戊戌变法
維新黨人中，康有為早離開北京，梁啟超逃入日本使館。其他數十人被捕，包括稱為「戊戌六君子」的譚嗣同、杨锐、林旭、劉光第、楊深秀、康廣仁，六人於9月28日被棄市於菜市口法場。剛毅親自監斬。徐致靖處以終身監禁（庚子之亂後得赦免）；張蔭桓則流放新疆。
孫家鼐
戊戌變法期間，孫家鼐主張向歐美學習，指出「中國以禮教為建邦之本，綱常名義，萬古常新」，變法乃維護清廷統治的工具，固有制度不可打破，與康有為、梁啟超等維新派的主張不同。二十四年，慈禧發動戊戌政變，停止新政，囚禁光緒帝，殺「戊戌六君子」。孫家鼐變法立場較溫和，遂未被追究。