Perro mestizo
Las poblaciones son especialmente vulnerables cuando los perros criados están estrechamente relacionados. La endogamia entre los purasangres ha puesto de manifiesto varios problemas de salud genéticos no siempre evidentes en las poblaciones menos uniformes (como la displacía de cadera). Los perros de raza mixta son genéticamente más diversos debido a la naturaleza más desordenada de apareamiento de sus parentales. La descendencia de estos apareamientos puede ser menos propensa a expresar ciertos trastornos genéticos ya que puede haber una disminución de la probabilidad de que los dos padres sean portadores de los mismos alelos perjudiciales recesivos. Sin embargo, algunos genes con alelos recesivos deletéreos (genes letales), se presentan a través de muchas razas aparentemente sin relación, por lo tanto mezclar las razas no es garantía de salud genética, (únicamente de diversidad), pero el entrecruzamiento de dos ejemplares genéticamente pobres no garantizará que la descendencia resultante será más saludable que los padres, porque la descendencia podría heredar los peores rasgos de ambos padres. Esto se ve comúnmente en los perros que vienen de fábricas de cachorros. En muchas líneas de perros de raza pura se han perdido los rasgos saludables debido a que los criadores de perros con pedigree están más interesados en conservar de una generación a otra la “conformación” -las características físicas de los perros en relación con el estándar de la raza- que la salud y el temperamento de trabajo para los que el perro fue criado originalmente.
Perro mestizo
Los estudios que se han hecho en los Estados Unidos sobre la salud, muestran que los perros mestizos son, en promedio, más saludables, con una mayor expectativa de vida a diferencia de los perros de raza. Esto se debe a que la corriente aceptada en las prácticas de crianza en las asociaciones de criadores caninos con pedigrí, resultan en una reducción de la diversidad genética, lo que puede ocasionar problemas de salud por la manifestación de trastornos. Estudios han demostrado que los perros de raza mixta poseen un número considerable de rasgos reproductivos deseables. Scott y Fuller encontraron que las hembras mestizas fueron madres superiores en comparación con las madres de raza pura, ya que en sus investigaciones observaron que producían más leche y dan una mejor atención a sus cachorros. Estas ventajas condujeron a una disminución de la mortalidad en las crías de perros mestizos, lo que podría señalar una correlación con el hecho de que con frecuencia, son los criadores profesionales quienes se encargan de la cría de las camadas de sus ejemplares reproductores lo que impide que los cachorros de las peores madres fallezcan, permitiendo que una predisposición a dicho comportamiento prevalezca, los perros de razas como el Pug,el Yorkshire terrier y el Bulldog, requieren que se realicen cesáreas en casi todos sus partos, ya que la cabeza de los cachorros suele ser más amplia que el canal de parto, lo que a menudo imposibilita a la madre el poder cuidar durante los primeros días de vida a sus cachorros.