ORF9c
ORF9c (পূর্বে ORF14 নামেও পরিচিত) হল সাবজেনাস সারবেকোভাইরাসের করোনভাইরাস জিনোমের একটি ওপেন রিডিং ফ্রেম (ORF)। এটি সার্স-কোভ-2 জিনোমে 73টি কোডন দীর্ঘ। যদিও এটি প্রায়শই সারবেকোভাইরাস ভাইরাল আনুষঙ্গিক প্রোটিন জিনের তালিকায় অন্তর্ভুক্ত থাকে, পরীক্ষামূলক এবং জৈব তথ্যবিজ্ঞানের প্রমাণ থেকে জানা যায় যে ওআরএফ9সি একটি কার্যকরী প্রোটিন-কোডিং জিন নাও হতে পারে। নামকরণ বৈজ্ঞানিক সাহিত্যে এই জিনের জন্য ব্যবহৃত নামকরণের মধ্যে অসঙ্গতি রয়েছে। SARS-CoV-এর উপর কিছু কাজে, এটিকে ORF14 হিসাবে উল্লেখ করা হয়েছে। এটিকে কখনও কখনও ওআরএফ9বি হিসাবে উল্লেখ করা হয়েছে, যখন এর দীর্ঘ উজানের প্রতিবেশী ওআরএফ9বি-কে ওআরএফ9এ নাম দেওয়া হয়েছিল। বর্তমান প্রস্তাবিত নামকরণ এই জিনটিকে ও. আর. এফ9সি এবং উজানের জিনটিকে ও. আর. এফ9বি হিসাবে উল্লেখ করে। অভিব্যক্তি এবং মিথস্ক্রিয়া ORF9c হল দুটি ওভারল্যাপিং জিনের মধ্যে একটি যা সম্পূর্ণরূপে এন জিন এনকোডিং করোনভাইরাস নিউক্লিওক্যাপসিড প্রোটিনের ওপেন রিডিং ফ্রেমের মধ্যে রয়েছে, অন্যটি হল ORF9b। SARS-CoV-2 সংক্রমণের সময় ORF9c কার্যকরীভাবে প্রকাশ করা হয় কিনা তা স্পষ্ট নয়; এটি পরীক্ষামূলক পরিস্থিতিতে অনুবাদ করা হয় না বলে জানা গেছে। যখন পরীক্ষামূলকভাবে অতিরিক্তভাবে প্রকাশ করা হয়, তখন প্রোটিন সিগমা রিসেপ্টর এবং এনএফ-কেবি পথের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে। সার্স-কোভ প্রোটিন স্ব-মিথস্ক্রিয়া গঠন করে যা প্রোটিন ডাইমার বা উচ্চ-ক্রমের অলিগোমার গঠনের পরামর্শ দেয়। SARS-CoV এবং SARS-CoV-2-এর মধ্যে বিবর্তন ORF9c-এর প্রায় 74 শতাংশ অনুক্রম পরিচয় রয়েছে। SARS-CoV-2 রূপগুলি চিহ্নিত করা হয়েছে যেখানে অকাল স্টপ কোডনগুলি প্রবর্তিত হয় বা যেখানে এর শুরু কোডনটি হারিয়ে যায় এবং অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রমটি দুর্বলভাবে সংরক্ষিত হয়, এই অনুমানকে সমর্থন করে যে এটি একটি কার্যকরী প্রোটিনকে এনকোড করে না। তথ্যসূত্র করোনাভাইরাস প্রোটিন