Q-FISH
কোয়ান্টিটেটিভ ফ্লুরোসেন্ট ইন সিটু হাইব্রিডাইজেশন (কিউ-ফিশ) ঐতিহ্যবাহী মাছ পদ্ধতির উপর ভিত্তি করে একটি সাইটোজেনেটিক কৌশল। কিউ-ফিশ-এ, কৌশলটি ফ্লুরোসেন্ট মাইক্রোস্কোপি এবং বিশ্লেষণ সফ্টওয়্যার ব্যবহার করে ক্রোমোসোমাল ডিএনএ-তে লক্ষ্য ক্রমের পরিমাণ নির্ধারণ করতে পেপটাইড নিউক্লিক অ্যাসিড (পিএনএ) অলিগোনিউক্লিওটাইড নামক লেবেলযুক্ত (সাই3 বা এফআইটিসি) সিন্থেটিক ডিএনএ অনুকরণ ব্যবহার করে। কিউ-ফিশ সাধারণত টেলোমের দৈর্ঘ্য অধ্যয়নের জন্য ব্যবহৃত হয়, যা মেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে ক্রোমোজোমের দূরবর্তী প্রান্তে অবস্থিত পুনরাবৃত্তিমূলক হেক্সামেরিক সিকোয়েন্স (টিটিএজিজিজি)। ডি. এন. এ-ক্ষতির প্রতিক্রিয়ার পাশাপাশি জিনোমের অস্থিতিশীলতা প্রতিরোধের জন্য ক্রোমোজোমের প্রান্তে টেলোমেরের প্রয়োজন হয়। আজও টেলোমিয়ার গবেষণার ক্ষেত্রে কিউ-ফিশ পদ্ধতি ব্যবহার করা হচ্ছে। পিএনএ এবং মাছ পিএনএ ব্যাকবোনে কোনও চার্জড ফসফেট গ্রুপ না থাকার কারণে, পিএনএ এবং ডিএনএর মধ্যে বন্ধন ডিএনএ/ডিএনএ বা ডিএনএ/আরএনএ ডুপ্লেক্সের চেয়ে শক্তিশালী। কিউ-ফিশ পিএনএ-র এই অনন্য বৈশিষ্ট্যটি ব্যবহার করে যেখানে কম আয়নিক শক্তিতে, পিএনএগুলি পরিপূরক একক-আটকে থাকা ডিএনএ সিকোয়েন্সগুলিতে অ্যানিল করতে পারে যেখানে একক-আটকে থাকা ডিএনএ করতে পারে না। শুধুমাত্র লেবেলযুক্ত (সি. সি. সি. টি. এ. এ) 3 পি. এন. এ-কে (টি. টি. এ. জি. জি. জি) এন টার্গেট সিকোয়েন্সগুলিতে সংকরিত করার অনুমতি দেয় এমন শর্তগুলি ব্যবহার করে, কিউ-ফিশ পি. এন. এ-গুলির টেলোমেরিক সিকোয়েন্সগুলিতে সংকরকরণের পরিমাণ নির্ধারণ করতে সক্ষম। কালচার্ড কোষের জন্য সাধারণ পদ্ধতি/প্রটোকল মেটাফেজ-গ্রেপ্তার কোষ প্রস্তুত করে কালচার্ড কোষগুলি সংগ্রহের কয়েক ঘন্টা আগে, কালচার মাধ্যমের সাথে কোলসেমিড যোগ করা হয়। কোলসেমিড মাইটোটিক কোষে মাইক্রোটিউবিউলগুলিকে ব্যাহত করে মেটাফেজ অবস্থায় কোষগুলিকে আটকাতে কাজ করে। কোষগুলি তারপর ট্রিপসিনাইজ করা হয় এবং একটি হাইপোটোনিক বাফার-এ পুনরায় স্থগিত করা হয়। এটি সংগৃহীত কোষগুলিকে স্ফীত করবে এবং ক্রোমোজোমগুলি ছড়িয়ে দেবে। কোষ স্থির করুন হাইপোটোনিক দ্রবণটি সেন্ট্রিফিউগেশনের মাধ্যমে অপসারণ করা হয় এবং একটি মিথানল/হিমবাহ অ্যাসিটিক অ্যাসিডে পুনরায় স্থগিত করা হয়। স্লাইড প্রস্তুত করুন একটি মাইক্রোস্কোপ স্লাইডে সেল সাসপেনশনের কয়েক ফোঁটা রাখুন এবং সারা রাত বাতাসকে শুকিয়ে যেতে দিন। পরের দিন, কয়েক মিনিটের জন্য ফসফেট বাফার্ড স্যালাইনে (পিবিএস) স্লাইডটি নিমজ্জিত করুন। স্লাইডগুলি ফর্মালডিহাইডে ঠিক করুন স্লাইডগুলি 4 শতাংশ ফর্মালডিহাইড দ্রবণে স্থানান্তর করুন এবং কয়েক মিনিটের জন্য ঠিক করুন। পি. বি. এস দিয়ে কয়েকবার স্লাইড ধুয়ে নিন। পেপসিন স্লাইড দিয়ে ট্রিট স্লাইডগুলি তারপর একটি পেপসিন দ্রবণে স্থানান্তরিত হয়। পেপসিন একটি প্রোটিয়াস এবং প্রোটিনকে পেপটাইডে পরিণত করার কাজ করে। হাইব্রিডাইজ পিএনএ প্রোব (সাই3 বা এফআইটিসি লেবেলযুক্ত পিএনএ) হাইব্রিডাইজেশন মিশ্রণের একটি ছোট ভলিউম একটি কভারস্লিপে স্থাপন করা হয় এবং তারপর মাইক্রোস্কোপ স্লাইডে আলতো করে স্থাপন করা হয় যেখানে স্থির কোষগুলি থাকে। তাপ বিকৃতি ডিএনএ স্লাইডটি তারপর একটি প্রাক-উত্তপ্ত ওভেনে স্থাপন করা হয় যেখানে কোষের ক্রোমোজোমাল ডিএনএ কয়েক মিনিটের জন্য 80 ডিগ্রি সেলসিয়াসে বিকৃত করা হয়। পি. এন. এ-কে পরিপূরক ডি. এন. এ-তে সংকরিত করার অনুমতি দেওয়ার জন্য স্লাইডটি কয়েক ঘন্টার জন্য ঘরের তাপমাত্রায় রেখে দেওয়া হয়। আনবাউন্ড পিএনএ অপসারণের জন্য স্লাইডগুলি ধুয়ে ফেলুন এবং পাল্টা দাগযুক্ত ডিএনএ (ডিএপিআই বা পিআই) স্লাইডগুলি পরে আনবাউন্ড পিএনএ অপসারণের জন্য বিভিন্ন ধোয়ার দ্রবণে সাবধানে ধুয়ে ফেলা হয়। মাইক্রোস্কোপ মাউন্টিং মিডিয়াম তারপর কোষের উপর স্থাপন করা হয়। এই মাধ্যমটিতে সাধারণত ডিএপিআই (একটি ডিএনএ কাউন্টারস্টেন) এবং পিএনএ ফ্লুরোসেন্স সংরক্ষণ এবং ফটোব্লিচিং হ্রাস করার জন্য একটি অ্যান্টিফেড সমাধান থাকে। ছবি তোলা এবং বিশ্লেষণ পরীক্ষামূলক নমুনাগুলি ছবি তোলার আগে, ক্যামেরা এবং ফ্লুরোসেন্ট মাইক্রোস্কোপের যথাযথ সেট-আপ নিশ্চিত করার জন্য ফ্লুরোসেন্ট রেফারেন্স পুঁতির ছবি তোলা হয়। উপরন্তু, এই রেফারেন্স পুঁতিগুলি প্রতিটি অধিগ্রহণ অধিবেশনের আগে চিত্রায়িত করা হবে। এটি নিশ্চিত করবে যে নমুনাগুলির মধ্যে পার্থক্য ল্যাম্প বা ক্যামেরার ত্রুটির কারণে নয়। একটি মেটাফেজ সেল তারপর ম্যানুয়ালি নির্বাচন করা হয় এবং ক্যামেরার জন্য কেন্দ্রীভূত করা হয়। দুই ধরনের ছবি তোলা হয়ঃ মেটাফেজ অবস্থায় দাগযুক্ত ক্রোমোজোমের ছবি এবং টেলোমেরেসের ফ্লুরোসেন্ট ছবি। দুটি ছবি তখন একটি সম্মিলিত চিত্র তৈরি করতে সুপারইম্পোজ করা যেতে পারে। এই চিত্রটি তখন ক্যারিওটাইপ বা নির্ধারিত নামকরণ করা যেতে পারে। উপরন্তু, p-বাহু বনাম q-বাহুতে টেলোমের দৈর্ঘ্যের আন্তঃ-ক্রোমোসোমাল বন্টন পরিমাপ করা যেতে পারে। বিভিন্ন পরীক্ষার তথ্য ফ্লুরোসেন্সের তীব্রতা স্বাভাবিক করতে ব্যবহার করা যেতে পারে, অন্যদিকে পরিচিত সংখ্যক টেলোমেরিক পুনরাবৃত্তি সহ প্লাজমিডগুলি টেলোমের ফ্লুরোসেন্স এবং টেলোমের দৈর্ঘ্যের সাথে সম্পর্কিত করতে সহায়তা করার জন্য মান হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে। ফ্লুরোসেন্ট রেফারেন্স পুঁতি ছাড়াও, বোন ক্রোমাটিডস থেকে সংকেত শক্তি সমান হওয়া উচিত এবং তাই তথ্যের নির্ভুলতা পরিমাপ করার জন্য অন্য নিয়ন্ত্রণ হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে। সবশেষে, এটি গুরুত্বপূর্ণ যে ছবিগুলি স্যাচুরেটেড নয়। যদি ফ্লুরোসেন্সের তীব্রতা স্যাচুরেশনে পৌঁছায়, তাহলে টেলোমেরের দৈর্ঘ্যকে অবমূল্যায়ন করা হয়। কিউ-ফিশ চিত্র বিশ্লেষণ সফ্টওয়্যার ফ্লিন্টবক্স নেটওয়ার্ক থেকে বিনামূল্যে পাওয়া যায়। টেলোমের দৈর্ঘ্যের বিতরণ সম্পর্কিত তথ্য পরিমাপ করতে এবং এটিকে বিভিন্ন অসুস্থতার সাথে যুক্ত করতে অ্যাপ্লিকেশন এবং তাৎপর্য কিউ-ফিশ ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়েছে। এই প্রসঙ্গে, কিউ-ফিশ বিশেষভাবে প্রাসঙ্গিক কারণ এটি সমালোচনামূলকভাবে সংক্ষিপ্ত টেলোমিয়ারগুলি সনাক্ত এবং পরিমাপ করতে সক্ষম। এটি দেখানো হয়েছে যে টেলোমিয়ারের গড় দৈর্ঘ্যের পরিবর্তে এই সমালোচনামূলকভাবে ছোট টেলোমিয়ারগুলির ফ্রিকোয়েন্সি, যা টেলোমিয়ার কর্মহীনতার ক্ষেত্রে গুরুত্বপূর্ণ। কিউ-ফিশ টেলোমিয়ারের দৈর্ঘ্য সম্পর্কে সঠিক তথ্য সরবরাহ করে, তবে কিউ-ফিশকে অন্যান্য মাছ সম্পর্কিত কৌশল যেমন ফ্লো-ফিশ-এর সাথে একত্রিত করে এর প্রাসঙ্গিকতা বাড়ানো যেতে পারে। ফ্লো-ফিশ-এ, ফ্লো সাইটোমেট্রি কিউ-ফিশ-এ মাত্র কয়েকটি কোষের পরিবর্তে কোষের একটি বড় জনসংখ্যায় ফ্লুরোসেন্স তীব্রতা (এবং এইভাবে টেলোমিয়ার দৈর্ঘ্য) পরিমাপ করতে ব্যবহৃত হয়। বিপরীতভাবে, কিউ-ফিশ-এর বিপরীতে, ফ্লো-ফিশ একটি পৃথক কোষের মধ্যে একটি নির্দিষ্ট ক্রোমোসোমে টেলোমের দৈর্ঘ্য নির্ধারণ করতে অক্ষম। যাইহোক, যদিও কিউ-ফিশকে সাধারণত কম-থ্রুপুট হিসাবে বিবেচনা করা হয় এবং জনসংখ্যা অধ্যয়নের জন্য উপযুক্ত নয়, গোষ্ঠীগুলি উচ্চ-থ্রুপুট (এইচটি) কিউ-ফিশ প্রোটোকল তৈরি করেছে যা 96 ওয়েল প্লেটে ইন্টারফেজ নিউক্লিয়াসের উপর কিউ-ফিশ সম্পাদনের জন্য স্বয়ংক্রিয় যন্ত্রপাতি ব্যবহার করে। একইভাবে, মাল্টিপ্লেক্স-ফিশ এবং সেনএম-ফিশ-এর মতো অন্যান্য পদ্ধতিও তৈরি করা হয়েছে যা কিউ-ফিশ-এর সঙ্গেও ব্যবহার করা যেতে পারে। মাল্টিপ্লেক্স-ফিশ বিভিন্ন রঙে 24টি ক্রোমোজোম কল্পনা করতে এবং আন্তঃ-বা আন্তঃ-ক্রোমোজোমাল পুনর্বিন্যাস সনাক্ত করতে বিভিন্ন ধরনের অনুসন্ধান ব্যবহার করে। সেন্ট্রোমিয়ার-নির্দিষ্ট মাল্টি-কালার ফিশ (সিএনএম-ফিশ) মাল্টিপ্লেক্স-ফিশ থেকে মাল্টি-কালার প্রোবের পাশাপাশি সেন্ট্রোমিয়ার অঞ্চলগুলি সনাক্ত ও আলাদা করার জন্য সেন্ট্রোমিয়ার নির্দিষ্ট লেবেলযুক্ত প্রোব ব্যবহার করে। সেন্ট্রোমিয়ার অস্বাভাবিকতা বা ক্রোমোসোমাল পুনর্বিন্যাস এবং টেলোমিয়ার দৈর্ঘ্যের মধ্যে সম্পর্ক উচ্চ ক্লিনিকাল প্রভাব ফেলতে পারে, কারণ এগুলি প্রাক বা প্রসবোত্তর রোগ নির্ণয় এবং টিউমার বিকাশে গুরুত্বপূর্ণ বলে মনে হয়। এই পরীক্ষাগুলি টেলোমিয়ারের ভূমিকা এবং টেলোমিয়ার দৈর্ঘ্যের গুরুত্ব সম্পর্কে আরও আলোকিত করতে পারে। কিউ-ফিশ-এর আরেকটি প্রয়োগ হল টেলোমেরিক ফিউশন সনাক্তকরণ, যেখানে ক্রোমোজোমের প্রান্তগুলি টেলোমেরে একসাথে সংযুক্ত করা হয়েছে, যাকে কখনও কখনও ইন্টারস্টিশিয়াল (ক্রোমোজোমের মধ্যে) টেলোমেরিক সিকোয়েন্স (আইটিএস) বলা হয়। টেলোমেরিক ফিউশন অধ্যয়ন কখনও কখনও বিবর্তনের গতিপথ দেখাতে পারে। উদাহরণস্বরূপ, একটি মানব ক্রোমোজোমের একটি আইটিএস থাকে যা শিম্পাঞ্জির দুটি ক্রোমোজোমের সমতুল্য বলে অনুমান করা হয় যা একসাথে মিশে যায়। বিভিন্ন প্রজাতির টেলোমের দৈর্ঘ্যের নিয়ন্ত্রণ পর্যবেক্ষণ করা ক্যারিওটাইপ বিবর্তন এবং মানুষের অসুস্থতার প্রাসঙ্গিকতা সম্পর্কে গুরুত্বপূর্ণ তথ্যও প্রকাশ করে। আরেকটি উদাহরণে, নন-হোমোলোগাস এন্ড জয়েনিং (এন. এইচ. ই. জে) প্রোটিন ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডি. এন. এ ব্রেক মেরামত করে এবং কাজ করার জন্য কে. ইউ. 70/কে. ইউ. 80 হেটেরোডাইমারের উপর নির্ভর করে। এই প্রোটিনগুলিকে ব্যাহত করার ফলে টেলোমেরিক ছোট হয়ে যায়, যা মাছের সাহায্যে টেলোমেরের দৈর্ঘ্য পরিমাপ করে পর্যবেক্ষণ করা যেতে পারে। উদাহরণস্বরূপ, কিউ 80 জিনের অভাব রয়েছে এমন ইঁদুরের মধ্যে টেলোমের দৈর্ঘ্য কিউফিশ দ্বারা পরিমাপ করা হয় এবং উল্লেখযোগ্যভাবে ছোট বলে মনে করা হয়। কিউ-ফিশ সাধারণত ক্যান্সার গবেষণায় ক্যান্সারযুক্ত এবং অ-ক্যান্সারযুক্ত কোষের মধ্যে টেলোমের দৈর্ঘ্যের পার্থক্য পরিমাপ করতে ব্যবহৃত হয়। টেলোমের সংক্ষিপ্তকরণ জিনোমিক অস্থিতিশীলতা সৃষ্টি করে এবং বয়স বাড়ার সাথে সাথে প্রাকৃতিকভাবে ঘটে, উভয় কারণই ক্যান্সারের সম্ভাব্য কারণগুলির সাথে সম্পর্কিত। কিউ-ফিশ-এর সুবিধা অন্যান্য মাছ ধরার কৌশলের তুলনায় কিউ-ফিশ-এর সবচেয়ে বড় সুবিধা হল কৌশলটির পরিমাণগত ক্ষমতা। ডিএনএ প্রোব ব্যবহার করে এমন ঐতিহ্যবাহী মাছের তুলনায়, পরিমাণগত তথ্য অর্জন করা কঠিন কারণ সংকরকরণ প্রোবগুলি পরিপূরক জিনোমিক ডিএনএ স্ট্র্যান্ডের পুনর্নবীকরণের সাথে প্রতিযোগিতা করে। অতএব, পিএনএ ব্যবহার করে এবং খুব কঠোর পরিস্থিতিতে তাদের সংকরকরণ করে, এটি একজনকে এই সমস্যাটি কাটিয়ে উঠতে সহায়তা করে। একইভাবে, যেহেতু কেউ পি. এন. এ প্রোবের উপস্থিতিতে ক্রোমোজোমাল ডি. এন. এ-কে বিকৃত করতে সক্ষম হয়, এটি মাছ প্রক্রিয়াটিকে সহজতর করে। উপরন্তু, পদ্ধতিটি বৃহত্তর রেজোলিউশন প্রদান করে, যা ব্যবহারকারীকে একটি নির্দিষ্ট কোষে প্রতিটি পৃথক ক্রোমোজোমের (পি বা কিউ আর্ম) টেলোমিয়ার দৈর্ঘ্য পরীক্ষা করার অনুমতি দেয়। এছাড়াও, একটি ব্লটের জন্য 105 টিরও বেশি কোষের প্রয়োজন হয় এমন সাউদার্ন ব্লটের বিপরীতে, কিউ-ফিশ-এ 30 টিরও কম কোষের প্রয়োজন হয়। কিউ-ফিশ-এর অসুবিধাগুলি এর সুবিধা থাকা সত্ত্বেও, কিউ-ফিশ বেশ শ্রম-নিবিড় এবং সাধারণত উচ্চ থ্রুপুট বিশ্লেষণের জন্য উপযুক্ত নয়। কৌশলটি ভালভাবে প্রস্তুত মেটাফেজ কোষের উপর নির্ভর করে এবং পরিমাপ সঠিক হওয়ার জন্য সরঞ্জাম এবং নমুনাগুলি সঠিকভাবে সামঞ্জস্য/স্বাভাবিক করা অতীব গুরুত্বপূর্ণ। এছাড়াও, শুধুমাত্র অল্প পরিমাণে কোষের প্রয়োজন হলেও, একবারে মেটাফেজে পর্যাপ্ত সংখ্যা পাওয়া কঠিন। উপরন্তু, দুর্বল ক্রোমোজোম অঙ্গসংস্থান প্রস্তুতির সময় উচ্চ তাপমাত্রার অতিরিক্ত এক্সপোজারের ফলে হতে পারে। একইভাবে, যদি কেউ বিভিন্ন ধরনের কোষ ব্যবহার করে, তবে কিউ-ফিশ-এর অনেক ধাপের (যেমন কোলসেমিড চিকিৎসার দৈর্ঘ্য) অপ্টিমাইজেশনের প্রয়োজন হবে। ফ্লুরোসেন্স মাইক্রোস্কোপির একটি সাধারণ সমস্যা হল ফটোব্লিচিং, যেখানে আলোর সংস্পর্শে আসার ফলে ফ্লুরোফোর তার ক্রিয়াকলাপ হারায়। এর ফলে প্রতিদীপ্তি তীব্রতার ভুল পরিমাপ হতে পারে। ফটোব্লিচিং, আলোর উৎসের স্থিতিশীলতা এবং সিস্টেমের পরিবর্তনশীলতা সবই ত্রুটির উৎস তবে ব্যবহারকারী যদি নমুনার মধ্যে অধিগ্রহণের সময় কমাতে এবং সঠিক নিয়ন্ত্রণগুলি অন্তর্ভুক্ত করতে সক্ষম হন তবে তা হ্রাস করা যেতে পারে। ধ্রুপদী কৌশল কিউ-ফিশ এবং পিএনএ-র বিকাশের আগে, টেলোমিয়ারের দৈর্ঘ্য পরিমাপের ধ্রুপদী কৌশল ছিল সাউদার্ন ব্লটের ব্যবহার। এই পদ্ধতিতে, জিনোমিক ডিএনএ সীমাবদ্ধ এনজাইম ব্যবহার করে পচানো হয় এবং জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিস দ্বারা পৃথক করা হয়। ডিএনএ তারপর একটি ঝিল্লিতে স্থানান্তরিত হয় এবং তেজস্ক্রিয় বা ফ্লুরোসেন্ট টেলোমেরিক ডিএনএ প্রোব ব্যবহার করে সংকরিত হয়। যাইহোক, এই পদ্ধতিটি শুধুমাত্র একটি কোষের জনসংখ্যার গড় টেলোমের দৈর্ঘ্য মূল্যায়ন করতে সক্ষম এবং জিনোমে ইন্টেরস্টিশিয়াল টেলোমেরিক সিকোয়েন্সের উপস্থিতি ভুল পরিমাপ করতে পারে। কিউ-ফিশ ফ্লো-ফিশ-এর বৈচিত্র্য কিউ-ফিশ-এর অনুরূপ, ফ্লো-ফিশ হল কিউ-ফিশ-এর একটি অভিযোজন যা ফ্লো সাইটোমেট্রি-র সঙ্গে পি. এন. এ-র ব্যবহারকে একত্রিত করে। এই পদ্ধতিতে, ফ্লো-ফিশ মেটাফেজ ক্রোমোজোমের পরিবর্তে ইন্টারফেজ কোষ ব্যবহার করে এবং সাসপেনশনে পিএনএ প্রোবগুলিকে সংকর করে। সংকরকরণের পরে, তুলনামূলকভাবে অল্প সময়ের মধ্যে একটি ফ্লো সাইটোমিটারে হাজার হাজার কোষ বিশ্লেষণ করা যেতে পারে। যাইহোক, ফ্লো-ফিশ শুধুমাত্র প্রতিটি কোষের জন্য একটি গড় টেলোমেরিক দৈর্ঘ্য প্রদান করে যেখানে কিউ-ফিশ একটি পৃথক ক্রোমোজোমের টেলোমের দৈর্ঘ্য বিশ্লেষণ করতে সক্ষম। পি. এন. এ-ফিশ যদিও কিউ-ফিশ-এর পরিমাণগত ক্ষমতা টেলোমিয়ার গবেষণায় সর্বাধিক ব্যবহৃত হয়, তবে অন্যান্য ক্ষেত্র যেখানে শুধুমাত্র গুণগত তথ্যের প্রয়োজন হয়, তারা গবেষণা এবং রোগ নির্ণয়ের উদ্দেশ্যে মাছের সাথে পি. এন. এ-র ব্যবহার গ্রহণ করেছে। ক্লিনিকের মধ্যে দ্রুত সংক্রামক রোগ শনাক্ত ও নির্ণয়ের জন্য পি. এন. এ-ফিশ পরীক্ষা তৈরি করা হয়েছে। ইতিবাচক রক্ত সংস্কৃতির ঐতিহ্যবাহী গ্রাম দাগের সাথে মিলিত হয়ে, পিএনএগুলি ব্যাকটেরিয়া বা খামিরের বিভিন্ন স্ট্রেন সনাক্ত করতে প্রজাতি-নির্দিষ্ট আরআরএনএ (রাইবোসোমাল আরএনএ) লক্ষ্য করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। যেহেতু পরীক্ষাটি তুলনামূলকভাবে দ্রুত করা যেতে পারে, তাই হাসপাতালগুলিতে ব্যবহারের জন্য পরীক্ষাটি বিবেচনা করা হচ্ছে যেখানে হাসপাতাল-অর্জিত সংক্রমণ ঘটতে পারে। কো-ফিশ (ক্রোমোজোম ওরিয়েন্টেশন-ফিশ) আরেকটি অভিযোজন যা পিএনএ এবং ফিশ ব্যবহার করে তা কো-ফিশ (ক্রোমোজোম ওরিয়েন্টেশন-ফিশ) নামে পরিচিত যা একটি নির্দিষ্ট পদ্ধতিতে পিএনএ সহ ক্রোমোজোমের লেবেলিংয়ের অনুমতি দেয়। এই পদ্ধতিতে ডি. এন. এ-র সদ্য প্রতিলিপি করা স্ট্র্যান্ডগুলি (বি. আর. ডি. ইউ সংযোজন ব্যবহারের মাধ্যমে) বাছাই করে অপসারণ করা হয়, যার ফলে শুধুমাত্র একক আটকে থাকা লক্ষ্য ডি. এন. এ হয়। বিভিন্ন রঙিন একমুখী পি. এন. এ প্রোব ব্যবহার করে, বোন ক্রোমাটিডগুলিকে অনন্যভাবে লেবেল করা সম্ভব হয়। তথ্যসূত্র সাইটোজেনেটিক্স