深海魚
共生发光的深海生物相对较少。典型的游泳深海鱼包括鞭冠𩽾𩾌科和水珍鱼目的一部分，而底栖鱼有突吻鳕科和稚鳕科（又称深海鳕科）。其中，鞭冠𩽾𩾌科以外的三个类群的发光器与消化道相连，可由肠道菌群不断补充发光细菌（主要是"Photobacterium phosphoreum"）。发光器的数量很少，通常为1-2个。
萤科
萤火虫发光是为了求偶， 有些种类的萤火虫只有雄虫有发光器官，而有些種類则双方都有。有些种类的光是一闪一闪的，有些则是持续不斷的發光。这种信号是因种類而异的，在长度和节律上都有所不同。北美的東美螢火蟲（"Photinus pyralis"），雌性虫也有发光器官，雌雄识别的关键是雌虫在接收到雄虫光信号后两秒钟应答。而在另一些种类里面，这些甲虫会与周围的间断光信号同步，从外面看起来，整个树丛或森林就在同步發亮了。