真菌繁殖
真菌繁殖是一種由交配型控制的複雜過程。 調查顯示出真菌繁殖已經集中在幾個特定不同表現的物種。 不是每個真菌都有產生性別，即使有產生也是同配生殖；而且，"雄性"和"雌性" 不適用在真菌界之中的許多物種。 同配子生殖的物種能讓相同的交配型繁殖，而異配子生殖的物種只能讓不同的交配型繁殖。  同配生殖的真菌中可能只包括從一個細胞到另一個細胞核的轉移。 營養不兼容的物種通常阻止一個真菌和另一個真菌單獨繁殖。 相同的不兼容孤立物種無法繁殖或有效繁殖。 經報告出來的變異型包括同化學型繁殖， 孢子體至配子體的繁殖以及粒線體的雙親轉換。
真菌修復
分解作用是真菌在生態系中所扮演的重要角色之一，由菌絲體往體外分泌酵素達成。木質素和纖維素是植物纖維的兩個主要組成部分。許多真菌可體外分泌酸性物質與酵素以分解纖維素與木質素等大分子物質，進行胞外消化，許多有機汙染物也有類似這些物質的長碳鏈結構。真菌修復的關鍵是找出可分解特定汙染物的真菌種類，已有某些種的真菌被發現有分解VX (神經毒劑)和沙林的能力。