蜕皮
爬行动物的表皮是皮肤的角质化产物，没有活的细胞，不能随动物个体生长而生长。在动物个体继续生长时，表皮就会成为限制因素。这时只有退掉原来的表皮鳞被，而长出新的表皮鳞被，才能适应其长大的躯体。在爬行动物中，最熟知的蜕皮的例子是蛇的蜕皮。蛇通常依靠硬的物体，比如岩石（或两块岩石之间）或木头，来摩擦它的头，使已经被拉长的皮肤裂开。这时，蛇继续在物体上摩擦它的皮，使得最靠近头部的一端可以自行剥离，直到蛇能够从皮肤中爬出来，高效地将蛇皮的内侧翻出来。这和某些人脱袜子的方式类似——抓住袜子的开口一端向下拉，使袜子从自己身上翻下来。蜕下来的蛇皮常常是一整块，包括被丢弃的brille（眼镜），因此蜕皮对维持动物的视力是至关重要的。相比之下，蜥蜴的皮一般会脱落为几片。
鼻
爬行动物的鼻腔一般而言都会更大一些，且他们的内鼻孔要更靠后一些，位于腭顶的中部或咽喉附近。对鳄目而言，他们的鼻腔非常长，这可以帮助他们在半潜入水中时进行呼吸。爬行动物的鼻腔可以分为三部分：位于前部的、主嗅室以及位于后方的鼻咽。嗅室是由嗅上皮在其上表面所形成的结构，并拥有一系列的鼻甲来增大感觉面积。蜥蜴与蛇类的犁鼻器已经非常发达，并且不再与鼻腔相连，而是直接通向上腭。而这一结构在龟类动物中较小，并且还保持着原有的与鼻腔之间的练习，同时这一结构在成年鳄目动物中完全消失。