日本海军历史
1895年4月17日签署的马关条约结束了这场战争，清朝向日本割让台湾和澎湖列岛。日本海军在台湾登陆后从3月到10月镇压了新成立的台湾民主国的清朝残余势力。台湾及澎湖到1945年再轉交中華民国。此外日本还获得了辽东半岛，后来在法国、德国和俄国的干涉下日本归还了辽东半岛，但此后不久俄国占领了辽东半岛的旅顺和大连作为租借地。
馬祖列島
1911年10月10日爆發辛亥革命後，清朝專制遭到推翻，隔年1月1日中華民國成立。馬祖列島隨後交由中華民國福建省管轄。1927年8月1日，執政的國共兩黨爆發南昌起義，標誌著國共內戰的開始。1937年9月10日，由於中国抗日战争的爆發，日本透過偽軍侵佔了北竿島和南竿島，雖無日軍登島駐防，但仍切斷列島與內地航行，使得兩座島嶼成為福建首批被日本佔領的島嶼之一，其他附屬島嶼在二戰期間並被日本軍隊佔領，因為它們在軍事上並無重要價值，直至1945年8月15日日本投降。