古代守
同じく同時期に書き下ろされた藤川桂介作、ひおあきら画の漫画版でも、やはり宇宙海賊のキャプテンハーロックとして登場し、たびたびヤマトの危機を救う。アニメ版のドメルにあたる将軍ロメルを一騎討ちで仕留め、最後の戦闘でデスラーを葬るという活躍を見せる。松本版とは違い、顔に傷と眼帯をした素顔を見せており、最後には守だと名乗っている。放射能によって余命が長くないことを告げ、人間である部下たちと同じく地球へは帰還しなかった。ハーロックの乗る艦に特に名称はついていない。松本の『宇宙戦艦ヤマト』関連の裁判後は、「本作品中に登場するキャプテンハーロックは、松本零士著作物『宇宙海賊キャプテンハーロック』からの特別友情出演です」との断り書きが巻末につくようになった（なお、同作は『ヤマト』よりも後発の作品である）。
ダイバー0
松本零士作品の代表作である『宇宙海賊キャプテンハーロック』の原型、もしくは外伝的な意味合いを持つ作品で、ハーロックとデスシャドウ号が登場して主人公ゼロを導いたり、ダイバーゼロの名前が台羽正（宇宙海賊キャプテンハーロックの登場人物参照）など共通性や関連性を随所で見せている。その他にも1000年女王というキャラクターが登場したり、ゼロという『コスモウォーリアー零』の名前や性格の基になる要素が存在する。