滿洲八旗
满洲八旗主要来源于建州和海西女真，此外还有部分东海女真、少部分早期归附的蒙古、索伦、朝鲜人、汉人、清前期归附的雅克萨俄罗斯人、清中期归附的西域回人、金川藏人等等，以最初跟随努尔哈赤起兵的元勋和早期被兼并的他部部众为主，按照女真人的传统狩猎习俗，将他们编入各个佐领之中。1601年，随着建州势力的扩张，努尔哈赤以五佐领为一参领，五参领为一旗，组建黄、红、蓝、白四旗。1615年，又再度增编镶黄、镶红、镶蓝、镶白四旗，合为八旗，当时旗下非女真族来源之人也隶属于满洲八旗，直到清太宗皇太极统治时期，才从满洲八旗分出大部分蒙古和汉人人丁分别组成蒙古和汉军两个独立的旗分。
汉军八旗
崇德二年（1637年）七月，汉军扩建为二旗，旗纛仍为青色。两年后（1639年）再增至四旗，旗纛为纯青镶黄、纯青镶白、纯青镶红和纯青色。不过，无论是汉军一旗、二旗还是四旗时期，旗下人丁的本籍均属满洲旗分之下，当时汉军的旗色只是为了对兵种加以区分。崇德七年（1642年）六月，由于清朝取得松锦大战的胜利，将此战降人和之前大凌河降人编立佐领，与原先的汉人佐领一同组建汉军八旗，旗色与满洲八旗相同，至此汉军开始拥有独立的旗籍。