Reinos nubios cristianos
En cuanto a las relaciones entre estos tres reinos cristianos no queda clara, aunque las fronteras probablemente habrían sido bastante fluidas y, además, compartían cultura material, religión, idioma y habían estado unidos bajo el gobierno meroítico. A partir de cierto momento se produjo la unificación de dos de estos reinos, Nobatia y Makuria, que serían conocidos bajo el único nombre de Makuria, pues la capital se fijó en Vieja Dongola. El proceso en sí no se conoce, pero en algún momento entre el 690-710, posiblemente en el 697, el rey Merkurios tendría la corona de ambos reinos, si bien otros autores opinan que Makuria ya tenía jurisdicción sobre toda Nubia a mediados del siglo VII. Independientemente de esto, Nobatia mantuvo un elemento de autogobierno, la figura política del eparca: un gobernador territorial similar a un virrey, aunque sus poderes no terminan de quedar claros.
Historia de Kush
La región de Nubia se encontraba al sur de Egipto, en lo que actualmente es Sudán del Norte. En ella se desarrolló el reino de Kush, que pasó por cuatro fases importantes. La primera de todas fue la del reino independiente de Kerma, que duró desde el 2600 al 1520 a.c., coincidiendo en el tiempo con el Reino Medio en Egipto. Kerma es el término que empleamos hoy para denominar lo que los egipcios conocían como Kash, que posteriormente acabó evolucionando en Kush. De las poblaciones que habitaron Nubia, la de Kerma o Kush fue la más desarrollada, y gracias a las investigaciones arqueológicas de los últimos años sabemos que llegaron a contar con asentamientos amurallados, producción cerámica y una economía productora. Era esta una región rica en recursos naturales, lo que enriqueció de manera importante al reino, pero que también atrajo las miradas de sus vecinos norteños, que comenzaban también a demandar por parte de sus clases altas elementos de prestigio y lujo que, en su tierra, escaseaban. Las relaciones entre ambos reinos, durante este momento, fueron de intercambio y recelo. Los egipcios disponían de importantes asentamientos fortificados que miraban con hostilidad al sur, al mismo tiempo que les proporcionaban manufacturas a cambio de oro, marfil, madera o animales exóticos. Con el tiempo, estas fortalezas del Alto Egipto se fueron independizando de la capital y manteniendo relaciones estrechas con el reino de Kerma, hasta el punto de que algunos investigadores consideran que hubo matrimonios mixtos en la frontera. En 1550 todo esto cambia con la invasión egipcia durante el Reino Nuevo. Kerma pasa a convertirse en la provincia de Nubia, dividida en dos distritos administrativos: Baja Nubia o Uauat, que se extendía desde la primera catarata a la ciudad de Semna, y la Alta Nubia o Kush, que iba desde esta localidad hasta la cuarta catarata del Nilo. La provincia estaba administrada por un virrey, cercano a la familia real, y que ostentaba el título oficial de «hijo real o hijo real de Kush». Se encargaba principalmente de la administración, tanto de tributos como de la gestión de las importantes minas de oro de la región. Para mejorar dicha gestión, el virrey extranjero nombraba a dos directores, uno por distrito, de origen indígena, que además permitía al virrey gestionar la provincia desde Tebas. Los directores nombraban a su vez a los alcaldes de las ciudades, teniendo solamente jurisdicción en los asuntos civiles. De los militares, así como de las plazas fuertes, se encargaban los oficiales del ejército egipcio, seguramente para evitar la rebelión. Para que pudiera ser factible este control administrativo, tuvo que haber otros elementos de control, ideológicos y políticos, para asegurar el predominio egipcio en la región. Uno de los más interesantes fue el sincretismo religioso. Los egipcios extendieron a Nubia su religión, mezclándose con el ya de por sí parecido culto indígena, y lo que es más importante, perpetuaron bajo la nueva religión los antiguos lugares de culto de los nubios, como el monte Djebel Barkal, en donde se fundó en la época del faraón Tutmosis III un templo dedicado a Amón. Pero la religión no fue la única estrategia de control egipcia. Las élites nubias fueron educadas a la manera egipcia, adoptaron nombres egipcios y se enterraban a la manera de los egipcios. Estas élites fueron el principal apoyo del estado egipcio en Nubia, y aseguraron su poder en la provincia hasta el debilitamiento de este en torno a la XX dinastía.