TMEM212
ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন 212 হল একটি প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে টি. এম. ই. এম. 212 জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। প্রোটিনটি 5টি ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেইন নিয়ে গঠিত এবং প্লাজমা মেমব্রেন এবং এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলামে অবস্থান করে। টি. এম. ই. এম. 212-এর মেরুদণ্ডী প্রাণীর মধ্যে অর্থোলগ রয়েছে তবে অমেরুদণ্ডী প্রাণীর মধ্যে নয়। টি. এম. ই. এম. 212 আফ্রিকান আমেরিকানদের মধ্যে বিক্ষিপ্ত পার্কিনসন রোগ, মুখের প্রক্রিয়াকরণ এবং অ্যাডিপোসিটির সাথে যুক্ত। টি. এম. ই. এম. 212 জিনটি ক্রোমোজোম 3-এ অবস্থান <আই. ডি. 1>-এ থাকে এবং প্লাস স্ট্র্যান্ডে অবস্থিত। জিনটি অবস্থান 171,561,140 থেকে 171,577,108 পর্যন্ত এনকোড করা হয়। এর দীর্ঘতম আইসোফর্মটি 4টি এক্সন, 1881 নিউক্লিওটাইডের একটি কোডিং ক্রম এবং একটি আপস্ট্রিম ইন-ফ্রেম স্টপ কোডন নিয়ে গঠিত। কোডিং সিকোয়েন্স হল টি. এম. ই. এম. 212 জিনের <আই. ডি1> বেস। জিনের আশেপাশের অন্যান্য জিনের মধ্যে রয়েছেঃ পিএলডি1, আরএনইউ 6-348 পি এবং এফএনডিসি3বি। প্রতিলিপি TMEM212 জিনের 2টি আইসোফর্ম রয়েছে। টি. এম. ই. এম. 212-এর এম. আর. এন. এ স্প্লাইস রূপগুলি শেষ এক্সনে পরিবর্তিত হয়। রূপগুলির মধ্যে একটি শেষ এক্সনের অংশকে বিভক্ত করেছে-এটি 537 টি নিউক্লিওটাইডকে খাটো করে তুলেছে। এই আইসোফ্রমের 1343টি নিউক্লিওটাইডের একটি এম. আর. এন. এ ক্রম রয়েছে। পরবর্তী রূপটি এনসিবিআই-তে স্বীকৃত হয়নি। টি. এম. ই. এম. 212 প্রোটিনের 5টি ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চল রয়েছে, যা এটিকে একটি ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন করে তোলে। 5টি ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চল মূলত অ-মেরু অ্যামিনো অ্যাসিড। তবে, ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চলের 2টিতে একটি মেরু, চার্জযুক্ত অ্যামিনো অ্যাসিড থাকে। প্রোটিনটি 194টি অ্যামিনো অ্যাসিড দীর্ঘ এবং এর আণবিক ওজন 21kDa। আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দুটি প্রায় 8 পিএইচ-এ থাকে। টি. এম. ই. এম. 212-এর অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রমে কোনও অভ্যন্তরীণ পুনরাবৃত্তি নেই। উপরন্তু, সমস্ত অ্যামিনো অ্যাসিড স্বাভাবিক প্রাচুর্যে থাকে। মানব টি. এম. ই. এম. 212 টেবিল 1-এ প্রদর্শিত হিসাবে তার অর্থোলগের অনুরূপ আণবিক ওজন এবং আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দু প্রদর্শন করে। সারণি 1: মানুষ এবং অর্থোলগে টি. এম. ই. এম. 212 প্রোটিনের বৈশিষ্ট্য মাধ্যমিক এবং তৃতীয় কাঠামো ফাইয়ার 2 এবং আলি 2 ডি ভবিষ্যদ্বাণী করে যে টি. এম. ই. এম. 212-এর আলফা হেলিসেস সমৃদ্ধ একটি গৌণ কাঠামো রয়েছে, বিশেষ করে ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চলে। আলফা হেলিসগুলি স্তন্যপায়ী থেকে সরীসৃপ পর্যন্ত অর্থোলগে সংরক্ষিত ছিল। উপরন্তু, ডায়ানা ভবিষ্যদ্বাণী করে যে TMEM212 6টি সিস্টিন অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে 3টি ডাইসালফাইড বন্ধন নিয়ে গঠিতঃ C46-C88, C105-C154, এবং C135-C16। তৃতীয় কাঠামোর ঝিল্লির মধ্যে 5টি অঞ্চল রয়েছে। জিন লেভেল রেগুলেশন প্রোমোটার জেনোম্যাটিক্সের মতে, টি. এম. ই. এম. 212-এর 3 জন সম্ভাব্য প্রোমোটার রয়েছে। যাইহোক, টি. এম. ই. এম. 212-এর সবচেয়ে সম্ভাব্য প্রবর্তক সরাসরি টি. এম. ই. এম. 212-এর জিনের উজানে রয়েছে এবং এটি 1654 বেস জোড়া (জি. এক্স. পি. 277729)। অভিব্যক্তি টি. এম. ই. এম. 212 আর. এন. এ বেশিরভাগ টিস্যু প্রকারের (জি. ডি. এস. 1096) মধ্যে নিচু এবং সর্বব্যাপীভাবে প্রকাশ করা হয়। টি. এম. ই. এম. 212 ডিম্বাশয়, মস্তিষ্ক, ফুসফুস, হৃদয়, কিডনি, অণ্ডকোষগুলিতে সামান্য উচ্চতর স্তরে প্রকাশিত হয়। টি. এম. ই. এম. 212 মস্তিষ্কের নির্দিষ্ট অংশে প্রকাশ করা হয়েছিল যার মধ্যে রয়েছে পনস এবং ট্রাইজেমিনাল গ্যাংলিয়ন। মাঝারি অভিব্যক্তি সহ অন্যান্য টিস্যুগুলির মধ্যে অ্যাড্রিনাল কর্টেক্স এবং অ্যাপেন্ডিক্স অন্তর্ভুক্ত ছিল। সমস্ত উপলব্ধ আর. এন. এ-অনুক্রমের তথ্য দেখায় যে টি. এম. ই. এম. 212 ফুসফুসে পাওয়া যায়। প্রতিলিপি স্তর নিয়ন্ত্রণ 5 'অ-অনুবাদিত অঞ্চলটি 35টি বেস জোড়া দীর্ঘ। 3 'অনুবাদহীন অঞ্চলটি দৈর্ঘ্যে 1221 বেস জোড়া এবং বেস 661 থেকে 1881 পর্যন্ত অবস্থিত। 5 'ইউটিআর এবং 3' ইউটিআর-এর জন্য সর্বনিম্ন শক্তি কাঠামোর পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। স্বল্প দৈর্ঘ্যের কারণে, 5 'ইউটিআর-এ 1টি স্টেম-লুপ থাকার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। 3 'ইউটিআর-এ 17টি স্টেম-লুপ থাকবে বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। প্রোটিন স্তর নিয়ন্ত্রণ পরিবর্তন এটি পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে যে টি. এম. ই. এম. 212-এর দুটি সালফেশন সাইট এবং একটি ফসফোরাইলেশন সাইট রয়েছে। অ্যামিনো অ্যাসিড 23 এবং 24 এর মধ্যে একটি সম্ভাব্য ক্লিভেজ সিগন্যাল পেপটাইড রয়েছে। ফসফোরিলেশন সাইট এবং ক্লিভেজ সিগন্যাল পেপটাইডের উপস্থিতি অর্থোলোগের মধ্যে সাধারণ। উপকোষীয় স্থানীয়করণ প্রাথমিক উপকোষীয় অবস্থানগুলির মধ্যে রয়েছে প্লাজমা ঝিল্লি এবং এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলাম। টি. এম. ই. এম. 212-এর উপকোষীয় অবস্থান অর্থোলগে সংরক্ষিত। টি. এম. ই. এম. 212 অ্যান্টিবডিগুলির ইমিউনোফ্লোরেসেন্ট স্টেনিং দেখায় যে টি. এম. ই. এম. 212 নিউক্লিয়াসে উপস্থিত রয়েছে, তবে কারণটি অজানা রয়ে গেছে। মানুষের মধ্যে বেশিরভাগ প্রোটিনের তুলনায় টি. এম. ই. এম. 212 কম পরিমাণে পাওয়া যায়। বিবর্তন প্যারালগ টিএমইএম212-এর একটি পরিচিত প্যারালগ রয়েছেঃ মেমব্রেন-স্প্যানিং 4 ডোমেন এ7 (এমএস4এ7)। জিনটি ক্রোমোজোম 11-এ 11q12.2-এ অবস্থিত। এমএস4এ7 সম্ভবত টিএমইএম212 435-475 মিলিয়ন বছর আগে থেকে বিবর্তিত হয়েছে। এটি ডানদিকে দেখানো হয়েছে যেখানে বিভিন্ন প্রোটিনের বিচ্যুতির হারের তুলনা করা হয়েছে। হোমো সেপিয়েন্সের অর্থোলগস টি. এম. ই. এম. 212 অত্যন্ত সংরক্ষিত। এটি মেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে পাওয়া যায় কিন্তু অমেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে পাওয়া যায় না এবং স্তন্যপায়ী প্রাণী, পাখি, সরীসৃপ, উভচর প্রাণী এবং মাছ সহ অনেক অর্থোলগ রয়েছে। নীচের সারণি 2-এ স্তন্যপায়ী প্রাণী, সরীসৃপ, পাখি, উভচর প্রাণী এবং মাছের মধ্যে টি. এম. ই. এম. 212-এর অর্থোলগ দেখানো হয়েছে। ডানদিকে একাধিক ক্রম বিন্যাসে প্রদর্শিত হিসাবে, স্তন্যপায়ী প্রাণী এবং সরীসৃপের মতো কঠোর অর্থোলগের অত্যন্ত সংরক্ষিত অঞ্চল রয়েছে। বেশিরভাগ সংরক্ষিত এলাকা পতিত হয়েছে যেখানে ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চলগুলি স্থানীয়। সাইটোক্রোম সি এবং ফাইব্রিনোজেন আলফার রেফারেন্স সিকোয়েন্সের তুলনায় টি. এম. ই. এম. 212 মাঝারিভাবে দ্রুত বিকশিত হচ্ছে। টি. এম. ই. এম. 212, এম. এস. 4এ7, সাইটোক্রোম সি এবং ফাইব্রিনোজেন আলফার বিচ্যুতির হারের তুলনা করার সময় এটি ডানদিকে দেখানো হয়। এম. আই. এ = লক্ষ লক্ষ বছর আগে আন্তঃক্রিয়াশীল প্রোটিন তিনটি প্রোটিন টি. এম. ই. এম. 212-এর সাথে সম্ভাব্য মিথস্ক্রিয়া প্রকাশ করেছেঃ টি. এম. ই. এম. 45এ, জিপিআর137সি, এবং এইচ. এন. আর. এন. পি. এল। এই প্রোটিনগুলি সহ-অভিব্যক্তি বা অ্যাফিনিটি ক্যাপচার-আর. এন. এ-র মাধ্যমে পরীক্ষামূলকভাবে চিহ্নিত করা হয়েছিল। টেক্সট মাইনিং ব্যবহার করেও তাদের চিহ্নিত করা হয়েছিল। টি. এম. ই. এম. 212-এর মতো টি. এম. ই. এম. 45এ এবং জিপিআর137-ও প্লাজমা ঝিল্লিতে পাওয়া যায়, যা এই মিথস্ক্রিয়াকে সম্ভাব্য করে তোলে। টেবিল 3: যে প্রোটিনগুলি টি. এম. ই. এম. 212-এর সঙ্গে মিথস্ক্রিয়া করে ক্লিনিকাল তাৎপর্য টি. এম. ই. এম. 212 আফ্রিকান আমেরিকানদের মধ্যে চর্বি, মুখের প্রক্রিয়াকরণ এবং বিক্ষিপ্ত পার্কিনসন রোগের সাথে যুক্ত হতে পারে। আফ্রিকান আমেরিকানদের মধ্যে টি. এম. ই. এম. 212 (এম. আর. এন. এ বা প্রোটিন) বৃদ্ধি এবং উচ্চ বি. এম. আই একটি যোগসূত্র দেখিয়েছে কারণ টি. এম. ই. এম. 212-এর কাছাকাছি একটি লোকাসে এস. এন. পি-গুলি বর্ধিত অ্যাডিপসিটির সাথে যুক্ত হয়েছে। উপরন্তু, জিন টি. এম. ই. এম. 212 মুখের প্রক্রিয়াকরণের সাথেও জড়িত থাকতে পারে। মুখের প্রক্রিয়াকরণ জিনগতভাবে নিয়ন্ত্রিত হয়, এবং মুখের অভিব্যক্তির প্রতিক্রিয়ায়, টি. এম. ই. এম. 212-এ পাওয়া একটি সাধারণ এস. এন. পি মস্তিষ্কের ডান ফিউসিফর্ম গাইরাস এলাকা সক্রিয় করে, যা মুখের প্রক্রিয়াকরণের জন্য গুরুত্বপূর্ণ। এটি বিশেষভাবে 3q26.31-এ ঘটেছিল। এসএনপি হল 12485367 নম্বর। সি হোমোজাইগোটের তুলনায় জি অ্যালে আক্রান্ত ব্যক্তিদের সক্রিয়তা বেশি ছিল। টি. এম. ই. এম. 212 পার্কিনসন রোগের সঙ্গেও যুক্ত হতে পারে। টি. এম. ই. এম. 212 জিনের এস. এন. পি. আর. এস. 2270568 (ক্রোমোজোম 3 অবস্থান 172048861)-এর পরিবর্তনগুলি বেস টি-কে সি-তে পরিবর্তন করার সাথে সম্পর্কিত ছিল এবং স্পোরাডিক পার্কিনসন রোগের ঘটনা বৃদ্ধি পেয়েছিল। তথ্যসূত্র