حرب مرتفعات قرة باغ
اندلعت الحرب أواخر شتاء 1992. ولم تتمكن المنظمات الدولية من احتواء الصراع، وفي ربيع 1993 استولت القوات الأرمنية على مناطق خارج الوصيدة بما يعادل 9% من الأراضي الأذربيجانية، وقد وصل عدد المشردين من الجهتين إلى 23000 مشرد أذري، و 80000 أرميني وأرتساخي. وقد وضعت روسيا حلاً لوقف الصراع تم التوقيع عليه في أيار / مايو 1994، بواسطة مؤتمر الأسس الأمنية والتعاونية الأوروبية (مجموعة مينسك)، وقد عقدت من جانب أرمينيا وأذربيجان.
وزارة الشؤون الداخلية لجمهورية أذربيجان
في المعارك بين 1941 و 1945 ، حارب حوالي 800 ضابط من الشرطة الأذربيجانية الفاشية وحصلوا على أوامر وميداليات عالية ، مظاهرين البطولة والشجاعة.وبعد الصراع الأرمني الأذربيجاني - ناغورنو - كاراباخ ، قُتل موظفو الشؤون الداخلية والقوات الداخلية في المعارك من أجل استقلال أذربيجان وسلامة أراضيها ، وقُتل 932 شخصاً وأصيب 681 منهم بعاهات.في المعارك من أجل السيادة والسلامة الإقليمية لجمهورية أذربيجان ، قتل 460 ضابط شرطة ، وقتل 511 جنديا من القوات الداخلية ، وحصل 67 موظفا من هيئات الشؤون الداخلية على لقب "البطل الوطني" ، و 86 موظف حصلوا على وسام "علم أذربيجان" و 247 موظفا والميداليات منحت.بعد اعتماد القانون الدستوري المتعلق باستقلال الدولة لجمهورية أذربيجان في 18 أكتوبر 1991 ، كانت وزارة الشؤون الداخلية لجمهورية أذربيجان تابعة لوزارة الشؤون الداخلية لاتحاد الجمهوريات الاشتراكية السوفياتية السابق وكانت تعمل كواحدة من صلاحيات وزارة الشؤون الداخلية لجمهورية أذربيجان.تمت الموافقة على النظام الأساسي والهيكلية لوزارة الداخلية بموجب المرسوم الصادر عن رئيس جمهورية أذربيجان في 30 يونيو 2001.