ユビキノン
ユビキノン（略号：UQ）とは、ミトコンドリア内膜や原核生物の細胞膜に存在する電子伝達体の1つであり、電子伝達系において呼吸鎖複合体IとIIIの電子の仲介を果たしている。ベンゾキノン（単にキノンでも良い）の誘導体であり、比較的長いイソプレン側鎖を持つので、その疎水性がゆえに膜中に保持されることとなる。酸化還元電位 (E') は+0.10V。ウシ心筋ミトコンドリア電子伝達系の構成成分として1957年に発見された。
下村脩
1955年（昭和30年）から平田の有機化学研究室に研究生として所属。平田から与えられた研究テーマは「ウミホタルのルシフェリンの精製と結晶化」だった。これは、プリンストン大学のグループが20年以上も前から解決しようとしていた、極めて難しい問題であった。下村は、研究に没頭。10か月後の1956年（昭和31年）2月に、努力が実を結び「ウミホタルのルシフェリンの結晶化」に成功した。27歳の下村の成し遂げた業績であった。その後も実験を続け論文として発表した。
この間、1959年（～1963年）には、長崎大学の助手となる。プリンストン大学の フランク・ジョンソン教授は、下村の論文に感銘を受け、プリンストン大学に招聘1959年（昭和34年）、下村は受諾した。平田はハーバード大学留学体験から博士の学位により報酬が倍増されることを知っていたため、博士課程の学生ではなかった下村に博士号を与えた。1960年（昭和35年）4月に、「海ホタルルシフェリンの構造（第2～3報）」の論文に対して、名古屋大学から理学博士号が授与された。1960年（昭和35年）8月に、横浜港から氷川丸にて渡米した。