中国红十字基金会
目前，中国红基会主要实施两大系列的公益项目：一是助医领域的“红十字天使计划”，一是助学系列的“博爱助学计划”。两大系列下面又有很多子项目，如嫣然天使基金（救助唇腭裂儿童）、玉米爱心基金（白血病、卫生院）、捐建博爱小学等。
中國回教協會
2020年，协会与黎巴嫩非政府组织URDA协力，向居住在黎巴嫩贝卡谷地及阿卡省的难民营的叙利亚内战难民捐助了粮食与儿童服装。 中国回教协会主要与台湾政府和地方自治体合作进行清真寺运营、伊斯兰文化宣传、穆斯林权益提升、穆斯林友善化等活动。此外，协会的活动还包括协助已失去信仰的“前回民”群体恢复信仰、发行和广播会志《中国回教》等。 中国回教协会致力于国内穆斯林的培养，在内政部和外交部的资助下于1976年设立了中国回教文化教育基金会，通过此基金会开设奖励穆斯林的奖学金，进行伊斯兰相关的讲学等等。此外，为了填补台湾其他伊斯兰教组织的人员不足，协会也组织相关的志愿活动。