الحلة
بعد تراجع الأمن في العراق، وانتشار العنف المسلح في جميع أنحاء المدن العراقية تعرضت مدينة الحلة إلى أعنف عمليات إرهابية لم تشهدها أي مدينة الا بغداد، فقد تعرضت المدينة عام 2005 إلى تفجير إنتحاري أدى إلى مقتل نحو 127 شخصا وإصابة أكثر من 140 آخرين بجروح، وقد تبنى تنظيم القاعدة هذه العملية وأعلن اسم منفذ هذه العملية يدعى رائد منصور البنا ولد في الأردن.
العراق
بعد الغزو، أخذ تنظيم القاعدة بوضع أقدامه في البلاد. وفي صباح يوم الأربعاء 22 فبراير 2006 قام ارهابيون باقتحام مرقدي الإمامين العسكريين، مما ادى إلى انهيار القبة الخاصة بالضريح التي تعتبر واحدة من أكبر قباب العالم الإسلامي ، وبعدها حدثت أعمال عنف طائفية أدت إلى عمليات تطهير عرقي متبادل (سني – شيعي) في العراق، وكانت هناك العديد من الهجمات على الأقليات العرقية مثل اليزيديين والمندائيين و وغيرهم.
وفي 30 ديسمبر عام 2006، أعدم الرئيس العراقي السابق صدام حسين وصادف اليوم الأول لعيد الأضحى عند المسلمين بالتقويم الهجري، وتمت عملية الإعدام في مقر الشعبة الخامسة في منطقة الكاظمية ببغداد.