Reformismo borbónico
El tercer pilar de la ""nueva planta académica"" fue la Real Academia de la Historia, nacida oficialmente en 1738 y cuyos miembros recibieron también el privilegio de «criados de la casa real». Su origen, como el de la Real Academia Española, fue una tertulia privada surgida hacia 1735 que se reunía en casa del abogado Julián de Hermosilla, en la que no se trataban únicamente cuestiones de historia, por lo que inicialmente se llamó Academia Universal, pero que pronto se orientó exclusivamente a la historia y geografía de España. Una parte de sus miembros pretendía depurar "la historia de España de invenciones basadas en leyendas y cronicones falsos", aunque este trabajo crítico debía ser compatible con la historia sagrada. El primer apoyo oficial, concretamente del confesor del rey, lo recibió al año siguiente cuando la academia se reunió en la Real Biblioteca. Sin embargo, las primeras actividades historiográficas de la Academia fueron poco afortunadas, como la publicación de la "España Primitiva" de Francisco Xavier de la Huerta y Vega que estaba basada en un falso cronicón del siglo XVII, lo que fue denunciado por el bibliotecario real el ilustrado valenciano Gregorio Mayáns que recibió presiones de las Academias de la Historia y de la Lengua para que cambiara su criterio, pero a pesar de ello la obra finalmente se publicó.
Real Academia de Bellas Artes de la Purísima Concepción
En sus inicios, se propuso un ambicioso programa de defensa de las artes y de la enseñanza de las mismas, así como las matemáticas y, poco después, la arquitectura. Sus estudios estaban homologados y, después de que Carlos IV equiparó la misma a la Real Academia de Bellas Artes de San Carlos, expidió títulos oficiales de agrimensor o maestro de obras. Más tarde, en 1808, cumplió funciones de visado de los proyectos arquitectónicos de la región. Establecido el régimen liberal durante el reinado de Isabel II, la reestructuración de las Academias de España dejó a la de Valladolid como "Academia Provincial de Bellas Artes" de primera clase, donde se impartían estudios oficiales elementales y superiores (estos últimos hasta 1869). Después debió hacerse cargo de las obras de arte de las instituciones religiosas desamortizadas. En 1883 alcanzó la Academia el máximo de alumnado de su historia, con 1.238 inscritos. La reorganización de las enseñanzas de 1892 supuso el fin de las funciones como institución educativa pública, quedando relegada a un papel más restringido. En 1936 recuperó el nombre original que mantiene en la actualidad.