Divisoria Congo-Nilo
La divisoria Congo-Nilo (o cuenca Nilo Congo) es una de las principales divisorias continentales de África, la que separa las cuencas de drenaje de los ríos Nilo y Congo. La cuenca del Congo —que drena y pertenece a tres países— y la cuenca del Nilo —que drena y es parte de once países— son dos de las (la 3.ª y la 5.ª). La línea divisoria Congo-Nilo tiene una longitud de cerca de y discurre, o es frontera, de ocho países: República Centroafricana, Sudán, Sudán del Sur, República Democrática del Congo, Uganda, Ruanda, Burundi y Tanzania.
Río Dja
En el tramo final de la reserva, el río también es durante un corto tramo la frontera entre las regiones del Este y del Sur, en la que no entra. Vira hacia el sureste y tras un corto tramo llega a la frontera con la República del Congo. Durante toda la parte final de su curso, en dirección este-sureste, el río formará la frontera natural entre Camerún y el Congo (en concreto, con la región de Sangha).