Чёрная смерть
В своём исследовании, опубликованном в 1941 году, демограф Борис Урланис отмечал, что высокий уровень смертности был свойствен прежде всего городам, а не сельской местности, и 30-40 % смертности для городского населения дают седьмую-восьмую часть населения для Европы и двадцатую для России.
Эпидемия чумы в России (1654—1655)
В октябре—ноябре эпидемия пошла на спад. И. А. Хилков сообщал Никону и царской семье, которые уже было хотели двинуться из своего стана на Нерли в Новгород, о том, что с 10 октября моровое поветрие в Москве стало утихать. Некоторые источники относят спад эпидемии в столице ко второй половине ноября. В первых числах декабря в Москву прибыл Б. М. Хитрово с заданием зафиксировать, сколько в городе находится мёртвых и живых. Подсчёт вёл дьяк Кузьма Мошнин. К 17 декабря он завершил работу, собранная им статистика свидетельствовала о высокой смертности в городе. В декабре царю сообщили о том, что морового поветрия в Москве больше нет и «в рядах сидят, торгуют», но он решил повременить с приездом. 12 октября чума покинула Шую. К 13 октября относят прекращение эпидемии в Казани, к 18-23 октябрю — в Вологде, к 19 октябрю — в Ярославле, к 6 декабрю — в Соли Галичской, к 25 декабрю — в Коломне. В Галиче пик эпидемии пришёлся на 23 ноября — 12 декабря. 3 февраля в Москву прибыл Никон. Он описал вид опустошённого безлюдного города: 
Непрестанно плакал смотря пустоты Московския, пути и домов, идеже преж соборы многие и утеснение, тамо никаково, великия пути в малу стезю и потлачены, дороги покрыты снеги и никем суть не следими, разве от пес. Ох, ох! 10 февраля в Москву наконец приехал Алексей Михайлович.