珊瑚藻
由於其鈣化結構，珊瑚藻具有許多經濟價值。於18世紀開始就有採集非附著的珊瑚藻（藻團粒）為土壤調理劑。在英國及法國，每年就有超過30萬噸的"Phymatolithon calcareum"及"Lithothamnion corallioides"被挖出來。在巴西對出海岸的一些挖掘工作可以延綿幾千公里。藻團粒也會被用作為歐洲牛及豬的食物添加劑，與及過濾酸性飲用水。
珊瑚礁
蓝藻为珊瑚礁提供可溶的营养物质。珊瑚虫直接从海水吸收营养，包括无机氮和磷。此外它们吃被水流带到它们附近的浮游动物。因此珊瑚礁的初级生产量非常高。珊瑚礁的生产者还包括与珊瑚虫共生的虫黄藻和不同的海带。对于比较小的藻类的作用在科学界尚有争议。