在峨眉工业区的环保问题则较为棘手，因工业区预定地有一处水坝，原为供应农业用水，尽管其功能已不彰，但农委会方面仍以有破坏水土保持及农业用水的理由，而不同意开发计划，工业局表示，目前也只能继续沟通，并提出更详尽的水土保持计划，来获取农委会的同意。
在峨眉工业区的环保问题则较为棘手，因工业区预定地有一处水坝，原为供应农业用水，尽管其功能已不彰，但农委会方面仍以有破坏水土保持及农业用水的理由，而不同意开发计划，工业局表示，目前也只能继续沟通，并提出跟详尽的水土保持计划，来获取农委会的同意。