علية
هناك موقفان واسعان حول ما هو "العالم" الذي قامت الميتافيزيقيا بدراسته. يفترض الرأي القوي والكلاسيكي أن الكائنات التي تدرسها الميتافيزيقيا موجودة بشكل مستقل عن أي مراقب و يفترض الرأي الضعيف والحديث أن الأشياء التي درستها الميتافيزيقيا موجودة داخل عقل أحد المراقبين بحيث يصبح الموضوع شكلاً من أشكال الاستبطان والتحليل المفاهيمي. يناقش بعض الفلاسفة ، ولا سيما كانط ، كل من هذه "العوالم" وما يمكن استنتاجه من كل واحد. بعض الفلاسفة ، مثل الوضعيين المنطقيين ، وكثير من العلماء ، يرفضون النظرة القوية للميتافيزيقا بأنها لا معنى لها ولا يمكن التحقق منها. كما رد بعضهم على ذلك بأن هذا النقد ينطبق أيضًا على أي نوع من أنواع المعرفة بما في ذلك العلوم الصعبة ، التي تدعي أنها تصف أي شيء بخلاف محتويات الإدراك البشري ، وبالتالي فإن عالم الإدراك هو العالم الموضوعي بمعنى ما. غالبًا ما تفترض الميتافيزيقا نفسها أن بعض المواقف قد تم اتخاذها على هذه الأسئلة ، وأنها يمكن أن تمضي بشكل مستقل عن الاختيار - السؤال الذي يتعلق بالموقف الذي يجب أن نأخذه ينتمي إلى فرع آخر من الفلسفة والنظرية.
ما وراء الطبيعة
انصبت كثير من الأعمال الحديثة على تحليل دور ما وراء الطبيعة في التنظير العلمي. قاد ألكسندر كويري هذه الحركة، حيث أعلن في كتابه ما وراء الطبيعة والقياس أن "لا يحقق العقل العلمي التقدم من خلال اتباع التجربة، بل من خلال تخطي التجربة". يمكن لهذا الافتراض الميتافيزيقي التأثير في التنظير العلمي كما قال جون واتكينز في أهم إسهاماته للفلسفة. منذ 1957 "أظهر طرق بعض الأفكار غير القابلة للقياس وبالتالي –طبقا لأفكار بوبر- تكون الافتراضات غير التجريبية مؤثرة في تطوير نظريات علمية قابلة للقياس. مثلت هذه النتائج العميقة في المنطق الأولي التطبيقي عملية إصلاحية هامة لطرق التدريس الإيجابية عن انعدام معنى ما وراء الطبيعة وعن الادعاءات القياسية". ادعي إمري لاكاتوس أن لكل النظريات العلمية قلبا ميتافيزيقيا صلبا ضروريا لجيل الأطروحات والافتراضات النظرية. من هنا –طبقا للاكاتوس- "ترتبط التغيرات العلمية بثورات ميتافيزيقية جامحة وواسعة".