深海魚
生物发光在捕食上的基本用途是照亮猎物，许多深海鱼类会这么做。巨口魚科的眼睛下方以及一些类群的眼后具有大发光器，照亮了它们的视野。另有许多深海鱼会发光以吸引食物。角𩽾𩾌亚目通过擬餌体顶部的共生发光吸引猎物，鬚角鮟鱇科顎部的多叉胡须则含有自发光器官。此外，褶胸鱼属和黑线岩鲈属等类群的发光器官则在口腔中。
大洋帶
由于透光层带以下区域的皆非常黑暗，许多在深海中生存的生物没有眼睛，或者自行發光。光线通常為蓝绿色，因为许多海洋生物都对蓝光敏感。两种化学物质，萤光素和萤光素酶相互反应，产生柔和的光線。生物发光的产生过程与荧光棒破裂时的发生过程非常相似。从诱饵到航行，深海生物都使用生物发光。