クモ膜下腔
クモ膜下腔（蜘蛛膜下腔、くもまくかくう、くもまっかくう）は、中枢神経系を覆う髄膜のうち、一番内の軟膜と、その隣のクモ膜の間にある空間を指す。軟膜とクモ膜は密着しておらず、小柱と呼ばれる線維の束で結ばれている。小柱は軟膜とクモ膜の間ではいたるところで無数に入り乱れ、その様子がクモの網に似ていることからクモ膜の名がある。小柱の隙間に鍾乳洞のような形で残るのがクモ膜下腔である。クモ膜下腔は脳脊髄液で満たされている。
ミトコンドリア膜間腔
ミトコンドリアの内膜は、一般的にマトリックス側に大きく突出したクリステという構造を取っている。そのため膜間腔も、外膜と内膜に挟まれた周縁部と内膜のみに挟まれたクリステ内腔とに分けられ、両者の内容物には差がある。構造上も、周縁部の厚みが内膜や外膜を構成する脂質二重層と同程度（およそ6nm）であるのに対し、クリステ内腔はおよそ2倍の厚さがある。