Reforma protestante en España
Sin embargo, la Reforma protestante en España no arraigó debido a la implacable persecución a la que fueron sometidos los luteranos por la Inquisición española, lo que obligó a los que pudieron escapar a refugiarse en estados protestantes o más tolerantes. Henry Kamen destaca que «España era el único país europeo que contaba con una institución nacional dedicada a erradicar la herejía». Pero también existieron otras razones, como las que señala Joseph Pérez: «España estaba alejada del epicentro de la revolución religiosa; las reformas introducidas en la disciplina eclesiástica y en las órdenes religiosas en los primeros años del siglo XVI, aunque limitadas, habían contribuido a corregir ciertos abusos; por último, las inquietudes religiosas habían adoptado en la península Ibérica una forma original. En España es más fuerte la tentación del iluminismo que la del luteranismo o del calvinismo». Henry Kamen apunta otra más: «España no había experimentado desde el comienzo de la Edad Media ni una sola herejía que triunfara a nivel popular. Todas las luchas ideológicas desde la Reconquista se habían dirigido contra las religiones minoritarias, el Judaísmo y el Islam. En consecuencia, no había habido herejías autóctonas, al estilo de la de John Wycliff en Inglaterra, sobre las que pudieran enraizar las ideas luteranas».
Reforma en el Reino de Hungría
El movimiento de Reforma ejerció influencia sobre la vida religiosa y la teología en toda Europa, pero prosperó particularmente en aquellas regiones que estaban bajo una autoridad central débil. Los actos de los reformadores radicales alarmaron a mucha gente y una naciente nostalgia por los valores tradicionales de la iglesia dio un ímpetu a la renovación católica, que culminó con la Contrarreforma. Un cortesano español convertido en fraile, Ignacio de Loyola, estableció una orden religiosa altamente centralizada, la Compañía de Jesús. Conocidos popularmente como jesuitas, los miembros de la Compañía eran más bien misioneros o maestros que sacerdotes ordinarios desde la década de 1550. El Concilio de Trento (1545-1563) aprobó decretos para renovar y reforzar la teología católica y la vida de la iglesia. En respuesta al concepto de Lutero sobre una humanidad pecadora incapaz de cumplir la ley divina, el Concilio enfatizó que la humanidad retuvo el libre albedrío después de la Caída. La última sesión del concilio ordenó la fundación de seminarios para asegurar la formación de los párrocos.