Аялон (пещера)
Пещеры, как правило, бедны видами живых существ по сравнению с поверхностью Земли. Однако в некоторых пещерах был обнаружен сравнительно широкий спектр видов. Пещеры с высоким уровнем биоразнообразия, как правило, находятся в карстовых районах, проникают в зону грунтовых вод (фреатическая зона), имеют большое количество органического вещества (например, хемоавтотрофного происхождения) и большую длину. Пещера Аялон сочетает в себе все эти факторы. Изучение хемоавтотрофных экосистем показало, что большинство хемоавтотрофных колоний создают основу для существования сложных сообществ живых организмов и большого разнообразия беспозвоночных в этих сообществах. Особое значение пещере Аялон придает тот факт, что в её полностью изолированной от внешнего мира и целиком основанной на хемосинтезе экосистеме сосуществовали вместе водные и наземные виды живых существ.
Аялон (пещера)
Экосистема пещеры сталкивается с высоким риском попадания в пещеру внешних животных, доступ которых на ранней стадии оказался возможным из-за пробитого отверстия. Её края и образовавшиеся при предыдущих пробных бурениях между пещерой и окружающим миром отверстия были заполнены полиуретановой пеной. Однако обитающие в пещере пауки видимо были принесены в пещеру из надземной фауны воздушными потоками через отверстия в земле. Несмотря на все усилия по сохранению карстового явления пещера Аялон, над пещерной экосистемой по прежнему нависает угроза. Слой скалы над пещерой был срублен наполовину; также в скальном покрове над пещерой в результате добычи полезных ископаемых образовались трещины. Это увеличивает опасность попадания в пещеру надземных организмов, что может нарушить хрупкую систему и далее уничтожить отдельные элементы фауны.