梅毒
日本における感染者は2010年頃より増加傾向で、2015年は2014年を上回り、2017年には11月19日までの速報値で5,053人の感染者が国立感染症研究所により報告されたが、5,000人を超えるのは1973年以来44年ぶりであった。かつて第二次世界大戦後の1948年以降大きく減少していたが、1967年、1972年、1999年、2008年に小流行を起こし、2010年までは500例から800例で（人口10万当たり発生率は0.4〜0.6程度）推移していたが、2012年以降増加傾向に転じ2013年の梅毒総報告数は1,226例、2014年 1275例が報告され、人口10万当たり発生率は 0.96 と上昇している。また感染者の約80%は男性で男性の人口10万当たり発生率は1.6ある。なお、様々な診療科で鑑別診断が行われず、梅毒患者が見逃されていることを指摘する医師もいる。
麻疹・風疹混合ワクチン
1988年（昭和63年）から、日本で定期接種が開始された麻疹・流行性耳下腺炎・風疹混合ワクチン（新三種混合ワクチン、MMRワクチン）は、大阪大学微生物病研究所の占部株ムンプスワクチンを原因とする無菌性髄膜炎の発症率が想定以上に高かった為、1993年（平成5年）に予防接種を中止した。
その後、MMRワクチンから占部株ムンプスワクチンを除いたMRワクチンが、2005年（平成17年）6月に日本で認可された。