Clara de Asís
Clara e Inés pronto abandonaron el beaterio de San Ángel. Así Francisco habló con los camaldulenses del monte Subasio, que antes habían donado a la nueva Orden la Porciúncula, los cuales le ofrecieron cederles la iglesia de San Damián y la casa anexa, que serían desde ese momento la casa de Clara durante 41 años hasta su muerte.
Misión Santa Clara de Asís
En 1850, California se convirtió en estado. Con ese cambio, los sacerdotes de la orden Compañía de Jesús tomaron el control de la Misión Santa Clara de Asís en 1851 de manos de los franciscanos. El padre John Nobili, S.J., fue puesto a cargo de la misión. Comenzó una universidad en el sitio de la misión en 1851, que se convirtió en Universidad de Santa Clara; es la única misión de formar parte de una universidad, y también es la universidad más antigua de California. A lo largo de la historia de la misión, las campanas han sonado fielmente todas las noches, una promesa hecha al rey Carlos III de España cuando envió las campanas originales a la misión en 1777. Pidió que las campanas se tocaran cada noche en 8:30 en memoria de los fallecidos, aunque las campanas reales han sido reemplazadas por una grabación. El campanario tiene tres campanas; uno fue donado por el rey Carlos IV pero posteriormente destruido en un incendio. El rey Alfonso XIII donó una campana de reemplazo, que se exhibe en el "Saisset Museum" (en la misión).