Pueblos originarios de Ciudad de México
Los pueblos originarios son aquellas localidades que históricamente se desarrollaron de manera independiente a la Ciudad de México, pero que han sido absorbidas por ella, como consecuencia del crecimiento de la metrópoli. La mayor parte de estas comunidades tienen su origen en la época prehispánica, y fueron fundados por grupos de filiación otomangue —como los otomíes, y matlatzincas— y nahua. En la actualidad, la mayoría de los pueblos originarios poseen topónimos de origen náhuatl, aunque en muchos de ellos se hablaba otomí, mazahua y matlatzinca en el momento de la Conquista.
Mexicanos
Un estudio autosómico realizado en mestizos de las tres ciudades más grandes de México reportó que los mestizos de la ciudad de México tenían en promedio un 50% de ascendencia europea, 1% de ascendencia africana y 49% de ascendencia amerindia, mientras que los mestizos de las ciudades de Monterrey y Guadalajara tenían en promedio un 60% de ascendencia europea y un 40% de ascendencia indígena.