诺如病毒
传播途径主要有感染性食物中毒和传染性胃肠炎。生食海贝类及牡蛎等水生动物是该病毒的主要传播途径，也会从非细菌性急性胃肠炎患者的呕吐物及粪便，或者干燥之后通过尘埃感染。
輪狀病毒
輪狀病毒是由糞口路徑（fecal-oral route）所傳染的，藉由與接觸弄髒的手、弄髒的表面以及弄髒的物體來傳染，而且有可能經由呼吸路徑傳染。受感染病患的糞便每克可以包含超過10兆個有傳染性的病毒顆粒；而其中只要10顆到100顆就可以藉由傳播而感染另一個人。
粪口路径
下面的列表展示了可通过粪-口途径传播的主要疾病 （按涉及疾病传播的病原体类型分组）。 介水传染病是由病原 微生物引起的疾病，常于受污染的淡水中传播。 这是粪便传播的一种特殊类型。  被忽视的热带病还包含许多通过粪-口途径传播的疾病。
计算机病毒
由于操作系统桌面环境90%的市场都是使用微软Windows系列產品， 所以病毒作者纷纷把病毒攻击对象选为Windows。制作病毒者首先应该确定要攻击的操作系统版本有何漏洞，这才是他所写的病毒能够利用的关键。Windows當時並沒有有效的安全與防禦功能，且用户常以管理员权限运行未经安全检查的软件，这也为Windows下病毒的泛滥提供了温床。Linux、Mac OS等操作系统，因使用的人群比较少，病毒一般不容易擴散。大多病毒发布作者的目的有多种，包括恶作剧、想搞破坏、报复及想出名与对研究病毒有特殊嗜好。 病毒主要通过网路浏览以及下载，電子郵件以及可移动磁盘等途径迅速传播。
嗜肝DNA病毒
乙肝病毒在人类的主要传播途径是肠外体液接触，如血液和唾液（但感染的毒性因各种程度的乙肝疾病而不同）；围产期婴儿与患者母亲接触。有人认为，在乙肝病毒感染率高的地区，如东亚、南亚以及撒哈拉沙漠以南的非洲，围产期母亲患者对婴儿的传染，以及这种终身病毒携带的状态是高流行率的主要原因。还有案例发现，有乙肝表面抗原阳性的母乳的母亲是病毒携带者，但是还没有科学性的报道关于乙肝病毒通过母乳传播。
植物病毒
植物病毒（Plant virus）泛指感染植物的病毒，大多為正單鏈RNA病毒，一般不具有外膜（布尼亞病毒目與單股反鏈病毒目的病毒則有），有許多外觀呈棒状，也有呈正多面體者，其中的病毒由雙生的兩個正二十面體組成。植物病毒在自然界中大多以動物媒介、花粉或種子傳播，較少如般以直接接觸傳染，動物媒介包括昆蟲、線蟲與蜘蛛等，其中以昆蟲居多（特別是半翅目昆蟲），有些病毒可進入昆蟲的血腔中，使其終生具備散播病毒的能力，有些病毒並可影響宿主花朵的特性以吸引或阻止昆蟲前來。植物可以植物激素（水楊酸、茉莉酸與脫落酸等）啟動抗病毒反應，並以RNA干擾等機制清除病毒RNA，而病毒也有許多機制對抗宿主免疫反應，例如形成膜結構以避免被宿主核酸酶切割，並可利用植物透過原生質絲在細胞間傳遞mRNA的機制傳播自己的RNA。
病毒
并非所有的病毒都会导致疾病，因为许多病毒的复制并不会对受感染的器官产生明显的伤害。一些病毒，如艾滋病毒，可以与人体长时间共存，并且依然能保持感染性而不受到宿主免疫系统的影响，即“病毒持续感染”（viral persistence）。但在通常情况下，病毒感染能够引发免疫反應，消灭入侵的病毒。而这些免疫反应能够通过注射疫苗来产生，从而使接种疫苗的人或动物能够终生对相应的病毒免疫。像细菌这样的微生物也具有抵御病毒感染的机制，如限制修飾系統。抗生素对病毒没有任何作用，但用于治疗病毒感染的抗病毒药物已經研发出來。
普通感冒
普通感冒病毒通常經由飛沫或是直接接觸受病毒感染的鼻腔分泌物以及接觸其他病毒的汙染物，但這些主要的感染途徑並未被完全確定。病毒可能長時間存在於環境中，被人類的手碰觸後再接觸到眼睛或鼻子而造成感染。接觸傳染最常發生在托兒所和學校，主因是惡劣的衛生環境、密切的接觸以及孩童的免疫力較弱。這些兒童感染普通感冒之後還可能將病毒帶回家中，進而造成家中成員感染。沒有證據顯示在飛機上的循環空氣會增加普通感冒傳播的機率，但人們比鄰而坐將產生較大的風險。鼻病毒引起的普通感冒在產生症狀的一到三日最具傳染性，之後傳染力便會逐漸下降至沒有。
病毒概論
病毒是最小的感染源之一，光学显微镜觀察不到大部分的病毒，因此病毒屬於亞顯微結構。大部分病毒只能用电子显微镜观察。病毒的大小从20到300纳米不等，把30,000到750,000個病毒一個個緊靠着排列起來才能達到1厘米的長度。 相比之下，细菌的直径通常在1微米（合1000纳米）左右，高等生物的细胞直径为几十微米。有些病毒比较大，如分別於2003年和2013年发现的能感染变形虫的巨大病毒和潘多拉病毒，直径可达1 微米，大約比流感病毒大一千倍。这些「庞大」的病毒的发现令科學家們相當驚訝。
传播途径
粪-口传播的病原体主要是发现在原宿主的粪便中，而病原体通常是经过口腔进入新的感染者。缺乏足够的卫生设施和不良的卫生习惯是粪-口传播疾病蔓延的主要成因。
传播途径
在医学、公共卫生、生物学、传染病学中，传播途径是指病原体从原宿主排出体外，经过一定的传播方式，到达并入侵新感染者的过程。
病毒
只要有生命的地方，就有病毒存在；病毒很可能在第一个细胞进化出来时就存在了。病毒起源于何时尚不清楚，因为病毒不形成化石，也就没有外部参照物来研究其进化过程，同时病毒的多样性显示它们的进化很可能是多条线路的而非单一的。分子生物学技术是目前可用的揭示病毒起源的方法；但这些技术需要获得远古时期病毒DNA或RNA的样品，而目前储存在实验室中最早的病毒样品也不过90年。有三种流行的关于病毒起源的理论：利用计算机来分析病毒和宿主DNA的序列信息，可以对不同病毒之间的进化关系有更好的了解，而且可以有助于发现现代病毒的祖先。至今这类分析还没有能够决定哪一种理论是正确的。而且不大可能所有的病毒都来自同一祖先，不同的病毒很可能是通过一种或多种机制在不同的时期产生。
2020年北京新发地农产品批发市场冠状病毒病聚集性疫情
中国疾控中心病毒病预防控制所所长助理张勇表示，新发地检出的病毒比欧洲当下流行的病毒要老，传入方式存在多种可能，“比如病毒潜伏在了进口的冷冻食品当中，在从境外到境内的整个存储、运输的期间，病毒由于被冷冻没有发生进化，所以它不会发生变异；也有可能病毒是在新发地农产品批发市场等阴暗潮湿的环境里潜伏下来，没有被消毒、灭菌，在一定时间内突然暴露感染人，导致进化速度变慢，最终我们看到的就是这些毒株更接近于欧洲老病毒。”
病毒式传播
病毒式传播是指当人們接触到一些感興趣的事物時，能够迅速的讓更多的人知道、了解這一事物。社交網站興起後，一个视频、图像或文章能在短时间内传播给众多在线用户 。
咂陽
像衣原體、人類乳突病毒、淋病、單純皰疹病毒、肝炎般的病原體和疾病可在口交中傳播。與感染人類免疫缺陷病毒（一種引起愛滋病的病毒）的人交換體液便有機會遭該種病毒感染。然而與陰道交或肛交相比，口交傳播性感染疾病的風險明顯較低。在眾多傳播HIV病毒的途徑當中，口交的風險是最低的。
高耀洁
她反对官方宣传“艾滋病在中国的主要传播途径是性传播和吸毒传播”的观点，她认为中国农村并没有多少同性恋人口，贫穷的农民也无力购买毒品。此外，经武汉中南医院桂希恩教授在河南驻马店调查500多艾滋病病人, 夫妻 同居时间在5年以上, 对方感染愛滋病病毒者,40多人,证实艾滋病性传播的机率不到10 %, 因中国的艾滋病病毒类型与外国不同, 过分强调官方的观点助长了人们对于艾滋病患者的偏见。人们认为，既然吸毒或性滥交是艾滋病的主要传播途径，那么得艾滋病的人必定大多从事这类活动，进而称艾滋病为“脏病”。艾滋病患者也因而受到歧视甚至侮辱，并殃及家人。
鼠冠狀病毒
鼠冠狀病毒有超過25種不同株系，以呼吸道或糞口途徑傳播，其中有許多可感染鼠類的肝臟，曾被用作研究肝炎的動物模型，亦有感染腸道與神經組織者。MHV-D、MHV-DVIM、MHV-Y與MHV-RI以侵染腸道為主，有時也感染脾臟、肝臟與淋巴組織，以糞口途徑傳播；MHV-1、MHV-2、MHV-3、MHV-A59、MHV-S與MHV-JHM等病毒株感染初期在呼吸道複製增殖，進而擴散至肝臟、肺與腦等其他器官，其中MHV-JHM主要感染中樞神經，是MHV病毒株中最多人研究的，此病毒株於1949年自小鼠腦部分離後被世界各地許多實驗室使用而又分化成諸多株系，其感染的腦部細胞種類和毒力也有差異，包括毒力很高、感染神經元與神經膠細胞的JHM.SD（又稱MHV-4）、JHM-DL與JHM cl-2等，以及毒力弱化的V5A13.1和OBLV60等；除了MHV-JHM之外，主要感染肝臟的MHV-A59也能感染腦部，但毒力弱於前者，這些感染神經的鼠肝炎病毒可造成急性或慢性的神經性症狀，且因其感染會刺激小鼠自身的免疫反應，導致神經元，而被用作研究多發性硬化症的動物模型。另外MHV-2、MHV-3與MHV-A59可感染肝臟，其中前兩者毒力較強，MHV-3為用來研究肝炎的主要病毒株；MHV-1則主要感染肺部。
蝙蝠携带的病毒
蝙蝠携带的病毒可以经由其唾液传播，唾液、粪便和尿液雾化后也能够传播病毒。不只狂犬病毒，近年来一些新兴的病毒（例如伊波拉病毒、SARS病毒、中東呼吸綜合症冠狀病毒、嚴重急性呼吸綜合症冠狀病毒2型等）可由蝙蝠直接传染给人类。如果不加以诊断和治疗，狂犬病毒的病毒株感染人体到患者发病的潜伏期短则几小时， 多则数年。由于未意识到睡眠时被蝙蝠叮咬或是没有被叮咬的感觉，或者在阁楼、地下室、谷仓等封闭环境停留过久，多数患者并不知道自己曾被蝙蝠咬过，或是曾经接触过蝙蝠的分泌物。
傳染病
由於生物性的致病原於人體外可存活的時間不一，存在人體內的位置、活動方式都有不同，都影響了一個感染症如何傳染的過程。為了生存和繁衍，這類病原性的微生物必須具備可傳染的性質，每一種傳染性的病原通常都有特定的傳播方式，例如透過呼吸的路徑，某些細菌或病毒可以引起宿主呼吸道表面黏膜層的型態變化，刺激神經反射而引起咳嗽或噴嚏等症狀，藉此重回空氣等待下一個宿主將其入，但也有部分微生物則是引起消化系統異常，像是腹瀉或嘔吐，並隨著排出物散布在各處。透過這些方式，複製的病原隨患者的活動範圍可大量散播。
布尼亞病毒目
除汉他病毒外，均通过节肢动物传播。汉他病毒则通过与啮齿动物粪便接触而传播。感染病例通常与传播媒介的活动性有关，例如，蚊类传播病毒通常见于夏天。
核糖核酸病毒
双链RNA病毒的群体多样，它们寄生的宿主范围很广（人类，动物，植物，真菌，细菌）。这一类病毒包括造成儿童肠胃炎的轮状病毒和造成世界各地的人和动物腹泻，在他们的排泄物里发现的picobirnaviruse。小核糖核酸病毒最近也有报道在一些猪和蓝舌病毒（bluetongue virus），一种会影响牛羊的重要病原体上发现。近年来，在确定许多关键病毒蛋白和几种 dsRNA 病毒的病毒体衣壳的原子和亚纳米分辨率结构方面取得了进展，突出了许多这些病毒的结构和复制过程的显着相似之处。（病毒体本身不携带RNA複製酶）
病毒学
病毒学（），是一门以病毒 -- 亚微观的，蛋白质外壳中包含的遗传物质的寄生颗粒 - 和病毒样代理（virus-like agents）为研究对象的学科。它关注病毒的以下方面：病毒的结构，分类和进化，感染和开发宿主细胞繁殖的方式，它们与宿主生物体生理和免疫的相互作用，它们引起的疾病，分离和培养它们的技术，以及它们在研究和治疗中的应用。病毒学被认为是微生物学或医学的一个子领域。
蝙蝠携带的病毒
2002年爆发、次年开始全球流行的非典型肺炎疫情和2012年爆发的中东呼吸综合征，其源头都指向蝙蝠。冠状病毒是一种正义单链RNA病毒，分为四个属，分别用希腊字母的前四个字母命名。其中，α-冠状病毒和β-冠状病毒可经由蝙蝠传播。
嚴重急性呼吸系統綜合症冠狀病毒2型
现在对SARS-CoV-2理化特性的认识多来自对SARS-CoV和MERS-CoV的研究。这一病毒能以动物为中介传染给人类，且具有人传人的能力。新型冠状病毒虽然被证明和SARS-CoV的基因只有79%的相似度，但它也可以借由hACE2作为受体结合，透過呼吸道上皮细胞进入肺部进行复制过程为主，但肠上皮细胞也较为易感。其主要作用对象被发现也是与SARS相同的T淋巴细胞。在SARS-CoV-2感染宿主时，hACE2的表达被认为主要局限于II型肺细胞、吸收性肠上皮细胞和鼻黏膜分泌细胞。而人类的结膜及角膜组织中也被发现有较高表达的hACE2和TMPRSS2，是除呼吸道外的病毒主要感染门户。在接触宿主细胞时，病毒的会经历特定的构象变化，使之RBD区域暴露后与hACE2相结合，接着透過促进S2蛋白介导与细胞的膜融合完成感染的全过程。有研究发现，SARS-CoV-2和RaTG13、MP789、GX/P5L在RBD的外子域中拥有保守的二硫键，另一种病毒RmYN02的RBD内则有氨基酸缺失，形成更短的环，可能会造成构象变化。这一特征被怀疑和病毒与hACE2受体结合的能力相关。其他研究指出，新型冠状病毒的RBD中有可变的关键性氨基酸残基，对hACE2受体的作用过程与SARS可能有一定差异。 现已知SARS等冠状病毒S蛋白进入靶细胞取决于与hACE2受体的结合作用以及细胞蛋白酶对S蛋白的启动作用，SARS的S蛋白与其受体hACE2结合是靠细胞丝氨酸蛋白酶TMPRSS2来引发的，与它有76%氨基酸同一性的新型冠状病毒被发现有相似的机能。在现有认知中，新型冠状病毒与SARS在序列及传播途径的相似无法确切证实两者之间有相似的生物学特性。一项初步研究对比了包括SARS、MERS以及新型冠状病毒在内的多种同属病毒，发现了在新型冠状病毒RBD中的RBM，怀疑其中负责和hACE2结合的序列与SARS相同，且在其余无法透過hACE2结合的Bat-CoV中未发现同样的序列。研究表示，在实验新型冠状病毒进入Caco-2细胞时，使用针对TMPRSS2的丝氨酸蛋白酶抑制因子卡莫司他后，有效阻止了病毒的入侵；相反的，针对CatB/L的抑制因子E64d在293T细胞上无效果。这一实验结果初步表明新型冠状病毒的S蛋白也是由TMPRSS2引发的，并可在呼吸道上皮细胞上进行膜融合。
肝炎
甲型肝炎病毒（HAV）是医学家于1973年用免疫电镜技术在急性期患者的粪便中发现的。现在，世界约平均每年发生150万临床病例。此种病毒主要通过肠道传播，与恶劣的卫生条件密切相关，最常见的感染方式是与患者密切接触，或进食了被污染的水、食物和海产品等。一旦感染上甲型肝炎病毒，患者会出现发热、厌食、恶心、腹部不适等症状，有些人的全身和眼睛还会突然变黄。一般经过1—3月的对症治疗，患者就能痊愈，半年之内可以完全恢复健康，而且身体会自动产生抗体，不会再次感染甲肝病毒。
骨痛熱症
和大多数虫媒病毒一样，在自然界中，登革病毒的传播以吸血节肢动物作为媒介，脊椎动物为宿主。病毒主要在南亚和非洲森林中从雌性斑蚊-除了埃及斑蚊之外的属-传播给它们的后代和较低级灵长类动物。在城镇，病毒主要通过高度居家的埃及斑蚊来传播，在农村，病毒通过埃及斑蚊和其它斑蚊属如白線斑蚊传播给人。这两个斑蚊属在20世纪后半期所在地区范围都扩大了。在所有环境中，被感染的低级灵长类动物和人以一种称为扩增的方式使流行的登革病毒数量增加。
茲卡病毒
世界卫生组织（WHO）表示该病毒有可能透過性接触在人與人之間傳播，不过仍需更多研究以确认性传播是否为兹卡病毒的传播途径之一。 在2016年1月25號倫敦衛生與熱帶醫學院的Laura Rodrigues教授於2016年1月25號強調發展茲卡病毒疫苗的重要性，應該如同德國麻疹疫苗一樣給予有生育計劃的女性接種以防止懷孕時受到病毒感染而導致畸胎。在疫苗出現前，對於想要懷孕或已經懷孕的女性而言應該小心被蚊蟲叮咬以及避免前往高風險的疫區。
病毒
病毒的核酸可以是单链或双链，也与核酸的种类无关。双链的病毒核酸是由两条互补配对的核酸链所组成，如同一个梯子。而单链的病毒核酸是一条没有配对的核酸链，如同一个梯子从中间分成两边的其中一边。一些病毒，如肝病毒科中的部分病毒，其核酸部分为单链，部分为双链。
冠状病毒
甲型與乙型冠狀病毒都源於蝙蝠病毒，再由蝙蝠散播至其他動物，其中乙型冠状病毒屬的支系A（即亞屬"Embecovirus"，包含可感染多種動物的乙型冠狀病毒1型、鼠冠狀病毒、人類冠狀病毒HKU1與黃鼠冠狀病毒HKU24等）中尚未發現任何蝙蝠病毒，其共祖可能是鼠類病毒。
人類免疫缺陷病毒
在人類免疫缺乏病毒感染病程的一些時期，特別是早期及末期，具有感染性的病毒顆粒會存在於含有免疫細胞、血漿、淋巴液或組織液的某些體液中，如血液、精液、前列腺液、陰道分泌液、乳汁或傷口分泌液；另一方面，病毒在體外環境中極不穩定。因此，人類免疫缺乏病毒的傳播途徑主要是不安全性行為、靜脈注射、輸血、分娩、哺乳等；而通常的工作、學習、社交或家庭接觸，比如完整皮膚間的接觸、共用坐便器、接觸汗液等，不會傳播人類免疫缺陷病毒；與唾液或淚液的通常接觸（如社交吻禮或短暫接吻）也未有導致傳播人類免疫缺陷病毒的報告；但美國疾病控制與預防中心說已感染病毒的母親，可將病毒透過先嚼過的食物（唾液內含血液）傳給孩子。
嗜肝DNA病毒
水平传播
病毒
并非所有的病毒感染都会引起保护性免疫反应。例如，艾滋病毒可以通过不断地变换其病毒体表面蛋白的氨基酸序列来逃避免疫系统的打击。这些顽固的病毒采用多种方式来逃脱免疫系统的控制，如隔离、阻断抗原呈递、产生细胞因子抗性、逃避自然杀伤细胞的作用、逃脱细胞凋亡以及抗原转移。其他一些病毒，如向神经病毒（neurotropic virus），可以通过神经来传播，而在神经系统中免疫系统可能无法接触到它们。
食用蝙蝠
由于蝙蝠能够携带和传播传染病病毒，在西非，捕猎和食用蝙蝠已成为严重的公共卫生问题。蝙蝠可携带例如埃博拉病毒、马尔堡病毒等丝状病毒，感染了这些病毒的蝙蝠会把病毒传染到附近的人身上。此外，蝙蝠也是亨尼巴病毒和丽莎病毒的宿主。蝙蝠也可以携带冠状病毒，是近年来多种大规模流行的呼吸道疾病（例如非典型肺炎、2019冠状病毒病）的源头。
輪狀病毒
輪狀病毒是藉由糞口途徑傳染的。它會感染與小腸壁上的並且產生腸毒素（enterotoxin），腸毒素會引起腸胃炎，導致嚴重的腹瀉，有時候甚至會因為脫水而導致死亡。雖然輪狀病毒於1973年就被由澳洲的所發現，而且造成嬰兒與幼兒總計超過50%以上因為嚴重腹瀉而住院治療的案例，但是在公共衛生社群中它仍然沒有被廣泛地重視，特別是在發展中國家更是如此。除了對人類健康的影響之外，輪狀病毒也會感染動物，是家畜的病原体之一。
癌变
此外許多癌症起源於病毒感染。特別是在動物中，例如鳥類。由病毒引起的人類癌症大約佔所有人類癌症的15%。與癌症有關的病毒主要有人類乳突病毒、乙型肝炎病毒、人類疱疹病毒第四型和人類嗜T細胞病毒（）。實驗結果和流行病學數據顯示在所有引起癌症的危險因子中，病毒排名第二，僅次於菸草。病毒引發腫瘤的方式可以分為或兩種。可造成急性轉化的病毒中帶有，是非常活躍的致癌基因。當被感染的細胞表現病毒致癌基因時，就會使細胞轉化。相反的，進行慢性轉化的病毒通常要將其染色體插入宿主的基因中，而這樣的過程也是逆轉錄病毒的特性。當病毒的基因插入到原致癌基因附近時，借由病毒基因帶有的啟動子或者其他調控轉譯的機制，讓原致癌基因大量表現使細胞生長失去控制。因為病毒基因是以隨機的方式插入到宿主的基因中，如果插入的地方恰好沒有原致癌基因存在，對於細胞的生長就不會有太大影響。相對於急性轉化的病毒本身即攜帶病毒致癌基因，慢性轉化的病毒則需要更長的時間引起癌症。
幽門螺桿菌
世界超過50%人口在消化系統上部带有幽門螺桿菌。感染較盛行於发展中國家，而西方國家的影響範圍也逐漸縮小。有人认为幽门螺杆菌的传染途径可能为口口或粪口传播，但这种传播方式一直缺乏证据支持，没有证据显示可以从感染者口腔和粪便中分离到活的具有感染力的幽门螺杆菌；另外，随着人们普遍卫生习惯和饮食习惯的改善，理论上上述传播途径导致幽门螺杆菌的传播应该大大下降，但目前幽门螺杆菌的自然感染率并没有呈现下降的趋势。因此，幽门螺杆菌的传播方式依然是个谜。
传播途径
通过性接触传播的疾病包括艾滋病毒/艾滋病、衣原体门、尖锐湿疣、淋病、乙型肝炎、梅毒、疱疹、及滴虫病。
高耀洁
地方政府官员切断了解决这场危机的唯一通道：面对问题。他们隐藏问题，并借着大众宣传媒体，误导艾滋病病毒的传播途径，说是来自于性乱与吸毒。多年来，农村人得到的都是错误消息。根据一项对一万名人的调查，不到15% 的人能正确的说出HIV传播的方式或者如何保护自己。他们并不知道艾滋病病毒可以通过血液感染而传播。“输血加剧了艾滋病的传播，并非像他们声称的是性接触传染，”高耀洁在一次路透社的采访中说，“这是真实的，尤其是在河南、安徽、四川和广西省贫穷的偏远地区。”
病毒
病毒由两到三个成分组成：病毒都含有遺傳物質（RNA或DNA，只由蛋白质-{}-组成的朊毒體并不属于病毒）；所有的病毒也都有由蛋白质形成的衣壳，用来包裹和保护其中的遗传物质；此外，部分病毒在到达细胞表面时能够形成脂质包膜环绕在外。病毒的形态各异，从简单的螺旋形和正二十面體形到複合型结构。病毒颗粒大约是细菌大小的千分之一。病毒的起源目前尚不清楚，不同的病毒可能起源于不同的机制：部分病毒可能起源于-{zh-tw:質體;zh-cn:质粒}-（环状DNA，可以在细胞内复制并在细胞间转移），而其他一些则可能起源于细菌。
脑膜炎
细菌性和病毒性脑膜炎都具有傳染性，但传染性都没有普通感冒或流感强。两种脑膜炎均可能透過飛沫及接觸呼吸道分泌物傳染，如接吻、打喷嚏，或咳嗽等。但是不會藉由空氣傳染，人们不会仅仅因为吸入脑膜炎患者接觸過的空气而受到感染。病毒性脑膜炎通常是由肠病毒引起的，最常见的传播方式是粪便污染。我们可以通过改变导致疾病传播的行为来减少感染的风险。
病毒
不同的病毒有着不同的致病机制，主要取决于病毒的种类。在细胞水平上，病毒主要的破坏作用是导致细胞裂解，从而引起细胞死亡。在多细胞生物中，一旦机体内有足够多的细胞死亡，就会对机体的健康产生影响。虽然病毒可以引发疾病，却也可以无害地存在于机体内。例如，能够引起唇疱疹的单纯疱疹病毒可以在人体内保持休眠状态；这种状态又称为“潜伏”（latency），这也是所有疱疹病毒（包括能够导致腺热的艾伯斯坦-巴尔病毒和能够导致水痘的）的特点。进入潜伏状态的水痘－带状疱疹病毒在“苏醒”后，能够引起带状疱疹。
嚴重急性呼吸系統綜合症冠狀病毒2型
溶于较大液滴中的SARS-CoV-2会透過人触摸脸部的方式传染，但多数会沉淀于上呼吸道或被鼻腔的分泌物清除。研究发现，在封闭空间中，单纯的呼吸和说话会产生直径更小的气溶胶。这一发现建议病毒粒子可以更容易进入肺部，并直接感染肺部内的细胞。尽管消化道接触病原体也被怀疑有传染可能，这一途径未被证实。
病毒
病毒是导致癌症发生的原因之一。与人类癌症相关的主要病毒有人類乳突病毒、乙肝病毒、艾伯斯坦-巴尔病毒和人类嗜T淋巴细胞病毒（human T-lymphotropic virus）。肝炎病毒可以诱发慢性病毒感染从而导致肝癌。人类嗜T淋巴细胞病毒可以导致热带痉挛性瘫痪（tropical spastic paraparesis）和成人T细胞白血病。人類乳突病毒是子宫颈癌、皮肤癌、肝门癌和阴茎癌的成因。在疱疹病毒科中，卡波西肉瘤相关疱疹病毒（Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus）能够导致卡波西氏肉瘤（Kaposi's sarcoma）和体腔淋巴瘤（body cavity lymphoma），而艾伯斯坦-巴尔病毒可以导致伯奇氏淋巴瘤（Burkitt's lymphoma）、霍奇金淋巴瘤（Hodgkin's lymphoma）、B淋巴扩增紊乱（B lymphoproliferative disorder）和鼻咽癌（nasopharyngeal carcinoma）。
计算机病毒
病毒一般会自动利用电子邮件传播，利用对象为某个漏洞。将病毒自动复制并群发给存储的通讯录名单成员。邮件标题较为吸引人点击，大多利用社会工程学如“我愛妳”这样家人朋友之间亲密的话语，以降低人的警戒性。如果病毒制作者再应用脚本漏洞，将病毒直接嵌入邮件中，那么用户一点邮件标题打开邮件就会中病毒。
传播途径
母婴传播的疾病通常是在胚胎内的婴孩通过产道感染，产后母親与子女之间身体接触，或通过母乳而感染的。可以通过这种方式传播的传染病包括：艾滋病毒、乙型肝炎和梅毒。不少共生菌也是透过母婴传播的。
病毒導致的肝炎
病毒導致的肝炎（，也稱病毒性肝炎）是由於感染病毒而引發的肝炎。這種疾病可能是因近期感染，發病呈急性形式，但也有慢性的形式。 造成病毒性肝炎最常見的有5種彼此不相關的趨肝性病毒（hepatotropic viruses），即A型肝炎病毒、B型肝炎病毒、C型肝炎病毒、D型肝炎病毒、和E型肝炎病毒。有些別的病毒也可引起肝臟發炎，包括巨細胞病毒、愛潑斯坦-巴爾病毒、和黃熱病。也有許多由單純皰疹病毒所引起病毒性肝炎病例記錄。 病毒性肝炎可透過受污染的食物或水（A型、E型），或是透過血液和體液（B型、C型）傳播。透過水和食物傳播的病毒大多是自限性，導致急性發病，可完全消除。血體液病毒可引起急性和慢性的肝病，會在分娩時從母親對嬰兒、性交時接觸體液、使用不安全的注射方式、和未經篩查的輸血而造成感染。 最常見的肝炎類型可預防，或是治愈。A型和C型肝炎可透過接種疫苗作預防。對於C型肝炎，已有有效的治療方式，但費用昂貴。 全球在2013年約有150萬人因病毒性肝炎而死亡，最常見的是B型和C型肝炎。東亞是受到影響最嚴重的地區，尤其是在蒙古。 最常見發生肝炎的原因是由病毒造成。雖然會導致肝炎的病毒有多種，但它們之間並不全然有關聯。 A型肝炎會導致黃疸，是由A型肝炎病毒 (HAV) 所引起，這是一種微小核糖核酸病毒，透過糞口途徑傳播，通常與接觸受到污染的食物有關。會導致急性肝炎，但不會發展成慢性階段。患者的免疫系統會產生針對HAV的抗體，因此對未來感染具有免疫力。罹患A型肝炎的患者需要休息、吸收水分、以及避免飲酒。有疫苗可預防HAV的感染，時間長達10年。A型肝炎可透過個人接觸、生食海鮮、或飲用受污染的水而傳播。這種疾病主要發生在第三世界國家。嚴格遵守個人衛生、避免生食、和食用前需要去皮的食物，會有助於預防感染。患者在黃疸出現前兩週和出現後一週，HAV會隨糞便排出體外。從感染到發病之間的時間平均為28天（從15到50天不等），大多數會在2個月內完全康復，但大約有15%的患者的症狀在初步診斷之後，會持續或是間斷，為期在6個月到1年之間。 B型肝炎是由B型肝炎病毒所引起，B型肝炎病毒是種會引起急性和慢性肝炎的肝病毒。 有15%的成年人在初次感染後無法消除病毒，而發展為慢性肝炎。確定的傳播方法包括接觸血液、輸血（現在極為少見）、刺青之前未充分消毒、性行為（透過性交或接觸體液）、或是通過母乳哺育傳給嬰兒， 透過胎盤傳播的證據不多。但大約有一半的病例無法確定感染源。接觸血液（包括利用靜脈注射藥物時數人共用注射器、共用刮鬍刀片、或接觸疾病感染者的傷口而發生。許多國家已制定 以作預防。（參見安全注射器#立法） 罹患慢性B型肝炎的患者自身有抗體可對抗病毒，但不足以清除受到感染的肝細胞。病毒和抵消性抗體的持續產出可能是導致這些患者出現免疫複合體病（immune complex disease）的原因。有種疫苗可達成終生預防感染。由於慢性肝炎、肝硬化、和肝細胞癌（HCC）的併發症，B型肝炎感染導致全世界每年有500,000至1,200,000人死亡。B型肝炎是許多（主要是東南亞）國家的地方性流行病，而導致肝硬化和HCC，導致多人死亡。美國食品藥物監督管理局 (FDA) 核准8種治療方案，用於治療慢性B型肝炎感染者：α-干擾素（參見）、、阿德福韋、恩替卡韋、、拉米夫定、替諾福韋二吡呋酯、和丙酚替諾福韋。 C型肝炎（最初被稱為“非A型/非B型肝炎”）是由C型肝炎病毒 (HCV) 所引起，這是一種黃病毒科的RNA病毒。 HCV可透過血液接觸傳播（包括在性接觸時，雙方的血液有過混合），也可透過胎盤傳播。C型肝炎通常是導致慢性肝炎，最終讓某些人出現肝硬化。感染者通常在幾十年內保持無症狀的狀態。C型肝炎患者如果也感染到A型或B型肝炎，則易出現重症肝炎，因此所有C型肝炎患者，如果尚未對A型或B型肝炎免疫，應接種相關疫苗，並避免飲酒。HCV可導致發展出HCC，但只有少數HCV感染者會發展為癌症（每年有1-4%），顯示C型肝炎病毒的基因表達與宿主，以及環境因素之間複雜的相互作用，而促進致癌的發展。感染HCV的患者，如果也有活躍的HBV複製情況，與罹患潛伏的HBV及HCV患者相比，罹患HCC的風險會增加1倍，死亡率增加21%。通過干擾素和抗病毒藥物利巴韋林的組合治療罹患HCV的患者，效果比單獨使用干擾素做治療會有較佳的功效。C型肝炎是美國最常見的血體液傳染病。
血體液傳染病
血體液傳染病（）是指受到污染的血液和其他體液而傳播的疾病。血液中可能含有不同類型的病原體，其中主要是微生物（例如細菌和寄生蟲）和非細胞生物感染原（例如病毒）。美國疾病控制與預防中心（CDC）所屬美國國家職業安全衛生研究所（CDC-NIOSH）認為醫事人員最需要注意的是三種經由血體液傳播的病原體（全部都是病毒）：人類免疫缺乏病毒（HIV）、B型肝炎（HVB）、和C型肝炎（HVC）。 不直接透過血液接觸，而是通過昆蟲或其他病媒傳播的疾病，縱然在患者血液中可找到致病病原，將之歸類為蟲媒傳染病會更妥切。病媒傳播的疾病包括西尼羅河病毒、茲卡熱、和瘧疾。
病原体
人類可以感染許多不同類型的病原體，包括院病毒，病毒，細菌和真菌。感染人類的病毒和細菌會引起打噴嚏，咳嗽，發燒，嘔吐甚至死亡等症狀。這些症狀中的一些是由病毒本身引起的，而另一些則是由感染者的免疫系統引起的。
2019冠状病毒病
根据中华人民共和国国家卫生健康委员会发布的《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案（试行第七版）》，2019冠状病毒病目前可依臨床癥狀被分為轻型、普通型、重型、危重型，以及临床诊断患者和无症状患者。目前關於此疾病的初期傳染途徑仍在调查中。一般認為疫情最初期的傳播可能源自於野生動物對人的傳播，後來人傳人成為主要的傳播途徑。2019冠状病毒病主要是透過患者咳嗽或打噴嚏的飛沫傳染。除了直接吸入患者的飛沫之外，也可能藉由觸碰到受飛沫污染的表面，再觸碰臉部而傳染（環境污染傳播模式）。有文獻表示病原體也可能透過氣溶膠傳播，並認為病原體在氣溶膠的狀態下，可能存活長達數日。目前尚無證實本疾病可透過糞口途徑傳播，但已證實有些患者的糞便可驗出病毒，因此不能排除相關風險。
病毒
病毒可以感染所有的物种，少数病毒（如mimivirus）甚至也会受到其他特定病毒的感染；但特定的病毒感染物种的范围是有限的。例如，植物病毒不会感染动物，而噬菌体只能感染细菌。
嗜肝DNA病毒
跨物种传播还未被科学证实，但是如果这类型的传播发生了，会扩大各病毒株的宿主范围，降低各病毒株宿主特异性，为控制病毒的传播加大了难度，也会使试图通过免疫以降低乙肝病毒的感染的途径变得更难实施。由于人类不断侵入雨林灵长类动物栖息地中，加上试图保护面临灭绝危险的灵长类动物的，从而增加了野生灵长类动物和人类的互动接触，正肝病毒的相互的跨物种转播提供了可能性。在灵长动物之间的跨物种传染已经发现过很多例了，这种跨物种之间的传染，灵长类动物之间以及动物与人间的跨物种传染，也给嗜肝DNA病毒株基因重组提供了很大的机会，更进一步的研究表明在灵长类动物中存在的各类嗜肝DNA病毒株有很大可能分享过同一古老的宿主 。
病毒
巴尔的摩分类法是基于病毒mRNA的生成机制。在从病毒基因组到蛋白质的过程中，必须要生成mRNA来完成蛋白质合成和基因组的复制，但每一个病毒家族都采用不同的机制来完成这一过程。病毒基因组可以是单链或双链的RNA或DNA，可以有也可以没有反转录酶。而且，单链RNA病毒可以是正义（+）或反义（-）。这一分类法将病毒分为7类：
肺炎
肺炎性的病毒可能藉由不同的管道進入肺部。呼吸道合胞病毒（RSV）通常是在病人觸摸到受感染的物體後，然後又碰觸眼、鼻而感染 。其他感染途徑則包含口鼻吸入空氣當中的飛沫而感染 。病毒感染上呼吸道之後，可能會再接著感染肺部，並入侵氣管內襯細胞、肺泡或是實質組織。另外如麻疹及皰疹病毒則是透過血液進入肺部 。肺部的病毒感染可能造成不同程度的細胞死亡，且一旦免疫系統開始對抗這些感染，以單核球為主的白血球會啟動發炎反應，可能會對肺部形成更大的傷害。在損傷肺部的同時，病毒也會同時影響其他器官，進一步阻礙正常的身體運作。病毒也會使得身體更易遭受其他細菌感染，因此病毒性肺炎有可能會合併感染細菌性肺炎。
病毒
一些病毒可以利用改造后的宿主的细胞膜（来自细胞表面的质膜或细胞内部的膜，如核膜及内质网膜）环绕在病毒体周围，形成一层脂质的包膜。包膜上既镶嵌有来自宿主的膜蛋白也有来自病毒基因组编码的膜蛋白；而脂质膜本身和其中的糖类则都来自宿主细胞。包膜型病毒位于包膜内的病毒体可以是螺旋形或正二十面体形的。
病毒概論
海洋哺乳动物也会受病毒感染。1988年和2002年，在歐洲殺死了數以千計的海豹。杯状病毒、疱疹病毒、腺病毒和细小病毒等亦在海洋哺乳動物中流行。
病毒
流行病学研究是用于在病毒性疾病爆发时及时切断病毒在人群中的传染链。防治措施是针对病毒的传播方式进行控制。发现病毒源和鉴定病毒是其中的重要环节。一旦鉴定了病毒，其传播就可以通过注射疫苗来阻断。当没有可用的疫苗时，改善环境卫生以及采取消毒措施也可以有效地防止病毒传播。通常受感染的病人需要与其他健康人群隔离开，而对有接触过病毒的人需要进行隔離檢疫。大多数人和动物的病毒感染具有一定的潜伏期，在这一期间，不会有患病的迹象和症状。病毒性疾病的潜伏期从几天到几个星期不等，但多数病毒感染的潜伏期已经得以确定。在潜伏期之后，会有一段“可传染期”，即此期间受感染的个体可以将病毒传染给其他个体。对于了解可传染期和潜伏期的长短对于控制疾病的爆发也非常重要。当疾病爆发导致一个人群、社区或地区中有反常的高比例患病者时，这一疾病就称为流行病；如果疾病传播到世界范围则称为瘟疫。
病毒概論
病毒是一種依靠宿主的細胞来繁殖的類生物體。在感染宿主細胞之後，病毒就會迫使宿主細胞以很快的速度製造、裝配出數千份與它（病毒）相同的拷貝。不像大多數生物體，病毒沒有會分裂的細胞，新的病毒是在宿主細胞內生產、組裝的。不過，與構造更簡單的傳染性病原體朊病毒不同，病毒含有能使得它們發生變異和進化的核酸。目前，人們已經發現了超過5000種的病毒。
传播途径
医源传播主要是透过医疗过程而接触病原体，例如触碰受污染的医疗器材、不安全的注射或移植受感染的器官。一些比较常见的医源传播疾病包括： 克雅二氏症（注射受污染的人类生长激素）和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌。
流行性感冒
流感的傳播大致可分為三種：直接傳播（傳染者的飛沫接觸到感染者的眼、鼻或口）、空氣傳播（即吸入傳染者經咳嗽、噴嚏或痰液所產生的懸浮粒子）和接觸傳染（如手眼接觸、手鼻接觸、手口接觸等等），三種傳播途徑的相對風險目前未明。空氣傳播途徑的粒徑約為0.5至5µm左右，只要吸入一粒就足以致病。平均每次噴嚏會產生約40,000顆飛沫顆粒，但絕大多數的顆粒過大，因此會迅速沉降。病毒的存活時間需視空氣濕度及紫外線輻射而定，冬季的空氣濕度低、陽光輻射也低，會增加病毒的存活時間。
西非伊波拉病毒疫症
2014年8月18日世界衛生組織聲明，伊波拉通過空氣傳播的可能性不高。伊波拉病毒需要通過直接接觸感染者的體液或分泌物，如血液、嘔吐物、汗液或糞便等才能傳播。此外，感染者通常非常虛弱，乘坐飛機旅行的可能性很小。
馬爾堡病毒
一般相信病毒是透過與染病的人畜緊密接觸，通過體液傳播。日常接觸相信不會傳染。病患者危急時，體內的病毒傳染力最強。部分非洲地區的殮葬風俗應該是導致疾病傳播的原因之一。
口蹄疫
口蹄疫的感染一般為地域性，病毒通过直接接触受感染的动物传播给易感染动物，或者通过被污染的畜舍或运输牲畜的货车。动物管理人（如农场工人）的外衣或皮肤、动物接触过的水，和未煮过的食物碎屑以及包含感染动物产品的饲料添加剂都可能是病毒的携带源。另外，母牛可以通过公牛精液传染上口蹄疫。对其的控制可以是隔离或销毁受感染的牲畜，以及禁止向未有感染疫情的国家出口动物肉类以及相关动物产品。
感染
用於防止感染傳播的有：要預防或減慢感染性疾病傳播的方法之一，是去了解各種疾病的不同特徵。應評估的一些關鍵特徵包括病毒性、患者的活動範圍、以及感染性。例如，伊波拉病毒極快的讓受害者病倒，並很快死亡。結果，受害者沒機會遠離他們最初的感染地點。而且，這種病毒必須通過皮膚的病變，或者諸如眼睛的可滲透膜傳播。伊波拉病毒的初始階段感染性不高，受害者僅發生內部出血。由於前述特徵，伊波拉病毒的傳播雖然非常迅速，但是通常只發生在相對狹小的地理範圍之內。相反的，愛滋病病毒透過攻擊受害者的免疫系統，緩慢地殺死受害者。結果，它的許多受害者甚至在沒有意識到自己罹患這種疾病之前就將病毒傳播給其他人。而且，愛滋病相對較低的病毒性讓受害者能夠長途跋涉，增加變成流行病的機率。 降低感染性疾病傳播率的另一種有效方法是認識到小世界網路的影響。在流行病中，感染者的地理集點或群體之內通常互動頻繁，而且和離散集點內的易感個體有其他互動。雖然離散集點之間的互動不強，但疾病仍可以跳傳給離散集點中易感的人。因此，如果把受感染集點內個人間的互動消除，小世界網絡中的感染率就可降低。但是，如果把重點放在防止集點間的疾病跳傳，則可大幅降低感染率。在患有愛滋病吸毒者密度高的地區，使用換新針頭的措施，是成功實施這種降低傳染措施的一個示例。 另一個例子是在2001年英國諾森伯蘭郡，對鄰近農場中的潛在易感牲畜撲殺或作疫苗接種，以防止口蹄疫病毒的傳播。
计算机病毒
一般的病毒仅在数KB左右，这样除了传播快速之外，隐蔽性也极强。部分病毒使用“无进程”技术或插入到某个系统必要的关键进程当中，所以在任务管理器中找不到它的单独运行进程。而病毒自身一旦运行后，就会自己修改自己的文件名并隐藏在某个用户不常去的系统文件夹中，这样的文件夹通常有上千个系统文件，如果凭手工查找很难找到病毒。而病毒在运行前的伪装技术也不得不值得我们关注，将病毒和一个吸引人的文件綁紮合并成一个文件，那么运行正常吸引他的文件时，病毒也在我们的操作系统中悄悄的运行了。
病毒
病毒（）是僅能在生物體活細胞內複製繁衍的亞顯微病原體。它由核酸分子（DNA或RNA）与保护性外壳（蛋白质）构成的非细胞形态的类生物结构（bio-like structure），無法自行表現出生命現象，是介於生命体及非生命體之間的生化結構，既不是生物亦不是非生物，卻是寄生性自我複製物（self-replicator）。藉由感染機制侵入有機體後，这些简单的生化結構可以利用宿主的细胞系统自我复制，但无法独立生长和复制。病毒可以感染所有具有细胞结构的生命体。第一个已知的病毒是烟草花叶病毒，由马丁乌斯·贝杰林克于1899年发现并命名，迄今已有超过5000种类型的病毒得到鉴定。尽管学界对于病毒是否为一种生物仍有争议，病毒学（研究病毒的科学）总是被归为微生物学的分支。
2019冠状病毒病
病毒主要通过口鼻分泌物传播，包括咳嗽、打喷嚏和说话产生的。这些飞沫通常不会在空气中长距离传播。但是，站在近处的人可能会因吸入这些飞沫而被感染。人们也可能通过接触受污染的表面，然后再接触自己的脸而受到感染。在封闭的空间内，也可能通过能够在空气中悬浮较长时间的气溶胶传播。在出现症状后的前三天最具传染性，尽管在症状出现前和无症状的人身上都有可能传播，而有研究显示约40%-45%的患者为无症状感染者。
埃博拉病毒屬
伊波拉是人畜共通病毒，主要的感染途徑是透過患者體液傳染，如血液、汗、嘔吐物、排泄物、尿液、唾液或精液等，目前並無飛沫感染的證據。儘管世界衛生組織竭力研究，至今仍沒有辨認出任何有能力在爆發時存活的動物宿主，目前認為果蝠是病毒可能的原宿主。目前已有疫苗可以預防薩伊伊波拉病毒(Zaire ebolavirus)，但無法預防其它伊波拉病毒株。
宏病毒
在1990年代中后期最流行的病毒就是和微软公司办公软件（如Microsoft Word及Excel）相关的-{zh-hans:宏;zh-hk:巨集;zh-tw:巨集;}-病毒。在90年代后期，微软公司的电子邮件软件Outlook（拥有scripting特性）成为传播-{zh-hans:宏;zh-hk:巨集;zh-tw:巨集;}-病毒最常用的载体。直到今天还是如此。Outlook的scripting特性使得-{zh-hans:宏;zh-hk:巨集;zh-tw:巨集;}-病毒能够获得Outlook用户地址簿中存储的联系人地址，通过向这些地址发送E-mail将病毒体广泛传播。而之前的电脑病毒（比如Morris电脑病毒）同样通过E-mail传播，但破坏力远不及此。
保持社交距離
当传染病可以通过飞沫接触（咳嗽或喷嚏）、包括性接触在内的直接身体接触、间接身体接触（比如：接触受污染的表面，如）或空气传染（这样的微生物可以在空气中生存较长时间）来传播时，保持社交距離是最有效的感染控制措施。
真菌病毒
真菌病毒（）泛指可以感染真菌的病毒。多數真菌病毒都屬於，但也有約三成屬於正义单链RNA病毒。真菌病毒必須具備感染健康真菌的能力，許多真菌細胞內類似病毒的物質並無感染能力，故只能稱為，並非真正的真菌病毒。大多數真菌病毒的感染都沒有任何症狀，它們可能在長期共演化之下，演化出對宿主無害、甚至對宿主有益的共生機制，例如細胞內的雙股RNA病毒可編碼毒素，幫助其宿主毒殺周圍的其他酵母菌，不過仍有少數真菌病毒的感染會嚴重影響真菌的生長，並降低部分植物病原真菌感染植物的能力。真菌病毒學（）是病毒學中一個相對較新的分支領域，其研究範圍包括真菌病毒的分類、起源、演化、宿主種類、傳播機制與對宿主的影響等。
舐陰
披衣菌感染、人類乳突病毒（HPV）、人類免疫缺陷病毒、淋病、疱疹、病毒性肝炎般的性傳播感染（STIs）能经由口交傳播。與感染人類免疫缺陷病毒（一種引起愛滋病的病毒）的人交換體液便有機會遭該種病毒感染。然而與陰道交或肛交相比，口交傳播性感染疾病的風險明顯較低。在眾多傳播HIV病毒的途徑當中，口交的風險是最低的。再者现有記錄指出，在舐陰中傳播人類免疫缺陷病毒的風險低於吮陽、陰道交和肛交。
病毒概論
包括人类在内的动物先天就有很多抵御病毒的方式。其中，一些方式是非特異性的。也就是說，它們能對所有的病毒起防禦作用。先天免疫不会在多次接触病毒后增强，對病毒感染也没有“记忆力”。动物的皮肤，尤其是由死细胞構成的皮膚表層，能將多種病毒拒之門外。胃酸亦能消灭很多被吞入消化道的病毒。即使病毒突破这些屏障，进入了宿主体内，也还有其他的先天免疫途徑能阻止病毒在体内扩散。比如，宿主会产生一种叫干扰素的激素來杀死被病毒感染的细胞和與之相邻的细胞以阻止病毒繁殖。细胞内部也有能破坏病毒RNA的酶。該過程被稱爲RNA干擾。此外，有些血细胞能吞噬受病毒感染的细胞並將之「摧毀」。
病毒概論
哪里有生命，哪里就有病毒与之共存。活细胞开始进化之初就可能有病毒存在。因为病毒不形成化石，所以它的起源仍然不明。分子生物学方法是推究病毒起源的最有效方法。不过这些方法需要取得古老病毒的DNA或RNA，但現在的實驗室卻鮮有儲存超過90年的病毒。 分子生物学方法只能追溯在二十世纪演化出的病毒的祖先。
病毒
植物具备精巧而有效的防御机制来抵抗病毒感染。其中，最为有效的机制是“抵抗基因”（R基因）。每个R基因能够抵抗一种特定病毒，主要是通过触发受感染细胞的附近细胞的死亡而产生肉眼可见的空点，从而阻止感染的扩散。植物中的RNA干扰也是一种有效的防御机制。当受到感染，植物常常就能够产生天然消毒剂（如水杨酸、一氧化氮和活性氧分子）来杀灭病毒。
病毒分类表
巴尔的摩分类法是基于病毒 mRNA 的生成机制。在从病毒基因组到蛋白质的过程中，必须要生成mRNA来完成蛋白质合成和基因组的复制，但每一个病毒家族都采用不同的机制来完成这一过程。病毒基因组可以是单链或双链的 RNA 或 DNA，可以有也可以没有反转录酶。而且，单链RNA病毒可以是正义（+）或反义（-）。这一分类法将病毒分为7类：
病毒
举一个病毒分类的例子：水痘病毒，即带状疱疹病毒，属于疱疹病毒目，疱疹病毒科，甲型疱疹病毒亚科，水疱病毒属；同时，带状疱疹病毒是巴尔的摩分类法中的第一类，因为它是双链DNA病毒，且不含有反转录酶。
真菌病毒
目前尚不清楚真菌病毒在宿主細胞內的移動是主動或被動的過程，但一般認為它是隨細胞內的原生質流流動，可以隨之流到新生成的菌絲中 。許多研究觀察到真菌病毒的顆粒在孔（septal pores）的附近出現，這些顆粒有可能可以隨著原生質流穿透隔膜孔而在細胞間移動，不受伏魯寧體的阻擋。
传播途径
这是指任何通过性活动（包括性交、肛交或口交）而传染的疾病。性交传播可以透过直接接触或透过分泌物(例如：精液)。受病原体污染的分泌物可以通过通过阴茎，阴道或直肠进入伴侣的血液。
病毒概論
与此同时，其他几位科学家证实，这些后来被称为病毒的媒介虽然与细菌不同，但仍可致病。它们的大小大概是细菌的百分之一。1899年荷兰微生物学家马丁努斯·拜耶林克观察到这种媒介只在分裂細胞中繁殖。他不能确定这种媒介到底是什么，所以就称之为“"contagium vivum fluidum"”（意爲“”）。 20世纪初英国细菌学家弗雷德里克·图尔特发现了能感染细菌的病毒。法裔加拿大籍微生物学家亦在該階段發現，如果把一種病毒加到培養有細菌的琼脂培養基上，那麼這個培養基中的细菌就会成片死亡。通過數出出現細菌大規模死亡的區域數，他就能算出培養基中的病毒数量。
瘟疫
伊波拉病毒、拉薩熱、裂谷熱、-{zh-cn:馬爾堡病毒; zh-tw:馬堡病毒;}-、玻利維亞出血熱都具高度傳染性並且能快速致人於死，理論上將可能造成廣大的流行。然而這些疾病的擴散能力卻也因此受到侷限，患者還不及將病原散佈便喪命，加上這幾種疾病都需要近距離接觸才會傳染，至今尚未在全球發生大流行，但基因突變的可能性，將有機會提高它們的蔓延潛力。
跨物種感染
跨物種感染（Cross-species transmission；host jump）是指病原獲得感染新物種宿主能力，進而感染新宿主、在新宿主個體間傳播的現象，關於此現象的研究以病毒為主，但細菌等其他微生物也可能發生。跨物種感染的第一步為病原與一個新宿主物種個體接觸，其後病原可能逐漸適應新的宿主而造成疾病爆發，是新興傳染病（特別是病毒疾病）的起因之一。多數感染人類的病毒均起源於感染其他動物的病毒，包括SARS-CoV、MERS-CoV、SARS-CoV-2、豬流感病毒、禽流感病毒與伊波拉病毒等。
病毒
无包膜的病毒在宿主细胞内完成复制后，需要宿主细胞死亡并裂解后，才能逸出并进一步感染其他细胞。这种方法虽然简单，但常常造成大量非成熟细胞死亡，反而降低了对宿主细胞的利用率。而有了包膜之后，病毒可以通过包膜与宿主的细胞膜融合来出入细胞，而不需要造成细胞死亡。流感病毒和艾滋病毒就采用的是这种策略。大多数的包膜型病毒的感染性都依赖于包膜。
病毒載體
病毒載體（英語：Viral vectors）是一種常使用於分子生物學的工具，可將遺傳物質帶入細胞。可發生於完整活體（"in vivo"）或是細胞培養（"in vitro"）中。原理是利用病毒具有傳送其基因組進入其他細胞，進行感染的分子機制。可應用於基礎研究、基因療法或疫苗。可供利用的病毒目前有腺病毒、腺相关病毒、逆轉錄病毒（含慢病毒）、巨細胞病毒、仙台病毒，以及流感病毒、麻疹病毒。
病毒概論
病毒的起源至今不明。有些病毒可能是由質粒，即一種可在細胞間移動的環狀DNA進化而來。同時，也有些病毒可能是由細菌進化而來。病毒由兩或三種結構組成。其中，所有病毒都有的兩種結構是化學本質爲DNA或RNA的核酸與保護基因的蛋白質外殼。其中，核酸爲攜帶遺傳訊息的長鏈狀分子。部分病毒還有一個由脂肪構成的包裹着病毒體的病毒包膜。病毒包膜可以在病毒處於宿主細胞胞外時爲它們提供保護。病毒的形狀變化多樣，既有螺旋形、二十面體形的病毒，也有擁有更為複雜的幾何結構的噬菌體。病毒的大小在20納米到300納米之間，把30,000到500,000個病毒一個個緊靠着排列起來才能達到1厘米的長度。
病毒性肺炎
病毒為了複製，必須侵入細胞。典型的情況是，病毒靠著飛沫傳染的方式經嘴鼻吸入後到達肺部。病毒入侵氣道（airways）與肺泡（alveoli）的細胞黏膜組織（cells lining）。這樣的侵入常常導致細胞死亡——不是病毒直接殺死就是經由細胞凋亡（apoptosis）來自我毀滅。
嗜肝DNA病毒
长臂猿：相关研究表明在感染了HBV的类人猿中，HBV的传播的根本途径是垂直传播。但是从长臂猿唾液中HBV的DNA检测得知，水平传播也有可能。如果这些健康的和感染HBV的长臂猿被圈养在相同区域里，他们很有可能通过性接触以及其他水平传播方式感染上HBV 。
性傳染病
有許多的細菌，原生动物，真菌及病毒還不確定是否會透過性行為散播，可能是出目前沒有文獻資料，或是相關研究還很少。除了上述提到的病原體以外，還有許多其他的疾病可能透過性行為傳染。在傳染病中，性行為的傳染途徑影響較小，而且這類的病原因目前不是疾病主要的研究領域，因此診所不會篩檢這些疾病，其中有些疾病已確定會透過性行為傳播。
传播途径
飞沫传播是指通过飞沫而传播的病原体。飞沫通常是通过咳嗽、打喷嚏或说话而产生。新感染者需要接触带有病原体的飞沫并且触摸自己身体上的黏膜， 如眼睛、鼻子和嘴巴。传播也可以是间接的，患者可以通过接触受污染物品来传播。飞沫通常比较大并不能够在空气中悬浮，因此它们传播的距离比较短。
传播途径
通过飞沫传播的病包括一些呼吸道病毒（如流感病毒、副流感病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒、人类偏肺病毒），百日咳杆菌、肺炎双球菌、白喉。
嗜肝DNA病毒
总之，当涉及到血液等体液对感染源的暴露时，动物类疾病的传播始终存在，并引起慢性感染或者急性感染，涉及到这些拥有家庭宠物，饲养员，以及屠夫等的情况。 DHBV：鸭乙肝病毒，只能感染一定种类的鸭和鹅，但是不能感染番鸭或鸡，至少不能有效的感染。
病毒
与一般的细胞生物的遗传物质为双链DNA不同的是，病毒的遗传物质（即病毒基因组）可以为DNA或RNA，可以为单链或双链。从目前已发现的病毒来看，更多的是RNA病毒；其中，植物病毒多为单链RNA病毒，而噬菌体多为双链DNA病毒。不同病毒的遗传物质中的基因结构也各不相同，它们之间的差异性比动物、植物或细菌中任何一个生物域内物种间的差异性都要大。
病毒
20世纪的下半叶是发现病毒的黄金时代，大多数能够感染动物、植物或细菌的病毒在这数十年间发现。1957年，马动脉炎病毒和导致牛病毒性腹泻的病毒（一种瘟病毒）正式发现；1963年，巴鲁克·塞缪尔·布隆伯格发现了乙型肝炎病毒；1965年，霍华德·马丁·特明发现并描述了第一种逆转录病毒；这类病毒将RNA逆转录为DNA的关键酶，即逆转录酶，在1970年由霍华德·马丁·特明和戴维·巴尔的摩分别独立鉴定出来。1983年，法国巴斯德研究院的吕克·蒙塔尼耶和他的同事弗朗索瓦丝·巴尔－西诺西首次分离得到了一种逆转录病毒，也就是现在世人皆知的艾滋病毒（HIV）。其二人也因此与发现了能够导致子宮頸癌的人乳头状瘤病毒的德国科学家哈拉尔德·楚尔·豪森分享了2008年的诺贝尔生理学与医学奖。
嗜肝DNA病毒
垂直传播
輪狀病毒
輪狀病毒總共有七種，分別以英文字母編號為A、B、C、D、E、F與G等。人類主要是受到輪狀病毒A種、B種與C種的感染，而其中最常見的是輪狀病毒A種的感染。而這七種輪狀病毒都會在其他動物身上造成疾病。
戊型肝炎
戊型肝炎的传播途径是通过接触的粪便-口传染。此外通过饮水也可以传播戊型肝炎。至今为止未能观察到通过体液接触的人至人的传播。因此改善卫生和煮沸食水能避免戊型肝炎传播。
非洲豬瘟病毒科
病毒存在於環境時間於冷藏豬肉 100 天、冷凍豬肉 1,000 天、豬舍 1 個月、糞便室溫 11 天。該病以接觸傳染為主，可經由廚餘、節肢動物、動物分泌物或排泄物、車輛及人員夾帶等途徑傳播。
介数中心性
渗流中心性是加权介数中心性的一种特殊情况，它在计算其权重时考虑了每条最短路径的源节点与目标节点的“状态”。 在复杂网络中，许多情景都会发生“感染”并进行渗流。 例如，众所周知，在接触网络中细菌或病毒的感染可以在人群的社会网络中传播。也可以将疾病的传播抽象化，认为一个城镇或人群聚集地是由公路、铁路或航空的连接而构成的网络。计算机病毒可能通过计算机网络传播。关于商业报价和交易的传闻或新闻也可以经由人群的社交网络传播。 在所有这些情景下，一个“感染”可在复杂网络中通过连接传播，并伴随着节点“状态”的改变，如受到感染或感染后恢复到原状态。例如，在一个流行病的情景下，个体在感染传播时会将状态由“易感染”变为“已感染”。 在上述例子中，各个节点在传播时可能的状态可以是二元的（已受到/未受到感染）、离散的（易感染/已感染/已恢复）乃至连续的（如城镇中受感染者的比例）。 在所有这些情景中，常见的特征是传染病的传播使网络中节点状态发生变化。 以上这些有关渗流中心性(PC)的概念由Piraveenan et al.提出，这对具体地测量节点在网络渗透中的重要性很有帮助。
人類免疫缺陷病毒
愛滋病毒是透過交換體液來傳播的，具體是指：最常見的傳染途徑是：進行陰道或肛門性交，共用沾污了的針筒，受病毒感染的母親傳播給嬰兒 (懷孕、分娩或哺乳)。 相反，以下途徑不傳播病毒：正確的避孕套可大幅降低感染HIV的機率，但亦非天衣無縫。
腸道病毒
腸病毒在全球皆有分布，而人類是唯一宿主及唯一感染源。腸病毒具高傳染性，主要經由兩途徑傳染，經由吃到被汙染的食物、水、玩具、口水等或經由呼吸道(飛沫、咳嗽等)傳染，故為了避免被感染應經常正確洗手尤其吃東西前一定洗手、不吃生食、兒童玩具經常清洗與消毒、室內保持良好的通風環境、流行期間避免到公共場所、感染者盡量在家休息至少3-5天，都是預防腸病毒感染有效途徑。大部分的腸病毒感染之臨床症狀都是輕微的類流感症狀，如發燒、喉痛、頭痛、噁心等，典型的疱疹型咽峽炎及手足口病(hand-foot-mouth disease)有時亦可見。疱疹型咽峽炎典型特徵為於咽峽部會出現潰瘍或小水泡。手足口病典型特徵為在手、腳、口腔有隆起紅疹與水泡。大部分的腸病毒感染都屬於自限型疾病，給予保守性的療法如控制發燒、疼痛及適當補充水分、足夠休息等即可控制病情。
病毒
由病毒引起的人类疾病种类繁多。已经确定的如，感冒、流感、水痘等一般疾病，以及天花、艾滋病、SARS、禽流感和2019冠状病毒疾病等严重疾病，还有一些疾病可能是以病毒为致病因子；例如：人疱疹病毒6型与一些神经性疾病，如多发性硬化症和慢性疲勞症候群之间可能相关。此外，原本认为是马類神经系统疾病的致病因子的玻那病毒，现在发现其可能足以引起人类精神疾病。病毒能够导致疾病的能力称为病毒性（virulence）。
病毒
在19世纪末，认为病毒的特性是感染性、具滤过性和需要活的宿主，也就意味着病毒只能在动物或植物体内生长。1906年，哈里森发明了在淋巴液中进行组织生长的方法；接着在1913年，E·斯坦哈特（E. Steinhardt）、C·伊斯雷利（C. Israeli）和R·A·蘭伯特（R. A. Lambert）利用这一方法在豚鼠角膜组织中成功培养了牛痘苗病毒，突破了病毒需要体内生长的限制。 1928年，H·B·梅特蘭（H. B. Maitland）和M·C·梅特蘭（M. C. Maitland）有了更进一步的突破，他们利用切碎的母鸡肾臟的悬液对牛痘苗病毒进行了培养。他们的方法在1950年代得以广泛应用于脊髓灰質炎病毒疫苗的大规模生产。