Group III pyridoxal-dependent decarboxylases
আণবিক জীববিজ্ঞানে, গ্রুপ III পাইরিডক্সাল-নির্ভর ডিকার্বক্সিলেস হল ব্যাকটেরিয়াল এনজাইমের একটি পরিবার যা অর্নিথিন ডিকার্বক্সিলেস, লাইসিন ডিকার্বক্সিলেস এবং আর্জিনিন ডিকার্বক্সিলেস নিয়ে গঠিত। পাইরিডক্সাল-5 '-ফসফেট-নির্ভর অ্যামিনো অ্যাসিড ডিকার্বক্সিলেসকে অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্সের উপর ভিত্তি করে চারটি গ্রুপে ভাগ করা যেতে পারে। তৃতীয় গ্রুপে প্রোক্যারিওটিক অর্নিথিন এবং লাইসিন ডিকার্বক্সিলেস এবং প্রোক্যারিওটিক বায়োডিগ্রেডেটিভ ধরনের আর্জিনিন ডিকার্বক্সিলেস রয়েছে। কাঠামো এই উৎসেচকগুলি বেশ কয়েকটি সংরক্ষিত ক্ষেত্র নিয়ে গঠিত। এন-টার্মিনাল ডোমেনের একটি ফ্ল্যাভোডক্সিন-সদৃশ ভাঁজ রয়েছে এবং সামগ্রিক 3ডি কাঠামোতে এর অবস্থানের কারণে এটিকে "উইং" ডোমেন বলা হয়। ল্যাকটোব্যাসিলাস 30এ (এল30এ অর্নডিসি) থেকে অর্নিথিন ডিকার্বক্সিলেস বড়, পাইরিডক্সাল-5 '-ফসফেট-নির্ভর ডিকার্বক্সিলেসের প্রতিনিধি যা লাইসিন, আর্জিনিন বা অর্নিথিনে কাজ করে। এল30এ অর্নডিসির স্ফটিক কাঠামোটি 3-এ রেজোলিউশনে সমাধান করা হয়েছে। সি6 প্রতিসাম্য দ্বারা সম্পর্কিত সিক্স ডাইমারগুলি এনজাইমগতভাবে সক্রিয় ডোডেকামার (প্রায় 106 ডিএ) গঠন করে। এল30এ অর্নডিসির প্রতিটি মনোমারকে পাঁচটি ক্রমিক ভাঁজ ডোমেনের পরিপ্রেক্ষিতে বর্ণনা করা যেতে পারে। অ্যামিনো-টার্মিনাল ডোমেন, অবশিষ্টাংশ 1 থেকে 107, একটি পাঁচ-স্ট্র্যান্ডেড বিটা-শীট নিয়ে গঠিত যাকে "উইং" ডোমেন বলা হয়। প্রতিটি ডাইমারের দুটি উইং ডোমেন ডোডেকামারের কেন্দ্রের দিকে এগিয়ে যায় এবং ডোডেকামার স্থায়িত্বে অবদান রাখে। প্রধান ডোমেনে একটি সংরক্ষিত লাইসিন অবশিষ্টাংশ রয়েছে, যা পাইরিডক্সাল-ফসফেট গ্রুপের সংযুক্তির স্থান। আরও দেখুন গ্রুপ I পাইরিডক্সাল-নির্ভর ডিকার্বক্সিলেস গ্রুপ II পাইরিডক্সাল-নির্ভর ডিকার্বক্সিলেস গ্রুপ IV পাইরিডক্সাল-নির্ভর ডিকার্বক্সিলেস রেফারেন্স প্রোটিন ডোমেন