Bacillus thuringiensis
La exposición constante a una toxina da lugar a la presión selectiva, que contribuye a que las plagas se hagan resistentes a la toxina. Actualmente, se sabe que la población de un tipo de polillas se ha vuelto resistente al Bt en forma de spray (es decir, sin ingeniería genética) cuando se utiliza en la agricultura ecológica. El mismo investigador ha informado recientemente del primer caso documentado de una plaga resistente al algodón transgénico.
Disrupción del apareamiento
La disrupción del apareamiento es una forma de manejo de plagas que sirve para controlar las poblaciones de ciertos insectos plagas por medio de la introducción de estímulos artificiales que confunden a los individuos y les impide la localización de parejas o el cortejo, bloqueando así el ciclo reproductivo. Generalmente incluye el uso de feromonas sexuales sintéticas. También se están desarrollando otros métodos como interferir con la comunicación vibratoria.