Perang Diponegoro
Pada hari Rabu, 20 Juli 1825, pihak istana mengutus dua bupati keraton senior yang memimpin pasukan Jawa-Belanda untuk menangkap Pangeran Diponegoro dan Mangkubumi di Tegalrejo sebelum perang pecah. Meskipun kediaman Diponegoro jatuh dan dibakar, pangeran dan sebagian besar pengikutnya berhasil lolos karena lebih mengenal medan di Tegalrejo. Pangeran Diponegoro beserta keluarga dan pasukannya bergerak ke barat hingga Desa Dekso di Kabupaten Kulonprogo, dan meneruskan ke arah selatan hingga keesokan harinya tiba di Goa Selarong yang terletak lima kilometer arah barat dari Kota Bantul. Pangeran Diponegoro kemudian menjadikan Goa Selarong, sebuah goa yang terletak di Dusun Kentolan Lor, Guwosari Pajangan Bantul, sebagai basisnya. Pangeran menempati goa sebelah Barat yang disebut Goa Kakung, yang juga menjadi tempat pertapaan dia. Sedangkan Raden Ayu Retnaningsih (selir yang paling setia menemani Pangeran setelah dua istrinya wafat) dan pengiringnya menempati Goa Putri di sebelah Timur.
Kerto Pengalasan
Basah Ngabdullatip Kerto Pengalasan (O Jawa: Kerta Pengalasan) (1795-sekitar 1866) adalah salah satu senopati yang berpihak pada Pangeran Diponegoro pada masa Perang Jawa. Sebelum perang, Pengalasan menjadi kepala desa di Desa Tanjung, Nanggulan, Kulon Progo dengan nama Kromowijoyo (O Jawa: Kramawijaya). Ia juga diangkat menjadi abdi dalem di dalam wilayah benteng dan mempelajari adat istiadat kedaton. Menurut Babad Kedhung Kebo, Pengalasan mampu menggambar bagian dalam dan bagian luar kedaton secara rinci, bertugas pada akhir masa pemerintahan Sultan Hamengkbuwono III (3-4 November 1814) dan Sultan Hamengkubuwono IV (6-7 Desember 1822). Pengalasan diperintahkan oleh anak dari Pangeran Blitar I (?1784-1827), salah satu putra dari Sultan Hamengkubuwono I untuk mendukung Diponegoro dalam mengadakan perang.