Tercera carta de relación de Hernán Cortés al emperador Carlos V
Ante la muerte y destrucción que había dejado el sitio, Cortés menciona que intentó persuadir a la población de rendirse, recibiendo negativas, incluso de Cuauhtémoc. Al tomar todo el territorio, el capitán de un bergantín, García Holguín capturó a los señores de México, Texcoco y Tlacopan (Cuauhtémoc, Coanacochtzin y Tetlepanquetzaltzin). La captura de Cuauhtémoc, último señor de México-Tenochtitlán, se toma como la caída de los tenochcas y fin del Imperio mexica, el 13 de agosto de 1521.
Sitio de Tenochtitlan
En Tenochtitlan, Cuitláhuac nombró a Atlacótzin —nieto de Tlacaélel— como su nuevo cihuacóatl y a Cuauhtémoc como teotecuhtli o sumo sacerdote. La Excan Tlahtoloyan o Liga del Anáhuac fue restablecida, Tetlepanquetzaltzin asumió el trono de Tlacopan y Coanácochtzin el de Tetzcuco. El 7 de septiembre de 1520, durante los festejos de la coronación del nuevo huey tlatoani, fueron sacrificados los prisioneros españoles y algunos de los caballos que habían sobrevivido al episodio de la Noche Triste, sus cabezas fueron colocadas de forma alternada en el tzompantli del Huēy Teocalli o Templo Mayor. Sin embargo el gobierno de Cuitláhuac solo duró hasta el 25 de noviembre, en esa fecha el huey tlatoani murió a consecuencia de la epidemia de viruela que había comenzado a diezmar a la población indígena y que había comenzado a esparcirse por un esclavo africano que había llegado enfermo en la expedición de Narváez.