奈良の鹿
7世紀後半から8世紀後半にかけて編纂された万葉集においては奈良の鹿の歌が詠まれ、このころは純粋に野生の鹿だった。同時期の767年には春日大社が創建され、その由来で主神の建御雷命（たけみかづちのみこと）が鹿島神宮から遷る際に白鹿に乗ってきたとされ、神鹿（しんろく）と尊ばれるようになる。氏社参詣の藤原氏からも崇拝の対象となり、人間が鹿に出会うと神の使いとして輿から降りて挨拶した。これが続いて、鹿もお辞儀の習慣を覚えたという説がある。
厳島
厳島のシカとサルは、フェリー桟橋付近にも現れたり、マスコットキャラクターとして図案化されたりして、「宮島のシンボル」ともいうべき知名度がある。なお、厳島のシカは神の使い「神鹿（しんろく）」として神聖視されていたが、第二次世界大戦後に厳島を接収したGHQの兵士がハンティングの対象として撃っていたために激減した。現在島にいる鹿は近年の分子遺伝学で、広島と山口と近い宮島固有の歴史を持つ鹿であるという事が証明されている。
また、一部で奈良から譲り受けたという噂があるが、奈良から譲渡される場合、春日大社に譲渡記録が記されるが、宮島に譲渡された記録は残っていない。
サルについては、江戸時代以前には記録がなく、古い絵巻でもサルの絵は猿回しに現れる程度で非常に少ない。このため、外部から持ち込まれたものが野生化したとする説が一般的である。一例として、1962年（昭和37年）頃、観光振興・生態研究のために小豆島にある日本モンキーセンターからニホンザル45頭が移入されている。これに関連して、2011年（平成23年）以降5年間の計画で、日本モンキーセンターの協力により愛知県犬山市へのニホンザルの移送が行われている。