上清派
上清派强调人体内精气神的修炼，重登斋入靖、存思诸神形象，不重炼外丹。该派开创人物认为依上清法修行得道、即可升入“上清”，主神為元始天王（後稱元始天尊），比天师道主神太上老君的“太清”更高。上清派的开创人物均为門閥人物，上流社會出身，有较高的文化修养，和统治阶级上层亦有联系。上清派的出现，反映了民间道教转向士大夫道教发展的变化。
道经
至東晉末年，尊崇元始天尊、元始天王、太上大道君、玉晨大道君的上清經系和靈寶經系開始廣泛流傳。南朝廬山道士陸修靜，「祖述三張，弘衍二葛」，以上清、靈寶、三皇「總括三洞」，編制了《三洞經書目錄》。上清經系，以《上清大洞真經》、《黃庭經》為要，茅山道士陶弘景作《真誥》、《登真隱訣》，教人「存思」身外景物、身中諸神，守「三元真一」，乃至於守「腦九宮」，徊風混合為「帝一」；靈寶經系，以《元始赤書五篇真文》摹畫自然真文，《昇玄步虛章》吟詠洞章，洗心奉齋，《靈寶度人經》宣揚「仙道貴生，無量度人」之旨，并餘諸經演說科儀齋法、教戒緣起。