通用儲值票
1984年，九鐵票務系統自動化，採用和地鐵類似的相同大小磁性車票，同時接受儲值票（只適用於九龍站（即現紅磡站）至上水站普通等車廂。羅湖站須使用羅湖儲值票，或逐次購買單程票或來回票。頭等車廂則不設任何儲值票，只可逐次購買頭等單程票或購買頭等附加票；儲值票使用者不可以使用憑此票繳付頭等車資。因應地鐵儲值票適用範圍擴展至九鐵，改稱「通用儲值票」。
查理卡
自动检票机不仅可以使用查理卡，也可以使用查理票（）。查理票是一种印有磁条的纸质车票，既可用作一次性车票使用，也可以作为储值卡使用，还有日卡、周卡和月卡形式。查理票最初于2005年2月以储值票的形式应用在，后来推广至所有线路。 乘客使用查理票时，需要将票插入检票口门前的插槽内，机器收取车费后，将卡内剩余余额显示在屏幕上，并打印新的票。即便票内没有余额，机器也会将票还给乘客。