病毒
病毒的流行病学是现代医学中的一个分支，主要是研究基于人的病毒的传播途径和对病毒感染的控制方法。病毒的传播可以是垂直方式，如从母亲到婴儿，或者是水平方式，即从一个人到另一个人。的例子包括乙肝病毒和艾滋病毒，婴儿一出生就会从母亲处感染病毒；另一个少见的例子是水痘－带状疱疹病毒，虽然只会引起较温和的感染反应，但对于胎儿或刚出生的婴儿却是致命的。是最普遍的病毒在人群中的传播方式。病毒的传播途径包括：血液交换或性行为，如艾滋病毒、乙肝和丙肝病毒；口部的唾液交换，如人类疱疹病毒第四型；含病毒的食物或饮用水，如诺罗病毒；呼吸入以气溶胶形式存在的病毒，如流感病毒；以蚊虫为载体，通过蚊虫叮咬注入人体，如登革熱病毒。病毒感染的传播速率取决于多重因素：包括人口密度、易感染个体（例如缺乏对该病毒的免疫力）的数量、医疗和天气条件等。
鼠冠狀病毒
鼠冠狀病毒有超過25種不同株系，以呼吸道或糞口途徑傳播，其中有許多可感染鼠類的肝臟，曾被用作研究肝炎的動物模型，亦有感染腸道與神經組織者。MHV-D、MHV-DVIM、MHV-Y與MHV-RI以侵染腸道為主，有時也感染脾臟、肝臟與淋巴組織，以糞口途徑傳播；MHV-1、MHV-2、MHV-3、MHV-A59、MHV-S與MHV-JHM等病毒株感染初期在呼吸道複製增殖，進而擴散至肝臟、肺與腦等其他器官，其中MHV-JHM主要感染中樞神經，是MHV病毒株中最多人研究的，此病毒株於1949年自小鼠腦部分離後被世界各地許多實驗室使用而又分化成諸多株系，其感染的腦部細胞種類和毒力也有差異，包括毒力很高、感染神經元與神經膠細胞的JHM.SD（又稱MHV-4）、JHM-DL與JHM cl-2等，以及毒力弱化的V5A13.1和OBLV60等；除了MHV-JHM之外，主要感染肝臟的MHV-A59也能感染腦部，但毒力弱於前者，這些感染神經的鼠肝炎病毒可造成急性或慢性的神經性症狀，且因其感染會刺激小鼠自身的免疫反應，導致神經元，而被用作研究多發性硬化症的動物模型。另外MHV-2、MHV-3與MHV-A59可感染肝臟，其中前兩者毒力較強，MHV-3為用來研究肝炎的主要病毒株；MHV-1則主要感染肺部。