Uadi al-Yarf
La excavación sistemática se reanudó en 2011 por un equipo arqueológico egipcio-francés liderado por Pierre Tallet (Universidad París IV-La Sorbonne), El Sayed Mahfouz y Gregory Marouard (The Oriental Institute, Chicago). En abril de 2013, los arqueólogos anunciaron el descubrimiento de un antiguo puerto y docenas de papiros en el lugar. Son los papiros escritos más antiguos que se han encontrado en Egipto (ca. 2560–2550 a. C., a finales del reinado de Jhufu). El complejo portuario data de la Dinastía IV, hace aproximadamente 4.600 años. Consta de un muelle o embarcadero de piedras de entre 150 y 200 metros que aún es visible en marea baja, un "alamat" o punto de referencia de navegación de piedras apiladas, un curioso edificio de función desconocida de 60m × 30m que está dividido en 13 salas largas, y una serie de 25 a 30 galerías de almacenamiento excavadas en afloramientos de piedra caliza más hacia el interior. El edificio de función desconocida es el edificio faraónico más grande descubierto a lo largo de la costa del Mar Rojo hasta la fecha. Las galerías de almacenamiento miden entre 16 y 34m de largo y suelen tener 3m de ancho y 2,5m de altura. Dentro de las galerías se hallaron varios fragmentos de barcos y velas, algunos remos y numerosos trozos de cuerdas antiguas. Se encontraron veinticinco anclas de piedra debajo del agua y 99 anclas en un aparente edificio de almacenamiento. Son las primeras del Imperio Antiguo encontradas en su contexto original. Muchas anclas tienen jeroglíficos con los nombres de los barcos de los que procedían.  Este puerto fue el punto de partida de los viajes desde el Egipto continental hasta las instalaciones mineras al sur del Sinaí. Se especula que también puede haber sido utilizado para embarcarse hasta la misteriosa Tierra de Punt, un conocido socio comercial del Antiguo Egipto.
Hipótesis del Egipto Negro
Un estudio publicado en 2017 describió la extracción y análisis del ADN de 151 individuos momificados del antiguo Egipto, cuyos restos fueron recuperados de Abusir el-Meleq de la gobernación de El Cairo. Los científicos dijeron que la obtención de ADN bien conservado y no contaminado de momias ha sido un problema en este campo y que estas muestras proporcionaron "el primer conjunto de datos fiables obtenido de los antiguos egipcios usando métodos de secuenciación de ADN de alto rendimiento". El estudio mostró que los antiguos egipcios tenían un mayor parecido con las poblaciones modernas de Oriente Medio (árabe, levantina y de Anatolia), y tenían significativamente más parecido con los europeos del sureste que con los africanos subsaharianos. Sin embargo, hubo un pequeño componente del África subsahariana en la ascendencia de las tres momias examinadas: "las estimaciones absolutas de ascendencia africana utilizando estos dos métodos en los tres individuos antiguos oscilan entre el 6 y el 15%". Este nivel de ascendencia del África subsahariana es significativamente más bajo que el de los egipcios modernos de Abusir, que "oscilan entre el 14 y el 21%". Los autores del estudio advirtieron que las muestras de las momias, que fueron tomadas de una región que (aunque técnicamente forma parte del Medio Egipto) está geográficamente en el extremo norte de Egipto, no pueden ser representativas del Antiguo Egipto en su conjunto. Los estudios genéticos contemporáneos muestran niveles mucho mayores de ascendencia del África subsahariana en las poblaciones actuales del sur que en las del norte de Egipto. En sus poblaciones de referencia para su estudio genográfico de ADN, National Geographic afirmó que el 68% de los egipcios modernos proceden de la etnia norteafricana, con invasiones extranjeras que tienen poco efecto en la mayoría de la genética de los egipcios modernos. Otros grupos étnicos que completan a los egipcios modernos fueron los del suroeste de Asia y el Golfo Pérsico con un 17%, la diáspora judía con un 4%, Asia Menor con un 3%, África Oriental con un 3% y Europa del Sur con un 3 %.