澎湖縣歷史
1895年4月，《馬關條約》簽訂，依第二條之三「澎湖群島，即英國格林尼次東經百十九度起至百二十度止、北緯二十三度起至二十四度之間諸島嶼」，確定澎湖列島與台灣共同割讓給日本。台灣總督府變更清領時期之府為縣，府轄之縣為支廳，但澎湖廳仍維持建制直屬總督府管轄。
澎湖天后宮
1663年，東印度公司在前一年被鄭成功擊敗，因而失去在台灣的領地後，隨即任命（Balthasar Bort）率艦隊企圖將之奪回。博特曾與清軍聯盟，在中國沿海與鄭軍交戰獲勝，但後來未獲清廷支援攻台。博特失望憤慨之餘，在1664年1月3日攻擊澎湖島上的鄭軍，並在1月10日放火燒毀寺院及附近的房舍。據此，澎湖媽祖宮曾在1664年被毀。博特在其航海記中亦附有澎湖港圖，其中的寺院也在今天-{后}-宮的位置上。 1683年（康熙22年）福建水師提督施琅率軍攻台，在澎湖擊敗由劉國軒率領的明鄭海軍主力，明鄭隨後便即投降。施琅將勝利歸因於媽祖庇佑，並奏請康熙皇帝敕封其為「護國庇民妙靈昭應仁慈天后」。清廷在1684年（康熙23年）准奏，並且派禮部雅虎專程來澎湖致祭，將媽祖封為天后，並改「天妃宮」為「天后宮」。