Графство Ницца
Аннексия была временно поставлена под сомнение после того, как во время Австро-итало-французской войны 1859 года, Наполеон III заключил сепаратный мир с Австрией по которому Австрия отдавала Франции Ломбардию, а Венеция оставалась в составе Австрии. В марте 1860 года, Тоскана, Парма и Модена должны были объединиться в одно государство с Сардинией. Наполеон III передал Пьемонту Ломбардию, получая в обмен Ниццу и Савойю. Франция аннексировала провинции в соответствии с положениями Туринского договора, подписанного 24 марта 1860 года. Договор сопровождался плебисцитом в Ницце 15 и 16 апреля и в Савойе 22 и 23 апреля по результатам которого подавляющее большинство жителей этих двух территорий проголосовали за утверждение договора и вступление с состав Франции. Официально Франция приняла во владение Ниццу и Савойю 12 июня 1860 года.
Савойское герцогство
Сам Карл Эммануил II весьма мало интересовался вопросами управления государством и проводил всё своё время в развлечениях, предоставив всю полноту власти матери, занимавшайся всеми вопросами внешней и внутренней политики. В этот период, в 1655 году, в Савойе произошло массовое преследование и истребление членов протестантской общины вальденсов. Лишь после смерти матери в 1663 году Карл Эммануил принимает на себя управление страной. В своей политике выступал против возрастающего могущества своего соседа — Франции, но в то же время при нём Савойя приняла вид Французского лена. В 1672—1673 годах он вёл неудачную для Савойи войну с Генуэзской республикой с тем, чтобы получить выход в Лигурии к побережью Средиземного моря ("Вторая савойско-генуэзская война"). Внутренняя политика Карла Эммануила была более успешной — по его указанию была расширена морская гавань Ниццы, возросла внешняя торговля герцогства, улучшилось состояние его финансов. Создал в Савойе постоянную армию, отказавшись от услуг наёмных войск, как это практиковалось в герцогстве ранее. По приказу Карла Эммануила через альпийские перевалы была проложена "Chemin des Grottes des Échelles" — дорога из Верхней Италии во Францию. Умер в 1675 году.