冰藻
在极地海洋生态系统的初级生产中，冰藻起着至关重要的作用。作为极地食物网的基础，通过光合作用，它们把二氧化碳和无机营养物质转化成氧气和有机物。在北极圈内，冰藻在初级生产中的参与度从3%~25%到高纬度的50%~70%不等。海冰藻通常在海冰底部积累生物质，供端足类（磷虾等）和桡脚类动物食用，而这些小动物最终又成为鱼类、鲸、海豚和企鹅的食物。海冰藻离开冰面后，沉入海底，被无脊椎海底生物尤其是浮游动物享用。海冰藻富含不饱和脂肪酸，其中的omega-3脂肪酸对桡脚类动物的产卵、孵卵，以及浮游动物的生长发育相当重要。
蛋白核
藻類只能生活在水環境中，即使是陸生的藻類也是如此——這限制了它們對二氧化碳的吸收。二氧化碳在水中的擴散速度比在空氣中的慢10,000倍。另外，二氧化碳在水中濃度達到平衡也需要較長時間。因此，水中的二氧化碳很容易耗盡，水從空氣中吸收二氧化碳的速度也很慢。另外，二氧化碳溶於水後會和水中的碳酸氫根達到平衡。這種平衡受到水中pH值的調控。比如，在海水中，溶解無機碳（DIC）主要以碳酸氫根的形式存在，遊離的二氧化碳很少，在這種條件下，藻類加氧酶的工作速度甚至不能達到最快速度的四分之一。因此，二氧化碳濃度有時會成爲限制藻類光合作用的因素之一。