Ç
La ce cedilla se usó antiguamente para un sonido que se cree que era la consonante alveolar africada sorda de, por ejemplo "plaça", semejante y opuesto al de la antigua "z", que se cree que representaba la consonante alveolar africada sonora , por ejemplo en "vezino". A raíz de la última gran transformación fonológica del español, culminada hacia los siglos y , la diferencia entre esos dos fonemas desapareció, con la pérdida de la sonoridad como rasgo relevante en fricativas y africadas, y, por otro lado, en el norte y centro de España el fonema adquirió un sonido [θ], y en el suroeste se fusionó con /s/. Debido a que el número de grafías para los sonidos que quedaban resultaba excesivo ("z", "c", "ç") y a que su uso ya no respondía a diferencias reales, la RAE decidió, en el , simplificar el alfabeto eliminando la "ç".
Ch
El dígrafo "ch" representa sonidos diferentes en cada idioma. Se considera una letra separada en los idiomas bretón (donde representa [ʃ], una consonante fricativa prepalatal sorda), galés, checo y eslovaco (donde representa [x], una consonante fricativa velar sorda). No se considera una letra separada en los idiomas inglés ([tʃ], [k], [ʃ]), francés ([ʃ], [k]), alemán ([x], [ç], [k]), italiano ([k] antes de "e", "i", como el dígrafo "qu" español), portugués ([ʃ]), neerlandés ([x]), sueco ([ɧ], [ɕ]; [k] o mudo en la conjunción "och") y vietnamita ([c] en inicio, [k̟] en fin de sílaba). El sistema pinyin de la representación fonética del chino usa el dígrafo "ch" para representar el sonido [tʂʰ].