علية
في حين أن الميتافيزيقيا يمكنها و كحالة خاصة ، دراسة الكيانات التي يفترضها العلم الأساسي مثل الذرات والأوتار الفائقة ، فإنها تختص بدراسة مجموعة من المواضيع مثل الكائن والملكية والسببية التي تفترضها هذه النظريات العلمية. على سبيل المثال: الادعاء بأن "الإلكترونات لها شحن" هو نظرية علمية. أثناء استكشاف ما يعنيه أن تكون الإلكترونات (أو على الأقل ، أن ينظر إليها على أنها "كائنات") ، وأن تكون "ممتلكات" ، وأن تكون موجودة في كيان طوبولوجي يسمى "الفضاء" ، فإنها مهمة الميتافيزيقيا.
المصمم الذكي
العديد من الآراء الميتافيزيقية تعتقد بان الكون والحياة تدين بهيكليتها إلى مصمم ذكي. الملحد ريتشارد دوكينز يقول بان: "من الممكن أن تجد أدلة إذا نظرت إلى تفاصيل الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية، قد تجد توقيع من المصمم من نوعا ما". مصطلح المصمم الذكي تم استخدامه من قبل حركة التصميم الذكي لوصف الكينونة التي يفترضون انها تقف وراء انشاء الحياة والكون بدون الدخول في تعابير دينية حتى لاتوصف الحركة على انها خلقية. يتجنب مناصروا حركة التصميم تعريف هوية المصمم الذكي حتى لاتعرف الحركة على انها حركة دينية لكن تصريحات بعض قادة الحركة عرفت المصمم الذكي على انه الله.