Gramática del idioma muisca
La primera es la pronunciación de la z, sobre la que Fray Bernardo de Lugo, en su "Gramática en la lengua general del Nuevo Reino, llamada Mosca", publicada en 1619, dice que debe pronunciarse como la s, conservándola tan solo «por ser necesaria para la escriptura» . Sin embargo, Fray Bernardo de Lugo empleó el signo ʒh para el sonido que posteriormente se ha reservado para la z, que es el equivalente al ts castellano o casi al tch francés.En cuanto a la letra ç, se identifica normalmente como [ts], pero es un alófono de /s/. Se encuentra en algunos préstamos del español, como en igleçia y plaça.
Consonante velar
Entre las lenguas del mundo el cambio fonético más frecuente que experimentan las consonantes velares es la palatalización ante vocal anterior o palatal. Ese cambio es por ejemplo el origen de que en español y otros idiomas romances las letras "c" y "g" no se pronuncien igual cuando les siguen las vocales "e" o "i" que en el resto de posiciones. Sin embargo, el fonema /x/ del español es en gran parte el resultado de una despalatalización de los antiguos fonemas /š, ž/ [], que a su vez procedían de palatalizaciones de diversas consonantes latinas.