Paspor biometrik
Saat ini Indonesia telah menggunakan data biometrik pemohon paspor sebagai salah satu unsur pengaman dalam penerbitan paspor Republik Indonesia. Namun untuk sementara ini hanya dapat diajukan di beberapa kantor Imigrasi kelas 1 di Jakarta, Soekarno-Hatta, Tanjung Priok, Surabaya dan Batam. Proses pengajuan Paspor biometrik memerlukan waktu 15 Hari di semua Kantor imigrasi tersebut.
Transportasi di Kota Atambua
Jalur bemo ini sudah ditentukan oleh dinas Pariwisata, dan dinas Perhubungan, untuk bemo #1: dari Pasar Baru ke Halilulik., bemo #2: Pasar Baru ke Umanen, bemo #3: Bandara ke Lampu Merah Pelita, bemo #4: Bandara ke Pasar Baru, lewat Tini.
Di dalam kota ini, selain transportasi darat, terdapat juga transportasi udara, yaitu melalui Bandar Udara A. A. Bere Talo. Jarak dari pusat kota 5km, bandara ini adalah salah satu dari belasan bandara di NTT. Bandara ini melayani penerbangan domestik dengan 2 pesawat terbang, Wings Air, dan Susi Air, yang melayani 6 penerbangan setiap minggunya.
Kota ini juga dilayani oleh 2 pelabuhan laut, yaitu pelabuhan Atapupu dan pelabuhan Tegur (Teluk Gurita).
Pelabuhan Atapupu merupakan pelabuhan kargo, dan minyak, sedangkan Pelabuhan Tegur merupakan pelabuhan ferry yang melayani rute Atambua Alor dan Atambua - Kupang, dan sejumlah tempat lainnya.