Systematic Protein Investigative Research Environment
সিস্টেমেটিক প্রোটিন ইনভেস্টিগেটিভ রিসার্চ এনভায়রনমেন্ট (এসপিআইআরই) প্রোটিন এবং পেপটাইড সনাক্ত করার জন্য ওয়েব-ভিত্তিক পরীক্ষা-নিরীক্ষা-নির্দিষ্ট মাস স্পেকট্রোমেট্রি (এমএস) প্রোটিওমিক্স বিশ্লেষণ এবং লেবেল-মুক্ত অভিব্যক্তি এবং আপেক্ষিক অভিব্যক্তি বিশ্লেষণ প্রদান করে। স্পায়ার একটি ওয়েব-ইন্টারফেস প্রদান করে এবং ইন্টারেক্টিভ এবং সহজ উভয় তথ্য বিন্যাসে ফলাফল তৈরি করে। পদ্ধতিবিদ্যা স্পায়ারের বিশ্লেষণগুলি একটি পরীক্ষামূলক নকশার উপর ভিত্তি করে যা মিথ্যা আবিষ্কারের হার এবং স্থানীয় মিথ্যা আবিষ্কারের হার (এফডিআর, এলএফডিআর) তৈরি করে এবং মুক্ত-উৎস অনুসন্ধান এবং তথ্য বিশ্লেষণ পদ্ধতিগুলিকে সংহত করে। এক্স-এর সংমিশ্রণে! ট্যান্ডেম, ওএমএসএসএ এবং স্পেকট্রাস্ট স্পায়ার স্কোরিং এবং একক সার্চ ইঞ্জিনের বর্তমান সংমিশ্রণের তুলনায় প্রোটিন আইডি (50-90%) বৃদ্ধি করতে পারে এবং সঠিক বহুমুখী ত্রুটি অনুমানও প্রদান করতে পারে। স্পায়ার তার বিশ্লেষণের ফলাফলগুলিকে প্রোটিন ফাংশন, পথ এবং মডেল জীব থেকে প্রোটিন অভিব্যক্তি সম্পর্কিত তথ্যের সাথে একত্রিত করে। অন্যান্য তথ্যের সাথে সংহতকরণ স্পায়ার তার মাল্টি-অমিকস প্রোফাইলিং এক্সপ্রেশন ডেটাবেস (এমওপিইডি)-এর মাধ্যমে সর্বজনীনভাবে উপলব্ধ প্রোটিওমিক্স ডেটার সাথে ফলাফলগুলিকে সংযুক্ত করে। স্পায়ার ব্যবহারকারী-সরবরাহকৃত প্রোটিন আইডি এবং এক্সপ্রেশন ডেটার জন্য বিশ্লেষণ এবং টীকা প্রদান করতে পারে। ব্যবহারকারীরা ডেটা আপলোড করতে পারেন (যথাযথভাবে প্রমিত) বা ডেটা ফাইলগুলিতে মেইল করতে পারেন। আরও পড়ার তথ্যসূত্র গণ স্পেকট্রোমেট্রি সফ্টওয়্যার প্রোটিওমিক্স জৈবিক ডাটাবেস