Proyecto GNU
Armado con las herramientas de GNU, en 1991 el entonces estudiante universitario finlandés Linus Torvalds empezó a escribir el núcleo Linux inspirado en el sistema operativo Minix creado por el profesor de ciencias de computación estadounidense Andrew Tanenbaum. En sus primeros anuncios públicos, Torvalds le atribuía su acción a la frustración de no poder usar Minix comercialmente, y a la ausencia de núcleos libres tipo Unix como GNU Hurd; o el de BSD, descendiente de Unix que para entonces se encontraba purgando el código privativo original de AT&T y defendiéndose legalmente del mismo. A pesar de sus desacuerdos suscitados a raíz de la publicación de Linux, tanto Torvalds como Tanenbaum pronosticaban que el superior núcleo de GNU eventualmente dejaría obsoletos a Linux y Minix. En 1992 Torvalds decidió cambiar la licencia no comercial de Linux a la GPL. Rápidamente, múltiples programadores se unieron al desarrollo, colaborando a través de Internet y consiguiendo que paulatinamente Linux fuera más serio, potente y compatible con UNIX. Linux fue combinado con el resto del sistema GNU, resultando en un sistema operativo libre y completamente funcional que sigue usándose al día de hoy. La combinación es conocida como "GNU/Linux" o como una "distribución Linux" y existen diversas variantes.
MINIX FS
Cuando Linus Torvalds comenzó a escribir el núcleo Linux en 1991, él trabajaba en una máquina corriendo MINIX, así el lanzamiento inicial estuvo basado en las funcionalidades de este último sistema operativo. Linux usaba el sistema de archivos MINIX hasta que en abril de 1992 se realiza la introducción del Extended file system (sistema de archivos "extendido", conocido como ext. Véase ext2 y ext3). Este sistema de ficheros es aún usado por algunas distribuciones GNU/Linux para arrancar discos y en otras situaciones, donde se necesite un sistema de archivos simple y compacto.