兽脚类五巨头
兽脚亚目五巨头（英文：Theropoda 'big V'，或称兽脚类五巨头、五巨头），指目前为止出土过的最著名，也最为庞大的5种兽脚亚目的肉食性恐龙，分别指：棘龙、霸王龙、马普龙、南方巨兽龙、鲨齿龙。由于后来发现更多的巨型兽脚亚目恐龙，有人提议将“五巨头”的範圍扩充至“七巨头”甚至是“十巨头”，加入諸如：特暴龙、魁纣龙、蛮龙、食蜥王龙、依潘龙等體型較大的獸腳亞目恐龙。一般认为“五巨头”包括如下几种著名的兽脚亚目恐龙，为避免争端，下列排名不分先后也不以实力强弱为准：
阿巴拉契亞龍屬
阿巴拉契亞龍屬（學名："Appalachiosaurus"）是暴龍超科恐龍的一屬，生存於上白堊紀的北美洲。如同其他的獸腳亞目，阿巴拉契亞龍是雙足的獵食動物。目前只有發現一個幼年個體的骨骼，從而得知阿巴拉契亞龍的身長超過7米長，重量約600公斤。阿巴拉契亞龍是北美洲東部最為完整的獸腳亞目恐龍。
鳥腳亞目
鳥腳亞目意為“鳥的腳部”，在希臘文裡"ornis"意為鳥，"pous"意為腳；這名稱指的是牠們腳掌的三個腳趾，類似鳥類，但許多早期物種有四個腳趾。牠們的其他特徵是沒有護甲、發展出角質喙狀嘴、修長的恥骨最後延展超過腸骨、下頜沒有洞孔。許多鳥腳類恐龍的肋骨兩側，有多塊薄的軟骨骨板，其功能未明；有些骨板在化石化的過程中保存下來。目前已在稜齒龍、奧斯尼爾洛龍、帕克氏龍、小頭龍、奇異龍、巨謎龍的化石發現這些骨板。
鳥鱷屬
鳥鱷的頭顱骨類似獸腳亞目，但腳掌具有5根腳趾，背部具有兩排鱗甲，身長約4公尺。鳥鱷的後肢有五個腳趾，暴龍只有三個腳趾。
鳥龍鳥科
鳥龍鳥科是於1985年成立，包含了一些最初被認為是細小獸腳亞目恐龍的化石。
艾雷拉龍屬
艾雷拉龍的前肢相對較短，小於後肢長度的二分之一。肱骨及橈骨較短，而手掌较长。拇指及第二、第三指都配有彎曲而锋利的爪，可以抓住獵物。第四及第五指很短小，沒有指爪。艾雷拉龍或许是地球上最早期的恐龍之一，也有可能是最早有雙足獸腳亞目形態的動物。牠的後肢強壯，位於身體正下方，股骨較短，而腳掌較長，因而善於奔跑。尾巴用作平衡，會以重疊的尾椎突以使部份尾巴硬化，這亦是適合高速的構造。
獸腳亞目
在1956年以前，獸腳亞目曾長時間不被使用，直到阿爾弗雷德·羅默將蜥臀目重新分類為獸腳亞目與蜥腳亞目（Sauropoda），獸腳亞目可分為原蜥腳下目、虛骨龍下目、肉食龍下目；目前的分類法大致上遵循者羅默的版本。在1969年，恐爪龍與恐手龍的發現，衝擊了虛骨龍下目與肉食龍下目的二分法，因為牠們無法份類於任一個下目。在1970年代晚期，瑞欽·巴思缽（Rinchen Barsbold）將獸腳亞目改分類為：虛骨龍下目、恐爪龍下目、偷蛋龍下目、肉食龍下目、似鳥龍下目、恐手龍下目（Deinocheirosauria）。
中國鳥腳龍屬
中國鳥腳龍屬（屬名：，意為「中國的鳥類外形」），是一種小型肉食性恐龍，屬於獸腳亞目傷齒龍科，身長為1公尺。中國鳥腳龍生存於早白堊紀巴列姆階的中國內蒙古，約1億1300萬年前，可能以小型哺乳類與昆蟲為食。
獸腳亞目
第一群被確定不是肉食性的獸腳類恐龍是鐮刀龍超科（原名慢龍下目）。鐮刀龍類最初被認為屬於原蜥腳下目，具有小型頭部、喙狀嘴、針狀牙齒，是群草食性動物，其大型腹部可以容納較長的消化器官，詳細地消化植物纖維。直到近年，鐮刀龍類被發現是群高度特化的手盜龍類。近年的種系發生學研究也助於釐清不同食性的手盜龍類的演化關係。原始手盜龍類是雜食性動物，後來演化出不同的食性，鐮刀龍類、原始偷蛋龍類、少數鳥翼類演化成草食性動物，馳龍科演化成肉食性動物，阿瓦拉慈龍科、多數鳥翼類則是食蟲動物，而傷齒龍科、衍化的偷蛋龍類則屬於雜食性動物。除此之外，似鳥龍下目也是雜食性或草食性恐龍。棘龍科與某些獸腳類恐龍（例如惡龍）更特化成以魚類為主食。
恐手龍屬
2014年的研究将恐手龙科定义为一个包括所有与奇异恐手龙的共同祖先比与急速似鸟龙的共同祖先更近的分类群的演化支。这三个成员的四肢有着不同的解剖学特征。2014年的演化树表明，早白垩世的似鸟龙类分为两个主要谱系：恐手龙科和似鸟龙科。与其他似鸟龙类不同的是恐手龙科不善于奔跑。与其它体型小得多的似鸟龙类相比，恐手龙的解剖学特征主要是其的体型和重量更大。与更原始的似鸟龙类不同，恐手龙和更小的似鸟龙科没有牙齿。在2020年，来自墨西哥的恐手龙科怪诞龙被命名，使其成为该分类群第一个来自北美洲的已知成员。其叙述者认为恐手龙科起源于劳亚古陆（当时北方的一个超大陆）或分散在北半球的极地地区，在坎帕阶至马斯特里赫特阶时期，与亚洲物种存在亲缘关系的其他恐龙类群也发生了类似的动物群交换。这项研究还发现似鸟身女妖龙是一属基础恐手龙科，同时将北山龙作为一种基础似鸟龙类而排除在该分类群之外。
剑龙亚目
劍龍類恐龍都是四足恐龍，四肢擁有蹄狀的腳趾。華陽龍之後出現的所有劍龍類，前肢比後肢短許多。牠們的短前肢限制了牠們的速度，牠們的體型則限制牠們以二足方式行走，這顯示牠們無法快速奔跑。前肢可能直立，或是從肘部往兩側外張。尾巴沒有骨質肌腱可以硬挺，與多數鳥臀目恐龍不同。
捷足龙属
捷足龙属（学名：，意为“敏捷的足”）是一属已灭绝的近颌龙科恐龙，化石发现于加拿大亚伯达省南部晚白垩世坎帕阶的，生活在大约7690万至7580万年前。特殊的喙表明捷足龙和其它近颌龙科都是植食性动物。模式种文雅捷足龙（"C. elegans"）以前曾被归入纖手龍屬、单足龙属、细喙龙属和似鸟龙属。
蜥腳下目
根據許多屍骨層與足跡化石，顯示蜥腳類恐龍是群居動物。但是不同種類的蜥腳類恐龍，構成群體的規模不一。以一個發現於阿根廷侏羅紀中期地層的屍骨層為例，當中的化石由成年個體、幼年個體所構成，來自於不同年齡層。而根據其他屍骨層、足跡化石，許多蜥腳類恐龍的群體依年齡層而構成，成年個體與幼年個體分別獨自行動。目前已知會以不同年齡層而個別群體行動的的物種，包含：阿拉莫龍、巧龍、以及某些梁龍科。
獸腳亞目
與人類、其他靈長目相比，獸腳類恐龍的前肢活動範圍不大，與大眾媒體與讀物中的形象相反。獸腳類與原蜥腳類恐龍無法前後轉動牠們的手掌，手掌只能朝向身體内側，而不能朝下、或朝後──唯一使手掌朝向地面的方法是如同鳥類伸展翅膀那般地側向抬起整個前肢。人類的橈骨與尺骨關節，允許他們隨意轉動手掌。在蜥臀目恐龍的肘部關節中，橈骨末端接至尺骨的溝，妨礙大範圍的動作。同樣地，其腕部關節的活動方向、活動範圍也有限。
半鳥屬
半鳥屬（屬名："Unenlagia"，意為「一半的鳥」）又名若鳥龍，是獸腳亞目恐龍的一屬，生存於晚白堊紀的南美洲，化石發現於阿根廷內烏肯省中部山區。半鳥屬於馳龍科的半鳥亞科，是群奇特、極度類似鳥類、生存於岡瓦那大陸的動物；半鳥與鷲龍、內烏肯盜龍有接近親緣關係（牠們可能與半鳥是同一種動物）。彼得·馬克維奇等人在2005年提出可飛行的脅空鳥龍也屬於半鳥亞科，這意味者不能飛行的半鳥是從類似脅空鳥龍的祖先演化而來，有可能牠們在演化過程中失去飛行能力，或者是多個物種個別演化出飛行能力。馬克·諾瑞爾（Mark Norell）等人則在2006年發現脅空鳥龍是半鳥的姐妹分類單元。
艾雷拉龙科
以下第一个的演化树显示了Fernando E. Novas、Martin D. Ezcurra、Sankar Chatterjee和T. S. Kutty于2011年的分析。在该次分析中，艾雷拉龙为原始的蜥臀目，并非兽脚亚目。第二个演化树则是基于Hans-Dieter Sues、Sterling J. Nesbitt、David S Berman和Amy C. Henrici于2011/12年的分析。这个分析则显示艾雷拉龙为基础的兽脚亚目。
非正式命名恐龍列表
颊齿龙（英语： ) 是一属尚未描述的恐龙的非正式名称，生存于早白垩世（大约1.12亿年前的阿普第阶至阿尔布阶）。它可能是一种鸟臀类恐龙，要么是鸟脚类，要么是基底角足龙类，化石发现于现在的美国马里兰州。模式种米尔柯克颊齿龙（"Magulodon muirkirkensis"）由克兰兹（P. Kranz）在1996年创造。它是一个所谓的牙齿分类单元，命名仅根据一颗牙齿。由于没有正式描述，它也是一个无资格名称。在一篇论文中，它被认为是一个分类不确定的标本。该论文中提到了该物种预期的正模标本，但避免使用“颊齿龙”这个名称，以防止分类混乱。
獸腳亞目
獸腳亞目（学名：，发音为，源自古希腊语单词“野兽”和“脚”）通常归类於蜥臀目，尽管2017年的论文已将他们作为鸟臀目的最近亲属放置在拟议的中。是群雙足恐龍。雖然牠們主要是肉食性動物，但是在白堊紀時期，一部份的獸腳類恐龍演變成為植食性、雜食性、甚至食蟲動物。獸腳類最早出現在三疊紀晚期的卡尼階，大約是2億3100萬年前。牠們從侏儸紀早期開始成為獨占廣大陸地的肉食動物，直到6500萬年前的白堊紀結束為止。獸腳亞目也是恐龍總目中唯一的肉食族群，其餘的鳥臀目所有恐龍、以及和獸腳亞目同為蜥臀目的蜥腳亞目都已經改為素食，但他們的祖先卻肉食素食都有。
星宿龙属
星宿龙的十四节背椎略呈（amphicoelous）或两端凹陷，属于典型的基底蜥脚形亚目特征。其同样典型的特征是第一至第三背椎下侧有叶片状龙骨，这是其它恐龙所没有的。此外，身体前部附近的背椎具有典型的低、短且略呈板状的神经棘。然而，不同寻常的是在后三个背椎上也可见到这类神经棘，而只有在像艾雷拉龙和始盗龙这样的基底蜥臀目动物中才具备该特征。在中后背椎上，神经棘后上角向外突出以产生凹形后缘，此特征可见于其它一些基础蜥脚类身上，而在禄丰龙、金山龙、云南龙和里奥哈龙身上则没有看到。 在基础蜥脚形亚目中，星宿龙有四节骶椎。这是一种典型特征，通常出现在更多的蜥脚形亚目身上，如黑丘龙、利奥尼拉龙巨脚龙和蜀龙。这些骶椎中的第一节，即背骶（dorsosacral）与下一节骶骨的融合不好；而在（transverse processes）上，它也没有完全融合到相应的肋骨。背骶和第一对骶肋共同向前延伸以接触髂骨。第二和第三骶椎（两个“原始骶骨”）长度大致相同且彼此融合良好。正像其他基底蜥脚形类一样，第三骶椎横突也向后向外突出；第四骶椎的横突和肋同样如此，它们在后侧再次接触髂骨。所有神经棘皆呈板状，就像最后几节背椎上的一样。
獸腳亞目
從1980年代開始，隨者親緣分支分類法與系統發生學的盛行，獸腳類恐龍的分類與演化關係逐漸明朗。在1986年，嘉克斯·高斯特（Jacques Gauthier）建立堅尾龍類，將獸腳亞目分為基礎型的角鼻龍下目與較衍化的堅尾龍類。同年，高斯特並建立了手盜龍類，以包含最類似鳥類的獸腳類恐龍。隨者近年許多關於獸腳類與鳥類關係的發現，大部分科學家認為鳥類是手盜龍類的直系後代，使得鳥類成為白堊紀-第三紀滅絕事件後，唯一倖存至今的恐龍。
單足龍亞科
在單足龍亞科內，目前只有二到六個種被古生物學家所普遍承認。隨者近年的新發現與新理論，可能高達10個種。近頜龍科過去有非常混淆的分類歷史，這些混淆主要來自於第一個被敘述的纖手龍屬。因為大部分近頜龍科的化石保存狀態並不良好，進而導致鑑定上的錯誤，而纖手龍的不同標本與不同骨頭在過去曾被歸類於許多不同的種。舉例而言，"Macrophalangia"的腳部化石與纖瘦纖手龍的化石都發現於相同年代的同一地層，後來發現的手部與腳部化石，證實"Macrophalangia"與纖瘦纖手龍的相同動物。 ；而近年發現的部分頭骨、手部、腳部化石，證實纖手龍與近頜龍也可能是同種動物。
非正式命名恐龍列表
雙葉龍（英语：）是日本晚白垩世一種兽脚类恐龙的非正式名称，关于这种动物，人们只知道在科尼亞克階中发现的部分胫骨。它是由大卫·兰伯特（David Lambert）在1990年创造的，是对日本一種未命名的獸腳類動物的绰号“Futaba-ryu”的轉写。董枝明和合著者简要讨论了這些胫骨化石，并发表了一张照片。他们认为这块骨头属于一种不确定的霸王龙類。如果标本最终被描述和命名，它将需要一个不同的名字，因为“雙葉龍”这个名字已经被用于蛇颈龙類的一个属。
恐爪龍屬
其他同時期的恐龍包括有草食性的楯甲龍、鳥腳下目的西風龍及腱龍。在奧克拉荷馬州，恐爪龍的生態系統也包括了巨大獸腳亞目的高棘龙、蜥腳下目的波塞東龍、稜角鱗鱷、以及雀鱔目的"Lepisosteus"。如果馬里蘭州所發現的牙齒是屬於恐爪龍的，那恐爪龍也在當地區與星牙龍、傷龍、孔牙龍（目前只發現牙齒）等恐龍共同生存。Cloverly組中段的地質年代約為1億1500萬到1億800萬年前。
獸腳亞目
在20世紀早期，部分古生物學家不再認為肉食性恐龍是個天然群體，例如休尼（Friedrich von Huene）。休尼不使用獸腳目，改使用哈利·絲萊（Harry Seeley）建立的蜥臀目，休尼將蜥臀目分為虛骨龍亞目與Pachypodosauria亞目。休尼將大部分小型獸腳類恐龍歸類於虛骨龍亞目，大型獸腳類恐龍與原蜥腳類則歸類於Pachypodosauria亞目；休尼認為Pachypodosauria亞目是蜥腳類恐龍的祖先（在當時，原蜥腳類恐龍被認為是肉食性，因為勞氏鱷目巨齒龍的頭骨與埃弗拉士龍的身體被拼湊在一起）。在1922年，W.D. Matthew與巴納姆·布郎（Barnum Brown）敘述了第一種馳龍科（艾伯塔馳龍），並首次將原蜥腳類排除於肉食性恐龍之外，並再度採用科普的Goniopoda，但當時不被普遍接受。
古似鳥龍屬
與古似鳥龍共棲的恐龍包括：其他獸腳類如暴龍超科的獨龍、鐮刀龍科的二連龍和內蒙古龍、偷蛋龍科的巨盜龍；植食性恐龍以鴨嘴龍類的巴克龍和計氏龍、蜥腳類的蘇尼特龍為代表。
斯基瑪薩龍屬
北非的森諾曼階地層已經發現數種大型的獸腳亞目恐龍（體重多於1噸），所以產生體型較小型恐龍是否能共存的疑問。已知最大的獸腳亞目棘龍與鯊齒龍，化石已在摩洛哥及埃及發現。兩類較小型的獸腳亞目：三角洲奔龍及巴哈利亞龍都分別在摩洛哥及埃及被發現，而且彼此是近親，或可能是同一物種。摩洛哥的斯基瑪薩龍與埃及的「棘龍B」則代表了第四類大型的獵食動物。這種情況就像侏羅紀晚期北美洲的莫里遜組般，有著達五類超過1噸的獸腳亞目，與一些小型的物種。大型獸腳亞目恐龍的頭型及體型差異，使不同的獵食動物佔據者不同的生態位，如同今日的非洲莽原。
眼齒鳥屬
该文章发表后不久，许多古生物学家对眼齿鸟是否是恐龙表示了怀疑，因为与兽脚类动物相比，它与鳞龙类的相似性要高得多。人们普遍认为该属颅骨的形状是支持它与鸟类具有亲缘关系的最大证据，但一些已知的现存蜥蜴（如和）和灭绝的爬行动物（如和）也具有形状类似鸟的颅骨，但这只是一种趋同演化现象。他们还批评了这份只考虑眼齿鸟是鸟类而不考虑其它可能性（如蜥蜴）的系统发育分析。中国科学院古脊椎动物与古人类研究所的几位科学家发表了一篇论文，主张将眼齿鸟定为蜥蜴而不是鸟类。2020年7月份，该属的分类地位因原始论文的撒回而变得不确定（见§科学评论），但第二个标本极有可能引出它正确的分类地位。
鳥腳亞目
更晚鳥腳類的體型更為大型，但並未達到長頸、長尾蜥腳類恐龍般的巨大體型，部分蜥腳類恐龍的生態位被鳥腳類取代。最大型的鳥腳類，例如：埃德蒙頓龍與山東龍，身長並未達到15公尺。
似非洲龙属
尽管与阿贝力龙超科有许多共同特征，但塞里诺仍在2017年将其归类于似鸟龙类。为支持这一观点，他指出，在中国似鸟龙、似鸡龙和其它似鸟龙类（恐手龙有宽阔的椎体但没有前关节突凹陷）的椎骨前关节突存在“花生状”椎体和边缘凹陷，与玛君龙、恶龙和阿瓦拉慈龙超科的次圆形椎体形成对比。他还提出其脚爪特征――即带有V形平台的宽阔底面和凹陷的屈肌附属结构――是似鸟龙类的共同特征。虽然前两个特征及靠近脚爪顶部的角质鞘附着槽与阿贝力龙超科相同，但他注意到后一特征在阿贝力龙超科中并不一致：阿贝力龙超科的凹槽通常延伸至爪子顶端，而似非洲龙和艾尔雷兹组一种未命名的西北阿根廷龙科的凹槽则会事先消失。塞里诺还指出，腓骨下端的扩张与恶龙相似，但与未命名的西北阿根廷龙科不同。
巴哈利亞龍科
巴哈利亚龙科（学名 : ）是兽脚亚目下的一个科，属于鸟吻类，可能包括少数非洲和南美洲的恐龙物种，例如南盗龙、巴哈利亚龙、三角洲奔龙和瓜里丘龙。这些兽脚类动物的分类有争议。一些研究将上述动物归类于与西北阿根廷龙科有关的角鼻龙类基群，并将西北阿根廷龙科中的轻巧龙亚科划入该分类群；另一些研究将上述动物归类于大盗龙类、新猎龙科基群或虚骨龙类基群。2020年出版的一份卡玛卡玛群脊椎动物多样性专论提出，巴哈利亚龙科有可能并不是一个单系群，且模式属巴哈利亚龙是一个。这篇论文将三角洲奔龙归类於阿贝力龙科。
瑪君龍屬
在1896年，法國古生物學家Charles Depéret敘述了第一個來自於馬達加斯加西北部的獸腳亞目化石。這些化石是由一個法國陸軍軍官在貝齊布卡河（Betsiboka River）沿岸發現，包含兩顆牙齒、一個指爪、以及一些脊椎骨，目前存放在里昂第一大學。Depéret將這些化石分類於斑龍屬的一種，凹齒斑龍（"Megalosaurus crenatissimus"）；斑龍屬在當時是個「未分類物種集中地」，包含許多大型獸腳類，但這些物種彼此之間並沒有關聯。種名"crenatissimus"衍化自拉丁語，crenatus意為「凹槽」，而issimus意為「最」，意指牠們牙齒前後的大量鋸齒狀邊緣。Depéret稍後將牠們重新歸類於北美洲的傷龍，這是另一個所知有限的屬。 在馬達加斯加西北部馬哈贊加省發現的許多破碎化石，在過去100多年來經由法國籍人員發現，其中許多目前存放在巴黎國家自然歷史博物館。在1955年，René Lavocat在發現第一個標本的同一地區梅法拉諾組，發現了一個獸腳亞目的齒骨與牙齒。這些牙齒符合Depéret首次敘述的標本，但大幅彎曲的頜部骨頭與斑龍、傷龍有極大不同。Lavocat將牠們重新命名為瑪君龍（"Majungasaurus"），屬名由馬哈贊加省的舊名馬任加省（Majunga Province）以及希臘文的蜥蜴所構成，並將這個頜部骨頭列為模式標本（編號MNHN.MAJ 1），存放在巴黎國家自然歷史博物館。在1979年，漢斯·戴爾特·蘇伊士（Hans-Dieter Sues）與菲利普·塔丘特（Philippe Taquet）將瑪君龍第四號標本（編號MNHN.MAJ 4）的圓頂頭顱碎片，敘述成一個新的厚頭龍類恐龍，名為瑪君顱龍（"Majungatholus atopus"）。這是首次在南半球發現的厚頭龍類恐龍。
雷前龍屬
於2003年，澳洲的蜥腳形亞目專家亞當·耶茨（Adam Yates）與南非的詹姆斯·基欽（James Kitching）共同命名了雷前龍。這個名字是由拉丁文的「"ante-"」（意即「之前的」）及「"tonitrus"」（意即「雷」）而來的，是指牠們的生存年代比其他蜥腳下目更早，尤其是雷龍。當時雷龍尚被認為是迷惑龍的異名，但此名卻比迷惑龍更常被使用，而一般大眾也多以雷龍一名來通稱蜥腳下目恐龍。雷前龍目前只有一個種，巨腳雷前龍（"A. ingenipes"），種名是由拉丁文的「"ingens"」（意即「巨大」）及「"pes"」（意即「腳」）組成，因為牠是前腳只用來支撐的蜥腳類恐龍。
鳥獸腳類
鳥獸腳類（学名：）是獸腳亞目堅尾龍類的一個演化支，包含肉食龍下目與虛骨龍類。在1988年，保羅·塞里諾（Paul Sereno）提出鳥獸腳類的概念，最初使用嗜鳥龍、美頜龍、異特龍科、暴龍科、以及部分阿貝力龍科（例如印度鱷龍）作為分類的基準點。在1994年，湯瑪斯·霍爾茲（Thomas R. Holtz）正式建立鳥獸腳類（Avetheropoda）的名稱。同樣在1994年，保羅·塞里諾與其他科學家建立新堅尾龍類（Neotetanurae）演化支，範圍與鳥獸腳類接近。由於鳥獸腳類的正式命名，早於新堅尾龍類約一個月，鳥獸腳類成為正式的名稱。
似鳥龍類
似鳥龍下目（）意為「鳥類模仿者蜥蜴」，是一群獸腳亞目恐龍，外表類似現代的鴕鳥，例如似雞龍。牠們是群快速、敏捷、雜食性或草食性恐龍，生存於白堊紀的勞亞大陸（現在的亞洲、歐洲、北美洲）。似鳥龍下目首次出現於早白堊紀，並存活到晚白堊紀。牠們似乎與較原始的虛骨龍類恐龍有親緣關係，例如細頸龍與暴龍科。似鳥龍下目的原始物種包括：似鵜鶘龍、神州龍、似鳥身女妖龍，還有大型的恐手龍，恐手龍的手臂長度可達2.4公尺。更先進的種都屬於似鳥龍科，包括：似雞龍、古似鳥龍、似鵝龍、似鴕龍、以及似鳥龍。有些古生物學家，例如保羅·塞里諾（Paul Sereno），認為充滿謎題的阿瓦拉慈龍科是似鳥龍下目的近親，並將牠們分類於似鳥龍超科（Ornithomimoidea）。
炎生龙属
炎生龙作为左龙属的旁系群，被置于虚骨龙类的基础位置。 炎生龙来自早白垩世，与之共存的非鸟兽脚亚目恐龙包括查林杰激龙、普氏桑塔纳盗龙和不对称小坐骨龙。
莫罗龙属
此外，该属还有两个独特的特征组合，而这些特征本身并不独特。在股骨上，小转子斜向倾斜，紧挨着大转子。在胫骨上，内踝呈三角形轮廓，显示出一个前凹的表面。 本属被归类为禽龙类，是真禽龙类的基础成员。这反过来又与巴塔哥尼亚和南极洲的其他鸟脚类形成了一个演化支，特别是特立尼龙、加斯帕里尼龙、阿纳拜斯龙、南方棱齿龙、小头龙和巨谜龙，它们同处于一个名为薄板类的分类群中，其成员特征是对奔跑的生活方式的适应性，这可以从它们狭窄的足部形态上得到体现。脚的第四跖骨变薄，表明其适用于高速奔跑；其次是扩展的人字骨，这种特征与它较大的表面积相关联以附着尾部侧部肌肉，从而可以很好地控制其运动；弯曲的肱骨没有显示出三角肌嵴，因此前肢不用于行走。但是，由于该属残骸数量有限，无法确定莫罗龙本身是否具有这些特征。该演化支的存在可能表明巴塔哥尼亚、南极和澳大利亚具有相同类型的动物。除了加斯帕里尼龙被证明是该类群中最基础的成员外，无法确定该演化枝内的确切系统发育关系。
鳥龍鳥屬
鳥龍鳥屬（屬名：，意為「鳥蜥蜴」）是白堊紀晚期北美洲的一屬反鳥亞綱鳥類。其下僅有一個物種，即模式種阿氏鳥龍鳥（"A. archibaldi"）。兩者都只有一條跗蹠骨化石。
腕龍屬
莫里逊组发现的其它恐龙包括肉食性兽脚类剖齿龙、史托龙、嗜鸟龙、角鼻龙、异特龙、蛮龙和食蜥王龙以及植食性鸟臀类弯龙、橡树龙、奥斯尼尔龙、怪嘴龙和剑龙。异特龙占兽脚类标本的70%至75%，在莫里逊组食物链中处于营养级顶端。角鼻龙可能专门攻击大型蜥脚类，包括腕龙的较小个体。共享这一古环境的其它脊椎动物包括辐鳍鱼、青蛙、蝾螈、海龟如、喙头蜥、蜥蜴、陆生及水生鳄形超目如以及几种翼龙如抓颌龙和买萨翼龙。双壳类和水生蜗牛的壳也很常见。绿藻、真菌、苔藓、马尾、苏铁、银杏和几科松柏门化石揭示了该时期的植物区系。多种多样的植被从无树区域长有和蕨类的河岸林（）向长有稀疏树木（如类似南洋杉的针叶林）的蕨类热带草原变化。
鸟吻类
鸟吻类（学名：）是一个包含有着上颌骨窗孔的兽脚亚目恐龙的一个演化支，即在上颌骨的前外侧有构成上颌骨一个额外的开口。
十字手龍屬
自從1677年以來，英格蘭已發現許多恐龍化石，大部分的未詳細鑑定化石是屬於獸腳亞目恐龍。在早期研究歷史中，大型獸腳類化石常被歸類於斑龍屬或是其近親，而小型受腳類恐龍化石則常被歸類於髂鱷龍屬。在這次研究過程，研究人員比對斑龍屬、沃里克郡的化石，發現沃里克郡化石的脊椎較低矮、較寬廣，兩者的臀部、後肢骨頭也有差異。在2010年，古生物學家Roger Benson、Jonathan Radley將這些化石名為新屬，模式種是諾曼氏十字手龍（"C. newmanorum"）。屬名是由拉丁文的「十字架」（"crux"）與古希臘文的「手掌」（"cheiros"）所構成，意指化石發現處的十字手採石場，而不是意指其化石的形狀；種名則是以採石場的擁有者諾曼家庭為名。
禽龍屬
禽龍的化石多數發現於歐洲的比利時、英國、德國。牠們主要生存於約1億2600萬年前到1億1300萬年前。禽龍的演化位置大約位於行動敏捷的稜齒龍類首次出現，演化至鳥腳亚目中最繁盛的鴨嘴龍類，這段演化過程的中間位置。禽龍與年代更晚的鴨嘴龍類，共同屬於禽龍類演化支。
蜥腳形亞目
蜥腳形亞目（学名：，或譯作蜥腳亞目）意為「蜥蜴般的腳」與「形態」，是蜥臀目的一個演化支，包含蜥腳下目、與其祖先近親（原蜥腳下目，可能是並系群）。蜥腳下目是一群長頸部、長尾巴、大體型的植食性恐龍(實際上要到中生代末期才有草等禾本科植物，所以不能稱為草食性恐龍)，最後演化成完全四足行走，並且為出現過的最大陸地動物。原蜥腳下目的生存年較早，體型較小，在生理上能夠以二足方式行走。蜥腳形亞目是三疊紀晚期到白堊紀末期的優勢植食性動物。
單足龍亞科
單足龍亞科（學名：）是近颌龙科恐龍的一科，體型較大、前肢較長、具有頭冠。
鳥臀目
鳥臀目分成兩個演化支：装甲类、角足龙类。装甲类包括劍龍亚目（例如劍龍）與甲龍亚目（例如甲龍）。角足龙类包括頭飾龍類（角龍亚目與厚头龙亚目），以及鳥腳亚目（例如鴨嘴龍科的埃德蒙頓龍）。
擅攀鳥龍屬
史蒂芬·切爾卡斯（Stephen Czerkas）與袁崇喜根據擅攀鳥龍的原始與類似鳥類的特徵，將擅攀鳥龍用來解釋非正統的恐龍演化。他們根據擅攀鳥龍的蜥臀目類型恥骨與粗厚坐骨，宣稱擅攀鳥龍比始祖鳥還要原始。擅攀鳥龍也缺乏完全開口的髖臼，髖臼是臀窩上的一個孔，是恐龍的關鍵特徵，傳統上用來鑑定牠們。當這兩位作者認同這些閉合的髖臼是從更傳統的恐龍髖臼演化而來，他們提出其他的原始特徵，來指出擅攀鳥龍是最類似鳥類的恐龍，也是以之最原始的恐龍。切爾卡斯與袁崇喜認為擅攀鳥龍是種原始手盜龍類，這支持格里高利·保羅（Gregory S. Paul）所提出的理論；保羅認為大型、居住於地面上的手盜龍類，例如迅猛龍，是從小型、飛行或滑翔、樹棲的物種演化而來。切爾卡斯與袁崇喜的理論將保羅的理論進一步延伸，並支撐了喬治·奧利舍夫斯基（George Olshevsky）在1992年的假設；奧利舍夫斯基認為所有缺乏飛行或至少樹棲的獸腳類恐龍，都是從小型、樹棲、類似擅攀鳥龍的祖先演化而來。切爾卡斯與袁崇喜也認為手盜龍類從獨立於獸腳亞目的支系演化而來，而這支系在獸腳亞目演化歷史的非常早期開始分化；這論點與大部分的系統發生樹不同。
斑盜龍屬
斑盗龙属（学名："Overoraptor"，意为“斑纹的盗贼”）是一属近鸟类兽脚亚目恐龙，在演化关系上接近于胁空鸟龙，生存于晚白垩世（森诺曼阶）的冈瓦纳古陆上，化石发现地位于今天的阿根廷。该属仅含一个物种，奇氏斑盗龙（"Overoraptor chimentoi"）。
大山铺恐龙化石群遗址
大山铺恐龙化石群遗址具有化石藏量巨大、门类齐全、埋藏集中、保存完整等特点。作为一处罕见的自然历史遗产，它所产出的化石不仅具有重要的科普教育和旅游观光价值，而且填补了恐龙演化史上侏罗纪早－中期恐龙化石材料缺乏的空白，对研究恐龙及其相关古动物的系统演化、生理特征、生活环境等具有十分重大的科学价值。大山铺发掘的各种恐龙及伴生物化石数以百计，组成了一个完整的“恐龙动物群”。其中包括了3个纲、11个目、15个科的属种，既有陆生、水生、两栖类，又有空中飞行的古脊椎动物；有长达20米的草食长颈椎蜥脚龙、凶猛的肉食恐龙和数量多而完整的短颈椎蜥脚龙，也有仅14米长的鸟脚龙。最珍贵的是目前世界上发掘最早的中侏罗纪剑龙和首次发现的翼龙，填补了恐龙演化史上的一段空白。自贡恐龙博物馆被评为“中国旅游胜地四十佳”之一。
獸腳亞目
堅尾龍類比角鼻龍下目更為特化。牠們可分為兩個演化支：較原始的斑龍超科（或稱棘龍超科、蠻龍超科）、以及較先進的鳥獸腳類。斑龍超科在侏儸紀中期到白堊紀早期最為普遍，其中的棘龍科存活到白堊紀的土仑阶。鳥獸腳類更為接近鳥類，並且還可分為兩個演化支：肉食龍下目（例如異特龍）、虛骨龍類。虛骨龍類是一個非常大群且多樣化的演化支，在白堊紀時期非常普遍。
獸腳亞目
某些物種的手掌與手指可以做出較靈活的動作，例如肉食龍下目的高棘龍、以及原始的艾雷拉龍下目、雙脊龍科。虛骨龍類的前肢開始出現功能的轉變，肩膀關節節相當靈活，可將前肢平舉；可飛行鳥類的前肢運動達到極限。但是，似鳥龍下目與馳龍科的手掌、手指較不靈活。手盜龍類（包含馳龍類）的手腕有半月形骨頭，使腕部關節相當靈活，可以做出類似鳥類的手掌收疊於前肢側的動作。
擅攀鳥龍科
擅攀鳥龍科的一個明顯特徵是牠們的延長第三手指，此為手部最長一根手指；大部分獸腳亞目恐龍的最長手指是第二根手指。擅攀鳥龍科的其他特徵包含：顱骨短而高、往下彎的下頜、大型的前端牙齒、以及長手臂。不同物種的尾巴長度不一致。樹息龍的尾巴長度是身體的三倍，尾端的羽毛短；而耀龍的尾巴長度是身體的70%，尾端的羽毛極長。樹息龍、擅攀鳥龍、耀龍的模式標本都包含了化石化的羽毛壓痕。
禽龍科
禽龍科（Iguanodontidae）是鳥腳亚目的一科，生存於白堊紀早期到中期，分布於今日的亞洲、歐洲、非洲、以及北美洲等地。最著名的屬是禽龍，是最早被命名的恐龍之一。
卡岩塔獵龍屬
卡岩塔獵龍與其他恐龍共享棲地，包含數種獸腳類如雙冠龍、、搖搖獸腳類（the "Shake N Bake" theropod）；基礎蜥腳形亞目如莎拉龍；畸齒龍科；覆有裝甲的腿龍和小盾龍。卡岩塔組挖出了三種不同體型的腔骨龍科遺骸，可能暗示著潛在未知的角鼻龍類高度多樣性。卡岩塔組形成一個小而持續擴增的動物相。其他卡岩塔組脊椎動物包含：弓鯊科、硬骨魚、肺魚、蠑螈、青蛙（）、真蚓科的、烏龜卡岩塔龜屬、喙頭蜥；翼龍類的喙頸龍；合弓綱的'、卡岩塔獸、小駝獸、、可能的早期哺乳類"Dinnetherium"、賊獸目；鱷形超目的卡索亞鱷、、卡岩塔鱷、原鱷。
單足龍亞科
單足龍亞科目前包含三個屬、六個種。然而，因為文雅單足龍與纖手龍都被發現於北美洲的同一地點，而離亞洲的稀罕單足龍非常遠，所以某些古生物學家認為文雅單足龍是纖手龍的一個異名。亞洲近頜龍屬起初被列於近頜龍科，但牠們可能更為原始，分類位置位於近頜龍超科之內，而不屬於單足龍亞科與偷蛋龍亞科。此外，Maryańska、Osmólska、與Wołsan等人認為有尾綜骨的偷蛋龍類天青石龍，屬於單足龍亞科。在2010年的ㄧ個研究，則提出體型巨大的巨盜龍也屬於偷蛋龍科。
胼足亚目
胼足亚目（学名：）是偶蹄目的一个演化支，大约在4620万年前始新世中期开始出现，在北美洲及欧洲都有长期的化石记录，现在仅有骆驼科一支存活至今，目前分布在南美洲、亚洲及非洲北部；澳洲大陆也有由人类引进的野化骆驼分布。
恐爪龍屬
根據這些蛋的微結構，發現它們是屬於獸腳亞目，因為它們有著其他獸腳亞目蛋的特徵，並與鳥臀目及蜥腳下目蛋的不同。與其他手盜龍類比較，這些蛋化石較像竊蛋龍科的蛋，而非傷齒龍科的蛋。雖然該蛋經已碎裂，而很難評估其大小，但Tinner與馬克維奇根據蛋所經過的骨盆腔，推測出蛋的直徑約為7厘米。這個大小與最大的葬火龍蛋的直徑7.2厘米接近。而葬火龍與恐爪龍的體型接近，支持了蛋的估計值。再者，葬火龍蛋殼及恐爪龍蛋殼厚度差不多完全一致，由於蛋殼厚度影響著蛋的體積，故此有指牠們蛋的大小是完全一樣的。
頭飾龍類
頭飾龍類（学名： ）是鳥臀目恐龍的一個演化支，包括有厚頭顱骨的厚頭龍亚目，以及有角的角龍亚目。牠們全是植食性恐龍(實際上要到中生代末期才有草等禾本科植物，所以不能稱為草食性恐龍)，以二足或四足方式行走，特徵是頭顱後方有骨質隆起或裝飾物。頭飾龍類演化支在侏儸紀演化出來，繁盛於白堊紀晚期。
南方稜齒龍屬
Martínez找不到證據顯示南方稜齒龍屬於禽龍類，所以將牠們歸類於更基礎的稜齒龍科，而在當時南方稜齒龍是南美洲唯一的稜齒龍類。在1999年，羅多爾夫·科里亞（Rodolfo Coria）對於南美洲鳥腳亚目恐龍的研究，支持南方稜齒龍屬於稜齒龍科的分類法。但最近對於基礎鳥腳類恐龍的研究，發現南方稜齒龍的化石過於破碎，而不能分類於真鳥腳類之外；真鳥腳類是個位於鳥腳下目內的演化支，包含稜齒龍類與禽龍類。但是，稜齒龍科目前被認為是原始鳥腳類的並系群，包含多群原始鳥腳類的小型支系。
恐手龍屬
恐手龙的大脑通过CT扫描而重建，并在2014年古脊椎动物学会会议上发表。大脑呈球状，近似鸟类和伤齿龙科，扩张方式类似大多数兽脚类，嗅束（olfactory tracts）相对较大。大脑比例小而紧凑，（脑部身体质量比）估计为0.69，这对兽脚类来说很低，与蜥脚类相似。其他似鸟龙类具有更大的大脑，而恐手龙较小的大脑可能反映了其社交行为或饮食习惯。其协调和平衡能力不会像肉食性兽脚类动物那样重要。  2015年，渡边昭信（Akinobu Watanabe）和同僚发现，恐手龙与古似鸟龙和似鸡龙在似鸟龙类中拥有最为气腔化的骨骼。“气腔化”被认为有利于现代鸟类的飞行，但它在非鸟恐龙中的作用尚不确定。有人提出气腔化被用来减轻大型骨骼的重量（在恐手龙的情况下则与巨大尺寸有关），与较高的新陈代谢、运动时的平衡或体温调节有关。
似鳥龍屬
似鳥龍屬（屬名："Ornithomimus"）意為「鳥類的模仿者」，是一種雜食性獸腳亞目恐龍，除了尾巴較長、沒有羽毛之外，其餘形狀均和現代鴕鳥極度相似，牠也是似鳥龍科中最先被發現的。似鳥龍的生存於晚白堊紀的北美洲地獄溪組，在現代美國、加拿大和墨西哥均有發現，和暴龍、三角龍、甲龍、腫頭龍和愛德蒙托龍生活在同一個地質年代。目前有兩個有效種，一個是急速似鳥龍（"O. velox"），是根據一個腳掌與部份手掌來命名的，這些化石發現於馬斯垂克階的丹佛組；另一個是埃德蒙頓似鳥龍（"O. edmontonicus"），是在加拿大發現的更好、更完整的的化石，產自艾伯塔省的，在加拿大省立恐龍公園中尤其多；在美國東岸則發現了一個保存極好的天然狀態標本化石，疑似似鳥龍，目前仍不清楚屬於哪種。
雙葉龍屬
另一種獸腳亞目恐龍也名為“Futabasaurus”，且都是生存於白堊紀晚期的日本。然而，該恐龍還沒有被正式的命名，是一個無資格名稱。
伊萨西奔龙属
1980年，地质学家弗朗西斯科·努鲁（Francisco E. Nullo）注意到阿根廷圣克鲁斯省以南埃斯坦西亚·阿尔塔·韦斯塔（Estancia Alta Vista）的山坡上发现了蜥脚类骨骼。他向当时著名的古生物学家何塞·波拿巴报告了这些发现。1981年，波拿巴挖出一块大型蜥脚类颈椎。在2019年1月13日至17日至3月14日至19日期间，对旧址进行了重新安置和新的挖掘，并在埃斯坦西亚·拉·安尼塔（Estancia La Anita）发现了一个新遗址。2000年，一个全新的动物群在一个面积为的地区被发现。蜥脚类动物的发现被命名为新属努鲁巨龙，但技术人员马塞洛·帕布罗·伊萨西（Marcelo Pablo Isasi）也发现了一种新的鸟脚类动物的骨骼，它们出现于一些沧龙科牙齿旁边。
棘龍屬
包括棘龙科在内的兽脚亚目无法将其手部向前旋转（旋转前臂，使手掌朝向地面）， 但手部在侧边的休息姿势是可能发生的，这是根据侏罗纪早期的兽脚亚目脚印化石。根据2021年最新发现的棘龙前肢化石显示，其二足行走的可能性极高，也不像2020年发现尾鳍化石时猜测的那样类似鳄鱼，而是更加接近于涉禽。
獸腳亞目
因此，在侏儸紀晚期，有四個獸腳亞目支系存活者，包括：角鼻龍下目、斑龍超科、肉食龍下目、以及虛骨龍類，牠們以豐富的小型與大型草食性恐龍為食。這四個演化支都存活到白堊紀，其中只有阿貝力龍超科、異特龍超科與虛骨龍類存活到白堊紀末；而阿貝力龍超科、異特龍超科分布於岡瓦納大陸，虛骨龍類主要分布於勞亞大陸。
腱龍屬
腱龍屬（屬名：）是種體型中到大型的鳥腳亚目恐龍。腱龍原本被認為屬於稜齒龍類，但自從稜齒龍類不在被認為是個演化支後，腱龍現在被認為是種非常原始的禽龍類。
鳥首龍目
鳥首龍目（Avicephala）又譯鳥頭龍目，是雙孔亞綱的一個目或演化支，生存於二疊紀晚期到三疊紀。牠們的四肢、尾巴高度特化，具有抓握能力，是群樹棲爬行動物，並可能具有滑翔能力。
獸腳亞目
過去數十年來，對一般大眾而言，暴龍是最大型的也是最著名的獸腳亞目恐龍。然而，自從暴龍被發現以後，已經有許多的其他大型獸腳亞目恐龍被敘述，包括：棘龍、鯊齒龍、南方巨獸龍、以及馬普龍。在電影《侏儸紀公園III》中，棘龍被敘述成體型大於暴龍；而根據棘龍的原始標本與2006年的新發現化石，也顯示棘龍身長比暴龍長6公尺，而體重比暴龍重1公噸。目前還沒有科學上的解釋，為何這些掠食動物成長的越來越大。
恐龙生理学
偷蛋龍類、似鳥龍類的食性充滿謎題，牠們屬於獸腳亞目演化支，而大部分獸腳類恐龍是肉食性動物；但偷蛋龍類與似鳥龍類的頜部小、缺乏牙齒或牙齒窄小，牠們有可能是雜食性、草食性動物。
稜齒龍科
最近數個關於鳥臀目的研究，例如Butler（2005年）、Barrett等人（2005年）、徐星等人（2006年）、以及Butler等人（2007年）的研究，發現原始鳥臀目恐龍與原始鳥腳亚目恐龍有些演化關聯，但每個研究提出的演化關係都不同。這領域自從80年代晚期以來缺乏研究；加上數個種被重新分類為非鳥腳亚目恐龍，例如靈龍、奧斯尼爾洛龍，都造成分類上的困難。
新獸腳類
新兽脚类由罗伯特·巴克于1986年命名，并作为一个包括相对衍生的兽脚类分类群如角鼻龙类和坚尾龙类但不含腔骨龙超科的演化支。然而，大多数后来的研究者使用它来表示一个更广泛的演化支。1998年，首次将其定义为：含有腔骨龙超科加上全部现代鸟类，包括除最原始物种以外的几乎所有兽脚类。
獸腳亞目
在三疊紀晚期，一些原始獸腳類與獸腳類恐龍便已經出現。最早且最為原始的肉食性恐龍是阿根廷的始盜龍與艾雷拉龍科。艾雷拉龍科最早出現於三疊紀的卡尼階後期到諾利階（Norian）早期。在北美洲與南美洲可以發現這類恐龍化石，此外牠們可能也出現在印度與非洲南部。艾雷拉龍科同時擁有一些較為原始以及較為晚近的恐龍特徵，是一種鑲嵌演化（Mosaic evolution；不同特徵擁有不同演化速率）的現象。古生物學家們本來認為艾雷拉龍類是獸腳類的物種之一，不過後來發現牠們可能是原始的蜥臀目恐龍，甚至可能早於蜥臀目與鳥臀目的分化。根據2009年新發現的太陽神龍，顯示艾雷拉龍類可能是群早期獸腳類恐龍。 最早且最原始的獸腳亞目恐龍（或者說是真獸腳類）為腔骨龍超科。腔骨龍超科是群輕型、分布廣泛的群居恐龍。腔骨龍科包含小型掠食動物（例如腔骨龍、合踝龍），以及大型掠食動物（例如身長6公尺的雙脊龍）。這些成功的動物生存於三疊紀的諾利階到侏儸紀的托阿爾階。但在早期的親緣分支分類法研究裡，腔骨龍超科被分類於角鼻龍下目，並且被認為是更先進獸腳類的一個旁支；目前腔骨龍超科被認為可能是其他獸腳類的祖先，如此一來，牠們將成為並系群集合。
翼手龍亞目
不確定位置：阿拉利坡龍（"Araripedactylus"）、懷俄明翼龍（"Wyomingopteryx"）、班尼特翼龍（"Bennettazhia"）、皮翼龍（"Dermodactylus"）、郝氏翼龍（"Haopterus"）、買薩翼龍（"Mesadactylus"）、槌喙龍（"Criorhynchus"）。
蜥足龍
蜥足龍（學名："Sauropodus"）是蜥腳下目恐龍的一屬，生存於白堊紀晚期的阿根廷。這個學名是在2001年宣布的，意為「蜥蜴的腳」，但是沒有經過正式的敘述、命名，目前的狀態是個無資格名稱。
冠龙属 (兽脚亚目)
五彩冠龍被估計約有3米長，牠是雙足恐龍，與後期的暴龍類有許多共同特徵，但冠龍有一些獨特的地方，如牠頭上的大冠。不像後期的暴龍類，五彩冠龍的前肢很長，肢上有三指。除了獨特的冠外，牠與近親的帝龍相似，可能與帝龍一樣有一層原始羽毛。五彩冠龍可能與有相似的冠的單脊龍生活於相同時代的相同地區。
角鼻龍類
角鼻龍類（Ceratosauria）是一群獸腳亞目恐龍，被定義為：在獸腳亞目之中，比鳥類更接近角鼻龍的所有物種。目前對於角鼻龍類的鑑別特徵、物種列表，並沒有一致的共識。根據其中一個理論，角鼻龍下目包含角鼻龍、輕巧龍、阿貝力龍等生存於晚侏羅紀到晚白堊紀的獸腳亞目恐龍，主要發現於南半球。角鼻龍類的分布廣泛，而且是恐龍時代早期的主要掠食性恐龍，然而當堅尾龍類出現時，牠們逐漸在北方各大陸消失。
刑天龍屬
刑天龙属（学名：）是一属已灭绝的偷蛋龙类兽脚亚目恐龙，生存於早白垩世的中国，模式种兼唯一种干戚刑天龙（"X. ganqi"）于2019年命名、叙述。它与尾羽龙和似尾羽龙一起归类于尾羽龙科。
非正式命名恐龍列表
阿馬加劍龍（英语：）是一屬已灭绝剑龙科鳥臀類恐龍的非正式名稱，發現于阿根廷的，命名自标本MACN N-43（包括背部皮内成骨、颈椎、尾椎及一块顱骨）。2016年，和宣布它是一個無資格名稱，并将其確立为分類不明的剑龙類恐龍。 印度安得拉龍（英语：）是印度一屬已灭绝裝甲鸟臀目恐龙的非正式名稱。罗曼·乌兰斯基在2014年根據部分顱骨、约30個皮内成骨及椎骨和四肢骨骼建立该裸名。所有化石都保存在GSI的藏品中，并由纳特（T. T. Nath）等人（2002年）分類於甲龙下目。
怪腳龍屬
怪脚龙（属名："Anomalipes"，意为“怪异的脚”）是近颌龙科兽脚亚目恐龙已灭绝的一个属，化石发现于中国晚白垩世坎帕阶的，模式种是赵氏怪脚龙（"Anomalipes zhaoi"）。
喙嘴翼龍亞目
喙嘴翼龍亞目（），又名喙嘴龍亞目，是翼龍目兩個亞目之一，代表翼龍目的原始階段。喙嘴翼龍亞目是並系群，翼手龍亞目從喙嘴翼龍類演化而來，而非更直系的共同祖先。因為喙嘴翼龍亞目並非完全自然的生物群，大多數科學文獻並不使用此名詞並，但還是被某些翼龍專家用在大眾作品裡，例如大衛·安文（David Unwin）在2006年的《"The Pterosaurs: From Deep Time"》一書。喙嘴翼龍類是第一批出現的翼龍類，出現於三疊紀的卡尼阶末期。大多數喙嘴翼龍類有牙齒與長尾巴，大多數物種缺乏冠飾，這些特點不像牠們的的翼手龍類後代，但幾個喙嘴翼龍類有由軟組織如角質所形成的冠飾。喙嘴翼龍類通常較小，牠們的手指仍然用來攀抓。
雙葉龍 (恐龍)
雙葉龍（學名："Futabasaurus"）是獸腳亞目恐龍的一屬，生存於白堊紀晚期的日本。化石是一個部分脛骨，發現於日本福島縣的雙葉群（Futaba Group）的足沢層（Ashizawa Formation），地質年代為科尼亞克階。在1990年，大衛·蘭伯特（David Lambert）提出這個名稱，認為牠們是獸腳亞目的分類位置未定屬。同年，董枝明等人簡述這個化石，並公布圖片，認為雙葉龍是種暴龍科恐龍。但因為從沒有正式敘述、命名過，雙葉龍的狀態是個無資格名稱（Nomina nuda）。雖然這個名稱是在1990年出現，但在2006年，日本的一種蛇頸龍類首先正式使用雙葉龍（"Futabasaurus"）這名稱。如果這個獸腳類恐龍未來被正式命名，必須使用其他名稱。
恐龙
白堊紀晚期的恐龍通常分為三個動物群。在北半球的北美洲與亞洲，獸腳類恐龍主要有大型的暴龍科、以及眾多的小型手盜龍類恐龍，優勢植食性恐龍則由鴨嘴龍科、角龍亞目、甲龍科、厚頭龍亞目所構成。南半球的岡瓦那大陸持續分裂中，阿貝力龍科是優勢獸腳類恐龍，泰坦巨龍類則是優勢植食性恐龍。在歐洲，凹齒龍科、結節龍科、泰坦巨龍類則是常見的恐龍。開花植物更為輻射演化，第一批禾本科（草）植物被部分学者认为出現在白堊紀末期。鴨嘴龍科與甲龍亞目在北美洲、亞洲發展至極度多樣化。獸腳亞目也演化出植食性或雜食性的物種，鐮刀龍超科與似鳥龍下目更為常見。
鳥首龍目
鳥首龍目是群奇特、多樣化、相關研究不多的爬行動物，目前很難確定牠們的演化關係與分類位置。某些研究人員曾提出，鐮龍科與長鱗龍屬於原蜥形目，另一群早期雙孔亞綱爬行動物。在2004年，菲力·森特（Phil Senter）發現鐮龍科、長鱗龍與空尾蜥科屬於同一演化支，他命名為鳥首龍目（Avicephala），屬於雙孔亞綱，是新雙孔類的姐妹分類單元。
角足龙类
有數個物種難以歸類到鳥腳亚目或頭飾龍類。
長鱗龍屬
因為這些類似鳥類的結構，長鱗龍處於「鳥類是否從恐龍演化而來」爭論的中心。大多數的恐龍與鳥類研究者使用親緣分支分類法研究，認為鳥類從類似伶盜龍的衍化獸腳亞目恐龍演化而來。早期的獸腳亞目可能都是恆溫動物，並進化出簡易的纖細羽毛作保暖之用，而這些羽毛後來變得更大及複雜，適合空氣動力用途。這種說法一般都有化石證據支持（參有羽毛恐龍）。此陣營的科學家們通常認為長鱗龍是奇怪的雙孔亞綱動物，有特別的鱗片，不明的頭顱骨特徵，而其他類似鳥的特徵也被誤釋，這些特徵同樣可見於跟鳥類無關的物種，這是適應樹棲生活的後果，可見於現代樹棲動物變色龍，並非鳥類演化的成份。
恐龙
蜥臀目（學名：Saurischia）意為「蜥蜴的髖關節」，骨盆型態比較接近早期的祖先，恥骨朝前。數個演化支的恥骨個別演化成朝向後方，例如：艾雷拉龍下目、鐮刀龍超科、馳龍科、以及其後代鳥類。蜥臀目主要包括兩個亞目：二足、大部分是肉食性的獸腳亞目；長頸部、四足、植食性的蜥腳形亞目。某些獸腳亞目大約在侏儸紀時期演變成為鳥類的祖先。
福斯特龙属
福斯特龙（属名："Fostoria"）是一属禽龙类鸟脚亚目恐龙，化石发现于澳大利亚新南威尔士州的，模式种兼唯一种羊圈福斯特龙（"Fostoria dhimbangunmal"）命名于2019年。
似鳥龍類
在1990年代早期，著名的古生物學家，例如托馬斯·霍爾特（Thomas R. Holtz Jr）假設出獸腳亞目與夾蹠龍類之間有緊密的關係；二足恐龍的上足部骨頭擠壓在一起，這是種奔跑的適應演化。在1994年，霍爾特將夾蹠龍類定義為：獸腳亞目之中，首隻發展出夾蹠腳掌的物種，以及牠們的後代。這群生物包含傷齒龍科、暴龍超科、以及似鳥龍下目。霍爾特後來在1996年與2000年，以支系作為基礎，重新將夾蹠龍類定義為：似鳥龍，以及獸腳亞目之中與似鳥龍有較近的最近共同祖先，而非與鳥類有較近共同祖先的所有物種。之後大部分科學家，包括霍爾特在內，認為夾蹠龍類並非一個天然演化支，並證實暴龍超科與傷齒龍科與虛骨龍類的親緣關係較近，而離似鳥龍下目較遠。自從夾蹠龍類改採似鳥龍作為基礎的狹隘定義，該名詞與似鳥龍下目相比顯得多餘，所以夾蹠龍類逐漸少用。
鸟
鸟或者鳥類，是鸟纲（）和今鳥亞綱（）的通称，是唯一存活並演化至今的恐龍，現代所有鳥類在生物学上也被分類為鸟形恐龙（即鳥翼類）的一部份；鸟纲的全体成员均为两足、恒温、卵生、身披羽毛且色彩鮮艷各異、前肢特化成翅膀、具有坚硬的喙、流線型的身軀，具備絕佳的視覺，較複雜的社交行為，多數可飛行，小部分純陆栖、或潛水，骨骼中空輕盈並有強力肌肉附著，以及用氣囊行雙重呼吸的一種有脊椎動物。目前全球鳥類共有8600種，如果算入未被分類和不確定的有9000多種；東亞地區中，中国大陸有1400種、特有種70多個；臺灣有21目94科305屬788種，特有種29個。鸟类的食物多种多样，包括植物的花蜜、种子、果实，昆虫、魚類，蛙类、蜥蜴类、蛇类、龟类、老鼠类，魷魚類、貝類、和其它鸟类，以及動物的蛋、腐肉、骨骼和人类的生活垃圾。鸟的体型大小不一，最大的鴕鳥體高可達2.5米，而最小的吸蜜蜂鳥體長僅5厘米。多数的鸟在日间活动，也有一些鸟在夜间或者黄昏的时候活动（例如夜鷹、猫头鹰等）。许多鸟都会进行长距离迁徙以寻找最佳栖息地（例如北极燕鸥），也有一些鸟大部分时间都在海上度过（例如信天翁）。大多数鸟类都会飞行，不能飞的鸟包括古颚总目下的鸵鸟、鸸鹋、几维鸟等多数种类，企鹅目的全部鸟类，某些生活在没有地面捕猎者的孤立海岛上的鸟类如鹦鹉目的鸮鹦鹉，也在演化过程失去了飞行能力。
尾羽龍屬
但是，並非所有科學家都認為尾羽龍是恐龍，有些科學家持續地提出反對意見。古生物學家艾倫·費多契亞（Alan Feduccia）反對鳥類與獸腳類恐龍之間有演化關係，他認為尾羽龍是種無法飛行的鳥類，而且跟恐龍沒有接近親緣關係。在2000年，T.D. Jones與其他人將尾羽龍的身體比例，與無法飛行的鳥類、獸腳亞目比較，他們指出尾羽龍的腳與不能飛卻適於行走的新鳥亞綱很相似，例如鴕鳥，因而做出尾羽龍是鳥類的結論。在2005年，G.J. Dyke與馬克·諾瑞爾（Mark Norell）批評了Jones等人研究在科學方法上有瑕疵，並提出完全相反的結論。
蜥腳形亞目
蜥腳形亞目是蜥臀目的兩個主要演化支之一。蜥腳形亞目的姐妹分類單元是獸腳亞目，包含二足肉食性恐龍，例如迅猛龍與暴龍。然而，蜥腳形亞目與鳥臀目也有許多共同特徵，所以有少數的古生物學家如羅伯特·巴克（Robert Bakker），建立「Phytodinosauria」（或Ornithischiformes）來包含草食性的蜥腳形亞目與鳥臀目。
非正式命名恐龍列表
斯卡拉奔龙（英语："Skaladromeus"）或称凯帕罗维茨的鸟脚类（"Kaiparowits ornithopod"），是来自的一种鸟脚类，由克林特·博伊德（Clint Boyd）命名于2012年的一份论文中。预期的模式种是戈氏斯卡拉奔龙（"Skaladromeus goldenii"）。正模标本似乎被一只鳄形类咬过，这表明斯卡拉奔龙是被鳄鱼所捕食的。
非正式命名恐龍列表
曼加桓加龙（英语："Mangahouanga"，命名自同名河流曼加桓加溪，又称）或“的兽脚类”（Joan Wiffen's theropod"）是新西兰一种兽脚类的非正式名称，化石是单个椎骨，由琼·威芬于1975年发现。“属名”由莫利纳·佩雷兹和拉腊门迪于2016年在书中命名，但并未给出种名。作者估计“曼加桓加龙”长，重 。
鳥頸類主龍
恐龍形態類（Dinosauromorpha）包括原始的馬拉鱷龍與兔蜥（"Lagerpeton"），與牠們著名的後代恐龍。獸腳亞目被現代科學家認為是現代鳥類的祖先。
劍龍屬
与剑龙共享栖息地的恐龙包括兽脚类的异特龙、食蜥王龙、蛮龙、角鼻龙、马什龙、史托龙、嗜鸟龙、虚骨龙和长臂猎龙。蜥脚类在该地区占主导地位，包括腕龙、迷惑龙、梁龙、雷龙、圆顶龙和重龙。其他鸟臀目包括弯龙、怪嘴龙、橡树龙、奥斯尼尔龙和德林克龙。在莫里逊组的恐龙里，剑龙可能比较偏好干燥环境，不同于异特龙、迷惑龙、圆顶龙和梁龙。
非正式命名恐龍列表
后来，人们将这块骨头与其他更完整的鸟脚类遗骸进行比较，发现“米切尔鸟脚类”的骨头与鸭嘴龙类和禽龙类最为相似，尽管它很可能是一种基底鸟脚类动物。雷塔拉克认为这块骨头属于一个新属，尽管没有足够的遗骸作为这一说法的依据。
斑盜龍屬
斑盗龙发现于乌因库尔组――一个近年来已被广泛研究的地层。该属与多种恐龙共享栖息地，如西北阿根廷龙科的乌因库尔龙，阿贝力龙科的蝎猎龙、肌肉龙和雷霆龙，鲨齿龙科的马普龙以及一些地位未定的兽脚类如瓜里丘龙和南盗龙。蜥脚类中具有代表性的恐龙如雷巴齐斯龙科的鹫龙和利迈河龙，泰坦巨龙类的阿根廷龙和乔冈龙以及一些未命名物种。鸟臀目包括几种未命名的禽龙类。
鳥足龍屬
鳥足龍屬（學名："Avipes"）意為「鳥類的足部」，可能是種獸腳亞目恐龍，生存於三疊紀中期，化石發現於德國的一處砂岩地層。
非正式命名恐龍列表
洛帕龙（英语："Lopasaurus"，意为“阿尔贝托·洛帕”的蜥蜴）是一属尚未叙述的驰龙科兽脚亚目恐龙的非正式名称，因其与鹫龙、内乌肯盗龙和彭巴盗龙的相似性而被认为属于半鸟亚科，化石出自巴西蓬托普莱斯1号遗址（Ponto 1 do Price site）晚白垩世马斯特里赫特阶的。“正模标本”为部分右跖骨（含第二、第三和第五跖骨），由阿尔贝托·洛帕（Alberto Lopa）在20世纪40年代至60年代期间发现，但该化石在1980年去世后不久就遗失了。“洛帕龙”在布鲁姆等人对渔龙的叙述中简要提及，并在题为《巴西恐爪龙类的记录》（The record of deinonychosaurians in Brazil）的一节中暂时归类于半鸟亚科。尽管“洛帕龙”和渔龙发现于同一地层，但作者并未将前者归类于后者。
沼澤鳥龍屬
沼澤鳥龍成為類似鳥類的真手盜龍類，但並非現代鳥類。重腿龍的化石資訊不多。而七鎮鳥龍與沼澤鳥龍的化石非常相似，所以剛出土時被認為是同一個體，卻似乎屬於更古老的獸腳亞目演化支。這個狀況類似脅空鳥龍與"Vorona"。在阿瓦拉慈龍科的單爪龍亞科中，七鎮鳥龍的體型過大。因為三類恐龍都只有碎片，爭論應仍會繼續。
艾雷拉龍屬
自发现以来，有很长的一段时间艾雷拉龍的分類都不清楚，原因是牠最初只有一些化石碎片。牠曾被認為是基礎獸腳亞目恐龍、基礎蜥腳形亞目恐龍、基礎蜥臀目恐龍、或者不是恐龍。但是，隨著1988年發現了大部份完整的骨骼及頭顱骨後，艾雷拉龍在至少五個關於獸腳亞目演化的研究中，被分類為早期的獸腳亞目、或早期蜥臀目恐龙，但也有研究人員選擇暫時性地將艾雷拉龍列為獸腳亞目的最原始物種。艾雷拉龍是中型的雙足恐龍，屬於艾雷拉龍下目，這群外表相似的動物，是最早期的恐龍結果。
翼手龍亞目
翼手龍亞目（學名：Pterodactyloidea），希臘文意思為“有翼的手指”，是翼龍目兩個亞目之一，包括翼龍類的較先進物種。牠們在侏罗紀中晚期出現，與喙嘴翼龍亞目的差別在於牠們的短尾巴，與翼上的長指骨。最先進的物種缺乏牙齒。許多物種頭顱上有發展良好的冠飾，這是一種展示物，夜翼龍與古神翼龍擁有巨大的冠飾。翼手龍類，尤其是神龍翼龍科，是白堊紀末最後存活的翼龍目動物。白堊紀-第三紀滅絕事件滅絕了翼龍類、恐龍、與大多數海生爬行動物。
岛屿龙属
岛屿龙是巴塔哥尼亚中部的第一个非鸭嘴龙科的鸟脚类。该属的发现增加了鸟脚类动物的解剖学知识，并为生活在白垩纪末南极附近巴塔哥尼亚的恐龙动物群的组成增加了新的数据。