Lenguas guanches
El guanche no ha sido clasificado con certeza. Muchos lingüistas proponen que el guanche era probablemente un idioma bereber, o que al menos estaba relacionado con los idiomas bereberes. Sin embargo, las palabras bereberes reconocibles son principalmente vocabulario agrícola o ganadero, mientras que no se han identificado inflexiones gramaticales bereberes y hay una gran cantidad de vocabulario que no se parece en absoluto al bereber. Por ello, es posible que el guanche en realidad solo tuviera el bereber como sustrato y no perteneciera a su familia lingüística.
Lenguas Ubangui
J. Greenberg (1963) clasificó las entonces poco conocidas lenguas Ubangui como parte de la macrofamilia Níger-Congo y posteriormente las clasificó junto con las lenguas Adamawa en una rama llamada "Adamawa oriental". Los trabajos posteriores no parece confirmar que se trata de una unidad filogenética válida. Así R. Blench propone una rama dentro de las lenguas Níger-Congo, la llamada lenguas de la Sabana. Sin embargo, la incertidumbre de clasificación externa es todavía mayor después de la revisión de Dimmendaal (2008), quien concluye que la incapacidad para generar una evincia convincente dentro de la macrofamilia Níger-Congo, sugiere que las lenguas Ubangui "probablemente constituyen una familia lingüística independiente que no puede demostrarse esté relacionado con las otras lenguas Níger-Congo (ni ninguna otra familia establecida)".