كتائب الشهيد عز الدين القسام
تأسست بذور كتائب القسام في عام 1984م، وذلك قبل الإعلان عن انطلاقة الحركة فعلياً باسم حركة حماس، واستمر العمل تحت عناوين مختلفة مثل "المجاهدون الفلسطينيون" عام 1987 ، واستمر التغيير حتى عام 1991م، حيث أعلن عن اسم "كتائب الشهيد عز الدين القسام" في منتصف عام 1991م.
من أبرز مؤسسيها الشيخ صلاح شحادة، وعماد عقل، ومحمود المبحوح في قطاع غزة، والمهندس يحيى عياش في الضفة الغربية، وفي شمال الضفة زاهر جبارين، وعدنان مرعي، وعلي عاصي .
كتائب الفاروق
من ابرز قادة كتائب الفاروق ومؤسسيها المحامي أسامة جنيدي الملقب أبو سايح الشخصية التي آثرت عدم الظهور في بداية الثورة واكتفى بالقيادة من خلف الكواليس في بداية المرحلة رغم أن الفضل الكبير يعود له في ادارة العمليات العسكرية وتأمين الذخيرة والدعم الكامل حيث استطاع هو وقادة الفصائل العاملة في كتائب الفاروق من بسط سيطرتهم على كامل المناطق المتواجدين بها.