偶蹄目
这使得偶蹄动物传统上被定义为无效的並系群分类，因为它包括来自共同祖先的动物，但不包括其所有后代。系统发育分类只识别单系群分类群; 也就是从一个共同的祖先下降，并包括其所有后代的群体。为了解决这个问题，传统的偶蹄目和鯨目有时被归入更具包容性的鯨偶蹄目(Cetartiodactyla)分类群中。另一种方法是在修订后的偶蹄目分类单元中包括陆地居住的甚至有蹄类动物和海洋栖息的鲸类动物（鲸目改为鲸下目）。本目各亚目的演化关系如下：
多彩海麒麟科
多彩海麒麟科（學名：），亦作多彩海蛞蝓科或多彩海牛科，是一個色彩繽紛的海蛞蝓支序分類科，其多姿多彩在整個動物界也很少見。舊屬後鰓目，根據布歇特和洛克羅伊的腹足類分類 (2005年)，被劃歸裸側類裸鰓類支序（）的有角鰓類（）支序海牛亚目（）海牛總科（）。現時本科有超過360個已描述的物種，主要發現於熱帶及亞熱帶的水域，是所在地的珊瑚礁群落的成員，特別是在其獵物海綿的附近。