Bacillus thuringiensis
La exposición constante a una toxina da lugar a la presión selectiva, que contribuye a que las plagas se hagan resistentes a la toxina. Actualmente, se sabe que la población de un tipo de polillas se ha vuelto resistente al Bt en forma de spray (es decir, sin ingeniería genética) cuando se utiliza en la agricultura ecológica. El mismo investigador ha informado recientemente del primer caso documentado de una plaga resistente al algodón transgénico.
Cydia pomonella
Se han realizado ensayos con pulverizaciones de caolín y han dado buenos resultados en el control de esta plaga ya que las mariposas encuentran inapropiadas para realizar las puestas las hojas y frutos tratados con esta arcilla. El caolín también hace que los árboles sean menos reconocibles por los insectos. El recubrimiento por caolín debe de ser total por lo que debe ser renovado si es lavado por lluvias, pero también debe conseguirse que en el momento de la recolección la fruta esté limpia de caolín.