深海魚
共生发光的深海生物相对较少。典型的游泳深海鱼包括鞭冠𩽾𩾌科和水珍鱼目的一部分，而底栖鱼有突吻鳕科和稚鳕科（又称深海鳕科）。其中，鞭冠𩽾𩾌科以外的三个类群的发光器与消化道相连，可由肠道菌群不断补充发光细菌（主要是"Photobacterium phosphoreum"）。发光器的数量很少，通常为1-2个。
蝦紅素
蝦紅素是一种血紅色的色素，是淡水微藻類中的雨生紅球藻（""）和酵母菌黃單胞菌中天然產生的。當藻類受壓缺乏營養，鹽分增加或日照過多時，就會產生蝦紅素。以這種藻類為食的動物，包括有：鮭魚、紅鱒、（"Pagrus major"）、火烈鸟及各種甲殼類動物（例如：虾、磷蝦、蟹、龍蝦及小龍蝦等海洋生物）均可找到由蝦紅素而引起的橙紅色染色效果。