顕微鏡
最初の顕微鏡は1590年、オランダのミデルブルフで眼鏡製造者サハリアス・ヤンセンと父のハンス・ヤンセンが作った。他に、同じ眼鏡製造者であるハンス・リッペルスハイ（望遠鏡を最初に作ったといわれる）が顕微鏡も最初に作ったとする説もある。ただし、彼らがこれを使って何か意味のある観察をしたという記録はない。
大腸内視鏡
第3段階は治療＝内視鏡的ポリープ切除術（ポリペクトミー）の開発である。1968年、東大の丹羽、常岡により高周波スネアーが開発され、胃の内視鏡的ポリープ切除術が成功した。そして1969年、オリンパスの一人の社員を通じてスネアーがアメリカの新谷に渡り大腸の内視鏡的ポリープ切除術が成功した。1968年になぜ、日本で大腸の内視鏡的ポリープ切除術がおこなわれなかったのかには、いくつかの理由があるが、1968年の東大紛争による研究の中断と、当時の日本では大腸癌が多くなく重視されなかった事情の2点が大きいといえる。いずれにせよ、「切るだけで縫合しない」大腸の内視鏡的ポリープ切除術が手術として「完成」したのは1970年代以降に内視鏡による縫合技術（クリップ）が林、蜂巣により開発されてからである。