SDD-AGE
জৈব রসায়ন এবং আণবিক জীববিজ্ঞানে, এস. ডি. ডি-এ. জি. ই হল সেমি-ডিনাচুরেটিং ডিটারজেন্ট অ্যাগারোজ জেল ইলেক্ট্রোফোরেসিসের সংক্ষিপ্ত রূপ। এটি বড় প্রোটিন পলিমারগুলি সনাক্ত ও চিহ্নিত করার একটি পদ্ধতি যা বেশিরভাগ বড় প্রোটিন কমপ্লেক্সের বিপরীতে ঘরের তাপমাত্রায় 2 শতাংশ এসডিএস-এ স্থিতিশীল। এই পদ্ধতিটি প্রিওন এবং অ্যামাইলয়েড অধ্যয়নের জন্য খুব কার্যকর, যা প্রোটিনযুক্ত পলিমার গঠনের দ্বারা চিহ্নিত করা হয়। অ্যাগারোজ জেলের জন্য ব্যবহার করা হয় কারণ এসডিএস-প্রতিরোধী পলিমারগুলি বড় (200-4000 + কেডিএ পরিসরে) এবং একটি প্রচলিত পলিঅ্যাক্রিলামাইড জেল প্রবেশ করতে পারে না, যার ছোট ছিদ্র রয়েছে। অন্যদিকে অ্যাগারোজে বড় ছিদ্র থাকে, যা পলিমারগুলিকে পৃথক করার অনুমতি দেয়। এই পদ্ধতির ব্যবহার গবেষকদের বুঝতে সাহায্য করেছে যে কমপক্ষে কিছু ধরনের প্রিওন সমষ্টি দুটি স্তরের কাঠামোতে বিদ্যমান ছিল-পলিমারগুলিতে গোষ্ঠীভুক্ত প্রোটিন অণু, যা খুব স্থিতিশীল এবং ঘরের তাপমাত্রায় 2 শতাংশ এসডিএসের সাথে চিকিত্সা সহ্য করে এবং সমষ্টি, যা পলিমারের বান্ডিল, যা এই পরিস্থিতিতে বিচ্ছিন্ন হয়। পলিমারের আকারের পার্থক্য ভিভোতে পলিমার খণ্ডনের দক্ষতা নির্দেশ করতে পারে। পদ্ধতিটি রাশিয়ান কার্ডিওলজি রিসার্চ ইনস্টিটিউটের আণবিক জেনেটিক্স পরীক্ষাগারে তৈরি করা হয়েছিল এবং 2003 সালে ক্রিনুশকিন এট আল দ্বারা প্রকাশিত হয়েছিল। মূল পদ্ধতিটি একটি টি. এ. ই বাফারিং সিস্টেম ব্যবহার করে এবং একটি ঝিল্লিতে প্রোটিন স্থানান্তরের জন্য একটি পরিবর্তিত ভ্যাকুয়াম ব্লটিং সিস্টেম অন্তর্ভুক্ত করে (মূলত পি. ভি. ডি. এফ)। পরিবর্তিত ভ্যাকুয়াম ব্লটিং সিস্টেমটি আসলে একটি ভ্যাকুয়াম-সহায়ক কৈশিক স্থানান্তর, যেহেতু ভ্যাকুয়াম শুধুমাত্র সেই তরলকে সহায়তা করে যা ইতিমধ্যে জেল এবং ঝিল্লির মধ্য দিয়ে গিয়ে সিস্টেমটি ছেড়ে যেতে পারে। বৈচিত্র্য অন্যান্য পরিবর্তনগুলিও ব্যবহার করা হয়েছে, যেমন বাগ্রিয়ান্টসেভ এট আল-এ বর্ণিত, ঐতিহ্যবাহী ভিজা স্থানান্তর এবং একটি টিজিবি বাফারিং সিস্টেম ব্যবহার করে, এবং অন্যরা আধা-শুকনো স্থানান্তর বা কৈশিক স্থানান্তর ব্যবহার করে। ডিডি-এজিই, পদ্ধতির আরও একটি বৈচিত্র্য যা ডাইথিওথ্রেটোল (ডিটিটি) এবং 95 ডিগ্রি সেলসিয়াসে তাপ বিকৃতি হ্রাসকারী এজেন্ট সহ সম্পূর্ণরূপে বিকৃতি পরিস্থিতি ব্যবহার করে-পলিগ্লুটামিন প্রোটিনের তাপ-স্থিতিশীল অন্তর্ভুক্তি সংস্থার বিশ্লেষণের জন্য উপযুক্ত। তথ্যসূত্র প্রোটিন পদ্ধতি আণবিক জীববিজ্ঞান