藤原教通
後三条天皇が藤原氏との関係が疎遠であったために教通の時代に藤原摂関家が衰退したとされているが、教通が兄・頼通との約束に反して子・信長への関白譲位を図った事から兄弟の不仲が深刻となり、頼通の影響力を抑制したい後三条天皇と教通の思惑が合致したことによって両者は接近する。『栄花物語』には後三条天皇が自己の主張を貫きつつも教通との関係を重視したことが記されている。そのため、頼通の財政的な基盤を切り崩すために後三条天皇が行った延久の荘園整理令の施行を事実上容認したとも言われている。
藤原教通
康平7年（1064年）に頼通から藤氏長者を譲られる。治暦3年（1067年）12月には頼通が関白を辞任。頼通は実子の右大臣・師実に関白職を譲ろうとしたらしいが、姉の上東門院（藤原彰子）が道長の遺言を理由にこれを許さず、しばらく関白職が空席となる。翌治暦4年（1068年）4月には後冷泉天皇が重態となり、藤原氏と関係が疎遠な後三条天皇の即位が確実となる状況下で、やむなく頼通は教通への関白職譲渡に同意し、4月16日に教通が関白に任ぜられる。この関白任命は後冷泉天皇在位中であるが、任命から3日後には後冷泉天皇が死去して後三条天皇が践祚しているため、教通の関白任命は新帝（後三条天皇）即位に対応した人事である。なお、教通は三条天皇の娘・禔子内親王を後室とし、さらに息子・信家の室に三条天皇の孫でその養女となった儇子内親王（実父は小一条院）を迎えていることなどにより、もともと三条天皇系の陽明門院・後三条天皇母子と教通の関係は、頼通との関係ほど疎遠ではなかったとの説もある。また、後冷泉天皇の意向により、教通の関白就任の翌日17日に歓子が皇后に冊立されている。