Área 51
El intenso secretismo que rodea a la base, cuya existencia no fue reconocida por el Gobierno de los Estados Unidos hasta el 29 de septiembre de 1995, ha llegado a convertirse en el tema principal de las teorías de conspiración y el fenómeno ovni. Todo lo que ocurre en Área 51 es Información Compartimentada y Clasificada como de Alto Secreto, por lo que esta política de seguridad del gobierno asegura que solo aquellos con la suficiente "necesidad de conocimiento" tienen exclusivamente acceso a información que estos requieren, garantizando así que sujetos desconocidos no obtengan información de lo que no conocen.
Comando Stargate
El SGC también sirve como un lugar para la investigación de tecnología alienígena, pero los proyectos más grandes y largos tienen lugar en el Área 51. En más de una ocasión, el personal del SGC ha tenido que abandonar la base para recapturar tecnología alienígena que había salido al mundo exterior. El personal del SGC firma un contrato para mantener en secreto la existencia de la base y todas las operaciones que allí se realizan. La gran mayoría del personal duerme allí mismo. Se les permite dejar la base para poder desarrollar una vida normal siempre que la situación lo permita. Se han generado muchas historias de encubrimiento para mantener el desconocimiento del público general acerca de la existencia del SGC.