蜕皮
爬行动物的表皮是皮肤的角质化产物，没有活的细胞，不能随动物个体生长而生长。在动物个体继续生长时，表皮就会成为限制因素。这时只有退掉原来的表皮鳞被，而长出新的表皮鳞被，才能适应其长大的躯体。在爬行动物中，最熟知的蜕皮的例子是蛇的蜕皮。蛇通常依靠硬的物体，比如岩石（或两块岩石之间）或木头，来摩擦它的头，使已经被拉长的皮肤裂开。这时，蛇继续在物体上摩擦它的皮，使得最靠近头部的一端可以自行剥离，直到蛇能够从皮肤中爬出来，高效地将蛇皮的内侧翻出来。这和某些人脱袜子的方式类似——抓住袜子的开口一端向下拉，使袜子从自己身上翻下来。蜕下来的蛇皮常常是一整块，包括被丢弃的brille（眼镜），因此蜕皮对维持动物的视力是至关重要的。相比之下，蜥蜴的皮一般会脱落为几片。
爬行动物
所有的爬行動物都用肺呼吸。水生烏龜發展出具滲透性的皮膚，某些爬行動物可用泄殖腔來增加氣體交換的面積（Orenstein, 2001）。即使具有這些構造，牠們仍需要肺來完成呼吸作用。在各個主要的爬行動物種類之間，完成肺部換氣的方式並不相同。有鱗目爬行動物的肺部幾乎只藉由軸肌換氣，而這個肌肉也同時用於運動。因為這個限制，大部分的有鱗目爬行動物必須在激烈的移動中停止呼吸。但是，有些爬行動物找到了解決方法。巨蜥以及一些其他的蜥蜴物種使用一種使用到喉嚨肌肉的方法來補足原本的“軸呼吸”。這使得這些動物可以在激烈運動中為肺部完全充氣，所以可以持續進行有氧呼吸很長一段時間。據了解雙領蜥具有原始橫膈膜可將胸腔和腹腔分開來。即使此膜不能動，它還是能藉著將內臟的重量和肺分開而增加肺的吸氣量。鱷魚其實擁有和哺乳類動物相似的有肌肉橫膈膜。不同的是，鱷魚的橫膈膜將恥骨拉回（部分的骨盆，在鱷魚中能移動），從而使肝下降，以騰出空間使肺能脹大。這種橫膈膜式的機制被稱作〝肝活塞〞。