Raíz primaria
La "raíz primaria", también llamada raíz pivotante, raíz axonomorfa o raíz fusiforme, es la raíz que crece verticalmente hacia abajo. Forma un centro del cual otras raíces pueden brotar lateralmente.
Rhynie Chert
"Rhynia gwynne-vaughanii", las primeras investigaciones en Rhynie Chert permitieron describir un género de plantas característico, "Rhynia" (orden Rhyniales), con dos especies "Rhynia gwynne-vaughanii" y "Rhynia major" (40-50 cm x 6mm) ambas con un rizoma subterráneo y tallos aéreos dicótomos de sección circular, carecen totalmente de hojas o raíces aunque tenían rizoides para la absorción. La segunda de estas especies "Rhinia major" fue posteriormente renombrada como "Aglaophyton major" tras estudios más profundos. El sistema conductor de "Rhynia gwynne-vaughanii" es muy simple, constando de un simple vaso de traqueidas en posición central rodeado de un floema con vasos conductores de sección oblicua en una sola capa. Los esporangios fusiformes se encontraban localizados en el extremo de la ramas terminales. "Rhynia" poseía estructuras similares a raíces, aunque no raíces verdaderas, que le permitían anclarse al sustrato, y carecían de hojas. El talo de "Rhynia" posee una única capa de tejido vascular en estructura protostela; todas estas características hacen a las especies de "Rhynia" similares a los actuales "Psilotum", con quienes se han emparentado a menudo; muchos investigadores sin embargo consideran que el amplio lapso de tiempo transcurrido, 300 millones de años, del que no poseemos registro fósil apuntaría a un origen más reciente de "Psilotum", quizás desde "Filicopsida". "Asteroxylon mackiei" otra especie presente en Rhinie Chert, fue localizada en peor estado de conservación que las especies de los otros géneros, los fósiles fragmentarios impidieron la reconstrucción de esta especie con tanta fidelidad. Se deduce de las muestras que la planta poseía un rizoma horizontal y tallos erectos. El sistema vascular contaba de una serie de traqueidas engrosadas rodeadas de floema; en las partes aéreas esta estructura de transporte tenía forma estrellada con cinco lóbulos. "Horneophyton lignieri", es una planta de unos 20 centímetros con tallos aéreos con ramificación dicótoma y esporangios terminales con columela central que recuerdan a los esporangios de los antoceros salvo con la excepción de que los de la especie extinta suelen estar ramificados como los tallos. Difieren de "Rhynia" en la estructura de su rizoma que en el caso de "Horneophyton" es grueso, similar a un tubérculo alargado. Entre las células del parénquima de los rizomas se localizaban hifas de un hongo en lo que se cree que eran endomicorrizas. El esporangio era similar a "Rhynia" pero poseía una columela central que se continuaba con el floema del tallo. Estas estructuras hacen pensar en que la evolución de estos esporangios tuvo lugar por la modificación de los tallos alrededor de las estructuras productoras de esporas. Otras especies presentes de estructura similar a las anteriores son "Trichopherophyton teuchansii", "Ventarura lyonii" o "Nothia aphylla". Las convergencias evolutivas de estos géneros, es decir la similar estructura en forma de rizomas rastreros y talos erectos delgados, indica algún tipo de adaptación en estas plantas. Probablemente la reducción de las superficies trranspirantes tenga relación con el crecimiento en ambientes xerófitos o en atmósferas cargadas de gases como parecía suceder en Rhinie Chert aunque no explica la similitud en la estructura de los esporangios.