Branching order of bacterial phyla (Gupta, 2001)
ব্যাকটেরিয়াল ফাইলার শাখা ক্রমের বেশ কয়েকটি মডেল রয়েছে, এর মধ্যে একটি 2001 সালে গুপ্ত দ্বারা সংরক্ষিত ইনডেল বা প্রোটিনের উপর ভিত্তি করে প্রস্তাবিত হয়েছিল, যাকে "প্রোটিন স্বাক্ষর" বলা হয়, যা আণবিক ফাইলোজেনির একটি বিকল্প পদ্ধতি। কিছু সমস্যাযুক্ত ব্যতিক্রম এবং দ্বন্দ্ব এই সংরক্ষিত ইন্ডেলগুলিতে উপস্থিত রয়েছে, তবে, তারা শ্রেণী এবং ফায়লার বিভিন্ন গোষ্ঠীর সাথে একমত। এই পদ্ধতির মাধ্যমে প্রাপ্ত ক্ল্যাডোগ্রামের একটি বৈশিষ্ট্য হল কোষ প্রাচীরের অঙ্গসংস্থানের ক্লাস্টারিং (কিছু ব্যতিক্রম সহ) মনোডার্ম থেকে ট্রানজিশনাল ডিডার্ম থেকে ঐতিহ্যবাহী ডিডার্ম পর্যন্ত। নীচের ক্ল্যাডোগ্রামে, হলুদ = সিউডোপেপ্টিডোগ্লাইকান মনোডার্ম (গ্রাম পরিবর্তনশীল), লাল = পুরু পেপ্টিডোগ্লাইকান মনোডার্ম (গ্রাম পজিটিভ), নীল = পাতলা পেপ্টিডোগ্লাইকান ডিডার্ম (গ্রাম নেগেটিভ), সবুজ = অ্যাটিপিকাল, বন্ধনীতে নোট দেখুন)। এছাড়াও দেখুন ব্যাকটেরিয়াল ফাইলার শাখা ক্রম (ওয়োজ, 1987) ব্যাকটেরিয়াল ফাইলার শাখা ক্রম (র্যাপ এবং জিওভানোনি, 2003) এআরবি সিলভা জীবন্ত গাছের শাখা ক্রম ব্যাকটেরিয়াল ফাইলার শাখা ক্রমের পরে ব্যাকটেরিয়াল ফাইলার শাখা ক্রম (সিকেরেলি এবং অন্যান্য, 2006) ব্যাকটেরিয়াল ফাইলার শাখা ক্রম (ব্যাট্টিস্টুজি এবং অন্যান্য, 2004) ব্যাকটেরিয়াল ফাইলার শাখা ক্রম (গুপ্তা, 2001) ব্যাকটেরিয়াল ফাইলার শাখা ক্রম (ক্যাভালিয়ার-স্মিথ, 2002) রেফারেন্স ব্যাকটেরিয়াল ট্যাক্সনমি-র ব্যাকটেরিয়ালজি সিস্টেম