澎湖群島
1895年4月，依據《馬關條約》第二條之三「澎湖群島，即英國格林尼次東經百十九度起至百二十度止、北緯二十三度起至二十四度之間諸島嶼」，確定澎湖列島與台灣共同割讓給日本。设澎湖岛厅，1897年改称澎湖厅。
澎湖廳舍
明治28年（1895年），日軍攻佔澎湖後，在澎湖設置「澎湖列島行政廳」取代清治時期的澎湖廳，並使用原清總鎮署作為辦公廳舍。1896年5月更名為「澎湖島廳」，1897年5月3日實施六縣三廳之際改稱「澎湖廳」。澎湖廳於大正9年（1920年）與阿緱廳（今屏東縣及旗山地區）及臺南廳一部份（今高雄市及岡山鳳山地區）合併為高雄州時，澎湖廳改制為澎湖郡，大正15年（1926年）再獨立復設置澎湖廳，1945年二戰結束前共管轄二支廳。