环境容量
环境容量是环境自净能力的指标，指得是自然环境可以通过大气、水流的扩散、氧化以及微生物的分解作用，将污染物化为无害物的能力。环境有多大的容量，即是可以容纳多少污染物而又可以不为环境造成永久性损害。环境容量的确定为环境评价提供必要的依据。
宏基因组学
微生物在人體的食物消化、機體免疫等方面發揮著重要作用。在大多數情況下，微生物通過群落而非單一個體來發揮這些重要功能。 水體、土壤、腸道和很多的人工生物環境（如廢水處理、、堆肥、沼氣池，等等）都具有很複雜的微生物群落，這些微生物相互作用、共同協作，一起完成複雜的代謝功能。環境樣品中的微生物組成的群落構成了一個巨大而復雜的基因庫，在這個基因庫中既包含代表不同微生物身份的系統發育標記基因（如16S rRNA基因），也包含各種代謝功能基因，它們統稱為宏基因組（Metagenome，又稱宏基因組、環境基因組或生態基因組），這些基因確定了樣品微生物群落的組成與功能。研究樣品的基因組是認識複雜微生物群落的主要途徑。