厦门港
厦门港指台湾海峡西岸环厦门湾和东山湾的港区，包括东渡、海沧、翔安、招银、后石、石码、古雷、东山、云霄和诏安等十个港区。港口、航道和水路运输实施行政管理的交通行政管理部门为厦门港口管理局。
五通码头
由于二期的候船楼仍然无法满足乘客需求，因此五通码头决定启动三期工程。2013年10月，厦门市规划局批复五通码头三期工程的规划方案。根据媒体报道，五通码头已于2015年启动三期建设。根据规划，五通码头三期总用地面积为7.14万平方米，包括总建筑面积10万多平方米的候船楼一座，共五层，建筑高度23.7米；水工方面包含客运码头及岸壁改造两部分，在原有两个5000吨级杂货泊位的岸壁结构上进行改造，改造成6个客运泊位，每2个泊位可兼顾停靠1艘客船，并新建钢趸船3艘，同时对东侧210m长度范围内的护岸进行改造。