Clemente VIII (antipapa)
La elección papal así prevista fue ejecutada solo por los tres cardenales leales a Benedicto XIII, puesto que Carrier, ausente en Francia, calificó la elección de simoniaca, pero Muñoz aceptó la designación y tomó el nombre de Clemente VIII. Dos años después, Carrier eligió él solo como papa al sacristán de Rodez Bernard Garnier Benedicto XIV.
Cónclave de 1689
El 6 de octubre de 1689, Ottoboni resultó elegido papa bajo el nombre de Alejandro VIII por unanimidad por cuarenta y nueve cardenales electores. Fue el primer papa veneciano en más de dos siglos. Ottoboni decidió tomar el nombre de Alejandro en honor del tío de Flavio Chigi, Alejandro VII, ya que Chigi había ayudado en su elección, y también respetó al Papa Alejandro III, que era popular entre los venecianos. Originalmente había considerado tomar el nombre de Urbano, en honor de Urbano VIII, que había ayudado a comenzar su carrera, antes de establecerse en Alejandro.