蓮華寺 (京都市左京区)
上述のように、蓮華寺の起源である西来院は本来は時宗寺院であった。しかし、近義による再建に際して、実蔵坊実俊（じつぞうぼうじっしゅん）という比叡山延暦寺の僧が開山として招かれたことから、比叡山延暦寺を本山とし、延暦寺実蔵坊の末寺のひとつとして天台宗に属する寺院となった。また、現在の寺号は、境内地がかつて同名の廃寺の跡地であったことに由来する。
妙蓮寺 (京都市)
妙蓮寺（みょうれんじ）は、京都府京都市上京区にある、本門法華宗の大本山。山号は卯木山（うぼくさん）。塔頭が8院ある（恵光院、玉龍院、本光院、円常院、堅樹院、慈詮院、本妙院、常住院）。