Inquisition
L’Inquisition (du mot latin "inquisitio" signifiant "enquête", "recherche") est une juridiction spécialisée (autrement dit un tribunal), créée au par l'Église catholique et relevant du droit canonique, dont le but était de combattre l'hérésie, en faisant appliquer aux catholiques qui ne respectaient pas les dogmes des peines variant de simples peines spirituelles (prières, pénitences) à des amendes lorsque l'hérésie n'était pas établie, et de la confiscation de tous les biens à la peine de mort pour les apostats relaps. Combattant les hérésies, l'Inquisition ne pouvait condamner que des catholiques — dont ceux qui avaient fait le choix libre du baptême. Bien que la peine de mort puisse être prononcée, elle ne l’a été que très rarement puisqu'Anne Brenon, spécialiste du catharisme, estime à le nombre de peines de mort prononcées par l'Inquisition durant ses cinq siècles d'existence à travers l'Europe. Elle se substituait à l'ordalie en introduisant la notion de tribunal, de défenseur et de minutes du procès.
Marranisme
À partir du , l’Espagne décida d’appliquer une politique plus répressive à l’égard des communautés juives et entama des campagnes de conversions forcées. Cette répression s'alourdit encore avec le développement de l’Inquisition, en particulier sous l'influence du premier Grand Inquisiteur, Tomás de Torquemada. Cette politique culmina avec le décret de l'Alhambra, le , qui donnait aux Juifs le choix entre la conversion et l’exil. Les conditions de l’exil étaient telles qu’elles les obligeaient, dans les faits, à abandonner presque tous leurs biens sur place, au profit de l’Inquisition espagnole et des autorités royales. Il existait déjà des marranes auparavant : des Juifs qui s’étaient convertis au catholicisme mais continuaient à pratiquer leur religion en secret, et qui furent d’ailleurs la cible principale de l’Inquisition. Mais à partir de cette date, tous les Juifs qui ne purent partir sans pour autant abandonner leur religion se virent contraints de devenir marranes ou crypto-juifs, c’est-à-dire « officiellement » catholiques mais judaïsants en secret. Toutefois, certains Juifs se convertirent volontairement afin de poursuivre leur carrière ou maintenir leurs positions sociales.