Pesca con explosivos
Los arrecifes de coral dañados por la pesca con explosivos conllevan una disminución instantánea de la riqueza y cuantía de las especies de peces. Las bombas caseras utilizadas en la pesca con explosivos no sólo matan a los peces, pues también destruyen los esqueletos de los corales, creando escombros de corales desbalanceados. La eliminación de los peces también elimina la capacidad de resistencia de los arrecifes de coral al cambio climático, entorpeciendo aún más su recuperación. Tras una sola explosión, los arrecifes se pueden recuperar entre 5 y 10 años, mientras que la práctica frecuente y generalizada de ellas transforma estos ecosistemas biodiversos en escombros inestables continuos.
Arrecife de coral del Amazonas
Como todos los arrecifes coralinos del mundo el arrecife del Amazonas está amenazado por el aumento de la temperatura de los océanos causada por el calentamiento global, que interfiere en la simbiosis del coral con sus algas microscópicas y priva al arrecife de su principal fuente de nutrición; si esta condición se prolonga, puede morir. Otra amenaza, son las perforaciones petrolíferas en la región; a fecha del descubrimiento del arrecife, existían 95 pozos, y el gobierno de Brasil no ha renunciado a establecer en la zona un nuevo enclave para la extracción de petróleo crudo. Empresas como Total y BP se han interesado por las reservas en el área, que pueden aproximarse a los veinte mil millones de barriles.