子囊菌门
某些子囊菌门真菌也可以无性生殖，包括芽生、分裂或以分生孢子的方式，但这不是子囊菌门区别于其它真菌门的特征。无性生殖期本门真菌依环境温度不同还改变其形态，这一特性称为双态性，这些真菌称为双态性真菌。阿耶洛双态菌科的许多成员、组织胞浆菌、隐球菌等都属于这一类，它们在环境温度下以丝状真菌（霉菌）存在，吸入人体后在体内高温环境下变成单细胞酵母繁殖，给人类或动物造成急性播散性真菌病或慢性机会性感染。
準性生殖
目前仍沒有觀察到白色念珠菌能進行有性生殖，過去認為這種真菌只能以無性生殖繁殖，現代研究則發現它亦可進行準性生殖。不同於多數真菌以單倍體的型式存在，白色念珠菌為二倍體，因此其準性生殖不同於其他真菌為單倍體-二倍體-單倍體的過程，而是二倍體-四倍體-二倍體。有研究顯示環境的壓力可以促進白色念珠菌進行準性生殖。