真菌
真菌的無性生殖有透過產生無性孢子與等機制，前者包括以孢子囊、等特化的結構產生孢子，後者則是菌絲斷裂成為許多片段，每一片段都長成一條新的菌絲。無性生殖可以產生基因上與母體相同、佔據同樣生態棲位的子代，繁殖效率也較有性生殖迅速，可以在短時間快速拓殖。不完全菌是一個舊時的分類名詞，指未觀察到有性世代的真菌，現在分類學上已不使用此名詞，但仍可以用來泛指缺乏有性世代的真菌。
菌絲體
真菌在生態系中最重要的角色之一就是分解有機養分。石化工業產物、殺蟲劑與汙染物等有機物質都可能成為真菌生長的基質，所以只要它們的毒性不會影響真菌的生長，真菌即有能力將它們分解並移除，此即為真菌修復（Mycoremediation）。美國真菌學家保罗·史塔曼兹提倡了以菌絲體作為生物過濾材料的方法，可過濾掉水或土壤中的重金屬與化學物質，這個方法稱為真菌過濾（Mycofiltration）。