Франц Фердинанд
Семья Франца Фердинанда проживала в австрийском замке Гогенберг и в замке Конопиште, в Чехии. У Франца Фердинанда и Софии была одна дочь — София и два сына — Максимилиан и Эрнст. Они носили фамилию Эсте и титул князей Гогенбергов. В 1938 году Максимилиан и Эрнст Гогенберги, как родственники Австрийского дома и противники аншлюсса Австрии, были посажены по приказу Гитлера в концлагерь Дахау. Максимилиан был освобождён через 6 месяцев, а Эрнст переведён в другой лагерь и освобожден в 1943 году. Они оба пережили войну, и ныне существуют их потомки.
Габсбург-Лотарингский дом
Младший сын Франца и Марии-Терезы Фердинанд Австрийский женится на Марией Беатриче д’Эсте, последней преставительнице итальянских Эсте. В приданое вошли и Феррара, и Модена, и Реджо. От этого брака происходит первое ответвление Габсбург-Лотарингских (если считать начало Тосканской линии с Фердинанда, а не с Франца I) и единственное пресекшееся. Во времена наполеоновских войн по итогам Кампо-Формийского мира дом австрийских Эсте потерял все владения. После Венского конгресса территории были возвращены, но ненадолго. Последствия Рисорджименто затронули и Эсте: Франческо д'Эсте потерял все владения и умер бездетным, в результате чего линия австрийских Эсте 
прекратилась.