Complejo Chelonoidis nigra
Inicialmente, la tortuga gigante de Aldabra ("Geochelone gigantea") y las de las Galápagos fueron consideradas como una sola especie, pues los naturalistas pensaban que los marineros habían transportado a las tortugas. En 1783, Johann Gottlob Schneider clasificó todas las tortugas gigantes como "Testudo indica" («tortuga de las Indias»). En 1812 August Friedrich Schweigger las llamó "Testudo gigantea" («tortuga gigante»). En 1834, André Marie Constante Duméril y Gabriel Bibron clasificaron las tortugas de las Galápagos como una especie separada, a la que llamaron "Testudo nigrita" («tortuga negra»).
Glyptemys insculpta
Muchos animales son depredadores o suponen una amenaza para la tortuga de bosque. Entre ellos se encuentran las tortugas mordedoras, los puercoespines, los castores, los mapaches, las nutrias, los zorros y los gatos. Todas estas especies destruyen las puestas de huevos y cazan a los recién nacidos y juveniles. Varios animales que a menudo buscan huevos de galápago, como el cuervo y el coyote pueden llegar a destruir por completo los nidos que encuentren. Son comunes marchas de ataques de depredadores, como heridas en la piel y caparazón, tendiendo a presentar más cicatrices las poblaciones del norte que las del sur. Además de estas amenazas, los galápagos de bosque también pueden ser parasitados por las sanguijuela.