日本佛教
日本的佛教在飛鳥時代傳入，並於奈良時代與平安時代開始發展，為漢傳佛教的一支，以大乘佛教為主流。中国佛教已经消失的宗派如真言宗、法相宗等，在日本反而传承至今。根據美國中央情報局（CIA）的調查，神道教約佔日本人口比率70.4%，佛教徒約佔人口的69.8%（含同時信奉神道教）。根據日本文化廳每年實施的《宗教統計調查》，截至2016年12月31日，神道教的信徒有8474萬人（約佔人口68%），佛教徒有8770萬人（約佔人口70%），亦即大多數日本人同時信仰神道教與日本佛教。許多的日本人不參與任何宗教組織，只參與婚喪喜慶與祭祀等傳統上的宗教儀式；還有不少年輕人就算參加宗教儀式，卻自認為不可知論者甚至無神論者。
日本天主教
截至2018年底的統計，日本的天主教會共設有3個教省、16個教區（包括3個總教區）以及777個堂區，並設有一個主教團做為教會最高領導機構。日本信仰天主教的人口為434,111人，佔日本全國人口的0.34%，其中包括神職人員（包括主教、神父與執事）2,695人，修道者4,997人（含修士161人、修女4,836人）。開教歷史悠久的長崎縣（長崎總教區）則是特例，天主教信仰人口佔當地總人口逾4%。除了教堂外，天主教會在日本各地亦設有多處文教與社福機構，包括醫療機構42所、社福機構643處、各級學校828間等，其中上智大學與南山大學為日本著名高校之一。