Chelonoidis chilensis
Se ha establecido, a pesar de su diferencia de tamaño, la cercanía genética entre el complejo insular que integran las tortugas de las Galápagos y "Chelonoidis chilensis", con una distancia genética menor que la que hay entre esta última y otras especies del género "Chelonoidis" del subcontinente sudamericano: el "morrocoy sabanero" y el "morrocoy de la selva".
Chelonoidis porteri
Esta especie integra, junto a los otros taxones, el complejo "Chelonoidis nigra" el que incluye a todas las especies de tortugas nativas de las islas Galápagos. Anteriormente, este taxón y los demás del complejo, eran considerados subespecies de "Chelonoidis nigra", pero nuevos estudios permitieron separarlos como especies plenas.