実況パワフルプロ野球 サクセスモード
『実況パワフルプロ野球3』から登場した選手育成モード。「野球」部分と同じくパワプロの看板モードである。『パワプロ2』開発スタッフの間で『ときめきメモリアル』が流行しており、『パワプロ3』開発時に何か売りが欲しいとスタッフが考えたことが導入のきっかけになった。
プロ野球スピリッツ4
前作『3』ではXbox 360とPlayStation 2（PS2）のダブルプラットホームで発売されていたが、今作ではXbox 360ではなく、PlayStation 3（PS3）とのダブルプラットホームである。
今作の主なモードはペナント（真剣、名将、フリー）、MVP（『3』では『MVPペナント』となっていたが今作から独立）、スピリッツ等の従来からのモードに加え、新モードとしてプロスピ入門、応援曲作成が追加された。また、2007年からの、セントラルリーグのクライマックスシリーズ導入にも対応している。
PS2版には『3』及び『実況パワフルプロ野球13』・『同・決定版』とのパスワードや選手移籍などの互換性が存在する。PS3版ではオンライン対戦や最新のプロ野球ニュースの閲覧が可能である。
本作ではオープニング画面が『プロ野球スピリッツ2004』以来の実写ムービーで、2006年シーズンの名場面を編集したものである。
プロ野球スピリッツシリーズのパッケージ表紙は、前年に活躍した選手の写真が1チームにつき1人載ることが通例となっている。プロ野球スピリッツ4においてパッケージの表紙を飾った選手は以下の12名。
失投せずにストライクを投げる（ただし、コースを狙う練習では赤い的がストライクゾーンからはみ出ているものもあり、この場合は赤い的に当てればボールでも成功となる）ことが必須。変化球を使わないレッスンではストレートのみ、使うレッスンではストレート・ツーシームファスト・スライダー・フォーク・シンカー・シュートが持ち球として用意される。
フェアグラウンドに飛ばすことが必須。バント以外では多少打ち上げてもかまわない。変化球を打つ・ヒットを打つレッスンではCOM投手は投球部門の変化球を投げるレッスンでプレイヤーが使える変化球を投げてくるが、ツーシームファストは投げない。