云南省
云南境内河网密布，集水面积100平方千米以上的河流有908条，主要河流达到180多条，为入海河流的上游，分属伊洛瓦底江、怒江、澜沧江、金沙江、红河和珠江六大水系，其集水面积覆盖全省。著名的河流有金沙江（长江上游干流）、澜沧江（湄公河上游干流）、元江（红河上游）、南盘江（珠江正源）、怒江（萨尔温江上游）、伊洛瓦底江（瑞丽江和大盈江），七大河流集水总面积达到323,953平方千米，占云南总面积的82.22%。其中金沙江干流云南境内河段1,560公里，集水面积105,614平方千米；澜沧江1,227公里，集水面积88,574公里。云南处云贵高原地理位置，境内均系高原湖泊，其中水面面积30平方千米以上的有滇池、洱海、抚仙湖、程海、泸沽湖、异龙湖、杞麓湖、阳宗海等九大湖泊。
长江流域
滇北黔西高原湖区包括云南省北部、贵州省西部以及毗邻的四川省西部一带的高原湖泊，这类湖泊总面积约500平方公里，占长江流域湖泊总面积3.3％，主要湖泊有滇池、泸沽湖、程海、草海、邛海、马湖等，其中滇池位于云南省昆明市西南部，面积297平方公里，为云贵高原最大湖泊，湖的南部海口螳螂川为滇池唯一出口，亦即金沙江支流普渡河的上源，为云南省重要的水产基地。