Misa del Papa Marcelo
Las sesiones tercera y de clausura del Concilio de Trento sucedieron en 1562–63, en las cuales se discutió el uso de la música polifónica en la Iglesia católica. El interés residía en dos cuestiones: primero, el uso de música inaceptable, como las canciones seculares proporcionadas con letras religiosas (contrafacta) o las misas basadas en canciones con letras sobre beber y galanteos; y segundo, si la imitación en música polifónica obscurecía las palabras de la misa, interfiriendo con la devoción del oyente. Se debatió si la polifonía tendría que ser prohibida en el culto, y algunos de las publicaciones auxiliares por asistentes del concilio advierten contra estos problemas. Aun así, ninguno de las proclamaciones oficiales del Concilio menciona la música polifónica, exceptuando un mandato contra el uso de música que era, en las palabras del Concilio, "lasciva o impura".
Misa en si menor, BWV 232
Aunque recientemente se está debatiendo la posibilidad de una interpretación en Viena en tiempos de Bach, se considera que la primera interpretación pública (aunque parcial) tuvo lugar en 1834/1835, a cargo de la Berliner Singakademie, dirigida por Carl Friedrich Rundhagen; el primer proyecto de edición data de 1816 por parte del editor Wesley. La primera interpretación completa no se dio hasta el año 1856; fue en Fráncfort, a cargo de la Asociación de Santa Cecilia de esa ciudad. La primera edición fue obra de Nägeli, en 1845. En el 2015, el manuscrito de la misa fue declarado Patrimonio de la Humanidad por la UNESCO.