Kesultanan Ngayogyakarta Hadiningrat
Mengikuti kerajaan Mataram, wilayah Kesultanan Yogyakarta pada mulanya dibagi menjadi beberapa lapisan yaitu Nagari Ngayogyakarta (wilayah ibukota), Nagara Agung (wilayah utama), dan Manca Nagara (wilayah luar). Keseluruhan wilayah Nagari Ngayogyakarta dan wilayah Nagara Agung memiliki luas 53.000 karya (sekitar 309,864500 km persegi), dan keseluruhan wilayah Manca Nagara memiliki luas 33.950 karya (sekitar 198,488675 km persegi). Selain itu, masih terdapat tambahan wilayah dari Danurejo I di Banyumas, seluas 1.600 karya (sekitar 9,3544 km persegi).Wilayah-wilayah Kesultanan tersebut bukan sebuah wilayah yang utuh, namun terdapat banyak enklave maupun eksklave wilayah Kasunanan dan Mangkunegaran. Wilayah-wilayah tersebut merupakan hasil dari Perjanjian Palihan Nagari yang ditandatangani di Giyanti. Perjanjian itu juga disebut Perjanjian Giyanti.
Kadipaten Surabaya
Kadipaten Surabaya adalah sebuah monarki Jawa yang berpusat di Surabaya, di pantai timur laut Jawa (sekarang Jawa Timur, Indonesia), yang berkuasa dari  1546 1625. Menjadi merdeka setelah berpisah dari Kesultanan Demak, dan pada awal abad ke-17 telah menjadi kekuatan utama di Jawa timur dan pelabuhan paling penting di wilayah pantai timur laut. Selanjutnya, memasuki masa konflik dengan Kesultanan Mataram yang berakhir dengan kemenangan dari Mataram dan akhirnya Surabaya jatuh ke tangan Mataram pada tahun 1625.