مخزن نرم‌افزاری
برای مثال سیستم‌عامل فری‌بی‌اس‌دی از مدیر بسته‌ای به نام پی‌کاجی استفاده می‌کند و کاربران با استفاده از این ابزار می‌توانند به مخازن نرم‌افزاری فری‌بی‌اس‌دی متصل شده و نرم‌افزارهای دلخواه خود را نصب کنند. بیشتر سیستم‌عامل‌ها مخازن خود را در سرویس‌دهنده‌های مختلفی که در سرتاسر دنیا پراکنده‌اند نگهداری می‌کنند تا کاربران راحت‌تر بتوانند از آن‌ها استفاده کنند. هر سیستم‌عامل مخازن نرم‌افزاری مخصوص بخود را دارد و نمی‌توان از مخازن نرم‌افزاری یک سیستم‌عامل بر روی سیستم‌عامل دیگری استفاده کرد. برنامه مدیر بسته معمولاً پس از دریافت برنامه‌ها از مخزن راه دور، آن‌ها را از نظر امنیتی بررسی می‌کند تا مبادا برنامه‌ها ناقص دریافت شده باشند یا شخصی در بین راه آن‌ها را دستکاری کرده باشد. این کار توسط یک کلید امنیتی انجام می‌شود.
یواس‌بی زنده
یواس‌بی زنده یک یواس‌بی فلش درایو یا یک دیسک سخت اکسترنال است که حاوی یک سیستم‌عامل کامل است که می‌توان رایانه را از طریق آن بوت کرد. یواس‌بی‌های زنده، ارتباط نزدیکی با دیسک‌های زنده دارند، با این تفاوت که گاهی اوقات، می‌توان تنظیمات انجام شده بر روی سیستم را به صورت دائمی بر روی آنها ذخیره کرد یا اینکه نرم‌افزاری را به شکل دائمی بر روی سیستم‌عامل نصب کرد، برخلاف دیسک زنده که یک رسانه فقط-خواندنی است و چنین امکانی را فراهم نمی‌کند. همانند دیسک‌های زنده، یواس‌بی‌های زنده را هم می‌توان برای مدیریت کردن سیستم، بازگردانی اطلاعات و تعمیر سیستم، یا برای آزمایش کردن یک سیستم‌عامل جدید، بدون نیاز به نصب آن بر روی هارد دیسک و دیگر اهداف، مورد استفاده قرار داد. بسیاری از سیستم‌عامل‌ها نظیر مک اواس ۹، مک اواس ده، ویندوز اکس‌پی امبدد، سیستم‌عامل‌های خانواده بی‌اس‌دی و بسیاری از توزیع‌های لینوکس را می‌توان از روی یواس‌بی زنده هم اجرا کرد.