Jutsu (Naruto)
Durante la segunda parte de la serie, se introduce el concepto de , alterando la cualidad del chakra. La manipulación de la naturaleza permite al ninja, después de cierto entrenamiento, transformar su chakra en uno de los cinco elementos: tierra, agua, fuego, viento, y relámpago. Cada elemento es más fuerte y poderoso que el anterior; por ejemplo, el fuego es débil contra el agua, pero puede contrarrestar fácilmente los jutsu basados en el viento. Todo los ninjas tienen una especial atracción por uno de los cinco elementos, lo que les permite usar jutsus de ese tipo con mayor facilidad. Los ninjas con afinidad al fuego, en consecuencia, son capaces de resistir e inhalar el fuego antes que manipular el agua.
Jutsu (Naruto)
Éstos jutsus son generalmente de ataque a distancia, pero como se ha visto a lo largo de la serie hay muchos Ninjutsus que son de ataque físico, como el Chidori, pero se diferencian del Taijutsu porque a diferencia de este se necesita moldear chakra para generar esferas o instrumentos hechos del mismo y a menudo adicionarle un elemento para que aumente la fuerza al golpear. Así mismo se ha visto que muchos Ninjutsus como el Rasengan y sus demás variantes se pueden usar a distancia y cuerpo a cuerpo.