生殖系统
真菌的生殖相當複雜，反映真菌生物體在生命型態及基因上的多樣性。估計約有三分之一的真菌有一種以上的生殖方式。例如生殖可能會出現在真菌生命週期中二個明顯不同的階段：有性階段（teleomorph）及無性階段（anamorph）。 環境條件會觸發由基因決定的發育狀態，也會產生適合有性生殖或是無性生殖的構造。這類的構造可以有效的散播孢子或是含有孢子的繁殖體，以利於繁殖。
浮黴菌門
其中浮黴菌屬("Planctomyces")和小梨形菌屬("Pirellula")等都是專性好氧菌。它們通過出芽法繁殖。形態上，它們通常是卵形，不用來繁殖的一端有柄，可以用來附着。它們的生活史分爲固着細胞和有鞭毛的游動細胞，類似α-變形菌綱的柄桿菌屬。