核糖核酸
在细胞中，根據結構功能的不同，RNA主要分三類，即tRNA、rRNA，以及mRNA。mRNA是依據DNA序列轉錄而成的蛋白質合成模板；tRNA是mRNA上遺傳密碼的識別者和氨基酸的轉運者；rRNA是組成核糖体的部分，而核糖體是蛋白質合成的機械。
細菌小RNA
小RNA可與細菌的其他RNA或蛋白質結合，影響基因表現，調控代謝、感染、對環境反應與細胞結構等，與蛋白質結合後可調控其功能，例如可與RNA聚合酶結合以調控轉錄、tmRNA與轉錄停滯的核糖體結合以啟動反式轉譯、4.5S RNA（信号识别颗粒RNA）組成信号识别颗粒以調控蛋白質的釋放。許多mRNA結合後可能藉由阻擋或開啟核糖体结合位点而影響其轉譯，還有些小RNA為順式作用元件，是由編碼mRNA基因的另一股DNA轉錄產生，因此序列和該基因mRNA互補，可抑制其表現。