Депортация карачаевцев
Также в Среднюю Азию, на основании приказа ГКО № 0741 от 3 марта 1944 года, были депортированы впоследствии военнослужащие карачаевской национальности. Численность спецпереселенцев, ранее служивших в Красной Армии, на май 1949 года составляла 2543 человек, из них офицеры — 238, сержанты — 495, солдаты — 1810 человек. Те карачаевцы, которые по каким то причинам остались в войсках, должны были, согласно Директиве народного комиссара внутренних дел № 140 от 22 августа 1945 года, направляться к месту расселения их семей или родственников. В пункте 1-м этой директивы было указано, что въезд на территорию бывшей Карачаевской области им воспрещен.
Чеченский конфликт
31 января 1944 г. в ходе Великой Отечественной войны Государственный комитет обороны СССР принял решение о принудительном переселении всех чеченцев и ингушей в Киргизскую и Казахскую ССР в целях стабилизации обстановки в Чечено-Ингушской АССР. Массовая депортация была проведена войсками НКВД под личным руководством Л. П. Берия. Начиная с 23 февраля 1944 г., за несколько недель в целом было выселено около 650 тыс. человек. Историк Н. Ф. Бугай указывает, что не менее 144 тыс. (ок. 24 %) из них погибли в процессе депортации и в течение первых четырёх лет нахождения в ссылке). Эти цифры не учитывают повышенную смертность среди высланных в следующие годы, а также более долгосрочные демографические последствия. В Киргизию и Казахстан вынуждены были позднее направиться и чеченцы и ингуши, которые на момент депортации находились на фронте.