真菌
除了球囊菌門與微孢子蟲外，其他門的真菌都可透過減數分裂產生配子、進行有性生殖（且基因組分析顯示球囊菌門與微孢子蟲的真菌應該也能進行有性生殖，只是尚未觀察到）。真菌有性生殖的過程與動物、植物相當不同，而不同真菌間特化來進行有性生殖的結構也有差異，是鑑定真菌物種的重要依據，而拿不同真菌進行交配實驗，觀察兩者能不能形成子實體，可以透過生物物種概念（biological species concepts）以兩者能不能成功交配、交配產生的子代有沒有生殖能力來判斷它們是不是同一物種 。主要的生物類群早期都是以有性生殖特化的結構與孢子差異來描述、區分的，例如產生子囊的子囊菌門與產生擔子的擔子菌門。有一些物種還有交配型之分，必須不同交配型的兩個體才可以交配（heterothallic），其他物種則可以和所有個體交配，甚至自交產生孢子（homothallic）。
天麻
天麻需要与真菌蜜环菌共生在腐烂的木头上 ，依赖真菌菌丝入侵根系吸取营养。因此就需要选好生长蜜环菌的木材，而木质坚硬的粗木是较为适合的，可选择水青冈、栎树、桦树、桤木、栗树等树种。选择好树种後，将木材截成大段，每隔十多厘米砍出一小口，整体呈鱼鳞状排列。接种蜜环菌後，将段木排成两层於坑中，层间填充腐殖土，保持适当温度和湿度，经2－4个月後即可长出蜜环菌，然後清除腐烂的蜜环菌，保留生长良好的蜜环菌，播种时将麻种栽於两层菌材间，重新填好土即可。若用种子或蒴果进行有性繁殖，也可采用上述的方法，只需在播种时，於两层菌材间多放一些树叶和腐殖土等覆盖物即可。天麻从10月中旬至翌年4月处於休眠期，因此采收应在此时段内进行，而播种的时间应选在10月中旬左右。