梅毒
日本における感染者は2010年頃より増加傾向で、2015年は2014年を上回り、2017年には11月19日までの速報値で5,053人の感染者が国立感染症研究所により報告されたが、5,000人を超えるのは1973年以来44年ぶりであった。かつて第二次世界大戦後の1948年以降大きく減少していたが、1967年、1972年、1999年、2008年に小流行を起こし、2010年までは500例から800例で（人口10万当たり発生率は0.4〜0.6程度）推移していたが、2012年以降増加傾向に転じ2013年の梅毒総報告数は1,226例、2014年 1275例が報告され、人口10万当たり発生率は 0.96 と上昇している。また感染者の約80%は男性で男性の人口10万当たり発生率は1.6ある。なお、様々な診療科で鑑別診断が行われず、梅毒患者が見逃されていることを指摘する医師もいる。
LGBTに関連した医療テーマ
2008年における日本でのHIVの新規感染者は男性が94％で、感染経路は同性間の性的接触が7割を占めている。しかしながら異性愛者のエイズ患者数は同性愛者の患者数と比較して大きな差がない。
アメリカ疾病予防管理センターはMSMに対して梅毒、淋病、HIVおよび性器クラミジア感染症のスクリーニング細胞診の年1回受診を推奨している。
上記の問題と付随して、献血において同性愛者（とくに男性同性愛者）の献血を何らかの形で禁止している国が多く存在する。日本においても同性愛者である場合献血を拒否する設問が設けられている場合が多いが、一方でこれを同性愛者差別であると見る向きや、不特定多数もしくは感染リスクの高い性交渉の有無ではなく「同性間の性交渉の有無」のみを対象にしていること 、つまり異性間接触でもHIVリスクはあり、またその性交渉の仕方についても感染リスクが大きく左右されるにもかかわらず、同性間で性交渉をおこなっただけでそれらを一切加味せずに拒否されていることなどを問題視する向きもある。海外においては日本と同様に拒否する通達や法制度を行っている国も多いが、一方でこれらの国でも日本と同じように同性愛者団体やが反発している。またイタリアでは同性愛者の献血は承認されており、タイでは同性愛者、異性愛者関係なしに、ハイリスクの献血者をはじくような設問に変更されている。