Cuenca del Congo
El río y sus afluentes fluyen por la selva del Congo. Por su área es la segunda selva más grande del mundo, solo superada por la selva del Amazonas en Sudamérica. Por su caudal el río es el tercer río más caudaloso del mundo, superado solo por el Amazonas y el complejo del Ganges-Brahmaputra-Meghna; y es uno de los ríos más profundos del mundo, alcanzando profundidades que superan los 220 m. Debido a que su cuenca comprende sectores tanto al norte como al sur del ecuador, su caudal es estable, ya que siempre hay por lo menos un sector del río en el cual es la temporada de lluvias.
Valle del Colca
Luego de su paso por la antigua población de Maca, la pendiente del río aumenta notablemente y el río se va alejando en profundidad del nivel del valle en el que se encuentran las poblaciones. Es aquí donde empieza el Cañón del Colca propiamente dicho. Alcanza su mayor profundidad cerca del famoso mirador de Cruz del Cóndor. Es uno de los cañones más profundos del mundo, con 3670 o 3200 m de profundidad. Luego de un descenso notable, caracterizado por lo que los piragüistas consideran algunos de los mejores rápidos del hemisferio occidental, el río toma el nombre de Majes al entrar al Valle del mismo nombre. Finalmente, y luego de un descenso mayor hacia la costa del océano Pacífico, el río toma el nombre de Camaná y desemboca en el mar cerca de la ciudad del mismo nombre.