過渡化石
鯨豚類等海洋哺乳動物是演化自陸生的哺乳動物。巴基鯨是已滅絕的一科偶蹄目哺乳動物，也是最早的鯨魚之一，其姐妹群是印多霍斯兽。巴基鯨存活於約5200萬年前的始新世，第一個化石於1979年發現於北巴基斯坦，與特提斯洋不遠。利用特化的骨頭取代鼓膜，巴基鯨有在水中的聽覺，但是無法辨別聲音的方位。
深海魚
深海生物存在的明确证据来自英國皇家海軍挑战者号从1872年到1876年的一次大规模环球探险。这次航行带来了巨大的海洋学研究成果，为各国海洋调查与深海鱼研究拉开序幕。