恩賜上野動物園
開園は1882年3月20日（日本で最も早い）。開園時には農商務省、その後宮内省、東京市、東京都建設局が所管、現在は指定管理者制度により公益財団法人東京動物園協会が管理する。
大阪市天王寺動物園
1995年（平成7年）に大阪芸術大学教授の若生謙二主導のもと、爬虫類生態館「アイファー」、1997年（平成9年）にカバ舎、1998年（平成10年）にサイ舎を開設。2000年（平成12年）には「アフリカサバンナゾーン草食動物エリア」、2004年（平成16年）1月31日には「アジアの熱帯雨林ゾーン」、2006年（平成18年）9月には「アフリカサバンナゾーン肉食動物エリア」が開設され、従来の系統分類展示型から環境デザインが一変した。