深海魚
共生发光的深海生物相对较少。典型的游泳深海鱼包括鞭冠𩽾𩾌科和水珍鱼目的一部分，而底栖鱼有突吻鳕科和稚鳕科（又称深海鳕科）。其中，鞭冠𩽾𩾌科以外的三个类群的发光器与消化道相连，可由肠道菌群不断补充发光细菌（主要是"Photobacterium phosphoreum"）。发光器的数量很少，通常为1-2个。
鮟鱇目
鮟鱇魚為中型底棲魚類，此多潛伏海底，眼睛幾乎無用武之地，不善游泳，多靠腹鰭爬行。口內有銳利而且朝內傾斜的長牙，基本上，被咬中的獵物絕不可能逃走；而且擁有彈性的胃，因此某些種類能吃下比自己大的魚類。身體裸露無鱗，在頭體上方及體側邊緣均有大小不一的皮質突起。特別之處是有一支由前背鰭演化而成的發光釣竿，釣竿頂端內上百萬隻的發光菌，狀似小魚，會發出亮光，吸引小生物成为它们的食物，其英文名Anglerfish也来自于此。