Domain of unknown function
একটি ডোমেন অফ অননুমোদিত ফাংশন (ডিইউএফ) হল একটি প্রোটিন ডোমেন যার কোনও বৈশিষ্ট্যযুক্ত ফাংশন নেই। এই পরিবারগুলিকে পি. এফ. এ. এম ডাটাবেসে প্রিফিক্স ডি. ইউ. এফ ব্যবহার করে একত্রিত করা হয়েছে, যার পরে একটি সংখ্যা রয়েছে, যার উদাহরণ হল ডি. ইউ. এফ. 2992 এবং ডি. ইউ. এফ1220। 2019 সালের হিসাবে, পি. এফ. এ. এম ডাটাবেসের মধ্যে প্রায় 4,000 ডি. ইউ. এফ পরিবার রয়েছে যা পরিচিত পরিবারের 22 শতাংশেরও বেশি প্রতিনিধিত্ব করে। কিছু ডিইউএফ জনপ্রিয় ব্যবহারের কারণে নামকরণ ব্যবহার করে নামকরণ করা হয় না তবে তা সত্ত্বেও ডিইউএফ হয়। ডিইউএফ উপাধিটি অস্থায়ী, এবং এই ধরনের পরিবারগুলি একটি ফাংশন চিহ্নিত হওয়ার পরে আরও নির্দিষ্ট নামে (বা বিদ্যমান ডোমেনে একীভূত) নামকরণ করা হয়। ক্রিস পন্টিং স্মার্ট ডাটাবেসে ডিইউএফ1 এবং ডিইউএফ2 যুক্ত করার মাধ্যমে ডিইউএফ নামকরণ প্রকল্প চালু করেছিলেন। এই দুটি ক্ষেত্র ব্যাকটেরিয়াল সিগন্যালিং প্রোটিনে ব্যাপকভাবে বিতরণ করা হয়েছে। পরবর্তীকালে, এই ডোমেনগুলির কার্যকারিতা চিহ্নিত করা হয়েছিল এবং তারপর থেকে তাদের যথাক্রমে জি. জি. ডি. ই. এফ ডোমেন এবং ই. এ. এল ডোমেন হিসাবে নামকরণ করা হয়েছে। কাঠামোগত জিনোমিক্স প্রোগ্রামগুলি কাঠামো নির্ধারণের মাধ্যমে ডিইউএফ-এর কার্যকারিতা বোঝার চেষ্টা করেছে। 250টিরও বেশি ডিইউএফ পরিবারের কাঠামো সমাধান করা হয়েছে। এই (2009) গবেষণায় দেখা গেছে যে প্রায় দুই তৃতীয়াংশ ডিইউএফ পরিবারের কাঠামো পূর্বে সমাধান করা পরিবারের মতো ছিল এবং তাই সম্ভবত বিদ্যমান প্রোটিন সুপারফ্যামিলির ভিন্ন সদস্য হতে পারে, যেখানে প্রায় এক তৃতীয়াংশের একটি নতুন প্রোটিন ভাঁজ ছিল। কিছু ডিইউএফ পরিবার এমন ডোমেনের সাথে রিমোট সিকোয়েন্স হোমোলজি ভাগ করে নেয় যার বৈশিষ্ট্যযুক্ত ফাংশন রয়েছে। এই সম্পর্কগুলিকে যুক্ত করতে গণনামূলক কাজ ব্যবহার করা যেতে পারে। 2015 সালের একটি কাজ ডিইউএফ-এর 20 শতাংশ বৈশিষ্ট্যযুক্ত কাঠামোগত সুপারফ্যামিলিতে বরাদ্দ করতে সক্ষম হয়েছিল। পিফাম ক্রমাগত "ক্ল্যান" সুপারফ্যামিলি এন্ট্রিতে (ম্যানুয়ালি-ভেরিফাইড) অ্যাসাইনমেন্ট সম্পাদন করে। ফ্রিকোয়েন্সি এবং সংরক্ষণ 2013 সালে সমস্ত প্রোটিন ডোমেনের 20 শতাংশেরও বেশি ডিইউএফ হিসাবে উল্লেখ করা হয়েছিল। ইউক্যারিওটসে মাত্র 1,500-এর তুলনায় ব্যাকটেরিয়ায় প্রায় 2,700 ডিইউএফ পাওয়া যায়। ব্যাকটেরিয়া এবং ইউক্যারিওটের মধ্যে 800 টিরও বেশি ডিইউএফ ভাগ করা হয় এবং এর মধ্যে প্রায় 300 টি আর্কিয়াতেও উপস্থিত থাকে। 320 টি ডিইউএফ সহ মোট 2,786 টি ব্যাকটেরিয়াল পিএফএএম ডোমেন এমনকি প্রাণীদের মধ্যেও দেখা যায়। জীববিজ্ঞানে ভূমিকা অনেক ডিইউএফ অত্যন্ত সংরক্ষিত, যা জীববিজ্ঞানে একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকার ইঙ্গিত দেয়। যাইহোক, এই ধরনের অনেক ডিইউএফ অপরিহার্য নয়, তাই তাদের জৈবিক ভূমিকা প্রায়শই অজানা থাকে। উদাহরণস্বরূপ, ডিইউএফ143 বেশিরভাগ ব্যাকটেরিয়া এবং ইউক্যারিওটিক জিনোমে উপস্থিত থাকে। যাইহোক, যখন এটি এসচেরিচিয়া কোলিতে মুছে ফেলা হয়েছিল তখন কোনও সুস্পষ্ট ফেনোটাইপ সনাক্ত করা যায়নি। পরে দেখা গেছে যে ডিইউএফ143 ধারণকারী প্রোটিনগুলি রাইবোসোমাল সাইলেন্সিং ফ্যাক্টর যা দুটি রাইবোসোমাল সাবইউনিটের সমাবেশকে বাধা দেয়। যদিও এই ফাংশনটি অপরিহার্য নয়, এটি প্রোটিন জৈব সংশ্লেষণ বন্ধ করে কোষগুলিকে কম পুষ্টির অবস্থার সাথে খাপ খাইয়ে নিতে সহায়তা করে। ফলস্বরূপ, এই প্রোটিন এবং ডিইউএফ শুধুমাত্র তখনই প্রাসঙ্গিক হয়ে ওঠে যখন কোষগুলি অনাহারে থাকে। এইভাবে বিশ্বাস করা হয় যে অনেক ডিইউএফ (বা অজানা ফাংশন, পিইউএফ-এর প্রোটিন) শুধুমাত্র নির্দিষ্ট পরিস্থিতিতে প্রয়োজন হয়। অপরিহার্য ডিইউএফ গুডএকার এবং অন্যান্য। 355টি প্রয়োজনীয় প্রোটিনে (16টি মডেল ব্যাকটেরিয়া প্রজাতিতে) 238টি ডিইউএফ চিহ্নিত করা হয়েছে, যার মধ্যে বেশিরভাগই একক-ডোমেইন প্রোটিনের প্রতিনিধিত্ব করে, যা স্পষ্টভাবে ডিইউএফ-এর জৈবিক প্রয়োজনীয়তা প্রতিষ্ঠা করে। এই ডিইউএফগুলিকে "অপরিহার্য ডিইউএফ" বা ইডিইউএফ বলা হয়। বাহ্যিক লিঙ্ক ডি অক্ষর দিয়ে শুরু হওয়া পিফাম পরিবারের তালিকা, ডিইউএফ পরিবার সহ রেফারেন্স প্রোটিন ডোমেন