Sasuke Uchiha
Sasuke Uchiha on yksi sarjan tärkeimmistä henkilöistä ja hänen osuutensa tarinasta kasvaa varsinkin myöhemmissä jaksoissa. Sasuke on luonteeltaan kylmä, sulkeutunut ja töykeä, mutta ninjana hän on äärimmäisen lahjakas. Hänen tunnekylmyytensä ei kuitenkaan ole synnynnäistä, vaan siihen on syynä hänen koko perheensä kuolema. Sasuke menetti hyvin pienenä koko klaaninsa, kun hänen isoveljensä Itachi tappoi kaikki suvun jäsenet yhden ainoan yön aikana. Tuntemattomasta syystä Itachi jätti Sasuken ainoana henkiin. Näiden tapahtumien jälkeen Sasuke sulkeutui itseensä ja järkeili elämänsä ainoaksi tavoitteeksi koston. Vuosien ajan Sasuke on hyvin kapeakatseisesti keskittynyt ainoastaan harjoittelemaan taitojaan, jotta voisi joskus vielä tappaa Itachin, ja on näin syrjäytynyt maailmasta.
Quan Chi
Saatuaan tämän tiedon, Quan Chi teki sopimuksen Lin Kuei klaanin kanssa; hän tuhoaisi heidän vihollisensa, Shirai Ryu klaanin, jos saisi avustusta yhdeltä Lin Kuein sotureista, Sub-Zerolta. Quan Chi käski Sub-Zeroa tuomaan hänelle amuletin ja hän teki näin (tappaen samalla Hanzo Hasashin, tulevan Scorpionin) tietämättä Quan Chin motiiveista. Quan Chi ei kuitenkaa antanut amulettia Shinnokille, vaan piti sen itsellään ja antoi tälle kopion. Hieman myöhemmin Sub-Zero tapasi Quan Chin uudestaan, Raidenin käskettyä häntä hankkimaan amuletin takaisin, ja voitti hänet Sareenan avulla. Tämän jälkeen Quan Chi vietti aikaansa avustaen Shinnokia ja valmistellen heidän tulevaa hyökkäystään. Hän myös johti Brotherhood of the Shadow kulttia.