九州横断新干线
计划在起点大分市与同样是基本计划路线的东九州新干线及四国新干线连接。特别地，本线和四国新干线都是从大阪经由四国连接九州的太平洋新国土轴构想的基础。然而，这些线路相互连接的具体计划尚未确定。
羽越新干线
1973年11月15日，根据《全国新干线铁道整备法》第四条第一项的规定，本线被列入《确定新建新干线铁路路线的基本计划》（昭和48年运输省告示第466号）中，为12条基本计划新干线之一。富山站至上越妙高站与北陆新干线共线，长冈站-新潟站与上越新干线共线。本线建成后，将与北陆新干线、上越新干线、北海道新干线一起，连接大阪府大阪市-新潟县新潟市-青森县青森市-北海道札幌市，构成贯通日本海侧的新干线通道，不经过首都圈即可往返于西日本和北日本之间。