冰藻
一些海冰藻分泌胶状的（EPS）——聚冰蛋白质（ice-binding proteins，IBP）以保护细胞免遭水分子结冰膨胀和结冰—融冰循环的损害。EPS能够改变冰的微结构，为以后的藻类爆发创造环境。居住在冰面的藻类还会分泌一种天然色素来抵御紫外线的侵害。这种叶黄素能够在春季融冰时保护藻类，使其不被能够穿过液态水的紫外线辐射。海冰藻对光照的高效利用能够在春季刚来临时形成较多的聚落，进而产生大量叶黄素形成保护。
毬藻
冰島瑪花頓湖（Lake Mývatn）的毬藻群落近年來由於不明的原因，數量大量的衰減，幾乎絕滅。在日本的阿寒湖，人們投下相當大的心力與資金，來保護及推廣毬藻及相關的文化產業，包括了每年一度、為期三天的毬藻祭。毬藻在日本也被視為環境教育中重要的一環。在日本，毬藻是國家指定的特別天然紀念物。瑪花頓湖和阿寒湖都是被保護的棲地，前者為自然保留區，後者為國家公園。