子囊菌门
某些子囊菌门真菌也可以无性生殖，包括芽生、分裂或以分生孢子的方式，但这不是子囊菌门区别于其它真菌门的特征。无性生殖期本门真菌依环境温度不同还改变其形态，这一特性称为双态性，这些真菌称为双态性真菌。阿耶洛双态菌科的许多成员、组织胞浆菌、隐球菌等都属于这一类，它们在环境温度下以丝状真菌（霉菌）存在，吸入人体后在体内高温环境下变成单细胞酵母繁殖，给人类或动物造成急性播散性真菌病或慢性机会性感染。
菌絲體
真菌在生態系中最重要的角色之一就是分解有機養分。石化工業產物、殺蟲劑與汙染物等有機物質都可能成為真菌生長的基質，所以只要它們的毒性不會影響真菌的生長，真菌即有能力將它們分解並移除，此即為真菌修復（Mycoremediation）。美國真菌學家保罗·史塔曼兹提倡了以菌絲體作為生物過濾材料的方法，可過濾掉水或土壤中的重金屬與化學物質，這個方法稱為真菌過濾（Mycofiltration）。