脂肪族化合物
有机化学中，碳氢化合物被划分为两类：脂肪族化合物和芳香族化合物。芳香族化合物指含有苯环或其它芳香环的烴類，而脂肪族化合物则与其相对，是指結構上不含芳香环的烴類。脂肪族化合物中，碳原子以直链、支链或环状排列，分别称为直链脂肪烃、支链脂肪烃及脂环烃。脂肪族化合物可以是烷烃、烯烃或炔烃。除氢之外，其它的原子也可存在，比如氧、氮、硫和氯。
金属键
有些金屬間化合物（例如會形成原子簇的）有類似分子的性質，這些化合物比較常在化學中進行討論，而不是在冶金學中討論。這些原子簇的形成可以視為是將缺電子的鍵結轉變為更定域化（localized）的鍵結。氢气是这种凝聚形式的极端例子，在高壓下氢是一種金屬，木星內部就有許多的金屬氫，而因為重力本身形成很高的壓力。不過在低壓下，其鍵結定域化，變成為一般的共價鍵，而且定域化非常完全，因此產生了（一般更為熟悉的）H氣體。另一個類似的例子是硼，相較於碳，硼是電子缺乏的元素，不會形成金屬。不過硼有些複雜的結構，例如二十面体的B原子簇。也是和這個相關的現象。