乌干达
非洲最大的河流白尼羅河，亦發源在維多利亞湖，流經烏干達全境後，向北進入南蘇丹、苏丹和埃及，再注入地中海。此外，東西部國境線和國內的其他地區，也有很多湖泊穿插其間，使烏干達增加了不少自然上的美景。全國湖泊面積共有35436平方公里，各地沼澤面積共約14567平方公里。
刚果河
刚果河的源头位于赞比亚境内东非大裂谷的高地山区，源头称谦比西河，经过姆韦鲁湖后称卢阿普拉河，向北与发源于坦噶尼喀湖及姆韋魯湖的卢阿拉巴河汇合后，过了基桑加尼附近的斯坦利瀑布后称为刚果河，上游河段全长约2200公里，后折向西流，进入中游河段。