미나모토노 요시쓰네
1181년 기요모리가 죽은 뒤 헤이케는 점차 기울기 시작했고, 각지에서 일어나는 겐지들의 반헤이케 거병에 밀린 헤이케는 결국 교토를 떠나 본거지인 서쪽으로 낙향하기에 이르렀고, 이때 안토쿠 천황과 삼종신기를 함께 가지고 가버린다. 주에이 2년(1183년) 7월에 기소 요시나카(木曾義仲, 미나모토노 요시나카)가 헤이시를 교토에서 몰아내고 가장 먼저 교토에 들어간다. 하지만 고시라카와 법황은 헤이시 추토의 공적을 논하면서 1등을 요리토모로 두고 요시나카를 2등으로 두는 등 요시나카를 낮게 평가하면서, 거꾸로 요리토모가 교토로 들어와주기를 기대하였다. 8월 14일에 요시나카는 후계 천황으로서 자신이 직접 옹립한 호쿠리쿠노미야(北陸宮)를 천거하지만 고시라카와 법황은 이에 격노하고, 요시나카를 제치고 요리토모에게 선지를 내려(주에이 2년 10월의 선지) 요리토모에게 간토 지역의 지배권을 인정해주기에 이르면서 양자간의 대립은 격화된다. 요리토모는 윤10월 5일에 가마쿠라를 떠났지만, 다이라노 요리모리로부터 교토의 심각한 식량부족 상황을 전해듣고 교토로 가는 것을 중지하고, 대신 요시쓰네와 나카하라노 지카요시(中原親能)를 대관으로서 교토에 보냈다. 당시 구교였던 구조 사다자네의 일기 《교쿠요》윤 10월 17일조에는 "'요리토모의 아우인구로(九郞)'라는 자가 대장군으로서 수만의 군병을 거느리고 교토로 왔다"고 하면서, 구로에 대해서 "이름은 모르겠다"고 적었다. 이것이 귀족의 일기에 요시쓰네가 처음으로 등장하는 사례이다.
원정 (군주제)
고시라카와 천황은 호겐 3년(1158년)에 니조 천황에게 양위하고 원정을 시작했다. 하지만 '정통'이라는 의식이 강했던 천황이 원정이 아닌 천황 친정을 지향하면서 또 한 번 조정은 고시라카와 상황을 지지하는 원정파와 니조 천황을 지지하는 친정파로 나뉘었다. 니조 천황대의 고시라카와 상황의 원정은 그리 강고하다고 할 수 없었지만, 니조 천황이 에이만 원년(1165년) 6월 25일에 병을 이유로 나이 어린 로쿠조 천황에게 양위하고 불과 한 달 뒤인 7월 28일에 붕어하면서 고시라카와인의 원정은 비로소 강화되었다. 이후 헤이지의 난과 다이라노 기요모리를 필두로 하는 헤이케 정권의 등장 및 붕괴, 지쇼·주에이의 내란의 발발, 그리고 미나모토노 요리토모의 가마쿠라 막부 성립 등 무사들이 잇따라 대두하는 시대가 찾아오게 된다. 이런 와중에 고시라카와 법황은 말년에 헤이케의 수장인 다이라노 기요모리와 대립하다가 지쇼 3년(1179년) 11월의 정변으로 토바덴(鳥羽殿)에 유폐되어 그의 원정은 중단되고 만다.(지쇼 3년의 정변) 고시라카와 법황의 원정이 중단되면서 다카쿠라 천황의 친정 체제가 성립되었지만, 다카쿠라 천황은 지쇼 4년(1180년) 2월에 안토쿠 천황에게 양위하고 다시 다카쿠라 천황의 원정이 시작되었다. 다카쿠라 천황이 원정을 행하던 동안 후쿠하라 천도 등이 이루어졌지만, 원래 병약했던 다카쿠라 상황이 후쿠하라에서 병을 얻어 교토로 돌아온 직후(1181년) 붕어하고, 얼마 못 가서 기요모리도 죽었다. 기요모리 사후 헤이케의 수장이 된 다이라노 무네모리는 고시라카와 법황의 원정을 부활시켰다.