पीयूष ग्रन्थि
मस्तिष्क के तल पर स्थित पीयूषिका (पिट्यूटरी) दो ललाट खण्डों (lobes) से मिलकर बनी होती है: अग्रस्थ पीयूषिका (adenohypophysis) और पश्च पीयूषिका (neurohypophysis). पीयूषिका कार्यात्मक रूप से हाइपोथैलेमस से पीयूषिका डांठ द्वारा जुड़ा हुआ होता है, जिससे हाइपोथैलेमस (अध्:श्चेतक) संबंधी स्रावित होने वाले कारक स्रावित होते हैं और, बदले में, पीयूषिका हार्मोनों के स्राव को उत्तेजित करते हैं। हालांकि पीयूषिका ग्रंथि को मास्टर अंत:स्रावी ग्रंथि के रूप में जाना जाता है, इसके दोनों ललाट खंड हाइपोथैलेमस के नियंत्रण के अधीन होते हैं।
आज्ञा चक्र
आज्ञाचक्र भौंहों के बीच माथे के केंद्र में स्थित होता है। यह भौतिक शरीर का हिस्सा नहीं है लेकिन इसे प्राणिक प्रणाली का हिस्सा माना जाता है। स्थान इसे एक पवित्र स्थान बनाता है जहां हिंदू इसके लिए श्रद्धा दिखाने के लिए सिंदूर लगाते हैं । अजना चक्र पीनियल ग्रंथि के अनुरूप है।  मूलाधार , स्वाधिष्ठान , मणिपूरक , अनाहत और विशुद्ध - इन पंच चक्रों से ऊपर होने के कारण आज्ञाचक्र छठा चक्र भी कहलाता है । उपनिषद् आज्ञा चक्र केन्द्र विन्दु को दोनों भौंहों के बीच अन्दर में निर्दिष्ट करते हैं और संतवाणी दोनों आँखों के मध्य तथा नाक के आगे बारह अंगुल की दूरी पर अन्दर में ही । आज्ञाचक्रकेन्द्रविन्दु में सिमटकर अवस्थित होने पर अन्तर्ज्योति दिखाई पड़ने के साथ - साथ अन्तर्ध्वनि भी सुनाई पड़ने लग जाती है । वह अन्तर्ध्वनि मानो साधक के लिए ब्रह्मांड में आ जाने की प्रभु - आज्ञा का शब्द हो ; क्योंकि अन्तर्ज्योति - सह अन्तर्ध्वनि प्रत्यक्ष हो जाने पर साधक को ब्रह्मांड में प्रवेश करने की योग्यता हासिल हो जाती है । छठवें चक्र को हठयोगियों - द्वारा ' आज्ञाचक्र ' कहने का यही कारण है ।