Secondary chromosome
ক্রোমিড, পূর্বে (এবং কম সুনির্দিষ্টভাবে) গৌণ ক্রোমোজোম, ব্যাকটেরিয়ার প্রতিলিপির একটি শ্রেণী (ডিএনএ অণুর প্রতিলিপি)। এই প্রতিলিপিগুলিকে "ক্রোমিড" বলা হয় কারণ এগুলির ক্রোমোজোম এবং প্লাজমিড উভয়েরই বৈশিষ্ট্য রয়েছে। প্রথম দিকে, মনে করা হয়েছিল যে সমস্ত মূল জিন ব্যাকটেরিয়ার প্রধান ক্রোমোসোমে পাওয়া যেতে পারে। যাইহোক, 1989 সালে প্রধান ক্রোমোজোমের বাইরে মূল জিন ধারণকারী একটি প্রতিলিপি (বর্তমানে ক্রোমিড নামে পরিচিত) আবিষ্কৃত হয়। এই মূল জিনগুলি ক্রোমাইডকে জীবের জন্য অপরিহার্য করে তোলে। ক্রোমাইডগুলি বড় প্রতিলিপি, যদিও প্রধান ক্রোমোজোমের মতো বড় নয়। যাইহোক, ক্রোমাইডগুলি প্রায় সবসময় একটি প্লাজমিড (বা মেগাপ্লাজমিড) এর চেয়ে বড় হয়। ক্রোমাইডগুলি ক্রোমোজোমের অনেক জিনোমিক স্বাক্ষর ভাগ করে নেয়, যার মধ্যে তাদের জিসি-বিষয়বস্তু এবং তাদের কোডন ব্যবহারের পক্ষপাত রয়েছে। অন্যদিকে, ক্রোমিডগুলি ক্রোমোজোমের প্রতিলিপি ব্যবস্থা ভাগ করে না। পরিবর্তে, তারা প্লাজমিডের প্রতিলিপি ব্যবস্থা ব্যবহার করে। 2009 সালের মধ্যে ক্রমানুসারে 10 শতাংশ ব্যাকটেরিয়া প্রজাতিতে ক্রোমাইড উপস্থিত রয়েছে। একটি প্রধান ক্রোমোজোম এবং এক বা একাধিক ক্রোমাইডের (এবং/অথবা মেগাপ্লাজমিড) মধ্যে বিভক্ত ব্যাকটেরিয়াল জিনোমগুলিকে বিভক্ত বা মাল্টিপার্টাইট জিনোম বলা হয়। বেশিরভাগ ক্রোমাইড-এনকোডিং ব্যাকটেরিয়ায় শুধুমাত্র একটি ক্রোমাইড থাকে, যদিও 9 শতাংশের একাধিক ক্রোমাইড থাকে (একাধিক মেগাপ্লাজমিডযুক্ত 12 শতাংশ মেগাপ্লাজমিড-এনকোডিং ব্যাকটেরিয়ার তুলনায়)। অ্যাজোস্পিরিলাম গণের তিনটি প্রজাতি রয়েছে যার পাঁচটি পর্যন্ত ক্রোমিড রয়েছে, যা এখন পর্যন্ত একটি প্রজাতির মধ্যে সর্বাধিক পরিচিত ক্রোমিড। ইউক্যারিওট এবং অজৈব চাপের প্রতি উচ্চ সহনশীলতা সহ জীবের সাথে সিম্বায়োটিক বা প্যাথোজেনিক সম্পর্ক রয়েছে এমন ব্যাকটেরিয়াতেও ক্রোমাইডগুলি বেশি দেখা যায়। 1989 সালে রোডোব্যাক্টর স্ফেয়ারোইডস নামে পরিচিত আলফাপ্রোটোব্যাকটেরিয়ার একটি প্রজাতিতে ক্রোমাইড আবিষ্কৃত হয়। যাইহোক, একটি স্বাধীন ধরনের প্রতিলিপি হিসাবে "ক্রোমিড" ধারণার আনুষ্ঠানিকতা কেবল 2010 সালে আসে। বেশ কয়েকটি শ্রেণিবিন্যাস ক্রোমাইডগুলির মধ্যে তাদের অপরিহার্যতার শর্ত, তাদের প্রতিলিপি ব্যবস্থা এবং আরও অনেক কিছুর উপর নির্ভর করে পার্থক্য করে। ক্রোমিডের উৎপত্তির জন্য দুটি অনুমান হল "প্লাজমিড" এবং "স্কিজম" অনুমান। প্লাজমিড অনুমান অনুসারে, ক্রোমাইডগুলি প্লাজমিড থেকে উদ্ভূত হয় যা বিবর্তনীয় সময়ের সাথে মূল জিন অর্জন করেছে এবং তাই তাদের নিজ নিজ বংশে স্থিতিশীল হয়েছে। বিভেদ অনুমান অনুসারে, ক্রোমিডের পাশাপাশি প্রধান ক্রোমোজোম একটি বৃহত্তর, পূর্ববর্তী ক্রোমোজোমের বিভেদ থেকে উদ্ভূত হয়। প্লাজমিড অনুমান বর্তমানে ব্যাপকভাবে গৃহীত হয়েছে, যদিও এমন বিরল ঘটনা থাকতে পারে যেখানে বড় প্রতিরূপগুলি ক্রোমোসোমাল বিভেদ থেকে উদ্ভূত হয়। একটি অনুসন্ধানে বলা হয়েছে যে ক্রোমাইডগুলি ব্যাকটেরিয়াল ফাইলোজেনিগুলির মধ্যে 45 বার উদ্ভূত হয়েছিল এবং দু 'বার হারিয়ে গিয়েছিল। আবিষ্কার এবং শ্রেণিবিন্যাস আবিষ্কার ব্যাকটেরিয়া জিনোমিক্সের যুগের গোড়ার দিকে, ব্যাকটেরিয়ার জিনোমের তুলনামূলকভাবে সহজ স্থাপত্য রয়েছে বলে মনে করা হত। সমস্ত পরিচিত ব্যাকটেরিয়ায় বৃত্তাকার ক্রোমোজোম ছিল যার মধ্যে সমস্ত গুরুত্বপূর্ণ জিন ছিল। কিছু ব্যাকটেরিয়ার অতিরিক্ত প্রতিলিপি ছিল যা প্লাজমিড নামে পরিচিত, এবং প্লাজমিডগুলি চরিত্রগতভাবে ছোট, বৃত্তাকার এবং বিতরণযোগ্য ছিল (যার অর্থ তারা কেবল অপ্রয়োজনীয় জিনগুলিকে এনকোড করেছিল)। আরও বেশি ব্যাকটেরিয়া এবং তাদের জিনোম অধ্যয়ন করার সাথে সাথে ব্যাকটেরিয়ার জিনোমিক স্থাপত্যের অনেক বিকল্প রূপ আবিষ্কৃত হতে শুরু করে। বেশ কয়েকটি প্রজাতিতে রৈখিক ক্রোমোজোম এবং রৈখিক প্লাজমিড আবিষ্কৃত হয়েছে। এর পরপরই, বেশ কয়েকটি বড় প্রতিলিপি সহ ব্যাকটেরিয়া আবিষ্কৃত হয়, যা এই দৃষ্টিভঙ্গির দিকে পরিচালিত করে যে ইউক্যারিওটসের মতো ব্যাকটেরিয়াতেও একাধিক ক্রোমোজোম দিয়ে তৈরি একটি জিনোম থাকতে পারে। এর প্রথম উদাহরণ ছিল 1989 সালে রোডোব্যাক্টর স্ফেয়ারোইডস, তবে 1993 সালে ব্রুসেলা মেলিট্যান্সিস, 1994 সালে বার্কহোল্ডেরিয়া সেপাসিয়া কমপ্লেক্স, 1995 সালে রাইজোবিয়াম মেলিলোটি, 1996 সালে ব্যাসিলাস থুরিনজিয়েনসিস এবং এখন প্রায় 10 শতাংশ ব্যাকটেরিয়া প্রজাতির বড় প্রতিরূপ রয়েছে যা প্রধান ক্রোমোজোম থেকে আলাদা। সংজ্ঞা এই আবিষ্কারগুলির সূচনার সাথে সাথে, মাল্টিপার্টাইট জিনোমের বিভিন্ন উপাদানকে শ্রেণীবদ্ধ করার জন্য বেশ কয়েকটি পদ্ধতির প্রস্তাব দেওয়া হয়েছিল। প্রধান ক্রোমোজোম ব্যতীত বড় প্রতিরূপগুলিকে বর্ণনা করার জন্য বিভিন্ন শব্দ ব্যবহার করা হয়েছে, যার মধ্যে রয়েছে কেবল তাদের অতিরিক্ত ক্রোমোজোম বা "মিনিক্রোমোজোম", "মেগাপ্লাজমিড" বা "সেকেন্ডারি ক্রোমোজোম" হিসাবে চিহ্নিত করা। এই প্রতিরূপগুলির মধ্যে পার্থক্য করার জন্য ব্যবহৃত মানদণ্ডগুলি সাধারণত আকার এবং মূল জিনের উপস্থিতির মতো বৈশিষ্ট্যগুলির চারপাশে ঘোরে। 2010 সালে, এই জিনোমিক উপাদানগুলিকে ক্রোমিড হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ করার প্রস্তাব দেওয়া হয়েছিল। পূর্ববর্তী পদগুলি, যেমন "সেকেন্ডারি ক্রোমোজোম", এই পর্যবেক্ষণে অপর্যাপ্ত বলে মনে করা হয় যে এই প্রতিলিপিগুলিতে প্লাজমিডের প্রতিলিপি ব্যবস্থা রয়েছে এবং তাই ক্রোমোজোমের তুলনায় মৌলিকভাবে ভিন্ন শ্রেণীর প্রতিলিপি। 'ক্রোমিড'-এর মূল সংজ্ঞায় তিনটি মানদণ্ড পূরণ করা হয়ঃ যদিও এই সংজ্ঞাটি শক্তিশালী, তবে যে লেখকরা এটি প্রস্তাব করেছিলেন তারা এই প্রত্যাশায় করেছিলেন যে কিছু ব্যতিক্রম পাওয়া যাবে যা ক্রোমিড এবং অন্যান্য প্রতিলিপির মধ্যে রেখাগুলি অস্পষ্ট করে দেবে। এই প্রত্যাশা বিদ্যমান ছিল কারণ বিবর্তনীয় বংশের দ্ব্যর্থহীন ব্যবস্থা তৈরি করার সাধারণ প্রবণতা, যার ফলে একটি ব্যাপকভাবে পরিবেষ্টিত প্রজাতির সংজ্ঞা প্রণয়নের ক্ষেত্রে আরও সুপরিচিত সমস্যা তৈরি হয়েছে। ক্রোমিডের শ্রেণিবিন্যাসের পর থেকে, অন্যান্য প্রতিলিপি আবিষ্কৃত হয়েছে যা ক্রোমিডের কিছু বৈশিষ্ট্য ভাগ করে নেয় তবে আলাদাভাবে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছে। একটি উদাহরণ হল ব্যাকটেরিয়াল জেনাস অরাইমোনাস-এর মধ্যে একটি ক্লেড-এ পাওয়া মনোনীত "আরআরএন-প্লাসমিড"। আরআরএন-প্লাজমিডে আরআরএন (আরআরএনএ) অপেরন থাকে (তাই এর নাম), এবং আরআরএন অপেরন প্রধান ক্রোমোসোমে পাওয়া যায় না। প্রধান ক্রোমোজোমকে তাই "আরআরএন-ল্যাকিং ক্রোমোজোম" বা আরএলসি বলা হয়, এবং তাই অরাইমোনাসের মধ্যে যে ব্যাকটেরিয়ার ক্লেড আরআরএন-প্লাজমিড ধারণ করে তাকে "আরএলসি ক্লেড" ও বলা হয়। আরএলসি ক্লেডের সদস্যদের নয়টি প্রতিলিপি রয়েছে, যার মধ্যে প্রধান ক্রোমোজোমটি বৃহত্তম এবং আরআরএন-প্লাজমিড কেবলমাত্র 9.4kb-এ সবচেয়ে ছোট। আর. আর. এন-প্লাজমিডের আর. এল. সি ব্যাকটেরিয়াতেও একটি উচ্চ অনুলিপি সংখ্যা রয়েছে। যদিও এই খুব ছোট আকার এবং অনুলিপি সংখ্যাটি ক্রোমিডের তুলনায় প্লাসমিড মোরেসোর সাথে সাদৃশ্যপূর্ণ, তবুও আরআরএন-প্লাসমিড এখনও আরআরএন অপেরন এবং টিআরএনএ (আইলে)-এর জন্য জিনের একমাত্র অনুলিপি। বৈশিষ্ট্যগুলির এই স্বতন্ত্র সংগ্রহটি বিজ্ঞানীদের এই প্রতিলিপিটি আবিষ্কার করতে পরিচালিত করে এটিকে কেবল একটি আরআরএন-প্লাজমিড হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ করার জন্য, যা একটি "প্লাজমিড" বা "ক্রোমিড" এর চেয়ে পৃথক শ্রেণীবিভাগ হিসাবে বিবেচিত হয়। অতিরিক্ত প্রস্তাবিত শ্রেণীবিভাগ ক্রোমাইড হিসাবে নির্দিষ্ট প্রতিলিপিগুলিকে শ্রেণীবদ্ধ করার বাইরে, বেশ কয়েকজন বিজ্ঞানী বিভিন্ন ধরনের ক্রোমাইডের মধ্যে আরও পার্থক্য করার প্রস্তাব দিয়েছেন। একটি শ্রেণীবিভাগ প্রাথমিক এবং গৌণ ক্রোমিডের মধ্যে পার্থক্য করে। প্রাথমিক ক্রোমাইডগুলিকে মূল জিনযুক্ত ক্রোমাইড হিসাবে সংজ্ঞায়িত করা হয় যা সমস্ত পরিস্থিতিতে ব্যাকটেরিয়ার বেঁচে থাকার জন্য সর্বদা প্রয়োজনীয়। গৌণ ক্রোমাইডগুলি ব্যাকটেরিয়ার স্থানীয় পরিস্থিতিতে বেঁচে থাকার জন্য প্রয়োজনীয় ক্রোমাইড হিসাবে সংজ্ঞায়িত করা হয়, তবে পরীক্ষাগার পরিবেশের মতো নির্দিষ্ট "নিরাপদ" পরিস্থিতিতে অপ্রয়োজনীয় হতে পারে। সেকেন্ডারি ক্রোমিডের আরও সাম্প্রতিক বিবর্তনীয় উৎস থাকতে পারে এবং প্রাথমিক ক্রোমিডের তুলনায় আরও কিছু প্লাজমিডের মতো বৈশিষ্ট্য ধরে রাখতে পারে। প্রস্তাবিত প্রাথমিক ক্রোমিডের একটি উদাহরণ হল প্যারাকোক্কাস ডেনিট্রিফিক্যান্স পিডি1222-এর "দ্বিতীয় ক্রোমোজোম"। বৈশিষ্ট্য আকার এবং অনুলিপি সংখ্যা একটি ব্যাকটেরিয়া জিনোমে, প্রধান ক্রোমোজোম সর্বদা বৃহত্তম প্রতিলিপি হবে, তারপরে ক্রোমিড এবং তারপরে প্লাজমিড। এই প্রবণতার একটি ব্যতিক্রম ডিইনোকোকাস ডেসার্টি ভিসিডি115-এ জানা যায়, যেখানে উভয় প্লাজমিডই ক্রোমিডের চেয়ে বড়। ক্রোমাইডগুলি জীবের মধ্যে আকারে উল্লেখযোগ্যভাবে পরিবর্তিত হয়। ভাইব্রিও ব্যাকটেরিয়াল বংশে, প্রধান ক্রোমোজোম 3.0-3.3 Mb এর মধ্যে পরিবর্তিত হয় যেখানে ক্রোমিডের আকার 0.8-2.4 Mb এর মধ্যে পরিবর্তিত হয়। বুকনেরার একটি প্রজাতির একটি প্রতিলিপি, যা কিছু মূল জিনকে এনকোড করে, শুধুমাত্র 7.8kb। যদিও মূল জিনের উপস্থিতি এই প্রতিলিপিটিকে ক্রোমিড হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ করতে পারে, তবে এই প্রতিলিপিটিকে নির্দিষ্ট সংজ্ঞাতেও বাদ দেওয়া যেতে পারে। কিছু পদ্ধতি শুধুমাত্র নির্দিষ্ট প্রতিলিপিগুলিকে ক্রোমিড হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ করে যদি তারা 350 কেবি এর প্রান্তিক আকার পূরণ করে। এটিও দেখা গেছে যে ক্রোমোজোম এবং মেগাপ্লাজমিডের মতো ক্রোমিডের কোষে কম অনুলিপি সংখ্যা থাকে। গড়ে, ক্রোমাইডগুলি মেগাপ্লাজমিডগুলির চেয়ে দ্বিগুণ বড় (এবং তাই একটি মেগাপ্লাজমিড থেকে একটি ক্রোমাইডের উত্থান রূপান্তরের পরে একটি বড় জিন সঞ্চয়ের সাথে যুক্ত)। সবচেয়ে বড় ক্রোমাইডগুলির মধ্যে একটি হল বার্কহোল্ডেরিয়া সিউডোমাল্লি, যা আকারে 3.1 মিলিয়ন নিউক্লিওটাইড অতিক্রম করে, অর্থাৎ। 3. 1 মেগাবেজ বা 3 এম. বি। জিনোমিক বৈশিষ্ট্যগুলি প্রধান ক্রোমোজোমের তুলনায় ক্রোমিডে প্রায়শই জি + সি উপাদান কম থাকে, যদিও এই সংযোগের শক্তি খুব বেশি শক্তিশালী নয়। একটি ক্রোমিডে সাধারণত প্রধান ক্রোমোজোমের 1 শতাংশের মধ্যে একটি জি + সি উপাদান থাকে, যা একটি প্রয়োজনীয় সময়ের জন্য একটি ব্যাকটেরিয়া বংশের মধ্যে স্থিতিশীলভাবে বিদ্যমান থাকার পরে প্রধান ক্রোমোজোমের মূল গঠনের ভারসাম্যের কাছাকাছি প্রতিফলিত করে। ক্রোমাইডগুলি তাদের কোডন ব্যবহারের পক্ষপাতের ক্ষেত্রেও প্রধান ক্রোমোজোমের অনুরূপ। একটি বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে, মেগাপ্লাজমিডের 1.9 শতাংশ এবং প্লাজমিডের 2.8 শতাংশ মানের তুলনায় প্রধান ক্রোমোজোমের সঙ্গে জিসি-র পরিমাণের মধ্যে ক্রোমিডের মধ্যবর্তী 0.34% পার্থক্য রয়েছে। ক্রোমিডের প্রধান ক্রোমোজোম থেকে কমপক্ষে একটি মূল জিন অনুপস্থিত থাকে। (প্রধান ক্রোমোজোমগুলি একটি ব্যাকটেরিয়ার মূল জিনের বড় অংশ ধারণ করে, যেখানে প্লাজমিডগুলিতে কোনও মূল জিন থাকে না।) উদাহরণস্বরূপ, ভিব্রিও কলেরার ক্রোমিডে রাইবোসোমাল সাবইউনিট এল20 এবং এল35-এর জন্য জিন থাকে। যদিও বেশিরভাগ ক্রোমিডে প্রধান ক্রোমোজোমের তুলনায় অপ্রয়োজনীয়ভাবে কম সংখ্যক প্রয়োজনীয় জিন থাকে, যেমন আরআরএনএ জিন বা আরআরএনএ অপেরনের জিন, কিছুতে আরও অনেক প্রয়োজনীয় জিন থাকতে পারে এবং এমনকি ক্রোমোজোমের সাথে "সমান অংশীদার" হিসাবে বিবেচিত হতে পারে। সাধারণভাবে, ক্রোমাইডগুলি পরিবহন, বিপাক, প্রতিলিপি, নিয়ন্ত্রক ক্রিয়াকলাপ, সংকেত সঞ্চালন এবং গতিশীলতা-সম্পর্কিত ক্রিয়াকলাপের প্রক্রিয়াগুলির সাথে জড়িত জিনের সমৃদ্ধিও দেখতে পায়। ক্রোমিডে অবস্থিত প্রোটিনগুলি এমন প্রক্রিয়াগুলিতে জড়িত যা প্রধান ক্রোমোসোমে এনকোড করা প্রোটিনের সাথে মিথস্ক্রিয়া করতে পারে। ক্রোমোজোমের তুলনায় ক্রোমিডে বেশি ট্রান্সপোসেজ জিন থাকে, তবে মেগাপ্লাজমিডের চেয়ে কম। ফাইলোজেনেটিক বন্টন মূল জিনের উপস্থিতি ব্যাকটেরিয়ার বেঁচে থাকার জন্য ক্রোমিডকে অপরিহার্য করে তোলে। একই মূল জিন একটি বংশের মধ্যে ক্রোমিডে পাওয়া যাবে তবে অগত্যা গণের মধ্যে পাওয়া যাবে না। একটি বংশের সমস্ত ক্রোমাইড অতিরিক্তভাবে প্রচুর সংখ্যক সংরক্ষিত কিন্তু অপ্রয়োজনীয় জিন ভাগ করে নিতে পারে যা বংশের ফেনোটাইপকে সংজ্ঞায়িত করতে সহায়তা করে (এবং ক্রোমাইডের উত্থান ক্রোমাইড-এনকোডিং ব্যাকটেরিয়া গণ গঠনে প্রাথমিক বিবর্তনীয় শক্তি বলে মনে হয়, যেমন ভিব্রিয়োর ক্ষেত্রে পরামর্শ দেওয়া হয়েছে)। বিপরীতে, ব্যাকটেরিয়াল ক্রোমোজোম সর্বজনীনভাবে বা প্রায় সর্বজনীনভাবে শত শত সংরক্ষিত মূল জিন ভাগ করে নিতে পারে। প্লাজমিডগুলিতে কোনও মূল জিন থাকে না এবং ক্রোমিডের বিপরীতে, একটি ব্যাকটেরিয়া বংশের মধ্যে বিভিন্ন প্রজাতির প্লাজমিডগুলি (বা এমনকি একই প্রজাতির মধ্যে কেবল ভিন্ন বিচ্ছিন্ন) কয়েকটি জিন ভাগ করে নেয়। এটি আংশিকভাবে প্লাজমিডগুলির লাভ এবং ক্ষতির সাধারণ স্থানান্তর এবং সংমিশ্রণের মাধ্যমে ব্যাকটেরিয়ার মধ্যে তাদের স্থানান্তরের (অনুভূমিক জিন স্থানান্তরের একটি রূপ) কারণে হয়, যেখানে ক্রোমাইডগুলি অনুভূমিক জিন স্থানান্তরের মধ্য দিয়ে চলার কোনও প্রমাণ ছাড়াই কোষ বিভাজনের (উল্লম্বভাবে) মধ্য দিয়ে যায়। এটি লক্ষ্য করা গেছে যে ব্যাকটেরিয়াকে অদম্য না করেই কমপক্ষে একটি ব্যাকটেরিয়া প্রজাতির ক্রোমিডকে নির্মূল করা যেতে পারে, তবে ব্যাকটেরিয়াটি অক্সোট্রফিক হয়ে ওঠে যা ক্রোমিডের ক্ষতির সাথে সম্পর্কিত একটি গুরুতর ফিটনেস আপোষের ইঙ্গিত দেয়। ব্যাকটেরিয়া বংশের মধ্যে তাদের স্থিতিশীল উপস্থিতির কারণে, ক্রোমাইডগুলির নির্দিষ্ট গণের মধ্যে ফাইলোজেনেটিকভাবে সীমাবদ্ধ থাকার একটি বৈশিষ্ট্যও রয়েছে। ক্রোমাইডযুক্ত ব্যাকটেরিয়ার গণের উদাহরণগুলির মধ্যে রয়েছে ডিইনোকোকাস, লেপ্টোস্পিরা, সায়ানোথেস (এক ধরনের সায়ানোব্যাকটেরিয়া) এবং সিউডোমোনাডোটা গণের সমৃদ্ধি। সামগ্রিকভাবে, ব্যাকটেরিয়ার জিনোম সিকোয়েন্সিং ইঙ্গিত দেয় যে প্রায় 10 শতাংশ ব্যাকটেরিয়া প্রজাতির একটি ক্রোমিড রয়েছে। এটিও দেখা গেছে যে একই জীবের মধ্যে একটি ক্রোমিড এবং একটি মেগাপ্লাজমিডের সহ-উপস্থিতির প্রতি পক্ষপাত রয়েছে। মেগাপ্লাজমিডগুলি ক্রোমাইডের সম্ভাব্য বিবর্তনীয় উৎস হওয়া সত্ত্বেও মেগাপ্লাজমিডগুলির (প্রায় দ্বিগুণ প্রজাতির) তুলনায় ফাইলোজেনিগুলিতে ক্রোমাইডগুলি প্রায়শই দেখা যায়। এর ফলে ক্রোমাইডের সহজাতভাবে বৃহত্তর বিবর্তনীয় স্থিতিশীলতার তুলনায় জীবের সময়ের সাথে সাথে তাদের মেগাপ্লাজমিড হারানোর প্রবণতা দেখা দিতে পারে। ক্রোমোজোম এবং ক্রোমাইড উভয়ের প্রতিলিপির বৈশিষ্ট্য ক্রোমাইডগুলি ভাগ করে নেয়। প্রথমত, ক্রোমাইডগুলি প্লাজমিডের প্রতিলিপি ব্যবস্থা ব্যবহার করে। যদিও প্লাজমিডগুলি প্রধান ক্রোমোজোম বা কোষ চক্রের সাথে সমন্বয় করে প্রতিলিপি তৈরি করে না, ক্রোমাইডগুলি প্রতি কোষ চক্রে কেবল একবার প্রতিলিপি তৈরি করে। ভাইব্রিও গণের ব্যাকটেরিয়ায়, ক্রোমিডের প্রতিলিপির আগে প্রধান ক্রোমোজোমের প্রতিলিপি শুরু হয়। ক্রোমোজোমের তুলনায় ক্রোমাইড ছোট, এবং তাই প্রতিলিপি তৈরি শেষ করতে কম সময় লাগে। এই কারণে, ক্রোমোজোম এবং ক্রোমিডের মধ্যে প্রতিলিপি সমাপ্তির সমন্বয় করতে ক্রোমিডের প্রতিলিপি বিলম্বিত হয়। ক্রোমিডের তুলনায় ক্রোমোজোমের পূর্ববর্তী প্রতিলিপিও এনসিফার মেলিলোটিতে দেখা গেছে। ক্রোমোজোম এবং ক্রোমিডের মধ্যে প্রতিলিপি তৈরি শুরু করতে ব্যাকটেরিয়া বিভিন্ন প্রতিলিপির কারণের উপরও নির্ভর করে। ক্রোমোজোমের প্রতিলিপি ডিএনএএ প্রোটিনের অভিব্যক্তির উদ্দীপনার উপর শুরু হয়, যেখানে ক্রোমাইড প্রতিলিপির প্রকাশের জন্য ডিএনএএ প্রয়োজন তবে এটি আরসিটিবির উপরও নির্ভর করে। এটি এফ1 এবং পি প্লাজমিডগুলির অনুরূপ যা ডিএনএএর উপরও নির্ভর করে তবে এখনও তাদের প্রতিলিপি অন্যান্য প্রোটিন (বিশেষত আরপিএ এবং আরপিই) দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয়। ক্রোমিডের পৃথকীকরণ ব্যাকটেরিয়ার বিভিন্ন গণের মধ্যে বিভিন্ন নিদর্শন অনুসরণ করে, যদিও এটি সাধারণত প্রধান ক্রোমোজোমের পৃথকীকরণের পরে ঘটে। এখনও অবধি, ক্রোমাইডগুলি দুই ধরনের সিস্টেমের মধ্যে একটির সাথে প্রতিলিপি তৈরি করতে পরিচিতঃ হয় রিপএবিসি সিস্টেমের সাথে বা ইটেরনগুলির সাথে। বিবর্তনীয় নমনীয়তা বেশ কয়েকটি গবেষণা ইঙ্গিত দেয় যে ক্রোমাইডগুলি কম সংরক্ষিত এবং ব্যাকটেরিয়ায় ক্রোমোজোমের তুলনায় দ্রুত বিকশিত হয়। ভিব্রিও গণের অনেক প্রজাতির একটি গবেষণায় দেখা গেছে যে প্রধান, বড় ক্রোমোজোমের সামঞ্জস্যপূর্ণ আকারের পরিসীমা 3-3.3 এমবি ছিল, যেখানে গৌণ ক্রোমোজোম নমনীয়ভাবে 0.8-2.4 এমবি থেকে ছিল। এই উল্লেখযোগ্য বৈচিত্র্য বৃহত্তর মাত্রায় কাঠামোগত নমনীয়তার ইঙ্গিত দেয়। অ্যাগ্রোব্যাকটেরিয়াম গণ এবং অন্য একটি গণের ব্যাকটেরিয়ায় তিন বা ততোধিক ক্রোমাইড থাকতে পারে এবং বিভিন্ন প্রজাতির এই একাধিক ক্রোমাইডগুলি সাধারণত বড় আকারের পুনর্বিন্যাসের মধ্য দিয়ে যায় যা একটি ক্রোমাইডের একটি বড় অংশকে অন্যটিতে স্থানান্তর করতে পারে। ক্রোমিডে অবস্থিত জিনগুলিও বিবর্তিত হওয়ার প্রবণতা বেশি এবং কম পরিশোধনকারী নির্বাচন প্রদর্শন করে। যেহেতু প্রোক্যারিওটের জন্য সাধারণ প্রজাতির সংজ্ঞা ডি. এন. এ ক্রম বা গড় নিউক্লিওটাইড পরিচয়ের উপর ভিত্তি করে, তাই ক্রোমিডের বৃহত্তর বিবর্তনের ফলে ক্রোমিডযুক্ত জীবের প্রজাতির প্রবণতা বেশি হতে পারে। উৎপত্তি "স্কিজম" এবং "প্লাজমিড" অনুমান ক্রোমিডের উৎপত্তি ব্যাখ্যা করার জন্য বেশ কয়েকটি পরামর্শ দেওয়া হয়েছে। দুটি প্রধান অনুমান হল "স্কিজম হাইপোথিসিস" এবং "প্লাজমিড হাইপোথিসিস"। বিভেদ অনুমান অনুসারে, একটি বৃহত্তর ক্রোমোজোমের বিভাজনের মাধ্যমে দুটি পৃথক ব্যাকটেরিয়াল ক্রোমোজোম তৈরি হতে পারে, যার ফলে একটি প্রধান এবং একটি গৌণ ক্রোমোজোম (বা একটি ক্রোমিড) তৈরি হতে পারে। যাইহোক, ক্রোমিডে প্লাজমিড-টাইপ রক্ষণাবেক্ষণ এবং প্রতিলিপি ব্যবস্থার পাশাপাশি প্রধান ক্রোমোজোম এবং ক্রোমিডের মধ্যে মূল জিনের অসম বিতরণের কারণে, প্লাজমিড অনুমানটি পরামর্শ দেয় যে ক্রোমিডগুলি মেগাপ্লাজমিড থেকে বিবর্তিত হয়েছে যা মূল জিন অর্জন করেছে। একবার মেগাপ্লাজমিডগুলি প্রধান ক্রোমোজোম থেকে মূল জিন অর্জন করে, প্রধান ক্রোমোজোম থেকে সেই মূল জিনের একযোগে ক্ষতির সাথে মিলিত হয়ে, প্লাজমিড ব্যাকটেরিয়া জিনোমের একটি স্থিতিশীল এবং প্রয়োজনীয় উপাদান হয়ে ওঠে। (মেগাপ্লাজমিডগুলি প্রধান ক্রোমোজোম থেকে মূল জিনের প্রতিলিপিও অর্জন করতে পারে। ডুপ্লিকেট কোর জিনের অস্তিত্ব প্রধান ক্রোমোজোমের উপর অধঃপতিত হতে পারে, যার ফলে নবগঠিত ক্রোমিডে এর একমাত্র উপস্থিতি হতে পারে। এই ক্ষেত্রে, ক্রোমাইড একটি নিরপেক্ষ রূপান্তরের মাধ্যমে গঠিত হয়।) এই ঘটনাটি নতুন ক্রোমিডে অবস্থিত অন্যান্য জিনগুলিকেও স্থিতিশীল করে, যার ফলে নতুন বংশের জন্য একটি চরিত্রগত ফেনোটাইপ হতে পারে। এই মূল জিনগুলি বিভিন্ন উপায়ে মেগাপ্লাজমিডে স্থানান্তরিত হতে পারে। একটি হল প্রধান ক্রোমোজোম এবং প্লাজমিডের মধ্যে সমজাতীয় পুনর্মিলন। এটিও সম্ভব যে একটি বিদ্যমান ক্রোমাইড তার প্রতিলিপি ব্যবস্থা অর্জনের জন্য একটি প্লাজমিডের সাথে পুনরায় মিলিত হতে পারে। একবার একটি ক্রোমিড একটি বংশে উপস্থিত হলে, এটি দীর্ঘ বিবর্তনীয় সময়কালে স্থিতিশীল থাকে। বেশ কয়েকটি ব্যাকটেরিয়া গণের ক্রোমিড রয়েছে যা প্রতিটি গণের বৈশিষ্ট্য। যেখানে একটি একক বংশে পাওয়া ক্রোমাইডগুলি সর্বজনীনভাবে প্রচুর সংখ্যক জিন ভাগ করে নিতে পারে, সেখানে বিভিন্ন গণের ক্রোমাইডগুলিতে সর্বজনীনভাবে কোনও জিন পাওয়া যায় না। প্লাজমিডগুলি প্রায় সবসময়ই ক্রোমিডের উৎপত্তির উৎস হয়, তবে কমপক্ষে দুটি ব্যাকটেরিয়া স্ট্রেনের বড় প্রতিরূপগুলি বৃহত্তর ক্রোমোজোমের বিভেদ থেকে উদ্ভূত হতে পারে। এই ব্যতিক্রমী ক্ষেত্রে, "গৌণ ক্রোমোজোম" শব্দটি তাদের বর্ণনা করার জন্য ধরে রাখা যেতে পারে এবং তাই, এই অর্থে, তাদের "ক্রোমাইড" থেকে আলাদা করে। একটি প্রতিরূপকে "গৌণ ক্রোমোজোম" হিসাবে চিহ্নিত করা প্রধান ক্রোমোজোমের সাথে সংরক্ষিত সিন্টেনি এবং মূল জিনের এলোমেলো বিতরণের ভিত্তিতে করা যেতে পারে। প্রস্তাবিত অভিযোজিত কারণ ক্রোমাইডের উৎসের প্রশ্নটি কেন তারা বিবর্তিত হয়েছিল সেই প্রশ্নের সাথে আবদ্ধ। একটি সম্ভাবনা হ 'ল ক্রোমাইডগুলি একটি "হিমায়িত দুর্ঘটনা", যেখানে তারা কেবল কোনও নির্দিষ্ট কারণ ছাড়াই আকস্মিকভাবে বিকশিত হয়েছিল এবং তাই, কেবল এই কারণেই, যে জীবের মধ্যে তারা আবির্ভূত হয়েছিল তার বংশধরের মধ্যে উপস্থিত রয়েছে। এই পরিস্থিতিতে, মূল জিনগুলি কাকতালীয়ভাবে ক্রোমিডের উপর শেষ হয়, তবে নিরপেক্ষ পরিবর্তনের মাধ্যমে গৌণ প্রতিরূপের উপর মূল জিনের আকস্মিক স্থিরকরণ জীবের কাছে এর প্রয়োজনীয়তার দিকে পরিচালিত করে। যাইহোক, ক্রোমাইডগুলি কিছু সুবিধাও নিয়ে আসতে পারে যা ব্যাকটেরিয়াকে তার পরিবেশে প্রতিদ্বন্দ্বিতা করতে সহায়তা করে। দেখা গেছে যে ক্রোমাইডযুক্ত ব্যাকটেরিয়া কালচারে দ্রুত বৃদ্ধি পেতে সক্ষম এবং এতে মোটামুটি বেশি বড় আকারের জিনোম রয়েছে। ক্রোমাইড-এনকোডিং ব্যাকটেরিয়ার গড় আকার 5,73 ± 1.66 এমবি, যেখানে ক্রোমাইড এনকোড না করা ব্যাকটেরিয়ার গড় জিনোমের আকার 3.38 ± 1.81 এমবি। এই কারণে, কেউ কেউ এই সিদ্ধান্তে পৌঁছেছেন যে মূল ক্রোমোজোমের পরিবর্তে ক্রোমিডে বেশ কয়েকটি জিনের স্থাপন প্রতিলিপির গতি এবং দক্ষতার সাথে আপস না করে জিনোম সম্প্রসারণের অনুমতি দেয়। অন্যদিকে, 6 এমবি-র বেশি ব্যাকটেরিয়ার জিনোমের দুই-তৃতীয়াংশ মাল্টিপার্টাইট নয় এবং পঞ্চাশটি বৃহত্তম জিনোমের মধ্যে মাত্র তিনটি মাল্টিপার্টাইট, এবং তাই একটি বৃহত্তর জিনোম এখনও ক্রোমিডের বিবর্তনীয় উৎসের কারণ হিসাবে প্রদর্শিত হয়নি। দ্রুত বর্ধনশীল ব্যাকটেরিয়াতেও ক্রোমাইডগুলি প্রায়শই পাওয়া যায়, যা প্রতিলিপি এবং বিভাজনের গতিতে তাদের অবদানের পরামর্শ দেয়, যদিও এখানেও বেশ কয়েকটি বিশ্লেষণ ক্রোমাইডের উত্থানের জন্য একটি চালিকা বিবর্তনীয় শক্তি হিসাবে এই পরামর্শের সাথে অসুবিধা উত্থাপন করেছে। পরিবর্তে, জিনোম সম্প্রসারণ এবং দ্রুত প্রতিলিপির গতি বংশগতভাবে ক্রোমিডের রক্ষণাবেক্ষণে জড়িত থাকার সম্ভাবনা বেশি তবে তাদের উত্থানের কারণগত ব্যাখ্যা নয়। ক্রোমাইডগুলি কুলুঙ্গি-নির্দিষ্ট জিনের সমন্বিত প্রকাশের অনুমতি দিতে পারে। একটি নির্দিষ্ট পরিবেশে একটি সুবিধাজনক জীবনধারা প্রদানের জন্য প্রয়োজনীয় জিন রয়েছে এমন ক্রোমাইডগুলির বিরল আবির্ভাব জীবের মধ্যে সেই ক্রোমাইডকে স্থিতিশীল করতে এবং এখনকার গুরুত্বপূর্ণ প্রতিলিপির উপস্থিতি দ্বারা সংজ্ঞায়িত একটি নতুন বংশের দিকে পরিচালিত করতে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করতে পারে। তথ্যসূত্র ডি. এন. এ প্রতিলিপি ব্যাকটেরিয়াল জেনেটিক্স