백악기
백악기 초기에서 중기에 이르기까지 하늘에는 익룡이 날아다녔다. 이후 공룡의 일부가 방산 적응의 결과 조류로 진화하였다. 수각아목에 속하는 발가락이 셋 달린 공룡인 코에루로사우루스류가 이시기에 출현하였으며 이 가운데 일부가 진화하여 조류가 되었다. 조류는 백악기 말에 있었던 대멸종에서도 살아남아 오늘날까지 유지되고 있다.
검룡류
검룡류는 갑옷을 가진 공룡 (장순류) 으로 초기에는 해당 그룹의 원시적인 형태와 크게 다르지 않아 작은 몸집에 낮은 자세로 갑옷 같은 인갑(scute)로 몸을 보호하며 달릴 수 있는 동물이었다. 검룡류가 초기에 이룩한 진화적 혁신은 골침 (thagomizer) 이라고 불리는 꼬리의 스파이크로, 방어를 위한 무기였다. 후대의 종들 중 스테고사우루스과에 속한 종들은 몸집이 커졌고, 뒷다리가 길어져 달릴 수 없게 되었다. 이런 변화로 인해 골침을 이용한 능동적인 방어가 더 중요해졌다. 꼬리는 넓은 형태의 골반에서 수평으로 뒤쪽으로 뻗어나가 상대적으로 높은 위치에 있었기 때문에 골침을 이용해 커다란 포식자도 물리칠 수 있었다. 스테고사우루스과 공룡들은 등과 엉덩이 그리고 꼬리에 복잡한 배열의 스파이크와 골판을 가지고 있었다. 이들의 목은 더 길어졌고 작은 머리는 더 좁아져 부리를 이용해 소철류의 가장 좋은 부분만 선택적으로 뜯어먹을 수 있었다. 소철류가 쇠퇴하기 시작하자 검룡류도 그 뒤를 따랐고 백악기 전기에 멸종했다.