Reforma protestante
Durante aproximadamente 20 años, la Iglesia católica había visto cómo gran parte de sus fieles se peleaban entre ellos en Europa, y obispos que dejaban de reconocer al papa como Primus inter pares o como máximo pontífice de la Iglesia católica, y se separaban de Roma incluso algunos cardenales, en consecuencia, hubo muchos católicos que requerían una reacción de la Iglesia que mejorase las costumbres, corrigiendo los abusos que habían alimentado la Reforma protestante. A esta reacción de la Iglesia católica ante el protestantismo se le conoce generalmente con el nombre de Contrarreforma católica, aunque algunos historiadores consideran más preciso el término «Reforma católica».
Bautistas Reformados
En Francia, los protestantes reformados fueron llamados Hugonotes. los Iglesia reformada de Francia sobrevivió a la persecución desde 1559 hasta la Edicto de Nantes (1598), cuyo efecto fue establecer regiones en las que los protestantes pudieran vivir sin ser molestados. Estas áreas se convirtieron en centros de resistencia política bajo los cuales se protegió la iglesia reformada hasta 1628, cuando La Rochelle, el centro protestante de resistencia a Luis XIII, fue invadido por un bloqueo del ejército francés. Después de que fracasara la resistencia protestante, la Iglesia Reformada de Francia se reorganizó y se le garantizó la tolerancia bajo la Edicto de Nantes hasta la revocación final de la tolerancia en 1685 (Edicto de Fontainebleau). Los períodos de persecución esparcieron a los refugiados reformados franceses a Inglaterra, Alemania, Suiza, Países Bajos, África (especialmente Sudáfrica) y America. Luis XVI concedió una edicto de tolerancia. La libertad de religión llegó con la Revolución Francesa. Napoleón organizó una iglesia reformada francesa controlada por el estado con la Artículos orgánicos en 1802. Un sínodo libre (es decir, no controlado por el estado) de la Iglesia Reformada surgió en 1848 y sobrevive en pequeñas cantidades hasta la actualidad. Los refugiados franceses establecieron iglesias reformadas francesas en los países latinos y en América.