Club Atlético Los Andes
El clásico rival histórico de Los Andes es el Club Atlético Banfield, de la vecina ciudad homónima. La rivalidad nace en los primeros tiempos de la era profesional del fútbol argentino. Han jugado 56 partidos, con 12 partidos ganados por el "milrayitas", 22 por el "taladro" y 22 empates, con una ventaja en el historial para el conjunto banfileño. de la vecina ciudad de Lomas de Zamora, con el cual ya comenzó a rivalizar en los inicios de la era profesional del fútbol argentino.
Club Atlético San Martín (San Juan)
El clásico rival de San Martín es el Club Atlético de la Juventud Alianza, ya que ambos eran los clubes más longevos de la ciudad (luego Juvenud Alianza se mudó a Villa Krause, y posteriormente a Santa Lucía -donde continúa-, ciudades del Gran San Juan), aunque actualmente el partido no se juega en forma oficial desde hace muchos años debido a encontrarse en diferentes categorías (Juventud Alianza compite en la cuarta división del fútbol argentino, el Torneo Federal B). También posee una rivalidad antigua con el Club Sportivo Peñarol debido a la cercanía geográfica de ambos clubes.