इलाहाबाद की संधि
मुगलकाल में प्रान्तीय प्रशासन के स्तर पर दो अधिकारी होते थे, जिन्हे दीवान एवं सूबेदार या गवर्नर कहा जाता था। दीवान प्रान्तीय राजस्व या वित्त व्यवस्था का प्रभारी होता था, जबकि सूबेदार या गवर्नर निजामत (सैन्य, प्रतिरक्षा, पुलिस एवं न्याय प्रशासन) के कार्यो का निष्पादन करता था। ये दोनों अधिकारी एक दूसरे पर नियन्त्रण रखते थे एवं मुगल केन्द्रीय प्रशासन के प्रति उत्तरदायी होते थे।
प्रतापादित्य
प्रतापादित्य की अधिकांश सेना बंगाली कायस्थों, ब्राह्मणों, राजपूतों, बरगा क्षत्रियों, पुर्तगाली नाविकों और अफगानों से बनी थी। उसकी सेना में बड़ी संख्या में कुकी और अराकनी सैनिक थे। इसके अलावा, प्रतापादित्य की सेवा में कई अफगान अधिकारी थे, जिनमें कतलू खान के पुत्र जमाल खान और ख्वाजा कमाल शामिल थे। उनके सामरिक युद्ध के प्रमुख शंकर चक्रवर्ती और रुद्रादित्य उपाध्याय नामक दो ब्राह्मण थे। रुद्रादित्य का विवाह प्रतापादित्य की भतीजी बैसाखी देवी से हुआ था। राजधानी की सीमाओं का प्रबंधन रुद्रादित्य द्वारा किया जाता था। मुगलों के खिलाफ अपनी लड़ाई के दौरान उन्होंने कई पुर्तगाली अधिकारियों को भी नियुक्त किया।