Jutsu (Naruto)
Durante la segunda parte de la serie, se introduce el concepto de , alterando la cualidad del chakra. La manipulación de la naturaleza permite al ninja, después de cierto entrenamiento, transformar su chakra en uno de los cinco elementos: tierra, agua, fuego, viento, y relámpago. Cada elemento es más fuerte y poderoso que el anterior; por ejemplo, el fuego es débil contra el agua, pero puede contrarrestar fácilmente los jutsu basados en el viento. Todo los ninjas tienen una especial atracción por uno de los cinco elementos, lo que les permite usar jutsus de ese tipo con mayor facilidad. Los ninjas con afinidad al fuego, en consecuencia, son capaces de resistir e inhalar el fuego antes que manipular el agua.
Rasengan
El es un Ninjutsu que fue creado por Naruto Uzumaki, pero era el concepto original del Cuarto Hokage, combinar la manipulación elemental y la manipulación de forma con el Rasengan regular. Después de su entrenamiento Naruto fue finalmente capaz de combinarlos. Usa esta técnica durante su entrenamiento enfrentándose al Rasengan normal de Kakashi, lo cual termina en la total destrucción de la mano de este último. Además en la pelea contra los Akatsuki: Hidan y Kakuzu, realizándolo al mismo tiempo con la técnica Suiton (agua) de Yamato para formar un torbellino que retenga el ataque de Kakuzu hacia sus compañeros. Luego de esto Naruto realiza su futón rasengan contra Kakuzu y logra derrotarlo, pero esta técnica era de corto alcance y de tanto poder que el mismo Naruto quedó herido en su brazo izquierdo