Графство Ницца
Аннексия была временно поставлена под сомнение после того, как во время Австро-итало-французской войны 1859 года, Наполеон III заключил сепаратный мир с Австрией по которому Австрия отдавала Франции Ломбардию, а Венеция оставалась в составе Австрии. В марте 1860 года, Тоскана, Парма и Модена должны были объединиться в одно государство с Сардинией. Наполеон III передал Пьемонту Ломбардию, получая в обмен Ниццу и Савойю. Франция аннексировала провинции в соответствии с положениями Туринского договора, подписанного 24 марта 1860 года. Договор сопровождался плебисцитом в Ницце 15 и 16 апреля и в Савойе 22 и 23 апреля по результатам которого подавляющее большинство жителей этих двух территорий проголосовали за утверждение договора и вступление с состав Франции. Официально Франция приняла во владение Ниццу и Савойю 12 июня 1860 года.
Французский Индокитай
После подписания в 1858 году в Тяньцзине франко-китайского договора Наполеон III приказал перебросить участвовавшие в китайской кампании войска во Вьетнам; к французам присоединились испанские колониальные войска с Филиппин, привычные к местному климату. Командующим объединёнными франко-испанскими силами стал адмирал Риго де Женуйи. Регулярная вьетнамская армия была разбита европейскими войсками, в марте 1859 года французы взяли Сайгон, а затем захватили большие территории в различных частях Вьетнама. Вьетнамское правительство было вынуждено пойти на мирные переговоры, и в 1862 году был подписан Сайгонский договор, согласно которому Вьетнам уступил в собственность Франции три провинции. Так как ратификация договора затянулась, то боевые действия возобновились, и в 1867 году вьетнамцам пришлось подписывать мир с Францией уже на более тяжёлых условиях.
После захвата французами южного Вьетнама король Камбоджи направил в 1861 году в Сайгон большое посольство с выражением дружеских чувств французам. В связи с нарастающей угрозой экспансии со стороны Сиама правящие круги Камбоджи стали склоняться в пользу признания французского протектората. Франко-камбоджийский договор о протекторате был подписан 11 августа 1863 года и ратифицирован обеими сторонами в 1864 году. В 1864—1867 году, в соответствии с условиями договора, французам пришлось помогать властям протектората Камбоджи в подавлении многочисленных восстаний, что дорого стоило Франции. В 1867 году французские власти Кохинхины успешно провели переговоры с Сиамом о разделе Камбоджи. По условиям договора от 1 декабря 1867 года Сиам признал протекторат Франции над Камбоджей, а взамен Франция согласилась на присоединение к Сиаму двух западных камбоджийских провинций.