京都大学
創立以来「自由の学風」を建学の精神としている。国立大学法人となったのちに制定された京都大学の基本理念にも引き継がれた。
京都学園大学
最初期の建学の精神は、「日本人らしい日本人の育成」である。これは、学園創立者辻本光楠が1897年（明治30年）に単身渡米し、留学生を対象とした学舎などを多く設立した経験から、当時の時世を踏まえ、これからの国際社会に伍していくに必要な精神を訴えたものである。「一国の国民として国際社会に卑屈になることなく、驕ることなく、平等互恵の立場で接することができる人間」という意味と説明される。すなわち、折々の状況を世界的視野に立って、自らの判断で決定し、行動する人材の育成である。