مخزن نرم‌افزاری
برای مثال سیستم‌عامل فری‌بی‌اس‌دی از مدیر بسته‌ای به نام پی‌کاجی استفاده می‌کند و کاربران با استفاده از این ابزار می‌توانند به مخازن نرم‌افزاری فری‌بی‌اس‌دی متصل شده و نرم‌افزارهای دلخواه خود را نصب کنند. بیشتر سیستم‌عامل‌ها مخازن خود را در سرویس‌دهنده‌های مختلفی که در سرتاسر دنیا پراکنده‌اند نگهداری می‌کنند تا کاربران راحت‌تر بتوانند از آن‌ها استفاده کنند. هر سیستم‌عامل مخازن نرم‌افزاری مخصوص بخود را دارد و نمی‌توان از مخازن نرم‌افزاری یک سیستم‌عامل بر روی سیستم‌عامل دیگری استفاده کرد. برنامه مدیر بسته معمولاً پس از دریافت برنامه‌ها از مخزن راه دور، آن‌ها را از نظر امنیتی بررسی می‌کند تا مبادا برنامه‌ها ناقص دریافت شده باشند یا شخصی در بین راه آن‌ها را دستکاری کرده باشد. این کار توسط یک کلید امنیتی انجام می‌شود.
اکس‌فری۸۶
قبل از تغییر دادن پروانه، اکس‌فری۸۶ پر استفاده‌ترین سرور اکس در میان سیستم‌عامل‌ها بود تا این که در نسخه ۴٫۴٫۰ پروانه نرم‌افزار تغییر کرد و خیلی از سیستم‌عامل‌ها استفاده از این برنامه را کنار گذاشتند و امروزه به ندرت از آن استفاده می‌شود. تنها سیستم‌عاملی که هنوز هم از این برنامه استفاده می‌کند نت‌بی‌اس‌دی است که در بعضی از سکوها به صورت پیشفرض با اکس‌فری۸۶ عرضه می‌شود. هرچند که سرور اکس. ارگ هم از طریق پکیج سورس قابل نصب است.