MediaWiki
ウィキペディア立ち上げ当初の2001年1月は、という既存のソフトウェアで駆動しており、記述はPerlを採用してすべてのウィキページをテキスト形式で保存していた。ところがすぐに機能面でもパフォーマンスでも制約の多さが目につき始めた。2001年半ばにはという当時ウィキペディアの編集者でケルン大学在籍の大学生開発者が、ウィキペディアに使うUseModWikiの代替となるソフトウェアを書き始める。PHPを使用し情報はすべてMySQLデータベースに保存、英語版ウィキペディアには2002年1月に実装し、他の言語版ウィキペディアのサイトでも徐々に実装が進んでいく。このソフトウェアが「PHPスクリプト」あるいは「phase II」と呼ばれたことから、UseModWikiには「phase I」という別名が与えられた。
ウィキメディア・インキュベーター
2005年7月8日に仮運用がスタートした。 当初は、琉球語の表記法が定まっていないため日本語のような漢字、ひらがな、カタカナ混じり文で書かれた記事とアルファベットで書かれた記事があったが、徐々にアルファベット形式のページが転送ページに置き換わり、日本語形式のみとなった。2016年2月時点で、約1000の記事が存在する。