Jihadi ya Kiislamu ya Misri
Kundi lilijiita lenyewe Jihadi ya Kiislamu الجهاد الإسلامي na "Jeshi la ukombozi wa mahali patakatifu". Lilianza shughuli zake katika dekadi ya 1970. Lilitangazwa marufuku na Umoja wa Mataifa kama kundi linaloshirikiana na Al Qaida. Linaitwa "Jihadi ya Misri" kwa kuitofautisha na vikundi vingine vinavyotumia pia jina la "Jihad". Mwaka 2001 Al Qaida na mabaki ya Jihadi ya Kiislamu ya Misri waliungana kwa jina la 'Qaida al-Jihad'.
Al-Qaeda
Hadi mwisho wa 2004, serikali ya Marekani alitangaza kwamba theluthi mbili ya waandamizi al-Qaeda takwimu kuanzia mwaka 2001 alikuwa alitekwa na kuhojiwa na CIA: Abu Zubaydah, Ramzi bin al-Shibh na Abd al-Rahim al-Nashiri katika 2002; Khalid Sheikh Mohammed mwaka 2003; na Saif al Islam el Masry mwaka 2004. Mohammed Atef na wengine kadhaa waliuawa.