Arrecife periférico
Los arrecifes de mantenimiento crecen al mismo ritmo que sube el nivel del mar. Los arrecifes de recuperación inicialmente crecen más lentamente que el nivel del mar, pero finalmente se recuperan cuando el aumento del nivel del mar disminuye o se detiene. Los arrecifes abandonados no pueden crecer lo suficientemente rápido y se "ahogan". Hay seis formas principales diferentes en las que los arrecifes marginales crecen y se desarrollan.Al igual que con otros tipos de arrecifes, existen muchas razones para la destrucción de los arrecifes marginales. Las prácticas de pesca destructivas, como la pesca con cianuro, la pesca con explosivos, la pesca de arrastre de fondo y el muro-ami (golpear el arrecife con palos), pueden tener efectos perjudiciales. La pesca de arrastre es una de las mayores amenazas para los arrecifes de coral de agua fría. La sobrepesca afecta el equilibrio ecológico de las comunidades de los arrecifes de coral, perturbando la cadena alimentaria y provocando efectos mucho más allá de la población directamente sobrepescada. El turismo, como la navegación descuidada, el buceo, el esnórquel y la pesca, con personas tocando los arrecifes, removiendo sedimentos, recolectando corales y echando anclas en los arrecifes, puede destruir los arrecifes. Algunos centros turísticos e infraestructura se han construido directamente sobre los arrecifes, y algunos centros turísticos vacían sus aguas residuales u otros desechos directamente en el agua que rodea los arrecifes de coral.
Acidificación oceánica en la Gran Barrera de Coral
Los organismos calcificadores están en riesgo, debido a la resultante falta de aragonito en el agua y la disminución del pH. Esta disminución de la salud de los arrecifes de coral, en particular la Gran Barrera de Coral, puede dar lugar a una reducción de la biodiversidad. Los organismos pueden sufrir estrés debido a la acidificación del océano y la desaparición de los arrecifes de coral sanos, como la Gran Barrera de Coral, es una pérdida de hábitat para varios taxones. El dióxido de carbono atmosférico ha aumentado de 280 a 409 ppm desde la revolución industrial. Este aumento de dióxido de carbono ha llevado a una disminución de 0,1 del pH, y podría disminuir en 0,5 para el 2100. Cuando el dióxido de carbono se encuentra con el agua de mar forma ácido carbónico, que luego se disocia en hidrógeno, bicarbonato y carbonato y reduce el pH del océano. La temperatura de la superficie del mar, la acidez del océano y el carbono inorgánico disuelto también están positivamente correlacionados con el dióxido de carbono atmosférico. La acidificación de los océanos puede causar hipercapnia y aumentar el estrés en los organismos marinos, lo que conduce a una disminución de la diversidad biológica. Los propios arrecifes de coral también pueden verse afectados negativamente por la acidificación oceánica, ya que las tasas de calcificación disminuyen a medida que aumenta la acidez.