Formate-nitrite transporter
ফরমেট-নাইট্রাইট ট্রান্সপোর্টার (এফএনটি) পরিবারটি মেজর ইন্ট্রিন্সিক প্রোটিন (এমআইপি) সুপারফ্যামিলির অন্তর্গত। এফএনটি পরিবারের সদস্যদের গ্রাম-নেগেটিভ এবং গ্রাম-পজিটিভ ব্যাকটেরিয়া, আর্কিয়া, খামির, উদ্ভিদ এবং নিম্ন ইউক্যারিওট থেকে ক্রমবদ্ধ করা হয়েছে। এফএনটি পরিবারের প্রোক্যারিওটিক প্রোটিনগুলি সম্ভবত কাঠামোগতভাবে সম্পর্কিত যৌগ, ফরমেট এবং নাইট্রাইটের পরিবহনে কাজ করে। গঠন খামির প্রোটিন (627 অ্যামিনো অ্যাসাইল অবশিষ্টাংশ) ব্যতীত, পরিবারের সমস্ত বৈশিষ্ট্যযুক্ত সদস্যদের দৈর্ঘ্যে 256-285 অবশিষ্টাংশ থাকে এবং 6-8টি অনুমানমূলক ট্রান্সমেম্ব্রেন α-হেলিকাল স্প্যানার (টিএমএস) প্রদর্শন করে। একটি ক্ষেত্রে, ই. কোলাই ফোকা (টিসি #1.A.16.1.1) প্রোটিনের একটি 6 টিএমএস টপোলজি প্রতিষ্ঠিত হয়েছে। ইস্ট প্রোটিনের একটি অনুরূপ আপাত টপোলজি রয়েছে তবে প্রায় 400 অবশিষ্টাংশের একটি বড় সি-টার্মিনাল হাইড্রোফিলিক এক্সটেনশন রয়েছে। ই. কোলাই-এর এফ. ও. সি. এ হল একটি প্রতিসম পেন্টামার, যার প্রতিটি উপ-একক ছয়টি টি. এম. এস নিয়ে গঠিত। ফাইলোজেনি ফাইলোজেনেটিক গাছ ফাংশন এবং জৈব ফাইলোজেনি অনুযায়ী ক্লাস্টারিং দেখায়। পাইরুভেট-ফরমেট লাইয়েজ (পি. এফ. এল)-এর সঙ্গে যুক্ত ব্যাকটেরিয়ার পুটেটিভ ফরমেট এফ্লাক্স ট্রান্সপোর্টার (এফ. ও. সি. এ.; <আই. ডি. 8> <আই. ডি. 4> এবং <আই. ডি. 1>) ক্লাস্টার 1 নিয়ে গঠিত; ফর্মেট ডিহাইড্রোজেনেসের সঙ্গে যুক্ত ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়ার পুটেটিভ ফরমেট আপটেক পারমিয়াস (এফ. ডি. এইচ. সি; <আই. ডি 8> <আই. ডি 2> এবং <আই. ডি 7>) ক্লাস্টার 2 নিয়ে গঠিত; ব্যাকটেরিয়ার নাইট্রাইট আপটেক পারমিয়াস (এন. আর. সি, <আই. ডি 8> <আই. ডি 6>, <আই. ডি 3>, এবং <আই. ডি 5>) ক্লাস্টার 3 নিয়ে গঠিত এবং একটি ইস্ট প্রোটিন ক্লাস্টার 4 নিয়ে গঠিত। ফাংশন এফএনটি পরিবারের প্রোটিনের জন্য শক্তি সংযোগ প্রক্রিয়া ব্যাপকভাবে চিহ্নিত করা হয়নি। এইচসিও এবং নো আপটেকগুলি এইচ + সিম্পোর্টের সাথে যুক্ত হতে পারে। এইচ. সি. ও এফ্লাক্স একটি ইউনিপোর্ট প্রক্রিয়া বা এইচ + অ্যান্টিপোর্ট দ্বারা ঝিল্লি সম্ভাব্যতা দ্বারা চালিত হতে পারে। ই. কোলাই-এর এফ. ও. সি. এ দ্বিমুখী গঠনমূলক পরিবহণকে অনুঘটক করে এবং একটি চ্যানেল-টাইপ প্রক্রিয়া দ্বারা কাজ করতে পারে। এফওসিএ, শর্ট-চেইন অ্যাসিড পরিবহন করে। এফ. ও. সি. এ তার কার্যপদ্ধতি উচ্চ বাহ্যিক পিএইচ-এ একটি নিষ্ক্রিয় রপ্তানি চ্যানেল থেকে কম পিএইচ-এ একটি গৌণ সক্রিয় বিন্যাস/এইচ + আমদানিকারক-এ পরিবর্তন করতে সক্ষম হতে পারে। পিএইচ 4-এ সালমোনেলা টাইফিমুরিয়াম এফওসিএ-এর স্ফটিক কাঠামো দেখায় যে এই পরিবর্তনটি পেন্টামেরিক চ্যানেলে পৃথক পৃথক প্রোটোমারের অ্যামিনো টার্মিনার একটি বড় পুনর্বিন্যাসের সাথে জড়িত। অ্যামিনো-টার্মিনাল হেলিসগুলি একটি সমন্বিত, সহযোগিতামূলক ক্রিয়ায় পরিবহনকে উন্মুক্ত বা অবরুদ্ধ করে যা নির্দেশ করে যে কীভাবে ফোকাকে পিএইচ-নির্ভর উপায়ে গেটেড করা হয়। ইলেক্ট্রোফিজিওলজিক্যাল স্টাডিজ দেখায় যে প্রোটিন পিএইচ 7-এ একটি নির্দিষ্ট ফরমেট চ্যানেল হিসাবে কাজ করে এবং পিএইচ 5.1-এ স্থানান্তরিত হলে এটি বন্ধ হয়ে যায়। পরিবহন প্রতিক্রিয়া এফএনটি পরিবারের বিভিন্ন সদস্যদের দ্বারা অনুঘটকিত সম্ভাব্য পরিবহন প্রতিক্রিয়াগুলি হলঃ (1) আরসিও বা এনও (আউট) আরসিও বা এনও (ইন), (2) এইচসিও (ইন) এইচসিও (আউট), (3) এইচএস-(আউট) এইচএস-(ইন)। বর্তমানে এফ. এন. টি পরিবারের অন্তর্গত শ্রেণীবদ্ধ সদস্যদের একটি প্রতিনিধি তালিকা ট্রান্সপোর্টার ক্লাসিফিকেশন ডাটাবেসে পাওয়া যাবে। কিছু বৈশিষ্ট্যযুক্ত সদস্যের মধ্যে রয়েছেঃ ফোকা এবং এফওসিবি (যথাক্রমে TC#s 1.A.16.1.1 এবং 1.A.16.1.2), এসচেরিচিয়া কোলাই থেকে, ফরমেটের দ্বিমুখী পরিবহনের সাথে জড়িত পরিবাহক। এফডিএইচসি, মিথেনোব্যাকটেরিয়াম মেরিপালুডিস (টিসি #1.A.16.2.3) এবং মিথেনোথার্মোব্যাক্টর থার্মোফর্মিকাম (টিসি #1.A.16.2.1) থেকে, একটি সম্ভাব্য গঠনকারী পরিবাহক। ই. কোলাই (টিসি #1.A.16.3.1) থেকে নির্সি, একটি সম্ভাব্য নাইট্রাইট পরিবাহক। ক্ল্যামিডোমোনাস রেইনহার্ডটি (ক্ল্যামিডোমোনাস স্মিথাই)-এর নার1 (টিসি #1.A.16.2.4), 355টি অ্যামিনো অ্যাসাইল অবশিষ্টাংশের একটি নাইট্রাইট গ্রহণকারী পোর্টার। বি. সাবটিলিস হাইপোথেটিক্যাল প্রোটিন ওয়াইডব্লিউসিজে (আইপিএ-48আর) (টিসি #1.A.16.3.2)। তথ্যসূত্র প্রোটিন পরিবার ঝিল্লি প্রোটিন ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন ট্রান্সমেম্ব্রেন পরিবাহক পরিবহন প্রোটিন ইন্টিগ্রাল মেমব্রেন প্রোটিন