中国工程院院士
1993年，中华人民共和国国务院决定将中国科学院学部委员改称中国科学院院士，同时宣布成立中国工程院。中国工程院1994年产生第一批96名院士，其中30人为中科院院士。
中央研究院第一屆院士
中央研究院於1948年選舉產生第一屆院士，開中國在學術體制上實行院士制度的先河，後來被海峽兩岸所繼承和發展。除選舉結果被認為體現了當時中國學術界的最高水平外，選舉本身也得到了當時社會各界的較高評價。提名和選舉的全過程均依照中研院主導製訂的法規進行，由學術共同體自主完成，將政治的干預降至最低，基本遵循胡適主張的“以學術立場為主”的原則，保證了選舉的公正性和自主性，樹立了學術公正和學術自由的典範。政治立場明顯傾向中國共產黨的郭沫若、馬寅初等人均以學術貢獻當選（不過郭、馬二人都沒有表示接受院士職務，或以院士身份參與中研院的任何活動），郭沫若的提名和當選還得到政治立場迥異的胡適、傅斯年等人自始至終的支持；具有政府官員身份的朱家驊、翁文灝、吳敬恆、王世-{杰}-、王寵惠等人，早年也曾作為學者從事研究工作，取得過一定的學術成績。因此，選舉的公正性得到時人的普遍認同，例如楊鍾健認為：“院士之當選，在國内一時被認為特殊榮譽。至少在產生方式方面，十分慎重，缺少弊端，其為一般人之重視，當亦在此。”與此相比，1955年中國科學院學部委員的產生，首先在程序上不採用選舉，而是由官方組織少數學者進行協商，再由中共高層決定人選；其次，明確強調政治方面的標準，即要“擁護社會主義、擁護共產黨”；最後，很多人是作為領導意識形態的黨政官員身份當選，本身缺少學術方面的貢獻，例如陳伯達、周揚、胡喬木等。