鎌倉時代
1274年（文永十一年）、1281年（弘安四年）在幕府执权北条时宗的领导下取得两次反元侵略战争的胜利，而战后受货币经济影响，无法恩赏抗元官兵，导致御家人的贫困与御家人制度的解体。北条氏实行一族独裁，加深御家人和非御家人武士的反感。地方武士和农民的联合武装团体到处进行反幕活动。幕府由盛转衰。后醍醐天皇乘机发动正中之变与元弘之变。倒幕号召得到各地武士响应。1333年5月新田义贞攻陷镰仓，幕府灭亡。
平安时代
平安前期的日本政治針對奈良時代中央集權的律令政治作部分的修正或添加、基本上仍繼承律令體制。然而由於律令體制與現實狀況不符難以實施，律令體制下的班田制在奈良時代便以逐漸崩潰，土地逐漸私有化，並由貴族、寺社掌握，不過此時中央政府仍然可以向貴族、寺社掌控的土地征稅。902年日本進行最後一次班田，此後，政府為確保税收，將作為律令制基本的個人別支配体制改變為以土地作為課税對象，並指派地方有力人士擔任國司（受領），為政府收取租稅。這樣的轉變將中央政府的權力委與民間的有力者，形成新的支配体制。