Bacillus thuringiensis
La exposición constante a una toxina da lugar a la presión selectiva, que contribuye a que las plagas se hagan resistentes a la toxina. Actualmente, se sabe que la población de un tipo de polillas se ha vuelto resistente al Bt en forma de spray (es decir, sin ingeniería genética) cuando se utiliza en la agricultura ecológica. El mismo investigador ha informado recientemente del primer caso documentado de una plaga resistente al algodón transgénico.
Peronospora farinosa
Como en otros mildius, el patógeno persiste durante el invierno en forma de oosporas en el suelo del cultivo, en las semillas o sobre la propia planta. En el caso de la remolacha la infección se realiza durante el estadio de germinación y la formación de la plántula. Los cotiledones son sistemáticamente infectados, resultando en una decoloración y deformación. La infección es menos efectiva en las hojas maduras de la remolacha. El control de la enfermedad se realiza tratando las semillas y retirando aquellas plantas que han sido infectadas. Por lo general no es necesario el uso de fungicidas. En las espinacas ataca las hojas desarrolladas, y el tratamiento requiere el uso de fungicidas específicos.