日本プロサッカーリーグ
1993年に10クラブで開始し、1998年までは1部のみの「Jリーグ」として最大で18クラブによって開催された。1999年から「Jリーグ ディビジョン1」（現J1リーグ）と「Jリーグ ディビジョン2」（現J2リーグ）の2部制に移行、2014年に「J3リーグ」（J3）が創設され3部制に移行した。制度上J3リーグは日本サッカーのリーグ構成上、アマチュア最高峰の日本フットボールリーグ（JFL）と同格と位置付けられており、J1・J2とJ3とではリーグエンブレムや参加要件等様々な点で差別化されている。
ジャパンフットボールリーグ
発足当初は、Jリーグ参加を目標に立てながらもハード・ソフト面での準備不足で、Jリーグ発足時の最初の10クラブから漏れたクラブや、Jリーグに参加しない社会人・地域クラブが混在していた。名目的にはアマチュアリーグであったJSLの後を受け継いだリーグであったが、旧JFLに参加したクラブにはJリーグへの参加意思を持ったクラブ（第2位までに入ったクラブにJリーグ加盟権利が与えられる準会員チームも）が多く、実質的にはJリーグにこうしたクラブを送り出す、Jリーグの下部リーグ（セミプロリーグ）としての性格を強く持っていた。