়ে বা ভেক্টর ডিএনএতে ডিএনএ সন্নিবেশ করার সময় ব্যবহৃত হয়। এই ধরনের প্রান্তগুলি সীমাবদ্ধতা এনজাইম দ্বারা উত্পন্ন হতে পারে যা নির্দিষ্ট স্থানে অণুর ফসফডিয়েস্টার মেরুদণ্ড ভেঙে দেয়, যা নিজেরাই এক্সোনিউক্লিয়াস এবং এন্ডোনিউক্লিয়াস নামক একটি বৃহত্তর শ্রেণীর এনজাইমের অন্তর্গত। একটি সীমাবদ্ধতা এনজাইম যা অ-সংলগ্ন স্থানে উভয় স্ট্র্যান্ডের মেরুদণ্ড কেটে দেয়, একটি স্তম্ভিত কাটা ছেড়ে যায়, দুটি ওভারল্যাপিং স্টিকি প্রান্ত তৈরি করে, যখন একটি এনজাইম যা একটি সোজা কাটা তৈরি করে (উভয় স্ট্র্যান্ডের একে অপরের থেকে সরাসরি জুড়ে অবস্থানগুলিতে) দুটি ভোঁতা প্রান্ত তৈরি করে। সিঙ্গেল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ অণু একটি সিঙ্গেল-স্ট্র্যান্ডেড অ-বৃত্তাকার ডিএনএ অণুর দুটি অ-অভিন্ন প্রান্ত থাকে, 3 'প্রান্ত এবং 5' প্রান্ত (সাধারণত "থ্রি প্রাইম এন্ড" এবং "ফাইভ প্রাইম এন্ড" উচ্চারিত হয়)। সংখ্যাগুলি ডিঅক্সিরাইবোজে কার্বন পরমাণুর সংখ্যা নির্দেশ করে, যা একটি চিনি যা ডিএনএ অণুর মেরুদণ্ডের একটি গুরুত্বপূর্ণ অংশ গঠন করে। ডি. এন. এ-র মেরুদণ্ডে একটি ডিঅক্সিরাইবোজের 5 'কার্বন একটি ফসফডাইস্টার বন্ধন সংযোগের মাধ্যমে অন্যটির 3' কার্বনের সাথে যুক্ত থাকে। এই ডিঅক্সিরাইবোজের 5 'কার্বন আবার পরবর্তী 3' কার্বনের সাথে যুক্ত হয়, ইত্যাদি। ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড অণুতে বৈচিত্র্য যখন ডি. এন. এ-র একটি অণু ডাবল স্ট্র্যান্ডেড হয়, যেমন ডি. এন. এ সাধারণত হয়, তখন দুটি স্ট্র্যান্ড বিপরীত দিকে চলে। অতএব, অণুর এক প্রান্তে স্ট্র্যান্ড 1-এর 3 'প্রান্ত এবং স্ট্র্যান্ড 2-এর 5' প্রান্ত থাকবে এবং অন্য প্রান্তে এর বিপরীত হবে। যাইহোক, অণু দুটি আটকে থাকার বিষয়টি অসংখ্য ভিন্ন বৈচিত্র্যের অনুমতি দেয়। ব্লান্ট শেষ একটি ডাবল স্ট্রেন্ডেড অণুর সহজতম ডিএনএ প্রান্তকে ভোঁতা প্রান্ত বলা হয়। ব্লান্ট প্রান্তগুলি অ-সমন্বিত প্রান্ত হিসাবেও পরিচিত। একটি ভোঁতা-প্রান্তের অণুতে, উভয় স্ট্র্যান্ড একটি বেস জুটিতে শেষ হয়। জৈবপ্রযুক্তিতে ব্লান্ট প্রান্তগুলি সর্বদা পছন্দসই হয় না কারণ যখন একটি ডিএনএ লিগাজ ব্যবহার করে দুটি অণুকে একটিতে যুক্ত করা হয়, তখন ভোঁতা প্রান্তের সাথে ফলন উল্লেখযোগ্যভাবে কম হয়। সাবক্লোনিং করার সময়, এটির সম্ভাব্য বিপরীত দিকে সন্নিবেশ ডিএনএ ঢোকানোর অসুবিধাও রয়েছে। অন্যদিকে, ভোঁতা প্রান্তগুলি সর্বদা একে অপরের সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ। এখানে ভোঁতা-প্রান্তযুক্ত ডি. এন. এ-র একটি ছোট অংশের উদাহরণ দেওয়া হলঃ 5 '-জিএটিসিটিজিএসিটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএটিজিএ একটি ওভারহ্যাং হল একটি ডিএনএ অণুর শেষে অপ্রচলিত নিউক্লিওটাইডের একটি প্রসারিত অংশ। এই অপ্রচলিত নিউক্লিওটাইডগুলি যে কোনও স্ট্র্যান্ডে থাকতে পারে, যা 3 'বা 5' ওভারহ্যাংগুলি তৈরি করে। এই ওভারহ্যাংগুলি বেশিরভাগ ক্ষেত্রে প্যালিনড্রোমিক হয়। একটি ওভারহ্যাং-এর সবচেয়ে সহজ কেস হল একটি একক নিউক্লিওটাইড। এটি প্রায়শই অ্যাডেনিন এবং কিছু ডিএনএ পলিমারেজ দ্বারা 3 'ওভারহ্যাং হিসাবে তৈরি করা হয়। সাধারণত এটি এই ধরনের এনজাইম দ্বারা তৈরি পিসিআর পণ্যগুলির ক্লোনিংয়ে ব্যবহৃত হয়। পণ্যটি একটি 3 'থাইমিন ওভারহ্যাং সহ একটি রৈখিক ডিএনএ অণুর সাথে যুক্ত হয়। যেহেতু অ্যাডেনিন এবং থাইমিন একটি ক্ষার জোড়া গঠন করে, তাই এটি একটি লাইগেজ দ্বারা দুটি অণুর সংযোগকে সহজতর করে, একটি বৃত্তাকার অণু উৎপন্ন করে। এখানে এ-ওভারহ্যাং-এর একটি উদাহরণ দেওয়া হলঃ 5 '-এ. টি. সি. টি. জি. এ. সি. টি.-3'-টি. জি. এ. সি. টি. জি. এ-5 'দীর্ঘ ওভারহ্যাং-কে কোহেসিভ এন্ড বা স্টিকি এন্ড বলা হয়। ডিএনএ কেটে ফেলার সময় এগুলি প্রায়শই সীমাবদ্ধ এন্ডোনিউক্লিয়াস দ্বারা তৈরি হয়। প্রায়শই তারা দুটি ডিএনএ স্ট্র্যান্ডকে একে অপরের থেকে চারটি বেস জোড়া কেটে ফেলে, একটি অণুর মধ্যে একটি চার-বেস 3 'ওভারহ্যাং এবং অন্যটিতে একটি পরিপূরক 3' ওভারহ্যাং তৈরি করে। এই প্রান্তগুলিকে কোহেসিভ বলা হয় কারণ এগুলি সহজেই একটি লিগাজ দ্বারা একত্রিত হয়। উদাহরণস্বরূপ, এই দুটি "আঠালো" প্রান্ত সামঞ্জস্যপূর্ণঃ 5 '-এ. টি. সি. টি. জি. সি. জি. টি. জি. সি. টি-3'-এ. টি. জি. সি. টি. জি. সি. টি-3 '-এ. টি. জি. সি. টি. জি ক্যাটাক্গা-5' এছাড়াও, যেহেতু বিভিন্ন সীমাবদ্ধতা এন্ডোনিউক্লিয়াসগুলি সাধারণত বিভিন্ন ওভারহ্যাং তৈরি করে, তাই ডি. এন. এ-র একটি টুকরো (প্রতিটি প্রান্তের জন্য একটি ভিন্ন এনজাইম ব্যবহার করে) এক্সাইজ করে এবং তারপরে একই এনজাইম দ্বারা ছাঁটা প্রান্ত সহ অন্য ডি. এন. এ অণুর সাথে যুক্ত করে একটি প্লাজমিড তৈরি করা সম্ভব। যেহেতু লিগাজের কাজ করার জন্য ওভারহ্যাংগুলিকে পরিপূরক হতে হয়, তাই দুটি অণু শুধুমাত্র একটি অভিযোজনে যোগ দিতে পারে। আণবিক জীববিজ্ঞানে এটি প্রায়শই অত্যন্ত কাম্য। ডি. এন. এ-র প্রতিটি একক স্ট্র্যান্ড জুড়ে, আমরা সাধারণত থাইমিনের সাথে অ্যাডেনিন জোড়া এবং গুয়ানিনের সাথে সাইটোসিন জোড়া দেখতে পাই যা নীচে বর্ণিত হিসাবে একটি সমান্তরাল পরিপূরক স্ট্র্যান্ড গঠন করে। এই পদ্ধতিতে একে অপরের সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ দুটি নিউক্লিওটাইড ক্রমকে পরিপূরক হিসাবে উল্লেখ করা হয়ঃ 5 '-এ. টি. সি. টি. জি. এ. সি. টি-3'-টি. এ. জি. এ. সি. টি. জি. এ-5 'একটি ফ্রায়েড এন্ড মানে শেষের কাছাকাছি একটি ডাবল স্ট্র্যান্ডেড (বা অন্যান্য মাল্টি-স্ট্র্যান্ডেড) ডি. এন. এ অণুর একটি অঞ্চল যেখানে অ-পরিপূরক ক্রমের একটি উল্লেখযোগ্য অনুপাত রয়েছে; অর্থাৎ, এমন একটি ক্রম যেখানে সংলগ্ন স্ট্র্যান্ডগুলির নিউক্লিওটাইডগুলি সঠিকভাবে মেলে নাঃ 5'-এ. টি. সি. টি. জি. এ. জি. জি. সি. এ-3 '-টি. এ. জি. এ. সি. টি. জি. এ. টি. জি-5' শব্দটি "ফ্রায়েড" ব্যবহার করা হয় কারণ ভুলভাবে মিলে যাওয়া নিউক্লিওটাইডগুলি বন্ধন যদিও ডাবল স্ট্র্যান্ডেড ডি. এন. এ-র মাঝখানে অ-পরিপূরক ক্রমও সম্ভব, প্রান্ত থেকে দূরে মিলহীন অঞ্চলগুলিকে "ফ্রায়েড" হিসাবে উল্লেখ করা হয় না। আবিষ্কার রোনাল্ড ডব্লিউ. ডেভিস প্রথম ইকোআরআই-এর ক্রিয়ার পণ্য হিসাবে স্টিকি প্রান্তগুলি আবিষ্কার করেছিলেন, যা সীমাবদ্ধতা এন্ডোনিউক্লিজ। শক্তি স্টিকি শেষ লিঙ্কগুলি তাদের স্থায়িত্বের ক্ষেত্রে ভিন্ন। গঠনের মুক্ত শক্তি স্থিতিশীলতা অনুমান করার জন্য পরিমাপ করা যেতে পারে। অলিগোনিউক্লিওটাইড ইউভি তাপীয় বিকৃতি বক্ররেখা সম্পর্কিত তথ্য থেকে বিভিন্ন ক্রমের জন্য মুক্ত শক্তির আনুমানিক হিসাব করা যেতে পারে। এছাড়াও আণবিক গতিবিদ্যা সিমুলেশন থেকে ভবিষ্যদ্বাণীগুলি দেখায় যে কিছু স্টিকি শেষ লিঙ্ক অন্যদের তুলনায় প্রসারিতভাবে অনেক শক্তিশালী। তথ্যসূত্র সাম্ব্রুক, জোসেফ; ডেভিড রাসেল (2001)। আণবিক ক্লোনিংঃ একটি গবেষণাগার ম্যানুয়াল। নিউ ইয়র্কঃ কোল্ড স্প্রিং হারবার ল্যাবরেটরি প্রেস। ডি. এন. এ জেনেটিক্স কৌশল আণবিক জীববিজ্ঞান