괴혈병
그러나 당시의 항해에서는 신선한 감귤을 항상 섭취하기 어려웠기 때문에 영국 해군의 질병위원회는 괴혈병을 막는 약으로 보리를 끓인 물, 휴대용 수프, 농축 오렌지 주스 등을 쿡에게 지급했다. 그러나, 오늘날에는 이러한 물품들이 전혀 효과가 없는 것으로 밝혀졌다. (농축 오렌지 주스는 이미 가열되어 비타민 C가 파괴되었다). 어쨌든 주로 사워크라우트 덕분이었다는 것을 당시 잘 알지 못했고, 이후 귀환 후 쿡은 보리를 끓인 물을 추천하기도 하였지만, 장기 항해의 괴혈병의 근절은 이후에도 좀처럼 진행되지 않았다.
시트르산
시트르산은 특정 과일과 야채에 많이 들어 있는데, 감귤류 과일에 특히 많이 들어 있어서 이 이름이 정해졌다. 라틴어 "citrus"는 "감귤"을 뜻하며, "구연(枸櫞)"은 "레몬을 가리키는 한자"이다.