日本宗教
對一般的日本人來說，「宗教」或「信仰」，指的是參加宗教組織，（如教會、念佛社等），因此當日本人被問及「你屬於那個宗教信仰？」根據日本放送協會（NHK）的研究，大部分日本人會表示「無宗教，無信仰，或神道與民間信仰」，只是指他不屬於任何宗教組織，但其實一般日本人同時採用神道與佛教習俗且時常參拜神社與寺院。1996年，阿滿利麿（Ama Toshimaru）在《日本人為甚麼無宗教信仰》中解釋，多數日本人不參加宗教組織，但會經常祈求和祭祖、祭拜神靈，如果依照文化上的定義，這些日本人屬於神道與佛教的信徒。根據皮尤研究中心在2010年的調查，超過半數的日本人沒有明確的宗教信仰。
日本正教会
最早在1864年，有三位日本人改宗东正教，（虽然还有更早就在俄罗斯就已皈依的。）尼古拉在日俄战争期间仍留在日本传教，并被任命为日本正教会主教。1863年左右，他将教会本部迁移至东京。至1868年，日本正教会已有逾一万名信徒。1891年，尼古拉在东京神田建立了教堂，并在那里度过了他的余生。圣尼古拉还将新约全书及其他基督宗教著作翻译为日文。