Respiración
Las plantas realizan exactamente la misma respiración aeróbica descrita anteriormente. Durante la noche, la fotosíntesis queda en suspenso por carencia de luz. Aun así la respiración en las plantas se produce en todo momento para obtener la energía necesaria para llevar a cabo el catabolismo, del mismo modo que lo hacen el resto de eucariontes: Mediante la oxidación de glúcidos por parte de enzimas que conduce a la liberación de dióxido de carbono al medio ambiente. Aun así, la cantidad de dióxido de carbono que los autótrofos desprenden es menor que la cantidad que absorben para realizar la fotosíntesis, y el oxígeno que necesitan también es menor que el que llegan a desprender. La emisión limpia de dióxido de carbono es relativamente muy pequeña en comparación con la producción de oxígeno.
Gliceraldehído 3-fosfato
Durante la fotosíntesis que se realiza en las plantas, se producen 2 moléculas de glicerato-3-fosfato (GP; conocido también como 3-fosfoglicerato) en el primer paso de la reacción independiente de la luz, cuando la ribulosa-1,5-bisfosfato (RuBP) y el dióxido de carbono se unen en la reacción catalizada por la enzima RuBisCO. El GP se convierte en D-gliceraldehído-3-fosfato (G3P) utilizando para ello la energía proveniente de ATP y el poder reductor de NADPH, como parte del ciclo de Calvin.