江户时代
江戶時代（1603年－1867年），又稱德川時代，是指日本歷史中在江户幕府（德川幕府）統治下的時期，從慶長八年二月十二（1603年3月24日）德川家康被委任為征夷大將軍在江戶（現在的東京）開設幕府時開始，到慶應三年十月十四（1867年11月15日）大政奉還後結束，為期264年。江户时代是日本封建統治的最後一個時代。在江戶幕府時期，征夷大將軍是實際上政權的控制者、國家的最高領導人，號稱日本國大君，日本天皇朝廷不過是被幕府架空甚至被監控的象徵性元首。
東京都
伊豆群島在江戶時代是德川幕府的直轄地，由伊豆代官統治。同時伊豆群島在江戶時代也是犯罪者的流放地。但這些流放者也為伊豆群島帶來了新技術，促進了伊豆群島的發展。 明治新政權成立時，政府內部對首都地點的意見並不統一，大久保利通主張遷都大阪，而前島密主張遷都江戶。此後遷都江戶派逐漸佔據優勢，而大久保等人也接受了這一主張。1868年，日本政府宣布將江戶改名為東京，江戶城改作為皇居使用，實質遷都東京。但為緩和遷都後公家及京都地區的強烈不滿，明治新政權使用「奠都」而非「遷都」一詞，在名義上實行東西兩京制。1868年9月3日，東京府正式成立。同年和東京府接壤的近郊農村地區設立了。東京府最初的管轄地區僅相當於江戶的町人地，而佔江戶面積約60%的武家地在當時幾乎是荒廢狀態。對此新政府在決定將武家屋敷開墾為桑田或茶田以換取外匯（但這些農田大多因收成欠佳而在後來改為農場），並將部分規模較大的屋敷改建為政府辦公場所或軍用地。現在的赤坂離宮、新宿御苑、明治神宫等大規模綠地也曾是武家屋敷。1871年廢藩置縣後，日本政府設立了新的東京府。在經過數次合併後。1873年時的東京府轄區範圍基本接近現東京都區部的範圍。