日本プロサッカーリーグ
2018年シーズン開始時点で、日本国内の38都道府県に本拠地を置く54クラブ（J1：18、J2：22、J3：14）が参入、また、JFLなどのカテゴリーに属するJリーグ百年構想クラブが6クラブ認定されている。リーグ構成については日本サッカーのリーグ構成 (1種)を参照。
四国サッカーリーグ
日本サッカー協会の公式見解としてはJ3リーグと日本フットボールリーグ（JFL）を3部相当で並列させているが、JFLを4部とみなした場合は、四国リーグは5部に相当する。1部の優勝チームは全国地域サッカーリーグ決勝大会に出場し、各地域リーグ優勝チームと対戦。原則、上位2チームが全国リーグである日本フットボールリーグ（JFL）へ自動昇格、3位のチームはJFL16位チームとの入れ替え戦に進出することができるが、JFLにて降昇格や退会などの理由によりチーム数に変動があった場合、昇格枠は変更される。