子囊菌门
某些子囊菌门真菌也可以无性生殖，包括芽生、分裂或以分生孢子的方式，但这不是子囊菌门区别于其它真菌门的特征。无性生殖期本门真菌依环境温度不同还改变其形态，这一特性称为双态性，这些真菌称为双态性真菌。阿耶洛双态菌科的许多成员、组织胞浆菌、隐球菌等都属于这一类，它们在环境温度下以丝状真菌（霉菌）存在，吸入人体后在体内高温环境下变成单细胞酵母繁殖，给人类或动物造成急性播散性真菌病或慢性机会性感染。
菌丝
菌丝的生长有独特的方法，它可以通过环境刺激来控制，例如利用电场來刺激菌丝。菌丝亦可以感受到一定範圍內的生殖单位，並朝向它们成长。菌丝亦可以穿透一些渗透面。对在琼脂培养基等均匀的基质上，各个方向的初始菌丝生长均匀，但逐渐倾向于从中心朝向外部。菌丝的生长随温度的不同有着很大的变化。菌丝可以通过许多不同的方式进行修饰以提供特定的功能。