ماهی
می‌توان گفت گوناگونی گونه‌های ماهی به صورت یکسان میان ماهی‌های دریایی و ماهی‌های زیست‌بوم آب شیرین تقسیم می‌شود. ناحیهٔ هند-آرام مرکز اصلی گوناگونی‌های ماهی‌های دریایی است در حالی که ماهی‌های آب‌های شیرین بیشتر در حوضهٔ آبریز رودخانه‌های بزرگ جنگل‌های باران‌خیز استوایی گوناگونی دارند به ویژه در بستر رودهای آمازون، کنگو و مکونگ. بیش از ۵۶۰۰ گونهٔ ماهی در آب‌های شیرین منطقهٔ گرمسیری قارهٔ آمریکا و منطقهٔ معتدل آمریکای جنوبی وجود دارد (قلمرو نوگرمسیری). این گونه‌های ماهی نزدیک به ۱۰٪ همهٔ گونه‌های مهره‌داران را پوشش می‌دهند. ناحیه‌های سرشار از مواد خوراکی بستر آمازون مانند کانتائو به تنهایی بیشتر از کل اروپا گوناگونی در ماهی‌های آب‌های شیرین دارند.
مکنده‌ماهی
مکنده ماهی ها بیشتر در آبهای ساحلی و شیرین زندگی می کنند و در بیشتر مناطق معتدل به جز در آفریقا یافت می شوند. بعضی از گونه ها (به عنوان مثال Geotria australis ، Petromyzon marinus و Entosphenus tridentatus) مسافت های قابل توجهی را در اقیانوس آزاد طی می کنند،  که همین امر نشانگر عدم انزوای تولیدمثلی بین جمعیت ها است. گونه های دیگر در دریاچه های محصور در خشکی یافت می شوند. لاروها (آموكوتها) آنها در برابر دماي بالاي آب تحمل كمی دارند كه اين امر توضيح دهنده این است كه چرا در مناطق گرمسيري توزيع نمي شوند.