Complejo Chelonoidis nigra
Inicialmente, la tortuga gigante de Aldabra ("Geochelone gigantea") y las de las Galápagos fueron consideradas como una sola especie, pues los naturalistas pensaban que los marineros habían transportado a las tortugas. En 1783, Johann Gottlob Schneider clasificó todas las tortugas gigantes como "Testudo indica" («tortuga de las Indias»). En 1812 August Friedrich Schweigger las llamó "Testudo gigantea" («tortuga gigante»). En 1834, André Marie Constante Duméril y Gabriel Bibron clasificaron las tortugas de las Galápagos como una especie separada, a la que llamaron "Testudo nigrita" («tortuga negra»).
Odontochelys
Como una tortuga primitiva, "Odontochelys" difiere mucho de las tortugas modernas en varios aspectos. Las tortugas modernas poseen un pico córneo sin ningún diente en su boca, mientras que los fósiles de "Odontochelys" tienen dientes encajados en sus mandíbulas superiores e inferiores. Una de las características más relevantes de las tortugas -modernas y prehistóricas- son sus caparazones dorsales, que forman una armadura sobre el cuerpo del animal; "Odontochelys" sólo posee la porción inferior de la armadura de tortuga, el plastrón. Todavía no poseía un caparazón sólido como la mayoría de las otras tortugas y en lugar de ello tenía costillas ensanchadas, como las de los embriones de las tortugas modernas en las que aún no ha comenzado a desarrollarse el plato osificado de un caparazón.