オートファジー
1953年から1955年にかけてクリスチャン・ド・デューブにより多様な加水分解酵素を含む細胞小器官としてリソソームが発見された。ド・デューブは、1963年に細胞が自身のタンパク質を小胞としてリソソームと融合し分解する現象をオートファジー、その小胞をオートファゴソームと命名した。
オートファジー
現在（2014年）では38種類の"ATG"遺伝子が同定されている。その内、合計18個（"Atg1"～"Atg10"，"Atg12"～"Atg14"，"Atg16"～"Atg18"，"Atg29"，"Atg31"）がオートファゴソームの形成に必須の遺伝子とされている。