本日山
西藏和平解放前，环绕林芝市巴宜区境内的苯教神山本日山建有苯教寺院七座，即达则寺、衮钦寺、滚巴颠巴寺、嘉黎寺、大卓萨寺、宗琼丹寺、羊滚寺。其他藏传佛教寺院也有不少。如今，本日山周围保存完好的寺庙有4座，即吉日寺、大卓萨寺、达则寺、色迦棍钦寺，均属苯教。达则寺曾为西藏苯教第二大寺。
觉囊派
現存覺囊派的主寺為四川省壤塘縣藏哇寺，阿壩、馬爾康以及青省的班瑪、久治、甘德等七縣，共三十多​​座。僧人約五千。特別值得一提的是位於​​西藏日喀則地區拉孜縣的覺囊寺被毀後，二十世紀八十年代覺囊寺已重建，已完成“十萬佛塔”一座。 现时，觉囊派的主要传播区域以四川的壤塘县为中心，并分布于邻近的四川、青海、甘肃3省交界地区。