미토콘드리아
내막은 구불구불 접혀져 있기 때문에 막 표면적이 넓어져 ATP생성 능력을 높여준다. 이러한 내막이 늘어난 부분을 크리스테라고 하고, 이런 구조형태를 '크리스테 구조' 라고 한다.
예를 들어 간의 미토콘드리아는 크리스테를 포함한 내막 표면적이 외막의 5배에 달하며 근육세포와 같이 더 많은 ATP를 요구하는 세포의 경우 간세포의 경우보다 더 많은 크리스테를 가지고 있다
세포자살
-사이토크롬 c가 미토콘드리아 외막에 형성된 채널(MAC-Mitochondrial Apoptosis-induced channel)로 인해 세포질로 방출된다. 방출된 사이토크롬 c는 Apaf-1(Apoptotic protease activating Factor-1)와 ATP와 결합한 후, pro-caspase-9(caspase가 되는 물질)과 결합해 apoptosome이라는 단백질 복합체를 형성한다. Apoptosome은 다른 비활성화 상태인 pro-caspase-9을 caspase-9으로 활성화 시켜 다른 세포자살에 관여하는 물질들을 활성화 시키는 cascade를 발생시킨다. 
미토콘드리아 외막의 투과성을 높이는 채널을 만드는 Mitochondrial Outer Membrane Permeabilization Pore이라고도 불리는 MAC은 Bcl-2 단백질에 의해 통제된다. 따라서 Bcl-2 단백질도 세포자살 통제에 큰 역할을 한다.