BitKeeper
Linux カーネル開発に BitKeeper を採用するという決定（2002年）には異論があった。例えば、GNUプロジェクトの創始者リチャード・ストールマンは最も有名なフリーソフトウェアプロジェクトで商用ツールを利用することに懸念を表明した。Linux のリーダーであるリーナス・トーバルズや主要な開発者は BitKeeper 採用に積極的だったが、一部の主要開発者（アラン・コックスなど）は BitMover によるライセンス条件がプロジェクトの方向性をある程度制限する（あるいは企業によってLinux開発が管理される）ものであるとして反対した。このような懸念を払拭するため、BitMover は Linux の BitKeeper サーバ（BitMover が管理）と CVS や Subversion を使っている開発者との間にゲートウェイを追加した。その後も主要な開発者と自らも Linux 開発者である BitMover の CEO Larry McVoy を巻き込んだ論争が起きた。。
アンドリュー・タネンバウムとリーヌス・トーヴァルズの議論
さらにトーヴァルズは、特に Intel 80386 向けにLinuxを開発したと述べた。
それは単に、Intel 80386 アーキテクチャについてより深く学ぶことができるようにするための、自分の個人的なプロジェクトを行っていたからであった。
こうした事情からトーヴァルズは、Linuxはカーネル自体は移植性の面でMINIXより劣っていると述べたが、一方で移植性のあるアプリケーションプログラミングインタフェース (API、システムコール) がLinuxの設計原則であるとも述べた。
この設計原則に従うことで、Linuxの設計を簡潔にすることができたとしている。
このような理由から、トーヴァルズは「LinuxはMINIXより移植性が高い」と述べた。