稲作
稲作の起源は2017年現在、考古学的な調査と野生稲の約350系統のDNA解析の結果、約1万年前の中国長江流域の湖南省周辺地域と考えられている。（かつては雲南省の遺跡から発掘された4400年前の試料や遺伝情報の多様性といった状況から雲南省周辺からインドアッサム州周辺にかけての地域が発祥地とされていた。）
深草
山城国紀伊郡深草郷（不加久佐）は、京都盆地でいち早く稲作が始まったことが深草弥生遺跡から見ることができ、そして渡来系の豪族秦氏が拠点とした地の一つとされている。その秦氏の祖霊として創建された伏見稲荷大社は、全国の稲荷神社の総本社であり季節にかかわらず観光客で賑わっている。百済から日本に伝えられた頃から作られていたという瓦や、伏見稲荷のお土産から全国に広まった土人形、そして三和土の原料となる良質な粘土質の深草土が産出した。また、稲荷山の南麓には竹林が広がり、天正年間には真竹を用いた平柄の丸団扇が考案される。この深草団扇は、現在も京の花街で名前を入れて配られる京丸団扇のルーツだが、骨組みが丸亀から仕入れられるようになり明治末期に衰退。現在の竹林には孟宗竹が植えられ、たけのこが生産されている。
地区内を南北に京街道の一部で港町伏見と京都を結ぶ竹田街道（国道24号線）と伏見街道（直違橋通）、川端通と京町通を繋ぐ師団街道が、東西は西岸寺から稲荷山と大岩山の間の峠を勧修寺に至る大岩街道と、名神高速道路、そして阪神高速8号京都線の稲荷山トンネルが東山を抜け山科との間を結ぶ。さらに、京都を通らずに大津宿と伏見宿を結ぶ東海道五十七次の一部である大津街道は、藤森神社前で伏見街道から分岐し大亀谷の西福寺から大岩街道を経て髭茶屋追分に至り、墨染から八科峠を経て六地蔵に至る奈良街道（墨染通）なども地区内を通る古くからの交通の要衝であり、京都市街地や山科区、宇治市、城陽市方面へのアクセスも容易である。
また、京都の中心部と伏見を結ぶ運河として江戸時代初期には東高瀬川が、明治には鴨川運河（琵琶湖疏水）が開削され水運に用いられていた。そして鉄道は旧東海道本線が稲荷駅から大岩街道の峠を越え、日本初の路面電車である京都市電伏見線が竹田街道に、また竹田街道から稲荷大社までの支線京都市電稲荷線もあったがどれも廃止され、現在は京阪本線、JR奈良線、近鉄京都線が域内を通っている。
町村制の施行により深草村が発足。深草町を経て1931年（昭和6年）4月1日に、伏見市とともに京都市へ編入され伏見区の一部となった。昔から分区構想がたびたび出ていることもあり、地域内の住民登録や行政事務は深草向畑町にある伏見区役所深草支所にて独自に行われている。第16師団司令部が置かれていたが、戦後は庁舎が学校法人聖母女学院の本館となり、鴨川運河に架かる橋に施された意匠や、師団街道、軍人湯などの名称、国立病院機構京都医療センター（旧京都衛戍病院）の存在などにも名残が見られる。周辺の陸軍用地跡には京都教育大学や龍谷大学などが出来たため学生も多く住む。