上海市
2013年8月，国务院正式批准设立中国（上海）自由贸易试验区。该试验区成立时，以上海外高桥保税区为核心，辅之以机场保税区和洋山港临港新城，成为中国经济新的试验田，实行政府职能转变、金融制度、贸易服务、外商投资和税收政策等多项改革措施，并将大力推动上海市转口、离岸业务的发展。该项目立项的过程中曾遭遇阻力，但得到中共中央总书记习近平及国务院总理李克强的支持，该项目最终成功启动。2013年9月29日，上海自由贸易区正式挂牌成立。
上海推进科技创新中心建设办公室
2015年4月27日，随着上海自贸区范围扩大（包括张江高新区），中国（上海）自由贸易试验区管理委员会（与浦东新区人民政府合署办公）设立区域性的张江管理局，与张江高新区管委会合署办公。