Langues tokhariennes
En fait, il n'y a pas une seule langue, mais trois langues. Les deux premières à avoir été découvertes furent initialement appelées tokharien A et tokharien B. Dans la région de Koutcha, seuls des manuscrits en tokharien B ont été trouvés et cette langue est appelée aussi le koutchéen. L'essentiel des manuscrits en tokharien A provient de la région de Karachahr, plus précisément des ruines d'un grand complexe monastique qui se trouve à une trentaine de kilomètres au sud-ouest de cette ville, sur le site de Chortchouq. Dans cette région se trouvait autrefois un royaume, appelé Agni dans les textes sanskrits. Le terme d'agnéen peut donc être utilisé pour désigner le tokharien A. À Chortchouq, on a aussi trouvé des manuscrits en koutchéen. Enfin, des textes en koutchéen et en agnéen proviennent de différents sites de la région de Tourfan. Plus récemment, un ensemble de mots d'une langue similaire trouvés dans des manuscrits de Loulan a été désigné comme tokharien C ou "Kroränien."
Yugurs
Les Yugurs parlent trois langues en raison de leurs diverses origines : environ parlent le yugur occidental une langue turque à l'ouest du xian autonome, environ parlent le yugur oriental, une langue mongole à l'est du xian autonome et un dialecte du mandarin à Huangnibao. La langue vernaculaire des Yugurs est donc également le mandarin. La langue yugure a conservé de nombreux archaïsmes du ouïghour du . Un très petit nombre de Yugurs parlent le tibétain. Ils utilisent principalement le mandarin pour leurs intercommunications. Les langues yugures ne sont plus écrites aujourd'hui, bien qu'elles aient utilisé jusqu'à la fin de une écriture verticale tirée de l'écriture ouïghoure, dont est dérivée l'écriture « "mongol bičig" ».