FAM193A
ক্রমের সাদৃশ্যযুক্ত পরিবার 193 সদস্যের এ হল এমন একটি প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে ক্রোমোজোম 4-এর লোকাস p16.3-এ অবস্থিত এফএএম193এ জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। FAM193A C4orf8, ক্রোমোজোম 4 ওপেন রিডিং ফ্রেম 8, RES 4-22, প্রোটিন IT143, এবং অনুমানমূলক প্রোটিন LOC86032 নামেও পরিচিত। জিন এনসেম্বল ব্যবহার করে এফএএম193এ জিন জুড়ে স্প্লাইসিংয়ের বৈচিত্র্যের তুলনা করে, 11টি প্রতিলিপি পাওয়া গেছে যার মধ্যে তিনটি ভুল বা কাটা প্রোটিন এবং দুটি অ-সিডিএস প্রতিলিপি থেকে ইন্ট্রন ধরে রাখা হয়েছে। উপস্থাপিত সমস্ত প্রতিলিপি এক্সন 1-এর ক্ষেত্রে ঠিক একই সূচনা বিন্দু প্রকাশ করে। এই ধারাবাহিকতা 5 'ইউ. টি. আর জুড়ে সমস্ত বিকল্পভাবে স্প্লাইসড এম. আর. এন. এ-তে দেখা যায়, স্প্লাইস ভেরিয়েন্ট 4 ব্যতীত। প্রকাশিত প্রোটিনের মধ্যে তিনটি ক্ষেত্র রয়েছে যার সম্ভবত মোটিফ রয়েছে; একটি কয়েল-কয়েলের মধ্যে লিউসিন জিপার। এই তিনটি মোটিফ এক্সন 5,16 এবং 17-এর মধ্যে রয়েছে। ক্ষেত্রগুলি হয় প্রকাশ করা হয় বা সম্পূর্ণরূপে বাদ দেওয়া হয় এবং অন্যান্য অংশগুলি প্রকাশ করা হয়। টিস্যু বিতরণ FAM193A জিনটি ভ্রূণ, লিম্ফ নোড, স্নায়ু, জরায়ু, অণ্ডকোষ, স্বরযন্ত্রের টিস্যু এবং রক্তে কিছু পরিমাণে তার EST প্রোফাইল Hs.652364 থেকে স্পট তীব্রতা পরীক্ষা করে প্রচুর পরিমাণে প্রকাশ করা হয়। জিনটি বেশ কয়েকটি স্বাস্থ্য অবস্থার মাধ্যমে প্রকাশিত হয়, উদাহরণস্বরূপ, অ্যাড্রিনাল, কনড্রোসারকোমা এবং জরায়ুর টিউমার, এটি নরম টিস্যু/পেশী টিস্যু টিউমারেও জড়িত। প্রসবপূর্ব এলসিএম মাইক্রো অ্যারে তথ্যের মধ্যে BRAINSPAN.org থেকে একটি মাইক্রো অ্যারে মস্তিষ্ক জুড়ে সর্বব্যাপী মানুষের মধ্যে এফএএম193এ অভিব্যক্তির উচ্চ প্রাচুর্য দেখায়। তিনটি প্রোবের মধ্যে একটি এফএএম193এ (এ _ 24 _ পি126465)-এর খুব কম জিন অভিব্যক্তি দেখিয়েছে। মাইক্রো অ্যারে থেকে সংকেতের তীব্রতার দিক থেকে সবচেয়ে উল্লেখযোগ্য কাঠামো হল; অক্সিপিটাল লোব, হিপ্পোক্যাম্পাল গঠন, গ্লোবাস প্যালিডাস, প্যারাহিপ্পোক্যাম্পাল গাইরাস, অ্যামিগডালা, তবে ইনসুলায় তুলনামূলকভাবে কম অভিব্যক্তি। রেগুলেশন এফএএম193এ-তে প্রকাশিত সাহিত্য থেকে তৈরি বেশ কয়েকটি নির্দিষ্ট রাসায়নিক-জিন মিথস্ক্রিয়া রয়েছে। আফ্লাটক্সিনের সাথে মিথস্ক্রিয়া, একটি প্রাকৃতিকভাবে ঘটে যাওয়া মাইকোটক্সিন, দীর্ঘস্থায়ী ইঁদুর জৈব বিশ্লেষণের প্রয়োগের মাধ্যমে কার্সিনোজেনিক সম্ভাবনার জন্য মূল্যায়ন করা হয়েছিল। এই যৌগটি এফ. এ. এম. 193এ এম. আর. এন. এ-র অভিব্যক্তি বৃদ্ধি করে এবং শ্রেণিবদ্ধ ক্লাস্টারিং দ্বারা এই জিনটিকে ম্যাক্রোমোলিকুল, সেলুলার সংগঠন এবং নিয়ন্ত্রণ সম্পর্কিত প্রক্রিয়াগুলিতে জড়িত করে। ডাইহাইড্রোটেস্টোস্টেরন হল পুরুষ যৌন হরমোনের অ্যান্ড্রোজেন। প্রোস্টেট কোষের রক্ষণাবেক্ষণ ও বৃদ্ধিতে অ্যান্ড্রোজেন গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। 6, 24 এবং 48 ঘন্টার জন্য ডাইহাইড্রোটেস্টোস্টেরন এবং বাইকালুটামাইড দিয়ে চিকিত্সা করা প্রোস্টেট ক্যান্সার সেল লাইন এলএনসিএপি ব্যবহার করে একটি গবেষণায় গবেষকরা 56 টি বিভিন্ন প্রতিলিপি নিবন্ধিত করেছেন যা প্রতিলিপির কারণ, কোষ চক্র নিয়ন্ত্রক, বিপাকীয় এনজাইম এবং অনুমানমূলক প্রোটিনের সমরূপতা দেখিয়েছে। এর মধ্যে এফএএম193এ জিন অভিব্যক্তি 48 ঘন্টার জন্য ডাইহাইড্রোটেস্টোস্টেরনের উপস্থিতিতে নিয়ন্ত্রিত হয়। এন. সি. বি. আই-এর সি. বি. এল. এ. এস. টি ব্যবহার করে পাঁচটি কাঠামো পাওয়া গেছে যা কিছুটা এফ. এ. এম193এ-এর সাথে সংযুক্ত। কাঠামোগুলির মধ্যে কেবল দুটি চেইন এ, সিজোস্যাকারোমাইসেস পোম্বে থেকে আরএনএ পলিমারেজ আই এবং চেইন এ ট্রপোমায়োসিন পরীক্ষা করা হয়েছিল। উদীয়মান খামির স্যাকারোমাইসেস সেরেভিসিয়া থেকে উৎসেচকের পূর্ববর্তী কাঠামোর সাথে তুলনা শুরু সাইট নির্বাচন এবং ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর মিথস্ক্রিয়ায় জড়িত অঞ্চলগুলির মধ্যে পার্থক্য প্রকাশ করে। ট্রান্সক্রিপশন পদ্ধতির এই দিকগুলি এস. পম্পে এবং এস. সেরেভিসিয়ার মধ্যে পৃথক, তবে এস. পম্পে এবং মানুষের মধ্যে সংরক্ষিত। কাঠামোগত পার্থক্যের জন্য আপাতদৃষ্টিতে দায়ী অ্যামিনো অ্যাসিডের পরিবর্তনগুলি এস. পম্পে এবং মানুষের মধ্যেও সংরক্ষিত থাকে, যা পরামর্শ দেয় যে এস. পম্পের কাঠামো মানব উৎসেচকের জন্য একটি ভাল সারোগেট হতে পারে। predictprotein.org-এর মাধ্যমে পরীক্ষা করা এফএএম193এ-এর পূর্বাভাসকৃত গৌণ কাঠামো দেখায় যে 3/4-এরও বেশি অবশিষ্টাংশ তাদের পৃষ্ঠের 16 শতাংশেরও বেশি উন্মুক্ত করে। এই প্রোগ্রামটি আরও দেখায় যে এফএএম193এ প্রায় 1⁄2 আলফা হেলিকাল। আই. আর. আই. জি. আই. ও নামে একটি নতুন জিন রয়েছে যা পিএএক্স3-এফ. ও. এক্স. ও1 ফিউশন জিনের সাথে সহযোগিতা করে এবং শিশুদের মধ্যে রাবডোমিওসারকোমাজেনেসিসে অবদান রাখতে পারে। ন্যাশনাল সেন্টার ফর বায়োটেকনোলজি ইনফরমেশন বেসিক লোকাল অ্যালাইনমেন্ট সার্চ টুল ব্যবহার করে এই নতুন জিনটি এফএএম193এ-এর সমতুল্য, যা 53 শতাংশের সামগ্রিক সমরূপতা প্রকাশ করেছে। উপরন্তু, উভয় প্রোটিনের শেষ 76টি অ্যামিনো অ্যাসিডে (89 শতাংশ সমতুল্য) সর্বোচ্চ মিল রয়েছে। পরিমাণগত বৈশিষ্ট্য লোকাস পরিমাণগত বৈশিষ্ট্য লোকাসঃ সম্পর্কিত জিন অর্থোলগস প্রাইমেট, শিম্প এবং গিবন, মানুষের সাথে সম্পর্কিত অর্থোলগাস প্রোটিনের নিকটতম গোষ্ঠীর প্রতিনিধিত্ব করে (ই পরিসীমা = 0.0-0.0), এগুলি অন্যদের সাথে একাধিক ক্রম সারিবদ্ধকরণ (এম. এস. এ) তৈরি করতে ব্যবহৃত হয়েছিল। মানুষের নিকটতম ক্লেডের এম. এস. এ একই ডুপ্লিকেশন ইভেন্টের অধীনে পড়েছিল। এভিয়ান (জেব্রা ফিঞ্চ, মুরগি, টার্কি) এবং মাছ (জেব্রা মাছ, পাফারফিশ)। যে প্রাণীগুলি ডুপ্লিকেশন ইভেন্টের আগে এই প্রোটিন অর্জন করেছিল। এগুলি মানব জিনোমের বিরুদ্ধে ব্লাস্টিং দ্বারা পাওয়া গেছে। মানব জিনোমের বিরুদ্ধে বি. এল. এ. এস. টি. পি-র জন্য অনুসন্ধান করা আর. এন. এ প্রতিলিপিগুলি তাৎপর্যপূর্ণ কোনও ফলাফল দেয়নি। একইভাবে, দূরবর্তী সম্পর্কিত প্রাণীগুলিকে বি. এল. এ. এস. টি. পি ব্যবহার করে পাওয়া গেছে, তবে প্রোটিন সিকোয়েন্সের সাথে মিলেছে, শুধুমাত্র ছোট অংশগুলি এফ. এ. এম193এ-এর সাথে সম্পর্কযুক্ত। প্যারালগস সাপোর্ট ফর ওয়ান প্যারালগ, এফএএম193বি, এফএএম193এ-এর সি-টার্মিনাস প্রান্তের সমরূপতা দেখায়। এফ. এ. এম. 193বি-র দৈর্ঘ্য 2961 নট এবং এফ. এ. এম. 193এ-এর দৈর্ঘ্য 4710 এবং বায়োলজি ওয়ার্কবেঞ্চ ব্যবহার করে সারিবদ্ধ করা হলে-4490-এর কম স্কোর পায়। তথ্যসূত্র