ZNF548
জিঙ্ক ফিঙ্গার প্রোটিন 548 (ZNF548) হল একটি মানব প্রোটিন যা ZNF548 জিন দ্বারা এনকোড করা হয় যা ক্রোমোজোম 19-এ অবস্থিত। এটি নিউক্লিয়াসে পাওয়া যায় এবং আর. এন. এ পলিমারেজ 2 দ্বারা প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রণে একটি ভূমিকা পালন করে বলে অনুমান করা হয়। এটি ক্রুপেল সি2এইচ2-ধরনের দস্তা-আঙুল প্রোটিন পরিবারের অন্তর্গত কারণ এতে অনেক দস্তা-আঙুলের পুনরাবৃত্তি রয়েছে। জিন এই প্রোটিন কোডিং জিনটি 4987 বিপি লম্বা এবং প্রতিলিপি বৈকল্পিক 1 কে এনকোড করে যা দীর্ঘতম জেডএনএফ 548 আইসোফর্ম। এটি ক্রোমোজোম 19-এ পাওয়া যায়; প্লাস স্ট্র্যান্ডে এর সঠিক অবস্থান 19q13.43। জিনের 4টি এক্সোন রয়েছে যা একটি ক্রুপেল সম্পর্কিত বাক্স (কেআরএবি ডোমেন) এবং 11টি দস্তা আঙুলের পুনরাবৃত্তির জন্য এনকোড করে। ZNF548 জিনের প্রবর্তক 1198 বেস দীর্ঘ এবং ক্রোমোজোম 19-এ 57388850-57390047-এ অবস্থিত। প্রবর্তক অঞ্চলটি 6টি অর্থোলগে সংরক্ষিত রয়েছেঃ রিসাস ম্যাকাক (রিসাস বানর), প্যান ট্রোগলোডাইটস (শিম্পাঞ্জি), ওরিক্টোলাগাস কিউনিকুলাস (ইউরোপীয় খরগোশ), ইকুয়াস ক্যাবালাস (ঘোড়া), ক্যানিস লুপাস পরিচিত (কুকুর) এবং সুস স্ক্রোফা (শূকর)। প্রতিলিপি প্রতিলিপি বৈকল্পিক 1 হল দীর্ঘতম প্রতিলিপি এবং দীর্ঘতম প্রোটিন আইসোফর্ম (জেডএনএফ 548 আইসোফর্ম 1) এনকোড করে যা 545 অ্যামিনো অ্যাসিড দীর্ঘ। প্রতিলিপি বৈকল্পিক 2-এ এক্সন 2 অনুপস্থিত এবং ZNF548 আইসোফর্ম 2-কে এনকোড করে যা 533 অ্যামিনো অ্যাসিড দীর্ঘ। প্রোটিন ZNF548 ক্রুপেল C2H2-টাইপ জিঙ্ক ফিঙ্গার প্রোটিন পরিবারের অন্তর্গত কারণ এতে 11টি Cys2His2-টাইপ জিঙ্ক ফিঙ্গার রিপিট রয়েছে। প্রতিটি দস্তা আঙুলের একটি সংরক্ষিত ββα কাঠামো রয়েছে যেখানে একটি দস্তা পরমাণু C2H2 অবশিষ্টাংশ দ্বারা স্থির করা হয়। ZNF548 তার C2H2 Zn মোটিফের মাধ্যমে 44 বিপি দীর্ঘ ক্রমে ডিএনএর সাথে সংযুক্ত হতে সক্ষম, প্রতিটি 4 টি ডিএনএ ঘাঁটির সাথে আবদ্ধ। প্রোটিনে একটি ক্রুপেল-সম্পর্কিত বাক্স (কে. আর. এ. বি) রয়েছে যা এন টার্মিনাস-এ পাওয়া একটি ডোমেন এবং এতে একাধিক চার্জযুক্ত অ্যামিনো অ্যাসিড রয়েছে। এই ডোমেনটি প্রতিলিপিতে একটি ভূমিকা পালন করে; এটি কেএপি-1/টিআইএফ-1-বিটা কো-রিপ্রেসারের রিং-বি বক্স-কয়েল্ড কয়েল (আরবিসিসি) ডোমেনের সাথে আবদ্ধ হয়। আই-টাসার ব্যবহার করে জেড. এন. এফ. 548-এর তৃতীয় কাঠামোর পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। জেড. এন. এফ. 548-এর আণবিক ওজন 64 কে. ডি. এ এবং পূর্বাভাসকৃত আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দু 8,21। জেড. এন. এফ. 548-এর গঠনগত বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে অ্যালানাইন প্রত্যাশার চেয়ে কম শতাংশে পাওয়া গেছে এবং হিস্টিডিন মানব জেড. এন. এফ. 548-এ প্রত্যাশার চেয়ে অনেক বেশি শতাংশে পাওয়া গেছে। উপকোষীয় অভিব্যক্তি প্রোটিন নিউক্লিয়াসে পাওয়া যায় এবং সাইটোপ্লাজম বা মাইটোকন্ড্রিয়াতেও সনাক্ত করা যেতে পারে। মানুষের মধ্যে টিস্যু এক্সপ্রেশন ZNF548 এক্সপ্রেশন অন্যান্য প্রোটিনের তুলনায় তুলনামূলকভাবে কম। এর টিস্যু নির্দিষ্টতা কম; এটি সমস্ত মানব টিস্যুতে প্রকাশ এবং সনাক্ত করা হয়। নিউক্লিয়ার ডিস্ট্রিবিউশন প্রোটিন নুড-লাইক 1 (এন. ডি. ই. এল. 1) এবং ডিসরাপ্টেড ইন সিজোফ্রেনিয়া 1 (ডি. আই. এস. সি. 1) প্রোটিনের সঙ্গে মানুষের জেড. এন. এফ. 548 প্রোটিনের মিথস্ক্রিয়া দুটি সংকর খণ্ড পুলিং পদ্ধতি ব্যবহার করে পরীক্ষামূলকভাবে বৈধ করা হয়েছে। 36 (এল. আর. আর. সি. 36), মায়োট্যুবুলারিন 1 (এম. টি. এম. 1), মায়োট্যুবুলারিন সম্পর্কিত প্রোটিন 4 (এম. টি. এম. আর. 4) এবং আর. এন. এ বাইন্ডিং মোটিফ প্রোটিন 39 (আর. বি. এম. 39) যুক্ত লিউসিন সমৃদ্ধ পুনরাবৃত্তিও অ্যাফিনিটি ক্যাপচার-মাস স্পেকট্রোমেট্রি-র মাধ্যমে জেড. এন. এফ. 548 প্রোটিনের সাথে মিথস্ক্রিয়া করতে সনাক্ত করা হয়েছে। ফাংশন ZNF548 জিন এক্সপ্রেশনের সাথে যুক্ত হয়েছে কারণ এটি নিউক্লিক অ্যাসিডের পাশাপাশি দস্তা আয়নগুলির সাথেও আবদ্ধ হতে পারে। অন্যান্য কে. আর. এ. বি-জেড. এন. এফ প্রোটিনের কার্যকারিতার উপর ভিত্তি করে অনুমান করা হয় যে এটি আর. এন. এ পলিমারেজ 2 দ্বারা প্রতিলিপি করা প্রোটিন-এনকোডিং জিনের প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রণে ভূমিকা পালন করে। বিশেষত এটি একটি ডিএনএ-বাইন্ডিং ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর যা আরএনএ পলিমারেজ II দ্বারা প্রতিলিপি করা নির্দিষ্ট জিনের প্রতিলিপি বাড়ায় বা বাধা দেয়। এটি একটি ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর স্বীকৃতি ক্রমের সাথে আবদ্ধ হওয়ার ক্ষমতা রাখে যা তার দস্তা-আঙ্গুলের মাধ্যমে ট্রান্সক্রিপশন স্টার্ট সাইটের মতো একই স্ট্র্যান্ডে (সিআইএস) থাকে এবং নিউক্লিওপ্লাজমে কেআরএবি-জেডএনএফ/কেএপি কমপ্লেক্সের অংশ হয়ে ওঠে। কেআরএবি-জেডএনএফ প্রোটিনগুলি দমনকারী হিসাবে পরিচিত। অতএব, যখন একটি কে. আর. এ. বি-জেড. এন. এফ প্রোটিন, যেমন জেড. এন. এফ. 548, ডি. এন. এ-র সাথে আবদ্ধ থাকে এবং একই সাথে তার কে. আর. এ. বি ডোমেনের মাধ্যমে কে. এ. পি1 কো-রিপ্রেসারের সাথে আবদ্ধ হয়, তখন বিভিন্ন এনজাইম, যেমন হিস্টোন ডিঅ্যাসিটাইলেস, হিস্টোন মিথাইলট্রান্সফেরেস এবং হেটেরোক্রোমেটিন প্রোটিন, ক্রোমাটিন কাঠামোকে সংকুচিত করার জন্য এবং ফলস্বরূপ প্রতিলিপি প্রতিরোধ করার জন্য নিয়োগ করা হয়। ZNF548 প্রোটিনের অর্থোলোগ শুধুমাত্র স্তন্যপায়ী প্রাণীর বিভিন্ন শ্রেণীতে সংরক্ষিত অবস্থায় পাওয়া গেছে। এটি এই সত্যের সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ যে স্তন্যপায়ী প্রতিলিপির কারণগুলিতে সি2এইচ2-এর মতো ভাঁজ গোষ্ঠীগুলি খুব সাধারণ। কে. আর. এ. বি ডোমেনের পাশাপাশি দস্তা আঙুলের পুনরাবৃত্তি অর্থোলগ জুড়ে অত্যন্ত সংরক্ষিত। ZNF548-এর প্যারালগগুলিতে মানুষের মধ্যে 25টি প্যারালগাস প্রোটিন রয়েছে যা নীচের সারণিতে দেখা যায়। ক্লিনিকাল তাৎপর্য ZNF548 কে মেটা-ভাইরাস সিগনেচারে (MVS) একটি জিন হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছিল যা ভাইরাল সংক্রমণে আক্রান্ত ব্যক্তিদের ব্যাকটেরিয়া সংক্রমণে আক্রান্ত ব্যক্তিদের পাশাপাশি সুস্থ ব্যক্তিদের থেকে আলাদা করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। জেডএনএফ548 মাইক্রোআরএনএ এক্সপ্রেশন ডিম্বাশয়ের ক্যান্সার নির্ণয়ের জন্য একটি চিহ্নিতকারী হিসাবে কাজ করতে পারে। ZNF548 রক্তের জিন এক্সপ্রেশন বায়োমার্কার আত্মহত্যার জন্য একটি চিহ্নিতকারী হিসাবেও ব্যবহার করা যেতে পারে। তথ্যসূত্র মানব ক্রোমোজোমের উপর মানব প্রোটিন জিন 19 জিঙ্ক ফিঙ্গার প্রোটিন