후천면역결핍증후군
에이즈는 병리학적으론 최초로 1981년 미국에서 발견되었다. 하지만 언제 HIV 바이러스가 번지기 시작했는지는 정확히 말할 수 없으며, 의학계에서는 침팬지에서 발견되는 SIV에서 HIV가 유래된 것으로 보고 있으며, 그 출현 시기를 1930년대로 보고 있다. 즉 중앙 아프리카의 원주민들이 SIV를 보유하고 있는 침팬지와 접촉함으로 인해 인간의 면역체계를 약화시키는 변종 바이러스 HIV가 생겨난 것으로 추측하는 것이다. 이 가설을 뒷받침하는 간접적 증거로는 현재 가장 높은 에이즈 감염 및 사망률을 보이고 있는 지역이 바로 아프리카 대륙이라는 점을 들 수 있다. 또한 이 때는 아프리카 개발이 집중적으로 시작된 시기로 인간들의 무분별한 야생동물 사냥과 원시림을 파괴하며 얻은 SIV를 포함한 침팬치의 고기 및 다른 고기를 유통, 공급하면서 접촉하여 생긴 환경파괴 질병으로 보기도 한다.
KSHV
1994년, 콜롬비아 대학 부부팀인, Yuan Chang과 Patrick S. Moore은 AIDS환자의 카포시육종의 허피스바이러스의 DNA조각을 추출하여 KSHV를 처음 발견하였다. 1984년 초반, 과학자들은 전자현미경을 통하여 카포시육종에서 허피스바이러스와 같은 구조를 보았다고 보고했다. 과학자들은 그 뒤 cytomegalovirus와 HIV를 포함하여 카포시육종을 일으킬만한 20가지가 넘는 물질을 찾아보았다. Chang과 Moore는 AIDS환자의 카포시종양조직과 그의 영향 받지 않은 조직을 비교하여 KSHV를 찾기 위해 representational difference analysis(RDA)를 사용하였다. 이 실험에는 만약 바이러스가 카포시육종을 일으킨다면 두 샘플에서 유전체DNA는 바이러스를 가지고 있는 부분을 제외하고는 정확히 동일해야한다는 생각이 깔려있었다. 처음 RDA실험에서, 그들은 실제 바이러스 게놈의 1%미만을 나타내는 두개의 작은 DNA조각을 분리하였다. 이 조각들은 알려진 허피스바이러스와는 유사하지만 다른 서열을 보여주었기에 새로운 바이러스의 존재를 암시했다. 이 조각들로 시작하여, 연구팀은 전체 바이러스의 서열을 2년미만의 기간내에 알아낼 수 있었다.
허피스바이러스의 발견은 KSHV가 카포시육종의 원인이 되는 바이러스임을 보여주기위한 충분한 자료가 모아지기 전까지 상당한 논쟁과 과학적 내분을 일으켰다. 이 바이러스는 사하라사막 남부 아프리카에 살고 있는 사람들을 널리 감염시키는 것으로 알려졌다. 이스라엘, 사우디아라비아, 이탈리아와 그리스를 포함하는 지중해 인구는 중간 단계의 감염을 보여주고, 대부분의 북유럽과 북아메리카 사람들에게서는 낮은 단계의 감염을 보여준다. 동성애자와 양성애자들은 감염에 더 민감하다. 반면에 개발도상국에서는 성적이지 않은 경로를 통해 바이러스가 전파된다.