コレラ菌
エジプトでの流行が終息した後、コッホらはインドのカルカッタに赴きさらに調査を続けた。その結果、カルカッタのコレラ患者の糞便や死者の腸管からも、コッホがアレクサンドリアで見つけたものと同じ細菌が存在し、一方コレラ以外で死んだ死者の腸管にはこの菌が存在しないことを見出した。そこでコッホはこの細菌こそがコレラの原因菌であると考え、その形態からコンマ状桿菌(Kommabazillus)と呼んだ。コレラ菌は、ヒト以外の実験動物にはコレラを起こさなかったため、コッホの原則のすべてを満足しなかったものの、コッホは本菌がコレラの原因であると結論し、1884年にドイツ政府に報告した。このことによってコッホはコレラ菌の発見者として広く認知され、コレラ菌には"Vibrio comma"という学名が与えられたが、後にパチーニの業績が見直され、コッホが発見した菌が既に30年前に発見されていたものと同じであることが明らかになり、分類学上の取り決めに従って、先に名付けられた"V. cholerae"が優先され、正式な学名になった。
梅毒の歴史
この説では、梅毒は新世界の病気であり、コロンブス、マルティン・アロンソ・ピンソン、他の乗組員たちによる、意図せざるコロンブス交換の結果として持ち込まれたとされる。コロンブスのアメリカ大陸への最初の航海は、1495年ナポリでの梅毒のアウトブレイクの3年前である。ドミニカ共和国での538の発掘人骨の調査では 6-14% がトレポネーマ症の特徴を示しており、Rothschildらは梅毒であったと想定している。近年の新世界での人骨証拠によりよく一致するよう修正されたコロンブス説では、新世界が梅毒の誕生の地というわけではなく、非性病性のトレポネーマ症がコロンブスによってヨーロッパに持ち帰られた、と想定されている。現代のフランベジア (イチゴ腫) のものに似たその細菌は、旧世界への到着によって新たな選択圧にさらされ、性感染症となった亜種の梅毒が誕生した。この説は、性病性の梅毒と、南米ガイアナのフランベジアと梅毒の中間的疾患の細菌との系統解析によって支持されている。しかしこの研究には、わずかな数の配列の差異だけに基づいて結論が出されているという批判もある。2011年には "Yearbook of Physical Anthropology" において 、Harper らによる、査読を経て公開された54件の先行研究のシステマティック・レビューによる評価が公開され、人骨のデータからは梅毒がコロンブスが出航する以前のヨーロッパに存在しなかったことが支持され、それ以前の旧世界での梅毒とされる人骨のエビデンスは標準的な年代測定法では支持されない、とされた。