Liquid–liquid phase separation sequence-based predictors
এলএলপিএস প্রায়শই এমন ক্রম অঞ্চলগুলির সাথে জড়িত যার অনন্য কার্যকরী বৈশিষ্ট্য রয়েছে, পাশাপাশি প্রিওনের মতো এবং আরএনএ-বাইন্ডিং ডোমেনের উপস্থিতি রয়েছে। আজকাল এলএলপিএস চালানোর জন্য একটি প্রোটিনের প্রবণতা পূর্বাভাস দেওয়ার জন্য মাত্র কয়েকটি পদ্ধতি রয়েছে। এলএলপিএস-এর সাথে জড়িত জৈবিক প্রক্রিয়াগুলির পরিসীমা, এই প্রক্রিয়াগুলি সম্পর্কে সীমিত জ্ঞান এবং এলএলপিএস-এর গুরুত্বপূর্ণ প্রসঙ্গ-নির্ভর উপাদানগুলি এই সমস্যাটিকে চ্যালেঞ্জিং করে তোলে। বিগত বছরগুলিতে, এই ক্ষেত্রে অগ্রগতি সত্ত্বেও, এলএলপিএস-এর জন্য নির্দিষ্ট মাত্র কয়েকটি ভবিষ্যদ্বাণীকারী তৈরি করা হয়েছে, যা প্রোটিন সিকোয়েন্স বৈশিষ্ট্য এবং এলএলপিএস চালানোর ক্ষমতার মধ্যে সম্পর্ক বোঝার চেষ্টা করছে। এখানে আমরা অত্যাধুনিক এলএলপিএস ক্রম-ভিত্তিক ভবিষ্যদ্বাণীগুলি সংশোধন করব, সংক্ষেপে তাদের পরিচয় করিয়ে দেব এবং ব্যাখ্যা করব যে এলএলপিএসের প্রসঙ্গে তারা কোন পৃথক প্রোটিন বৈশিষ্ট্যগুলি চিহ্নিত করে। এল. এল. পি. এস সিমুলেশন এল. এল. পি. এস-এর ক্ষেত্রে আরেকটি গুরুত্বপূর্ণ গণনামূলক সম্পদ হল প্রোটিনের তাত্ত্বিক সিমুলেশন, বিশেষ করে অভ্যন্তরীণভাবে বিশৃঙ্খল প্রোটিন (আই. ডি. পি), যা এল. এল. পি. এস-কে চালিত করে। এই সিমুলেশনগুলি পরীক্ষার পরিপূরক এবং এলএলপিএস চালনাকারী পৃথক প্রোটিনের আণবিক প্রক্রিয়া সম্পর্কে গুরুত্বপূর্ণ অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে। ডিগনন এট আল-এর একটি পর্যালোচনা। পরীক্ষামূলক ফলাফলগুলি ব্যাখ্যা করতে, পর্যায়ের আচরণ ব্যাখ্যা করতে এবং টিউনেবল ফেজ ট্রানজিশন বৈশিষ্ট্য সহ প্রোটিন ডিজাইন করার জন্য ভবিষ্যদ্বাণীমূলক কাঠামো সরবরাহ করতে এই সিমুলেশনগুলি কীভাবে প্রয়োগ করা যেতে পারে তা নিয়ে আলোচনা করা হয়েছে। চ্যালেঞ্জটি হল মডেলের রেজোলিউশন এবং গণনামূলক দক্ষতার মধ্যে আপস, যেহেতু আইডিপি-র সাথে জড়িত বড় সিস্টেমগুলির সমস্ত-পরমাণু সিমুলেশনগুলি এখনও সম্পাদন করা কঠিন। উপরন্তু, ফোঁটা-অবস্থায় আইডিপির মধ্যে আণবিক মিথস্ক্রিয়া এখনও খুব কম বোঝা যায় এবং পরীক্ষামূলক তথ্য এবং সিমুলেশনগুলির সংমিশ্রণ তাদের ব্যাখ্যা করার জন্য অপরিহার্য। এই প্রক্রিয়াগুলিকে আলোকিত করার জন্য আগামী কয়েক বছরের মধ্যে নমুনা সংগ্রহ এবং অনুকরণ পদ্ধতির উন্নতি ঘটতে পারে। আরও দেখুন অভ্যন্তরীণভাবে বিশৃঙ্খল প্রোটিন ডিসপ্রোট ডাটাবেস মোবিডিবি ডাটাবেস রেফারেন্স প্রোটিন কাঠামো কাঠামোগত জৈব তথ্যবিজ্ঞান প্রোটিওমিক্স নিউরোডিজেনারেটিভ ব্যাধি