Ç
La ce cedilla se usó antiguamente para un sonido que se cree que era la consonante alveolar africada sorda de, por ejemplo "plaça", semejante y opuesto al de la antigua "z", que se cree que representaba la consonante alveolar africada sonora , por ejemplo en "vezino". A raíz de la última gran transformación fonológica del español, culminada hacia los siglos y , la diferencia entre esos dos fonemas desapareció, con la pérdida de la sonoridad como rasgo relevante en fricativas y africadas, y, por otro lado, en el norte y centro de España el fonema adquirió un sonido [θ], y en el suroeste se fusionó con /s/. Debido a que el número de grafías para los sonidos que quedaban resultaba excesivo ("z", "c", "ç") y a que su uso ya no respondía a diferencias reales, la RAE decidió, en el , simplificar el alfabeto eliminando la "ç".
J
En español medieval la letra j era pronunciada como la fricativa postalveolar sonora /ž/ (como la j francesa, signo AFI /ʒ/). Fue a partir del siglo XV durante el reajuste de las consonantes sibilantes cuando se perdió la sonora /ž/ por la sorda /š/ (equivalente al dígrafo "sh" en inglés, AFI /ʃ/, representada por la x sorda). En la misma época, se inició (se estima que en Sevilla) la velarización de /š/ por la moderna j /x/ representada por la x. Este cambio de lugar de articulación se extendió progresivamente a finales del siglo XVI y se hizo normal hacia la mitad del siglo XVII. Ya en el siglo XVIII la j tomaría su actual fonema /x/.