CBS domain
আণবিক জীববিজ্ঞানে, সিবিএস ডোমেন হল একটি প্রোটিন ডোমেন যা ব্যাকটেরিয়া থেকে শুরু করে মানুষ পর্যন্ত সমস্ত প্রজাতির প্রোটিনের পরিসরে পাওয়া যায়। এটি প্রথম 1997 সালে একটি সংরক্ষিত ক্রম অঞ্চল হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছিল এবং সিস্টেথিওনাইন বিটা সিনথেসের নামে নামকরণ করা হয়েছিল, এটি প্রোটিনের মধ্যে একটি। সিবিএস ডোমেইন বিভিন্ন ধরনের অন্যান্য প্রোটিনেও পাওয়া যায় যেমন ইনোসিন মনোফসফেট ডিহাইড্রোজেনেস, ভোল্টেজ গেটেড ক্লোরাইড চ্যানেল এবং এএমপি-অ্যাক্টিভেটেড প্রোটিন কাইনেজ (এএমপিকে)। সিবিএস ডোমেনগুলি এএমপি এবং এটিপি, বা এস-অ্যাডেনোসিলমেথিওনিনের মতো অ্যাডেনোসিল গ্রুপের সাথে অণুগুলিকে আবদ্ধ করার প্রতিক্রিয়ায় সম্পর্কিত এনজাইম্যাটিক এবং ট্রান্সপোর্টার ডোমেনের ক্রিয়াকলাপ নিয়ন্ত্রণ করে। কাঠামো সিবিএস ডোমেইন একটি বিটা-আলফা-বিটা-বিটা-আলফা গৌণ কাঠামো প্যাটার্ন নিয়ে গঠিত যা একটি গ্লোবুলার তৃতীয় কাঠামোতে ভাঁজ করা হয় যার একপাশে দুটি α-হেলিস সহ তিন-স্ট্র্যান্ডেড অ্যান্টিপারেলেল β-শীট রয়েছে। সিবিএস ডোমেনগুলি সর্বদা প্রোটিন সিকোয়েন্সে জোড়ায় পাওয়া যায় এবং এই ডোমেনগুলির প্রতিটি জোড়া তাদের β-শীটগুলির মাধ্যমে একটি তথাকথিত সিবিএস-পেয়ার বা বেটম্যান ডোমেন গঠন করে একটি ছদ্ম দ্বিমাত্রিক বিন্যাসে শক্তভাবে সংযুক্ত হয়। এই সিবিএস ডোমেইন জোড়া একটি হেড-টু-হেড (অর্থাৎ। পি. ডি. বি কোড,) অথবা হেড-টু-টেইল (অর্থাৎ। পি. ডি. বি কোড,) পদ্ধতিতে ডিস্কের মতো কম্প্যাক্ট কাঠামো তৈরি করে। এটি করার মাধ্যমে, তারা ফাটল তৈরি করে যা ক্যানোনিকাল লিগ্যান্ড বাঁধাই অঞ্চল গঠন করে। নীতিগতভাবে, ক্যানোনিকাল বাইন্ডিং সাইটের সংখ্যা অণুর মধ্যে সিবিএস ডোমেনের সংখ্যার সাথে মেলে এবং ঐতিহ্যগতভাবে সিবিএস ডোমেন অনুসারে সংখ্যায়িত হয় যেখানে প্রতিটি সংরক্ষিত অ্যাস্পার্টেট অবশিষ্টাংশ থাকে যা সম্ভাব্যভাবে নিউক্লিওটাইডের রাইবোজের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে। যাইহোক, এই সমস্ত গহ্বর অগত্যা নিউক্লিওটাইডগুলিকে আবদ্ধ করতে পারে না বা কার্যকরী হতে পারে না। সম্প্রতি, এএমপি-র জন্য একটি অ-ক্যানোনিকাল সাইটও এম. জান্নাসচি থেকে প্রোটিন এমজে1225-এ বর্ণনা করা হয়েছে, যদিও এর কার্যকরী ভূমিকা এখনও অজানা। লিগ্যান্ড বন্ধন এটি দেখানো হয়েছে যে সিবিএস ডোমেনগুলি এএমপি এবং এটিপি, বা এস-অ্যাডেনোসিলমেথিওনিনের মতো অণুতে অ্যাডেনোসিল গ্রুপের সাথে আবদ্ধ হয়, তবে তারা এমজি 2 + এর মতো ধাতব আয়নগুলিকেও আবদ্ধ করতে পারে। এই বিভিন্ন লিগ্যান্ডগুলিকে আবদ্ধ করার পরে সিবিএস ডোমেনগুলি সম্পর্কিত এনজাইম্যাটিক ডোমেনের ক্রিয়াকলাপ নিয়ন্ত্রণ করে। এই নিয়ন্ত্রণের অন্তর্নিহিত আণবিক প্রক্রিয়াগুলি সবেমাত্র ব্যাখ্যা করা শুরু হয়েছে। এই মুহুর্তে, দুটি ভিন্ন ধরনের প্রক্রিয়া প্রস্তাব করা হয়েছে। প্রথমটি দাবি করে যে লিগ্যান্ডের নিউক্লিওটাইড অংশটি মূলত প্রোটিন কাঠামোর কোনও পরিবর্তনকে প্ররোচিত করে না, বাঁধাই সাইটে ইলেক্ট্রোস্ট্যাটিক সম্ভাব্যতা অ্যাডেনোসিন নিউক্লিওটাইড বাঁধাইয়ের সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ বৈশিষ্ট্য। এই "স্থির" প্রতিক্রিয়া সেই প্রক্রিয়াগুলিতে জড়িত থাকবে যেখানে শক্তি আধান দ্বারা নিয়ন্ত্রণ সুবিধাজনক হবে। অন্যদিকে, দ্বিতীয় ধরনের প্রক্রিয়া ("গতিশীল" হিসাবে চিহ্নিত) লিগ্যান্ড বাঁধাইয়ের উপর প্রোটিন কাঠামোর নাটকীয় গঠনমূলক পরিবর্তন জড়িত এবং থার্মাস থার্মোফিলাস থেকে এমজি2 + ট্রান্সপোর্টার এমজিটিই-এর সাইটোসোলিক ডোমেনের জন্য, এম. জান্নাসচি থেকে অজানা ফাংশন প্রোটিন এমজে0100 এবং ক্লস্ট্রিডিয়াম পারফ্রিঞ্জেন্স পাইরোফসফেটেসের নিয়ন্ত্রক অঞ্চলের জন্য রিপোর্ট করা হয়েছে। সংশ্লিষ্ট ডোমেইন সিবিএস ডোমেইনগুলি প্রায়শই প্রোটিনে পাওয়া যায় যা অন্যান্য ডোমেইন ধারণ করে। এই ক্ষেত্রগুলি সাধারণত এনজাইম্যাটিক, মেমব্রেন ট্রান্সপোর্টার বা ডিএনএ-বাইন্ডিং ক্ষেত্র। যাইহোক, শুধুমাত্র সিবিএস ডোমেইন ধারণকারী প্রোটিনগুলিও প্রায়শই পাওয়া যায়, বিশেষ করে প্রোক্যারিওটগুলিতে। এই স্বতন্ত্র সিবিএস ডোমেইন প্রোটিনগুলি কাইনেসের মতো অন্যান্য প্রোটিনের সাথে আবদ্ধ হয়ে জটিল গঠন করতে পারে যার সাথে তারা মিথস্ক্রিয়া করে এবং নিয়ন্ত্রণ করে। কিছু মানব সিবিএস ডোমেইন-ধারণকারী প্রোটিনে রোগের রূপান্তরের দিকে পরিচালিত করে জিনগত রোগের দিকে পরিচালিত করে। উদাহরণস্বরূপ, সিস্টেথিওনাইন বিটা সিন্থেস প্রোটিনের মিউটেশনগুলি হোমোসিস্টিনুরিয়া () নামক বিপাকের একটি উত্তরাধিকারসূত্রে প্রাপ্ত ব্যাধি ঘটায়। এএমপিকে এনজাইমের গামা সাবইউনিটে মিউটেশনগুলি উলফ-পারকিনসন-হোয়াইট সিনড্রোম () সহ পারিবারিক হাইপারট্রফিক কার্ডিওমায়োপ্যাথির দিকে পরিচালিত করে। আইএমপিডিএইচ এনজাইমের সিবিএস ডোমেনে মিউটেশন চোখের অবস্থা রেটিনাইটিস পিগমেন্টোসার () দিকে নিয়ে যায়। মানুষের বেশ কয়েকটি ভোল্টেজ-গেটেড ক্লোরাইড চ্যানেল জিন রয়েছে এবং এর মধ্যে বেশ কয়েকটি সিবিএস ডোমেনে মিউটেশন জেনেটিক রোগের কারণ হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছে। সি. এল. সি. এন. 1-এ মিউটেশনগুলি মায়োটোনিয়া ()-এর দিকে নিয়ে যায়, সি. এল. সি. এন. 2-এ মিউটেশনগুলি ইডিওপ্যাথিক সাধারণীকৃত মৃগীরোগ ()-এর দিকে নিয়ে যেতে পারে, সি. এল. সি. এন. 5-এ মিউটেশনগুলি ডেন্টের রোগ ()-এর দিকে নিয়ে যেতে পারে, সি. এল. সি. এন. 7-এ মিউটেশনগুলি অস্টিওপেট্রোসিস ()-এর দিকে নিয়ে যেতে পারে এবং সি. এল. সি. এন. কে. বি-তে মিউটেশনগুলি বার্টার সিন্ড্রোম ()-এর দিকে নিয়ে যেতে পারে। তথ্যসূত্র প্রোটিন ক্ষেত্র