Аппарат правительства Российской Федерации
В конце 1993 года, в декабре, была принята Конституция РФ. Формально, некоторые нормы закона «О совете Министров — Правительстве РФ» не соответствовали некоторым её положениям. В первую очередь, деятельность Правительства РФ должна определяться федеральным конституционным законом. Соответствующий ФКЗ «О Правительстве Российской Федерации» был принят 17 декабря 1997 года. Для обеспечения деятельности правительства РФ и организации контроля за выполнением органами исполнительной власти решений, принятых Правительством, образован Аппарат правительства РФ. Положение об Аппарате правительства Российской Федерации утверждено постановлением Правительства Российской Федерации от 1 июня 2004 г. № 260 (одновременно с утверждением регламента Правительства РФ).
Министерство юстиции Российской Федерации
25 декабря 1991 года Верховный Совет РСФСР законом № 2094-1 постановил: РСФСР впредь именовать Российская Федерация (Россия). 21 апреля 1992 года Съезд народных депутатов РСФСР утвердил переименование РСФСР в Российскую Федерацию, внеся соответствующие поправки в Конституцию, которые вступили в силу 16 мая 1992 года с момента опубликования в «Российской газете». В связи с поправками в конституцию министерства РСФСР стали называться министерствами Российской Федерации (ст. 128 и 129 конституции) и соответственно Министерство юстиции РСФСР стало именоваться Министерством юстиции Российской Федерации.