Аялон (пещера)
Пещеры, как правило, бедны видами живых существ по сравнению с поверхностью Земли. Однако в некоторых пещерах был обнаружен сравнительно широкий спектр видов. Пещеры с высоким уровнем биоразнообразия, как правило, находятся в карстовых районах, проникают в зону грунтовых вод (фреатическая зона), имеют большое количество органического вещества (например, хемоавтотрофного происхождения) и большую длину. Пещера Аялон сочетает в себе все эти факторы. Изучение хемоавтотрофных экосистем показало, что большинство хемоавтотрофных колоний создают основу для существования сложных сообществ живых организмов и большого разнообразия беспозвоночных в этих сообществах. Особое значение пещере Аялон придает тот факт, что в её полностью изолированной от внешнего мира и целиком основанной на хемосинтезе экосистеме сосуществовали вместе водные и наземные виды живых существ.
Каракокшинская пещера
Находится в популярном туристском районе, примерно в 20—25 км от Каракольских озёр, добраться до неё можно по конной тропе. Суммарная протяжённость ходов 490 метров, глубина 24 метра. Пещера имеет два входа, характерна двухэтажным строением, по нижнему этажу течёт ручей, который перехватывается с поверхности вблизи верхнего входа. Этот же ручей появляется на дне Воронки, расположенной ниже пещеры по сухому руслу, и которая настолько известна, что является сама по себе экскурсионным объектом. В период весеннего паводка верхний этаж пещеры частично затапливается и становится непроходимым. Самый большой зал пещеры — зал Орла, высотой 7 метров. Пещера внесена в Красную книгу (особо охраняемые территории и объекты) Республики Алтай. Каракокшинская известна как самая высокорасположенная из крупных пещер Алтая. Высота входа около 1700 м н.у.м.