كروموسوم
الكروموسوم كلمة يونانية تعني الجسم الملون ولكل كروماتيد في الكروموسوم الواحد ذراعان أحدهما طويل والأخر قصير، تم ملاحظة الكروموسوم لأول مرة في خلايا النباتات من قبل عالم نبات سويسري اسمه كارل ولهيلم Karl Wilhelm في عام 1842. وتختلف الخلايا في الكائنات الحية في عدد الكروموسومات الموجودة فيه. ففي كل خلية جسمية في الأنسان يوجد 46 كروموسوما، أما في القرد فهناك 48 كروموسوما في كل خلية جسمية. ولا يعتمد عدد الكروموسومات على حجم الكائن الحي، فالفيل مثلا عنده 56 كروموسوما في كل خلية جسمية بينما تمتلك الفراشة 380 كروموسوما في كل خلية جسمية.
كروموسوم اصطناعي للخميرة
وهذا أمرمهم لأنه يسمح برسم خرائط تفصيلية لمناطق معينة من الجينوم. الكروموسومات البشرية قد درست كاملة، مثل كروموسوم X ، تخليق موقع العلامات الوراثية للعديد من الاضطرابات الوراثية والصفات.
YACs  أقل استقرارا بشكل ملحوظ من BACs, إنتاج " الآثار الخيالية  chimeric effects": المصنعات حيث تسلسل الحمض النووي المستنسخ يتطابق مع مناطق متعددة من الجينوم. الكيمرة قد يكون إما بسبب مشاركه-ربط ل قطع متعددة  من الجينوم إلى واحد YAC ، أو إعادة التركيب الجيني لاثنين أو أكثر من YACs الذين يتم تحويلهم في نفس خلية الخميرة المضيفة. حدوث الكميرة chimerism قد يصل إلى 50%. هناك مصنعات أخرى عبارة عن حذف أجزاء من المنطقة المستنسخة وإعادة ترتيب قطع الجينوم(مثل الانعكاس). في كل هذه الحالات ، التسلسل كما هو محدد من استنساخ YAC  يختلف عن الأصلي ، التسلسل الطبيعي ،  يؤدي إلى  نتائج غير متناسقة و أخطاء في التفسير إذا تم الاعتماد على معلومات الاستنساخ. بسبب هذه العقبات، مشروع الجينوم البشري في نهاية المطاف تخلى عن استخدام YACs وتحول إلىالكروموسومات الاصطناعية البكترية BACs ، حيث حدوث هذه المصنعات منخفضة جدا. بالإضافة إلى عوائق الاستقرار ، على وجه التحديد التكرار النسبي لحدوث الكميرة،فأنه ثبت ان YACs غير فعالة عند تخليق الحد الأدنى لتمهيد الطريق لتغطيه الجينوم البشري بأكمله. إنتاج مكتبات استنساخ يستغرق وقتا طويلا. أيضا، نظرا لطبيعة الإعتماد على تسلسل مواقع المعلمة (STS) كنقطة مرجعية عند اختيار الحيوانات المستنسخة المناسبة ، هناك ثغرات كبيرة تحتاج إلى إنشاء المزيد من المكتبات للتوسع. هذه هي  العوائق التي قادت المشروع إلى الاستفادة من BACs بدلا من YAC. ويرجع ذلك إلى عاملين: