CheShift
চেশিফ্ট-2 (উচ্চারিত/টিএচইসিএইচআইএফটি/) একটি অ্যাপ্লিকেশন যা 13সিএ এবং 13সিবি প্রোটিন রাসায়নিক স্থানান্তর গণনা এবং প্রোটিন কাঠামো যাচাই করার জন্য তৈরি করা হয়েছে। এটি 20টি অ্যামিনো অ্যাসিডের টর্সোনাল কোণের (φ, si, ω এবং χ1, χ2) ফাংশন হিসাবে 13Cα এবং 13Cβকেমিক্যাল শিফটের কোয়ান্টাম মেকানিক্স গণনার উপর ভিত্তি করে। চেশিফ্ট-2 একটি পিডিবি ফাইল থেকে তাত্ত্বিক রাসায়নিক স্থানান্তর মানগুলির একটি তালিকা ফেরত দিতে পারে। এটি আপলোড করা পি. ডি. বি ফাইল এবং রাসায়নিক স্থানান্তর মানের উপর ভিত্তি করে একটি 3ডি প্রোটিন মডেল প্রদর্শন করতে পারে। থ্রিডি প্রোটিন মডেলটি পাঁচটি রঙের কোড ব্যবহার করে রঙিন করা হয়েছে যা তাত্ত্বিক বনাম পর্যবেক্ষিত রাসায়নিক পরিবর্তনের মানগুলির পার্থক্য নির্দেশ করে। পর্যবেক্ষিত এবং ভবিষ্যদ্বাণীকৃত 13Cα এবং 13Cβ রাসায়নিক পরিবর্তনের মধ্যে পার্থক্য একটি সংবেদনশীল তদন্ত হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে যার সাহায্যে প্রোটিন কাঠামোর সম্ভাব্য স্থানীয় ত্রুটিগুলি সনাক্ত করা যায়। যদি 13Cα এবং 13Cβ উভয় পর্যবেক্ষিত রাসায়নিক পরিবর্তন সরবরাহ করা হয় তবে চেশিফ্ট-2 বিকল্প χ1 এবং χ2 পার্শ্ব-শৃঙ্খল টর্সোনাল কোণগুলির একটি তালিকা সরবরাহ করার চেষ্টা করবে যা পর্যবেক্ষিত এবং গণনা করা রাসায়নিক পরিবর্তনের মধ্যে পার্থক্য হ্রাস করবে, এই মানগুলি প্রোটিন কাঠামোর ত্রুটিগুলি মেরামত করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। চেশিফ্ট-2 অনলাইনে http://www.cheshift.com অথবা পাইমোল প্লাগইনের মাধ্যমে অ্যাক্সেস করা যেতে পারে। আরও দেখুন কাঠামো বৈধতা বায়োইনফরম্যাটিক্স গণনামূলক জীববিজ্ঞান সম্পর্কিত সফ্টওয়্যার কী যদি সফ্টওয়্যার PROCHECK পিএসভিএস বাহ্যিক লিঙ্ক চেশিফ্ট পাইমোল প্লাগইন গিটহাব সংগ্রহস্থল রেফারেন্স বায়োইনফরম্যাটিক্স সফ্টওয়্যার