일본의 역사
이어서 일본에서는 조몬 문화(기원전 1만 3천 년 경부터 기원전 300년까지)라고 불리는 독자적인 신석기문화로 이행했다. 그 뒤에도 해진 현상(海進現像)이 계속되어, 일본 열도는 현재의 혼슈, 시코쿠, 규슈, 홋카이도의 네 개의 큰 섬과 수많은 작은 섬으로 분리되었다. 한민족을 비롯한 몽골계 인종과 시베리아 지역을 통해 왔다고 추정되는 아이누족, 남방 폴리네시아 지역에서 온 민족들이 일본 열도로 이주하여 오늘날의 일본인의 조상이 되었다. 이 사람들을 다른 지역에서 건너 온 사람이라 하여 도래인(渡來人)이라고 한다.
시모다시
시모다에는 선사 시대 때부터 사람이 살기 시작했고 수많은 조몬 시대의 유적이 시역 내에서 발견된다. 나라 시대의 문서에 686년에 오쓰 황자가 모반을 계획하다 실패한 후에 유배된 것으로서 등장하고 헤이안 시대의 문서에는 철광석의 매장지로서 언급된다. 센고쿠 시대에는 호조 씨의 지배하에 있었고 성이 세워졌으나 후에 도요토미 히데요시에 의해 파괴되었다. 도쿠가와 막부 하에서 시모다는 막부의 직할령이 되었다. 에도 시대에 시모다는 해항으로서 번영하였고 오사카와 에도를 오가는 연안 선박들이 정박하는 주요 항구였다. 1721년까지 안전을 위해 에도로 가는 모든 선박들은 시모다에 정박해야만 했다.