子囊菌门
某些子囊菌门真菌也可以无性生殖，包括芽生、分裂或以分生孢子的方式，但这不是子囊菌门区别于其它真菌门的特征。无性生殖期本门真菌依环境温度不同还改变其形态，这一特性称为双态性，这些真菌称为双态性真菌。阿耶洛双态菌科的许多成员、组织胞浆菌、隐球菌等都属于这一类，它们在环境温度下以丝状真菌（霉菌）存在，吸入人体后在体内高温环境下变成单细胞酵母繁殖，给人类或动物造成急性播散性真菌病或慢性机会性感染。
根黴
孢囊孢子呈圓球形、橢球形或不規則球形，表面有紋路。產生孢囊孢子為根黴屬真菌的無性繁殖方式之一。另一種根黴屬真菌的無性繁殖方式為菌絲局部膨大形成厚膜孢子（chlamydospore）。