深圳市
深圳地铁一期工程于1998年开工，包括1号綫首通段和4号綫南段，并于2004年12月通车，深圳成为中国大陆继北京、天津、上海、广州后第五个拥有地铁的城市。二期工程则于2007年开始陆续开工，并于2011年6月全部通车营运，共新增站点118个。截至2016年底，深圳地铁已有8条线路、199座车站投入运营，运营总里程286公里。日均客流354万人次，约占深圳市公共交通客流量的三分之一。深圳地铁目前运营的线路有1号綫、2号綫、3号綫、4号綫、5号綫、6号綫、7号綫、8号线、9号綫、10号綫、11号綫。在建的线路有5号綫西延段、3号线东延段、6号线支线、11号线东延、8号线东延。
穗深城际铁路
2008年12月21日，穗莞深城轨东莞—深圳机场段在深圳宝安区举行开工仪式。按当时的规划，穗莞深城轨起于广州地铁5号线鱼珠站，经广州庙头、开发区，东莞麻涌、洪梅、沙田、厚街、虎门、长安，深圳松岗、沙井、福永、机场北，终点为深圳机场，设16个站，全长约86.62公里，总投资196.9亿元。东莞—深圳机场段先行开工，全长70.4公里，总投资156.78亿元，原计划总工期3年。另外深圳地铁11号线在松岗站将预留向西北延伸与穗莞深城轨东莞段衔接的条件，若条件成熟，穗莞深城轨列车将利用11号线轨道直通福田中心区，线路全长118公里，设站22个，全程运行时间约83分钟。此外穗莞深城轨东莞段原计划经麻涌、望牛墩、道滘、汽车总站、会展中心、厚街、虎门、长安进入深圳，途经东莞市中心，但在2008年方案改为经东莞西部，经麻涌、洪梅、沙田、厚街、虎门、长安。