自然资源部第二海洋研究所
1965年12月国家海洋局第二海洋研究所成立。1973年12月，海洋二所由宁波市迁至杭州市。1978年成立海洋遥感技术应用研究室。1980年，浙江省海洋学会挂靠海洋二所成立。1992 年，国家海洋局海洋工程勘测设计研究院成立。1997 年，国家海洋局海底科学重点实验室成立。1999年，国家海洋局海洋动力过程与卫星海洋学重点实验室成立。2003年设立博土后科研工作站。2005年，国家海洋局海洋生态系统与生物地球化学重点实验室成立。2018年11月，更名为自然资源部第二海洋研究所。
中央地质调查所
1949年中华人民共和国建立後，中央地质调查所被接收（1978年，在台灣的中華民國政府恢復設置中央地質調查所，即今之經濟部中央地質調查所）。1950年8月，中华人民共和国政府决定成立中国地质工作计划指导委员会，任命李四光为主任委员，尹赞勋、谢家荣为副主任委员，统一领导全中国的地质工作，全国地质机构开始大规模调整，中央地质调查所和中央研究院地质研究所等机构同时宣布撤消。 中国科学院地质研究所、中国科学院古生物研究所、中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、中国科学院土壤研究所等陆续成立。