Iris (anatomie)
La couleur de l'iris est un caractère phénotypique de l'individu résultant de l'expression de son génotype. Des travaux de recherche publiés en 2007 ont mis en évidence l'existence de plusieurs gènes, dont deux principaux, dans la détermination de la couleur de l'iris. L'un, comparé à un interrupteur, déterminerait si la coloration est brune ou bleue ; l'autre serait responsable des variantes noisette ou vert. De nombreux autres gènes interviendraient de manière mineure. Contrairement à l'hypothèse ancienne qui supposait que la couleur ne dépendait que d'un seul gène et que le phénotype clair était récessif, ce modèle permet à deux parents aux yeux clairs d'avoir des enfants aux yeux bruns, fait attesté bien que rare.
Couleur métamère
D'autre part, le cerveau humain distingue les couleurs à travers des récepteurs appelés cônes, disposés dans la rétine. Il existe trois types de cônes, qui réagissent différemment aux énergies de photons qui les touchent. Le reste du système visuel agglomère leurs sommes et leurs différences pour produire une sensation de couleur.