Cuauhtémoc
A Cortés no le interesó en ese momento la muerte de Cuauhtémoc. Prefería utilizar ante los mexicas su dignidad de Tlatoani, ahora subsidiaria del emperador Carlos V y del propio Cortés. Así lo hizo con éxito, aprovechando la iniciativa y el poder de Cuauhtémoc para asegurar la colaboración de los mexicas en los trabajos de limpieza y restauración de la ciudad. En los cuatro años que siguieron, la administración codiciosa por parte de los españoles, la desconfianza en Cortés, y los temores del propio Cortés, le llevaron a aprobar el tormento y la muerte del último tlatoani mexica.
Tercera carta de relación de Hernán Cortés al emperador Carlos V
Cortés explicó cómo ordenó a sus tropas inhabilitar a las poblaciones que rodeaban a la ciudad y que fueran vasallos y proveedores de los mexicas, con el fin de evitar que ingresaran a la ciudad productos básicos para la supervivencia de la población para que de esa forma Tenochtitlán sucumbiera con mayor rapidez al sitio. Es también contemporáneo a estos acontecimientos que Hernán Cortés menciona la primera de las epidemias de viruela, la cual mermó a la población indígena, falleciendo Cuitláhuac, hermano de Moctezuma, subiendo a la cabeza del imperio Cuauhtémoc. Bernal Díaz del Castillo menciona que dicha epidemia se debió a un esclavo negro que venía de la expedición de Pánfilo de Narváez.