深海魚
共生发光的深海生物相对较少。典型的游泳深海鱼包括鞭冠𩽾𩾌科和水珍鱼目的一部分，而底栖鱼有突吻鳕科和稚鳕科（又称深海鳕科）。其中，鞭冠𩽾𩾌科以外的三个类群的发光器与消化道相连，可由肠道菌群不断补充发光细菌（主要是"Photobacterium phosphoreum"）。发光器的数量很少，通常为1-2个。
光鯙
光鯙，又稱光海鱔，為輻鰭魚綱鰻鱺目鯙亞目鯙科的其中一種，分布於東太平洋區，從墨西哥至秘魯海域，棲息深度18-60公尺，體長可達120公分，為底棲性魚類，生活在岩石底質海域，平時躲在岩縫洞穴中，屬肉食性，生活習性不明，可做為食用魚。
荧光
由於醛類發光基質受到氧化，反應後成為一種酸類，且FMNH2亦氧化成為氧化態的FMN，因此這在化學反應上而言是一個氧化及釋放能量的過程，而釋放出的能量便是以發出螢光的形式表現出來。事實上，自然界中（尤其是海洋中）存在著許多發光細菌，但因這些細菌的分布不夠密集，其微弱的發光現象便因亮度不夠而被我們忽略了。而唯有當大量發光細菌聚集在一起共同發光時，才能形成我們肉眼可以觀看到的發光現象。這也是為什麼通常只在具有發光器的海洋動物中才觀察到生物螢光的原因（發光器中聚集共生著高密度的發光細菌）。
發光燈籠魚
發光燈籠鱼（学名：）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科燈籠鱼属的其中一種。分布于全球三大洋海域，為深海魚類，體長可達9.3公分。
鯖屬
一般情况下，新鲜的鲭鱼产生的组胺很少。经实验，-{zh-hans:青花鱼; zh-hant:鯖魚;}-、-{zh-hans:金枪鱼; zh-hant:鮪魚;}-、沙丁鱼等鱼类在37℃放置96小时即可产生1.6～3.2mg/kg的组胺，而鲤鱼、鲫鱼和鳝鱼等淡水鱼类产生的组胺仅为1.2～1.6mg/kg。而引起人体中毒的组胺摄入量为1.5mg/kg，并与个体对组胺的敏感程度有关。香港食品法典委员会所订的-{zh-hans:行动水平; zh-hant:安全標準;}-为200mg/kg。
燈籠魚目
燈籠魚目（学名：）又名七星鱼目，是輻鰭魚綱的其中一目。 本目的鱼通常存在脂鳍，具發光器，尾鳍发达，不与臀鳍愈合。这些鱼均是深海鱼。它们与仙女鱼目有点类似。
斑馬魚
2008年，美國波士頓兒童醫院的研究人员开发了一种新的斑马鱼品系Casper。这种品系的成鱼体色透明。这能够方便对细胞活动、循环系统遠端轉移等现象的细致观察。由于人和斑马鱼有许多基因功能是相同的Casper品种被寄予加深人类对如白血病等癌症在内的人类疾病研究的厚望。在2013年1月，日本科学家转基因透明斑马鱼品系得到可以在高强度脑活动时放出可见发光的品系，使得斑马鱼对外界刺激的反应可以被记录精确到特定的大脑发光区域。
烟色光鳃鱼
烟色光鳃鱼（学名：）为雀鲷科光鳃鱼属的鱼类，俗名燕尾光鳃雀鲷、燕尾光鳃鱼。分布于日本南方至澳大利亚之西太平洋海域、台湾岛等，主要栖息于水深10-20米之礁石斜面旁。该物种的模式产地在日本长崎市场。
深海魚
由于只有短波的蓝色、绿色光到达深海，许多深海鱼的眼睛只能检测到蓝光。但是属于巨口魚科的黑巨口鱼亚科和柔骨鱼亚科鱼类可识别红光，并可以利用覆盖发光器的特殊滤光器自行发出红光。使用猎物和其他捕食者无法识别的红光似乎对捕食和繁殖有益。
生物发光
甲藻对这种发光机理的应用更为奇妙。当这种浮游生物感觉到它的天敌接近时，會立刻发出螢光。这样捕食腰鞭毛虫天敌的动物也会被吸引过来，这样可能就化险为夷了。
深海魚
在表层带成长的深海鱼的仔鱼与稚鱼通常具有异于成鱼的独特形态（如具有透明的身体，外敌很难找到）。爐眼魚科与奇棘鱼属的仔鱼将鳍和眼球等以細長的突起伸出体外。另外，某些巨口魚科和燈籠魚科鱼类的仔鱼的肠道暴露于体外，游泳时吊着长身体数倍的肠道。这可以增加身体表面积、增加浮力，被认为是对浮游生活的适应。暴露的消化管还被认为增加了肠道表面积，得以消化吸收大猎物。
荧光
红宝石、翡翠、钻石可以在短波长的紫外线下发出红色的荧光，綠寶石、黃玉、珍珠也可以在紫外线下发出荧光。钻石还可以在X射线下发出磷光。
勒氏發光鯛
勒氏發光鯛為輻鰭魚綱鱸形目鱸亞目發光鯛科的一種，為熱帶海水魚，分布於中西太平洋新喀里多尼亞海域，深度可達360公尺，體長可達35公分，棲息在底中層水域，生活習性不明。
海水魚
海洋肉食性鱼类的繁殖方式有卵生、卵胎生和胎生三种。海洋鱼类的寿命相差较大，鰕虎鱼和灯笼鱼寿命不到1年，而某些鲟鱼可活到100岁。有些鱼在第一次性成熟产完卵后，便全部死去，如大麻哈鱼和欧洲鳗鲡等。 绝大多数海洋鱼类属于卵生，体外受精。魚類交配後，雌魚便會產卵。而不同的魚種有不同的產卵方式：有些魚會大量產卵，例如翻車魚一次會產下三億個卵，但大部分的卵都會被吃掉；有些魚也是卵生的，但雌魚會一直守着牠的卵，這樣做可以使卵孵化率大大提高。 卵胎生的魚的卵子在体内受精，受精卵在肚子裏孵化成稚魚，但胚体的营养是依靠自身的卵黄供给，与母体无关系。例如海卿等魚種，所以存活率很高。 卵在母体内受精发育，其营养不仅来自本体的卵黄，也需要通过母体血液循环来供给。如灰星鲨。 海洋鱼类产卵数量相差很大。某些鲨鱼仅产数粒大型卵，而翻车鱼则能产3亿粒浮性卵。一般来说，产卵后不護卵的鱼，产卵量较大，如真鲷产100万粒左右，鳗鲡产700～1500万粒。产卵后護卵的鱼，产卵量较小，如海马产卵数十粒到数百粒。
深海魚
逾1000米深的半深海带是个没有光线到达的黑暗世界，这个区域中许多深海鱼的眼睛小而凹陷。裸鼬魚科成员的眼睛埋入皮肤中，而爐眼魚科成员仅具有板状视网膜，它们仍然残留有检测光的能力，比起退化更适合将其视为特化。有研究认为，细小的锥形眼更适合捕获半深海带稀疏闪烁的生物发光。据说相比普通眼睛，这些鱼类的眼睛空间分辨率更好，适合捕获20至30米远的生物发光。对于游泳能力较弱的深海鱼而言，将视野限制在相对狭窄的范围内具有合理的性价比（即投入产出比）。
深海魚
巨口魚科所属的一些深海鱼能够发出强烈的防御性闪光，强度甚至可以使掠食者昏厥。水珍魚目管肩魚科成员从鳃下分泌发光液，被认为充当吸引捕食者的替身。
湖紅點鮭
湖红点鲑有三个亚种。普通湖红点鲑（ "Salvelinus namaycush namaycush" ），突吻湖红点鲑（ "Salvelinus namaycush siscowet" ）和较不常见的深水湖红点鲑（ "Salvelinus namaycush huronicus" ）。在夏季分层期间，一些湖泊没有中上层小型滤食性鱼类。在这些湖泊中，鳟鱼有一条被称为浮游生物的生活史。浮游种群中的湖鳟鱼非常丰富，生长非常缓慢，并且成熟程度相对较小。在那些确实含有深水草料的湖泊中，鳟鱼变成食鱼。食肉湖鳟鱼生长快得多，成熟时更大，但数量较少。尽管丰度有所不同，但是在相似的湖泊中，鳟鱼的生物量密度是相当一致的，无论它们所包含的鳟鱼种群是浮游性还是食鱼性。
波氏裸燈魚
波氏裸灯鱼（学名：Gymnoscopelus bolini）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科的其中一種，分布於南半球亞熱帶至南極間的海域，屬深海魚類，棲息深度可達4200公尺，體長可達28公分，可做為食用魚。 波氏裸灯鱼的圖片
紅蠟燭與人魚
次晨，人魚在神社捨棄的孩子，被一對開蠟燭店的老夫婦撿到。這一對老夫婦，老爺爺在家中負責做蠟燭，而老奶奶則負責在店前賣蠟燭，他們沒有子女，因此他們細心養育這個撿到的孩子，她長大後成為一個很美麗的女孩。長大後的人魚姑娘，為了答謝老夫婦的養育之恩，就在白蠟燭上用紅色顏料畫上圖案，而這些蠟燭得到很高的評價，讓這間蠟燭店變得生意興隆。若在神社點亮了這些蠟燭再出海捕魚，即使遇到暴風雨船也能平安返回，因此蠟燭店的好評越來越廣為流傳。
西钻光鱼
本魚屬深海魚類，具垂直性洄游的特性，屬肉食性，利用其發光器官吸引獵物，以磷蝦及橈腳類為食，產浮游性卵。
浮蚕属
美國動物學家埃德蒙·牛頓·哈維（）留意到本屬物種的疣足（）會發出黃色的生物光（）。在海洋生物中，黃色的生物光很少見。事實上，浮游生物有不少物種均會發出生物光。然而，浮蠶屬物種的發光機制還未清楚，只知道過程並沒有涉及萤光素（）的使用。有多個物種已知當受到搔擾時，其疣足會發出生物光，儘管這能力很可能在同屬的所有物種均有可能擁有。 這特殊功能相信是物種要分散其捕食者的注意力而演化出來，就好像軍機在轟炸時丟下大量干擾箔那樣。
南极中爪鱿
與箭魚和其他大型遠洋魚類不同，大王酸漿魷（以及大王烏賊）的眼睛直徑幾乎是深海同類的2-3倍。 進一步的研究表明，大王酸漿魷能夠看到大型捕食者移動時破壞浮游生物的生物發光。 大王酸漿魷的眼睛在黑暗中會散發光芒。
深海魚
微弱的阳光能到达约1000米的深度（根据透明度的不同而不同），因此生活在该区域的一些深海鱼类的具有非常大的眼睛。另有至少11个深海鱼类群具有管状眼，包括珠目魚科、褶胸魚科和鑽光魚科。因为光经散射和折射到达深海，无论太阳的位置如何，光总是从正上方射下且直至日落光强几乎不变。除了巨尾魚科等少数例外，大多数管状眼睛都竖直向上，以接受海平面来的光线。
氚管
由于氚管的发光无需借助外来的能量输入，因此常见于高端夜光潜水、军用手表上。有些特殊的钥匙链，紧急出口标识上也会用到氚管。早期的转盘电话上曾经用过氚管，但是由于已经过了多个半衰期，发出的光已经非常微弱，几乎不可见。极个别的鱼饵也会用氚管来吸引鱼类。
水族箱
光照同樣是水族箱的成敗關鍵，儘管一般人想像中飼養的魚不需要光照，但其实一个水族箱对光照的需求是随水族箱种类而变化的，部分玩家會挑戰的水草缸與珊瑚缸對光線的要求相當高，許多甚至需要昂貴的專用燈具與配置，很多都有設有複雜的自動定時功能，更可以模擬各種天候的光照與日、月相的季節性變化，光線的質量也是要點，許多燈具可以組合出不同波長的光值，但饲养纯鱼缸除非是血鹦鹉鱼等对光照需求较高的鱼种以外，大部分都只需要合理的光照就足够了，比如饲养灯眼鱼这类深海鱼类每天给予的光照时间可以少一点。
发光巨口鱼
发光巨口魚（学名：）为輻鰭魚綱巨口鱼目巨口鱼科的其中一種。分布於全球三大洋海域，為深海魚類，棲息深度200-1500公尺，體長可達32.2公分，屬肉食性，以魚類及甲殼類為食。
大口波拿巴鑽光魚
本魚屬深海魚類，具垂直性洄游的特性，會日週期地改變體色，屬肉食性，利用其發光器官吸引獵物，以浮游動物為食，產浮游性卵。
清亮燭光魚
清亮燭光鱼（学名：）为輻鰭魚綱巨口魚目褶胸鱼科的其中一種。分布於西大西洋區，包括美國、加拿大及古巴等海域，為深海魚類，會進行垂直性洄游。
十字蛸
十字蛸所屬的十字蛸屬為唯二可進行生物發光的章魚。十字蛸在每條觸腕的下側的每對鬚中間具有發光器，每條觸腕共約有40個發光器，可發出藍綠色的光，越靠近觸腕末端發光器的排列就越密集，但發出的光也越弱。十字蛸亮度較弱的發光器會持續發光，而亮度較強的發光器則會進行週期性的開關，造成類似閃爍的效果。發光器的作用相信是用來自我防衛，用來嚇唬掠食者；或是用來吸引浮游性的甲殼類。發光器也可能用來吸引異性，但這項理論多半不受到支持，因為在雌性、雄性以及未成年的個體上均有觀察到發光的行為。
魚津市
螢火魷是富山灣內的特產，在每年三月到五月期間可以在魚津的海灣就看到閃爍著藍白色光線的螢光魷。
巴氏標燈魚
又稱「閃光魚」，一般生活在水深200米以下，眼下的發光囊每10秒發光1次，休息不發光，發光生物中亮度最光。 共分兩種︰眼燈眼魚和奇眼鯛。
巴拿馬底燈魚
巴拿馬底灯鱼（学名：Benthosema panamense）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科底灯鱼属的鱼类。分布于東北太平洋區，包括墨西哥、薩爾瓦多、尼加拉瓜、瓜地馬拉及巴拿馬等海域，本魚背鰭軟條12-14枚；臀鰭軟條19-22枚；脊椎骨31-33個，體具發光器官，體長可達5.5公分，本魚屬深海魚類，成魚夜晚會成群游至表層水域。
光帶燭光魚
光帶燭光鱼（学名：）为輻鰭魚綱巨口魚目褶胸鱼科的其中一種。分布於西太平洋區，包括澳洲、紐西蘭、巴布亞紐幾內亞及南中國海等海域，棲息深度120-1244公尺，體長可達3.5公分，為深海魚類，會進行垂直性洄游。
萤光素
介形蟲螢光素（）可在特定的介形蟲和一種叫光蟾魚屬的深海魚類中發現。就像腔腸素那樣的化合物，它是一種並主要令動物發出藍光。
澳洲光頜松球魚
由於魚鰭短小，鱗片骨板狀，此魚不擅游泳。白天時出沒於洞穴或岩石下方，是個夜行動物。在-{zh-cn:新南威尔士州; zh-tw:新南威爾斯州; zh-hk:新南威爾斯州; zh-sg:新南威尔斯州;}-的Fly Point Halifax Park 水產保護區內，有一小群澳洲光頜松球魚被發現生活在同一岩石下長達7年，另一群則生活在另一個岩石下長達3年。到了晚上，此魚靠著發光器官的亮光，在海底沙床上覓食小蝦。澳洲光頜松球魚所發的光也許也可用於與同類溝通。澳洲光頜松球魚的發光器官內鑲著與光頜松球魚共生而會發光的費氏弧菌。費氏弧菌也不時會從發光器官排出魚體外在海水中自由存活，但在脫離魚身後數小時，將漸漸不再發光。此物種在人工飼養環境中壽命可長達10年。
斑馬魚
斑马鱼也被发现可在创伤后再生感光细胞与视网膜神经。目前研究显示，这是由(Muller glia)的去分化与增殖介导的。研究人员不断截断背上以及腹面上的尾鳍，并且分析其再生以观测其突变。已经发现，在截肢部位出现，使得斑马鱼的细胞重新活跃为可再生的类似于干细胞的状态。2012年，澳洲科学家发布的一项研究表明，斑马鱼使用一种被称为成纤维细胞生长因子的特异的蛋白质以确保其脊髓可以痊愈而无。此外，斑马鱼后侧体侧线的毛细胞被发现可以在创伤后或者发育中断后再生。对其再生期间基因表达的研究使得若干重要的信号通路得以被识别出来，例如Wnt信号通路和成纤维细胞生长因子等。
金焰灯笼鱼
金焰灯笼鱼（学名：）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科灯笼鱼属的鱼类。分布于太平洋热带、东至巴拿马、西到南海以及中沙及西沙群岛海域等，屬深海魚類，體長可達11公分。
生物发光
雪茄达摩鲨发光进行伪装，不过它腹部上的暗色小斑点在某些大型掠食性鱼类如鲔鱼和鲭鱼看来就像他们捕食的小鱼。当它们接近这些“小鱼”时，就成了鲨鱼的食物。
閃光鱘
閃光鱘可以長達2.2米及重80公斤。它們的背部呈深灰色至近黑色，兩側較淺色，腹部接近白色。背鰭共有40-46條軟鰭條，臀鰭有24-29條鰭條。吻長及端尖。下唇在中央斷開。觸鬚很短。它們有5行稜鯪，背部有11-14塊，兩側各有30-36塊，腹部有10-11塊，稜鯪行之間有星狀的板。
小冠太阳鱼
小冠太阳鱼（学名：""）為太陽魚屬的其中一種，是美国东南部的一种原生鱼类，因为是一种受欢迎的钓鱼品种，因而被引入到北美各地的水体中。它与蓝鳃太阳鱼类似，除了色彩和较大的体积。它的背部为深色，腹部为黄绿色。雄性的鳃盖有樱桃红边，雌性在这一区域色彩为橙色。成鱼的长度范围为20至24厘米。最大长度可达43.2厘米，蓝鳃太阳鱼的最大长度为40厘米。
生物发光
某些种类的鱿鱼身上的发光菌可发出与上方照射光强相同的光使自身隐蔽，这种现象就是对抗照明。对于这些动物，感光囊用来控制对比光线以达到与周围环境优化匹配。通常情况下鱿鱼身上的细菌发光组织与感光组织分离，但一种耳烏賊科四盤耳烏賊屬的夏威夷短尾魷魚把两者合二为一。
閃亮奇巨口魚
閃亮奇巨口魚（学名：）为輻鰭魚綱巨口鱼目巨口鱼科的其中一種。分布于東太平洋區，從加拿大卑詩省至墨西哥加利福尼亞半島海域，為深海魚類，棲息深度0-1219公尺，本鱼尾鰭小，腹鰭沒有薄膜，身體與頭部黑色;依附於頭部的發光器官彩色，觸鬚球莖粉紅色，眼下紅色，眶後綠色，體長可達23公分，屬肉食性，以甲殼類為食。
电磁学
远在公元前2750年，古埃及人就已经知道发电鱼（）会发出电击。这些鱼被称为“尼罗河的雷使者”，是所有其它鱼的保护者。大约两千五百年之后，希腊人、罗马人，阿拉伯自然学者和阿拉伯医学者，才又出现关于发电鱼的记载。古代罗马医生也在他的大作《》中，建议患有像痛风或头疼一类病痛的病人，去触摸电鳐，也许强力的电击会治愈他们的疾病。阿拉伯人可能是最先了解闪电本质的族群。他们也可能比其它族群都先认出电的其它来源。早于15世纪以前，阿拉伯人就创建了“闪电”的阿拉伯字“”，并将这字用来称呼电鳐。
带底灯鱼
带底灯鱼（学名：）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科底灯鱼属的鱼类。分布于太平洋东至夏威夷、南至新几内亚、北至日本、印度洋非洲沿岸以及东海等海域。该物种的模式产地在夏威夷。屬深海魚類，深度在0-2000公尺，本魚肛門的器官10-11個；成熟的雄魚有大的3到5個半透明的尾上腺與較小的尾下腺；成熟的母魚有小的尾上腺與較小尾下的區塊，背鰭軟條12-14枚；臀鰭軟條18-20枚；脊椎骨31-32個，體長可達10公分。
灿烂眶灯鱼
灿烂眶灯鱼（学名：）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科眶灯鱼属的鱼类，俗名照耀眶灯鱼。分布于印度洋、太平洋的热带海区以及南海等海域，垂直分布约1000-0米，體長可達4.5公分。
閃光鱘
閃光鱘是重要的商業漁獲，連同歐洲鰉及波斯鱘都是製成魚子醬的重要物種。它們的肉質可口，在裏海是一種美味。它們也會被用來製作卡博串。在俄羅斯、伊朗、義大利及美國都有養殖它們。閃光鱘的恢復力很低，要4.5-14年才可以令群落的數量倍增。
斑馬魚
斑马鱼的另一显著特征在于其拥有四种视锥细胞，除人体内拥有的红色、绿色、蓝色敏感视锥细胞外，拥有紫外线敏感细胞。斑马鱼因此可以看见非常广的色谱。故斑马鱼也被用于研究视网膜的发育，尤其是视锥细胞如何在视网膜中形成镶嵌方面。斑马鱼和一些真骨类鱼类以其视网膜上高度精密的视锥细胞镶嵌排列备受科学家关注。
深海魚
从约600米的深度起，深海鱼的体色从银白色迅速变为铅灰色，直至1000米的深水区处的深海鱼几乎全部呈暗色。多数奇鯛目成员呈亮红色，但只有偏蓝的短波光才能到达深海，因此它们如黑色一般，几乎看不见。
斑馬魚
从2003年后期起，表达绿色、红色、黄色荧光蛋白的转基因品种斑马鱼在美国上市。表达荧光蛋白的斑马鱼也被商家称为“螢光魚”。别的培养品种包括“golden”、“sandy”、“longfin”、“leopard”等。其中leopard品种，之前被称为"Danio frankei"，是一种由于色素变异产生的带点状色彩的斑马鱼品种。的普通斑马鱼品种与leopard品种、长鳍次种都已通过育种筛选获得并被用于水族鱼类交易。（Xanthochromism是一种有关红色素被黄色素替代的带有特殊黄色。）
生物发光
利用光吸引异性交配是生物发光的另一种机理。这在萤火虫身上非常常见，它们在交配季节腹部规律性的闪烁以吸引异性。在海洋生物中这种现象只在一种介形亚纲类的甲壳类动物身上确切地观察到过。科学研究表明性引诱剂适用于远程吸引异性 ，而生物发光适用于近距离呼唤对方。
安氏克燈魚
安氏克灯鱼（学名：）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科的其中一種。分布于南半球亞熱帶至南極間的海域，為深海魚類，棲息深度可達2700公尺，體長可達7.1公分，屬肉食性，以磷蝦及橈角類等為食。
中國槍魷
會發光，发光器在其直肠两侧，呈纺锤形。
大洋帶
由于透光层带以下区域的皆非常黑暗，许多在深海中生存的生物没有眼睛，或者自行發光。光线通常為蓝绿色，因为许多海洋生物都对蓝光敏感。两种化学物质，萤光素和萤光素酶相互反应，产生柔和的光線。生物发光的产生过程与荧光棒破裂时的发生过程非常相似。从诱饵到航行，深海生物都使用生物发光。
闪电烛光鱼
闪电烛光鱼（学名：）为輻鰭魚綱褶胸鱼科烛光鱼属的鱼类。分布于西北太平洋區的日本及台湾岛等海域。體長可達5.3公分，為深海魚類，棲息深度150-280公尺，夜間會進行垂直性洄游，该物种的模式产地在日本。
亮魣
亮魣為輻鰭魚綱鱸形目鯖亞目金梭魚科的其中一種，分布於中東太平洋的加利福尼亞灣海域，體長可達70公分，棲息在沿岸水域，屬肉食性，可做為食用魚及遊釣魚，具利齒，易造成創傷。
富营养化
水体出现富营养化时主要表现为浮游生物的大量繁殖，因占优势的浮游生物的不同而水面往往呈现出蓝色、红色、棕色和乳白色等。在江河、湖泊和水库中称为“-{zh-hant:藻華 ;zh-hans:水华}-”，在海洋中称为“赤潮”。
光魢
光魢(學名："Girella laevifrons")，又稱光瓜子鱲，為輻鰭魚綱鱸形目鱸亞目舵魚科的其中一種，分布於東南太平洋的秘魯及智利海域，體呈橢圓形，體色為灰藍色，背部顏色較深，尾鰭截形，體長可達38.3公分，棲息在岩石底質海域，會成小群活動，屬草食性，以海草為食，生活習性不明。
圆鳞发光鲷
圆鳞发光鲷（学名：），又名羽根田氏發光鯛、大面側仔、目本仔、深水惡，为輻鰭魚綱鱸形目鱸亞目发光鲷科发光鲷属的鱼类，俗名羽根田氏发光鲷。分布于从台湾向北扩至日本以及中国南海、台湾東港等海域，深度50-400公尺，體長可達13.5公分，棲息在底中層水域，生活習性不明，可做為食用魚。该物种的模式产地在日本Kumanonada。
發光器
發光器的型態與排列時常是深海魚物種辨認的重要依據。這些發光器多半用來吸引獵物或是形成消光剪影來躲避掠食者的攻擊。
深海魚
即使在深海中，也有微弱的光照射到约1000米深。因此，白天在从下方仰望海面时，会出现上部生物的阴影。通过将发光器置于腹部并将亮度调节至与向下的光线相同的水平，可以消除此阴影。这称为，为大多数中层带游泳深海鱼采用。半深海带鱼类中则很少见到腹部发光器，或因在1000米以上深度（完全黑暗的区域）中反照明效果不达预期。
鱼
大部分鱼类是变温动物，一些金槍魚及鯊魚（特別是鼠鯊科）体内的温度比周围环境的温度高。
閃光革鰺
閃光革鰺（学名：），為輻鰭魚綱鱸形目鱸亞目鰺科似鰺屬下的一個種，分布於東太平洋區，從墨西哥至厄瓜多海域，體呈紡錘型且側扁，背鰭2個，體被小圓鱗，尾鰭叉形，為黃色，背部深灰色，腹部銀白色至藍灰色，背鰭褐色、胸鰭黃色、臀鰭白色，體長可達25公分，成魚主要棲息在沿海泥底質的半鹹水及海域，背鰭及臀鰭硬棘具有毒腺，可忍受低鹽分水域，可做為食用魚。
发光炬灯鱼
发光炬灯鱼（学名：）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科炬灯鱼属的鱼类。分布于太平洋、印度洋、大西洋以及南海、东海等海域，屬深海魚類，棲息深度50-850公尺，體長可達20公分。该物种的模式产地在0°57′30″S、89°03′30″W。
鮟鱇目
鮟鱇魚為中型底棲魚類，此多潛伏海底，眼睛幾乎無用武之地，不善游泳，多靠腹鰭爬行。口內有銳利而且朝內傾斜的長牙，基本上，被咬中的獵物絕不可能逃走；而且擁有彈性的胃，因此某些種類能吃下比自己大的魚類。身體裸露無鱗，在頭體上方及體側邊緣均有大小不一的皮質突起。特別之處是有一支由前背鰭演化而成的發光釣竿，釣竿頂端內上百萬隻的發光菌，狀似小魚，會發出亮光，吸引小生物成为它们的食物，其英文名Anglerfish也来自于此。
鱼
魚類包括盲鰻、七鰓鰻、軟骨魚及硬骨魚等，也包括許多已經絕種的物種。魚絕大部份屬於變溫動物，其體溫會隨外在環境溫度而變化，極少數像大白鲨、及鮪魚及月魚等可以將體溫維持在較高溫度。在大部份的水體中都有魚。幾乎所有的水生環境中都有魚，從高山的溪流（如鱒魚）到深海帶甚至超深海渊带（像囊鰓鰻目及鮟鱇魚）。魚比其他的脊椎动物有更多的物種變異性。
荧光海滩
荧光海滩是由海水中的发光微生物被冲在沙滩上引起的现象。 世界上有四个国家七个地方出现过这一景象，三个在波多黎各，两个在澳大利亚，一个在马尔代夫，最著名的就是波多黎各Vieque岛。此外，2014年4月，中国大连甘井子区大黑石海岸出现了"荧光海滩"的美丽景象。
黄光鳃鱼
黄光鳃鱼（学名：）为雀鲷科光鳃鱼属的鱼类，俗名黄腋光鳃雀鲷。分布于印度西太平洋以及台湾南部等，一般栖息于10-48米之礁石斜面旁。该物种的模式产地在Banda群岛。
双灯灯笼鱼
双灯灯笼鱼（学名：）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科灯笼鱼属的鱼类。分布于印度洋、太平洋以及南海等海域，多生活于热带海区以及垂直分布约1000-0米，體長可達3.8公分。
螢光原燈籠魚
螢光原燈籠魚（学名：）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科的其中一種。分布于南冰洋附近海域，為深海魚類，棲息深度可達2000公尺，體長可達6.1公分。
斑點燈籠魚
斑點燈籠鱼（学名：）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科的其中一種。分布于大西洋海域，為深海魚類，棲息深度可達1000公尺，體長可達11公分。
大點波魚
本魚背鰭後部和臀鰭前部之間有一塊藍黑斑，背鰭和鰓蓋間中部位置有塊小一些的黑斑，橘紅色的魚體上遍布紫色發亮的鱗片，有些魚的魚體上還會遍布更多的斑點。頭小眼大，體色橙橘紅色，在光線照射下會有彩虹般的色澤，魚鰭呈黃色。體長可達10公分。
发光
该词可以指：
耀眼眶燈魚
耀眼眶灯鱼（学名：Diaphus lucidus）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科的其中一種，分布於全球三大洋海域，屬深海魚類，棲息深度0-2999公尺，體長可達11.8公分。
嘎巴虾
鼓虾產生的氣泡因被迅速地壓縮，熱力無處消散，使得氣泡內的溫度可激增至華氏8500度(約攝氏4704.4度)，並產生持續數億分之1秒的亮光，因持續時間太短，現時並沒有工具可以準確量度出持續時間。這道亮光用肉眼無法看到，事實上只是衝擊波造成的副產品，生物學上沒有重要性，但這是首次發現動物利用這方式發光。
閃光鮨
閃光鮨，為輻鰭魚綱鱸形目鱸亞目鮨科的其中一種，分布於東南太平洋的厄瓜多海域，棲息深度約82公尺，為底棲性魚類，屬肉食性，生活習性不明。
深海魚
生物发光是由荧光素与荧光素酶之间的化学反应引起的发光现象，是许多深海生物的重要特征之一。对东北大西洋的一项调查发现，生活在至少500米深的深海鱼类中，种类数的70％或个体数的90％以上会发光。深海鱼类的生物发光包括依靠体内发光细菌的共生发光和自发光。发光器官的位置各不相同，如眼睛周围、鳍和鱼须的末端、腹部、尾部和肛门周围。发光器的数量和形态是重要的分类特征。
萤光素
會發光的細菌一般存在於特定品種的魚類或耳烏賊目物種的身體裡。這些細菌的螢光素的分子比較大，包括一個已还原的核黄素磷酸鹽。
發光珍燈魚
發光珍灯鱼（学名：）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科的其中一種。分布于大西洋及西太平洋海域，為深海魚類，棲息深度40-1100公尺，體長可達8.5公分。
生物发光
某些深海鱼类如鮟鱇魚发出光吸引猎物。这种鱼的头部伸出悬挂的发光器可将小型鱼类吸引到自身附近。有的鱼却反其道而行之。
深海魚
鞭冠𩽾𩾌科鱼类的发光器官则位于擬餌体中，与消化道不连续。尚不清楚“灯笼”中的发光细菌来源，尽管已知它是弧菌属细菌，但截至2001年尚未成功人工培养 。
發光桿菌屬
發光桿菌屬（Photobacterium）又叫光合細菌，是弧菌目弧菌科的一个属。染色性質上屬於革蘭氏陰性菌。普遍的存在於海洋環境中和海洋生物體的體表和少許海洋生物的腸道中。
蝦紅素
蝦紅素是一种血紅色的色素，是淡水微藻類中的雨生紅球藻（""）和酵母菌黃單胞菌中天然產生的。當藻類受壓缺乏營養，鹽分增加或日照過多時，就會產生蝦紅素。以這種藻類為食的動物，包括有：鮭魚、紅鱒、（"Pagrus major"）、火烈鸟及各種甲殼類動物（例如：虾、磷蝦、蟹、龍蝦及小龍蝦等海洋生物）均可找到由蝦紅素而引起的橙紅色染色效果。
胸光虹燈魚
胸光虹灯鱼（学名：Bolinichthys photothorax）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科虹灯鱼属的鱼类。分布於大西洋及印度洋海域，屬深海魚類，深度可達40-750公尺，本魚背鰭軟條12-14枚;臀鰭軟條13-15枚，體長可達7.3公分。
光腺眶灯鱼
光腺眶灯鱼（学名：Diaphus suborbitalis），又名眶下眶灯鱼、灯笼鱼、七星鱼、光鱼，为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科的其中一種，分布於印度-西太平洋區的熱帶及亞熱帶海域，屬深海魚類，棲息深度在40-3240公尺，體長可達6.9公分，可做為食用魚。
閃光銀板魚
閃光銀板魚，為輻鰭魚綱脂鯉目脂鯉亞目锯脂鲤科的其中一個種，為熱帶淡水魚，分布於南美洲巴西Tapajós河流域，體長可達14公分，棲息在植被生長茂密的底中層水域，生活習性不明，可做為食用魚及觀賞魚。
三齿烛光鱼
三齿烛光鱼（学名：）为褶胸鱼科烛光鱼属的鱼类，俗名丰年狗母。分布于西太平洋菲律宾、日本、澳大利亚等邻近水域以及南海等海域，棲息深度640-825公尺，體長可達7.2公分。
萤科
萤火虫发光是为了求偶， 有些种类的萤火虫只有雄虫有发光器官，而有些種類则双方都有。有些种类的光是一闪一闪的，有些则是持续不斷的發光。这种信号是因种類而异的，在长度和节律上都有所不同。北美的東美螢火蟲（"Photinus pyralis"），雌性虫也有发光器官，雌雄识别的关键是雌虫在接收到雄虫光信号后两秒钟应答。而在另一些种类里面，这些甲虫会与周围的间断光信号同步，从外面看起来，整个树丛或森林就在同步發亮了。
磷蝦
除了深海磷蝦外，其他所有的磷蝦均會發光（Bioluminescence），牠們有一個稱為發光器的器官，可以發出光來。牠們的光線是通過酶促化學發光（chemiluminescence）反應造成的，其中的螢光素（luciferin）（顏料的一種）就是由熒光素酶（Luciferase）活化的。一些研究指出很多磷蝦的螢光素是一種熒光的四吡咯（tetrapyrrole），跟溝鞭藻類（Dinoflagellate）螢光素相似，但不是全然相同，磷蝦自己本身並不能生產物質，但牠們卻可從含有溝鞭藻類的食物中吸取得到這種物質。磷蝦的發光器官是一個複雜的器官，可以聚焦光線，亦可由肌肉轉動。這種器官精確的運作人類仍未能清楚了解；牠們很可能有交配的動機，可能是社交互動的方式之一。一些研究員認為磷蝦可能是用熒光來作偽裝的用途，用光線來令牠們的影子變得明亮如周圍的環境，令位處其下方的捕獵者更難注意得到牠們。
聲致發光
槍蝦是一種能製造出聲致發光的生物。當槍蝦獵食時，會將牠的巨螯快速合上，噴射出一道時速高達約每小時100公里的水流，這道高速水流會觸發氣穴現象，而成形一個極微小的低壓氣泡。氣泡所放出光的強度要比傳統聲致發光產生的光來得弱，用肉眼並沒有辦法看見。在生物學上，此現象並沒有任何重要性，也僅僅不過是槍蝦用來擊暈獵物的衝擊波的副產物而已。但在物理上，卻是第一個由生物利用聲致發光來發光的例子，因此在2001年10月發現這個現象時，也半戲謔性的將其稱為為「蝦光現象」（"shrimpoluminescence"）。科學家們在此之後隨即發現另一種叫做蝦蛄的動物，有某些品種其棍棒狀的前肢能急速來回揮動引發氣穴效應，進而產生聲致發光。 美國德州農工大學等離子體實驗室的Xin Tang和David Staack利用仿生學設計和3D打印技術製造的機械裝置在水中可以復現同樣的蝦光現象，並且這種機械裝置引發的蝦光現像也說明人類可以在水中用純機械的方法產生慣性約束的等離子體。
螢火魷
螢火魷（学名：），又名螢魷或螢烏賊，为武裝魷科下的一个物种，屬於只有本身的螢火魷屬。牠是一種非常小的魷魚，通常有3英寸（7.6厘米）長。和其他深海生物一樣可以發光，這些光可用來引誘獵物。萤火鱿多分布于日本海及日本四国以北的太平洋沿近海。
萤光素酶
冷光素或冷光素酶不是特定的分子，而是对于所有能够产生冷光的底物和其对应的酶的统称，虽然它们各不相同。不同的能够控制冷光的生物体用不同的冷光素酶来催化不同的冷光反应。最为人所知的发光生物是萤火虫，而其所采用不同的冷光素酶与其他发光生物如荧光菇（发光类脐菇，"Omphalotus olearius"）或许多海洋生物都不相同。在萤火虫中，发光反应所需的氧气是从被称为腹部气管（abdominal trachea）的管道中输入。一些生物，如叩头虫，含有多种不同的萤光素酶，能够催化同一冷光素底物，而发出不同颜色的冷光。萤火虫有2000多种，而叩甲总科（包括萤火虫、叩头虫和相关昆虫）则有更多，因此它们的萤光素酶对于分子系统学研究很有用。目前研究得最透彻的萤光素酶是来自Photinini族萤火虫中的北美萤火虫（"Photinus pyralis"）。
萤科
萤火虫的发光是生物发光的一种。萤火虫的发光原理是：萤火虫有专门的发光细胞，在发光细胞中有两类化学物质，一类被称作萤光素（在萤火虫中的称为萤火虫萤光素（）），另一类被称为荧光素酶。荧光素能在荧光素酶的催化下消耗ATP，并与氧气发生反应，反应中产生激发态的氧化荧光素，当氧化荧光素从激发态回到基态时释放出光子。反应中释放的能量几乎全部以光的形式释放，只有极少部分以热的形式释放，反应效率为95%，螢火虫也因此而不会过热灼伤。到目前为止現有的科技还没办法制造出如此高效的光源。
螢火魷
萤火鱿于西太平洋海域被发现，水深约183至366公尺（600-1200英尺）处。这种鱿鱼的每根触鬚都有一个发光器产生萤光，进而引诱猎物。据报导，此种鱿鱼是其物种中唯一能辨别颜色者，牠拥有3个类似视网膜的器官，每个具有不同光谱频率的感光度。萤火鱿身长大约3英寸（7.6厘米），寿命长约一年，拥有标准的8条触腕和2条触足。此鱿鱼一整天都待在百公尺深的海裡，只有夜晚才会来到海面附近，在体内的发光器与感光器作用下，牠可依照深度来调整自身的亮度。
芒光灯笼鱼
芒光灯笼鱼（学名：）为灯笼鱼科灯笼鱼属的鱼类。分布于大西洋、印度洋、太平洋以及南海等海域，属于深海小型鱼类。该物种的模式产地在8°44'N、21°W。
尾光炬燈魚
尾光炬灯鱼（学名：）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科的其中一種。分布于太平洋區，包括日本、澳洲、巴布亞紐幾內亞、紐西蘭、夏威夷群島、美國、加拿大、墨西哥、尼加拉瓜、薩爾瓦多、宏都拉斯、哥斯大黎加、巴拿馬、哥倫比亞、厄瓜多、秘魯及智利等海域，為深海魚類，棲息深度可達50-1000公尺，體長可達14公分。
深海魚
许多深海生物，包括深海鱼类，使用自己产生的萤光素发光。发光器的数量一般很大，可以达成百上千个。发光器的开口可伴随有透镜或类似滤光片的结构，这有助于调节光量，照射方向和发光颜色。
閃光鱘
閃光鱘（學名："Acipenser stellatus"）是一種鱘屬魚類，分佈在黑海、亞速海及裏海盆地。它們可以長達2.2米及重80公斤。最長壽的可以達27歲。
火体虫属
因为每个个体动物都会检测光线，然后发出光线，火体虫通常会在集群中来回传递光线。每个“个虫”包含一对发光器官位于靠近外面的外衣，这些器官充满了可能是细胞内生物发光细菌的发光细胞器。在集群内移动的生物发光波显然不是由神经元传播，而是由光刺激过程传播。 闪烁的"个虫"不仅通过发光刺激群体内的其他"个虫"发光，而且邻近的火体虫群体也会响应进行生物发光。火体虫群体对机械刺激(接触)做出生物发光响应，正如同光的激发一样。
小光燈籠魚
小光燈籠魚（学名：）为輻鰭魚綱燈籠魚目灯笼鱼科的其中一種。分布于東太平洋區的美國及墨西哥海域，為深海魚類，棲息深度100-500公尺，體長可達20公分。
狭串光鱼
狭串光鱼（学名：）为輻鰭魚綱巨口魚目光器魚科串光鱼属的鱼类，俗名长尾串灯鱼。分布于太平洋、大西洋、南非近海、地中海以及南海等海域，垂直分布约2000-100米，體長可達4.5公分，會進行垂直洄游，以小型甲殼類為食。
生物发光
约90%的深海生物都会产生某种形式的光。大多数生物发出属于蓝或绿光光谱，这样更容易通过海水传播。不过，某些巨口鱼发出红光或红外光，而浮蚕属的生物发出黄光。