Indiana Jones y la última cruzada
Spielberg usó palomas en vez de gaviotas para la escena donde Henry intenta hacer que el avión alemán se estrelle, debido a que las gaviotas originalmente usadas en la primera toma no volaron. En diciembre de 1988, Lucasfilm solicitó a la misma compañía que suministró las víboras y los insectos en las películas anteriores de la serie un millar de ratas grises libres de enfermedades para los segmentos de las catacumbas. A lo largo de cinco meses, alimentaron a 5000 ratas para rodar la escena. Asimismo, se incorporaron 1000 ratas mecánicas para el fragmento en el que varias ratas se incendian en las catacumbas. Además, miles de serpientes de hasta cinco razas distintas —incluyendo una boa constrictor— fueron utilizadas en la secuencia del tren, además de las víboras de goma sobre las que cae Phoenix en la misma secuencia. Debido a que las serpientes debían deslizarse de sus cajas, el equipo se vio en la necesidad de cavar en el aserrín tras haber finalizado la filmación para encontrarlas y llevarlas de vuelta a sus lugares correspondientes. Se usó a dos leones en la misma escena, los cuales se pusieron nerviosos debido al constante movimiento de balanceo y a las luces parpadeantes de las cámaras.
Indiana Jones y el reino de la calavera de cristal
Durante años, a partir del 2005, muchos fanes y actores de la película rumorearon e idearon sobre una quinta película, titulada "Indiana Jones 5". De acuerdo con Lucas y Spielberg, Paramount Pictures firmó con ellos un contrato para realizar cinco películas que hablaran sobre las aventuras de Indiana Jones. Sin embargo, George Lucas nunca hizo ninguna confirmación oficial durante un gran tiempo. Los planes para un spin-off de Mutt Williams empezaron a extenderse cuando salió el rumor de que Shia LaBeouf había firmado con Paramount Pictures para tres películas, pero los planes fueron desechados por Lucas tras discusiones con Shia LaBeouf. Sin embargo, Steven Spielberg habló sobre que tenían planes para "Indiana Jones 5" en 2009, pero que la secuela solo se realizaría si se hacía la película bibliográfica de Abraham Lincoln. Harrison Ford prometió regresar como Indiana Jones si no tenía que esperar veinte años más para otra película y si la película no iba a ser una película animada para cines, como "", del 2008.