中国科学院
中国科学院院士从全国最优秀的科学家中选出，每两年增选一次。目前有院士702人，外籍院士53人。全体院士大会是最高权力机构，其常设领导机构是学部主席团，由中国科学院院长担任学部主席团执行主席。
中央研究院第一屆院士
中央研究院於1948年選舉產生第一屆院士，開中國在學術體制上實行院士制度的先河，後來被海峽兩岸所繼承和發展。除選舉結果被認為體現了當時中國學術界的最高水平外，選舉本身也得到了當時社會各界的較高評價。提名和選舉的全過程均依照中研院主導製訂的法規進行，由學術共同體自主完成，將政治的干預降至最低，基本遵循胡適主張的“以學術立場為主”的原則，保證了選舉的公正性和自主性，樹立了學術公正和學術自由的典範。政治立場明顯傾向中國共產黨的郭沫若、馬寅初等人均以學術貢獻當選（不過郭、馬二人都沒有表示接受院士職務，或以院士身份參與中研院的任何活動），郭沫若的提名和當選還得到政治立場迥異的胡適、傅斯年等人自始至終的支持；具有政府官員身份的朱家驊、翁文灝、吳敬恆、王世-{杰}-、王寵惠等人，早年也曾作為學者從事研究工作，取得過一定的學術成績。因此，選舉的公正性得到時人的普遍認同，例如楊鍾健認為：“院士之當選，在國内一時被認為特殊榮譽。至少在產生方式方面，十分慎重，缺少弊端，其為一般人之重視，當亦在此。”與此相比，1955年中國科學院學部委員的產生，首先在程序上不採用選舉，而是由官方組織少數學者進行協商，再由中共高層決定人選；其次，明確強調政治方面的標準，即要“擁護社會主義、擁護共產黨”；最後，很多人是作為領導意識形態的黨政官員身份當選，本身缺少學術方面的貢獻，例如陳伯達、周揚、胡喬木等。