九州横断新干线
计划在起点大分市与同样是基本计划路线的东九州新干线及四国新干线连接。特别地，本线和四国新干线都是从大阪经由四国连接九州的太平洋新国土轴构想的基础。然而，这些线路相互连接的具体计划尚未确定。
羽越新干线
1969年5月30日，内阁会议通过了“新全国综合开发计划”。其中，作为主要开发项目的构想，将通过建设“日本海沿岸新干线铁路”、“上越新干线铁路”、“东北横断新干线铁路（中略），缩短东北地区与首都圈、北海道及区域内相互之间的时间距离，并加强区域间的交流。”在东北地方，建设几条新干线铁路的构想也包括在内。