Что означает термин "транскриптом"?
Транскриптом
Транскрипто́м () — совокупность всех транскриптов, синтезируемых одной клеткой или группой клеток, включая мРНК и некодирующие РНК. Понятие «транскриптом» может обозначать полный набор транскриптов в данном организме или специфический набор транскриптов (молекул РНК), представленный в клетках определённого типа.
Словарь бриджа
Техас — заявка, обещающая более старшую масть, как правило — следующую. Принятие Т. означает, что партнёр называет эту масть сам. При этом, например, контракт разыгрывается с более сильной руки. Популярны при безкозырном открытии. Разновидность "трансфера".
Транскриптомные технологии
При изучении транскриптомов создаются огромные объёмы данных, которые потенциально могут быть использованы и в других проектах. Поэтому сырые или обработанные данные размещают в публичных базах данных, чтобы сделать их доступными для всего научного сообщества. Например, по состоянию на 2018 год, база данных Gene Expression Omnibus содержит данные миллионов экспериментов.
Дескриптор
Дескри́птор (от «описывающий») — лексическая единица (слово, словосочетание) информационно-поискового языка, служащая для описания основного смыслового содержания документа или формулировки запроса при поиске документа (информации) в информационно-поисковой системе. Дескриптор однозначно ставится в соответствие группе ключевых слов естественного языка, отобранных из текста, относящегося к определённой области знаний.
Трактат
В этом значении слово "трактат" появляется при переводе с европейских языков названий произведений, где употребляется если не непосредственно (например, «» Спинозы или «Tractatus Logico-Philosophicus» Витгенштейна), то либо . При этом в английском языке для обозначения «кратких обличительных произведений на общественно-политические темы» стали использовать особый термин памфлет (, появился в XIV в.; первоначально означал непереплетённую брошюру без обложки), различая тем самым жанры публицистики (памфлет) и научного труда (трактат). Сама по себе тематика трактатов (философия, естественные науки, религия) не является аргументом в пользу возможности применения этого термина; она просто отражает типичный для средневековья и начала Нового времени тематический набор печатавшихся произведений. Существенным здесь является научно-философское содержание и принадлежность к этой эпохе. При использовании в переносном, шутливом значении (ср. "студенческий трактат") исходным является именно это значение термина.
Транстрав
Транстрав — кинематографический спецэффект, получаемый сочетанием поступательного движения камеры вдоль оптической оси объектива и плавного изменения его фокусного расстояния в обратном направлении. Название, общепринятое в российском кинематографе, получено комбинацией слов «трансфокатор» и «тревеллинг». Однако приём имеет множество других названий: эффект «раздвигающегося пространства», «обратный трекинг», «контр-зум», «телескопирование», «эффект раздвижных фонов» и прочие.
Программная транзакционная память
В компьютерных технологиях, программная транзакционная память () представляет собой механизм управления параллелизмом, аналогичный механизму транзакций баз данных для управления доступом к совместно используемой памяти в параллельных вычислениях. Это альтернатива для синхронизации на основе . Транзакция в этом контексте является частью кода, который выполняет считывание и запись в разделяемую (совместно используемую) память. Считывание и запись логически происходит в единичный момент времени, а промежуточные состояния невидимы для других (результативных) транзакций. Идея обеспечения транзакций аппаратной поддержкой зародилась в 1986 году в работе и патенте . Идея получила публичное освещение благодаря и . В 1995 году и Дэн Тойту дополнили эту идею до программной транзакционной памяти (SТМ). STM по-прежнему находится в центре интенсивных исследований; возрастает её поддержка для практических реализаций.
Транскриптомные технологии
После пробоподготовки молекулы транскриптов (точнее, соответствующих им кДНК) можно секвенировать в одном направлении (одноконцевое прочтение) или в обоих (парноконцевое прочтение). Одноконцевое секвенирование, как правило, быстрее и дешевле, и в большинстве случаев его достаточно для количественной оценки уровней экспрессии генов. Парноконцевое секвенирование позволяет получить более точные выравнивания и сборки, что очень важно для аннотации генов и описания изоформ транскриптов. Методы РНК-Seq, специфичные по отношению к цепи, сохраняют сведения о цепи ДНК, с которой был транскрибирован каждый транскрипт. Без этой информации прочтения можно выровнять на локус, однако будет неясно, в каком направлении происходит транскрипция гена. Одноцепочечный РНК-Seq удобен для определения направления транскрипции , расположенных на разных цепях, что позволяет сделать предсказание генов у немодельных организмов более точным.
Непереводимость
Другие виды каламбура, например, перестановка звуков (частей слов или слов) или перевёртыш (текст, одинаково читающийся слева направо и справа налево), также трудно переводить. Возьмём классический английский палиндром (перевёртыш): «A man, a plan, a canal: Panama». Дословно по-русски звучит так: «Человек, план, канал — Панама!». Такой перевод подходит разве что для заголовка к портрету Теодора Рузвельта (инициатора постройки Панамского канала). Но если нам нужно сохранить каламбур, то необходимо принести в жертву смысл фразы, и в качестве перевода тоже привести перевёртыш. К примеру, для приведенного выше английского палиндрома можно представить такой вариант в русском языке — «Я разуму уму заря, Я иду с мечем судия…» (Державин), или на французском — «'Un roc lamina l’animal cornu» (дословно — «глыба уничтожила рогатое животное»)
Транскриптомные технологии
Первые попытки изучения транскриптома были предприняты в начале 1990-х годов. Благодаря развитию новых технологий в конце 1990-х транскриптомика стала важной биологической наукой. В настоящий момент в транскриптомике есть два основополагающих метода: микрочипы, позволяющие выявить наличие и количество определённых транскриптов, и секвенирование РНК (РНК-Seq), в котором используются методы секвенирования нового поколения для получения последовательностей всех транскриптов. С улучшением методик количество данных, получаемых в ходе одного транскриптомного эксперимента, увеличивалось. В связи с этим методы анализа данных также совершенствовались, чтобы обеспечить точный и эффективный анализ возрастающего объёма данных. Транскриптомные базы данных постоянно растут и становятся всё более полезными для исследователей. Это связано с тем, что правильная интерпретация данных, полученных в ходе транскриптомного эксперимента, практически невозможна без опоры на предшествующие исследования.
Транскриптомные технологии
Для всех транскриптомных методов необходимо выделить РНК из исследуемого организма. Несмотря на огромное разнообразие биологических систем, методика выделения РНК во всех случаях примерно одна и та же. Она включает разрушение клеток и тканей, разрушение РНКаз при помощи солей, разрушение макромолекул и комплексов, содержащих нуклеотиды, отделение РНК от ненужных биомолекул, включая ДНК, концентрирование РНК при помощи из раствора и очищение с помощью специальных . Выделенную РНК также можно дополнительно обработать ДНКазой, чтобы разрушить остатки ДНК. Обычно необходимо концентрирование мРНК, поскольку 98 % выделенной РНК приходится на рРНК. Концентрирование можно произвести с помощью методов, использующих наличие у мРНК поли(А)-хвоста, или путём удаления рРНК с помощью специфических проб. На результаты эксперимента может повлиять разрушенная РНК. Например, если отбирать мРНК из повреждённых РНК, то отобранные молекулы могут быть лишены 5'-концов и привести к искажению данных. Чтобы избежать разрушения РНК, перед её выделением образец обычно подвергают .
Трактат
Тракта́т (от — «подвергнутый рассмотрению») — одна из литературных форм, соответствующих научному сочинению, содержащему обсуждение какого-либо вопроса в форме рассуждения (часто полемически заострённого), ставящего своей целью изложить принципиальный подход к предмету.
Экзом
Экзом — часть генома, представляющая экзоны, то есть последовательности, которые транскрибируются на матричную РНК после того, как интроны удаляются в процессе сплайсинга РНК. Таким образом, экзом отличается от транскриптома, включающего в себя всю совокупность транскриптов.
Полупроводники
Транзистор — полупроводниковое устройство, которое состоит из двух областей с полупроводниками p- или n-типа, между которыми находится область с полупроводником n- или p-типа. Таким образом, в транзисторе есть две области p-n перехода.
Транскриптомные технологии
Выравнивание первичных эукариотических транскриптов на референсный геном требует особое обращение с интронами, которых нет в зрелых мРНК. Программы для выравнивания коротких прочтений могут создавать особые выравнивания, предназначенные специально для идентификации сайтов сплайсинга на основе канонических последовательностей сайтов сплайсинга. Идентификация сайтов сплайсинга предотвращает их ошибочное выравнивание или отбраковывание, позволяя выровнять на референсный геном большее количество прочтений и увеличивая качество количественных оценок экспрессии генов. Поскольку может осуществляться на уровне изоформ мРНК, выравнивания, учитывающие сплайсинг, позволяют обнаружить изменения в численности тех или иных изоформ, что было бы невозможно с помощью обычного анализа.
Транспозиция (музыка)
Транспози́ция ( — перемещение) — многозначный музыкальный термин, относящийся к организации исполнения музыкального произведения или его фрагмента с систематическим сдвигом высот всех звуков на заданный интервал.
Трансдуктивное умозаключение
Трансдуктивное умозаключение ( — перемещение) — умозаключение, в котором посылки и заключение (вывод) являются суждениями одинаковой степени общности, т.е., когда вывод идёт от знания определённой степени общности к новому знанию, но той же степени общности [1].
Например:
Иван — брат Петра;
Пётр — брат Степана;
Следовательно: Иван — брат Степана.
По характеру посылок и вывода трансдукция может быть трёх типов:
1) Заключение от единичного к единичному;
2) Заключение от частного к частному;
3) Заключение от общего к общему.
Инактивация X-хромосомы
Tsix представляет собой длинную молекулу РНК, не кодирующую белок. Транскрипт Tsix является антисмысловым к транскрипту гена Xist, то есть транскрибируется с противоположной цепи ДНК того же гена. Tsix является негативным регулятором Xist; X-хромосомы, не экспрессирующие Tsix и имеющие поэтому повышенный уровень экспрессии Xist, инактивированы намного чаще, чем обычные хромосомы.
Словарь терминов физики полупроводников
Исток — термин, обозначающий один из контактов в полевом транзисторе.
Транзитный участок
Транзитный участок, или переход ( — «прыжок»), — участок сети между двумя узлами сети, по которому передаются сетевые пакеты (или датаграммы). Обычно используется для определения «расстояния» между узлами. Чем больше транзитных участков — тем сложнее путь маршрутизации и тем «дальше» находятся узлы друг от друга.
TopHat
TopHat-Fusion — это алгоритм, разработанный для определения транскриптов, которые получаются в результате слияния генов при разрыве или объединении двух различных хромосом, или при перестройках внутри одной хромосомы. Эта программа является усовершенствованной TopHat и не зависит от , поэтому TopHat-Fusion может обнаружить транскрипты, полученные при объединении известных генов, неизвестных генов и неаннотированных вариантов сплайсинга известных генов. TopHat-Fusion является бесплатным сервисом и доступен на сайте
Трансмутация
Трансмутация (от  «сквозь, через; за» +  «изменение, перемена») — превращение одного объекта в другой. Термин имеет несколько значений:
Транскриптомные технологии
С помощью РНК-Seq можно получить информацию о транскрипции эндогенных ретротранспозонов, которые могут влиять на транскрипцию соседних генов посредством разнообразных эпигенетических механизмов, что может привести к развитию болезней. Важной потенциальной сферой применения РНК-Seq является исследование молекулярных основ нарушений иммунной системы, потому что этот метод позволяет разделить популяции иммунных клеток разных типов и секвенировать репертуары T- и B-клеточных рецепторов пациентов.
Постскриптум
Постскриптум ( — «после написанного») — приписка к законченному и подписанному письму, обычно обозначаемая «"P. S."». Также используют сокращение «"P. P. S."» () для приписки, сделанной после постскриптума. В рунете иногда используют кириллические буквы «ЗЫ» — это PS, набранные русской раскладкой.
Транзакционная интерпретация
Одно из явных изложений дано Крамером (1986), который изобразил транзакцию как четыре вектора стоячей волны, концами которых являются события испускания и поглощения. В других возможных представлениях, изучаемых в настоящее время, транзакция есть пространственно-временной процесс, происходящий на уровне возможностей, а не действительности.
Тракт (жанр)
Тракт, "реже" трактус (лат. "tractus", от глагола "trahere" в значении «растягивать, вытягивать»; по др. этимологии от "tractim" — непрерывно, протяжно) — текстомузыкальная форма и жанр в богослужебном обиходе католической церкви (см. Григорианский хорал). 
Тракт исполняется церковным певчим соло или небольшим ансамблем певчих. Входит в состав проприя мессы, где звучит вместо аллилуйи перед Евангелием в покаянные дни. Тексты тракта обычно заимствованы из Псалтири. Стихи псалмов («версы», от 2 до 14) в тракте поются один за другим, не прерываясь рефренами, свойственными респонсорным формам (этим обстоятельством «непрерывности» псалма часто объясняют и сам термин tractus). Тракт относится к песнопениям мелизматического типа: протяжённые распевы слогов отмечаются как внутри версов, так и в каденциях. Для звуковысотной структуры (гармонии) тракта характерны только второй и восьмой церковные лады.
Транскриптомные технологии
Превалирующие современные методы — микрочипы и РНК-Seq — появились в середине 1990-х и 2000-х соответственно. Публикации по микрочипам, которые измеряли относительное содержание определённых транскриптов за счёт их гибридизации с комплементарными пробами, нанесёнными на микрочип, появились в 1995 году. Метод микрочипов позволял одновременно исследовать тысячи транскриптов, и за счёт этого позволял снизить стоимость исследования транскриптома в расчёте на ген и сэкономить усилия. До конца 2000-х лучшими методами транскрипционного профилинга были пятновые олигонуклеотидные чипы () и микрочипы с высокой плотностью. В течение этого периода было создано множество чипов, покрывающих известные гены модельных и экономически важных организмов. Улучшения технологий создания микрочипов привели к увеличению специфичности проб и количества генов, которые можно проанализировать с помощью одного чипа. Благодаря новым методам детекции флуоресценции стало возможным точно определять наличие и количество даже транскриптов, синтезируемых на низком уровне.
Банковская транзакция
Транза́кция, или транса́кция (, от — соглашение, договор) — в общем случае, любая сделка с использованием банковского счёта. Различают онлайн-транзакции, выполняющиеся в режиме реального времени между всеми заинтересованными сторонами, и офлайн-транзакции.
De novo сборка транскриптома
После построения графа требуется провести дополнительные процедуры по разрешению повторов. Повтор в транскриптоме изменяет граф де Брёйна, склеивая участки графа, соответствующие различным транскриптам. Разрешение повторов — это этап, на котором происходит попытка определить, какой путь в графе на самом деле содержит повтор. Затем происходит разделение повтора, при котором создается по копии повтора для каждого истинного пути.
Транзистор
Ниже приведена формальная классификация транзисторов, где ток образуется потоком носителей заряда, а состояния, между которыми переключается прибор, определяются по величине сигнала: малый сигнал — большой сигнал, закрытое состояние — открытое состояние, на которых реализуется двоичная логика работы транзистора. Современная технология может оперировать не только электрическим зарядом, но и магнитными моментами, спином отдельного электрона, фононами и световыми квантами, квантовыми состояниями в общем случае.
Троллей
Троллей (от  — «тележка, вагонетка») — совокупность проводящего провода (шины) и поддерживающих конструкций, предназначенная для передачи электрической энергии подвижным механизмам, перемещающимся вдоль троллея, а также в некоторых случаях для поддержки этих механизмов или их частей.
Само слово «троллей» заимствовано из английского, где слово "trolley" имеет значение «тележка, вагонетка». Токосъёмник первого троллейбуса, в отличие от нынешних, напоминал по форме тележку.
Трактат (дипломатия)
В этом контексте термин "трактат" восходит к — договор (ср. , ), т.е. напрямую не связан с "трактатом" как литературной формой. Очевидно, здесь имел место эффект «ложных друзей переводчика», и вместо перевода исходного французского "traité" русским эквивалентом «договор» использовали созвучный термин, относящийся к иному объекту. Последствия этой ошибки ощущаются и сегодня, т.к. одновременно возник новый ряд «ложных друзей переводчика»: , соответствуют политическим трактатам не в дипломатическом, а в литературно-жанровом смысле (см. выше), и потому во избежание коллизии при переводе указанных словосочетаний часто используют более узкий по значению термин памфлет.
Рескрипт
Рескри́пт () — в Российской империи с начала XVIII века — правовой акт (личное письмо императора), в частности данное на имя высокопоставленного лица (обычно члена императорской фамилии, министра, митрополита и тому подобное) с выражением ему благодарности, объявлением о награде или возложением на него поручения.
ATSC
Файл с расширением .TS представляет собой так называемый «транспортный поток», который по сути является форматом медиаконтейнера. Этот медиаконтейнер содержит множество потоков аудио и видео, мультиплексированных в единый поток данных. Транспортные потоки разрабатываются при тщательной синхронизации и с последующим восстановлением в памяти с целью не допустить потери данных там, где существует потенциальная угроза этого (например, при вещании ATSC при помощи радиосигнала). Когда радиосигнал ATSC преобразовывается в файл при помощи технических/программных средств, полученный в результате файл часто имеет расширение .TS.
Quid pro quo
Слово "Quid pro quo" используется в контексте транскрипции или переписывания данных текста. Не следует путать с "Quiproquo", которое применяется в театральном контексте. "Quid pro quo" указывает на более или менее равный обмен услугами или товарами.
Гибридные транскрипты
Гибридные транскрипты — это химерная РНК, образовавшаяся при транскрипции гибридного гена или из двух разных генов в процессе транс-сплайсинга. Некоторые гибридные транскрипты синтезируются раковыми клетками, и обнаружение такого рода транскриптов является частью рутиной диагностики определённых видов рака.
De novo сборка транскриптома
Качество секвенирования оценивается с помощью метрики (Q score). Она рассчитывается для каждого нуклеотида по формуле formula_1, где "P" — это вероятность ошибки. При "Q" > 20 можно говорить о хорошем качестве прочтения нуклеотида, то есть вероятность того, что он неверно отсеквенирован составляет 1%. Первичный анализ данных секвенирования (QC report) проводится в программе FastQC. Далее по порогу Q score можно отсекать нуклеотиды с низким качеством с концов прочтения (там качество заметно ниже), а также удалять последовательности адаптеров. Эта процедура называется триммированием.
Динофлагелляты
Показано, что у динофлагеллят экспрессия небольшой, но значимой доли генов зависит от различных условий. Анализ транскриптома "Pyrocystis lunula" с применением микрочипов показал, что количество транскриптов около 3 % генов значительно изменялось в соответствии с циркадными ритмами, а ещё 4 % — с окислительным стрессом. Проводились исследования по различиям транскриптомов токсинообразующих и не образующих токсинов штаммов динофлагеллят. Оказалось, что 4—7 % транскриптомов в этих случаях значительно различаются.
Ваххабизм
Что означает термин «ваххабит»?
Транскриптомные технологии
SAGE и CAGE дают информацию о большем количестве генов, чем секвенирование отдельных EST, однако пробоподготовка и анализ данных в этих методах существенно сложнее.
De novo сборка транскриптома
"De novo" сборка транскриптома не требует наличия референсного генома. Учитывая, что большинство организмов на данный момент еще не отсеквенированы, "de novo" сборка транскриптома таких организмов может быть использована как первый этап в их изучении. Например, для изучения и сравнения траснкриптомов между оранизмами, а также для анализа дифференциальной экспрессии при различных воздействиях на организм. Иногда бывает полезно собирать транскриптом "de novo" даже при наличии референсного генома, так как при этом можно обнаружить транскрибируемые участки, последовательности которых отсутствуют в геномной сборке. Имея "de novo" сборку и референсный геном можно детектировать транскрипты экзогенного происхождения. Самое важное отличие "de novo" сборки в том, что при этом не требуется выравнивать последовательности и решать проблемы поиска или предсказания сайтов сплайсинга, помимо этого удается собирать транскрипты, полученные в результате транссплайсинга. Однако сборка de novo является алгоритмически сложным и вычислительно затратным процессом.Также данный подход отличается высокой чувствительностью к ошибкам.
Транслятор
Трансля́тор — программа или техническое средство, выполняющее "трансляцию программы".
De novo сборка транскриптома
Oases – пакет программ, который предназначен для эвристической сборки транскриптов в отсутствии референсного транскриптома. Использует хэш-таблицу, динамическую фильтрацию шума (удаление «островных контигов», то есть не имеющих соседних контигов в графе де Брёйна и длиной менее 150 нуклеотидов), учитывает события альтернативного сплайсинга и осуществляет эффективное слияние нескольких сборок. Может использовать парно-концевые чтения, а также длинные последовательности для построения изоформ транскриптов.ABySS – ещё один сборщик, использующий парно-концевые чтения. Trans-ABySS – пакет программ, реализованных на Python и Perl, для сборки данных РНК-секвенирования. Может применяется к сборкам, сгенерированным в широком диапазоне k-значений. Сначала Trans-ABySS сводит набор данных к более мелким наборам контигов, находит события альтернативного сплайсинга, включая пропуски экзонов, образование новых экзонов, сохранение интронов, формирование новых интронов и альтернативное сращивание экзонов, после чего объединяет полученные сборки. Также способен оценивать уровень экспрессии генов, идентифицировать потенциальные сайты полиаденилирования и возможные химерные гены, образованные в результате слияния нескольких генов.Этот метод сборки транскриптома делит данные РНК-секвенирования на множество независимых графов де Брёйна (один граф соответствует одному экспрессируемому гену), после чего с помощью параллельных вычислений строит транскрипты из таких графов, включая альтернативные сплайсоформы. Может использовать как парно-концевые чтения, так и одиночные. Отличается понятным интерфейсом, который почти не требует никакой настройки параметров. Trinity состоит из трех независимых программных модулей, которые используются последовательно для создания транскриптов :Inchworm осуществляет сборку данных РНК-секвенирования в последовательности транскриптов. Часто генерирует полноразмерные транскрипты для преобладающих изоформ, а для альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов выдает только уникальные участки.Сhrysalis кластеризует контиги, полученные с помощью модуля Ichworm, и строит полные графы де Брёйна для каждого кластера.Batterfly анализирует графы де Брёйна, после чего выводит все возможные последовательности транскриптов. Сначала объединяет вершины в однозначных путях в графе для получения вершин, соответствующим более длинным последовательностям, и удаляет ребра, поддерживаемые небольим числом чтений. Затем отслеживает пути ридов в полученном графе и выдает последовательности транскриптов.
Интерпретатор командной строки
Конвейер — это последовательность одной или более команд, разделенных |(& для cmd.exe). Стандартный выходной поток каждой команды, кроме последней, соединяется при помощи программного канала со стандартным входным потоком следующей команды. Каждая команда выполняется как отдельный процесс; интерпретатор ожидает окончания последней команды. Статусом выхода конвейера является статус выхода его последней команды. Вот пример простого конвейера для интерпретатора bash :
Рескрипт
Так именовался документ, лично написанный (впоследствии — подписанный) императором, обычно высочайшее повеление (указ) сопровождалось присвоенным рескрипту номером: «…в рескрипте № A» или «рескрипта № B …».
Транскриптомные технологии
Первая попытка получения части человеческого транскриптома была предпринята в 1991 году; в ходе этого исследования были получены последовательности 609 мРНК из мозга человека. В 2008 году были опубликованы два человеческих транскриптома, состоящие из миллионов последовательностей, происходящих от транскриптов 16 тысяч генов. К 2015 году были опубликованы транскриптомы сотен людей. Получение транскриптомов индивидуумов с тем или иным заболеванием, разных тканей и даже одиночных клеток в настоящее время является рутинной процедурой. Бурное развитие транскриптомики было возможно благодаря быстрому развитию новых экономичных технологий с повышенной чувствительностью.
Транскриптомные технологии
Сериальный анализ экспрессии генов является дальнейшим развитием технологии EST с большей выработкой меток. Он также позволяет провести некоторый количественный анализ численности транскриптов. РНК сначала переводится в кДНК, затем она разрезается на метки длиной 11 нуклеотидов с помощью рестриктаз, которые вносят разрывы в определённые последовательности ДНК. Полученные метки сшивают по типу «голова к хвосту» в длинные фрагменты длиной более 500 нуклеотидов, которые секвенируют с помощью низкопроизводительных, но дающих длинные методов, таких как секвенирование по Сэнгеру. Далее последовательности снова делят на 11-нуклеотидные кусочки с помощью специальных компьютерных программ (деконволюция). Если референсный геном недоступен, то полученные метки можно непосредственно использовать в качестве диагностических маркеров, которые в случае болезни экспрессируются иначе, чем в здоровом организме.
Транзит (экономика)
Транзит (, предлог «сквозь» «через» и глагол «trans+ire» «проходить» > причастие «transitum» прошедший, проходящий) — важная отрасль в истории прошлой и современной мировой экономики, имеющая чётко выраженный посреднический характер. Транзит — это учёт грузов, проходящих по территории страны на протяжении определённого периода времени. Транзит является важной ценовой составляющей логистического процесса транспортировки груза от производителя к потребителю и имеет сложную многослойную структуру. Основные проблемы транзита — соблюдения правил безопасности, а также целого ряда экологических, юридических норм международного и внутригосударственного уровня.
Транзит вносит существенный вклад в бюджет многих государств-транзитёров, которые сами не располагают существенными ресурсами и предпочитают фокусироваться на логистике и созданию инфраструктуры для облегчения процесса транзита.
Транскриптомные технологии
Экспрессируемые метки последовательностей (EST) — это короткие нуклеотидные последовательности, полученные из целого транскрипта. Поскольку EST можно получить без какой-либо специфики относительно организма, из которого выделена РНК, их можно получить из смеси организмов или образцов, взятых из окружающей среды. Хотя в настоящее время чаще всего используется высокопроизводительное секвенирование, EST активно использовали при разработке первых микрочипов. Например, микрочип ячменя был получен из 350 тысяч предварительно секвенированных EST.
Контрафактура
Контрафакту́ра ("нем." Kontrafaktur, от ; ) — подтекстовка вокальной мелодии новыми стихами взамен первоначальных.
Транскрипт (биология)
Примерами транскриптов являются: мРНК, рРНК, тРНК, малые РНК.
PCI
Транзакция состоит из 1 или 2 циклов адреса (2 цикла адреса используются для передачи 64-битных адресов, поддерживаются не всеми устройствами, дают поддержку DMA на памяти более 4 Гб) и одного или многих циклов данных. Транзакция со многими циклами данных называется «пакетной» (burst), понимается как чтение/запись подряд идущих адресов и даёт более высокую скорость — один цикл адреса на несколько, а не на каждый цикл данных, и отсутствие простоев (на «успокоение» проводников) между транзакциями.
Транскриптомные технологии
Обычно транскриптомика рассматривает только мРНК клетки. Однако те же методы можно применить и к некодирующим РНК, которые участвуют в трансляции, репликации геномной ДНК, сплайсинге и регуляции транскрипции. Многие из этих некодирующих тРНК связаны с развитием болезней, в том числе рака, сердечно-сосудистых заболеваний и .
Retroscripting
Retroscripting — это термин, означающий написание сценария по импровизированному материалу в кинематографе, а на телевидении — перезапись диалогов.
Трактат (дипломатия)
Тракта́т, в системе категорий международного права и истории дипломатических отношений России — одна из разновидностей соглашений ("собирательное знач.": convention), наряду с договором, соглашением (accord, arrangement), конвенцией (convention), декларацией (declaration), пактом (pact), протоколом (protocol) и пр. С одной стороны, каждому элементу этого категориального ряда соответствуют чёткие формы документов, для которых определяется различный порядок оформления и вступления в силу (парафирование, ратификация и пр.). С другой, исключительные случаи специального именования ограничиваются только конкретными документами, и не создают прецедента переименования (употребления как синонима) в отношении других, аналогичных по статусу, международных актов.
Транскриптомные технологии
С помощью РНК-Seq можно находить изменения в экспрессии генов у человеческих патогенов, что может помочь идентифицировать новые , предсказывать устойчивость к антибиотикам, а также понять детали . С помощью РНК-Seq можно разработать оптимизированные меры , а также направленные индивидуальные стратегии лечения.
Постскриптум (театр)
До 2004 года существовал под именем театра «На пятом этаже». В 2004 году театр переехал из ДК Метростроя в ДК им. А. В. Луначарского. Руководство ДК и фабрики (которой принадлежит ДК) выделило помещения для костюмов и реквизита. Началась модернизация освещения. Под новым названием "Постскриптум" - театр шагнул к новым решениям.
Транскриптомные технологии
В ходе пробоподготовки для секвенирования фрагменты кДНК, соответствующие транскриптам, можно размножить с помощью ПЦР так, чтобы повысить численность молекул, содержащих необходимые 3'- и 5'-концевые . Стадия амплификации также необходима перед секвенированием образцов с очень низким содержанием РНК. Нижним пределом количества РНК, которое пригодно для секвенирования, является 50 пикограмм. Чтобы оценить качество библиотеки и секвенирования (GC-состав, длина фрагментов, предпочтение фрагментов с определённым положением в транскрипте), можно использовать контрольные . () — это короткие случайные последовательности, которые используются для индивидуального мечения фрагментов при приготовлении библиотеки таким образом, чтобы после добавления идентификатора каждый фрагмент был уникален. С помощью UMI можно измерить численность транскриптов в абсолютной шкале, чтобы скорректировать отклонения, возникшие при создании библиотеки, перед амплификацией, а также чтобы точно оценить количество ДНК в исходном образце. UMI особенно удобны для РНК-Seq одиночных клеток, в которых исходное количество РНК очень мало и требует неспецифичной амплификации.
Инскрипт
Инскри́пт (от [inscribo] — надпись, заглавие) — рукописная дарственная надпись на книге, грампластинке, оттиске, портрете, фотографии, антикварном предмете.
Транскриптомика одиночных клеток
Метод заключается в добавлении универсального праймера к 5’ концу после гомополимерного хвоста или . Для добавления гомополимерного хвоста длиной примерно в 30 нуклеотидов поли(А) к 3’ концу первой цепи кДНК используется концевая дезоксинуклеотидил-трансфераза. У этого подхода есть два основных недостатка. Из-за склонности ревертазы к раннему прерыванию 5’ конец имеет значительно меньшее покрытие. Кроме того, после добавления поли(А) хвоста к 3’ концу кДНК вдобавок к обычному поли(А) хвосту на 3’ конце РНК (то есть на 5' конце соответствующей кДНК) становится невозможно понять, с какой цепи ДНК эта РНК была изначально транскрибирована.
Транзитный штемпель
Транзи́тный ште́мпель () — в филателии календарный почтовый штемпель, проставляемый на оборотной стороне конверта (оболочки) почтового отправления и обозначающий почтамт или почтовое отделение по пути следования (транзитом), обмена почтой или сортировки почтового отправления.
В роли транзитного штемпеля выступают обычные календарные почтовые штемпели, и, как правило, только по их расположению на оборотной стороне корреспонденции и по календарным датам на них можно определить их транзитную функцию. Транзитные штемпели не следует смешивать со штемпелем исходящей корреспонденции, который также ставится на обороте конверта как почтовый штемпель почтового отделения, доставляющего почтовое отправление адресату. Впрочем, транзитные штемпеля и штемпеля исходящей корреспонденции иногда для удобства или в силу местных почтовых правил ставятся на лицевой стороне конверта.
Транспьютер
Транспью́тер () — элемент построения многопроцессорных систем, выполненный на одном кристалле большой интегральной схемы, продукт английской компании (ныне — подразделение STMicroelectronics).
Термин "транспьютер" происходит от слов «транзистор» () и «компьютер», по мнению разработчиков, такое название должно было подчёркивать возможность построения сложных вычислительных комплексов на базе транспьютеров, где их роль уподоблялась бы роли транзисторов, выступающих основным элементом при проектировании электронных схем. Другая интерпретация — "trans-put-er" — «"тот, кто передаёт"», указывает на присутствие встроенных скоростных устройств ввода-вывода для обмена с соседними процессорами.
Transaxle
Transaxle («Трэнсэ́ксл», «Трансэ́ксл») — от англ. "transmission" и "axle", «трансмиссия» и «ведущий мост» — трансмиссионный агрегат автомобиля, включающий в себя коробку передач и главную передачу, конструктивно объединённые в едином корпусе (картере). Трансэксл может устанавливаться как отдельно от двигателя, так и в едином блоке с ним.
Транскриптомные технологии
Измерение уровня экспрессии определённых генов в клетках разных тканей и при разных условиях или же в разные моменты времени даёт информацию о регуляторных механизмах, связанных с экспрессией генов. С помощью этих данных могут быть определены функции ранее генов. Анализ транскриптомов позволяет выявить различия в экспрессии определённых генов у разных организмов, что может быть особенно полезно для понимания молекулярных основ заболеваний человека.
Количественный анализ экспрессии генов
Количественный анализ экспрессии генов — анализ транскриптома, измерение транскрипционной активности гена, с помощью определения количества его продукта, матричной РНК (мРНК), универсальной для большей части генов.
PostScript
Для монохромных устройств — например для фотонабора, решение о закрашивании (засветке) пикселя может приниматься в результате сравнения вычисленного для данного пиксела значения "transfer function" и значения т. н. "Spot"-функции либо двумерного массива "Threshold array" [6, pp. 484–490], [15]: в случае, если значение "transfer function" больше значения "Spot"-функции или элемента "Threshold array" для этого пиксела последний закрашивается (засвечивается).
Специальный подбор "transfer function" и "Spot"-функции или "Threshold array" позволяет получить отношение числа закрашенных и незакрашенных пикселей устройства вывода для каждого пиксела исходного (растрируемого) изображения таким, что на оттиске (отпечатке) "средняя" яркость соответствующего участка изображения почти пропорциональна значению вычисленного параметра (см. выше).
Трактура
Тракту́ра (, и "tirage", ; от — тяга, тягловая сила) орга́на — совокупность агрегатов и механизмов, обеспечивающая связь клавиш органа (а также педалей, рычагов и прочих элементов, расположенных на консоли) с клапанами (вентилями) и другими устройствами, открывающими или закрывающими доступ нагнетаемого воздуха к органным трубам.
Транспозиция (музыка)
Конкретизация термина зависит от того, как и зачем осуществляется такой сдвиг. Транспозиция в рамках замысла автора произведения (например, мелодия один раз должна прозвучать ниже, а другой раз выше, что отражено нотной записью) является композиционным приёмом. Транспозиция за счёт конструкции ряда инструментов (скажем, в синтезаторе с функцией , когда абсолютная высота извлекаемых звуков не соответствует нотированию) является свойством этих инструментов. Транспозиция, выполняемая непосредственно исполнителем путём переноса каждой ноты по сравнению с имеющимся нотным текстом, является особым видом техники чтения нот. Последнее практикуется вокалистами и их концертмейстерами; при равномерной темперации, транспонированное сочинение обычно воспринимается слушателями как почти эквивалентное исполняемому в оригинальной тональности.
Magic Cap
Telescript — объектно-ориентированный язык программирования и библиотека времени выполнения, разработанные для создания переносимых графических интерфейсов, приложений, программных агентов, удалённых сценариев и других разновидностей распределённых вычислительных систем. Средой выполнения программ на языке Telescript является операционная система Magic Cap. Она предоставляет программам графический интерфейс, подсистему ввода-вывода, сетевые и другие сервисы.
Транскриптомные технологии
Слово «транскриптом» () было введено в употребление в 1990-х годах. В 1995 году появился первый транскриптомный метод, основанный на секвенировании, — (), который заключался в секвенировании по Сэнгеру соединённых фрагментов случайных транскриптов. Количество транскриптов оценивалось по числу совпадений с фрагментами известных генов. Вскоре появился вариант SAGE, использующий вместо секвенирования по Сэнгеру технологии секвенирования нового поколения — цифровой анализ экспрессии генов (). Однако эти методы практически полностью были вытеснены методами высокопроизводительного секвенирования целых транскриптов, которые давали дополнительную информацию о транскрипте, например, сведения о сплайсинговых вариантах.
Транскриптомика одиночных клеток
Транскриптомика отдельных клеток (англ. ) — область биологических исследований, в которой основным инструментом служат методы количественного анализа экспрессии генов в индивидуальных клетках. Эти методы сочетают в себе современные технологии секвенирования РНК отдельных клеток ("scRNA-Seq" от англ. single-cell RNA sequencing) и последние достижения микрогидродинамики. Они позволяют решить проблему «усреднённых» данных, получаемых при традиционном секвенировании массовых популяций клеток.
Hurd-транслятор
Трюк состоит в том, чтобы поместить транслирующую программу между действительным содержимым транслируемого файла и пользовательской программой и соответственно пользователем, который получает доступ к этому файлу. Такая транслирующая программа называется транслятором, потому что она способна обрабатывать поступающие запросы различными способами. Другими словами, транслятор это сервер, работающий в системе Hurd, который предоставляет базовый интерфейс файловой системы.
De novo сборка транскриптома
С развитием технологий секвенирования следующего поколения, получение фрагментов (ридов) стало на порядок дешевле, но размер фрагментов стал меньше. Для сборки из коротких прочтений было предложено использовать графы де Брёйна. Вершинами графа де Брёйна являются возможные "k"-меры (строки длины "k"), выделенные из исходных прочтений. Два "k"-мера, соединяются в графе ребром, если они являются префиксом и суффиксом "k+1"-мера, также представленного в исходных прочтениях. Ребром является "k+1"-мер.
Таргум
«Таргум» (, мн.ч.: targumim, букв. «перевод, интерпретация») — общее название для переводов Ветхого Завета на арамейский язык.
Транскриптомные технологии
Методы транскриптомики позволяют проводить параллельные эксперименты со множеством образцов, поэтому для получения результатов как с помощью РНК-Seq, так и с помощью микрочипов необходима серьёзная вычислительными методами. Данные с микрочипов представляют собой изображения с высоким разрешением, поэтому обработка данных включает () и спектральный анализ. Изображения, полученные с микрочипов, достигают размера 750 Мб, в то время как обработанные данные занимают 60 Мб. Множество коротких проб, соответствующих одному и тому же транскрипту, могут позволить определить экзон-интронную структуру гена, поэтому для определения достоверности финального сигнала необходимы статистические модели. В ходе экспериментов РНК-Seq получаются миллиарды коротких последовательностей ДНК, которые необходимо выровнять на референсный геном, включающий миллионы или миллиарды п. о. Сборка транскриптома "de novo" требует построения весьма сложных . Операции обработки данных РНК-Seq требуют многократного повторения, поэтому для них могут удобны параллелизованные вычисления, однако с использованием современных алгоритмов обработку данных простых транскриптомных экспериментов, не требующих сборки "de novo", можно осуществить даже на обычном персональном компьютере. Человеческий транскриптом можно достаточно точно собрать из 300 миллионов 100-нуклеотидных прочтений, полученных с помощью РНК-Seq. Для хранения такого объёма данных в сжатом требуется 1,8 Гб дискового пространства на образец. Обработанные численные значения для каждого гена занимают ещё меньше памяти, сопоставимо с обработанными данными с микрочипов. Данные о последовательностях можно хранить в публичных данных, таких как SRA (от  — архив прочтений последовательностей). Набор данных РНК-Seq можно загрузить в базу данных Gene Expression Omnibus.
Транскрипция (лингвистика)
Учеными выделены регулярные соответствия между различными системами алфавитного письма, но перед письменным переводчиком иноязычных текстов часто стоит задача выбора оптимального способа передачи собственных имен (личных имен и географических названий), названий инокультурных реалий на язык перевода. Этот выбор (в случае алфавитной письменности языка исходного текста) происходит между максимально возможной передачей звучания (транскрипцией) и передачей буквенных соответствий — транслитерацией (которая, естественно, невозможна при идеографической письменности источника) и переводчик вынужден искать компромиссы. Компромиссным вариантом считается практическая транскрипция, учитывающая не только звуковые, но и буквенные соответствия. Её используют и современные компьютерные программы, помогающие переводить; примером может служить опирающийся на исследования российских лингвистов инструмент «Транскриптор» на сайте Артемия Лебедева.
Сервер базы данных
Транзакция — совокупность логически взаимосвязанных запросов, направленных на согласованное изменение некоторого множества строк в одной или нескольких таблицах БД. Обычно при выполнении транзакций обновляется несколько таблиц и индексов, связанных с этими таблицами. Для того чтобы гарантировать синхронизацию обновления и целостность данных, в серверах обычно используется принцип «все или ничего», означающий, что в БД вносятся либо все обновления или ни одно из них. С этой целью ведется журнал транзакций, в котором регистрируется информация обо всех затребованных изменениях. Этот журнал обеспечивает возможность «прокрутить назад» совершенные транзакции и восстановить предыдущее состояние БД. Это становится важно, когда изменения в БД, предусмотренные в одной транзакции, реализованы лишь частично, например, из-за сбоя аппаратуры.
De novo сборка транскриптома
Геномы большинства организмов сложны для сборки из-за большого размера, а также повсеместно встречающихся повторов. Транскриптомы же организмов, состоящие из последовательностей РНК, из которых в процессе сплайсинга вырезаются интроны, гораздо меньше по размеру и количеству повторов. Поэтому гораздо дешевле секвенировать транскриптом, чем геном. Последовательность генома - эта наиболее полная информация об организме, однако реализация генетической программы порой гораздой важнее и инетереснее, чем сама программа. Поэтому узнать о том, какие участки генома транскрибируются и какие продукты они дают, можно при помощи технологии секвенирования RNA-seq. Транскриптомные данные почти всегда необходимы для точной аннотации генома. Что касается технической стороны обработки данных, алгоритмы сборки геномов плохо работают в случае неравномерного покрытия ридами, а в случае транскриптома гены могут иметь очень разное покрытие из-за разницы в уровнях эксрессии.
Трансдукция (языковая трансформация)
Понятие трансдукции () было предложено К. Хенгстом. В отличие от перевода, характерным примером трансдукции является опубликованный в реферативном сборнике реферат на русском языке научной статьи, первоначально опубликованной, скажем, на английском языке.
Компьютерная программа
Интерпретируемые программы, для которых, как правило, не применяется процесс компиляции и которые интерпретируются операционной системой или специальными программами-интерпретаторами, называются скриптами или «сценариями».
Количественный анализ альтернативного сплайсинга
Cuffdiff генерирует более точную оценку изменений в экспрессии генов, по сравнению с другими существующими подходами. Cuffdiff предполагает, что экспрессия транскрипта в каждом условии может быть измерена путём подсчета количества фрагментов сгенерированная им. Таким образом, изменение в уровне экспрессии транскриптов измеряется путём сравнения количества фрагментов каждом условии. Если возможность увидеть изменение достаточно мало по соответствующей статистической модели, то транскрипт считается значительно экспрессируемым.
GFF (формат файла)
• "transcript_id" — уникальный идентификатор для предсказанного транскрипта; если он не
указан, тогда нет транскрипта, связанного с описанным элементом.
Программирование эфира
Кросспрограммирование подразумевает использование взаимосвязи между двумя программами — кроссовера — когда персонажи и сюжетные линии из одного фильма или шоу включаются в содержание другого.
Транскриптомные технологии
Для сборки транскриптома "de novo" производится выравнивание прочтений друг на друга, что позволяет реконструировать полноразмерные транскрипты без использования референсного генома. Сложностями сборки "de novo" являются необходимость больших вычислительных мощностей, чем для сборки на основе референсного генома, дополнительной проверки вариантов и фрагментов генов и дополнительной аннотации собранных транскриптов. Первые метрики, предназначенные для оценки качества сборки транскриптома, такие как N50, были признаны ошибочными, и в данный момент доступны усовершенствованные методы оценки. Метрики, основанные на аннотации, хорошо подходят для оценки степени сборки генома. Транскриптом, собранный "de novo", может быть использован в качестве референсного при выравнивании последовательностей и количественном анализе экспрессии генов.
PostScript
PostScript — больше, чем типичный язык управления принтером, он является полнофункциональным языком программирования. Многие прикладные программы могут преобразовать документ в PostScript-программу, при выполнении которой будет получен начальный документ. Эта программа может быть послана непосредственно на принтер с поддержкой PostScript или преобразована интерпретатором PostScript в другой формат (для принтеров без поддержки PostScript), или результат её выполнения интерпретатором может быть показан на экране. Так как исходная PostScript-программа одна и та же, PostScript называется "независимым от устройства".
Транскриптомные технологии
Количественный анализ выравниваний прочтений может быть произведён на уровне гена, экзона и транскрипта. Типичным результатом анализа является количество прочтений для каждого элемента анализа (гена, экзона или транскрипта). Например, для генов она выдаётся в формате general feature format (GFF). Количество прочтений для генов и экзонов можно определить при помощи разных программ, например, HTSeq. Анализ на уровне транскрипта более сложен и требует привлечения вероятностных методов для оценки численности транскрипта на основании коротких прочтений; например, это может выполнить программа cufflinks. Прочтения, одинаково хорошо ложащиеся на разные места в геноме, должны быть идентифицированы и удалены либо выровнены на одно из возможных мест либо на наиболее вероятное из них. Некоторые методы оценки вовсе не предполагают выравнивания прочтения на референсный геном. Например, метод, используемый в программе kallisto, объединяет псевдовыравнивание и количественный анализ в один шаг, который идёт на два порядка быстрее, чем методы программ tophat и cufflinks, и требует меньших вычислительных затрат.
Транскриптомные технологии
Чувствительность и точность РНК-Seq определяются числом прочтений, полученных с каждого образца. Для достаточного покрытия транскриптома необходимо очень много прочтений, что позволяет обнаружить даже малочисленные транскрипты. Дополнительные сложности создаёт этап секвенирования, дающего прочтения ограниченной длины, различной точности и качества. Более того, организмы каждого вида имеют разное количество генов, поэтому для эффективной сборки транскриптома для каждого вида необходимо разное число прочтений. На ранних этапах это количество определялось эмпирически, однако с развитием технологий необходимое покрытие стало возможным предсказывать вычислительными методами. Наиболее эффективным способом улучшения точности выявления дифференциальной экспрессии низкоэкспрессируемых генов является не увеличение числа прочтений, а увеличение . В настоящий момент Энциклопедия элементов ДНК рекомендует 70-кратное покрытие экзома для обычного РНК-Seq и до 500-кратного покрытия для обнаружения редких транскриптов и изоформ.
Низкорамный трал
Трал — термин применяется в русскоязычном секторе перевозчиков грузов и в строительной отрасли.
Тралами в обиходе называют прицепную тяжеловозную технику — полуприцепы и прицепы.
Hurd-транслятор
До того как пытаться разобраться в том, что такое транслятор, необходимо познакомиться с тем, что из себя представляет обычная файловая система (ФС). Файловая система это набор построенных иерархически каталогов и файлов.
Для получения доступа к любому файлу используется текстовая строка, которая есть ни что иное как путь к файлу. Далее, существует технология создания и использования символьных ссылок, которые позволяют через себя обращаться к единственному файлу из каталогов, расположенных в разных местах в иерархическом дереве каталогов, также есть возможность создания жёстких ссылок, которые позволяют назначить единственному файлу сразу несколько имён. Также существуют специальные файлы устройств для обеспечения обмена данными с драйверами устройств, расположенными в ядре системы, и также есть каталоги, которые служат в качестве точек монтирования для разделов жёстких дисков и других устройств хранения данных. И ещё существуют файлы принадлежащие к типу FIFO.
Трансфер
Основные значения термина:
Траншейный стенд
Траншейный стенд, также англиц. трап (от ) — площадка для проведения соревнований по стендовой стрельбе. Траншейный стенд отличается от круглого тем, что стрелковые номера располагаются по прямой линии. Соревнования на траншейном стенде входят в программу Олимпийских игр с 1900 года.
Nonstop-деградация
У бактерий для высвобождения зависшей рибосомы имеется особый механизм транс-трансляции. Ключевые молекулы, участвующие в этом процессе — особая транспортно-матричная РНК (тмРНК) и белок SmpB. тмРНК связывается с А-сайтом «зависшей» рибосомы, причём на конце участка, взаимодействующего с рибосомой, присоединена аминокислота аланин. Неподалёку от неё с тмРНК связан SmpB. Рибосома начинает транслировать тмРНК, при этом к полипептиду, синтезированному с дефектного транскрипта, прикрепляется особая аминокислотная последовательность (она считывается с тмРНК), которая направляет полипептид на деградацию. Рибосома, закончившая трансляцию тмРНК, диссоциирует и освобождается.
Трансфер
Тра́нсфе́р (от  — переносить, перемещать, лат. trānferre) — термин, использующийся в русском языке в туристской, банковской, инновационно-экономической, спортивной, швейной, психологической и иных тематиках.
Трансакционные издержки
"Трансакцией" называется любая передача или переполучение права распоряжения имуществом или услугой в процессе обмена между двумя и более участниками договора. Движущей силой подобных процессов в рамках экономической теории выступает, в первую очередь, эффективность, направленная на бережливое использование ограниченных ресурсов. Ограниченными в данном случае могут быть не только производственные факторы, но и средства на организацию и проведение обмена. Трансакция считается эффективной, если выбранная участниками форма договора приводит к наименьшей сумме производственных и трансакционных издержек.
Уильямсон делит трансакционные издержки на следующие категории:
Транскриптомные технологии
С помощью РНК-Seq можно идентифицировать гены в геноме или установить, какие гены активны в данный момент времени. На основании количества прочтений можно точно установить относительный уровень экспрессии генов. Методология РНК-Seq постоянно совершенствуется, преимущественно за счёт улучшения технологий секвенирования, которые повышают производительность и точность метода, а также выдают прочтения всё большей длины. Со времени первых публикаций в 2006 и 2008 годах РНК-Seq интенсивно внедрялся в исследования и к 2015 году догнал микрочипы, став вторым доминирующим транскриптомным методом.
Транскриптомные технологии
Сборка прочтений РНК-Seq не зависит от референсного генома, поэтому этот метод идеально подходит для изучения экспрессии генов у немодельных организмов, для которых ещё нет готовых геномных данных. Например, база данных однонуклеотидных полиморфизмов, которая использовалась в программах по размножению псевдотсуги Мензиса, была создана при транскриптомном анализе "de novo" при отсутствии секвенированного генома. Схожим образом гены, участвующие в развитии сердечной, мышечной и нервной тканей у омара, были идентифицированы путём сравнения транскриптомов разных тканей без использования последовательности генома. РНК-Seq также можно использовать для обнаружения ранее неизвестных в уже секвенированных геномах.
Транзистор
«Открытым коллектором (стоком)» называют включение транзистора по схеме с общим эмиттером (истоком) в составе электронного модуля или микросхемы, когда коллекторный (стоковый) вывод не соединяется с другими элементами модуля (микросхемы), а непосредственно выводится наружу (на разъем модуля или вывод микросхемы). Выбор нагрузки транзистора и тока коллектора (стока) при этом оставляется за разработчиком конечной схемы, в составе которой применяются модуль или микросхема. В частности, нагрузка такого транзистора может быть подключена к источнику питания с более высоким или низким напряжением, чем напряжение питания модуля/микросхемы. Такой подход значительно расширяет рамки применимости модуля или микросхемы за счет небольшого усложнения конечной схемы. Транзисторы с открытым коллектором (стоком) применяются в логических элементах ТТЛ, микросхемах с мощными ключевыми выходными каскадами, преобразователях уровней, шинных формирователях (драйверах) и т. п.
PostScript
Процесс рисования (растрирования) при выполнении (интерпретации) "PostScript"-программы заключается в вычислении для каждого пиксела устройства вывода одного (для монохромного) или нескольких (например четырёх для "CMYK"-устройства или шести для "CMYKOrGr") значений параметра (-ов) в диапазоне от 0 до 1,0.
Вычисленное значение параметра (-ов) используется в качестве аргумента ещё одной важной функции — "transfer function" [6, pp. 478–480] (русскоязычный синоним — отображение). По умолчанию в подавляющем большинстве случаев эта функция представляет собой простейшую функцию y(x)=x и её значение тождественно равно значению аргумента. Однако в ряде случаев — например для компенсации растискивания используются достаточно сложные нелинейные зависимости y(x), задаваемые кусочной либо табличной аппроксимацией. Кусочно-линейная аппроксимация "transfer function" используется например в "EPS-" и "PS"-файлах "Adobe Photoshop" — для аппроксимации используется разбивка области определения [0;1,0] на сорок участков с шагом 0,025 (2,5 % растровой точки); на каждом из сорока участков "transfer function" имеет вид y(x)=b·x+a. "Transfer function" вида y(x)=1-x (в терминах "PostScript language" codice_23) обращает изображение, делая из него негатив — именно таким образом печатают негатив "PostScript"-принтеры.
Трансклюзия
Используя Ajax, скрипт, прилагающийся к HTML-документу, может попросить браузер изменить часть документа. Раньше же требовалось загружать с сервера новую версию страницы целиком. Такие скрипты могут вставлять элементы или документы с сервера с помощью трансклюзии уже после того, как браузер отобразил страницу, например, по запросу пользователя или реагируя на внешние изменения.
Кросспол
Кросспол (реже кросс-пол) — общеупотребительный в среде ролевиков постсоветского пространства термин, обозначающий распространённую практику антуражного отыгрыша игроком (чаще женского пола) на ролевой игре живого действия персонажа другого пола, своеобразный аналог театрального амплуа травести. Для обозначения практикующих кросспол игроков женского пола иногда применяется происходящий из среды толкинистов более широкий термин «нистано» (мн. ч. — «нистанор»; в переводе с искусственного языка квенья — буквально «[мужчина] рождённый женщиной»).
Анжамбеман
Анжамбема́н, или анжамбма́н ( от «перешагивать», «перепрыгивать»), также просто перенос в стихосложении — один из эффектов расхождения между синтаксическим и ритмическим строением стихотворного текста: несовпадение границы стихотворных строк с границей между синтагмами.