ستاد اجرایی فرمان امام
در ششم اردیبهشت سال ۱۳۶۸، حدود یک ماه قبل از درگذشت سید روح‌الله خمینی، با حکمی به حبیب‌الله عسگراولادی، مهدی کروبی و حسن صانعی برای در اختیار گرفتن همۀ وجوه و اموال مجهول‌المالک بلاصاحب، ارث بلاوارث و اموالی که بابت تخمیس و خروج از ذمه و اجرای اصل ۴۹ قانون اساسی و دیگر قوانین، در اختیار ولی فقیه قرار گرفته‌است، ستاد اجرایی فرمان امام آغاز به کار کرد. نام‌بردگان از طرف نخستین رهبر جمهوری اسلامی، اختیار داشتند تا هرگونه صلاح می‌دانند در تمامی ابعاد فروش، نگهداری و ادارهٔ آن‌ها اقدام کرده یا قسمتی از این اختیارات را به وزارت امور اقتصادی و دارایی واگذارند. این ستاد طی این حکم موظف شد همه درآمدهای حاصل را در موارد مقررهٔ شرعیه، بنیاد شهید، بنیاد پانزده خرداد، بنیاد مسکن، کمیتهٔ امداد، سازمان بهزیستی، طرح شهید رجایی و بنیاد جانبازان انقلاب اسلامی و مواردی از این دست مصرف کند.
ستاد مشترک سپاه پاسداران انقلاب اسلامی
ستاد مشترک سپاه پاسداران انقلاب اسلامی مرکز برنامه‌ریزی و هماهنگی بین نیروها و واحدهای مختلف سپاه پاسداران انقلاب اسلامی بود، که در سال ۱۳۶۳ تحت عنوان "ستاد کل سپاه پاسداران" فعالیت خود را آغاز کرد. این مرکز در سال ۱۳۷۰ به "ستاد مشترک سپاه پاسداران" تغییر نام داد و از اسفند ۱۳۸۶ وظایف آن به "معاونت هماهنگ‌کننده سپاه پاسداران" واگذار گردید. در حال حاضر سرتیپ بسیجی محمدرضا نقدی معاونت هماهنگ‌کننده سپاه پاسداران را برعهده دارد.