香港
イギリスは中華民国ではなく中華人民共和国をその返還交渉相手に選び、中華人民共和国間との交渉及び中英共同声明の結果として、香港はイギリスから中華人民共和国に返還され、一国二制度の原理の下、1997年7月1日に最初の特別行政区になった。1999年12月にポルトガルから移譲されたマカオも特別行政区である。現在も香港は中国大陸とは異なる政治制度を有する。香港の独立した司法機関はコモン・ローの枠組みに従って機能する。共同声明において正式に記された条項に基づいた返還以前に、中華人民共和国側により起草された定款である香港特別行政区基本法において香港の政治は行われ、国際関係及び軍事防御以外の全ての事柄において高度な自治権を有することを規定している。なおこの自治権は中国中央指導部の委任・承認に基づき地方を運営する権限であり、完全な自治権、地方分権的なものではないとされる（2014年6月10日中国国務院白書）。
中国大陸
ただし、中華民国政府が公的に領有権を主張する「中国大陸」には、中華人民共和国の実効支配が及ばないモンゴルなどの地域も含まれるが（詳細は中華民国#地理を参照）、実態としては中華人民共和国の実効支配下にある地域のみを指す場合がほとんどで、1992年に制定された両岸人民関係条例（）の施行細則第三条では「大陸地区」の定義を「中国共産党のコントロール下にある地区（）」としている。そのため、中華民国政府の行政院大陸委員会は、中華人民共和国の直接統治区域だけでなく、香港・澳門についての事務も管轄している。