中国社会科学院
1949年11月，中国科学院在北京成立。中国科学院哲学社会科学部最初设有语言研究所、哲学研究所、法学研究所、经济研究所、世界经济研究所、民族研究所、世界宗教研究所、考古研究所、历史研究所、近代史研究所、世界历史研究所、文学研究所、外国文学研究所和情报资料研究室等14个研究单位，总人数2200多人。
中国科学院神经科学研究所
1956年，神经生理学学者张香桐从美国辗转回到中国。此前，中国科学院生理生化研究所所长冯德培已经得到消息，于是竭力邀请张香桐到生理生化研究所工作，主持中枢神经系统的生理学研究。张香桐到上海后开始建立中枢神经系统生理研究室。1958年，中国科学院生理生化研究所的生理部分和生物化学部分分开成为独立的中国科学院生理研究所和中国科学院生物化学研究所。冯德培任生理研究所所长，生理生化研究所副所长王应睐任生物化学研究所所长。生理研究所由五个研究室组成，其中三个主要关注神经科学（中枢神经系统生理研究室、神经肌肉生理研究室和感觉器官生理研究室）。1980年，中枢神经系统生理研究室的一半由上海生理研究所分出，独立为中国科学院上海脑研究所，张香桐任所长。