奎松市
1939年，奎松市根据菲律宾第二任总统曼努埃尔·奎松的指示建立，以取代马尼拉作为国家首都，市名便取自该总统之名；1948年奎松市被宣布为菲律宾首都，直到1976年新的总统令下达，重新確立马尼拉為首都。值得注意的是，奎松市现为马尼拉都会区的主要组成部分，并不隶属任何省份，而菲律宾另有一个奎松省，位于吕宋岛东南的卡拉巴宋地区，其省名也是取自前總統奎松之名。
菲律賓第二共和國
太平洋战争中，日军入侵菲律宾并逼近马尼拉，菲律宾自治领总统曼努埃尔·奎松宣布马尼拉为不设防城市并流亡。日本军队于1942年1月2日进入该市。1942年5月6日，日本占领菲律宾全境。1943年6月，日军军官本间雅晴解散菲律宾自治领，建立“”作为临时政府。1942年12月8日，菲律宾执行委员会通过法令解散一切现存政党，建立“”（他加禄语：Kapisanan sa Paglilingkod sa Bagong Pilipinas，KALIBAPI）规划执政方案。1943年5月6日，日本内阁总理大臣东条英机访问菲律宾，同意给予菲律宾独立，作为日本“大东亚共荣圈”的一部分。