괴혈병
그러나 당시의 항해에서는 신선한 감귤을 항상 섭취하기 어려웠기 때문에 영국 해군의 질병위원회는 괴혈병을 막는 약으로 보리를 끓인 물, 휴대용 수프, 농축 오렌지 주스 등을 쿡에게 지급했다. 그러나, 오늘날에는 이러한 물품들이 전혀 효과가 없는 것으로 밝혀졌다. (농축 오렌지 주스는 이미 가열되어 비타민 C가 파괴되었다). 어쨌든 주로 사워크라우트 덕분이었다는 것을 당시 잘 알지 못했고, 이후 귀환 후 쿡은 보리를 끓인 물을 추천하기도 하였지만, 장기 항해의 괴혈병의 근절은 이후에도 좀처럼 진행되지 않았다.
간유
간유(肝油, )는 대구과의 생선에서 추출한 노란 기름으로, 대표적인 동물성 보조 식품이다. 오메가-3 지방산·에이코사펜타엔산(EPA)·도코사헥사엔산(DHA)·비타민 A·비타민 D를 풍부하게 함유하고 있다. 요리하는 데도 쓰이지만, 서구권에서는 구루병을 예방하기 위해 아이들에게 권장하는 식품이었다.