中華民國
儘管國語作為共通語被廣泛使用，台灣的不同族群亦有各自不同的語言使用習慣。對於人數最多、比例最高的閩南裔，臺灣話常被視為母語使用，金門縣居民則使用同屬閩南語的金門話；客家人族群也常使用臺灣客家語交談。雖然絕大部分遷往臺灣地區的外省人用國語溝通，大多數連江縣和烏坵鄉居民則將福州語與莆仙語視為母語。另外臺灣原住民族使用的臺灣南島語言常被視為南島語系發源地，但臺灣原住民族會使用母語的人口逐漸下降，國語的使用率則上升。目前臺灣原住民族14種現存語言中，有5種被認為是可能滅絕的瀕危語言。
魯凱語
台灣原住民魯凱語認證考試原先分為6類方言（含大武魯凱語），後再簡縮為5類方言: 魯凱語是在台灣南島語言上唯一沒有南島語配列的語言。 大南魯凱語（Tanan）也是含有大量的輔音成分的台灣南島語，有 23 個輔音及 4 個元音且有音長的對照關係。 大南魯凱語如同其他台灣南島語一般也用動態/非動態來替代人稱/非人稱之表達法。 羅斯（Ross 2009）指出時下的南島語系的重建工作沒有考慮到魯凱語群，因而認為對整體南島語系的架構之建立並不切實。