鎌倉時代
1274年（文永十一年）、1281年（弘安四年）在幕府执权北条时宗的领导下取得两次反元侵略战争的胜利，而战后受货币经济影响，无法恩赏抗元官兵，导致御家人的贫困与御家人制度的解体。北条氏实行一族独裁，加深御家人和非御家人武士的反感。地方武士和农民的联合武装团体到处进行反幕活动。幕府由盛转衰。后醍醐天皇乘机发动正中之变与元弘之变。倒幕号召得到各地武士响应。1333年5月新田义贞攻陷镰仓，幕府灭亡。
室町幕府
室町幕府（），也称足利幕府（），是日本历史上第二个幕府政权，由足利尊氏于1338年开设，终于1573年，其间共经历16代室町征夷大将军（由於第10和12代將軍是同一人，所以有說是15代）。室町幕府雖然長達二百多年，但有一半時間國家處於戰亂之中，幕府並無能力去控制擁兵自重的大名，日本步入長達一個半世紀的战国时代。