首都
在中國，明朝從應天府（今南京）遷都北平府（改稱順天府，又稱北京），加強北方边防，以防滿蒙兩族侵擾邊疆。李自成佔領首都後，明朝大致滅亡（南明──幾個由明朝皇室在南方建立的流亡政權──則繼續聲稱作為明室正統而存在）。而滿洲人在崇禎十七年五月初二(1644年6月6日)進入北京，将首都从沈阳迁往北京，則代表了正式的權力轉移。這樣的格局在中國歷史屢見不鮮，及至20世紀傳統儒家政體垮臺。滿清覆亡後，基於地方分權及交通技術的改進，國民政府得以在中國抗日戰爭時期迅速遷都，並維持其原有的領導架構。1949年因中國共產黨在中國大陸建立中華人民共和國之后，中華民國政府也從南京遷都至台北市。
南京历史
元至正十一年，红巾军起义爆发。1356年，原为濠州红巾军郭子兴部的明太祖朱元璋攻占集庆，改集庆为“应天府”，以此为基地。他採納謀士朱升「高築牆，廣積糧，緩稱王」的建議，先后消灭陈友谅、方国珍、张士诚等势力。1368年正月，朱元璋在應天稱帝，建立明朝，定都于此。当年，明军北伐攻入大都。建都之后，朱元璋动用了巨大人力，建成全长96华里、世界最长，也是中国最高的城墙，有将近三分之二的城墙保留至今；因而明代南京城面积达到南唐金陵城的三倍（约42平方公里）：西南部市民区即南唐金陵城，东部是新建的皇宫和官衙，西北部则分布有不少军营。永樂十九年，明成祖遷都北京（北京皇宫及官衙均仿照南京制度），将应天府改为南京（留都），仍设六部等机构。