Shaker Aamer
Shaker Aamer (12. joulukuuta 1968 Medina, Saudi Arabia) on brittiläinen kääntäjä, joka oli Yhdysvaltain vangitsemana ”laittomana vihollistaistelijana” vuosina 2001-2015. Hänet todettiin syyttömäksi kahdesti, ensin kesäkuussa 2007 George W. Bushin hallinto ja uudelleen vuonna 2009 Barack Obaman hallinto. Tästä huolimatta hänet vapautettiin vankileiriltä vasta lokakuussa 2015.
Alex Smith
Troy Smith kuitenkin jatkoi aloittjan paikalla, ja onnistui johdattamaan 49ersin selvään 27-6 -voittoon. Tämä ei kuitenkaan riittänyt pelastamaan hänen asemaansa, sillä tulevalle Super Bowl -voittajalle Green Bay Packersille hävityn ottelun jälkeen hän sai tehdä tilaa kyynärpäävammastaan toipuneelle Alex Smithille. Tämä onnistuikin johdattamaan paluuottelussaan joukkueen voittoon, mutta kahden seuraavan ottelun tappioiden myötä putoaminen jatkopeleistä varmistui. Ennen viimeistä, käytännössä merkityksetöntä ottelua Arizonaa vastaan, joukkueen päävalmentaja Mike Singletary sai potkut, ja tilalle otettiin väliaikaisesti puolustuksen koordinaattori Jim Tomsula. Tomsulan johdolla 49ers päätti kautensa voitokkaasti.