正蓝旗
正蓝旗分为满洲、蒙古、汉军三部分，最初由四大贝勒之一莽古尔泰担任旗主。天聪六年，莽古尔泰获罪解职，正蓝旗便由大汗皇太极亲自统帅，成为上三旗之一。直到顺治皇帝继位，睿亲王多尔衮摄政，他把自己所属的正白旗升为上三旗，而将正蓝旗降为下五旗，并改由诸王、贝勒和贝子分统。清朝末期，正蓝旗下辖83整佐领、11个半分佐领，共有旗兵两万六千人，算上家眷总人口约13万人。
清代蒙古
清代蒙古分為八旗蒙古、內屬蒙古與外藩蒙古，實行盟旗制與札薩克制。八旗蒙古於天聰九年（1635年）從八旗滿洲中分出，是與八旗滿洲、八旗漢軍性質相同的軍事組織。此後建旗、划界，旗逐渐成为整個蒙古地區的社会组织方式，旗亦演变成至今仍在使用的行政單位。內屬蒙古各旗由朝廷任命官員治理，與內地的州、縣無異。外藩蒙古各旗則由當地的世襲札薩克管理，處於半自治狀態。在外藩蒙古，以若干旗合為一盟，設正、副盟長，掌管會盟事宜，並對各旗札薩克進行監管。在中央，則由理藩院統管蒙古事務。