Ethnisme au Rwanda
Le génocide des Tutsi au Rwanda, qui se déroula au printemps 1994 après trente-cinq ans de pogromes anti-tutsi, a exacerbé l'enjeu polémique de ces théories car le régime, qui s'est auto-qualifié d'« Hutu Power » et a conduit le génocide, s'est appuyé sur la lecture coloniale de l'histoire de la population rwandaise. Dans les débats qui ont suivi le génocide tutsi, certains spécialistes, comme Jean-Pierre Chrétien, se sont opposés à cette notion « d'ethnisme au Rwanda », d'autres tels Filip Reyntjens ou Bernard Lugan ont avancé que si le clivage ethnique entre Hutu et Tutsi a été exacerbé par la colonisation, il était au moins en partie préexistant.
Négation du génocide des Tutsi au Rwanda
La thèse de la négation du génocide des Tutsi du Rwanda développée par le Front patriotique rwandais de Paul Kagame, ainsi que par quelques associations telle que Survie, considérant notamment comme « négationniste » le fait de contester la thèse d'une complicité de l'État français dans le génocide rwandais, a été sévèrement critiquée par plusieurs historiens et spécialistes de l'Afrique comme Stephen Smith, Filip Reyntjens, Pierre Péan, Charles Onana, Claudine Vidal, André Guichaoua, Bernard Lugan et le colonel Jacques Hogard. Ils affirment que cette polémique se situe en dehors du champ historique. L'hypothèse d'un soutien direct des génocidaires par l'État français avant, pendant et après le génocide, est toutefois relancée en mars 2018 par le journal "Le Monde". Le même journal qui précise, « une variante française introduit une forme particulière d’accusation de négationnisme : elle stigmatise ceux qui n’affirment pas le soutien direct de responsables politiques et militaires français dans l’exécution du génocide. »