مخزن نرم‌افزاری
برای مثال سیستم‌عامل فری‌بی‌اس‌دی از مدیر بسته‌ای به نام پی‌کاجی استفاده می‌کند و کاربران با استفاده از این ابزار می‌توانند به مخازن نرم‌افزاری فری‌بی‌اس‌دی متصل شده و نرم‌افزارهای دلخواه خود را نصب کنند. بیشتر سیستم‌عامل‌ها مخازن خود را در سرویس‌دهنده‌های مختلفی که در سرتاسر دنیا پراکنده‌اند نگهداری می‌کنند تا کاربران راحت‌تر بتوانند از آن‌ها استفاده کنند. هر سیستم‌عامل مخازن نرم‌افزاری مخصوص بخود را دارد و نمی‌توان از مخازن نرم‌افزاری یک سیستم‌عامل بر روی سیستم‌عامل دیگری استفاده کرد. برنامه مدیر بسته معمولاً پس از دریافت برنامه‌ها از مخزن راه دور، آن‌ها را از نظر امنیتی بررسی می‌کند تا مبادا برنامه‌ها ناقص دریافت شده باشند یا شخصی در بین راه آن‌ها را دستکاری کرده باشد. این کار توسط یک کلید امنیتی انجام می‌شود.
پی‌اف‌سنس
پی‌اف‌سنس یک مسیریاب و دیوار آتش است که مبتنی بر فری‌بی‌اس‌دی توسعه می‌یابد. پی‌اف‌سنس، قابلیت‌های فراهم می‌کند که تنها در دیوار آتش‌های تجاری گران‌قیمت یافت می‌شوند. پی‌اف‌سنس را می‌توان از طریق یک رابط مبتنی بر وب پیکربندی کرده و بروزرسانی کرد. رابط تحت وب پی‌اف‌سنس طوری طراحی شده که کاربران بدون نیاز به دانستن جزئیات سطح پایین و تحتانی سیستم (فری‌بی‌اس‌دی) بتوانند آن را مدیریت کنند. پی‌اف‌سنس یک نرم‌افزار آزاد است و تحت پروانه بی‌اس‌دی منتشر می‌شود. این پروژه در سال ۲۰۰۴ به صورت انشعابی از مونوال به وجود آمد.