Nutriment
Les protéines sont des chaînes d'acides aminés assemblées dans un ordre précis. Les acides aminés servant de base aux protéines sont au nombre d'une vingtaine dont huit (ou neuf selon les individus) sont « essentiels » à l'organisme humain. Leur présence dans la ration alimentaire est indispensable, l'organisme étant incapable d'en assurer la synthèse. Il s'agit de valine, leucine, isoleucine, thréonine, tryptophane, phénylalanine, méthionine et lysine.
Modélisation de protéines par enfilage
Les protéines sont définies comme ayant un pli (coude) commun si elles ont les mêmes structures secondaires majeures dans le même arrangement et avec les mêmes connexions topologiques. Différentes protéines avec le même pli ont souvent des éléments périphériques de structure secondaire et des régions de coude qui diffèrent en taille et en conformation. Dans certains cas, ces régions périphériques différentes peuvent couvrir la moitié de la structure. Les protéines placées dans la même catégorie de coudes de repliement peuvent ne pas avoir une origine évolutive commune: les similitudes structurelles pourraient provenir uniquement de la physique et de la chimie des protéines favorisant certains arrangements d'emballage et la topologie de chaîne.