ماهی
می‌توان گفت گوناگونی گونه‌های ماهی به صورت یکسان میان ماهی‌های دریایی و ماهی‌های زیست‌بوم آب شیرین تقسیم می‌شود. ناحیهٔ هند-آرام مرکز اصلی گوناگونی‌های ماهی‌های دریایی است در حالی که ماهی‌های آب‌های شیرین بیشتر در حوضهٔ آبریز رودخانه‌های بزرگ جنگل‌های باران‌خیز استوایی گوناگونی دارند به ویژه در بستر رودهای آمازون، کنگو و مکونگ. بیش از ۵۶۰۰ گونهٔ ماهی در آب‌های شیرین منطقهٔ گرمسیری قارهٔ آمریکا و منطقهٔ معتدل آمریکای جنوبی وجود دارد (قلمرو نوگرمسیری). این گونه‌های ماهی نزدیک به ۱۰٪ همهٔ گونه‌های مهره‌داران را پوشش می‌دهند. ناحیه‌های سرشار از مواد خوراکی بستر آمازون مانند کانتائو به تنهایی بیشتر از کل اروپا گوناگونی در ماهی‌های آب‌های شیرین دارند.
لقمه‌ماهی
حدود ۲۲۰ گونه شناخته شده‌است که در ده خانواده و ۲۹ جنس سازماندهی شده‌اند. گونه‌های لقمه‌ماهی به تدریج در معرض تهدید () یا در معرض انقراض قرار می‌گیرند، به ویژه در نتیجه ماهیگیری بی‌رویه (). از سال ۲۰۱۳، ۴۵ گونه در فهرست آسیب‌پذیر یا در معرض خطر اتحادیه بین‌المللی حفاظت از طبیعت قرار گرفته‌اند. وضعیت برخی از گونه‌های دیگر چندان شناخته شده نیست و منجر به این می‌شود که آنها به عنوان کمبود داده ذکر شوند.