チェコ鉄道680系電車
ペンドリーノ列車のチェコ鉄道の路線での正規運用は、2つの路線で2005年12月11日に始まった。言わゆる南ルート、プラハ - パルドゥビツェ - チェスカー・トルジェボヴァー - ブルノ - ブルジェツラフ (とその先のブラチスラヴァまたはウィーン)で、ユーロシティと共通種別での運行列車となるはずであった。しかし、列車はスロバキアとオーストリアでの運行許可を得ていなかったので、ペンドリーノは短縮した形で南ルートを運行した。故に、IC 570/571とEC 134/135はブラチスラヴァではなくブルジェツラフ終点となり、EC70から75までの3往復の列車がプラハ - ウィーンの全路線を国際列車として運行した。チェコ鉄道のペンドリーノは2006年12月10日にオーストリアとスロバキアでの運行認可を受け、強制乗換は不必要になった。南ルートは低い労働力と国際列車補助の少ない利益に苦しみ、故に2010年には既にウィーンまでの1往復("SC スメタナ")のみとなり、翌年はもう一方のブラチスラヴァ行("SC スロバキアの矢")となった。2012年の新ダイヤで南ルートは消滅した。
チェコ商業鉄道
1881年に、最初の路線が開通し、運行を開始した。一方で、次期路線建設の構想もあった。これは、大手鉄道会社の主要幹線と競争する様な鉄道ネットワークを構成する計画であった。そのため最初から、チェコ商業鉄道と他の大手鉄道会社との関係は緊張していた。愛国的なチェコ商業鉄道の経営陣は、小規模な農家や町村に株を売ったが、その株をが、小規模な投資家から購入した。1882年のヤン・ムジカの突然の死以降も、チェコ商業鉄道は存続した。1882年末には、全ての役員を国営鉄道会社の社員が占め、次の年には事実上国営鉄道会社が経営権を取得した。1909年に国有化された。