تواصل علمي
تستخدم مجريات الأمور المحاكاة للحكم على مدى نتائج معينة تقوم على السهولة التي يمكن أن يتصور لها نهاية معينة. يمكن أن يستخدم هذا استدلال في العديد من المهام، بما في ذلك التنبؤ (هل يمكن لفريق معين الفوز في هذه المباراة لكرة القدم) والسببية (هل جيم أكل الشريحة الأخيرة من البيتزا). تطبيق للاهتمام من هذا ارشادي هو الحال قرب يخطئ. بالنظر في المثال التالي من العالمين كانيمان وتفيرسكي. :كان من المقرر أن يغادر المطار السيد كرين والسيد تيز في رحلاتين مختلفتين، في نفس الوقت. سافرا من المدينة في نفس الليموزين، واقعا في ازدحام المرور، وصلا إلى المطار بعد نصف ساعة من وقت الموعد المقرر لمغادرة رحلاتهم. قال السيد كرين :إن رحلته غادرت في وقتها. قال السيد تيز :أن رحلته قد تأخرت، وغادر قبل خمس دقائق. من هو أكثر قلبا ؟ السيد . كرين أو السيد. تيز؟ يقول الجميع تقريبا، "السيد كرين"، لأنهم لا يستطيعون تخيل كيف السيد كرين يمكن أن ضبط رحلته بينما السيد تيز قد حققت المحملات أنه إن لم يكن لهذا المشية البطيئة، أو خط أمنية طويلة بشكل استثنائي. محاكاة الاستدلال لديها هذه القدرة على توليد الظروف ، والتي يمكن استخدامها لفهم مشاعر سلبية من الإحباط، والسخط، الخ التي تنشأ عن قرب حدوث خطأ مثل هذا السيد تيز المحملات. ويشار إلى هذه المحاكاة (بكيفية احتمال وقوع الأحداث) إلى التفكير بوصفها المخالف، ويمكن استخدامها لمحاولة تحديد الظروف الفريدة أو غير العادية التي تؤدي إلى نتائج مأساوية. على سبيل المثال، الرجل الذي أطلق النار خلال عملية سطو أثناء التسوق في أحد المتاجر. أن المواضيع تمنح المزيد من الأضرار التي تلحق الرجل الذي كان يتسوق في متجر بعيدا عن منزله مما سوف تحدث للرجل الذي كان يتسوق في متجر قرب منزله أنه عادة مرة. فيما يتعلق بعمليات محاكاة الأحداث في المستقبل، ببساطة تخيلُ أحداث افتراضية يجعل الأمر يبدو أكثر احتمالا أن تحدث لهم. ويمكن تمديد هذه الظاهرة لسلوك الشخص نفسه، كما يتصور نفسه أداء أو رفض تنفيذ إجراء يسبب تغيرات في توقعاته حول سلوك واحد في المستقبل. ومن المثير للاهتمام، المحاكاة هي "أكثر عرضة لزيادة احتمال بالنظر للنتائج المحتملة ثم للحد من احتمال بالنظر للنتيجة المحتملة. وهكذا، فإن الآثار المترتبة على الأبحاث على استدلال المحاكاة هي مثيرة للاهتمام بشكل خاص عند تصميم جهود التوعية التي تهدف إلى تغيير السلوكيات، مثل زيادة نسبة إعادة التدوير أو خفض استهلاك الوجبات السريعة.
محاذاة التسلسلات
عادة يتم تمثيل المحاذات سواء بيانيا وفي تنسيق النص. في تقريبا كل تمثيلات محاذاة التسلسلات ، التسلسلات مكتوبة في صفوف مرتبة حيث تظهر بقايا المنحازة في أعمدة متعاقبة. في تنسيقات النص، يتم الإشارة إلى محاذاة الأعمدة التي تحتوي على أحرف مطابقة أو مماثلة بنظام من الرموز المحافظة. كما في الصورة أعلاه، يتم استخدام رمز العلامة النجمية أو الأنابيب لإظهار الهوية بين عمودين; رموز أخرى أقل شيوعاً تشمل نقطتين لاستبدال المحافظ وفترة زمنية لاستبدال المحافظ جزئيا. كما تستخدم العديد من برامج التصور اللون لعرض معلومات عن خصائص عناصر التسلسل الفردية؛ في تسلسل الحمض النووي والجيش الملكي النيبالي، وهذا يساوي في تعيين كل النوكليوتيدات اللون الخاص بها. في التحالفات البروتين، مثل واحد في الصورة أعلاه، غالباً ما يتم استخدام اللون للإشارة إلى خصائص الأحماض الأمينيةالتي تساعد في الحكم على المحافظة  على استبدال حمض أميني معين. كثيرا من المتسلسلات الصف الأخير في كل عمود هو غالباً ما يوافق المحاذاة للتسلسل ؛ ويمثل تسلسل الآراء  أيضا في كثير من الأحيان بتنسيق رسومي (بياني) مع شعار تسلسل  الذي يتوافق مع حجم كل النوكليوتيدات أو حرف من الأحماض الأمينية يتوافق مع درجته من الحفظ .محاذاة التسلسلات يمكن تخزينها في مجموعة متنوعة من النصوص معتمدة على تنسيقات الملفات كثير منها وضعت أصلاًبالاقتران مع برنامج المحاذاة المحددة، أو تنفيذ. معظم الأدوات المستندة إلى ويب تسمح لعدد محدود من تنسيقات الإدخال والإخراج، مثل تنسيق FASTA  و بنك الجينات  والإخراج غير قابلة للتحرير بسهولة. عدة برامج التحويل التي تقدم الرسومات و/أو واجهات سطر الأوامر تكون متوفرة، مثل READSEQ  و EMBOSS . وهناك أيضاالعديد من حزم البرمجة التي توفر وظيفة التحويل، مثل BioPerl  و BioRuby .