明中都遗址
1368年明朝建立，同年明军北伐，占领元大都，结束了元朝在全国的统治。政治形势发生了巨大变化，经过对南京、关中、洛阳、开封和北平建都利弊分析，明太祖认为南京离中原太远，难于控制；中原又民生凋弊，物力和人力均依靠江南。于是在洪武二年九月下诏选择在濠州（临濠府）西二十里山南陂上建中都中立府，“命有司建置城池宫阙，如京师之制”。
北京市
明朝初年，朱元璋以金陵应天府（今南京市）为京师，大都路于洪武元年八月被明軍收復，改称为北平府，同年十月应军事需要划归山东行省。洪武二年三月，改为北平承宣布政使司驻地。燕王朱棣经靖难之变夺得皇位后，于永乐元年（1402年）升燕京北平为北京，暫稱“行在”（天子行銮驻跸的所在，就称“行在”）且在北伐時常驻于此，现在的北京也从此得名。朱棣行在北京后，一改元態，北京城秩序井然，繁榮安樂。永乐十九年正月，明成祖朱棣正式移鼎燕京，以燕京为京师，稱為「北京」。金陵应天府则作为留都，称南京。明仁宗及明宣宗的时期，因皇帝個人的喜好因素，北京之京师地位一度降為君主暫幸之行在，复稱金陵应天府為南京，明英宗親政後，正統七年（1441年）時才恢復燕京京师的地位。