Chelonoidis chilensis
Se ha establecido, a pesar de su diferencia de tamaño, la cercanía genética entre el complejo insular que integran las tortugas de las Galápagos y "Chelonoidis chilensis", con una distancia genética menor que la que hay entre esta última y otras especies del género "Chelonoidis" del subcontinente sudamericano: el "morrocoy sabanero" y el "morrocoy de la selva".
Chelonoidis phantasticus
Aunque para la IUCN es una especie «Extinta», ya que en el año 1906 esta especie se dio a conocer por un solitario ejemplar macho encontrado (y muerto) por miembros de la expedición de la Academia de Ciencias de San Francisco. Si bien hubo un descubrimiento de excrementos de tortuga en el año 1964, ninguna otra tortuga o incluso sus restos se habían encontrado en Fernandina, hasta el 19 de febrero de 2019, cuando una expedición con especialistas del parque nacional Galápagos y la organización no gubernamental Galápagos Conservancy localizaron un espécimen (hembra adulta).