明倫養賢堂
1871年（明治4年）の仙台医学館廃止の翌1872年、仙台藩医学校出身者が南町に私立仙台共立社病院を開設した。これが改組・改称を繰り返して、医学教育部門が1912年に東北帝国大学医学専門部として包摂された。現在は、東北大学医学部となっている。他方、病院部門は、現在東北大学病院となっている。
なお、養賢堂の設置から東北帝国大学医科大学の設置に至る過程において、数次の廃止および断続期間を挟んでいるほか、医学系部局は東北帝国大学設立後に包摂されたという経緯があるため、東北大学は、同大の創立年月日を、養賢堂の設置年月日ではなく、東北帝国大学の設置の勅令が公布された1907年6月22日としている。
東京慈恵会医科大学
東京慈恵会医科大学の起源は、高木兼寛によって1881年（明治14年）5月1日に創立された医術開業試験受験予備校（乙種医学校）の「成医会講習所」である。高木は1875年（明治8年）から5年間、海軍生徒として英国セント・トーマス病院医学校（現:ロンドン大学群キングス・カレッジ・ロンドン医学部）に学び、このように権威のある医学校を日本につくりたいと思っていた。高木は帰国後、廃止された慶應義塾医学所に関わっていた松山棟庵とともに1881年（明治14年）1月、「成医会」なる研究団体を設立し、次いで同5月にこの成医会講習所を設立している。