Furie iconoclaste
Durant cette période, la Réforme atteint les Pays-Bas. Chez les riches marchands d'Anvers, le protestantisme trouve écho face aux pratiques luthériennes des marchands allemands hanséatiques, peut-être en partie pour des raisons économiques. La propagation du protestantisme dans cette ville s'appuie sur la fondation en 1514 du cloître augustin dans le quartier de St. Andries. Luther, augustin lui-même, enseigna à certains de ses moines, et ses écrits sont publiés en 1518. Les premiers martyrs luthériens sont d'ailleurs d'Anvers. La Réforme aux Pays-Bas espagnols concerne donc la superposition de plusieurs vagues de réformes : l'arrivée des luthériens, suivie par un fort militantisme anabaptiste, puis celui des mennonites, et enfin le protestantisme de Calvin. Chacun de ces mouvements a son existence propre en parallèle de celle des autres.
Histoire de Congénies
Le fait marquant du , à Congénies aussi, c'est l'éclosion de la Réforme protestante. Celle-ci est installée en profondeur dès 1560-1561, année où l'on trouve mention de premiers pasteurs installés dans les paroisses de la Vaunage. D'après un décompte fait à Calvisson, déjà 80 % de la population adhère au protestantisme. Les causes de cette adhésion massive ne sont pas établies, d'autant plus qu'il s'agit ici d'une population essentiellement rurale, ce qui dément les théories fréquemment avancées sur l'adhésion prioritaire à la nouvelle religion des clercs, des bourgeois et des commerçants. Il est vrai que le luthéranisme est présent à Nîmes depuis 1532, année où un moine augustin (comme Luther) commente en chaire des passages de la Bible et que les premiers bûchers y ont été allumés en 1537 pour brûler ces nouveaux hérétiques, ce qui n'a pas empêché en 1559 l'arrivée d'un premier pasteur venu de Genève et l'établissement d'un consistoire protestant. Le arrive de Genève le pasteur Pierre Viret, dont l'éloquence va provoquer de très nombreuses conversions ; le , par imposition des mains, il consacre au ministère pastoral Jean Rouger qui va desservir les paroisses de Congénies, de Clarensac, d'Aujargues et de Vergèze. Aucun temple n'est encore construit, les cultes ont lieu en plein air à la belle saison, dans des maisons privées ou plus exceptionnellement dans une église "occupée" comme celle des Cordeliers à Nîmes. Au début de l'année suivante (1562), un synode général des églises réformées du Languedoc se tient à Nîmes avec .