Derecho eclesiástico
En la primera mitad del surge la Reforma protestante, en cuyo movimiento destacan tres personas: Lutero, Zwinglio y Calvino. El objetivo común era identificar lo máximo posible Iglesia y Estado, pero con la prevalencia del Estado. La reforma protestante trae como consecuencia que los súbditos quedan obligados a la religión del príncipe, de ahí que aparece las llamadas iglesias de Estados o Iglesias nacionales. Desde el punto de vista jurídico este movimiento de reforma da lugar a la distinción entre el Derecho eclesiástico y el Derecho canónico, en consecuencia se produce un cambio en la concepción del Derecho eclesiástico del Estado.Esta situación continua en los siglos y y supone el paso de una situación de intolerancia a otra de tolerancia en lugares concretos y determinados.
Reforma protestante en Suiza
La Reforma Protestante en Suiza fue promovida inicialmente por Ulrico Zuinglio, que obtuvo el apoyo del magistrado, Mark Reust, y de la población de Zúrich en la década de 1520. Ello condujo a importantes cambios en la vida civil y en los asuntos de Estado en Zúrich y se extendió a varios otros cantones de la Antigua Confederación Suiza. Sin embargo, siete cantones siguieron siendo católicos, lo que provocó guerras intercantonales conocidas como Guerras de Kappel. Tras la victoria de los cantones católicos en 1531, estos procedieron a instaurar políticas de Contrarreforma en algunas regiones. El cisma y la desconfianza entre los cantones católicos y los protestantes definieron su política interior y paralizaron cualquier política exterior común hasta bien entrado el siglo XVIII.