中华人民共和国教育部
1949年10月，中华人民共和国成立后，成立政务院文化教育委员会、中央人民政府教育部；1952年11月增设中央人民政府高等教育部、中央人民政府体育运动委员会、中央人民政府扫除文盲工作委员会。1954年，重新组建教育部，将扫除文盲工作委员会的职责并入教育部；1958年2月，高等教育部并入教育部。1964年7月，恢复高等教育部。1966年7月，高等教育部再次并入教育部。
中国科学技术大学校史
1993年，国家制定了《中国教育改革与发展纲要》，提出要办好100所左右的重点大学，开始实施“211工程”；随后1998年，教育部决定重点支持部分高校创建世界一流大学和高水平大学，即“985工程”。中科大作为国家首批211工程（1995年进入）和985工程（1999年进入）支持对象，也大力推行教学科研改革和结构性调整，开始了第三次创业。1998年，中科大加入了中国科学院实施的知识创新工程，从而获得了中国科学院更大的支持。