阿那克西曼德
阿那克西曼德是早期进化论提出者，他认为地球一开始为湿气，随着地球的逐渐干燥，最早的动物是从海泥中产生。人類与其他一些动物一样，是由鱼变化而来的，随着长期的进化才得以在陆地上独立生存。
演化
以自然選擇為基礎的演化理論，最早是由查爾斯·達爾文與亞爾佛德·羅素·華萊士所提出，詳細闡述出現在達爾文出版於1859年的《物種起源》。1930年代，達爾文自然選擇與孟德爾遺傳合而為一，形成了現代綜合理論。連結了演化的「單位」（基因）與演化的「機制」（自然選擇）。這種有力的解釋以及具預測性的理論成為現代生物學的中心原則，使地球上的生物多樣性得以作統一的解釋。
生物学史
哲学家亚里士多德是古典时期最有影响力的学者之一。尽管他早期对於自然哲学的作者都是理论性的，亚里士多德后期的生物学作品则偏向实验，关注生命的起源和生物多样性。他对自然界进行了无数的观察，特别是身边世界的植物和动物的习性和抽象化，他对分类对了大量工作。亚里士多德共分类了540个动物品种，并解剖了至少50种。他相信形式因指导了所有的自然进程。
英国
英格蘭和蘇格蘭是17世紀以來科學革命的主要中心。英國領導了18世紀的工業革命，並繼續培養出重要的科學家和工程師。17和18世紀的主要理論家包括艾萨克·牛顿，他的運動定律和引力定律被視為現代科學的基石。19世紀的查爾斯·達爾文，他的提出的進化論是現代生物學發展的基礎。詹姆斯·克拉克·麦克斯韦提出了電磁場的動力學理論對20世紀初物理學進展影響最為巨大；他的科學工作為狹義相對論和量子力學打下理論基礎。。
有性生殖的演化
对这个问题现代的哲学科学思考可以追溯到18世纪的伊拉斯謨斯·達爾文；它也同样体现在亚里士多德的作品中。这个线索后来由奥古斯特·魏斯曼所发展，他理解了性的目的是为了创造遗传变异，详见如下的大多数解释。另一方面，查尔斯·达尔文，同样在1889年，总结杂种优势（互补作用）的影响“对解释……两性的起源很充足。” 这与修复与互补假说相一致，如下 “其它解释” 章节中所述。
演化思想史
達爾文在提出演化論時並不知道遺傳機制如何運作，而孟德爾在1865年發表的遺傳定律則一直受到忽略。直到20世紀，達爾文的天擇理論與孟德爾的遺傳學才結合為現今所熟知的現代綜合理論。隨後科學家發現基因為遺傳物質，並發現基因由DNA所構成。現在的演化研究以基因為中心，並發展出許多相關學門。 早在達爾文之前，類似於演化的思想就已經出現。許多民族的神話中都有動物變成人的故事。
动物和植物在家养下的变异
在全书的最后，达尔文肯定了生物是由演化而来，人类或自然的选择使得动植物成为今天的样子。达尔文直接向他的支持者和朋友、美国植物学家阿萨·格雷所拥护的所谓“神引变异”（上帝创造了原初的物种并让它们在上帝的意愿下演化）提出了挑战。他以建筑师构筑大厦为例子：如果说现今的自然界是一幢大厦的话，那么动植物的各类性状就是这幢大厦的基石。达尔文说，如果自然界的建筑师（造物者）能够考虑到他所定的法则的全部后果，那么他就应该能够运用恰当形状的石头来构筑大厦的各个部分。然而，现实中，自然界这幢大厦的基石是由随意杂乱的石头构成的。如果造物者能够预先考虑到各类动植物的特点，为何家养动植物的各种变异中包括了如此多的对饲养者无用、不利乃至于危险的特征，比如凸胸鸽和斗牛犬？作为结尾，达尔文写道：“不论我们怎样愿意，都无法同意阿萨·格雷教授的信条：‘（生物的）变异是沿着经过事先预定的有益的道路进行的，如同水流经过设定的水渠来灌溉田地一样’”
社会达尔文主义
社會達爾文主義，也称社会进化论，指將達爾文演化論中自然選擇及適者生存的思想應用於人類社會的一系列社會理論。此一思想最早見於英國哲学家兼作家赫伯特·斯宾塞提出的社會文化進化論。社會達爾文主義的風行從19世纪持續到第二次世界大戰结束，有人認為現代的社會生物學也可歸類到社會達爾文主義學派中。“社會達爾文主義”一詞最早出現在美國歷史學家理查德·霍夫施塔特于1944年出版的著作《美國思想中的社會達爾文主義》，所以用“社會達爾文主義”一词来指稱1944年前的相關思潮是不確切的，但這種用法已被歷史學界廣泛採用。社会达尔文主义启发了许多种族灭绝制造者，如亚美尼亚种族灭绝及納粹大屠殺。
现代演化综论
建立並發展現代綜合理論的科學家，包括了數學家罗纳德·费希尔、生物學家休厄尔·赖特與J·B·S·霍爾丹，以及摩根、费奥多西·多布然斯基、朱利安·赫胥黎、恩斯特·麥爾、乔治·盖洛德·辛普森、等人。
演化思想史
演化思想是對於生物個體在不同世代之間具有差異的現象所做的一種解釋。在西方，類似想法最早起源可追溯至古希臘與古羅馬時代。此外，古代中國也有類似的生物演化、變化、轉化的觀念，如《莊子》中《寓言》和《至樂》篇章中談到不同生物的轉化。公元前6世紀，古希臘學者阿那克西曼德提出人類的祖先來自海中的理論。
演化論的社會影響
科學和宗教衝突自西方啟蒙時代開始已經爭鬧不休。西方中世紀教會擁有極大的權力，政教是合一的。教會和皇權操控社會一切活動和個人生活細節。學術研究更加不能夠逾越教會正統信仰的教導。基督教教會，包括天主教和宗教改革產生的宗派，相信人是神按神形象創造，人在一切創造物是至為尊貴的。因此，當時的人都是按照聖經的教導解釋所有對自然現象的理解，教會傳統教導是無誤的，天文學﹑地理學﹑生物學、哲學等學科，都是教會權威，不可以挑戰。學術的責任是發展知識服務教會﹑去支持教會和聖經無誤的教導。 西方国家一些宗教团体认为演化论与创世理论有冲突，一些地区的学校甚至不开设演化论的课程。一些地区开设演化论课程是与宗教团体妥协的结果。美國佛州规定必须在公立学校教授演化论，作为一种“理论”。某些基督教團體認為智能設計是同等重要的理論，該理論相信任何世界上的生物都來自一個智能設計者（改自上帝），在一瞬間全被創造，且這些生物除了為同一創造者造出之外毫無共通之處，即使之間具有差異也不可能改變物種。其理論的基礎是聖經的創世紀。2005年奇茲米勒訴多佛學區案一案。在這案例中原告方提出了證據證明當初智能設計的原稿只是份講解聖經創世紀用的文章，於1987年由作者在Edwards v. Aguillard一案後，將"創造者"改為"智能因子"的手法舊瓶換新藥的神創論。 有些教派則對於演化論持较为開明的態度。2005年，在美國一封由1萬多名基督教牧師簽名的說： 「……我們相信進化論是科學的基本事實，它經受住了嚴格的檢驗，人類許多豐富的知識和成就都建築在這個理論之上。拒絕這個事實，或者認為它只不過是『許多假說中的一種』，是對科學無知的蓄意容忍，而且將把這種無知傳遞給我們的後代。我們相信，能夠進行批判性思維的大腦就是上帝給予我們的珍貴禮物之一，拒絕充分使用這個禮物就是拒絕造物主的意願……我們敦促學校董事會成員肯定進化論教學是人類知識的重要部分，並因此維護科學課程的完整性。我們要求，把科學作為科學來對待，把宗教作為宗教來對待，這是兩種不同形式的相互補充的真理。」
演化
英文中的“”一词，起源於拉丁文的“”，原本的意思是将一个卷在一起的东西打开，當今的解釋是在地球歷史上，不同種類的生物怎樣從早期的形式發展出來的一個過程。當代英語字典也有「發展」、「從經歷中獲取」之義。 在《物種起源》最初的版本中沒有出現「Evolution」這個詞，達爾文用「經過改變的繼承」（）、「改變過程」（）或是「物種改變的原理」（）等。他曾在《物種起源》第7章中說，天擇的最後結果，包括了生物體的進步（）及退步（）兩種現象」，而總括來說，從地球有生物開始，是進步或退步的問題放在第10章討論，結論是現有的生物都是經過長時間的進步，到某程度而沒有違反天擇的，發展便停留下來。只有在全書的最後一句以「evolved」這個字結尾：
人類起源論
演化論受一般大眾、學者、開明宗教人士以及科學界支持，絕大多數的科學社群和學術團體，都認為演化論是唯一能完全滿足在生物學、古生物學、分子生物學、遺傳學、人類學及其他各領域中所觀察到的現象的理論。一項在1991年所作的蓋洛普民調顯示，只有大約5%的科學家（包括生物學領域以外的其他科學家）認為自己是創造論者。截至目前為止，沒有任何反對演化論且經過科學方面同行審查的論文，名列科學與醫學期刊搜尋引擎PubMed當中。
C. H. 沃丁顿
康拉德·哈尔·沃丁顿 ，简写C·H·沃丁顿（1905年11月8日 - 1975年9月26日）是英国发育生物学家、古生物学家、遗传学家、胚胎学家和哲学家。他为系统生物学、表观遗传学和进化发育生物学的早期发展奠定了基础。
先有鸡还是先有蛋
演化论表示物种在通过一定时间的突变以及自然选择后最终可以得到演化。这使得人们相信在历史上的某一刻，某一种像鸡但是不是鸡的物种，由于基因突变，产出了第一颗“鸡蛋”。因为，鸡和鸡蛋都是由鸟和不是鸡蛋的鸟蛋演化而来的，只不过在很长的时间中二者演化的越来越相似而已。
查尔斯·达尔文
達爾文並不是第一個提出演化思想的人，在達爾文出生之前許久，就已有人有生物會演變的想法了，例如在古希臘時代，前蘇格拉底哲學家阿那克西曼德及恩培多克勒就已認為一種生物可以源於另一種生物，一些古代神話中也有人起源於動物的說法，像是西藏一些地區的神話傳說中，就有獼猴逐漸變成人類、人類起源自獼猴的說法；然而達爾文關於物種演化的理論是現代演化思想的基礎。
胚種論
引導性泛種論，又稱意導泛種論（），是由諾貝爾獎得主弗朗西斯·克里克與萊斯里·歐戈（）共同提出。其內容是說在宇宙中所散播生命並非自然隨機發生，而是由先進的外星文明刻意所為。之後，生物學家認為RNA世界學說就說明了生命的起源，然而克里克卻認為生命不太可能源自地球。
朱利安·斯图尔德
朱利安·海恩斯·斯图尔德（Julian Haynes Steward，），美国人类学家，文化生态学理论与方法的创造者，文化变迁科学理论的创始人。在人类学界关于文化进化论的长期争论中，他以其多线进化论独树一帜，因此被视为新一代进化论的支持者，其影响也相当大。
演化
達爾文指出，人類是生物進化過程中的偶然產物，是大自然的產物。今天的一切生物都是人類的親屬，人類與其他生物特別是與類人猿並無本質的區別，我們認為人類特有的屬性——例如智力、道德等精神因素——都可在其他動物中找到雛形，也必定有其自然的起源。演化論推翻了人類自以為與眾不同的地位。人類和猿猴分享同一個祖先，這在當時的時空背景是很多人難以接受的。對於信奉基督教的人士而言，這一點更與聖經的創世故事有衝突。 演化論與字面解讀的《聖經．創世記》相衝突。演化論也導致一些以宗教觀點解讀演化論的理論出現。例如天主教，將其信仰與演化論調和為神導演化論。而除了傳統的創造論之外，也有一種稱為智慧設計的理論出現，是認為生物的出現必定受到某種智慧體的安排。
演化
自然選擇理論是一个關鍵理念把不變類型學或生物類型的概念打破，這是達爾文部分受到馬爾薩斯的《人口論》影響而建立的理論，達爾文指出，人口增長會導致「生存鬥爭」，有利的變化佔了上風，其他的則死去。每代中，很多子女因有限的資源而在達至生殖年齡前無法生存，這可以解釋共同祖先透过自然法則以同樣方式對待所有有機體演化而來的植物和動物的多樣性。從1838年起，達爾文逐步建立了他的「自然選擇」理論，在1858年，當華萊士給他發了一封理論幾乎相同的的信時，他正在編寫關於這个議題的「著作」。他們倆的共同論文「」在1858年的倫敦林奈學會上發表。在1859年年底，達爾文關於其「理論」的出版物《物種起源》詳細解釋自然選擇及其機制，造成日後漸為人接受的進化概念。托马斯·亨利·赫胥黎把達爾文的思想應用至人類，並利用古生物學和比較解剖學，去證明人類和類人猿有著共同的祖先。有些人對這種思想感到不安，因為它暗示人類在宇宙中並沒有特殊的地位。
哈麗
哈麗（Harriet）是一頭大加拉帕戈斯象龜，相傳是由英國進化論始創人達爾文於1835年在南太平洋加拉帕戈斯群島（Galápagos Islands）捕獲，最初住在英國，隨後被送到澳洲「布里斯班城市植物公園」，生命中最後的17年再遷往「澳洲動物園」，成為園內的明星。2006年6月23日牠因心臟衰竭病逝，估計享年約175歲，是世界已知第三长寿乌龟，次于约188岁的马利拉和约255岁的阿德维塔。
沃特·吉爾伯特
吉尔伯特率先提出内含子（intron）和外显子（exon）的存在，并且于1978年在自然 (期刊)发表开创性的“新闻与观点”论文里解释了内含子的进化。此外，他也創造了外顯子（exon）與內含子（intron）兩個名詞，來區分mRNA分子中的兩個部分。1986年，吉爾伯特提出生命起源的RNA世界学说，基于1967年的卡爾·沃斯首先提出觀念。
人類學史
早期的人类学家通常被称之为“单线进化论者”。他们坚信所有的文化基本上都沿着单一的发展线路以及同样的阶段在演变，即从野蛮到文明。德国的巴斯蒂安提出“心理一致说”，认为人类追求进步的心智和本质是一致的。面对当时不同的文明，摩尔根提出出社会进化大纲：蒙昧时代、野蛮时代、文明时代，认为社会文化进步的路线与阶段一致。同时在对亲属称谓的研究当中，归纳出“分类式”与“说明式”两种。古典进化论的人类学家相信人类和世界都是遵从自然、外在和既定的进步规律，从简单到复杂，从低级到高级，从同质不整合（机械团结）到异质整合（有机团结）的方向发展。他们认为每一种亲属称谓制度或形式，都是某种婚姻和家庭形式的反映。于是乎产生了家庭进化的观点：血亲家庭、伙婚制家庭、偶婚制家庭、父权制家庭、专偶制家庭。进化论者相信人类心理一致，并且愿意承认白人与非白人在基本能力上的平等，但他们却不愿意接受两者在文化上平等的观念，认为某些文化确实优于其他文化。
演化的證據
此條目為生物演化的論證。查尔斯·达尔文在生物學家中第一個科學地論證了生物的演化，並匯集了系統分類學、生物地理學、比較解剖學、比較胚胎學、古生物學等領域的證據，說明如果生物是由共同祖先演化而來的話，那麼這些領域的種種現象就有了合理的解釋。
演化伦理学
大卫·休谟首先提出了所谓的“是-应该问题”，即认为单从“是”的陈述中无法推出“应该”的命题。这一问题的本质是伦理系统是否可以论证，其重点在于我们"为什么"可以论证，而非"如何"论证。托马斯·亨利·赫胥黎则认为，道德情感可以逐渐形成，但这并不能成为道德的基础。他在上述评论中涉及了休谟的“是-应该问题”和后来由乔治·爱德华·摩尔提出的自然主義謬誤。此外，道德哲学家亨利·希德維克声称，鉴于演化论不能论证伦理学，它本质上与伦理学并没有什么关系。随后，英国哲学家摩尔在其《哲学原理》一书中证明了所有自然主义伦理学的学说（包括演化伦理学）均有缺陷。他首次指出，即使演化是一种进步，也不能由此得出更高级的有机体在所有方面都更高级的结论。因此，不可能由演化论证立某一特定的道德判断。另外，像“只因为演化的方向是进化的，我们应该朝这一方向前进”之类的论断是站不住脚的，因为它属于自然主义谬误，即以其他事物定义“善”这一概念的谬误。
法蘭茲·鮑亞士
基於这項理由，某些人主张鮑亞士派人类学与达尔文的演化論相衝突。这個论點是沒有根据的，且错误地设想人们經常使用“演化”一词來指称同一事物。实际上，鮑亞士支持达尔文的理论，尽管他並不认为它可以自然而然地適用於文化和历史现象。鮑亞士學派所嘲笑與拒斥的是当时盛行的直生论。直生論是一个确定的或目的論的演化过程，在这个过程中变異是向前推進的，而與自然选择無關。鮑亚士拒斥这套由爱德华·伯内特·泰勒、路易斯·亨利·摩爾根以及赫伯特·斯宾塞所发展的盛極一時的社會文化進化論，并不是因为他反对“演化”概念本身，而是他赞同达尔文的演化观而反对直生論的演化观。
歐洲中心主義
1859年达尔文发表《物种起源》，告诉人们自然界的生物都是优胜劣汰, 适者生存的, 并从科学上为这种演进提出了证明。斯宾塞则可以进一步提出物竞天择，适者生存的规律了。黑格尔从逻辑上、马克思从社会历史上也提出了人类演进的普遍规律，而欧洲正在这个演进的至高点上。
查尔斯·达尔文
目前達爾文的演化論已經獲得壓倒性的事實做支持，也是唯一能滿足各領域中所觀察到的現象的理論，作為物種起源和人類起源解釋的科學性，也成了學界共識；然而作為現代演化論開山鼻祖的達爾文，經常受到反對演化論的團體及宗教人士的攻擊。
文化演化
現代意義的文化演化是由唐納德·T·坎貝爾（Donald T Campbell）奠基。他在 1960 年指出賴特的生物演化概念可以文化的演變作類比，創意可以經由「無目標的變異加上選擇性的保留」而演化。之後他在 1965 年發展成完整的學說。在他心目中，文化演化並不是奠基自生物演化的類比，而是源自更基本的一套「類目的論」（quasi-teleological）機制，生物演化和文化演化都只是其中的特例。
演化生物学
在達爾文的時代，有些研究自然歷史的人開始質疑物種並非永恆不變的。法國生物學家拉馬克在1809年發表了《動物哲學》一書，系統地闡述了他的進化理論，即通常所稱的拉馬克學說。書中提出了用進廢退與獲得性遺傳兩個法則，並認為這既是生物產生變異的原因，又是適應環境的過程。但长久以来沒有科學證據可以證明「用進廢退」和「獲得性特徵可遺傳」的假說，然而近来有研究表明，过往的生存经历会一定程度上改变修饰遗传基因，从而影响后代的神经系统。 1831年12月達爾文參加了海軍艦艇小獵犬號前往南美洲從事自然調查研究工作，「天擇」的概念逐漸在達爾文五年的考察過程中形成。在他的航行中，達爾文觀察和收集了大量的生物，在南美沿岸和鄰近的加拉帕戈斯群島的各種形式的生命使達爾文非常感興趣。在1836年回到英國後，達爾文慢慢將他的看法寫成文章，然而沒有發表，原因之一就是擔心引起教會勢力的強烈反彈。1858年，達爾文接到在馬來群島調查的博物學者華萊士有關物種形成的文章；華萊士對於物種形成的看法與他有很多相似之處，增加了達爾文對其學說的信心。於是兩人在1858年的倫敦林奈學會中，以兩人共同署名的方式，發表有關物種形成的看法。接著達爾文在1859年發表了《物種起源》。
演化思想史
达尔文理论的成功深深地影响了科学界对于生命的理解，同时也激起了一场小规模的哲学革命。然而，此理论仍然不能解释一些演化过程中的重要组成部分。尤其无法解释同一物种内的差别以及无法解释是物种是以何种机制把这种差别传播到下一代（也就是遗传机制）。达尔文的泛生论的假设也仅仅对演化的统计模型，例如「生物计量学」学派的有一些用处，对于其他生物学家而言几乎毫无意义。
原子
原子论（英语：Atomism，来自古希腊语ἄτομον，atomos，含义为“不可分割”）是在一些古代传统中发展出的一种自然哲学。原子论者将自然世界理论化为由两基本部分所构成：不可分割的原子和空无的虚空（void）。原子论的创始人是古希腊人留基伯，他是德谟克利特的老师。古代学者在论及原子论时,通常是把他们俩人的学说混在一起的。留基伯的学说由他的学生德谟克利特发展和完善，因此德谟克利特被公认为原子论的主要代表。
特爾納特
1858年，阿尔弗雷德·拉塞尔·华莱士在特尔纳特写下了他关于进化论的论文，并将之递予查尔斯·达尔文。华莱士在1858年之前还没有发表一篇关于进化论的文章，他也没有打算将这篇《特尔纳特论文》交予达尔文出版。结果达尔文立刻决定出版自己的专著，并且在书中安排有《特尔纳特论文》，最终书籍于1858年7月1日在倫敦林奈學會发表。
恩斯特·海克尔
海克尔比较知名的文章主要是他的科普、嘲讽文章或者他的游记，但他的学术文章今天依然可以提供新的启发。比如他1866年的《形态学大纲》是世界上第一部达尔文的进化论的教科书，在他的1874年的《人类学》中他使用比较解剖学的方法来探讨人从动物世界的进化和人的来源。他的三卷长的《系统发生学》至今很少有人读，这是一部从1894年到1896年发表的巨著，其中海克尔描述了他对整个动物世界的进化和亲属关系的认识。
纳撒尼尔·索斯盖特·沙勒
在早期职业生涯中，沙勒是一位神创论和反达尔文主义者。这主要出于对曾在哈佛帮助過他，卓越而又有些保守的阿加西的尊重。当他在哈佛大学的地位稳固后，沙勒逐渐在原则上接受了达尔文主义，但仍通过“新拉马克主义”(neo-Lamarckian)的视角来看待它。沙勒夸大了查尔斯·达尔文研究的蚯蚓成土作用对其他动物，如蚂蚁的重要性。同当时许多其他进化论者一样，沙勒将自然选择基本原则-机遇、偶然性和应变性结合在一起，形成一顺序、目的和进程图，其特点是認为进化是生物个体的努力，通过遗传而形成的。
天主教與演化論
《物種起源》是在1859年發表的，當時的教宗庇護九世，也在1869年至1870年召開第一次梵蒂岡大公會議。會議中提及信仰与理性不應衝突，雖未針對演化論，但也堅持了神造萬物的立場。
物种
拉马克最大的貢獻在於提出不同物種之間可以有連續不斷的系谱。他在1809年的著作《动物学哲学》（"Zoological Philosophy"）是首個以邏輯理由否定創造論。當達爾文的進化論在1860年代被廣為接受後，卻掩蓋了拉马克的貢獻。及至二十世紀末，拉马克的理論重新獲得重視，成為适应突变的一個基礎。他另一曾被捨棄的目標為本進化論，亦發展成人工选择。 現代的分類學主要以遺傳序列為基礎。
恩斯特·海克尔
恩斯特·海因里希·菲利普·奥古斯特·海克尔（，）生于波茨坦卒于耶拿，德国生物学家、博物学家、哲学家、艺术家，同时也是医生、教授。海克尔将查尔斯·罗伯特·达尔文的進化論引入德国并在此基础上继续完善了人类的进化论理论。
科学革命
達爾文在19世紀發現人類本身的進化規律，其學說雖然在後來研究的基礎上得到了詳細的修改，但其要點實際上已為當時所有科學家所接受。但是在某些領域，特別是在教士中間，存在著激烈的反對意見。達爾文主義廢黜了人類在地球歷史上的中心地位。後來，達爾文的學說被應用到社會舞台上，被稱作社會達爾文主義。十六至十九世纪时的科学思想和科学家包括：
喬治·蓋洛德·辛普森
喬治·蓋洛德·辛普森（英语：，）是一位美國古生物學家。他的專長為以滅絕的哺乳類，與牠們在大陸之間的遷徙。同時他也是現代綜合理論的奠基者之一。在演化領域的主要著作包括《进化的速度和样式》（）與论文《分類規則與哺乳類分類》（）等。辛普森對演化論中的疾變平衡（）概念的建構也有所參與。
人
目前學界的共識認為，人類及所有的動物都是演化而來的，而目前已有壓倒性的證據，支持演化的真實性。人类起源是查尔斯·达尔文提出演化论后，逐渐发展起来的一种理论，目前一般认为，人类起源于类人猿，从灵长类经过漫长的演化过程一步一步发展而来，這項理論主張人類在演化上和現存的猿類最為接近。这一理论得到绝大多数生物學家及考古学家的支持，也有壓倒性的事實證據做支持，是现今科学界的主流理论。
現代主義
現代主義以科學為基礎，重視理性與邏輯，實驗探証。達爾文的進化論打破了人類特異於其他動物的觀點。弗洛伊德對自我的研究也為現代主義奠定了重要的理论基礎。
罗伯特·菲茨罗伊
1831年12月，小猎犬号再次出发，1836年10月返航。舰上配备的博物学家就是后来创立进化论的查尔斯·达尔文。脾气暴躁的菲茨罗伊与达尔文时有冲突，但仍支持后者考察安第斯山脉和加拉帕戈斯群岛。此后三年菲茨罗伊忙于整理4卷调查报告，其中第3卷由达尔文执笔，即是《小猎犬号航海记》。
爱德华·艾威林
爱德华·艾威林（；）是英国一名杰出的生物学讲师，也是达尔文进化论、社会主义、无神论的宣扬者。他是和独立工党的创始人之一。
泛生論
泛生論（）是由進化論之父，達爾文所提出的另一種由父母遺傳至兒女的方法。跟進化論截然不同的是，進化論是由基因經過多代的筛选而繁衍出來的。泛生論卻是直接由動植物的父母透過身體細胞所分泌出來的一種為gemmules的細胞而直接對兒女造成影響。達爾文試圖以此論點來解釋為何動植物的上一代和下一代會有除了基因方面以外的類似習性，例如習慣，脾氣，身形等。但是後來以科學實驗證明此觀點是錯誤的。因為部分的動物，天性並不單單是與生俱來的，部分可以是後天習得的。
演化
同期的其他博物學家根據自然規律，推斷出物種会隨時間演變。1751年，皮埃爾·莫佩爾蒂寫道透过繁殖和多代累積的自然變更，会產生新的物種。喬治-路易·勒克萊爾，布豐伯爵認為物種可以蛻化成不同的生物，伊拉斯謨斯·達爾文則提出所有恆溫動物可能是單一微生物的後裔。1809年，拉马克提出第一個全面的進化機制，其猜想自然發生在具有固定的漸進趨勢的平行世系中不斷地把簡單的生命變為更複雜的生命，並推測在局部的層面，下一代会通過遺傳他們父母用進廢退的器官以適應環境。（後一方法後來被稱為拉馬克主義。）這些想法受博物學家譴責，因為這些推測缺乏實證支持。尤其喬治·居維葉堅持認為種是不相關的並不變，它們的相似只是反映了上帝為了其功能需求的設計。英國牧師威廉·佩利把林奈的思想在《》中進一步發展，其中提出複雜的適應度是上帝所設計，這亦是查爾斯·達爾文推崇的證據。
人類起源論
人類起源的論點，在演化論發表以前人們多數認同自然發生論或創造論，而目前主流學界的看法認為，人類及所有的動物都是演化而來的。創造論及自然發生論則為一部分宗教或民間其他人士所相信。
理查德·道金斯
理查德·道金斯是当代最著名的无神论者之一，他崇尚科学与理智并批评世界上所有的宗教都是人类制造的骗局。他引用哲学家罗素的比喻，认为信仰上帝就如同相信有一把茶壶在绕火星飞行，虽然我们不能证明上帝和茶壶并不存在，但是他们存在的几率却是微乎其微。而对于“智能设计”的创建者声称其为科学，道金斯表明没有证据显示上帝的存在。达尔文的演化论是至今为止唯一能够解释物种起源的科学理论，创世论与智能设计并不是科学，因为他们缺乏证据；说上帝创造了万物并不能解决任何问题，因为我们无法解释上帝的存在。
演化思想史
科學式的演化論述則一直要到18世紀與19世紀才出現，例如蒙博杜（Lord Monboddo）與伊拉斯謨斯·達爾文（達爾文的祖父），提出所有生命源自共同祖先的想法。而第一個科學假說是由拉馬克在1809年所提出，他認為演化是來自後天獲得特徵的遺傳。拉馬克學說在提出後將近50年，才被達爾文與華萊士較接近現代觀念的理論所取代。其中達爾文做了較多細節上的討論，例如1859年出版的《物種源起》。達爾文強調生物的演化為事實，並以天擇機制作為解釋演化現象的理論。
演化
關於宏觀演化的過程，有許多不同的理論，主要是用來解釋化石紀錄中難以解釋的現象。傳統的觀念認為，許多微觀演化的累積，經歷足夠時間之後便形成新物種，這樣的理論稱為漸變論。而漸變論又有許多形式，例如由史蒂芬·古爾德與尼爾斯·艾崔奇在1972年提出的疾變平衡論。這種理論認為生物的演化歷史是許多走走停停的過程，在大多數時間並沒有太大的變化。而某些個體中存在關鍵基因（如同源异形盒），可能導致新物種迅速形成並大量繁殖，之後再恢復平衡。如此便能夠合理的解釋化石紀錄不平均的問題。其實古爾德經常以批判漸變論的姿態出現在大眾媒體，但是道金斯認為，疾變平衡論只是漸變論的一種形式。而極端的漸變論，認為演化過程是以等速進行，對於化石數量的不平均，則以「化石紀錄本身並不完整」來解釋。極端的漸變論，仍然經常使用在分子層次，並發展出分子時鐘的觀念。但是近年的研究發現，分子時鐘也並非等速進行，而是在不同物種或是不同年代具有不同的演化速度。且不同的研究中，對分子演化速率的推算差異相當大。
年轻地球创造论
基督教认为宇宙是上帝创造的，因为基督教在欧洲的影响，因此年轻地球创造论在长时间内是欧洲的主流思想，就包括多位被认为是现代科学奠基人的大家，比如哥白尼、开普勒、法拉第、伽利略、牛顿、麦克斯韦、帕斯卡和思特诺。直到自然科学的研究方法继续发展之后，科学家開始使用逻辑推理和观察重新思考地球起源的问题。
迈克·彭斯
彭斯是虔誠的基督新教福音派信徒以及堅定的創造論者，他曾在採訪中表示不相信進化論，並表示認為上帝創造了人類。
社會文化進化論
社會文化進化論（），有時又稱文化進化論、社會進化論，是十九世紀人類學和社會學的主流學說，由赫伯特·史賓賽建立，認為人類社會由固定的方式從「原始」發展到「進步」，並且世界各地的不同人種和社會分別發展到不同的階段，歐洲人最進步，遊獵採集部落最原始。路易斯·亨利·摩爾根進一步將社會進步和科技進步結合，認為科技、家庭結構、資產、社會結構、政治體制、和知識進展都是彼此相連的。
天演論
《天演論》原名《演化论与伦理学》，是嚴復翻譯自英国生物学家-{zh-hant:湯瑪斯·亨利·赫胥黎; zh-hans:托马斯·亨利·赫胥黎}-名為的演講與論文集，此書阐发了达尔文《物种起源》一書中關於生物进化的理论。
恩斯特·海克尔
海克尔的理论对进化论的历史非常重要。海克尔也是提出生态学这个概念的人。尤其他在解剖学上的知识给进化论提供了很多新的观点。他还描述了上百新的物种。此外他引入了使用演化树来描写生物学中的进化关系的表示方式。不过今天这样的演化树已经被认为是过时和不准确的。他提出了所有生物是从共同的祖先发展出来的设想。他推测这些祖先可能分三个组。大多数他的理论今天已经过时了。
约翰·梅纳德·史密斯
约翰·梅纳德·史密斯（，）是一位英国理论和数学进化生物学家和遗传学家，被誉为“进化博弈理论之父”。
吴新智
吴新智以对人类单地起源说的批评闻名。他于1984年与、一起提出了多地区进化说，并于1998年提出“连续进化附带杂交”理论以描述中国人类的起源。开创并推动中国的灵长类解剖学和法医人类学研究。
宗教与科学
科学的事实和观点的公众接受程度可能会受到宗教的影响；在美国有许多反对进化论（特别是关于人类）的人。一項2009年由皮尤研究中心做的調查顯示，「幾乎所有的科學家（97%）都認為，人類和其他的動物是透過演化而變成現在的樣子的，87%的科學家認為，這過程是自然發生的，包含了諸如天擇等的過程；然而科學界的主流觀點，也就是生物是透過天擇等過程演化來的這點，並非一般大眾普遍的看法，只有大約三分之一（32%）的民眾相信演化論。」然而美国国家科学院写了这么一句话："the evidence for evolution can be fully compatible with religious faith,（进化的证据可以与宗教信仰完全相容）"这个观点得到全球许多宗教教派的正式认可。
树模型
在海克尔提醒施莱谢尔之前，施莱谢尔甚至没听说过达尔文。他在1853年的一篇文章中发表了自己Stammbaum的想法，这比第一版《物种起源》早了6年。语言起源的概念绝不是新的。托马斯·杰斐逊本人是位虔诚的语言学家，他提出新词的持续需要意味着语言必须“进步”并“演化”。这些想法预示着生物或语言的进化，在施莱谢尔与达尔文的思想接触后，进化论被引入了语言变迁的研究，这种演化思想成为后世语言分类的依据。
重复独立发现发明列表
重复独立发现发明最常见的例子是微积分、氧气和进化论的发现及发明。微积分于17世纪由牛顿、莱布尼茨等人各自独立发明；氧气于18世纪由舍勒、普里斯特里、拉瓦锡各自独立发现；进化论则是于19世纪，由达尔文和华莱士分别独立提出。
分类阶元
分类阶元在18世纪由瑞典生物学家卡尔·林奈（Carl Linnaeus，1707～1778）所创立，他提出了纲、目、属、种四个阶元，其他各阶元由后世学者补充完善。由于林奈为分类阶元的奠基者，因此使用分类阶元对生物进行分类的方法被称作林奈分类法（Linnaean taxonomy），同时分类阶元也被表述为林奈氏分类系统、林奈套叠等级体系等。长期以来，现代生物分类法在实质上为林奈分类法，但随着系统发生学的日趋成熟，此法在表达物种演化脉络上暴露出一定局限性：当越来越多世代相承的演替类群被确立时，分类阶元因其有限的数量和人为预设的层级体系，无法一一适配，从而出现低等阶元包含高等阶元，或不同等级的阶元成为姊妹群等混乱现象。20世纪后半叶以来，基于演化支来归类物种的系统分类法极大地挑战了林奈分类法的传统地位，以至有学者提出全面废除人为假定的分类阶元，由演化支的概念取而代之，但分类阶元这一经典分类概念因为数个世纪以来的普遍使用已经深入人心，废除主张终究未能实行。
地质学史
1812年，法国生物学家居维叶根据对巴黎盆地的第三纪地层古脊椎动物化石的研究，提出了灾变论，认为古生物的突变现象是巨大灾变的结果。这种观点受到同时代的拉马克的反对。拉马克于1809年在其发表的《动物哲学》（Philosophie zoologique，亦译作《动物学哲学》）中首先提出“获得性遗传”(Inheritance of acquired traits)和“用进废退说”(use and disuse)，认为这既是生物产生变异的原因，又是适应环境的过程。
喬治·居維葉
拉马克反驳了这一结论，认为生物进化在短短幾千年之间难以发生足以观察到的变化。然而居维叶反过来批评拉马克和其他博物学家为了维护理论而贪图方便，“大笔一挥”就得出几百万年的结论。他表示，人们只能以积少成多的方式观察生物短时间的演变，从而推测长期变化。既然短时间内生物不发生任何变化，无论过多久物种都不会演化。此外，他认同生物器官相伴原理，所以断定生物任何部分都不能单独地发生演化，哪怕这种演化并不会使该种生物无法生存。在《赞美拉马克》（"Éloge de M. de Lamarck"）中，居维叶如是评论拉马克的进化论： 他发现典型生物种总是在化石地层中突然出现，在灭绝前都不会有大的变化。为了解释这种古生物学现象，居维叶提出了设想（在一个世纪后被解释为间断平衡理论），并与《圣经》相协调。居维叶提出地球每隔一段时间（时间长度不固定）就会发生一次重大灾难，而最后一次灾难在《创世记》中被记载下来。
遗传漂变
遗传漂变的概念由种群遗传学的奠基人之一休厄尔·赖特在20世纪30年代首次提出。日本科学家木村资生于50年代起，进一步将漂变理论发展完善，并以此为基础提出了中性进化理论。进化生物学界曾对遗传漂变在进化中的作用进行过多次激烈的讨论。20世纪后半叶以来，随着现代进化综论的确立，遗传漂变的重要性逐渐得到了普遍认同。
列夫·贝尔格
列夫·贝尔格（, ），俄罗斯与前苏联地理学家、生物学家和鱼类学家，在1940年至1950年期间担任苏联地理学会主席。他提出了与达尔文和拉马克理论相异的自己的进化理论，即"直向演化论"（融合突变的正交生成的一种形式）。
勒内·托姆
勒内·托姆（，，法語發音），法国数学家，突变论的创始人，於1958年获菲尔兹奖。
演化論的社會影響
中國人傳統上認為天人合一，包括人在內的萬物都是從原始狀態逐步發展來的，具有一定程度樸素的生物轉化、變化、進化思想（與現代進化論有區別，但在那個時代仍不失為一種創見），如《莊子》中《寓言》和《至樂》篇章中談到不同生物的轉化，而且，中國傳統故事中有不少動物通過修煉變成人的故事。西藏一些地區的神話傳說中，就有獼猴逐漸變成人類、人類起源自獼猴的說法。因此，中國人比西方人更容易接受進化論，且許多人認為進化論與中國傳統並無衝突。 日本人則認為進化論與神道教沒有衝突，日本本土的神道教认为大自然本身就具备神格，世上的一切都是神创神造，自然会有一个从低到高的发展进化过程，人的先祖和猿的先祖都来自于神代的神祇，从这一观点出发，接受“人猿同祖”的生物进化理论就可以心安理得了。
创化论
《创造进化论》（Evolution créatrice），法国哲学家亨利·柏格森在1907年發表的哲学著作。柏格森强调创造与进化并不相斥，因为宇宙是一个“生命冲力”（"élan vital"）在运作，一切都是有活力的。本书流行于20世纪早期，現代演化綜論出现以前。
不可知论
1879年，当达尔文撰写他的自传的时候，收到一封来信，询问他，是否有神论和演化论相容，他是否相信神。他回复说“可能会是个热心的有神论者和演化论者”，例如以金斯利（Charles Kingsley）和亞薩格雷（Asa Gray）引证为例，对达尔文自己来说，他「永远不是一个否认神存在的意义上的无神论者」。他还附加说“我觉得一般来说（随着我的年龄增长）但不总是，‘不可知论者’对我的想法是一个更加正确地描述”。
胚種論
已知這個假說最早始於西元前5世紀的希臘哲學家阿那克薩哥拉。到了19世紀，這個假說再一次引起永斯·貝采利烏斯、開爾文、赫爾曼·馮·亥姆霍兹和斯凡特·奥古斯特·阿倫尼烏斯 等科學家們的注意。儘管現在並沒有足夠的證據能支持泛種論的假說，而且不太可能有生物能在宇宙中移動並生存下來，弗雷德·霍伊爾爵士與錢德拉·魏克拉馬辛格（）仍是這個假說的重要擁護者，並認為直到現在，仍有生命以泛種論的方式進入地球，除了引發新的傳染病與災難，更是宏觀演化所不可缺少的因子。
演化生物学
拉馬克的用進廢退說雖然被德國的科學家魏斯曼的實驗否證，但近年來有新的證據顯示有些表觀遺傳學特徵可以不透過基因遺傳，也就是說有些後天獲得的性狀可以遺傳給下一代。除此之外，包括雙重遺傳理論、文化演化和棲位建構等理論也認為會遺傳並發生演化的是只有基因。 有很多生物学家对演化生物学的发展做出了贡献。而直到群体遗传学和现代演化综论的发展建立以后，演化生物学才成为一门专门的学科。费奥多西·多布然斯基和E·B·福特对建立起了演化生物学的实证研究模式起了主要作用。恩斯特·瓦尔特·迈尔、喬治·蓋洛德·辛普森和G·L·斯特宾斯也分别是系统分类学，古生物学和植物学领域的综合演化论的重要奠基者。James Crow， Richard Lewontin， Dan Hartl， Marcus Feldman和Brian Charlesworth 培养了大量的演化生物学家。
麦塞尔达尔文猴
麦塞尔达尔文猴（学名："Darwinius masillae"），是生活于始新世的灵长类动物的祖先。为纪念进化论的创立者达尔文，科学家将其命名为麦塞尔达尔文猴。麦塞尔达尔文猴被视为人类进化史上曾经缺失的环节，它的发现有重要的科学意义。  至今世界上已发现的达尔文猴化石只有一块，名为IDA。 她最初于1983年在德国麦塞尔化石坑出土，当时化石坑已经对外关闭，以做垃圾填满场的准备，化石之后被一个德国私人收藏家收藏。 在保存了20年后，此私人收藏家欲将其出售。最初联络的两家德国博物馆都以价钱太过昂贵而拒绝收购。之后这位德国收藏家联络到了挪威的乔恩·胡鲁姆(Jørn Hurum)，并出示了彩色高清晰的化石照片。乔恩·胡鲁姆马上意识到这是称为missing link的重要化石。尽管德国收藏家当时的开价要一百万美元之多，乔恩·胡鲁姆还是表示了收购意愿。他马上返回挪威筹款。乔恩·胡鲁姆首先联络的是自己就职的奥斯陆自然历史博物馆，但是博物馆没有此经济能力。之后乔恩·胡鲁姆开始联络有赞助商的博物馆，最后奥斯陆博物馆保证提供收购资金。乔恩·胡鲁姆联络德国收藏家，先支付一半的费用，X-光检验后再付余额。 最后化石的成交价为75万美元。
现代演化综论
生物學家保羅·扎卡里·邁爾斯強調現今擁目前已有大量書籍和研究，例如PubMed數據庫中大約有 150,000 篇關放進演化論的初級研究文章以及說明絕大多數生物學家支持進化並利用NCSE中反對科學神創的科學協會的聲明反駁安·庫爾特認為進化論沒有任何證據支持的言論。 美國國家科學教師協會認為進化是一個主要的統一科學概念。一項在1991年所作的蓋洛普民調顯示，有大約55%的科學家（包括生物學領域以外的其他科學家）相信自然進化，上帝並沒有參與其中，調查結果亦顯示至少有40%的科學家相信神導演化論 。美國臨床研究學會出版的《JCI：臨床研究雜誌》中的《捍衛科學教育對抗智能設計：行動號召》指出政治凌駕了科學教育，必須讓科學教育回到科學即進化論的本身，並認為神創論是偽科學且與進化論是對立的。 而在世界上最早的科學期刊之一《自然》中，有22位生物學家質疑進化論的真實性，並指出:「我們沒有關於進化論的絕對證據，我們只有支持它的壓倒性的旁證，同時，目前還沒有更好的選擇。 但是，如果現在有一個更好的理論出現，進化論明天就會被拋棄。」
演化的證據
然而達爾文也曾提出造物主的觀念，他曾經研讀神學，逝世時也葬於西敏寺（威斯敏斯特教堂）墓地。在其原著中，達爾文曾這樣寫著：「在我看來，所有過去和現在、在世界上生存過的生物，他們的產生和滅亡，是由於間接的原因。這樣的說法，更符合於我們所知道的造物主制定的有關生物方面的規律。」在該書的結論中，達爾文也這樣寫說：「造物主最初賦與生命於一個或數個形體，然後不斷地由這簡單的形體開始演化，而成為無數極為美麗奇異的形體；這種對生命來源的解釋是奇妙偉大的。」（引自輔仁神學著作編譯會編，《神學辭典》，台北：光啟出版社，1996年，頁721。）換句話說，達爾文對物種起源的解釋，跟他對造物主的信仰不但沒有衝突，甚至是要說明創造主上帝的智慧。
演化生物学
中性理論全稱為分子演化的中性理論。是日本遺傳學家木村資生所提出。這個理論認為在分子遺傳學的層次上，基因的變化大多數是中性突變。由於中性突變對生物個體既沒有好處也沒有壞處，因此並不受自然選擇影響。現今的演化生物學家認為，自然選擇理論與中性理論是能夠並立且互補。
基因
遗传学的奠基人奥地利人孟德尔，在布尔诺（今属捷克）的奥古斯丁教派修道院的後院里工作8年，於1865年2月的奥地利自然科学学会会议上报告了自己進行的植物杂交研究结果，第二年在奥地利自然科学学会年刊上发表了著名的《植物杂交试验》论文，闡述了遗传学的两項基本规律——基因的分离定律和基因的自由组合定律。文中指出，生物的所有性状都是通过遗传因子来传递的，遗传因子是一些独立的遗传单位。此理論把可观察的遗传性状和控制它的内在的遗传因子区分开来，遗传因子於是作为基因的雏形名词诞生了。基因的存在最早是由他在19世纪推論出来的，而不具有分子生物學的觀察基礎。在达尔文发表进化论后不久，孟德爾试图通过对豌豆进行试验来解释该理论。但是直到19世纪末他的研究才被人们所重视。虽然孟德尔还不知道遺傳因子是以怎样的方式存在，也不了解它的结构，但確實为现代基因概念的产生奠定了基础。
創造論
在人们探讨创造进化争议时，常常会用过于简单的二分法进行分类，为了消除这一误解，1999年，的使用一张图表描述了一系列連續的、在大众中有关创造论的宗教观点——从最极端的圣经直译创造论到另一侧最极端的唯物主义进化论，她的频谱和研究成果随后在大众的讨论中被广泛使用，后又发表在了该年的《国家科学教育中心报告》中。随后又有其他学者提出了其他的分类和比较方式。2009年，斯科特检视并修正了她的研究成果，并认为智能设计论与其他几种创造论有重叠，并认为每一种创造论都是代表着一种信仰和立场。修改后的图表额外增加了各派对地球的年齡的观点，并细化了各派对进化的看法。修改后的图表被最先发表于《进化对创造论：一份导论》，之后国家科学教育中心基于书中修改后的图表重写了官方网站中的内容。
生物学史
让-巴普蒂斯特·拉马克的理论是达尔文之前最重要的演化论，他的理论基於（这一遗传机制在20世纪前被广泛接受），这一理论描述了从最低级生物向人类发展的链条。英国博物学家查尔斯·达尔文将洪堡的生物地理学方法、莱尔的均变论地质学方法、托马斯·罗伯特·马尔萨斯关於人口增长的著作以及他自己的形态学专长相结合，创造出了更成功的基於自然选择的演化论。类似的证据使阿弗雷德·羅素·華萊士独立得出了相同的结论。
阿尔文·普兰丁格
普兰丁格用一种更严格形式的模态逻辑发展了Norman Malcolm和Hartshorne上帝存在的本体论证明。 在他的反自然主义的进化论论证中，普兰丁格声称进化论是自然主义的一个认识论上的否决因子（例如，如果进化论是正确的，它就会损害自然主义）。他的论证如下：如果进化论和自然主义都为真，人类的认识能力通过进化产生有生存价值的信念（在获得食物、争斗和繁衍上取得最大的成功），而不是必然产生正确的信念。所以，在这种自然-进化的模式中，既然人类的认识能力只是为适应生存而演进，而非为产生真理而演进，那么，这种认识能力的成果（包括自然主义和进化论）的真实性就值得怀疑了。换一种角度，如果是上帝根据自己形象用进化的手段（或者其他手段）创造人类，那么这种认识功能就更显得可靠了。
人類演化
「多地起源模型」是一種「解釋人類演化的模型」，由沃波夫（Milford H. Wolpoff）於1988年提出。多區域演化的觀點主張，人類演化是從距今250萬年前的更新世開始，直到現在，一直維持著單一的、連續的人類物種，在世界各地演化成為現代智人。依據多區域假設，化石及基因體資料是說明全球性人類演化的證據，這與最近由晚近非洲起源說所假定的物種形成過程相矛盾。理查德·李奇認為化石證據並不充足，無法解決這個爭論。 對於Y染色體及粒線體DNA的單倍群研究已大大支持一個晚近的非洲起源。來自常染色體DNA的證據也支持晚近非洲起源的可能性。然而，某些研究顯示，古智人（Archaic Homo sapiens）的遺傳成分也有可能摻雜在當代人類當中。最近關於尼安德塔人與丹尼索瓦人的基因體排序也顯示確實發生某些混雜。在非洲以外的現代人類在其基因體中，有2-4％的尼安德塔人的等位基因，美拉尼西亞人額外具有4-6％的丹尼索瓦人等位基因。這些新的結果並不與《源出非洲》模型相抵觸，但顯示發生了一些額外的混雜事件。可能源自於距今73,000年前的多峇超級火山災難的一個種群瓶頸之後，經過一段復甦時間，一支很小的群體離開非洲，並遇到尼安德塔人，可能是在中東，他們的後代擴散到世界各地，有一小支遇到了丹尼索瓦人，可能是在東南亞，就在他們遷入美拉尼西亞之前。
演化
生殖遺傳和新性狀起源的確切機制仍然是個謎，為此達爾文曾提出他的臨時學說泛生論。1865年，孟德爾遺傳性狀是在可預測的方式，通過元素的自由組合(孟德爾第二法則)和分離遺傳(該元素後來被稱為基因)，孟德爾遺傳定律最終取代大部分達爾文的泛生學說。奧古斯特·魏斯曼提出產生可產生配子的生殖细胞(如精子和卵子細胞)和身體的體細胞之間的重要區別，這表明遺傳只經生殖細胞系發生。许霍·德弗里斯把達爾文的泛生論連接至魏斯曼的發現並提出達爾文的泛生論應集中於細胞核，他表示細胞核可以移動到細胞質去改變細胞結構。德弗里斯也是令孟德爾的研究知名的研究人員之一，認為孟德爾性狀對應於沿種系的遺傳變異傳遞。為了解釋新變種如何起源，德弗里斯制定了一個突變理論，導致與德弗里斯同陣的生物統計學派(Biometricians)及達爾文的進化論出現暫時性裂痕。20世紀30年代，群体遺傳學領域的先驅如羅納德·費雪、生物學家休厄尔·赖特與约翰·伯顿·桑德森·霍尔丹把演化建基於健全的統計學理念上，因此，達爾文的學說、基因突變和孟德尔定律之間的偽矛盾被調和。
人
儘管目前演化論是解釋人類及所有生物起源的主流理論，但在學術界以外的地方，依舊有許多人相信演化論以外的其他解釋。一項2009年由皮尤研究中心做的調查顯示，在美国「幾乎所有的科學家（97%）都認為，人類和其他的動物是透過演化而變成現在的樣子的，87%的科學家認為，這過程是自然發生的，包含了諸如天擇等的過程；然而科學界的主流觀點，也就是生物是透過天擇等過程演化來的這點，並非一般大眾普遍的看法，只有大約三分之一（32%）的民眾相信演化論。」
进化论者党
进化主义共和党（，PRE）也被称为进化论者党，是葡萄牙历史上的的一个政党，由葡萄牙总统领导。 该党成立于1912年2月24日，是葡萄牙共和党内分裂的结果，导致了进化论者党、葡萄牙民主党和共和联盟的诞生。在1915年的议会选举中，该党赢得了26个众议院席位和9个参议院席位，成为仅次于民主党的第二大党派。
人
絕大多數的科學社群和學術團體，都認為演化論是唯一能完全滿足在生物學、古生物學、分子生物學、遺傳學、人類學及其他各領域中所觀察到的現象的理論。一項在1991年所作的蓋洛普民調顯示，只有大約5%的科學家（包括生物學領域以外的其他科學家）認為自己是創造論者。截至目前為止，沒有任何反對演化論且經過科學方面同行審查的論文，名列科學與醫學期刊搜尋引擎PubMed當中；然而和其它由演化理论发展出来的理论一样，「人類和黑猩猩由共同的祖先分化而來」的这一理论同样面对大量来自宗教界的挑战，不过，罗马天主教倒是支持这一理论，詳請見神導演化論。
物种起源
「天擇」的概念逐漸在達爾文的五年環球考察過程中形成。在1836年回到英國後，達爾文慢慢將他的看法寫成文章，然而沒有發表。大部分科學家認為，達爾文遲了很久才發表他的作品，原因之一就是擔心引起教會勢力的強烈反彈。1858年，達爾文接到在馬來群島調查的博物學者華萊士有關物種形成的來信；華萊士對於物種形成的看法與他有很多相似之處（《物种起源》的绪论中提到了这一段过往），一方面达尔文害怕被說是剽竊後輩的想法，另一方面可能别人的支持使他增加了信心，於是兩人在1858年的倫敦林奈學會中，以兩人共同署名的方式，發表有關物種形成的看法。接著達爾文在1859年發表了《物種起源》。
人類學史
在这个时期，人类知识开始突飞猛进的增长，与此同时各式各样的研究组织开始建立，知识探索慢慢地进入到一个专业化的时代。在经济上，殖民贸易的产生使得西方与外界的各种不同的文化交流碰撞。还有一点十分重要的是，达尔文的进化论思想的诞生与传播。在这样的背景下，古典进化论，或称演化论诞生了。而古典进化论的产生是文化人类学作为一门独立学科正式诞生的界碑。该学派活跃于19世纪60至90年代，成熟的标志是泰勒的《原始文化》（1871）和摩尔根的《古代社会》（1877）。
理查德·道金斯
道金斯1976年出版名著《自私的基因》，引起广泛关注。书中阐述了以基因为核心的演化論思想，将一切生物类比为基因的生存机器，并引入了“模因”概念。后来又出版了《延伸的表现型》、《盲眼钟表匠》、《上帝错觉》等书，宣扬演化论，反对神创论。在科学家里，道金斯以其直言不諱的語氣和科學求證的態度挑戰「神創造世界」宗教概念而聞名。他同美国哲学家丹尼尔·丹尼特、神经科学家山姆·哈里斯和英裔美籍作家克里斯托弗·希钦斯同稱“新无神论四骑士”。
創造論
主流新教及天主教會通过神导演化论将现代科学与他们的信仰进行调和，神导演化论认为神通过自然定律创造了世间万物，天主教会和主流新教都接受进化这一科学概念。一些团体把神导演化论称为主义。在和信仰中亦有人是创造论者。“创造论者”一词在进化论与创造论的争论中常追溯至查尔斯·达尔文在《物种起源》一书未发表的草稿中的使用，达尔文在之后与同事的书信中也用到过这个词。亞薩·格雷在1873年发表于《国家》的一篇文章中称有一些“特殊创造论者”持有“物种本身起源于超自然，上帝的力量让物种的起源不能被科学解释”的观点。
树模型
约瑟·哈罗德·格林伯格在1950年左右开始发表的一系列论文中以旧名称赋予了这个旧隐喻一个全新的含义。查尔斯·达尔文首先系统地提出了进化的概念，并获生物学普遍接受。由卡尔·林奈发明的生物分类学使用二名法为每个已知的生物体分配种名和属名，被安排在数个门之下依一定次序形成一定的等级，最终分支到各种物种。这种生物分类的基础是观察到的物种共有的物理特征。
罗伯特·泰弗士
罗伯特·泰弗士（，，），美国进化论学家和社会生物学家，罗格斯大学人类学与生物科学教授。他提出了互惠利他主義（1971年）、亲代投资（1972年）、兼性性別比确定（1973年）和亲子冲突（1974年）等理论。他还从适应性进化策略方面解释了现象（首次描述于1976年）并论述了基因組內部衝突。
演化
生物學家保羅·扎卡里·邁爾斯強調現今擁目前已有大量書籍和研究，例如PubMed數據庫中大約有 150,000 篇關放進演化論的初級研究文章以及說明絕大多數生物學家支持進化並利用NCSE中反對科學神創的科學協會的聲明反駁安·庫爾特認為進化論沒有任何證據支持的言論。 美國國家科學教師協會認為進化是一個主要的統一科學概念。一項在1991年所作的蓋洛普民調顯示，有大約55%的科學家（包括生物學領域以外的其他科學家）相信自然進化，上帝並沒有參與其中，調查結果亦顯示至少有40%的科學家相信神導演化論 。美國臨床研究學會出版的《JCI：臨床研究雜誌》中的《捍衛科學教育對抗智能設計：行動號召》指出政治凌駕了科學教育，必須讓科學教育回到科學即進化論的本身，並認為神創論是偽科學且與進化論是對立的。 而在世界上最早的科學期刊之一《自然》中，有22位生物學家質疑進化論的真實性，並指出:「我們沒有關於進化論的絕對證據，我們只有支持它的壓倒性的旁證，同時，目前還沒有更好的選擇。 但是，如果現在有一個更好的理論出現，進化論明天就會被拋棄。」
莱斯利·怀特
莱斯利·A·怀特（1900年1月19日——1975年3月31日）是美国知名人类学家，文化进化理论、社会-文化进化论以及新进化论的代表人。他对创建密歇根大学人类学系发挥了关键作用。怀特于1964年任美国人类学协会主席。
奥古斯特·施莱谢尔
施莱谢尔是自然主义语言学派的创立者，他重视语言的规律性和客观性，但把语言看成是一个有机体，认为语言也和有机体一样有生长、成熟和衰老期，认为生物学的术语都可以用于语言研究上，如：基因、属、种等。把语言学看成是自然科学，以生物学原则研究语言的发展和分类。他宣称在还没有读过达尔文的名著“物种起源”以前，自己就已经发现了语言的遗传和自然竞争现象。他发明了一种按照植物分类法则对语言的谱系分类方式，并按照生物进化树的方式排列各种语言。他是第一位提出“语言进化”观念的人。他以这种方法推搠古印欧语对历史比较语言学有一定的贡献。是语言谱系树理论的提出者。按新的语法概念来重新审视世界语言并做出的分类：孤立语、粘着语、屈折语。
人
目前學界對演化的科學性，有著強烈的共識，大約97%的科學家都支持演化論；然而在美国堪薩斯州，政府曾要求課本必須教授演化論以外的其他理論，如「智慧設計論」；而在土耳其也曾發生過將演化論從教科書當中刪除的事件。
圣经批评
关于圣经中的上帝造人和宇宙起源，甚至梵蒂冈和教皇对查尔斯·达尔文的进化论的看法也在改变, 教皇现在希望大眾接受进化论和大爆炸理论。 尽管如此，关于进化论的争论可能还在继续。
喬治·居維葉
居维叶提出的“物种一经成型就不再变化”的观点被后来的进化论批评者用来支持创造论，物种出现的突然性似乎与神创论一致。且物种不发生进化的观点与“物种”的神圣不可变性是一致的。然而居维叶的“不同生物种类出现在不同年代的底层中”的这一发现与神创论观点不相合。他支持的“灭绝”的概念显然也没有受到神创论者们的欢迎。
罗伯特·泰弗士
泰弗士是当今最有影响力的进化论学家之一。史迪芬·平克认为泰弗士是“西方思想史上最伟大的思想家之一” ，他说泰弗士
德谟克利特
德谟克利特（希腊语：，前460年—前370年或前356年，）來自古希臘愛琴海北部海岸的自然派哲學家。德謨克利特是經驗的自然科學家和第一個百科全書式的學者。古代唯物思想的重要代表。他是“原子論”的創始者，由原子論入手，他建立了認識論。 他認為每一種事物都是由原子所組成的，整個世界的本質只是原子和虛空。原子不可分割，並不完全一樣。在自然界中，每一件事的發生都有一個自然的原因，這個原因原本即存在於事物的本身。並在哲學、邏輯學、物理、數學、天文、動植物、醫學、心理學、倫理學、教育學、修辭學、軍事、藝術等方面，他都有所建樹。可惜大多數著作都散失了，至今只能看到若干殘篇斷簡，這對理解他的思想造成了一定的困難。
物种起源
達爾文的演化論當時引起了廣泛的爭議，被基督教會視為異端邪說，西方社會也對達爾文冷嘲熱諷。根據天主教當時的教條：人類是上帝依據自己形象所創造的，因此人是萬物之靈、代表天主有權統治萬物。達爾文的理論不僅使得上帝創造萬物的說法被推翻，人類也被形容為千百年來殘酷的生存競爭所形成的產物，還指出人與其他哺乳動物有著共同祖先，這根本就是褻瀆上帝及基督教教義，這在當時保守的社會是相當大的震撼。
達爾文主義
这个词语是由托马斯·亨利·赫胥黎在1860年创造出来的，那时候被用来描述演化概念，包括早期的概念，诸如马尔萨斯主义和斯宾塞主义。到了19世纪晚期，它开始代表“自然选择是唯一的演化机制”这个概念。与拉马克主义相比，在1900年左右，直到达尔文和孟德爾的思想统一成现代演化综论以前，它一直被孟德尔定律所掩盖。随着现代演化综论的发展，这个词语有时候会与特定的思想联系起来。
演化
演化論有時被誤解為主張有些物種（如人類）比其他的物種更高級，甚至是演化的方向與目的所在。且認為演化的過程必定會使生物愈來愈複雜，或是進行與演化相反的退化。而現在的生物學家認為演化是沒有方向的過程，也沒有任何預先計畫的目標。雖然在已知的演化過程中，確實具有逐漸複雜的現象，但是依然有許多物種保持在較簡單的狀態，如細菌。因此複雜性可能增加也可能減少，或是維持不變，結果取決於天擇的機制。 有些人以為演化論在學界無共識、創造論和演化論一樣有效。如前總統-{zh-hans:里根;zh-hk:列根;zh-tw:雷根;}-曾在1980年的一場競選活動中表示：“演化是一個理論，只是一個科學理論，直到現在依然在科學界中受到挑戰，並且尚未被科學界認為絕對正確。”這類說法強調演化只是一個理論，所以並不是真實存在的事物。然而對科學家而言，理論並非與事實對立。事實是指經驗上所得的資料或數據，理論則是對事實的解釋與想法。里根更說，如果學校要教進化論，也要教聖經上對人類來源的解釋，「而近年來的發現，指出了進化論重大的破綻」。這正與事實相反。2005年美國總統布希公開贊成學校同時教授智慧設計論與演化論。批評者說：「喬治·布什可以證明，受過哈佛和耶魯教育，也影響不了一個人的頑固。」。 2005年的美國賓州多佛學區案中，法官判決學校在2004年開始教授的智慧設計論違反法律，其它學區因爲避免官司而從此放棄教授此論。。2010年，美國宗教學院定下指導方針，智慧設計論不應在科學課中教授，只可作爲文學或社會科學的課程。