داروناویر
عوارض جانبی شایع شامل اسهال، تهوع، درد شکمی، سردرد و راش است. عوارض شدید نیز شامل واکنش‌های آلرژیک، مشکلات کبدی و راش‌های پوستی نظیر «نکرولیز اپیدرمی سمی» است. با آنکه مطالعات جامعی در دوران بارداری انجام نشده، اما احتمالاً برای جنین بی‌خطر است.
سوفوسباویر
عوارض جانبی شایع آن شامل احساس خستگی، سردرد، حالت تهوع و مشکل خواب است. عوارض جانبی به‌طور کلی در رژیم‌های حاوی اینترفرون بیشتر است. سوفوسباویر ممکن است هپاتیت ب را در کسانی که قبلاً آلوده شده‌اند دوباره فعال کند. در ترکیب با لدیپاسویر، داکلاتاسویر یا سیمپراویر به دلیل خطر ضربان قلب غیرطبیعی ، آمیودارون توصیه نمی‌شود. سوفوسباویر در خانواده دارویی آنالوگ نوکلئوتید است و با جلوگیری از پروتئین NS5B هپاتیت C کار می‌کند.