Mamoudzou
Mamoudzou on toiminut Mayotten pääkaupunkina vuodesta 1977 lähtien. Sitä ennen paikallishallintoalueen pääkaupunkina oli Dzaoudzi.
Malé
Pääkaupunki sijaitsee pienellä, 1,77 neliökilometrin kokoisella sarella, joten se on Malediivien tiheimmin asuttu kolkka. Saari tunnettiin aiemmin Sulttaanin saarena. Nähtävyyksiin kuuluu kauppatorin ja kalatorin lisäksi kansallismuseo, presidentin palatsi ja suuri moskeija, johon mahtuu kerralla yli viisituhatta palvojaa.