Very short patch repair
খুব ছোট প্যাচ (ভিএসপি) মেরামত একটি ডিএনএ মেরামত ব্যবস্থা যা 5-মিথাইলসাইটোসিনের থাইমাইনে ডিঅ্যামিনেশন দ্বারা সৃষ্ট জিটি অসামঞ্জস্যগুলি সরিয়ে দেয়। এই ব্যবস্থাটি বিদ্যমান কারণ গ্লাইকোসিলেসগুলি যা সাধারণত ডিঅ্যামিনেটেড ঘাঁটিগুলিকে লক্ষ্য করে থাকে তা থাইমিনকে লক্ষ্য করতে পারে না (এটি ডিএনএর নিয়মিত চারটি ঘাঁটির মধ্যে একটি)। সিস্টেমের উপাদানগুলি হল মিউটস, যা জিটি অসামঞ্জস্যের সাথে আবদ্ধ হয়, ভিএসআর এন্ডোনিউক্লিজ, যা ডিএনএ কেটে দেয় এবং মিউটএল, যা ইউভিআরডি হেলিকেজ নিয়োগ করে। ভিএসআর (খুব সংক্ষিপ্ত প্যাচ মেরামত) এন্ডোনিউক্লিয়াস বিভিন্ন ব্যাকটেরিয়ায় ঘটে। যদি মূল জোড়াটি পরিবর্তিত হয় বা ক্ষতিগ্রস্ত হয় তবে তারা কেটে বা বরং ডিএনএতে একটি নিক তৈরি করে কাজ করে। ডি. এন. এ-র মূল জোড়ায় ফাংশন মিউটেশন জীবের জন্য ক্ষতিকারক হতে পারে। বিশেষত, সি থেকে টি মিউটেশন প্রায়শই সাইটোসিনের মিথাইলেশনের কারণে ঘটে। অতএব, ভি. এস. আর এন্ডোনিউক্লিয়াসের একটি ফাংশন রয়েছে কোষকে পরিবর্তিত ডি. এন. এ দ্বারা সৃষ্ট ক্ষতি থেকে রক্ষা করার জন্য। প্রক্রিয়া ভি. এস. আর মিথাইলিত সাইটোসিনের স্বতঃস্ফূর্ত ডিঅ্যামিনেশনের পরে উত্পন্ন একটি টি. জি মিলহীন বেস জুটিকে সনাক্ত করে এবং এটি থাইমাইনের 5 'পাশে ফসফেট মেরুদণ্ডকে বিভক্ত করে একক স্ট্র্যান্ডে একটি নিক তৈরি করে। তারপর ডি. এন. এ পলিমারেজ-1 টি এবং 3 'স্ট্র্যান্ডের কিছু নিউক্লিওটাইড সরিয়ে দেয় এবং তারপর প্যাচটিকে পুনরায় সংশ্লেষিত করে। উপরন্তু, জিটি অসামঞ্জস্যগুলি মেরামত না করা হলে সি-টু-টি রূপান্তরের দিকে নিয়ে যেতে পারে। ভিএসআর জি-ধারণকারী স্ট্র্যান্ডের পক্ষে অসামঞ্জস্যগুলি মেরামত করে। এসচেরিচিয়া কোলিতে, এই এন্ডোনিউক্লিয়াস থাইমিডিনের অবশিষ্টাংশের পাশে সিটি (এটি) জিএন বা এনটি (এটি) জিজি অনুক্রমের মধ্যে ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএকে নিষ্ক্রিয় করে, যা 2 '-ডিঅক্সিগুয়ানোসিনের সাথে মেলে না। ছেদনটি অসামঞ্জস্য-নির্ভর এবং স্ট্র্যান্ড নির্দিষ্ট। কাঠামো ভিএসআর-এর কাঠামো সীমাবদ্ধ এন্ডোনিউক্লিয়াসের মূল কাঠামোর অনুরূপ, যার একটি 3-স্তরযুক্ত আলফা/বিটা/আলফা টপোলজি রয়েছে। ভিএসআর-এর তিনটি সুগন্ধি অবশিষ্টাংশ রয়েছে (ফে67, টিআরপি68 এবং টিআরপি86), যা ডিএনএ-কে বাঁকিয়ে এবং দুটি স্ট্র্যান্ডকে পৃথক করে প্রধান খাঁজটিতে আন্তঃসংযোগ করে। এন-টার্মিনাল ডোমেন প্রোটিন এবং ক্লিভড প্রোডাক্টের মধ্যে মিথস্ক্রিয়াকে স্থিতিশীল করে, যার ফলে ডিএনএ লিগাজ থেকে ডিএনএ পলিমারেজ 1-এর আগমন পর্যন্ত নিককে রক্ষা করে। রেফারেন্স প্রোটিন পরিবার ডিএনএ মেরামত