乌干达
非洲最大的河流白尼羅河，亦發源在維多利亞湖，流經烏干達全境後，向北進入南蘇丹、苏丹和埃及，再注入地中海。此外，東西部國境線和國內的其他地區，也有很多湖泊穿插其間，使烏干達增加了不少自然上的美景。全國湖泊面積共有35436平方公里，各地沼澤面積共約14567平方公里。
東非大裂谷
一般會將大裂谷區分成東部和西部，在西部裂谷，又稱為艾伯丁裂谷，主要由高山群組成，包括有Virunga山，Mitumba山，Ruwenzori山區和Rift Valley湖區，其中有世界最深淡水湖之一的坦干依喀湖（1470公尺深），以及世界上第二大的淡水湖－維多利亞湖。西部裂谷的形狀是比較破碎的。