Planarian secretory cell nidovirus
প্ল্যানারিয়ান সিক্রেটরি সেল নিডোভাইরাস (পি. এস. সি. এন. ভি) হল প্ল্যানিডোভাইরাস 1 প্রজাতির একটি ভাইরাস, একটি নিডোভাইরাস যা তার অত্যন্ত বড় জিনোমের জন্য উল্লেখযোগ্য। 41. 1 কিলোবেসে, এটি একটি আর. এন. এ ভাইরাসের বৃহত্তম জিনোম। এটি প্ল্যানারিয়ান ফ্ল্যাটওয়ার্ম শ্মিডটিয়া মেডিটেরানিয়ার ট্রান্সক্রিপ্টোম পরিদর্শন করে আবিষ্কৃত হয়েছিল এবং এটি প্রথম পরিচিত আরএনএ ভাইরাস যা প্ল্যানারিয়ানদের সংক্রামিত করে। এটি প্রথম 2018 সালে বর্ণনা করা হয়েছিল। জিনোম এবং অভিব্যক্তি পি. এস. সি. এন. ভি জিনোম 41.1 কিলোবেস দীর্ঘ, যা একটি আর. এন. এ ভাইরাসের বৃহত্তম জিনোম। এটি করোনভাইরাসগুলির তুলনায় যথেষ্ট বড়, বড় জিনোমের জন্য পরিচিত নিডোভাইরাসগুলির আরেকটি গ্রুপ, যা সাধারণত 27-32 kb পরিসরে থাকে। পি. এস. সি. এন. ভি-র একটি অস্বাভাবিক জিনোমিক সংগঠন রয়েছে যা একটি অত্যন্ত বড় ওপেন রিডিং ফ্রেম (ও. আর. এফ) নিয়ে গঠিত যা 13,556 অ্যামিনো অ্যাসিডের একটি পলিপ্রোটিনকে এনকোড করে-যা একটি আর. এন. এ ভাইরাস দ্বারা এনকোড করা সবচেয়ে বড় প্রোটিন। জিনোমের বায়োইনফরম্যাটিক্স বিশ্লেষণ থেকে জানা যায় যে এটি ক্যানোনিকাল নিডোভাইরাস জিনোমের মতো একইভাবে সংগঠিত, যেখানে ওআরএফ1এ এবং ওআরএফ1বি ভাইরাল ননস্ট্রাকচারাল প্রোটিনগুলিকে এনকোড করে এবং জিনোমের 3 'প্রান্তে অতিরিক্ত ওআরএফগুলি ভাইরাল স্ট্রাকচারাল প্রোটিনগুলিকে এনকোড করে; তবে, পিএসসিএনভিতে, এই ওআরএফগুলি সংযুক্ত করা হয় এবং ফলস্বরূপ পলিপ্রোটিন প্রোটোলাইটিকভাবে প্রক্রিয়াজাত করা হয়। যেখানে অন্যান্য নিডোভাইরাস দুটি ও. আর. এফ দ্বারা এনকোড করা প্রোটিনের স্টোইকিওমেট্রি নিয়ন্ত্রণ করতে ও. আর. এফ1এ-কে ও. আর. এফ1বি থেকে পৃথক করে একটি প্রোগ্রামযুক্ত রাইবোসোমাল ফ্রেমশিফ্ট ব্যবহার করে, সেখানে পি. এস. সি. এন. ভি জিনোমে আপেক্ষিক প্রোটিন অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণের জন্য একটি বিকল্প ফ্রেমশিফ্ট প্রক্রিয়া থাকার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। অন্যান্য নিডোভাইরাস জিনোমের তুলনায়, ও. আর. এফ1বি-র সঙ্গে সম্পর্কিত অঞ্চল-যা মূল ভাইরাল প্রতিলিপি উপাদানগুলিকে এনকোড করে-পি. এস. সি. এন. ভি জিনোমে সবচেয়ে বেশি প্রসারিত হয়েছে। প্রোটিন উপাদান সংরক্ষিত পি. এস. সি. এন. ভি জিনোম সনাক্তযোগ্য প্রোটিন ডোমেনগুলিকে এনকোড করে যা নিডোভাইরাসগুলির মধ্যে সংরক্ষিত থাকে-যথা প্রধান প্রোটিজ (3সিএল-এর মতো প্রোটিজ) ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন দ্বারা উভয় প্রান্তে, একটি নিউক্লিওটিডিলট্রান্সফেরেজ ডোমেন যা নিরান নামে পরিচিত, আর. এন. এ-নির্ভর আর. এন. এ পলিমারেজ (আর. ডি. আর. পি), একটি দস্তা-বাঁধাই ডোমেন এবং একটি হেলিকেজ। এটিতে মিথাইলট্রান্সফেরেজ এবং-বড় জিনোম সহ অন্যান্য নিডোভাইরাসের মতো-একটি প্রুফরিডিং এক্সোরিবোন্যুক্লিয়াস (এক্সওএন) রয়েছে, যা সম্ভবত একটি বড় জিনোমের প্রতিলিপি তৈরি করার জন্য পর্যাপ্ত প্রতিলিপি নিষ্ঠার জন্য প্রয়োজনীয়। যাইহোক, এক্সোএন কাঠামো এবং সক্রিয় সাইটের অবশিষ্টাংশগুলি অন্যান্য নিডোভাইরাল উদাহরণ থেকে পৃথক, এবং 3সিএল-এর মতো প্রোটিজ একটি সেরিন-হিস্টিডিন-অ্যাস্পার্টেট অনুঘটক ত্রয়ী ব্যবহার করে বলে মনে হয়, অন্যান্য নিডোভাইরাসের সাধারণ সিস্টিন নিউক্লিওফাইলের বিপরীতে। পরিচিত নিডোভাইরাসগুলির মধ্যে অনন্যভাবে, পিএসসিএনভি আরও বেশ কয়েকটি সনাক্তযোগ্য প্রোটিন ডোমেনকে এনকোড করে, সম্ভবত হোস্ট থেকে অর্জিত। পিএসসিএনভি রাইবোনিউক্লিজ টি2, দুটি ফাইব্রোনেক্টিন টাইপ II ডোমেন এবং তিনটি অ্যাঙ্কিরিন পুনরাবৃত্তি এনকোড করে। হোস্ট পি. এস. সি. এন. ভি পরীক্ষামূলকভাবে শ্মিড্টিয়া মেডিটেরেনিয়া প্রজাতির প্ল্যানারিয়ানদের সিক্রেটরি কোষগুলিকে সংক্রামিত করতে দেখানো হয়েছে, যার মধ্যে অযৌন পুনরুত্পাদন এবং যৌন স্ট্রেন উভয়ই রয়েছে। এটি একটি করোনভাইরাস জিনোমের অনুরূপ ক্রমের জন্য এই জীবগুলির প্রতিলিপি অনুসন্ধান করে আবিষ্কৃত হয়েছিল। এটি এই ধরনের একাধিক ট্রান্সক্রিপ্টোম ডেটাসেটগুলিতে উপস্থিত বলে মনে হয়, যা পরামর্শ দেয় যে ল্যাবরেটরি এস. মেডিটেরেনিয়ার সংক্রমণ সাধারণ, বিশেষ করে যৌন স্ট্রেনের ক্ষেত্রে। শ্রেণীবিভাগ পি. এস. সি. এন. ভি জিনোমের পাঁচটি স্বতন্ত্র প্রোটিন ক্ষেত্র রয়েছে যা সমস্ত নিডোভাইরাসের মধ্যে সংরক্ষিত রয়েছে। এর জিনোমের ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণের উপর ভিত্তি করে, এটি অন্যান্য নিডোভাইরাসগুলির সাথে ক্লাস্টার করে যা অমেরুদণ্ডী পোষককে সংক্রামিত করে। পি. এস. সি. এন. ভি হল ডুমেডিভাইরাস উপজাতির একমাত্র সদস্য, যা আলফামোনোনিভাইরাস গণের একমাত্র সদস্য। আর. এন. এ-নির্ভর আর. এন. এ পলিমারেজ (আর. ডি. আর. পি) ক্রমের উপর ভিত্তি করে আর. এন. এ ভাইরাস জিনোমের বড় গোষ্ঠীগুলির আরও বিশ্লেষণ নিডোভাইরাসগুলিকে তথাকথিত "পিকোর্নাভাইরাস সুপারগ্রুপে" রাখে, যা জিনোমের আকারের একটি বিশাল পরিসরে বিস্তৃত ভাইরাসগুলির একটি খুব বৈচিত্র্যময় গোষ্ঠী-পি. এস. সি. এন. ভি, বৃহত্তম আর. এন. এ ভাইরাস থেকে শুরু করে সোবেমোভাইরাস পর্যন্ত, ক্ষুদ্রতম আর. এন. এ ভাইরাসগুলির মধ্যে-এবং আর. ডি. আর. পি ছাড়া অন্য কোনও সাধারণ জিন ভাগ করে না। তথ্যসূত্র নিডোভাইরালেস ইনফ্রাস্পেসিফিক ভাইরাস ট্যাক্সা