Fármaco
El ingrediente farmacéutico activo puede ser desconocido o pueden existir cofactores, a fin de lograr los objetivos terapéuticos. Una manera como los fabricantes lo han tratado de indicar es la normalización de un marcador compuesto. Sin embargo la normalización no se ha estandarizado aún: las diferentes empresas utilizan diferentes marcadores, o diferentes niveles de los marcadores de la misma, o diferentes métodos de ensayo para los compuestos marcador.
Diseño de fármaco
La estructura de la molécula de un fármaco que puede interactuar  específicamente con las biomoléculas se puede modelar usando  herramientas computacionales. Estas herramientas pueden permitir que  una molécula de droga sea construida dentro de la biomolécula usando  lo que se conoce de su estructura y de la naturaleza de su sitio  activo. La construcción de una molécula de fármaco se puede hacer desde dentro hacia fuera o desde afuera hacia dentro, dependiendo de si eligen primero el núcleo o a los grupos R. Sin embargo, muchos de estos enfoques están plagados de los problemas prácticos de la síntesis química.