كتائب الشهيد عز الدين القسام
تأسست بذور كتائب القسام في عام 1984م، وذلك قبل الإعلان عن انطلاقة الحركة فعلياً باسم حركة حماس، واستمر العمل تحت عناوين مختلفة مثل "المجاهدون الفلسطينيون" عام 1987 ، واستمر التغيير حتى عام 1991م، حيث أعلن عن اسم "كتائب الشهيد عز الدين القسام" في منتصف عام 1991م.
من أبرز مؤسسيها الشيخ صلاح شحادة، وعماد عقل، ومحمود المبحوح في قطاع غزة، والمهندس يحيى عياش في الضفة الغربية، وفي شمال الضفة زاهر جبارين، وعدنان مرعي، وعلي عاصي .
كتائب الفاروق
عملت هذه الكتائب على السيطرة على المدينة بالكامل فقد قامت بعمليات ضخمة جداً حيث استطاعت السيطرة على قيادة المنطقة وأسرت قائد المنطقة ومعاونيه وخمسا وعشرين عنصراً وقتل ستة عشر وأسقطت حاجز البلدية وسط القصير والسيطرة على المشفى الوطني بالإضافة لمطار الضبعة وكتيبة الضبعة وتل النبي مندو كما سيطرت على معظم حواجز المنطقة وقد بقيت كتائب الفاروق مسيطرة على القصير إلى أن سقطت بيد النظام بتاريخ 4-6-2012 بعد معركة القصير الشهيرة ضد الجيش السوري وحزب الله اللبناني، 
من أبرز القادة في القصير :
النقيب معن الكنج،
الشيخ خالد البراك،
معمر محب الدين،
عبد الرحمن العتر،
الرقيب أحمد سيف الدين