Террористические акты 11 сентября 2001 года
27 сентября 2001 года ФБР обнародовало фотографии 19 террористов, сопроводив их информацией о их возможной национальности, возрасте и возможных прозвищах и псевдонимах. Расследование ФБР атак 11 сентября стало самым большим расследованием за всю историю существования агентства, в операцию под кодовым названием "PENTTBOM" было вовлечено более семи тысяч сотрудников. Правительство США решило, что за теракты несёт ответственность «Аль-Каида», возглавляемая Усамой бен Ладеном, после того как ФБР заявило, что доказательства причастности «Аль-Каиды» являются «"ясными и неоспоримыми"». Правительство Великобритании пришло к такому же заключению.
Чертофф, Майкл
С 2001 по 2003 год Чертофф занимал пост заместителя министра юстиции, руководил департаментом уголовных расследований. Сыграл значительную роль в реализации контртеррористической политики администрации после терактов 11 сентября 2001 года. Занимался расследованием терактов, под его руководством проводились массовые аресты подозреваемых. Чертофф стал одним из авторов широко известного закона The USA PATRIOT Act. Занимался делами «американского талиба» Джона Уокера Линда и «двадцатого угонщика» Закарии Муссауи. Деятельность Чертоффа в министерстве юстиции стала объектом критики правозащитников.