臺灣民主國大總統
大本營接納井上與中村的意見，於1895年1月，決定佔領澎湖列島，同年3月26日，日清兩國尚在下關進行和談時，派遣比志島支隊把澎湖島加以佔領。為封鎖清國政府對臺灣的支援，佔領澎湖島是必要並有效的戰略。此佔領給台灣官民帶來衝擊，對日本佔領台灣的企圖感到不安。雖然日清兩國於同月30日簽署了停戰協定，因為台灣與澎湖列島被排除在停戰區域之外，不安情緒更為增高，台灣與澎湖列島割讓的傳說也增加了真實感。清國政府將和談會議上有關遼東半島與台灣割讓之事極力隱瞞，不過，台灣官民由外國人洋行得到情報，和談會議的內容約略已知。
臺灣海峽兩岸關係史
元世祖至元十八年（1281年）元師伐日本，遭颱風襲擊，軍艦大部分沉沒，残部漂至台湾西岸及澎湖，遂設澎湖寨巡檢司，隸屬於福建泉州路，与琉求（台湾）相邻。1292年，元世祖遣使宣抚流求，但到达后跟当地人语言不通，无功而返。元成宗元贞三年（1297年），福建省平章政事高兴遣省都镇抚张浩、福州新军万户张进赴琉求国，生擒130余人而返。第二年正月，又将所俘琉求人放回，要他们归顺元朝，此後不了了之。元明宗至顺元年（1330年）及元统五年（1337年），汪大淵两度由泉州出发到各国贸易，他在《島夷志略》中记载澎湖属泉州晉江縣，而琉球为海外诸国之一。