九州横断新干线
计划在起点大分市与同样是基本计划路线的东九州新干线及四国新干线连接。特别地，本线和四国新干线都是从大阪经由四国连接九州的太平洋新国土轴构想的基础。然而，这些线路相互连接的具体计划尚未确定。
沪新线
沪新线为沪杭、沪宁两条铁路之间接轨线，最初为沪杭线的一段。民国3年，线路开始勘测，选线时有3个方案：一为架空方案，由上海北站向南跨英、美、法租界至上海县城西门外和沪杭铁路接轨；二为从沪宁铁路上的叉袋角（后为上海东站）起，紧绕租界边缘至沪杭铁路接轨；三为由沪宁铁路的真如车站起，向南跨苏州河经梵皇渡、徐家汇至日晖港与沪杭铁路接轨。经比较认为：一方案线路短而直，但涉及建筑物甚多；二方案洋籍土地多，造价太贵；三方案造价最低，但所经地区甚为偏僻。几经斟酌，决定取第二、第三方案间沪宁铁路叉袋角站西端出岔，向西跨苏州河，经梵皇渡、徐家汇至沪杭铁路龙华站和梅家弄站间接轨，设龙华新站。全线于民国4年（1915年）3月开工兴建，民国5年（1916年）11月竣工，同年12月建成通车。沪杭线的起点站便由上海南站改为上海北站。在华中铁道时期改名为海杭线，后又改回。上世纪90年代，因铁路周围逐渐城市化，道口频繁启闭严重阻碍城市交通。遂将经过列车全部移往沪杭铁路外环线运行，便改名为沪新线。后该线路拆除，在铁路原址上建造上海轨道交通3号线。