Jutsu (Naruto)
Durante la segunda parte de la serie, se introduce el concepto de , alterando la cualidad del chakra. La manipulación de la naturaleza permite al ninja, después de cierto entrenamiento, transformar su chakra en uno de los cinco elementos: tierra, agua, fuego, viento, y relámpago. Cada elemento es más fuerte y poderoso que el anterior; por ejemplo, el fuego es débil contra el agua, pero puede contrarrestar fácilmente los jutsu basados en el viento. Todo los ninjas tienen una especial atracción por uno de los cinco elementos, lo que les permite usar jutsus de ese tipo con mayor facilidad. Los ninjas con afinidad al fuego, en consecuencia, son capaces de resistir e inhalar el fuego antes que manipular el agua.
Dōjutsu
Según Itachi Uchiha solo dos personas poseen este ojo, una de ellas el propio Itachi Uchiha. Posteriormente se revela que la primera persona en poseer dicha evolución del Sharingan es Madara Uchiha pero posteriormente este poseería el Mangekyō Sharingan Eterno, otra persona que logró despertarlo es Obito Uchiha, quien además es el mentor y cómplice de Itachi durante la masacre del clan. También se revela que en el pasado el hermano de Madara, Izuna, también desarrolló el Mangekyō Sharingan y tenía una fuerte rivalidad con el segundo Hokage Tobirama Senju. Kakashi Hatake, un usuario no Uchiha y teniendo el Sharingan izquierdo de su compañero Obito Uchiha implantado en su ojo izquierdo desarrollo el Mangekyō Sharingan al mismo tiempo que su aparentemente fallecido compañero Obito, tras observar ambos la muerte de , consiguiendo ambos respectivamente una técnica ocular única conocida como Kamui, pero Kakashi no podría sacarle provecho a esta técnica sino hasta muchísimo después, ya que al ser un usuario no Uchiha dicha técnica le causa una fuga masiva de chakra cada vez que la usa, mientras que Obito por su parte y teniendo aún su ojo derecho le sacó provecho al 100% esta técnica única. Tras la muerte de Itachi, su hermano menor Sasuke Uchiha desarrolló el Mangekyō Sharingan. También el amigo de Itachi, Shisui Uchiha, pudo despertar el Mangekyō Sharingan, desarrollando una técnica propia y perfeccionando así sus propias técnicas ilusorias conocida como Kotoamatsukami. Obito, poco después se da cuenta de que Sasuke posee el Amaterasu de su hermano en su ojo izquierdo, esto lo hizo Itachi para proteger a su hermano de Obito (según el manga, cuando Itachi le tocó la frente a Sasuke le dio sus dōjutsus y programó el Amaterasu para que cuando Sasuke viera el Sharingan de Obito, el Amaterasu atacará automáticamente). Poco después de saber la verdad de su hermano, Sasuke consigue su propio Mangekyō Sharingan, y finalmente es capaz de controlar las llamas del Amaterasu a voluntad.