深海魚
共生发光的深海生物相对较少。典型的游泳深海鱼包括鞭冠𩽾𩾌科和水珍鱼目的一部分，而底栖鱼有突吻鳕科和稚鳕科（又称深海鳕科）。其中，鞭冠𩽾𩾌科以外的三个类群的发光器与消化道相连，可由肠道菌群不断补充发光细菌（主要是"Photobacterium phosphoreum"）。发光器的数量很少，通常为1-2个。
澳洲光頜松球魚
由於魚鰭短小，鱗片骨板狀，此魚不擅游泳。白天時出沒於洞穴或岩石下方，是個夜行動物。在-{zh-cn:新南威尔士州; zh-tw:新南威爾斯州; zh-hk:新南威爾斯州; zh-sg:新南威尔斯州;}-的Fly Point Halifax Park 水產保護區內，有一小群澳洲光頜松球魚被發現生活在同一岩石下長達7年，另一群則生活在另一個岩石下長達3年。到了晚上，此魚靠著發光器官的亮光，在海底沙床上覓食小蝦。澳洲光頜松球魚所發的光也許也可用於與同類溝通。澳洲光頜松球魚的發光器官內鑲著與光頜松球魚共生而會發光的費氏弧菌。費氏弧菌也不時會從發光器官排出魚體外在海水中自由存活，但在脫離魚身後數小時，將漸漸不再發光。此物種在人工飼養環境中壽命可長達10年。