中国工程院院士
1993年，中华人民共和国国务院决定将中国科学院学部委员改称中国科学院院士，同时宣布成立中国工程院。中国工程院1994年产生第一批96名院士，其中30人为中科院院士。
南京大学
自1956年至今的30项中国自然科学最高奖国家自然科学一等奖中，6项的唯一得奖人或第一得奖人曾就读于南京大学：馮康、劉東生、王德寶、秦仁昌、侯先光、閔乃本；另有2人曾執教南京大學：李四光、錢崇澍；另外“人工合成牛胰岛素试验研究”由南大校友王应睐领导完成；而全部约一半项目的得奖人名单中有南大校友，遥遥领先。在国家最高科学技术奖得主中，除毕业于前南大附中的袁隆平外，南大有三位校友：劉東生、閔恩澤、吳良鏞。2006年的一个统计显示，在中国科学院约120位研究院所机构负责人中，15人毕业于南京大学，位居第二位的北京大学为10人，第三位的中国科学技术大学为7人；在2010年的统计中，14人本科毕业于南大，位居第二名的北大为7人，第三名的复旦大学5人。各校本科毕业校友中的国家杰出青年科学基金获得者，南大108人，居第一位；北大96人（含合并的北医大共107人），居第二位；中国科大76人，居第三；清华大学61人（含合并院校共62人），居第四。在1992年至今的78位中国青年科学家奖获得者中，南大毕业校友5人，北大和清华毕业校友均为4人，名列前三。