皮克斯动画工作室
在艾斯纳被开除，罗伯特·艾格接任迪士尼CEO后，双方又回到了谈判桌。在此时，两个公司把分销协议扩展到定于2007年发行的《美食总动员》。但和旧协议不同，在新协议中，皮克斯负担全部制作费用，拥有所有角色的版权，而迪斯尼只负担发行的费用。2006年1月24日，迪士尼宣布以的形式，用74亿美元并购皮克斯，交易于2006年5月5日完成，并购后分销协议也终止。 通过交易，賈伯斯从持有皮克斯50.1%股份的最大股东变成持有迪士尼7%股份的最大个人股东，他不再担任皮克斯的董事长兼首席执行官，而成为迪士尼董事会的一员。约翰·拉塞特成为迪斯尼动画的创意总监（向总裁兼CEO罗伯特·艾格汇报，并向董事罗伊·愛德華·迪斯尼咨询），同时成为负责主题公园建设的華特迪士尼幻想工程的首席创意顾问。卡特莫尔仍担任皮克斯总裁，同时也是迪士尼动画工作室总裁，向罗伯特·艾格以及迪士尼动画工作室董事长汇报。该并购保证皮克斯保持运营上的独立性，例如皮克斯的人力资源政策仍维持不变。此外，皮克斯的名字仍保留下来，工作地点也维持不变。从汽車總動員开始，电影品牌的标示变为“Disney•Pixar”。
谁陷害了兔子罗杰
不过，影片的拍摄计划真正得到批准还是在预算被削减到了2990万美元的时候，这在当时仍然创下了拍摄动画电影最高的预算纪录。迪斯尼公司的另一位决策人相信，真人与动画一起出演的这部电影将“挽救”迪斯尼公司的动画部门。斯皮尔伯格的合约包括大部分创意的主控权和大比率的票房利润分成，而迪斯尼公司则保留所有的商品销售权。斯皮尔伯格说服了华纳兄弟公司、、环球影业、特纳娱乐公司等电影公司或工作室“借出”他们的动画角色出现在电影中，并且有些时候这种出现还是精心设计的。例如，迪斯尼公司的唐老鸭和华纳兄弟公司的达菲鸭是一对同样很有天份因而相互竞争的钢琴演奏家，米老鼠也和兔八哥出现在同一个镜头里。另外斯皮尔伯格和其它公司达成的协议中也包括这些公司将不会涉足本片的制作过程，但他还是没能说服包括哥伦比亚广播公司在内的其它多家公司请来大力水手、猫和老鼠、鬼马小精灵等动画角色出场。特瑞·吉列姆原本获得了执导本片的机会，但是他却认为这一项目在技术上太具挑战性因而没有接受，他之后承认，“我纯粹就是懒，对此我真是后悔死了”。罗伯特·泽米基斯因之前《回到未来》和《寻找绿宝石》的成功而于1985年重新被选中执导，理查德·威廉姆斯则获聘负责导演片中的动画镜头。