مخزن نرم‌افزاری
برای مثال سیستم‌عامل فری‌بی‌اس‌دی از مدیر بسته‌ای به نام پی‌کاجی استفاده می‌کند و کاربران با استفاده از این ابزار می‌توانند به مخازن نرم‌افزاری فری‌بی‌اس‌دی متصل شده و نرم‌افزارهای دلخواه خود را نصب کنند. بیشتر سیستم‌عامل‌ها مخازن خود را در سرویس‌دهنده‌های مختلفی که در سرتاسر دنیا پراکنده‌اند نگهداری می‌کنند تا کاربران راحت‌تر بتوانند از آن‌ها استفاده کنند. هر سیستم‌عامل مخازن نرم‌افزاری مخصوص بخود را دارد و نمی‌توان از مخازن نرم‌افزاری یک سیستم‌عامل بر روی سیستم‌عامل دیگری استفاده کرد. برنامه مدیر بسته معمولاً پس از دریافت برنامه‌ها از مخزن راه دور، آن‌ها را از نظر امنیتی بررسی می‌کند تا مبادا برنامه‌ها ناقص دریافت شده باشند یا شخصی در بین راه آن‌ها را دستکاری کرده باشد. این کار توسط یک کلید امنیتی انجام می‌شود.
پورت‌اسنپ
در سیستم‌عامل فری‌بی‌اس‌دی، پورت‌اسنپ برنامه‌ای است که به کمک آن می‌توان یک تصویر لحظه‌ای از درخت پورت‌های فری‌بی‌اس‌دی را به صورتی امن، فشرده شده و امضا شده دریافت کرد. از نسخه فری‌بی‌اس‌دی ۵٫۵ به بعد، پورت‌اسنپ به صورت پیش‌فرض در فری‌بی‌اس‌دی قرار داده شد. در نسخه‌های قدیمی این سیستم‌عامل، کاربران می‌بایست این برنامه را از درخت پورت‌ها نصب می‌کردند. پورت‌اسنپ در اولین اجرا، درخت پورت‌ها را به طور کامل دریافت می‌کند اما در دفعات بعدی فقط قسمت‌هایی که تغییر کرده‌اند دریافت خواند شد که این کار باعث بالا رفتن سرعت و کاهش مصرف پهنای باند می‌شود. برنامه پورت‌اسنپ هم می‌تواند به صورت مستقیم توسط کاربر از طریق خط فرمان اجرا شود و هم می‌توان آن را به صورت خودکار از طریق کرون اجرا کرد تا به صورت دوره‌ای درخت پورتها بروز شود. مزایای استفاده از پورت‌اسنپ برای دریافت و بروزرسانی درخت پورتها نسبت به دیگر روشها مانند سابورژن این است که: