C6orf58
C6orf58 হল একটি মানব জিন যা ক্রোমোজোম 6-এর লোকাস 6q22.33-এ অবস্থিত এবং ইউ. পি. এফ. 0762-এর জন্য এনকোড করে, একটি প্রোটিন যা পরবর্তীকালে একটি সিগন্যাল পেপটাইড ভেঙে যাওয়ার পরে নিঃসৃত হয়। ডি. ইউ. এফ. 781, যা ইউ. পি. এফ. 0762-এর একক শনাক্তযোগ্য ক্ষেত্র, জেব্রাফিশের একটি অর্থোলোগাস প্রোটিনে লিভারের বিকাশের সাথে যুক্ত। মানব ইউ. পি. এফ. 0762-এর কার্যকারিতা এখনও ভালভাবে চিহ্নিত করা হয়নি। যদিও C6orf58-এর 3টি স্প্লাইস ভ্যারিয়েন্ট রয়েছে, শুধুমাত্র একটি ভাল প্রোটিনকে এনকোড করে। মানুষের মধ্যে, C6orf58 প্রকাশিত ক্রম ট্যাগগুলি প্রাথমিকভাবে স্বরযন্ত্র এবং শ্বাসনালীতে সনাক্ত করা হয়েছিল। প্রতিলিপিগুলি শুধুমাত্র বিকাশের প্রাপ্তবয়স্ক পর্যায়ে সনাক্ত করা হয়েছিল। পরীক্ষামূলক মাইক্রো অ্যারে ডেটা, তবে, সি6ওআরএফ58 অভিব্যক্তির অতিরিক্ত অঞ্চলগুলি প্রকাশ করে, যেমন লালা গ্রন্থি, থাইরয়েড এবং ছোট অন্ত্রে। আর্সেনিক অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করতে পারে কারণ এটি C6orf58 প্রবর্তকের মিথাইলেশন বাড়ায়। সি6ওআরএফ58-এর 500 কিলোবেসের মধ্যে জিন নেবারহুড জিনের মধ্যে রয়েছে আরএসপিও3, সি6ওআরএফ174, কেআইএএ0408, আরপিএল17পি23, ইসিএইচডিসি1, আরপিএল5পি18, ওয়াইডব্লিউএইচএজেডপি4, এলওসি100420743, এলওসি100421513, এমআরপিএস17পি5 এবং থিমিস। সমতাত্ত্বিক অনুক্রমের একটি নির্বাচিত সেট নীচে তালিকাভুক্ত করা হয়েছে, মানুষের রেফারেন্স ক্রমের তুলনায় ক্রম পরিচয় গণনা করা হচ্ছে। প্রোটিন প্রোপার্টি মাস স্পেকট্রোমেট্রি দেখিয়েছে যে ইউ. পি. এফ. 0762-এর পর্যবেক্ষিত আণবিক ওজন হল 32 কে. ডি. এ। সিগন্যাল পেপটাইডের বিভাজন হিসাব করার পরেও কেন পর্যবেক্ষিত আণবিক ওজন পূর্বাভাসের চেয়ে কম তা স্পষ্ট নয়। এন-লিঙ্কযুক্ত গ্লাইকোসাইলেশন স্থানে চিনির সংযুক্তি আণবিক ওজনও বাড়িয়ে দেবে। হোমোলজি ইউ. পি. এফ. 0762 দেখায় যে প্রাইমেটদের মধ্যে উচ্চ সমরূপতা রয়েছে এবং অর্থোলোগাস প্রোটিনগুলি ট্রাইকোপ্ল্যাক্স অ্যাডেরেন্স পর্যন্ত খুঁজে পাওয়া যায়। নীচের প্রোটিনের তালিকাটি ইউ. পি. এফ. 0762 অর্থোলগের একটি বিস্তৃত তালিকা নয়। প্রশ্ন হিসাবে রেফারেন্স হিউম্যান সিকোয়েন্সের সাথে ব্লাস্ট ব্যবহার করে সিকোয়েন্স আইডেন্টিটি এবং মিল নির্ধারণ করা হয়েছিল। সংরক্ষিত ডোমেন DUF781 হল প্রোটিনের একক ডোমেন এবং প্রোটিনের 330টি অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে 318টি জুড়ে রয়েছে। জেব্রাফিশের যকৃতের বিকাশের সঙ্গে ডিইউএফ781-কে যুক্ত করা হয়েছে। অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তনগুলি পর্যবেক্ষণ করা হয়েছে অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তনগুলির মধ্যে রয়েছে অ্যামিনো অ্যাসিড 69-এ এন-লিঙ্কযুক্ত গ্লাইকোসাইলেশন। একটি সংকেত পেপটাইড, যা প্রোটিনকে নিঃসরণের জন্য এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলামে পরিচালিত করার পূর্বাভাস দেওয়া হয়, পেপটাইড অনুক্রমের প্রথম 20টি অ্যামিনো অ্যাসিড থেকে বিচ্ছিন্ন করা হয়। হেপাটোসেলুলার কার্সিনোমাতে সনাক্ত করা মিসসেন্স মিউটেশন এস18এফ সিগন্যাল পেপটাইডের পূর্বাভাসকৃত ক্লিভেজ স্কোরকে উল্লেখযোগ্যভাবে হ্রাস করে। হিউম্যান সি6ওআরএফ58 একটি ইস্ট টু-হাইব্রিড স্ক্রিনের মাধ্যমে ভ্যাকসিনিয়া ভাইরাস দ্বারা এনকোড করা রাইবোনিউক্লিয়টাইড রিডাক্টেজ এনজাইমের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে বলে জানা গেছে। প্যাথলজি পরিসংখ্যানগত বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে C6orf58 অগ্ন্যাশয়ের ক্যান্সার থেকে বেঁচে থাকার সময়ের সাথে যুক্ত। উপরন্তু, লিভার ক্যান্সার কোষে অ্যামিনো অ্যাসিড 18-এ একটি মিসসেন্স মিউটেশন লক্ষ্য করা গেছে যেখানে সেরিন ফেনিল্যালানাইনে পরিণত হয়। একটি সংকেত পেপটাইডের জন্য পরিবর্তিত প্রোটিন ক্রমের বিশ্লেষণ দেখায় যে নিয়মিত অ্যামিনো অ্যাসিড 20-এ বিভাজনশীলতা হারিয়ে যায়। লিভারের বিকাশের সঙ্গে ডি. ইউ. এফ. 781-এর সম্পর্ক এবং লিভার ক্যান্সারের সঙ্গে মিসসেন্স মিউটেশনের সম্পর্ক একটি সম্পর্ক যা এখনও তদন্ত করা বাকি। তথ্যসূত্র বাইরের লিঙ্ক