Facultad de Informática de San Sebastián
También ha evolucionado con los años la formación de postgrado. Lo que tradicionalmente eran cursos de doctorado hoy en día son Cursos de Máster. La primera experiencia como máster postgrado fue el máster en Ciencia y Tecnología de Computadores" que se impartió entre 1991 y 1993. La oferta actual se concreta en los siguientes másteres: Ingeniería de Sistemas Empotrados, Análisis y Procesamiento del Lenguaje (HAP, Hizkuntzaren Azterketa eta Prozesamendua, desde el curso 2007/08), Sistemas Informáticos Avanzados, Ingeniería Computacional y Sistemas Inteligentes, Tecnología de Apoyo a la Autonomía Personal (a partir del curso 2009/10), y Computación de Altas Prestaciones (a partir del curso 2013/14). Durante el curso 2014/15 se comenzarán a impartir el máster profesional en Ingeniería Informática, y el máster "Erasmus Mundus" Language and Communication Technologies."
Título propio
Cómo establece la Ley Orgánica de Universidades, en España, en respuesta a la gran demanda de educación especializada de carácter práctico además de la oferta de enseñanzas superiores oficiales, las universidades y escuelas de negocios pueden establecer otro tipo de enseñanzas que incluyen másteres, diplomados y títulos de experto/especialista, certificadas por diplomas y títulos propios, basados en normativas internas, a diferencia de los títulos universitarios.  La normativa de las titulaciones de "Máster" como títulos propios viene dictada por las instituciones educativas que los emiten. Sin embargo, este tipo de enseñanzas no están homologadas, por lo que no pueden acogerse a acuerdos o convenios de convalidaciones, aunque en el ámbito laboral son igualmente reconocidos.