Lenguas guanches
El guanche no ha sido clasificado con certeza. Muchos lingüistas proponen que el guanche era probablemente un idioma bereber, o que al menos estaba relacionado con los idiomas bereberes. Sin embargo, las palabras bereberes reconocibles son principalmente vocabulario agrícola o ganadero, mientras que no se han identificado inflexiones gramaticales bereberes y hay una gran cantidad de vocabulario que no se parece en absoluto al bereber. Por ello, es posible que el guanche en realidad solo tuviera el bereber como sustrato y no perteneciera a su familia lingüística.
Lenguas bereberes orientales
La clasificación interna también ha sido discutida. "Ethnologue" clasifica como lenguas orientales solo tres lenguas: el sawknah (sokna, foqaha), el awjilah y el siwi o siwa. Considerando que las dos primera forman un grupo. Sin embargo, la conservación del fonema /*β/ del protobereber en ghadamès y awjila apunta a que la clasificación de "Ethnologue" no es correcta.