Infection urinaire
L'infection urinaire chez l'homme a pratiquement toujours une cause anatomique. Schématiquement : malformations congénitales dans l'enfance et l'adolescence, problèmes prostatiques chez l'homme âgé, calculs et tumeurs entre ces deux âges. La tuberculose rénale semble pouvoir aussi être une cause « anatomique » favorisante.
Struvite
La struvite forme des calculs dans l'urine des humains et des animaux qui sont infectés par des organismes produisant de l'ammoniac. Leur production est facilitée par une basicité élevée de l'urine ainsi que par une forte excrétion de magnésium (régimes à base de plantes riches en magnésium). Chez le chat domestique, elle est également facilitée par une protéine spécifique de son urine.