珊瑚藻
由於其鈣化結構，珊瑚藻具有許多經濟價值。於18世紀開始就有採集非附著的珊瑚藻（藻團粒）為土壤調理劑。在英國及法國，每年就有超過30萬噸的"Phymatolithon calcareum"及"Lithothamnion corallioides"被挖出來。在巴西對出海岸的一些挖掘工作可以延綿幾千公里。藻團粒也會被用作為歐洲牛及豬的食物添加劑，與及過濾酸性飲用水。
囊泡藻类
许多囊泡藻界生物对生态系统有巨大的影响，往往是有害的影响。腰鞭毛虫门产生的赤潮会导致鱼类大量死亡，危害牡蛎的收获。顶复门是很多很成功的动物寄生虫. 卵菌纲的水霉会造成严重的植物病害. 实际上正是致病疫霉(Phytophthora infestans)引起了1845年-1852年的爱尔兰大饥荒. 但是，囊泡藻界的很多物种在生态系统中发挥了重要作用。硅藻是地球上重要的光合作用生物。褐藻产生了大量水下"森林"为海洋生物提供了栖息地与膳食。