몽골 인민공화국
1946년 1월 5일 중화민국은 소련과 중소 우호 동맹 조약을 체결하면서 외몽골의 독립을 승인했다. 1949년에 수립된 중화인민공화국은 소련과 체결한 중소 우호 동맹 상호 원조 조약을 통해 몽골을 독립 국가로 승인했다. 1953년 중화민국은 중소 우호 동맹 조약이 무효임을 선언하고 외몽골의 독립 승인 또한 철회했다. 1961년에는 몽골의 유엔 가입 신청을 거부하려고 했지만 미국의 압력으로 인해 포기하게 된다.
티베트
독립 이후 중화민국의 역대정권과 군사적인 긴장상태가 유지되었으며, 티베트 달라이 라마 정부의 실효적 지배 영역 내에서는 어떠한 중국의 기관도 설치가 승인되지 않았다. 1918년과 1930년에는 티베트 영내로 침입한 중국 군대를 격퇴하는 등 사실상 독립국으로서의 지위를 향유했다. 그러나, 1940년 달라이 라마 14세의 즉위식에 참석한 중화민국은 행정원몽장위원회를 사절단을 파견하였다. 그러나 의식 후에도 귀국하지 않았고 1948년에 강제로 퇴거되기까지 '중화민국 행정원 몽장위원회 주 티베트 대표처'라는 이름으로 라사에 계속 머물렀다.