Kota Ternate
Baabullah putra Khairun naik tahta menjadi Sultan. la lalu memobilisasi kekuatan menggempur Portugis di seluruh Maluku dan wilayah timur Indonesia. Setelah berperang selama lima tahun, pada 1575, Sultan Baabullah berhasil mengusir Portugis dari Ternate dan dari wilayah Maluku. Dalam sejarah Indonesia, ini merupakan kemenangan pertama bangsa-bangsa Nusantara melawan penjajah Eropa.
Hubungan Portugal dengan Timor Leste
Bangsa Portugal yang sedang mencari rempah pertama kali menetap di Timor tahun 1520. Pada abad ke-17, Belanda tiba dan menetap di pulau Timor bagian barat. Perjanjian tahun 1859 meresmikan pembagian pulau Timor antara kedua negara tersebut. Salah satu dampak kolonisasi Portugal adalah banyaknya penganut Katolik Roma di Timor Leste. Portugal baru menguasai Timor Leste sepenuhnya pada paruh kedua abad ke-20.