علية
مثل الرياضيات ، تعتبر الميتافيزيقا دراسة غير تجريبية يتم إجراؤها باستخدام خصم ما معروف سلفًا.و تحاول تقديم سرد متماسك لبنية العالم ، قادر على تفسير إدراكنا اليومي والعلمي للعالم ، والتحرر من التناقضات. في الرياضيات،هناك العديد من الطرق المختلفة لتحديد الأرقام ؛ وكذلك في الميتافيزيقيا هناك العديد من الطرق المختلفة لتحديد الأشياء والممتلكات والمفاهيم والكيانات الأخرى التي يتم الإدعاء بأنها تشكل العالم.
ما وراء الطبيعة
انصبت كثير من الأعمال الحديثة على تحليل دور ما وراء الطبيعة في التنظير العلمي. قاد ألكسندر كويري هذه الحركة، حيث أعلن في كتابه ما وراء الطبيعة والقياس أن "لا يحقق العقل العلمي التقدم من خلال اتباع التجربة، بل من خلال تخطي التجربة". يمكن لهذا الافتراض الميتافيزيقي التأثير في التنظير العلمي كما قال جون واتكينز في أهم إسهاماته للفلسفة. منذ 1957 "أظهر طرق بعض الأفكار غير القابلة للقياس وبالتالي –طبقا لأفكار بوبر- تكون الافتراضات غير التجريبية مؤثرة في تطوير نظريات علمية قابلة للقياس. مثلت هذه النتائج العميقة في المنطق الأولي التطبيقي عملية إصلاحية هامة لطرق التدريس الإيجابية عن انعدام معنى ما وراء الطبيعة وعن الادعاءات القياسية". ادعي إمري لاكاتوس أن لكل النظريات العلمية قلبا ميتافيزيقيا صلبا ضروريا لجيل الأطروحات والافتراضات النظرية. من هنا –طبقا للاكاتوس- "ترتبط التغيرات العلمية بثورات ميتافيزيقية جامحة وواسعة".