恩賜上野動物園
開園は1882年3月20日（日本で最も早い）。開園時には農商務省、その後宮内省、東京市、東京都建設局が所管、現在は指定管理者制度により公益財団法人東京動物園協会が管理する。
高崎山自然動物園
1952年（昭和27年）11月26日に上田が高崎山山麓の万寿寺別院の和尚とともに餌付けを開始。餌付けが軌道に乗った翌1953年（昭和28年）3月15日に正式に開園した。その際、上田の発案で、料金の表示を「小人十円、大人は小人並」としたことも話題を集めた。同年のうちに、高崎山が阿蘇国立公園（現阿蘇くじゅう国立公園）に指定されるとともに、「高崎山のサル生息地」が国の天然記念物に指定された。