OSER1
ক্রোমোজোম 20 ওপেন রিডিং ফ্রেম 111, বা C20orf111, হল একটি অনুমানমূলক প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে C20orf111 জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। সি20ওআরএফ111 পেরিট1 (পারক্সাইড ইন্ডুসিবল ট্রান্সক্রিপ্ট 1), এইচএসপিসি207 এবং dJ1183I21.1 নামেও পরিচিত। এটি মূলত ক্রোমোজোম 20-এর জিনোমিক সিকোয়েন্সিং ব্যবহার করে সনাক্ত করা হয়েছিল। ন্যাশনাল সেন্টার ফর বায়োটেকনোলজি ইনফরমেশন বা এনসিবিআই দেখায় যে এটি ক্রোমোজোম 20-এ q13.11-এ অবস্থিত, তবে ইউনিভার্সিটি অফ ক্যালিফোর্নিয়া-সান্তা ক্রুজ (ইউসিএসসি) ওয়েবসাইটের জিনোম ব্রাউজার দেখায় যে এটি q13.12 অবস্থানে এবং অ্যাডেনোসিন ডিঅ্যামিনেজ লোকাসের এক মিলিয়ন বেস জুটির মধ্যে রয়েছে। এটি হাইড্রোজেন পারক্সাইড ()-প্ররোচিত অ্যাপোপটোসিসের মধ্য দিয়ে যাওয়া কোষে অভিব্যক্তি বৃদ্ধি করতেও দেখা গেছে। C20orf111-এর অ্যামিনো অ্যাসিডের পরিমাণ বিশ্লেষণ করার পর, এটি সেরিন অবশিষ্টাংশে সমৃদ্ধ বলে জানা গেছে। জিন সি20ওআরএফ111 একটি বৈধ, প্রোটিন কোডিং জিন যা ইউসিএসসি জিনোম ব্রাউজার অনুসন্ধান করে q13.12-এ ক্রোমোজোম 20-এর মাইনাস স্ট্র্যান্ডে পাওয়া যায়, তবে এনসিবিআই-এর রেফসেক অনুসারে q13.11। C20orf111-এর কাছাকাছি কয়েকটি পরিচিত জিন তাদের পরিচিত কার্যকারিতা সহ নীচের বাক্সে দেওয়া হয়েছে। প্রতিলিপি সাধারণ বৈশিষ্ট্য জিনোমিক ডিএনএ দৈর্ঘ্যঃ 14,968 বেস জোড়া (বিপি) সর্বাধিক সাধারণ এমআরএনএ দৈর্ঘ্যঃ 4 এক্সনের সাথে 2,260 বিপি। এর 10টি স্প্লাইস আইসোফর্ম রয়েছে। 5 'অনুবাদ না করা অঞ্চল 252 বিপি দীর্ঘ। 3 'অনুবাদ না করা অঞ্চল 1,129 বিপি দীর্ঘ। প্রতিলিপি রূপগুলি 10টি স্প্লাইস আইসোফর্ম যা ভাল প্রোটিনগুলিকে এনকোড করে, মোট 8টি ভিন্ন আইসোফর্ম, যার মধ্যে 2টি সম্পূর্ণ আইসোফর্ম। নীচের চিত্রটি 10টি আইসোফর্ম দেখায় যা পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। এই 10টি স্প্লাইস আইসোফর্মের মধ্যে 8টির বিভিন্ন পেপটাইড দৈর্ঘ্য রয়েছে, তবে এই সমস্ত প্রোটিনগুলি কেবল অনুমানমূলক এবং তাদের উপর কোনও বিস্তৃত গবেষণা করা হয়নি। প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রণ পূর্বাভাসকৃত প্রবর্তক ক্রমের দিকে তাকালে, কোনও আরএনএ পলিমারেজ II বাঁধাই সাইট নেই, তবে টাটা-কম প্রবর্তকদের জন্য মূল প্রবর্তক উপাদানের জন্য একটি বাঁধাই সাইট রয়েছে। প্রবর্তকের এই একই অঞ্চলে, একটি টাটা-বাইন্ডিং ফ্যাক্টর ক্রমও রয়েছে, যা প্রতিলিপির জন্য আরএনএ পলিমারেজ II-এর অবস্থানে সহায়তা করে। প্রোটিনের সাধারণ বৈশিষ্ট্যগুলি অজানা ফাংশন 776 (ডিইউএফ 776)-এর একটি অত্যন্ত সংরক্ষিত ডোমেন ধারণ করে, যা পুরো প্রোটিনের 62 শতাংশ গঠন করে। আণবিক ওজন 31.8 কিলোডাল্টন আইসোইলেক্ট্রিক পয়েন্ট 8.57 একটি পারমাণবিক প্রোটিন ফাংশন হিসাবে পূর্বাভাস C20orf111 এর কার্যকারিতা বৈজ্ঞানিক সম্প্রদায় দ্বারা ভালভাবে বোঝা যায় না। এটিতে অজানা ফাংশনের একটি ডোমেন রয়েছে, ডিইউএফ 776, যার একটি বড় অংশ রয়েছে যা জেনোপাস ট্রপিকালাসের মাধ্যমে ভালভাবে সংরক্ষিত। এটি হাইড্রোজেন পারক্সাইড প্ররোচিত অ্যাপোপটোসিসের মধ্য দিয়ে যাওয়া ইঁদুরের কার্ডিওমায়োসাইটের অভিব্যক্তিতে বৃদ্ধিও দেখায়। মানুষের মধ্যে ই. এস. টি প্রোফাইলগুলি দেখার সময়, স্বাভাবিক টিস্যু (অ-ক্যান্সারযুক্ত), প্রতি মিলিয়নে 82টি প্রতিলিপির স্তরে প্রকাশ পায়। সি20ওআরএফ111 ইঁদুরের কার্ডিয়াক মায়োসাইটের অভিব্যক্তি বৃদ্ধি করতে দেখা গেছে যা |H |2 |O |2।-প্ররোচিত অ্যাপোপটোসিসের মধ্য দিয়ে যাচ্ছে, যা কোষের মৃত্যুতে একটি ভূমিকার পরামর্শ দেয়। মূত্রাশয়, সার্ভিকাল, মাথা এবং ঘাড়, নন-নিওপ্লাসিয়া, প্যানক্রিয়াটিক এবং প্রস্টেট ক্যান্সার কোষে এক্সপ্রেশন মাত্রা স্বাভাবিকের চেয়ে কম থাকে। মানব জিনোমে সি20ওআরএফ111 জিনের কোনও স্পষ্ট সমান্তরালতা নেই। যাইহোক, অন্যান্য জীবের মধ্যে এর অনেক অর্থোলগ রয়েছে এবং জেনোপাস ট্রপিকালিসের মতো জীবের মধ্যে এটি অত্যন্ত সংরক্ষিত এবং সি-টার্মিনাসের প্রোটো-অ্যানিম্যাল ট্রাইকোপ্ল্যাক্স অনুগামীদের মধ্যে আধা-সংরক্ষিত। নিম্নলিখিত টেবিলটি পাওয়া অর্থোলগের একটি নির্বাচিত সংখ্যা উপস্থাপন করে। সংরক্ষণ নীচের চিত্রটি অন্যান্য জীবের মধ্যে সি20ওআরএফ111 প্রোটিনের সংরক্ষণের তুলনায় একটি একাধিক ক্রম বিন্যাস। প্রোটিনটি মেরুদণ্ডী প্রাণীর মধ্যে ডিইউএফ 776 অঞ্চলে এবং ইউক্যারিওটের সি-টার্মিনাস-এও অত্যন্ত সংরক্ষিত থাকে। ExPASy-তে সরঞ্জামগুলি ব্যবহার করে C20orf111-এর জন্য অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তনের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। অবস্থান R81 এবং S82 এর মধ্যে প্রোটিনে প্রোপেপটাইড ক্লিভেজ সাইটের পূর্বাভাস। 30টি পূর্বাভাস দেওয়া সেরিন ফসফোরিলেশন সাইট 5টি পূর্বাভাস দেওয়া থ্রেওনিন ফসফোরিলেশন সাইট 3টি পূর্বাভাস দেওয়া টাইরোসিন ফসফোরিলেশন সাইট পূর্বাভাস দেওয়া গৌণ কাঠামো পিইএলই (প্রোটিন মাধ্যমিক কাঠামো পূর্বাভাস) সি20ওআরএফ111-এর গৌণ কাঠামোর পূর্বাভাস দিতে ব্যবহার করা হয়েছিল। β-স্ট্র্যান্ড বা α-হেলিক্স গৌণ কাঠামোর ক্ষেত্রে খুব কমই রয়েছে, তবে প্রোটিনের একটি বড় অংশ এলোমেলো কয়েল হিসাবে বিদ্যমান বলে মনে হয়। এটি ডানদিকে C20orf111 ছবির ছবিতে দেখানো হয়েছে। তথ্যসূত্র বাহ্যিক সংযোগ মানব প্রোটিন ক্রোমোজোম মানব জিনোম প্রকল্প