瑞士首都问题
1832年联邦方案的草案中就提出瑞士应有一个容纳各种联邦机构的中央首都。 因此1849年的瑞士宪法中对瑞士的首都做了如下规定：第108条称之为“联邦机构所在地”，包括联邦委员会，联邦大会及联邦政府，这一规定由联邦大会作出。
赫爾維蒂共和國
政府对瑞士内地的无能为力使得瑞士各地新制度的受损失者开始行动，其中包括失去了他们的特权和职权的城市贵族以及失去了它们的垄断地位和行会的城市。8月在苏黎世出现了反对赫尔维蒂政府的力量以及城市与农村之间的冲突。共和国政府派军队去苏黎世，导致情况白炽化。苏黎世关上城门，拒共和国军不纳。1802年9月10日和13日共和国君两次炮轰苏黎世。最后双方达成妥协，政府派驻的市长可以进入城市，但是他不带兵。这个妥协以及苏黎世坚决抵抗的榜样对起义军来说是一个信号，1802年9月和10月整个赫爾維蒂共和國陷入内战，即所谓的“杵棒战争”（），这次内战最终导致了赫爾維蒂共和國的覆灭。在9月内众多州表示不再支持共和国政府。一支起义军在阿尔高聚集后向共和国首都伯尔尼进发。 在伯尔尼赫尔维蒂政府解体。9月14日一些贵族和联邦派的参议员迫使三名政府成员离职，提名了一名过去的伯尔尼将军和联邦派人士为会长。但是这位将军立刻表示不受任，并参加勒比海起义军。因此9月16日老政府又上任。9月18日瑞士内地宣布停火结束，更加加剧了共和国的不利地位。雷丁呼吁全瑞士联邦派颠覆赫尔维蒂，重建老联盟。