لخته خون (ترومبوز)
یک ترومبوز زمانی ایجاد می‌شود که فرایند هموستاز که به صورت عادی در در پاسخ به یک آسیب ایجاد می‌شود،در یک رگ آسیب ندیده فعال شود. ایجاد ترومبوز در یک رگ خونی بزرگ باعث کاهش جریان خون در ان رگ می‌شود و در یک رگ کوچک ممکن است باعث قطع کامل خون شود که منجر به مرگ بافت هدف رگ می‌شود. اگر ترومبوز از دیواره کنده شود و در جریان خون ازادنه حرکت کند به ان امبولی می‌گویند.
انسداد زائده دهلیز چپ
در فیبریلاسیون دهلیزی (AF) غیر دریچه ای، بیش از ۹۰ درصد لخته‌های ایجاد کننده سکته مغزی از قلب در زائده دهلیزی چپ ایجاد می‌شود. رایج‌ترین درمان برای خطر سکته مغزی، درمان با داروهای رقیق کننده خون است که به آنها ضد انعقاد خوراکی نیز گفته می‌شود و احتمال تشکیل لخته خون را کاهش می‌دهد. این داروها (که شامل وارفارین و سایر داروهای رقیق کننده خونِ جدیدتر) در کاهش خطر سکته مغزی در بیماران AF بسیار مؤثر است. اکثر بیماران می‌توانند سالها (و حتی دهه‌ها) بدون عوارض جانبی جدی از این داروها استفاده کنند.