Chelonoidis chilensis
Se ha establecido, a pesar de su diferencia de tamaño, la cercanía genética entre el complejo insular que integran las tortugas de las Galápagos y "Chelonoidis chilensis", con una distancia genética menor que la que hay entre esta última y otras especies del género "Chelonoidis" del subcontinente sudamericano: el "morrocoy sabanero" y el "morrocoy de la selva".
Fosa temporal
Anteriormente las tortugas se consideraban anápsidos pero varios estudios moleculares y fósiles recientes descubrieron que son diápsidos que perdieron las fenestras temporales por el desarrollo de su caparazón y que sus parientes más cercanos son los arcosaurios (cocodrilos, aves y dinosaurios). Siendo clasificados incorrectamente en un notable caso de evolución convergente.