深海魚
生物发光在捕食上的基本用途是照亮猎物，许多深海鱼类会这么做。巨口魚科的眼睛下方以及一些类群的眼后具有大发光器，照亮了它们的视野。另有许多深海鱼会发光以吸引食物。角𩽾𩾌亚目通过擬餌体顶部的共生发光吸引猎物，鬚角鮟鱇科顎部的多叉胡须则含有自发光器官。此外，褶胸鱼属和黑线岩鲈属等类群的发光器官则在口腔中。
斑馬魚
从2003年后期起，表达绿色、红色、黄色荧光蛋白的转基因品种斑马鱼在美国上市。表达荧光蛋白的斑马鱼也被商家称为“螢光魚”。别的培养品种包括“golden”、“sandy”、“longfin”、“leopard”等。其中leopard品种，之前被称为"Danio frankei"，是一种由于色素变异产生的带点状色彩的斑马鱼品种。的普通斑马鱼品种与leopard品种、长鳍次种都已通过育种筛选获得并被用于水族鱼类交易。（Xanthochromism是一种有关红色素被黄色素替代的带有特殊黄色。）