中国社会科学院
1949年11月，中国科学院在北京成立。中国科学院哲学社会科学部最初设有语言研究所、哲学研究所、法学研究所、经济研究所、世界经济研究所、民族研究所、世界宗教研究所、考古研究所、历史研究所、近代史研究所、世界历史研究所、文学研究所、外国文学研究所和情报资料研究室等14个研究单位，总人数2200多人。
中国科学院上海有机化学研究所
中华人民共和国成立后，中国科学院开始接收并改组中央研究院化学研究所。1950年5月，由原中央研究院化学研究所和原北平研究院化学所与药物所合并成立中国科学院有机化学研究所，是中国科学院最初的15个研究所之一。1952年，中国科学院生理生化研究所的有机化学组调入。1953年，药物研究室调出，组建中国科学院药物研究所（现为中国科学院上海药物研究所）。1956年，王葆仁领导的高分子化学组和钱人元领导的高分子物理组调出参建中国科学院化学研究所，成为那里的主要部分。