深海魚
共生发光的深海生物相对较少。典型的游泳深海鱼包括鞭冠𩽾𩾌科和水珍鱼目的一部分，而底栖鱼有突吻鳕科和稚鳕科（又称深海鳕科）。其中，鞭冠𩽾𩾌科以外的三个类群的发光器与消化道相连，可由肠道菌群不断补充发光细菌（主要是"Photobacterium phosphoreum"）。发光器的数量很少，通常为1-2个。
南极中爪鱿
與箭魚和其他大型遠洋魚類不同，大王酸漿魷（以及大王烏賊）的眼睛直徑幾乎是深海同類的2-3倍。 進一步的研究表明，大王酸漿魷能夠看到大型捕食者移動時破壞浮游生物的生物發光。 大王酸漿魷的眼睛在黑暗中會散發光芒。