DIMPL
ডি. আই. এম. পি. এল (ডিসকভারি অফ ইন্টারজেনিক মোটিফস পাইপলাইন) একটি বায়োইনফরম্যাটিক পাইপলাইন যা ব্যাকটেরিয়া সমৃদ্ধ আন্তঃজেনিক অঞ্চল (আই. জি. আর) নিষ্কাশন এবং নির্বাচন করতে সক্ষম করে যা কাঠামোগত নন-কোডিং আর. এন. এ (এন. সি. আর. এন. এ)-র জন্য সমৃদ্ধ। এন. সি. আর. এন. এ মোটিফ আবিষ্কারের জন্য ব্যাকটেরিয়াল আই. জি. আর সমৃদ্ধ করার পদ্ধতিটি প্রথম "ব্যাকটেরিয়ায় কাঠামোগত ননকোডিং আর. এন. এ-র জিনোম-ওয়াইড আবিষ্কার"-এর একটি গবেষণার জন্য রিপোর্ট করা হয়েছিল। ডি. আই. এম. পি. এল পাইপলাইন আই. জি. আরগুলি বের করে, দৈর্ঘ্য এবং নিউক্লিক অ্যাসিড গঠন দ্বারা তাদের ফিল্টার করে এবং প্রার্থী মোটিফগুলি সনাক্ত করতে এবং তাদের সম্ভাব্য কার্যকারিতা নির্ধারণের জন্য প্রয়োজনীয় তথ্য সংগ্রহ করে মোট জিনোম বিশ্লেষণের প্রক্রিয়াটিকে স্বয়ংক্রিয় করে। ডি. আই. এম. পি. এল পাইপলাইন সাপোর্ট ভেক্টর মেশিন (এস. ভি. এম) শ্রেণীবিভাগের মাধ্যমে এন. সি. আর. এন. এ-র জন্য সমৃদ্ধ জিনোমিক অঞ্চলগুলি সনাক্ত করার জন্য পুনরুত্পাদনযোগ্য কৌশল সরবরাহ করে। রাইবোসুইচের মতো উপাদান, আপস্ট্রিম ওপেন রিডিং ফ্রেম (ইউওআরএফ), শর্ট ওপেন রিডিং ফ্রেম (এসওআরএফ), রাইবোসোমাল প্রোটিন লিডার সিকোয়েন্স, স্বার্থপর জেনেটিক উপাদান এবং অজানা ক্রিয়াকলাপের অন্যান্য কাঠামোগত আরএনএ মোটিফ সহ নিউক্লিক অ্যাসিড এবং প্রোটিন মোটিফগুলি সন্ধান করতে এটি ব্যবহার করা যেতে পারে। ডি. আই. এম. পি. এল বিভিন্ন ক্রম বিশ্লেষণ সংস্থান ব্যবহার করে, যার মধ্যে রয়েছেঃ পরিচিত আর. এন. এ পরিবারের বি. এল. এ. এস. টি. এক্স অনুসন্ধান সরঞ্জামের একটি রেফারেন্স হিসাবে আর. এফ. এ. এম. ডাটাবেস, অপ্রকাশিত প্রোটিন কোডিং অঞ্চলগুলির ইনফারনাল প্যাকেজ নির্মূল করতে, আই. জি. এস. স সিকোয়েন্স সিএমফাইন্ডার অনুসন্ধান করতে, সম্ভাব্য আর. এন. এ গৌণ কাঠামোর বৈশিষ্ট্যগুলি আর-স্কেপ সফ্টওয়্যার এবং আর2আর ড্রয়িং অ্যালগরিদম সন্ধান করতে, সর্বসম্মত মডেল আর. এন. এ কোড তৈরি করতে, কোডিং অঞ্চলের উপস্থিতি সন্ধান করতে জিনোমভিউ, ডি. আই. এম. পি. এল ব্যবহার করে আবিষ্কৃত আর. এন. এ মোটিফের জিনগত প্রসঙ্গ কল্পনা করতে এইচ. এম. পি-পিপি রাইবোসুইচ, আই. সি. ডি-2 এন. সি. আর. এন. এ মোটিফ, কার এ এন. সি. আর. এন. এ মোটিফ, এল. ডি. এইচ. 2 এন. সি. আর. এন. এ মোটিফ, অন্যদের মধ্যে। তথ্যসূত্র বায়োইনফরমেটিক্স গণনামূলক জীববিজ্ঞান