Perro antiguo
La investigación con razas precolombinas de México, América Central y América del Sur halladas por los arqueólogos, ha demostrado que las razas contemporáneas que semejan la apariencia de las antiguas, como la Xoloitzcuintle, la Chihuahua y el perro sin pelo del Perú, se han cruzado con perros modernos a tal punto que los haplotipos de ADN mitocondrial exclusivos de las razas antiguas de las Américas no se han encontrado presentes en los perros sudamericanos actuales. Así, dos haplotipos exclusivos encontrados en el sur del Perú en las momias del pastor Chiribaya se han encontrado en los perros actuales. En el caso de los Chihuahua se ha encontrado que uno de los haplotipos que presenta actualmente es exclusivo de esa raza y también fue detectado en perros precolombinos de México. Curiosamente los haplotipos antiguos americanos fueron hallados en dos perros callejeros mexicanos.
Canis familiaris
La Federación Cinológica Internacional establece una clasificación en diez grandes grupos por la función y características de los perros. El concepto que los científicos tienen de raza, como un grupo que comparte caracteres genéticos, difiere del uso coloquial del término dado por las personas como sinónimo de variedad. El término "raza" en ciencia incluiría todas las variedades de perros que habitan en el mundo, es decir, solo existe una "raza" de animales que comprenden a los perros y esta definición se acercaría más a la jerarquía taxonómica de "subespecie". El vulgo hizo extensiva la significación de "raza" a las distintas variedades de canes, como Bulldog, Doberman o Chihuahua; esto debido a que los perros son fenotípicamente distintos por lo que se creó esa "construcción social", sin embargo, en zoología, según algunos científicos, el concepto de "raza" no es sinónimo de variedad en la especie. Los perros tienen diversidad genética, pero esto se debe principalmente a la reproducción selectiva en condiciones controladas. Sin embargo, para otros las razas sí existen. Esto es similar a la especie humana.