Makuria
A finales del siglo VI los monarcas de Makuria se convirtieron al cristianismo, pero en el siglo VII Egipto fue conquistado por los ejércitos islámicos, y Nubia quedó aislada del resto de la Cristiandad. En 651 un ejército árabe intentó la invasión, pero fue repelido y se firmó un tratado llamado "baqt", que creó una paz entre los dos bandos que resistió hasta el siglo XIII. Makuria se expandió, anexionándose el reino del norte, Nobatia, o en tiempos de la invasión árabe o durante el reinado del rey Merkurios. El periodo desde aproximadamente 750 a 1150 fue próspero para el reino, y recibe el nombre de «Edad Dorada». Las agresiones desde Egipto y las discordias internas llevaron al colapso del estado en el siglo XIV.
Nobatia
En el 640 la ocupación por parte de los árabes ya musulmanes del Egipto hasta entonces bizantino aisló a los reinos cristianos del noreste africano (Nobatia, Makuria, Alodia, Reino Etíope Axumita) del resto de los estados cristianos, la unificación de Nobatia (ahora fronteriza con los árabes establecidos en Egipto) con Makuria fue un modo de mantener la identidad cultural y étnica de ambos estados ante el avance islámico.