Super Junior
Setelah subgrup Super Junior-K.R.Y. dan Super Junior-T, tanggal 2 Oktober 2007, S.M. Entertainment mengumumkan pembentukan proyek sub-unit Super Junior yang akan memulai promosi di Tiongkok tahun 2008. Zhou Mi dan trainee baru S.M. Entertainment berdarah Taiwan-Kanada Henry Lau, yang juga telah muncul di video musik "Don't Don", menjadi anggota dari subgrup ini.
Pengumuman dua anggota baru ini menimbulkan gejolak di kalangan penggemar, ada yang setujua ada yang menolak. Awalnya, sekelompok penggemar berencana memboikot produk perusahaan, namun akhirnya berubah mereka memilih protes diam. Ribuan penggemar dari fanclub resmi Super Junior E.L.F. duduk secara hening di depan bangunan SM sambil membawa tanda yang mendukung supaya grup hanya beranggotakan tiga belas orang.
Setelah berbagai rumor mengenai penambahan anggota lain ke dalam subgrup, para penggemar memutuskan untuk membuat perwakilan yang legal sebagai bagian dari pemegang saham S.M. Entertainment. Sampai tanggal 20 Maret 2008, penggemar Super Junior anggotai 58.206 lembar saham S.M. Entertainment, menguasai 0.3% dari saham keseluruhan perusahaan. Para penggemar merilis pernyataan bahwa mereka akan melakukan segala cara untuk menahan S.M. Entertainment menambah anggota baru dan menjaga Super Junior hanya bertiga belas.
Super Junior
Album kedua Super Junior tadinya direncanakan rilis pada tahun 2006, tetapi karena kecelakaan yang dialami Kyuhyun, several accidental setbacks, "Don't Don" tidak dirilis sampai 20 September 2007. Penjualan "Don't Don" mencapai 60.000 kopi pada hari pertama rilis dan berada di posisi pertama char bulanan pada September 2007. Meskipun "Don't Don" menerima beragam ulasan, album tersebut terjual 160.000 kopi pada akhir tahun, menjadi penjualan album terbaik kedua sepanjang tahun 2007. Super Junior menerima tujuh nominasi di Mnet/KM Music Festival 2007, dan berhasil memenangkan tiga penghargaan antara lain, Artist of the Year. Super Junior mendapat dua penghargaan di Golden Disk Awards ke 22, antara lain; Disk Bonsang award.