수원역
경부선 상의 수도권 전철 1호선과 분당선의 환승역이며, 현재 분당선의 종점이다. 2003년 4월 29일까지 수도권 전철 1호선은 모두 이 역에서 시·종착하였으나, 병점역과 그 이남 노선 개통 이래 1호선 열차는 현재 이 역에서 시·종착하지 않는다. 분당선의 지하 수원역은 2013년 11월 30일 분당선 연장 개통과 함께 신설되었는데, 한동안 수도권 서부본부 관할인 기존 수원역과 별도로 수도권 동부본부 관할이었으나, 2014년 6월에 분당선 수원역을 경부선 수원역에 흡수시키는 형태로 관할을 일원화하였다.
수도권 전철 4호선
금정에서 시종착하는 열차는 첫차와 막차에 2편성씩 존재하며 막차 1편성은 다시 운행하고 마지막 편성은 금정역에서 야간대기한다. 산본에서 시종착하는 열차는 첫차에 1편성, 막차에 2편성이 운행하며, 막차 1편성은 산본역에서 야간대기를 한다. 안산역 - 인덕원역 운행 계통과 경부선으로 직결하는 운행 계통은 폐지되어 지금은 운행하지 않는다.
2010년부터 안산역을 출발하여 중앙, 상록수, 산본, 금정역과 이후 모든 역에 정차하는 급행이 신설되었으며, 2014년 9월 1일부터 안산 방면 급행이 신설되었다. 2017년 7월 10일부터는 신설되는 수인선 급행과의 연계를 위해 오이도역으로 급행을 연장한다. 이는 같은 날 신설되는 수인선 급행과의 연계를 위한 조치이다. 추후 급행열차 확대 일환으로 과천선도 대공원역, 정부과천청사역 대피선 설치 등 시설개량을 거쳐 급행열차를 운행할 계획이 있다.