藏傳佛教
现代藏传佛教派别主要是在后弘期中逐渐形成的。其主要分为四大主流派别，分别为：宁玛派、噶举派、萨迦派及格魯派。在中文中，这四主流派别因其服饰及建物之特色而常被称为红教、白教、花教及黄教。其中，宁玛派是藏传佛教中历史最悠久的，萨迦派是以位于西藏南部的萨迦寺命名的。以下列表不分先后顺序：現在一般称呼的「黑教」是藏族的苯教之俗称，是佛教传入以前的西藏本土宗教。苯教是一种祭祀大地山河的泛灵信仰，後來一部分教士吸收了佛法名词及教义，在佛法传入西藏之后，苯术已不如佛教盛行。苯教在藏傳佛教勢力較薄弱的地區，如四川、青海一带仍有不少的信徒和寺廟。
藏傳密宗
寧瑪派一直以来遵循蓮花生大士與寂護上師最初所傳的舊密咒，即便是朗達瑪滅佛后，宁玛派的教法传承也与藏传佛教前弘时期的法统一脉相承。在禁佛时期是采取更为隐蔽的方式进行传授。寧瑪派的教法傳承，主要有三種：一遠者經典傳承，二近者埋藏傳承，三甚深淨境傳承。寧瑪派的教法全部包括在九乘三部裏，九乘包括顯三乘〈一聲聞，二獨覺，三菩薩〉、外密三乘（四事乘，五行乘，六瑜伽）和內密三乘(七大瑜伽乘，八无比瑜伽，九无上瑜伽)。