وحيد القرن الجاوي
يُشتقُّ اسمُ الجنس الخاص بِهذه الحيوانات، أي «"Rhinoceros"» (نقحرة: ) - وهو اسمُ جنس وحيد القرن الهندي كذلك - من كلمتان إغرقيَّتان: «ῥίς» () ومعناها «أنف»، و«κέρας» () ومعناها «قرن»؛ اسمُ النوع «"sondaicus "» (نقحرة: ) مُشتقٌ من منطقة السوندا، وهي إقليمٌ جُغرافي حيويّ يشتمل على جُزر جاوة وسُومطرة وبورنيو وما جاورها من جُزرٍ أصغر حجمًا. يُطلق على هذه الحيوانات أيضًا تسمية «الكركدن وحيد القرن الأصغر» تمييزًا لها عن «الكركدن وحيد القرن الأكبر» وهو وحيد القرن الهندي، وتمييزًا لها عن النوعان الأفريقيَّان (وحيد القرن الأسود ووحيد القرن الأبيض) اللذي يمتلك كُلٌ منهما قرنان. ويُشاعُ بِاللُغة العربيَّة استعمال تسمية «كركدن» و«خرتيت» عوض «وحيد القرن»، وبالتالي يُمكن أن تُطلق بعض المراجع العربيَّة تسمية «الكركدن الجاوي» أو «الخرتيت الجاوي» على هذه الحيوانات.
وحيد القرن الجاوي
يعترفُ العُلماء بِثلاث نُويعات من وحيد القرن الجاوي، منها نُويعة واحدة فقط باقية:يُعتقدُ بأنَّ أسلاف الكركدنَّات المُعاصرة انشقَّت عن سائر مُفردات الأصابع في العصر الفجري (الإيوسيني) المُبكر. تُفيدُ الدراسات التي أُجريت على الحمض النووي للميتوكندريات الخاص بِفصيلة الكركدنيَّات أنَّ سلفها المُشترك انشقَّ عن أسلاف الخيليَّات مُنذ حوالي 50 مليون سنة، كما يبدو أنَّ هذه الفصيلة ظهرت لِأوَّل مرَّة في أواخر العصر الفجري في أوراسيا، وأنَّ أسلاف الأنواع الباقية من وحيدة القرن اختفت تمامًا من آسيا في أوائل العصر الثُلثي الأوسط (الميوسيني).