괴혈병
그러나 당시의 항해에서는 신선한 감귤을 항상 섭취하기 어려웠기 때문에 영국 해군의 질병위원회는 괴혈병을 막는 약으로 보리를 끓인 물, 휴대용 수프, 농축 오렌지 주스 등을 쿡에게 지급했다. 그러나, 오늘날에는 이러한 물품들이 전혀 효과가 없는 것으로 밝혀졌다. (농축 오렌지 주스는 이미 가열되어 비타민 C가 파괴되었다). 어쨌든 주로 사워크라우트 덕분이었다는 것을 당시 잘 알지 못했고, 이후 귀환 후 쿡은 보리를 끓인 물을 추천하기도 하였지만, 장기 항해의 괴혈병의 근절은 이후에도 좀처럼 진행되지 않았다.
마테
마테차는 만드는 종류에 따라서 두가지로 분류 된다. "GREEN MATE"는 덖지 않고 사용한 것으로 비타민C,비타민A,비타민B1이 풍부하다. 반면에 "BLACK MATE"는 덖는 과정을 거치면서 비타민을 거의다 잃는다. 비타민C는 체내 철의 흡수률을 높이기 때문에 철분을 섭취하기 위해서는 그린 마테가 도움이 된다.