冰藻
一些海冰藻分泌胶状的（EPS）——聚冰蛋白质（ice-binding proteins，IBP）以保护细胞免遭水分子结冰膨胀和结冰—融冰循环的损害。EPS能够改变冰的微结构，为以后的藻类爆发创造环境。居住在冰面的藻类还会分泌一种天然色素来抵御紫外线的侵害。这种叶黄素能够在春季融冰时保护藻类，使其不被能够穿过液态水的紫外线辐射。海冰藻对光照的高效利用能够在春季刚来临时形成较多的聚落，进而产生大量叶黄素形成保护。
冰藻
海冰中的微生物十分多样，其中的优势物种依位置、冰类型和辐照度有所不同。总体而言，羽纹硅藻目（例如北极的"Nitschia frigida"和南极的"Fragilariopsis"）较易发展成优势物种。形成于冰底部约一米长纤维的"Melosira arctica"正如其名，常见于北极，是海洋动物的重要食物。藻类在碎冰形成时聚集，由海水进入海冰中，此时大量原生生物和细菌随海冰浮出水面。海水结冰形成大量气泡，海冰藻就出现在这些气泡中，在（海冰融化形成的水域）的冰面上也有分布。熔池中的优势藻类因含盐度有所不同，含盐度越高，硅藻类就越集中。藻类适应阴暗无光的环境，在冰层中垂直分布主要受到可获得营养的限制。海冰底部稀松多孔，离富有营养的海水最近，这使得底层聚集了最多的海藻。