吲哚
在很多有机化合物中能发现吲哚结构，比如色氨酸及含色氨酸的蛋白质，生物碱及色素中也包含有吲哚结构。
无机化学
典型的主族元素化合物有：SiO、SnCl和NO。它们之中有很多都可被归为“有机金属化合物”的范畴，例如B(CH)，由于其分子中含有有机基团的缘故。很多主族元素化合物也存在于自然界中——例如体液中的离子、DNA中的磷酸基团以及许多酶中的中心金属原子，而它们也因此被划在“生物无机化学”的范围之下。相反地，某些缺少氢的有机化合物也可被划分为无机化合物，比如富勒烯、碳纳米管和二元碳氧化物。过渡金属化合物包含的是4-11族元素所形成的化合物。尽管有时也会考虑3族和12族的元素，但一般主要认为它们属于主族元素化合物的范畴。