真菌
真菌的無性生殖有透過產生無性孢子與等機制，前者包括以孢子囊、等特化的結構產生孢子，後者則是菌絲斷裂成為許多片段，每一片段都長成一條新的菌絲。無性生殖可以產生基因上與母體相同、佔據同樣生態棲位的子代，繁殖效率也較有性生殖迅速，可以在短時間快速拓殖。不完全菌是一個舊時的分類名詞，指未觀察到有性世代的真菌，現在分類學上已不使用此名詞，但仍可以用來泛指缺乏有性世代的真菌。
接合孢子
根據產生接合孢子菌絲來源或親和力不同，一般可分為同宗配合和異宗配合兩類。例如毛霉目中就存在這兩種類型。所謂同宗配合，即每一菌體都是自身可孕的，不靠別的菌體幫助而能獨立地進行有性生殖。顯然，沒有兩性異體的黴菌是同宗配合的。如有性根霉單一的孢囊孢子萌發後，所形成的菌絲體，當相鄰兩菌絲靠近時，經過如前所述的過程，便可產生接合孢子。甚至同一菌絲的分枝間也可接觸而形成接合孢子。所謂異宗配合，是指每一菌體都是自身不孕的，不管它是否雌雄同體，都需要藉助別的可親和菌體的不同交配型來進行有性生殖。換言之，接合孢子的產生需兩種不同質的菌絲相遇後才能形成，而這兩種有親和力的菌系，在形態上並無什麼區別。毛霉目中多數種如匐枝根霉、高大毛霉等均以此方式形式接合孢子。異宗配合來自不同質菌絲，那麼如何辨認它們呢?這兩種菌絲分化形成的配子囊，二者在形態、大小上無法區別，更無雌雄之分，但生理上確有差異，所以常用接合作用來判斷。一般以「+」和「-」來表示兩個不同質的細胞，即認定一種配子囊為「+」，凡能與之結合形成接合孢子的配子囊則為「-」，否則為「+」。