Super Junior
Bulan Februari 2006, Super Junior 05 mulai menampilkan "Miracle", lagu promosi singel kedua dari album debut mereka. "Miracle" memuncaki tangga lagu Thailand, menarik minat dari pasar Internasional. Begitu promosi "Miracle" berakhir, SM Entertainment mulai memilih anggota baru untuk generasi kedua Super Junior, Super Junior 06. Perusahaan bahkan telah menyiapkan sebuah daftar anggota terpilih untuk wisuda dari grup. Namun, perusahaan membuang konsep rotasi setelah menambahkan anggota ketiga belas, Kyuhyun, tahun 2006. Grup tersebut kemudian dikenal dengan nama hanya Super Junior, tanpa suffix "05". Anggota Eunhyuk secara tidak langsung menjelaskan di sebuah "variety show" bahwa grup junior mereka, SHINee bisa jadi bagian dari grup, tetapi that was contemplated sebelum Kyuhyun menghancurkan konsep rotasi tersebut.
Super Junior
Terlepas dari kesuksesan yang mereka raih, grup ini diguncang masalah hukum dan perubahan personel saat tur konser berlangsung. Meskipun Kibum muncul di iklan dan video promosi Super Show 2, dia tidak berpartisipasi secara resmi dalam tur konser tersebut, dan mengumumkan bahwa dia meninggalkan grup untuk sementara waktu untuk mengejar karier aktingnya. Bulan Oktober 2009, Kangin divonis kasus tabrak lari setelah mobilnya menabrak taksi yang tengah parkir berisi tiga penumpang. Bulan Desember 2009, Han Geng menggugat SM Entertainment, dengan tuduhan kontrak yang dijalaninya tak berdasar-hukum, kejam, dan mengabaikan hak-haknya. Dia keluar dari grup, dan pada bulan yang sama Kangin mengumumkan masuk wajib militer.