Cation diffusion facilitator
ক্যাটায়ন ডিফিউশন ফেসিলিটেটর (সিডিএফ) হল ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন যা ক্যাডমিয়াম, দস্তা এবং কোবাল্টের মতো ডাইভ্যালেন্ট ধাতব আয়নগুলির প্রতি কোষের সহনশীলতা প্রদান করে। এই প্রোটিনগুলিকে এফ্লাক্স পাম্প হিসাবে বিবেচনা করা হয় যা কোষ থেকে এই দ্বৈত ধাতব আয়নগুলি সরিয়ে দেয়। যাইহোক, সিডিএফ সুপারফ্যামিলির কিছু সদস্য আয়ন গ্রহণের সাথে জড়িত। সিডিএফ পরিবারের সকল সদস্যের কাছে চারটি এন-টার্মিনাল স্প্যানারে সবচেয়ে শক্তিশালী সংরক্ষণ সহ ছয়টি অনুমানমূলক ট্রান্সমেম্ব্রেন স্প্যানার রয়েছে। ক্যাটায়ন ডিফিউশন ফেসিলিটেটর (সিডিএফ) সুপারফ্যামিলিতে নিম্নলিখিত পরিবারগুলি অন্তর্ভুক্ত রয়েছেঃ 1.A.52-দ্য সিএ2 + রিলিজ-অ্যাক্টিভেটেড সিএ2 + (সিআরএসি) চ্যানেল (সিআরএসি-সি) পরিবার 2. এ. 4-দ্য ক্যাটায়ন ডিফিউশন ফেসিলিটেটর (সিডিএফ) পরিবার 2.A.19-দ্য সিএ2 +: ক্যাটায়ন অ্যান্টিপোর্টার (সিএসিএ) পরিবার 2.A.103-দ্য ব্যাকটেরিয়াল মুরেইন প্রিকার্সার এক্সপোর্টার (এমপিই) পরিবার ক্যাটায়ন ডিফিউশন ফেসিলিটেটর (সিডিএফ) পরিবার সিডিএফ পরিবার (টিসি #2. এ. 4) একটি সর্বব্যাপী পরিবার, যার সদস্যরা ব্যাকটেরিয়া, আর্কিয়া এবং ইউকেতে পাওয়া যায়। এগুলি ক্যাডমিয়াম, দস্তা, কোবাল্ট, নিকেল, তামা এবং মার্কুরিক আয়নগুলির মতো ভারী ধাতব আয়নগুলি পরিবহন করে। 9টি স্তন্যপায়ী প্যারালগ রয়েছে, ZnT1-8 এবং 10। এই পরিবারের বেশিরভাগ প্রোটিনের ছয়টি ট্রান্সমেম্ব্রেন হেলিস রয়েছে, তবে এস. সেরেভিসিয়ার এমএসসি2 এবং এইচ. সেপিয়েন্সের জেডএনটি5 এবং এইচজেডটিএল1-এর যথাক্রমে 15 এবং 12 টি পূর্বাভাসযুক্ত টিএমএস রয়েছে। এই প্রোটিনগুলি একটি অস্বাভাবিক মাত্রার ক্রম বিচ্যুতি এবং আকারের বৈচিত্র্য (300-750 অবশিষ্টাংশ) প্রদর্শন করে। ইউক্যারিওটিক প্রোটিন কোষের স্থানীয়করণে পার্থক্য প্রদর্শন করে। কেউ কেউ সাইটোপ্লাজম থেকে বিভিন্ন ইন্ট্রাসেলুলার ইউক্যারিওটিক অর্গানেলস (জেডএনটি2-7)-এ ভারী ধাতুর উত্তোলনকে অনুঘটক করে, অন্যরা (জেডএনটি1) প্লাজমা ঝিল্লি জুড়ে সাইটোপ্লাজম থেকে বহির্মুখী মাধ্যমে বর্জ্যকে অনুঘটক করে। এইভাবে, কিছু কিছু প্লাজমা ঝিল্লিতে পাওয়া যায়, অন্যগুলি উদ্ভিদ এবং খামিরের ভ্যাকুয়েল এবং প্রাণীদের গলগির মতো অর্গানেলার ঝিল্লিতে পাওয়া যায়। তারা ক্যাটায়নকে অনুঘটক করেঃ প্রোটন অ্যান্টিপোর্ট, ডাইমারের মধ্যে প্রতিটি মনোমারের ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেনের মধ্যে একটি একক প্রয়োজনীয় দস্তা-বাঁধাই সাইট রয়েছে এবং সাইটোপ্লাজমিক সি-টার্মিনাল অঞ্চলে একটি দ্বিপক্ষীয় দস্তা-সংবেদনশীল এবং বাঁধাই সাইট রয়েছে। সি. ডি. এফ পরিবারের অন্তর্গত প্রোটিনের একটি প্রতিনিধি তালিকা ট্রান্সপোর্টার ক্লাসিফিকেশন ডাটাবেসে পাওয়া যাবে। ফাইলোজেনি প্রোক্যারিওটিক এবং ইউক্যারিওটিক প্রোটিন পৃথকভাবে গুচ্ছবদ্ধ হয় তবে একই প্রক্রিয়া দ্বারা একই মেরুকরণের সাথে কাজ করতে পারে। এই প্রোটিনগুলি গৌণ বাহক যা প্রোটন মোটিভ ফোর্স (পিএমএফ) ব্যবহার করে এবং এইচ + অ্যান্টিপোর্ট (ধাতব প্রবাহের জন্য) দ্বারা কাজ করে। একটি সদস্য, ব্যাসিলাস সাবটিলিসের সিজেডসিডি (টিসি #2.A.4.1.3), ট্রান্সমেম্ব্রেন পিএইচ গ্রেডিয়েন্ট দ্বারা সক্রিয় একটি বৈদ্যুতিন নিরপেক্ষ প্রক্রিয়ায় দুটি মনোভালেন্ট ক্যাটায়ন (কে + এবং এইচ +)-এর জন্য ডাইভ্যালেন্ট ক্যাটায়ন (জেডএন2 + বা সিডি2 +) বিনিময় করতে দেখা গেছে। আরেকটি, ই. কোলাই-এর জিটিবি (টিসি #2.A.4.1.4), প্রোটোলিপোসোমে পুনর্গঠন করা হয়েছে এবং গতিবিদ্যার মাধ্যমে অধ্যয়ন করা হয়েছে। এটি 1:1 স্টোইকিওমেট্রি সহ সাধারণ এমই2 +: এইচ + অ্যান্টিপোর্ট দ্বারা কাজ করে বলে মনে হয়। মন্টানিনি এবং অন্যান্যরা। (2007) সিডিএফ পরিবারের সদস্যদের একটি ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণ পরিচালনা করেছেন। তাদের বিশ্লেষণে তিনটি বড় এবং দুটি ছোট ফাইলোজেনেটিক গ্রুপ প্রকাশিত হয়েছে। তারা পরামর্শ দেয় যে তিনটি প্রধান গোষ্ঠী ধাতব আয়ন নির্দিষ্টতা অনুসারে পৃথক করা হয়েছেঃ Mn2 + Fe2 + এবং Zn2 + পাশাপাশি অন্যান্য ধাতব আয়ন Zn2 + এবং অন্যান্য ধাতু, তবে লোহা নয়। ই. কোলাই-এর ওয়াই. আই. পি-এর এক্স-রে কাঠামো একটি হোমোডিমারকে উপস্থাপন করে। Coudrey এবং অন্যান্য। (2013) ক্রায়োইলেক্ট্রন মাইক্রোস্কোপি ব্যবহার করে Zn2 + এর অনুপস্থিতিতে লিপিড দ্বিস্তরের মধ্যে শেওয়ানেলা ওয়ানিডেনসিস থেকে একটি YiiP হোমোলগের 13 Å রেজোলিউশন কাঠামো নির্ধারণ করা হয়। Zn2 +-এর উপস্থিতিতে এক্স-রে কাঠামো থেকে শুরু করে, তারা একটি মডেল তৈরি করতে আণবিক গতিশীল নমনীয় ফিটিং ব্যবহার করেছিল। কাঠামোগুলির তুলনা একটি গঠনগত পরিবর্তনের পরামর্শ দেয় যার মধ্যে এম3-এম6 হেলিক্স জুটির তুলনায় একটি ট্রান্সমেম্ব্রেন, চার-হেলিক্স বান্ডিল (এম1, এম2, এম4 এবং এম5) এর পিভোটিং জড়িত। যদিও এক্স-রে মডেলে পরিবহন সাইটগুলির অ্যাক্সেসযোগ্যতা ইঙ্গিত দেয় যে এটি একটি বাহ্যিক-মুখী অবস্থার প্রতিনিধিত্ব করে, তাদের মডেলটি একটি অভ্যন্তরীণ-মুখী অবস্থার সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ ছিল, যা পরামর্শ দেয় যে রূপান্তরমূলক পরিবর্তন পরিবহনের জন্য বিকল্প অ্যাক্সেস ব্যবস্থার সাথে প্রাসঙ্গিক। তারা অনুমান করেছিলেন যে ডাইমারটি ট্রান্সমেম্ব্রেন হেলিসের পুনর্বিন্যাসের সমন্বয় করতে পারে। এফ্লাক্স দ্বারা ধাতব সহনশীলতা/প্রতিরোধের সাথে জড়িত, বেশিরভাগ সি. ডি. এফ প্রোটিন একটি ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন (টি. এম. ডি) এবং একটি সি-টার্মিনাল ডোমেন (সি. টি. ডি) সমন্বিত একটি দ্বি-মডুলার স্থাপত্য ভাগ করে নেয় যা সাইটোপ্লাজমে প্রসারিত হয়। সামুদ্রিক ব্যাকটেরিয়া থেকে একটি জেডএন2 + এবং সিডি2 + সিডিএফ পরিবাহক, মারিকাউলিস মারিস, যার সিটিডি নেই, সিডিএফ-এর একটি নতুন, সিটিডি-অনুপস্থিত উপপরিবারের সদস্য। পরিবহন প্রতিক্রিয়া সি. ডি. এফ পরিবারের সদস্যদের জন্য সাধারণ পরিবহন প্রতিক্রিয়া হলঃ এম. ই. 2 + (ইন) এইচ + (আউট) ± কে + (আউট) → এম. ই. 2 + (আউট) এইচ + (ইন) ± কে + (ইন)। আরও দেখুন ইন্টিগ্রাল মেমব্রেন প্রোটিন আয়ন চ্যানেল ট্রান্সপোর্টার ক্লাসিফিকেশন ডেটাবেস প্রোটিন সুপারফ্যামিলি প্রোটিন পরিবার রেফারেন্স সেল বায়োলজি প্রোটিন পরিবার মেমব্রেন প্রোটিন ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন ট্রান্সমেম্ব্রেন ট্রান্সপোর্টার ইন্টিগ্রাল মেমব্রেন প্রোটিন