梅毒
日本における感染者は2010年頃より増加傾向で、2015年は2014年を上回り、2017年には11月19日までの速報値で5,053人の感染者が国立感染症研究所により報告されたが、5,000人を超えるのは1973年以来44年ぶりであった。かつて第二次世界大戦後の1948年以降大きく減少していたが、1967年、1972年、1999年、2008年に小流行を起こし、2010年までは500例から800例で（人口10万当たり発生率は0.4〜0.6程度）推移していたが、2012年以降増加傾向に転じ2013年の梅毒総報告数は1,226例、2014年 1275例が報告され、人口10万当たり発生率は 0.96 と上昇している。また感染者の約80%は男性で男性の人口10万当たり発生率は1.6ある。なお、様々な診療科で鑑別診断が行われず、梅毒患者が見逃されていることを指摘する医師もいる。
ノロウイルス
2000年代は遺伝子型「GⅡ/4」と呼ばれる特定のノロウイルスが世界各地で流行し、集団発生を起こしている。厚労省の食中毒統計（平成17年度版）によると全食中毒患者の33%を占めており患者数では最大であり、日本での流行は冬（11月〜2月）に多いが、流行年によっては流行時期には偏りがある。2006/07流行年は、当時過去最悪と言われる1000万人規模の報告患者数を記録し、以後患者数は減少していたが、2012/13流行年は2006/07流行年に匹敵する患者数が予測されている。
この、2012/13流行年の患者数の増加は遺伝子型「GⅡ/4」の変異株によると考えられている。