皮克斯动画工作室
在艾斯纳被开除，罗伯特·艾格接任迪士尼CEO后，双方又回到了谈判桌。在此时，两个公司把分销协议扩展到定于2007年发行的《美食总动员》。但和旧协议不同，在新协议中，皮克斯负担全部制作费用，拥有所有角色的版权，而迪斯尼只负担发行的费用。2006年1月24日，迪士尼宣布以的形式，用74亿美元并购皮克斯，交易于2006年5月5日完成，并购后分销协议也终止。 通过交易，賈伯斯从持有皮克斯50.1%股份的最大股东变成持有迪士尼7%股份的最大个人股东，他不再担任皮克斯的董事长兼首席执行官，而成为迪士尼董事会的一员。约翰·拉塞特成为迪斯尼动画的创意总监（向总裁兼CEO罗伯特·艾格汇报，并向董事罗伊·愛德華·迪斯尼咨询），同时成为负责主题公园建设的華特迪士尼幻想工程的首席创意顾问。卡特莫尔仍担任皮克斯总裁，同时也是迪士尼动画工作室总裁，向罗伯特·艾格以及迪士尼动画工作室董事长汇报。该并购保证皮克斯保持运营上的独立性，例如皮克斯的人力资源政策仍维持不变。此外，皮克斯的名字仍保留下来，工作地点也维持不变。从汽車總動員开始，电影品牌的标示变为“Disney•Pixar”。
腦筋急轉彎 (電影)
由於達克特於2009年所執導的《天外奇蹟》獲得空前的成功，皮克斯的高層也同意再次讓他製作一部具有更複雜故事的電影。《腦筋急轉彎》是皮克斯首部未在史蒂夫·乔布斯的資助下製作的原創電影；此前，身為蘋果公司前執行長的喬布斯曾是皮克斯的創辦人兼最大股東之一，且對於該工作室的作品有很大的影響力，直到他於2011年逝世為止。此外，迪士尼的首席創意官兼執行製作人約翰·拉薩特當時也因專注於重新組織洛杉磯的華特迪士尼動畫工作室，而較少參與這部電影的製作。迪士尼及皮克斯的高層對於《腦筋急轉彎》的製作提案雖持正面意見，卻也承認這部電影的行銷將會非常困難。