Super Junior
Setelah subgrup Super Junior-K.R.Y. dan Super Junior-T, tanggal 2 Oktober 2007, S.M. Entertainment mengumumkan pembentukan proyek sub-unit Super Junior yang akan memulai promosi di Tiongkok tahun 2008. Zhou Mi dan trainee baru S.M. Entertainment berdarah Taiwan-Kanada Henry Lau, yang juga telah muncul di video musik "Don't Don", menjadi anggota dari subgrup ini.
Pengumuman dua anggota baru ini menimbulkan gejolak di kalangan penggemar, ada yang setujua ada yang menolak. Awalnya, sekelompok penggemar berencana memboikot produk perusahaan, namun akhirnya berubah mereka memilih protes diam. Ribuan penggemar dari fanclub resmi Super Junior E.L.F. duduk secara hening di depan bangunan SM sambil membawa tanda yang mendukung supaya grup hanya beranggotakan tiga belas orang.
Setelah berbagai rumor mengenai penambahan anggota lain ke dalam subgrup, para penggemar memutuskan untuk membuat perwakilan yang legal sebagai bagian dari pemegang saham S.M. Entertainment. Sampai tanggal 20 Maret 2008, penggemar Super Junior anggotai 58.206 lembar saham S.M. Entertainment, menguasai 0.3% dari saham keseluruhan perusahaan. Para penggemar merilis pernyataan bahwa mereka akan melakukan segala cara untuk menahan S.M. Entertainment menambah anggota baru dan menjaga Super Junior hanya bertiga belas.
Super Junior
Masalah waktu penayangan terjadi antara S.M. Entertainment dan MBC ketika SM memaksa supaya Kangin tetap di "Explorers of the Human Body" SBS daripada "Sunday Night Dong-An Club" (동안클럽) MBC dimana Kangin menjadi pembawa acara reguler. MBC dalam jangka waktu tertentu mencekal semua anggota Super Junior lainnya muncul di penampilan dan acara yang dimiliki oleh MBC. Kangin juga kehilangan pekerjaan sebagai MC digantikan oleh T.O.P. Big Bang di acara musik, "Show! Music Core" dan dua variety show lainnya, dimana keduanya dihentikan setelah kepergian Kangin karena rating yang rendah. MBC menuntuk permintaan maaf dari S.M. Entertainment supaya Super Junior bisa tampil di acara-acara milik mereka. Namun, MBC concluded bahwa pencekalan Super Junior tidak pernah dilakukan secara resmi, namun hanya sebuah keoutusan dari produser acara terkait.