宝谛寺
宝谛寺是载于《理藩院则例》的满族藏传佛教寺庙，寺内僧人均为满族。清朝载于《理藩院则例》的满族藏传佛教寺庙共有6座，分别为东陵隆福寺、西陵永福寺、香山宝谛寺、圆明园正觉寺、功德寺、承德殊像寺。宝谛寺是其中最大最重要的一座，专设有“管理宝谛寺事务大臣”一职，专门管理满族藏传佛教寺庙事务。
五台山扎萨克喇嘛
具体而言，到清朝后期，西藏达赖喇嘛选派的扎萨克大喇嘛管理的黄衣僧寺院共21所：菩萨顶、罗喉寺、广仁寺、台麓寺、普寿寺、寿宁寺、七佛寺、三泉寺、三塔寺、玉花池、铁瓦寺、涌泉寺、鱼耐庵、南阁庙、普庵寺、宝华寺、圆照寺、集福寺、慈福寺。章嘉活佛管理的黄衣僧寺院共6所：镇海寺和“佛爷五处”（普勒院、集福寺、广化寺、文殊院、慈福寺）。 汉族的青衣僧寺院（汉传佛教寺院）在清朝初年设扎萨克大喇嘛后，属扎萨克大喇嘛管辖。但是后来，清朝中央政府在五台山沿袭明朝旧例，仍设五台山僧纲司，负责管理青衣僧事务。该司日常管理以显通寺为中心的几十座青衣僧寺院，但是对五台山的各项重大事务，五台山僧刚司仍需同五台山扎萨克大喇嘛协商解决。