Lenguas papúes
Las lenguas papúes suman más de 750 lenguas, lo que hace de Nueva Guinea y sus alrededores la zona con mayor diversidad lingüística del mundo. Si bien en Papúa-Nueva Guinea hay tres lenguas oficiales: el tok pisin, el hiri motu y el inglés y una única lengua oficial en Irian Jaya: la variante bahasa indonesia del malayo. Las más de 750 lenguas autóctonas de Nueva Guinea se clasifican en unas 60 familias diferentes, habiendo una docena de lenguas papúes que son lenguas aisladas, es decir, no tienen relación demostrable con ninguna otra lengua.
Lenguas papúes sudorientales
Algunos papuanistas creen que podrían formar un grupo filogenético dentro de las lenguas trans-neoguineanas (TNG), aunque eso no ha sido bien establecido que guarden un parentesco cercano con otros grupos dentro del TNG. Sin embargo, todas las lenguas sudorientales tienen en común la forma "ya" para 'vosotros', en lugar de formas derivadas del proto-TNG "*gi". Las lenguas goilalanas son incluidas frecuentemente dentro de las lenguas papúes sudorientales, aunque es cuestionable su inclusión como lengua TNG.