Усама бен Ладен
7 октября 2008 года на вторых дебатах кандидатов в президенты выдвиженец от Демократической партии Барак Обама заявил: «Мы убьём бен Ладена. Мы сломаем „Аль-Каиду“. Это должно быть главным приоритетом национальной безопасности». По избранию президентом он повторил о намерении «возродить обязательство США найти лидера „Аль-Каиды“ Усаму бен Ладена». Обама отказался от глобальной войны с терроризмом и сконцентрировался на борьбе с «Аль-Каидой». В декабре 2009 года министр обороны США Роберт Гейтс сообщил, что у американских властей долгие годы не было достоверной информации о местонахождении её главы. Неделю спустя командующий Международными силами содействия безопасности в Афганистане генерал Маккристал заявил, что «Аль-Каида» не будет побеждена до тех пор, пока Усама не будет схвачен или убит, так как, будучи культовой фигурой, помогает её существованию как международной франшизы, но его захват или гибель не будут означать уничтожения группировки. В апреле 2011 года Обама отдал приказ об осуществлении тайной операции по пленению или ликвидации Усамы бен Ладена. 2 мая того же года Белый дом сообщил о его гибели в убежище в городе Абботтабад в Пакистане.
Операция «Копьё Нептуна»
Директор ЦРУ Леон Панетта заявил, что ЦРУ исключило участие Пакистана в операции, поскольку опасалось, что «любые усилия по работе с пакистанцами могут поставить под угрозу миссию. Они могли бы предупредить цели». Однако государственный секретарь США Хиллари Клинтон заявила, что «сотрудничество с Пакистаном помогло привести нас к бен Ладену и укрытию, в котором он скрывался». Президент Обама высказал такое же мнение. Будучи ещё кандидатом в президенты США в 2008 году, Обама заявлял, что если руководство Пакистана не будет должным образом сотрудничать с США в борьбе с терроризмом на своей территории, то: «Если у нас будут надежные разведданные о важных террористических целях, а президент Мушарраф не захочет ничего делать, то это сделаем мы». Главный советник Обамы по борьбе с терроризмом Джон Бреннан заявил, что бен Ладен не мог не иметь поддержки со стороны Пакистана. Кроме того, он добавил: «Мы расследуем сейчас, как он мог скрываться там так долго».