Serratus (virology)
পৃথিবীর ভাইরোমের মোট জিনগত বৈচিত্র্য উন্মোচন করার জন্য সেরাটাস একটি বড় আকারের ভাইরোইনফরম্যাটিক্স প্ল্যাটফর্ম। অন্যান্য গবেষকদের দ্বারা ঘটনাক্রমে ক্রমবদ্ধ হওয়া নতুন করোনভাইরাসগুলি উন্মোচন করার লক্ষ্য নিয়ে এই প্রকল্পটি সমস্ত আরএনএ ভাইরাসকে অন্তর্ভুক্ত করার জন্য প্রসারিত হয়েছিল, যা একটি ভাইরাল আরএনএ-নির্ভর আরএনএ পলিমারেজকে (আরডিআরপি) এনকোড করে। 2020 সালের শেষের দিকে পাবলিক ডেটাবেস থেকে প্রায় 15,000 স্বতন্ত্র আর. এন. এ ভাইরাস সিকোয়েন্স জানা গিয়েছিল, যা স্বতন্ত্র আর. ডি. আর. পি-র সংখ্যা (অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্সে 10 শতাংশেরও বেশি পার্থক্য) দ্বারা পরিমাপ করা হয়েছিল। বড় মাপের ক্লাউড কম্পিউটিংয়ের জন্য অপ্টিমাইজড একটি বায়োইনফরমেটিক্স ওয়ার্কফ্লো ব্যবহার করে, গবেষণা দলটি মাত্র 11 দিনের মধ্যে সিকোয়েন্স রিড আর্কাইভ (এসআরএ)-এ 57 লক্ষ মুক্তভাবে উপলব্ধ সিকোয়েন্সিং ডেটাসেট (20.4 পেটাবাইট কাঁচা ডেটা) বিশ্লেষণ করেছে এবং কম্পিউটিং খরচ 23,900 মার্কিন ডলার। এই বিশ্লেষণে 132,000 নতুন ভাইরাল আর. ডি. আর. পি পাওয়া গেছে, যা আর. এন. এ ভাইরাসগুলির পরিচিত জিনগত বৈচিত্র্যের প্রায় পরিমাণ বৃদ্ধির প্রতিনিধিত্ব করে। ডাটাবেসের মধ্যে, আর. এন. এ ভাইরাসগুলিকে তাদের আর. ডি. আর. পি পামপ্রিন্ট অনুসারে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়, যা এক ধরনের আণবিক বারকোড। পামপ্রিন্টকে গণনামূলকভাবে দক্ষ সূচক হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে যার সনাক্তকরণের জন্য এস. আর. এ সিকোয়েন্সিং একটি নির্দিষ্ট আর. এন. এ ভাইরাস ধারণ করে। এই জাতীয় সূচক কাঁচা সিকোয়েন্সিং ডেটাসেটগুলির লক্ষ্যযুক্ত বিশ্লেষণের অনুমতি দেয় যা থেকে নতুন আরএনএ ভাইরাসগুলি চিহ্নিত করা যেতে পারে। সমস্ত সেরাটাস ডেটা আইএনডিএসসি রিলিজ নীতির অধীনে অবাধে উপলব্ধ। তথ্যসূত্র বাহ্যিক লিঙ্ক পামআইডিঃ আরডিআরপি সিকোয়েন্স সার্চ টুল সেরাটাস কোড রিপোজিটরি বায়োইনফরম্যাটিক্স গণনামূলক জীববিজ্ঞান ভাইরোলজি অধ্যয়নের গণনামূলক ক্ষেত্র