Ботафого
1 июля 1894 года в Рио-де-Жанейро был основан Клуб Регат «Ботафого», названный по району города и заливу. Вскоре клуб стал одним из сильнейших в городе. 12 августа 1904 года в том же районе было решено основать футбольную команду, получившую вскоре наименование Футбольный Клуб «Ботафого». Причём, цвета команды (чёрный и белый) и даже эмблема были похожи на Регатный Клуб. Футбольный Клуб «Ботафого» также стал одним из сильнейших в своём виде спорта и к 1942 году выиграл 8 чемпионатов города Рио-де-Жанейро.
Гарринча
В начале 1965 года руководство «Ботафого» начало компанию по дискредитации Гарринчи: были организованы серии статей, где отмечалось, что, несмотря на высокое мастерство, Манэ сильно постарел и перестал соответствовать уровню клуба. После этого тренерский штаб перестал ставить Гарринчу в основной состав команды, мотивируя это плохой формой форварда. Вскоре Гарринча перестал посещать тренировки, затем прибавил 7 кг лишнего веса. 22 августа 1965 года Гарринча забил единственный в матче гол, принеся победу своему клубу над «Фламенго». 5 сентября того же года Гарринча был включён в состав на финальный матч Кубка Гуанабара с клубом «Васко да Гама»; на игру собралось более 115 тысяч зрителей, поставив по этому показателю рекорд года. Многие рассчитывали, что Гарринча будет лидером своей команды, обыгрывая левого защитника «Васко», Олдаира, однако тот ни разу не дал Манэ шанса себя обыграть; более того, Олдаир забил один из голов своей команды, победившей 3:0. Через 10 дней, 15 сентября, Гарринча провёл последнюю игру в составе «Ботафого», в которой его клуб победил «Португезу» 2:1. В январе 1966 года он был продан в «Коринтианс» за 220 млн крузейро. Всего Гарринча сыграл за «Ботафого» 579 матчей и забил 249 мячей.