علم الأحياء
تكون الكروموسومات عادةً خطية الشكل في حقيقيات النوى ودائرية الشكل في بدائيات النوى. والكروموسوم هو تركيبٌ مُنظمٌ يتألف من الدنا والهستونات. وتُشكّل مجموعة الكرموسومات الموجودة في الخلية، بالإضافة إلى أية معلومات وراثية أخرى موجودة في الميتوكوندريا والبلاستيدات الخضراء أو أي مكان آخر، تُشكل مُجتمعةً ما يُعرف باسم الجينوم. توجد المعلومات الوراثية في حقيقيات النوى في نواة الخلية، بالإضافة إلى كميات أخرى صغيرة موجودة في الميتوكندريا والبلاستيدات الخضراء. أما في بدائيات النوى فتكون المادة الوراثية موجودةً في جسم غير مُنتظم الشكل يقع في السيتوبلازم يُسمّى بالنيوكليود. تكون معلومات الجينوم الوراثية موجودةً في الجينات، ويُسمّى مجموع هذه المعلومات في الكائن الحي بالنمط الجيني.
كروموسوم اصطناعي للخميرة
وهذا أمرمهم لأنه يسمح برسم خرائط تفصيلية لمناطق معينة من الجينوم. الكروموسومات البشرية قد درست كاملة، مثل كروموسوم X ، تخليق موقع العلامات الوراثية للعديد من الاضطرابات الوراثية والصفات.
YACs  أقل استقرارا بشكل ملحوظ من BACs, إنتاج " الآثار الخيالية  chimeric effects": المصنعات حيث تسلسل الحمض النووي المستنسخ يتطابق مع مناطق متعددة من الجينوم. الكيمرة قد يكون إما بسبب مشاركه-ربط ل قطع متعددة  من الجينوم إلى واحد YAC ، أو إعادة التركيب الجيني لاثنين أو أكثر من YACs الذين يتم تحويلهم في نفس خلية الخميرة المضيفة. حدوث الكميرة chimerism قد يصل إلى 50%. هناك مصنعات أخرى عبارة عن حذف أجزاء من المنطقة المستنسخة وإعادة ترتيب قطع الجينوم(مثل الانعكاس). في كل هذه الحالات ، التسلسل كما هو محدد من استنساخ YAC  يختلف عن الأصلي ، التسلسل الطبيعي ،  يؤدي إلى  نتائج غير متناسقة و أخطاء في التفسير إذا تم الاعتماد على معلومات الاستنساخ. بسبب هذه العقبات، مشروع الجينوم البشري في نهاية المطاف تخلى عن استخدام YACs وتحول إلىالكروموسومات الاصطناعية البكترية BACs ، حيث حدوث هذه المصنعات منخفضة جدا. بالإضافة إلى عوائق الاستقرار ، على وجه التحديد التكرار النسبي لحدوث الكميرة،فأنه ثبت ان YACs غير فعالة عند تخليق الحد الأدنى لتمهيد الطريق لتغطيه الجينوم البشري بأكمله. إنتاج مكتبات استنساخ يستغرق وقتا طويلا. أيضا، نظرا لطبيعة الإعتماد على تسلسل مواقع المعلمة (STS) كنقطة مرجعية عند اختيار الحيوانات المستنسخة المناسبة ، هناك ثغرات كبيرة تحتاج إلى إنشاء المزيد من المكتبات للتوسع. هذه هي  العوائق التي قادت المشروع إلى الاستفادة من BACs بدلا من YAC. ويرجع ذلك إلى عاملين: