生物化学
氨基酸是形成蛋白质的基本元件。每一种氨基酸都含有氨基端（-NH）和羧基端（-COOH），属于两性（可既带正电又带负电，即带有酸性又带有碱性）分子；其碳α原子上连接着侧链，而氨基端、羧基端和碳α原子则被称为主链（在蛋白质和多肽中）。氨基酸的特点主要由其侧链的化学性质的不同来表现。根据侧链化学性质的不同，氨基酸可以被分为带电氨基酸（如精氨酸、谷氨酸）、极性氨基酸（如丝氨酸）、非极性氨基酸（如苯丙氨酸）等。
蛋白核
人們目前還沒有完全弄清蛋白核中蛋白質的種類和結合狀況。不過，人們已經在蛋白核中發現了加氧酶以外的蛋白質，比如加氧酶活化酶、硝酸還原酶和亞硝酸還原酶。蛋白核在是如何在細胞分裂期間生成的也尚不明確。通過誘變萊茵衣藻進行的研究表明，加氧酶的亞基對蛋白核的組裝至關重要，尤其是兩個會與溶劑接觸的亞基。目前，加氧酶是自我組裝成蛋白核還是需要另外的伴侶分子幫助尚不可知。