生殖系统
真菌的生殖相當複雜，反映真菌生物體在生命型態及基因上的多樣性。估計約有三分之一的真菌有一種以上的生殖方式。例如生殖可能會出現在真菌生命週期中二個明顯不同的階段：有性階段（teleomorph）及無性階段（anamorph）。 環境條件會觸發由基因決定的發育狀態，也會產生適合有性生殖或是無性生殖的構造。這類的構造可以有效的散播孢子或是含有孢子的繁殖體，以利於繁殖。
基因工程历史
操纵DNA技术被开发的同时，DNA插入（称为转化）基因组的技术也被引入。格里菲思实验已经表明，一些细菌在自然条件下就有摄取并表达外源DNA的活化能力。大肠杆菌（"E.coli"）的人工活化在1970年的时候由Morton Mandel和Akiko Higa完成：在氯化钙溶液（CaCl）条件下大肠杆菌可以并入λ噬菌体的基因组。两年后，斯坦利·科恩表明，给予CaCl也是有效的质粒DNA的人工转化条件。利用电穿孔进行转化是在20世纪80年代后期发展的，它提高了转化效率和宿主细菌的选择范围。一种造成植物肿瘤的细菌，农杆菌"（Agrobacterium tumefaciens）"，在1907年被发现；在70年代初期它的Ti质粒经研究被认为是肿瘤诱导剂。通过消除质粒中导致肿瘤的基因和加入新基因，研究人员能够用农杆菌感染植物，让细菌将他们所选择的DNA加入植物的基因组中。