臺灣民主國大總統
大本營接納井上與中村的意見，於1895年1月，決定佔領澎湖列島，同年3月26日，日清兩國尚在下關進行和談時，派遣比志島支隊把澎湖島加以佔領。為封鎖清國政府對臺灣的支援，佔領澎湖島是必要並有效的戰略。此佔領給台灣官民帶來衝擊，對日本佔領台灣的企圖感到不安。雖然日清兩國於同月30日簽署了停戰協定，因為台灣與澎湖列島被排除在停戰區域之外，不安情緒更為增高，台灣與澎湖列島割讓的傳說也增加了真實感。清國政府將和談會議上有關遼東半島與台灣割讓之事極力隱瞞，不過，台灣官民由外國人洋行得到情報，和談會議的內容約略已知。
澎湖縣歷史
澎湖，古稱「平湖」或「彭湖」。史前時期，有在澎湖海溝發現的澎湖原人，屬於更新世中後期的直立人；粗繩紋陶為代表的新石器文化存在，證明澎湖至少在五千年前已有人类生活。连横在1920年所著《台灣通史》稱：「澎湖之有居人，尤遠在秦和漢之際，或曰楚滅越，越之子孫遷於閩，流落海上，或居於澎湖。」而史籍可考的最早歷史史學家的看法不一，在隋代以前，並無任何文獻資料可供參考，一些學者認為最早見於文獻上的記載可能為《隋書·流求國傳》記載的隋煬帝三次派兵伐「流求」。南宋理宗寶慶元年（西元1225年）宗室趙汝適著「諸蕃志」中明確指出「泉有海島曰彭湖，隸晉江縣」。 元初馬端臨的《文獻通考》曾記載：“琉求國在泉州之東，有島曰澎湖。煙火相望，水行五日而至”。