Podospora anserina
পোডোস্পোরা অ্যানসেরিনা হল সর্দারিয়ালিস ক্রমের একটি ফিলামেন্টাস অ্যাসকোমাইসেট ছত্রাক। এটি বার্ধক্য (বার্ধক্য), প্রিওন, যৌন প্রজনন এবং মায়োটিক ড্রাইভের আণবিক জীববিজ্ঞান অধ্যয়নের জন্য একটি মডেল জীব হিসাবে বিবেচিত হয়। এর একটি বাধ্যতামূলক যৌন এবং সিউডোহোমোথ্যালিক জীবনচক্র রয়েছে। এটি একটি অ-প্যাথোজেনিক কোপ্রোফিলাস ছত্রাক যা ঘোড়া, খরগোশ, গরু এবং ভেড়ার মতো তৃণভোজী প্রাণীর গোবরকে উপনিবেশ করে। ট্যাক্সনমি পোডোস্পোরা আনসেরিনা মূলত নাম দেওয়া হয়েছিল মালিনভার্নিয়া আনসেরিনা রাবেনহর্স্ট (1857)। পোডোস্পোরা অ্যানসেরিনা পরবর্তীকালে নিস্ল (1883)-এ প্রকাশিত হয়েছিল, যা আজ সেখান থেকে সাধারণ ল্যাবরেটরি স্ট্রেন, 'নিস্ল' উল্লেখ করতে ব্যবহৃত হয়। এটি প্লুরেজ অ্যানসেরিনা (সেস) নামেও পরিচিত। কুঞ্জ। পি. আনসেরিনার জিনতত্ত্ব রিজেট এবং এঙ্গেলম্যান (1949)-এ চিহ্নিত করা হয়েছিল এবং এসার (1974) দ্বারা পর্যালোচনা করা হয়েছিল। 18এস আরআরএনএ এবং প্রোটিন অর্থোলোগাস শেয়ার 60-70% হোমোলজির উপর ভিত্তি করে অনুমান করা হয় যে পি. অ্যানসেরিনা 75 মিলিয়ন বছর আগে নিউরোস্পোরা ক্রাসা থেকে বিচ্ছিন্ন হয়েছিল। অ্যাস্পারগিলাস নিডুলানস এবং পোডোস্পোরা অ্যানসেরিনার মধ্যে জিন ক্লাস্টার অর্থোলগের 63 শতাংশ অভিন্ন প্রাথমিক অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম রয়েছে (যদিও এই প্রজাতিগুলি স্বতন্ত্র শ্রেণীর) এবং তুলনামূলক প্রোটিওমের গড় অ্যামিনো অ্যাসিড 10 শতাংশ কম, যা স্বতন্ত্র প্রজাতির এখনও ভাগ করা জিনের অনুমানের জন্ম দেয়। গবেষণা পোডোস্পোরা হল জেনেটিক্স, বার্ধক্য (বার্ধক্য, কোষের অবক্ষয়), অ্যাসকোমাইসেট বিকাশ, হেটেরোক্যারিয়নের অসামঞ্জস্যতা, ছত্রাকের সঙ্গম, প্রিওন এবং মাইটোকন্ড্রিয়াল এবং পারক্সিসোমাল ফিজিওলজি অধ্যয়নের জন্য একটি মডেল জীব। পোডোস্পোরা জটিল (পূর্ণ) আলু ডেক্সট্রোজ, কর্নমিল আগর/ঝোল বা এমনকি সিন্থেটিক মাধ্যমে সহজেই চাষযোগ্য এবং আধুনিক আণবিক সরঞ্জাম ব্যবহার করে সহজেই পরিচালনা করা যায়। এর সর্বোত্তম বৃদ্ধির তাপমাত্রা পরীক্ষাগারের পরিস্থিতিতে 7 থেকে 11 দিনের মধ্যে তার জীবনচক্র সম্পূর্ণ করতে পারে। বেশিরভাগ গবেষণা 1920-এর দশকে নমুনা নেওয়া ফরাসি স্ট্রেনগুলির একটি ছোট সংগ্রহে করা হয়েছে, বিশেষত এস এবং এস নামক স্ট্রেনগুলি। এই দুটি স্ট্রেন হেট-এস লোকাস ব্যতীত খুব অনুরূপ বলে জানা যায়। 2008 সালে প্রকাশিত রেফারেন্স জিনোমটি এস + এর সাথে মিলে যায়, যা একটি + সঙ্গমের প্রকারের এস স্ট্রেনের হ্যাপ্লয়েড ব্যুৎপত্তি। এছাড়াও, আরও দুটি জনসংখ্যার নমুনা নেওয়া হয়েছে, একটি জার্মানির ইউজিংয়েনে এবং অন্যটি নেদারল্যান্ডসের ওয়াজেনিঙ্গেনে, যা উভয়ই বীজকণিকা হত্যা, ছত্রাকের মায়োটিক ড্রাইভের ফেনোটাইপিক অভিব্যক্তি অধ্যয়নের জন্য ব্যবহৃত হয়েছে। এছাড়াও একাধিক ল্যাব-উদ্ভূত স্ট্রেন রয়েছেঃ αPaKu70 পছন্দসই জিন মুছে ফেলা বা অ্যালেলিক মিউটেশন তৈরি করার জন্য রূপান্তরের সময় প্রোটোপ্লাস্টে সমজাতীয় পুনঃসংযোগ বাড়াতে ব্যবহৃত হয়। প্রোটোপ্লাস্টকে রৈখিক ডি. এন. এ দিয়ে রূপান্তরিত করে যা একটি অ্যান্টিবায়োটিক ক্যাসেটের সাথে পাক্যু 70 জিনকে পার্শ্ব করে এবং তারপরে স্ট্রেনগুলির জন্য নির্বাচন করে এবং পিসিআর দ্বারা যাচাই করে একটি αPaKu70 স্ট্রেন অর্জন করা যেতে পারে। এস স্ট্রেন থেকে উদ্ভূত। এমএন19 একটি দীর্ঘস্থায়ী স্ট্রেন যা বার্ধক্য অধ্যয়নের জন্য ব্যবহৃত হয়। এটি ম্যাঙ্গানিজ (এমএন)-এর উপর উত্থিত স্ট্রেন এ +-84-11 থেকে উদ্ভূত। এই বিশেষ জাতটি উদ্ভিজ্জ বৃদ্ধির উপর একটি রেস টিউবে 2 বছরেরও বেশি সময় ধরে বেঁচে ছিল বলে জানা গেছে। আইডাব্লুভিভ একটি অমর স্ট্রেন যা বার্ধক্যের কোনও লক্ষণ দেখায় না। এটি হলুদ রঞ্জক তৈরি করে। বন্য প্রজাতির তুলনায় ভি. আই. ভি-এর অভাব দিনের মধ্যে আয়ু 2 দশমিক 3 গুণ এবং আই-এর অভাব 1 দশমিক 6 গুণ বৃদ্ধি করে। যাইহোক, পুরো অধ্যয়নের সময় স্ট্রেন আইডাব্লুভিভ কোনও বার্ধক্য দেখায়নি এবং এক বছরেরও বেশি সময় ধরে উদ্ভিজ্জ ছিল। এই জিনগুলি সমন্বয়মূলক এবং শারীরিকভাবে ঘনিষ্ঠভাবে সংযুক্ত। এএল2 একটি দীর্ঘস্থায়ী স্ট্রেন। আল-2 ধারণকারী রৈখিক মাইটোকন্ড্রিয়াল প্লাজমিডের সন্নিবেশ জীবনকাল বৃদ্ধি দেখায়। যাইহোক, আল-2-এর সমতুল্য প্রাকৃতিক আইসোলেটগুলি বর্ধিত আয়ু দেখায় না। গ্রিসিয়া একটি দীর্ঘস্থায়ী স্ট্রেন এবং তামার অপটেক মিউট্যান্ট। এই স্ট্রেনের তামার সাথে কম সম্পর্ক রয়েছে এবং এইভাবে আন্তঃকোষীয় তামার মাত্রা কম হয়, যার ফলে সায়ানাইড-প্রতিরোধী বিকল্প অক্সিডেস, পিএওএএক্স, পাথওয়ে (তামা-নির্ভর মাইটোকন্ড্রিয়াল সাইটোক্রোম সি অক্সিডেস (সিওএক্স) কমপ্লেক্সের পরিবর্তে) ব্যবহার করা হয়। এই স্ট্রেনটি আরও স্থিতিশীল এম. টি. ডি. এন. এ প্রদর্শন করে। তামার ব্যবহার αx1 স্ট্রেনের অনুরূপ। এক্স 1 একটি 'অমর স্ট্রেন' যা 12 বছরেরও বেশি সময় ধরে বেড়ে উঠেছে এবং এখনও বার্ধক্যের কোনও লক্ষণ দেখায় না। এই স্ট্রেনটি সায়ানাইড-প্রতিরোধী, স্যালিসাইলহাইড্রক্সামিক অ্যাসিড (এসএইচএএম)-সংবেদনশীল পথের মাধ্যমে শ্বাস নেয়। এই অপসারণ সিওএক্স কমপ্লেক্সকে ব্যাহত করে। বার্ধক্যজনিত পোডোস্পোরা অ্যানসেরিনার একটি নির্দিষ্ট জীবনকাল রয়েছে এবং ফেনোটাইপিকভাবে সেনসেন্স দেখায় (ধীর বৃদ্ধি, কম বায়বীয় হাইফা এবং দূরবর্তী হাইফায় রঙ্গক উৎপাদন বৃদ্ধি দ্বারা)। যাইহোক, আইসোলেটগুলি হয় বর্ধিত জীবনকাল বা অমরত্ব দেখায়, কারণ বার্ধক্যের প্রক্রিয়া অধ্যয়ন করার জন্য অমর স্ট্রেন তৈরি করতে বা জীবনকাল বাড়ানোর জন্য অনেক জেনেটিক ম্যানিপুলেশন করা হয়েছে। সাধারণভাবে, মাইটোকন্ড্রিয়ন এবং মাইটোকন্ড্রিয়াল ক্রোমোজোম পরীক্ষা করা হয়। সেনসেন্স ঘটে কারণ শ্বাস-প্রশ্বাসের সময় প্রতিক্রিয়াশীল অক্সিজেন প্রজাতি তৈরি হয় যা জীবনকালকে সীমাবদ্ধ করে এবং সময়ের সাথে সাথে ত্রুটিযুক্ত মাইটোকন্ড্রিয়াল ডিএনএ জমা হতে পারে। এই জ্ঞানের সাহায্যে পুষ্টির প্রাপ্যতা, শ্বাসপ্রশ্বাস (এটিপি সংশ্লেষণ) এবং সাইটোক্রোম সি অক্সিডেসের মতো অক্সিডেসের দিকে মনোনিবেশ করা হয়। ক্যারোটিনয়েড, রঞ্জক পদার্থ যা উদ্ভিদের মধ্যে পাওয়া যায় এবং মানুষের জন্য স্বাস্থ্য উপকারিতা প্রদান করে, পোডোস্পোরার বিচ্ছিন্ন পূর্বপুরুষ নিউরোস্পোরা ক্রাসার মতো ছত্রাকের মধ্যে রয়েছে বলে জানা যায়; এন. ক্রাসার (এবং অন্যান্য ছত্রাক) কার্টেনোয়েড অ্যাল জিনগুলি ইউভি বিকিরণ সুরক্ষা প্রদান করে। আল-2 পোডোস্পোরা অ্যানসেরিনার অতিরিক্ত অভিব্যক্তি জীবনকাল 31 শতাংশ বৃদ্ধি করে। ক্যালোরি সীমাবদ্ধতা অধ্যয়নগুলি দেখায় যে চিনির মতো পুষ্টি হ্রাস, জীবনকাল বৃদ্ধি, সম্ভবত ধীর বিপাকের কারণে এবং এইভাবে প্রতিক্রিয়াশীল অক্সিজেন প্রজাতির উৎপাদন বা বেঁচে থাকার জিনকে প্ররোচিত করে। এছাড়াও, অন্তঃকোষীয় তামার মাত্রা বৃদ্ধির সঙ্গে সম্পর্কযুক্ত বলে দেখা গেছে। এটি গ্রিসিয়া-মুছে ফেলা এবং এক্স 1-মুছে ফেলা স্ট্রেনের পাশাপাশি বন্য ধরনের এস স্ট্রেনে অধ্যয়ন করা হয়েছিল। গ্রিসিয়া ছাড়া পোডোস্পোরা, একটি তামার প্রতিলিপি উপাদান, আন্তঃকোষীয় তামার মাত্রা হ্রাস করেছিল যা একটি বিকল্প শ্বাসযন্ত্রের পথের ব্যবহারের দিকে পরিচালিত করে যা ফলস্বরূপ কম জারণ চাপ তৈরি করে। হেটেরোক্যারিয়নের অসামঞ্জস্যতা নিম্নলিখিত জিনগুলি, অ্যালেলিক এবং নন-অ্যালেলিক উভয়ই উদ্ভিজ্জ অসঙ্গতির সাথে জড়িত বলে মনে করা হয় (শুধুমাত্র ক্লোন করা এবং বৈশিষ্ট্যযুক্তগুলি তালিকাভুক্ত করা হয়েছে): হেটি-সি, হেটি-সি, হেটি-এস, ইডিআই-2, ইডিআই-1, ইডিআই-3, মোড-এ, মোড-ডি, মোড-ই, পিএসপি-এ। পোডোস্পোরা অ্যানসেরিনায় কমপক্ষে 9 হেক্টর লোকাই থাকে। এনজাইম পোডোস্পোরা অ্যানসেরিনা ল্যাকসেস উৎপাদনের জন্য পরিচিত, যা এক ধরনের ফেনোলক্সিডেস। জেনেটিক্স জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস দ্বারা মূল জিনগত গবেষণায় 7টি ক্রোমোজোম এবং 1টি মাইটোকন্ড্রিয়াল ক্রোমোজোম সহ জিনোমের আকার, মেগাবেসের সন্ধান পাওয়া গেছে। 1980-এর দশকে মাইটোকন্ড্রিয়াল ক্রোমোজোমের ক্রমবিন্যাস করা হয়। তারপর, 2003 সালে, বিএসি ক্লোন এবং সরাসরি সিকোয়েন্সিং ব্যবহার করে ক্রোমোজোম ভি-এর সেন্ট্রোমিয়ারের সীমান্তবর্তী অঞ্চলগুলিকে সিকোয়েন্স করার জন্য একটি পাইলট গবেষণা শুরু করা হয়েছিল। 2008 সালে, একটি 10x সম্পূর্ণ জিনোম খসড়া ক্রম প্রকাশিত হয়েছিল। জিনোমের আকার এখন 35-36 মেগাবেজ বলে অনুমান করা হয়। কম সমজাতীয় পুনঃসংযোগ দক্ষতার কারণে ছত্রাকের মধ্যে জেনেটিক ম্যানিপুলেশন কঠিন এবং যা অ্যালিল প্রতিস্থাপন ব্যবহার করে জেনেটিক গবেষণায় বাধা দেয়। 2005 সালে, অ্যাস্পারগিলাস নিডুলানসের একটি মডেলের উপর ভিত্তি করে জিন অপসারণের একটি পদ্ধতি তৈরি করা হয়েছিল যা মহাজাগতিক প্লাজমিড রূপান্তরের সাথে জড়িত ছিল। 2008 সালে পোডোস্পোরার জন্য একটি উন্নত ব্যবস্থা তৈরি করা হয়েছিল এমন একটি স্ট্রেন ব্যবহার করে যার মধ্যে নন-হোমোলোগাস এন্ড জয়েনিং প্রোটিন (কেইউ (প্রোটিন) ছিল, যা পোডোস্পোরায় পাকু70 নামে পরিচিত)। এই পদ্ধতিতে দাবি করা হয় যে রূপান্তরকারীদের 100% কাঙ্ক্ষিত সমজাতীয় পুনঃসংযোগের মধ্য দিয়ে যায় যা অ্যালেলিক প্রতিস্থাপনের দিকে পরিচালিত করে এবং রূপান্তরের পরে, পাকু 70 মুছে ফেলা একটি বন্য-ধরনের স্ট্রেনের সাথে অতিক্রম করে পুনরুদ্ধার করা যেতে পারে যা শুধুমাত্র লক্ষ্যযুক্ত জিন মুছে ফেলা বা অ্যালেলিক বিনিময় (যেমন। পয়েন্ট মিউটেশন)। গৌণ বিপাক এটি সর্বজনবিদিত যে সমস্ত ক্ষেত্র জুড়ে অনেক জীব গৌণ বিপাক উৎপাদন করে এবং ছত্রাক এই ক্ষেত্রে প্রচুর পরিমাণে থাকে। 1990-এর দশকে পোডোস্পোরা গণের জন্য পণ্য খনন কাজ ভালভাবে চলছিল। পোডোস্পোরা অ্যানসেরিনা থেকে পেন্টাকেটাইড হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ দুটি নতুন প্রাকৃতিক পণ্য, বিশেষত বেনজোকুইনোনগুলির ডেরিভেটিভস আবিষ্কৃত হয়েছিল; এগুলি অ্যান্টিফাঙ্গাল, অ্যান্টিব্যাকটেরিয়াল এবং সাইটোটক্সিক ক্রিয়াকলাপ দেখায়। অনুভূমিক জিন স্থানান্তর ব্যাকটেরিয়া এবং প্রোক্যারিওটস এবং ইউক্যারিওটসের মধ্যে সাধারণ, তবে ইউক্যারিওটিক জীবের মধ্যে এটি আরও বিরল। ছত্রাকের মধ্যে, গৌণ মেটাবোলাইট ক্লাস্টারগুলি অনুভূমিক জিন স্থানান্তরের জন্য ভাল প্রার্থী, উদাহরণস্বরূপ, একটি কার্যকরী এস. টি জিন ক্লাস্টার যা স্টেরিগমাটোসিস্টিন তৈরি করে পোডোস্পোরা অ্যানসেরিনায় পাওয়া গিয়েছিল এবং মূলত অ্যাস্পারগিলাস থেকে উদ্ভূত হয়েছিল। এই গুচ্ছটি ভালভাবে সংরক্ষিত, বিশেষত, প্রতিলিপি-ফ্যাক্টর বাঁধাই সাইটগুলি সহ। স্টেরিগমাটোসিস্টিন নিজেই বিষাক্ত এবং এটি আরেকটি বিষাক্ত বিপাক, আফ্লাটক্সিনের অগ্রদূত। আরও দেখুন ফাঙ্গাল প্রিওনস পিএক্সএমপি3 ভাইরাস শ্রেণীবিভাগ ওলিগো প্রাইমার অ্যানালাইসিস সফ্টওয়্যার পয়েন্ট মিউটেশন অ্যামাইলয়েড রেফারেন্স এক্সটার্নাল লিঙ্ক ল্যাসিওস্ফেরিয়াসি ট্যাক্সা 1857 মডেল জীবদেহে বর্ণিত গটলব লুডভিগ রাবেনহর্স্ট দ্বারা নামকরণ করা ছত্রাক