食道癌
食道癌的化學療法由肿瘤分型而各异。常用的化疗药物是每三周给予順鉑（順一雙氨雙氯鉑，cisplatin）、卡鉑（顺二氨環丁烷铂，carboplatin）或奧沙利鉑（雙胺類環己烷草酸鉑，oxaliplatin），同时持续或每三周给予5-氟尿嘧啶（5-FU）。更新的研究结果发现，对晚期不易手术的患者，加上泛艾黴素（Epirubicin, ECF）的效果更好化疗可以作为术后巩固治疗（用来降低复发的可能）、术前巩固治疗；而对于不宜手术的情况也可用顺铂和5-氟尿嘧啶化疗。目前的临床试验着重于比较不同化疗药物组合的效果。例如已在II/III期的REAL-2试验比较了四个不同组合--泛艾黴素10公絲和順鉑或奧沙利鉑，同时不断注入氟尿嘧啶或卡培他濱（氟嘧啶氨基硝酸鹽，capecitabine）。
六甲蜜胺
目前较为普遍接受的说法是六甲蜜胺的其中一些分解产物起到了类似烷化剂的抗癌作用。口服六甲蜜胺后，肝脏中的细胞色素P450会催化其进行氧化与"N"-去甲基化，生成活性产物"N"-(甲基羟基)三聚氰胺（如三甲密醇，如下圖中的 Carbinolamine metabolite）， 后者在细胞内进一步脱甲基生成甲醛、甲醇胺、亚胺離子（圖中的 Reactive iminium ion ）等中间体。这些小分子能够与DNA或蛋白質反应生成共价键，引起DNA的烷基化、双链间交联及与蛋白质间的交联，从而损害DNA，抑制DNA的复制和转录，使癌细胞死亡。 也有研究认为六甲蜜胺是一种二氢叶酸还原酶抑制剂，通过抑制二氢叶酸还原酶起到抗代谢物的作用，阻碍癌细胞的DNA、RNA与蛋白质合成。主要支持的论据是六甲蜜胺与烷化剂无交叉抗药性。