梅毒
日本における感染者は2010年頃より増加傾向で、2015年は2014年を上回り、2017年には11月19日までの速報値で5,053人の感染者が国立感染症研究所により報告されたが、5,000人を超えるのは1973年以来44年ぶりであった。かつて第二次世界大戦後の1948年以降大きく減少していたが、1967年、1972年、1999年、2008年に小流行を起こし、2010年までは500例から800例で（人口10万当たり発生率は0.4〜0.6程度）推移していたが、2012年以降増加傾向に転じ2013年の梅毒総報告数は1,226例、2014年 1275例が報告され、人口10万当たり発生率は 0.96 と上昇している。また感染者の約80%は男性で男性の人口10万当たり発生率は1.6ある。なお、様々な診療科で鑑別診断が行われず、梅毒患者が見逃されていることを指摘する医師もいる。
E型肝炎
2010年の報告によると22,027人を対象とした抗体検査で 5.3%が抗HEV IgG抗体陽性、女性よりも男性、また西日本よりも東日本が、抗体陽性率が高い傾向がみられたと報告されている。この調査から推定される日本における感染者数は、500万人程度とされ、年間15万人の増加傾向にある。感染者の80%程度は不顕性感染であるが、20%程度に HEV-RNA陽性で肝酵素などの検査値異常を生じる。免疫抑制剤を投与されている人や免疫機能が低下する基礎疾患を有している場合、慢性肝炎の発症や重症化の危険性が高くなる。