Atromentin
অ্যাট্রোমেন্টিন হল একটি প্রাকৃতিক রাসায়নিক যৌগ যা অ্যাগারিকোমাইসিটস ছত্রাকের অ্যাগারিক্যালস এবং থেলেফোরালেস অর্ডারে পাওয়া যায়। এটি পরীক্ষাগার সংশ্লেষণের মাধ্যমেও প্রস্তুত করা যেতে পারে। রাসায়নিকভাবে, এটি একটি পলিফেনল এবং একটি বেনজোকুইনোন। ক্লিটোকাইব সাবিলুডেনের সংস্কৃতিতে এবং হাইডনেলাম পেকির নির্যাসে অ্যাট্রোমেন্টিন পাওয়া গেছে। এর জৈবসংশ্লেষণে প্রথম উৎসেচকগুলি ট্যাপিনেলা প্যানুইয়েডে চিহ্নিত করা হয়েছে। এর মধ্যে একটি হল অ্যাট্রোমেন্টিন সিন্থেটেজ। জৈব ক্রিয়াকলাপ অ্যাট্রোমেন্টিনের বেশ কয়েকটি সম্ভাব্য জৈবিক ক্রিয়াকলাপ ভিট্রোতে অধ্যয়ন করা হয়েছে। অ্যাট্রোমেন্টিন ইন ভিট্রো অ্যান্টিব্যাকটেরিয়াল ক্রিয়াকলাপ ধারণ করে, যা স্ট্রেপ্টোকোকাস নিউমোনিয়া ব্যাকটেরিয়ায় এনজাইম এনয়েল-অ্যাসিল ক্যারিয়ার প্রোটিন রিডাক্টেজ (ফ্যাটি অ্যাসিডের জৈব সংশ্লেষণের জন্য প্রয়োজনীয়) প্রতিরোধ করে। অ্যাট্রোমেন্টিন একটি মসৃণ পেশী উদ্দীপক হিসাবে দেখানো হয়েছে। এটি বিচ্ছিন্ন মানব লিউকেমিয়া ইউ937 কোষে অ্যাপোপটোসিসকেও প্ররোচিত করে। এটি একটি অ্যান্টিকোয়াগুলেন্টও। অ্যাট্রোমেন্টিন অ্যাট্রোমেন্টিন-এর জেনেটিক এবং এনজাইম্যাটিক ভিত্তি 4-হাইড্রক্সিফিনাইলপাইরুভিক অ্যাসিডের (4-এইচপিপি) দুটি ইউনিট থেকে একটি নন-রাইবোসোমাল পেপটাইড সিন্থেটেসের মতো এনজাইমের (অ্যাট্রোমেন্টিন সিন্থেটেস) মাধ্যমে জৈব সংশ্লেষিত হয়, যা ডোমেন আর্কিটেকচার অ্যাডেনাইলেশন-থিওলেশন-থিওয়েস্টেরেস (এ-টি-টিই) ধারণ করে। 4-এইচপিপি একটি অ্যামিনোট্রান্সফেরেজের মাধ্যমে একটি ডিঅ্যামিনেশন থেকে উত্পাদিত হয়। এই দুটি জিনের জিনগত ভিত্তি গুচ্ছবদ্ধ (অর্থাৎ, একে অপরের সংলগ্ন)। এই উৎসেচকগুলি প্রথমে ট্যাপিনেলা প্যানুইয়েডে চিহ্নিত করা হয়েছিল ই. কোলাইতে সংশ্লিষ্ট জিনগুলিকে (এ. টি. আর. এ এবং এ. টি. আর. ডি) অতিরিক্ত চাপ দিয়ে এবং অ্যাট্রোমেন্টিন গঠন পর্যবেক্ষণ করতে 4-এইচ. পি. পি দিয়ে হোলো-এনজাইমকে ইনকিউবেট করে। এর পরে সুইলাস গ্রেভিলিতে গ্রেএ উৎসেচক, প্যাক্সিলাস ইনভোলুটাসে ছয়টি (আইএনভিএ1-6, যার মধ্যে আইএনভিএ1,2 এবং 5 কার্যকরী ছিল) এবং সেরপুলা ল্যাক্রিম্যানস থেকে এনপিএস3-এর বৈশিষ্ট্যায়ন করা হয়। উপরন্তু, একটি অ্যালকোহল ডিহাইড্রোজেনেস/অক্সিডোরিডাক্টেজের জন্য আরেকটি সংলগ্ন এবং সংরক্ষিত জিন এনকোডিং রয়েছে যার কার্যকারিতা অস্পষ্ট। বেশিরভাগ ক্ষেত্রে ক্লাস্টারড বায়োসিন্থেটিক জিনগুলি বেসিডিওমাইসেটে অর্থোলোগাস পাওয়া যায়। অ্যাট্রোমেন্টিন সিন্থেটেজ এবং 23টি ভিন্ন অ্যাট্রোমেন্টিন উৎপাদনকারী বেসিডিওমাইসেটের অ্যামিনোট্রান্সফেরেজের মধ্যে একটি সাধারণ প্রবর্তক মোটিফ পাওয়া গেছে যা প্রায় সব ক্ষেত্রেই অ্যালকোহল ডিহাইড্রোজেনেস থেকে অনুপস্থিত ছিল, যা দুটি প্রয়োজনীয় জিনের সহ-নিয়ন্ত্রণকে নির্দেশ করে যা একটি সাধারণ প্রতিলিপি ফ্যাক্টর দ্বারা অ্যাট্রোমেন্টিন উৎপাদন নিশ্চিত করে। এক্টোমিকোরিহজার জন্য অ্যাট্রোমেন্টিন জিনের আগে অতিরিক্ত প্রবর্তক মোটিফগুলি চিহ্নিত করা হয়েছিল যা বাদামী রটার থেকে অনুপস্থিত ছিল, যা অ্যাট্রোমেন্টিন-এর ভিন্ন জিনগত নিয়ন্ত্রণের ইঙ্গিত দেয়। এস ল্যাক্রিম্যান থেকে অ্যাট্রোমেন্টিন সিন্থেটেজ এবং অ্যামিনোট্রান্সফেরেজের জিনগুলি ব্যাকটেরিয়ার সাথে সহ-ইনকিউবেশনের সময় নিয়ন্ত্রিত হয়েছিল। জৈব সংশ্লেষণের জন্য অ্যামিনো অ্যাসিড নন-রাইবোসোমাল কোড নন-রাইবোসোমাল পেপটাইড সিন্থেটেসের মতো এনজাইম (অ্যাট্রোমেন্টিন সিন্থেটেজ) যা 4-এইচপিপি-র দুটি মনোমারকে প্রতিসমভাবে ঘনীভূত করে তার একটি অ্যাডেনাইলেশন ডোমেন রয়েছে যা অনুঘটকের আগে স্তরগুলি গ্রহণ করে। গ্রহণকারী ডোমেনে একটি 10টি অ্যামিনো অ্যাসিড কোড রয়েছে যা ননরিবোসোমাল কোড (এনআরপিএস কোড) নামে পরিচিত। এখানে, সুইলস গ্রেভিলি, জি. আর. এ থেকে অ্যাট্রোমেন্টিন সিন্থেটেজের উদাহরণ ব্যবহার করা হয়েছে। কোডটি অ্যামিনো অ্যাসিডের অবস্থান 235 (ভি), 236 (এ), 239 (ই), 278 (এফ), 299 (এস), 301 (জি), 322 (জি), 320 (এ), 331 (সি), 517 (কে)-এ পাওয়া যায়। কোডটি এস ল্যাক্রিম্যানস (এন. পি. এস. 3), ট্যাপিনেলা প্যানুইয়েডস (এ. টি. আর. এ) এবং প্যাক্সিলাস ইনভোলুটাস (আই. এন. ভি. এ) থেকে অ্যাট্রোমেন্টিন সিন্থেটেসের সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ। একইভাবে, অ্যাট্রোমেন্টিন উৎপাদনের জন্য এনআরপিএস কোড অন্যান্য সুগন্ধযুক্ত আলফা-কেটো অ্যাসিড-উদ্ভূত যৌগগুলির জন্য সার্বজনীন কোডকে সমর্থন করে, যেমন ফেনাইলপাইরুভিক অ্যাসিডের মাধ্যমে র্যালফুরানোন বি-এর মতো এল-ফেনাইল্যালানাইন থেকে এবং ডিডেমিথাইল অ্যাস্টেরিকুইনোন ডি-এর মতো এল-ট্রিপ্টোফেন থেকে ইন্ডোল-3-পাইরুভিক অ্যাসিডের মাধ্যমে (নোট অ্যাট্রোমেন্টিন 4-হাইড্রক্সিফেনাইলপাইরুভিক অ্যাসিডের মাধ্যমে সুগন্ধযুক্ত আলফা-কেটো অ্যাসিড এল-টাইরোসিন থেকে উদ্ভূত হয়)। প্যাক্সিলাস ইনভোলুটাসের আইএনভিএ-র জন্য, থাইওএস্টেরেস ডোমেনে (শেষ ডোমেন) একটি সাধারণ অ্যামিনো অ্যাসিড মোটিফও পাওয়া গেছে যা অ্যাট্রোমেন্টিন গঠন সম্পূর্ণ করার জন্য এনজাইমটি কার্যকরী কিনা তার জৈব রাসায়নিক তথ্যকে সমর্থন করে। অ্যাট্রোমেন্টিন-এর জৈব সংশ্লেষণ সুগন্ধি অ্যামিনো অ্যাসিড এল-টাইরোসিন হল 4-হাইড্রক্সিফিনাইলপাইরুভিক অ্যাসিডের অগ্রদূত এবং 4-এইচপিপি-র 2 ইউনিট ঘনীভূত হয়ে অ্যাট্রোমেন্টিন গঠন করে। প্রাথমিক পদক্ষেপটি হল একটি অ্যামিনোট্রান্সফেরেজের মাধ্যমে ডিঅ্যামিনেশন। দ্বিতীয় ধাপটি একটি নন-রাইবোসোমাল পেপটাইড সিন্থেটেসের মতো এনজাইম দ্বারা অনুঘটকিত হয় (এন. আর. পি. এস-এর মতো, কারণ এটির অ্যাট্রোমেন্টিন/কুইনন সিন্থেটেজ নামে একটি ক্যানোনিকাল ঘনীভবন ক্ষেত্র নেই)। এই এন. আর. পি. এস-সদৃশ উৎসেচকের অ্যাডেনাইলেশন ক্ষেত্রটি এ. টি. পি-পি. পি. আই-এক্সচেঞ্জ অ্যাসে দ্বারা নির্ধারিত 4-এইচ. পি. পি গ্রহণ করে। এনজাইমটি, যখন ই. কোলাইতে উত্পাদিত হয়, তখন একটি ফসফোপ্যান্টিথেইনিল ট্রান্সফারেজের (পিপ্যান্ট) মাধ্যমে তার হোলো আকারে প্রাথমিকভাবে তৈরি করা প্রয়োজন, যদিও ই. কোলাই ভিভো প্রাইম-এ অ্যাপো-এনজাইম (যেমন। এন. টি. ডি-র মাধ্যমে)। এ. নিডুলানস থেকে উদ্ভূত সিডিএনএ থেকে প্যান্ট সফলভাবে ব্যবহার করা হয়েছে। এন. পি. জি. এ), স্ট্রেপ্টোমাইসেস ভার্টিসিলাস (এস. ভি. পি) এবং প্যাক্সিলাস ইনভোলুটাস (পি. পি. টি. এ)। কিছু গবেষণা, বিশেষ করে বিগিনস এবং অন্যান্যদের দ্বারা বার্কহোল্ডেরিয়া থাইল্যান্ডেনসিস ব্যাকটেরিয়া থেকে দেখা গেছে যে অ্যামিনোট্রান্সফেরেজ জিন অনুপস্থিত থাকতে পারে এবং এই ক্রিয়াকলাপ তার প্রাথমিক বিপাকের মাধ্যমে সরবরাহ করা যেতে পারে। অ্যাট্রোমেন্টিন হল পালভিনিক অ্যাসিড যেমন ভ্যারিয়েগ্যাটিক অ্যাসিড, জেরোকোমিক অ্যাসিড, হোমোক্সেরোকোমিক অ্যাসিড, আইসোক্সেরোকোমিক অ্যাসিড, অ্যাট্রোমেন্টিক অ্যাসিড, ভ্যারিয়েগেটরুবিন, জেরোকোমোরুবিন এবং অন্যান্য পরিবর্তিত ডেরিভেটিভস সহ অন্যান্য বিভিন্ন রঞ্জক পদার্থের অগ্রদূত। প্রধান পালভিনিক অ্যাসিড ধরনের রঞ্জকগুলি ব্যাকটেরিয়ার সাথে সহ-ইনকিউবেশনের সময় বা উচ্চ জৈব নাইট্রোজেন সামগ্রীর প্রবর্তনের সময় (অজৈব নাইট্রোজেনযুক্ত অ-প্ররোচক মাধ্যমের বৃদ্ধির তুলনায়) নিঃসৃত হতে দেখা গেছে। ডায়েরিলসাইক্লোপেন্টেনোনের মধ্যে রয়েছে ইনভোলুটিন, ইনভোলুটন, জাইরোসাইক্যানিন, জাইরোপোরিন (জাইরোসাইয়ানিনের জারিত রূপ), অ্যানহাইড্রোইনভোলুটিন এবং ক্যামোনিক্সিন। যদিও কাঠামোগতভাবে অনুরূপ, গ্রেভিলিন (এ-ডি) 4-এইচপিপি থেকে উদ্ভূত হয়, যা অ্যাট্রোমেন্টিন-এর অগ্রদূত। গ্রেভিলিন হল সুইলাস গণের একটি কেমোট্যাক্সোনমিক চিহ্নিতকারী। অ্যাট্রোমেন্টিন-এর পরিবর্তনের মধ্যে রয়েছে লিউকোআট্রোমেন্টিন, লিউকোমেন্টিন-3, লিউকোমেন্টিন-4 এবং সিলকোলিউকোমেলোন। উপরন্তু, থেলেফোরিক অ্যাসিড একটি ডেরিভেটিভ যা থেলেফোরয়েড ক্লেড থেকে আসে। এর অগ্রদূত অ্যাট্রোমেন্টিন উৎপাদনের জন্য জিনগত এবং উৎসেচক ভিত্তি ছাড়াও এই রঞ্জকগুলির গঠনে জড়িত বিভিন্ন উৎসেচক অজানা। প্যাক্সিলাস ইনভোলুটাসে, জে. জি. আই মাইকোকম পোর্টালের মাধ্যমে উপলব্ধ অ্যানোটেটেড জিনোমে ছয়টি নন-রাইবোসোমাল পেপটাইড সিন্থেটেসের মতো এনজাইম চিহ্নিত করা হয়েছিল। এই জিনগুলি, যাকে ইনভা 1,2,3,4,5 এবং 6 বলা হয়, ই. কোলাই-তে অতিরিক্তভাবে প্রকাশিত হয়েছিল এবং জিনগুলি 4-এইচপিপি-র সাথে অ্যাপ্রো-এনজাইমকে সহ-ইনকিউবেট করে চিহ্নিত করা হয়েছিল যাতে এট্রোমেন্টিন গঠন নির্ধারণ করা যায় যা তার বৈশিষ্ট্যযুক্ত ইউভি-ভিস বর্ণালী এবং মনোআইসোটোপিক ভর দ্বারা উল্লিখিত। ছয়টি এনজাইমের মধ্যে তিনটি কার্যকরী বলে জানা গেছে। এটি একটি বেসিডিওমাইসেটে অ্যাট্রোমেন্টিন উৎপাদনের জন্য একটি অভূতপূর্ব অপ্রয়োজনীয়তা দেখায়। তথ্যসূত্র অ্যান্টিকোয়াগুলেন্টস অ্যান্টিমাইক্রোবিয়ালস অক্সিডোরিডাক্টেস ইনহিবিটারস হাইড্রোক্সিবেনজোকুইনোনস পলিফেনোলস