日本海军历史
1895年4月17日签署的马关条约结束了这场战争，清朝向日本割让台湾和澎湖列岛。日本海军在台湾登陆后从3月到10月镇压了新成立的台湾民主国的清朝残余势力。台湾及澎湖到1945年再轉交中華民国。此外日本还获得了辽东半岛，后来在法国、德国和俄国的干涉下日本归还了辽东半岛，但此后不久俄国占领了辽东半岛的旅顺和大连作为租借地。
澎湖天后宮
1663年，東印度公司在前一年被鄭成功擊敗，因而失去在台灣的領地後，隨即任命（Balthasar Bort）率艦隊企圖將之奪回。博特曾與清軍聯盟，在中國沿海與鄭軍交戰獲勝，但後來未獲清廷支援攻台。博特失望憤慨之餘，在1664年1月3日攻擊澎湖島上的鄭軍，並在1月10日放火燒毀寺院及附近的房舍。據此，澎湖媽祖宮曾在1664年被毀。博特在其航海記中亦附有澎湖港圖，其中的寺院也在今天-{后}-宮的位置上。 1683年（康熙22年）福建水師提督施琅率軍攻台，在澎湖擊敗由劉國軒率領的明鄭海軍主力，明鄭隨後便即投降。施琅將勝利歸因於媽祖庇佑，並奏請康熙皇帝敕封其為「護國庇民妙靈昭應仁慈天后」。清廷在1684年（康熙23年）准奏，並且派禮部雅虎專程來澎湖致祭，將媽祖封為天后，並改「天妃宮」為「天后宮」。