Jutsu (Naruto)
Durante la segunda parte de la serie, se introduce el concepto de , alterando la cualidad del chakra. La manipulación de la naturaleza permite al ninja, después de cierto entrenamiento, transformar su chakra en uno de los cinco elementos: tierra, agua, fuego, viento, y relámpago. Cada elemento es más fuerte y poderoso que el anterior; por ejemplo, el fuego es débil contra el agua, pero puede contrarrestar fácilmente los jutsu basados en el viento. Todo los ninjas tienen una especial atracción por uno de los cinco elementos, lo que les permite usar jutsus de ese tipo con mayor facilidad. Los ninjas con afinidad al fuego, en consecuencia, son capaces de resistir e inhalar el fuego antes que manipular el agua.
Jinchūriki
Madara se convirtió en el Jinchuuriki del Diez Colas luego de capturar a Ocho de ellas y a la mitad del Nueve Colas sellado en Naruto. Luego, selló el Jūbi en él, convirtiéndose en un Jinchuuriki. Madara obtuvo un poder incluso hasta mayor que Obito, capaz de sobrevivir a Might Guy en su octava puerta y enfrentar a Naruto Uzumaki y Sasuke Uchiha al recibir sus nuevos poderes. Tras combinar el poder de sus Rinnegan original y el poder del Jūbi, un tercer ojo nació en Madara, el Rinnesharingan. Inesperadamente, Madara fue traicionado por Zetsu Negro, para su mala suerte, Zetsu utilizó el cuerpo de Madara para revivir a su "madre" y voluntad, Kaguya, la portadora original del Rinnesharingan, el Byakugan y la verdadera forma del Jūbi, así como madre biológica del Rikudō Sennin y su hermano. Desafortunadamente, Madara murió luego de perder al Jūbi cuando este fue sellado por Naruto y Sasuke.