Bacillus thuringiensis
La exposición constante a una toxina da lugar a la presión selectiva, que contribuye a que las plagas se hagan resistentes a la toxina. Actualmente, se sabe que la población de un tipo de polillas se ha vuelto resistente al Bt en forma de spray (es decir, sin ingeniería genética) cuando se utiliza en la agricultura ecológica. El mismo investigador ha informado recientemente del primer caso documentado de una plaga resistente al algodón transgénico.
Maleza
Comprender el hábito de las malezas también es importante para los métodos no químicos de control de las mismas, como el arado, el raspado de la superficie, la promoción de cultivos de cobertura más beneficiosos y la prevención de la acumulación de semillas en los campos. Por ejemplo, el amaranto es una planta comestible que la agricultura moderna considera una maleza. Produce abundantes semillas (hasta un millón por planta) que duran muchos años, y es de crecimiento rápido y temprano. Aquellos que buscan controlar el amaranto citan el mantra "¡Las semillas de este año se convierten en las malezas del año que viene!". Sin embargo, otra visión del amaranto valora la planta como una fuente de alimento resistente.