子囊菌门
某些子囊菌门真菌也可以无性生殖，包括芽生、分裂或以分生孢子的方式，但这不是子囊菌门区别于其它真菌门的特征。无性生殖期本门真菌依环境温度不同还改变其形态，这一特性称为双态性，这些真菌称为双态性真菌。阿耶洛双态菌科的许多成员、组织胞浆菌、隐球菌等都属于这一类，它们在环境温度下以丝状真菌（霉菌）存在，吸入人体后在体内高温环境下变成单细胞酵母繁殖，给人类或动物造成急性播散性真菌病或慢性机会性感染。
木腐真菌
木腐真菌是指一類能在树木上生長並侵入木材組織分解木材的真菌，大多數的木腐真菌只能在枯死的树木上進行生長，例如褐腐真菌，但仍有少數腐菌能攻擊活樹，如"honey fungus"。真菌在木材上生長和繁殖需要有高於纖維飽和點以上的水分 ，當真菌滲入木材的纖維結構後，能產生酶將木材的組織分解來獲取養分，能讓複雜的分子分解並將養分返回土壤，回歸自然界中 。不同的木腐真菌所產生的酶不同，可以降解不同的木材成分，並產生不同的木材腐朽形態 ，並可藉此將木材腐朽真菌大致區分為褐腐、軟腐和白腐真菌。 由不同真菌作用分解的殘留物具有不同的pH、溶解度和氧化還原電勢，這些殘留物最後會變成土壤中沈積物中，隨著時間的累積，可能對該地區的環境產生顯著影響。目前全世界约有5,000余种木腐真菌。