澎湖縣歷史
1895年4月，《馬關條約》簽訂，依第二條之三「澎湖群島，即英國格林尼次東經百十九度起至百二十度止、北緯二十三度起至二十四度之間諸島嶼」，確定澎湖列島與台灣共同割讓給日本。台灣總督府變更清領時期之府為縣，府轄之縣為支廳，但澎湖廳仍維持建制直屬總督府管轄。
海南特別行政區
民國34年（1945年）戰後，先由臺灣省行政長官公署接收管轄南海诸岛，12月12日，中華民國政府設立管理處隸屬廣東省政府管轄。民國35年（1946年）10月5日，法國Chevreud號侵入並登陸南沙群島南威島和太平島，在島上建立石碑，當時國民政府提出抗議，並與法方決定於該月及翌年1月4日進行談判，但因越南战争緊張，法國自動放棄談判。11月24日，中華民國國民政府派遣海軍「中業號」、「永興號」、「太平號」、「中建號」等四艘軍艦，由指揮官林遵、姚汝鈺率領南下，並有內政及陸海空各部代表隨往視察，會同海軍在廣州出發，赴西沙、南沙進駐接收，豎立起石碑並舉行接收和升旗典禮。設立「西沙群島管理處」及「南沙群島管理處」，由海軍管轄。民國39年（1950年）5月，解放軍攻陷海南島。國軍在撤離海南島的同時，駐守南沙及西沙的國軍一齊撤離，僅保留東沙群島的駐軍。解放軍於5月13日進駐西沙的永兴岛；菲律賓民間人士則佔領了包括南沙太平島在內的9座島礁，大肆盜採磷礦。民國45年（1956年），中華民國政府先後派出海軍立威部隊、威遠部隊和寧遠部隊三次「威力偵巡」宣示領土主權，驅離南沙群島的菲律賓人員，派遣海軍陸戰隊戍守太平島。6月5日，成立「東沙守備區」及「南沙守備區」，隸屬海軍司令部。雖然法理上海南特別行政區依然存在，但行政機關已經完全停擺，也沒在台灣本島，太平島或東沙島復辦。