深海魚
共生发光的深海生物相对较少。典型的游泳深海鱼包括鞭冠𩽾𩾌科和水珍鱼目的一部分，而底栖鱼有突吻鳕科和稚鳕科（又称深海鳕科）。其中，鞭冠𩽾𩾌科以外的三个类群的发光器与消化道相连，可由肠道菌群不断补充发光细菌（主要是"Photobacterium phosphoreum"）。发光器的数量很少，通常为1-2个。
深海魚
即使在深海中，也有微弱的光照射到约1000米深。因此，白天在从下方仰望海面时，会出现上部生物的阴影。通过将发光器置于腹部并将亮度调节至与向下的光线相同的水平，可以消除此阴影。这称为，为大多数中层带游泳深海鱼采用。半深海带鱼类中则很少见到腹部发光器，或因在1000米以上深度（完全黑暗的区域）中反照明效果不达预期。