Bacillus thuringiensis
La exposición constante a una toxina da lugar a la presión selectiva, que contribuye a que las plagas se hagan resistentes a la toxina. Actualmente, se sabe que la población de un tipo de polillas se ha vuelto resistente al Bt en forma de spray (es decir, sin ingeniería genética) cuando se utiliza en la agricultura ecológica. El mismo investigador ha informado recientemente del primer caso documentado de una plaga resistente al algodón transgénico.
Horticultura orgánica
Hay varios sistemas de control de plagas. En la horticultura química se usan pesticidas altamente específicos que matan rápidamente a un tipo determinado de insecto plaga. Los productos químicos pueden reducir dramáticamente las poblaciones de plagas en un corto plazo pero, infortunadamente, esto destruye también a las poblaciones de los parásitos y predadores que normalmente actúan como controles biológicos de las plagas. Esto, más tarde causa un resurgimiento de las poblaciones de las plagas. Como consecuencia se crea un problema mayor que el original. El uso repetido de plaguicidas o pesticidas lleva a crear resistencia contra ellos y se vuelve necesario usar mayores dosis y tipos más poderosos de controles químicos.