Drapeau de la Moldavie
Lors de l'indépendance de 1991, les autorités moldaves reprennent les couleurs bleue-jaune-rouge verticales en y ajoutant cette fois les armoiries pour le distinguer de celui de la Roumanie. En 1995, lorsque l'ONU demande aux États de choisir parmi plusieurs nuances de bleu, la Roumanie opta pour un bleu cobalt proche de celui de la France mais différent du tricolore roumain originel au bleu plus clair, que la Moldavie conserva. De plus les dimensions du drapeau roumain sont de 2/3 alors que celles du moldave sont de 1/2. Il y a donc actuellement trois différences entre le pavillon de la Roumanie, et celui de la Moldavie : le bleu, la présence des armoiries et les proportions.
Moldavie
La RSS de Moldavie déclare son indépendance vis-à-vis de l'Union soviétique en août 1991 et est admise à l'Organisation des Nations unies en mars 1992, mais la présence d'importantes minorités notamment slaves (un tiers des habitants) et d'une armée russe (la quatorzième) qui participe à la sécession de l'État autoproclamé de Transnistrie et à la guerre du Dniestr de 1992 puis l'émergence de la Russie comme superpuissance dissuadent les Moldaves de se rapprocher de la Roumanie en dépit de l'héritage historique, linguistique et culturel commun. La constitution actuelle, adoptée en 1994, en fait une république parlementaire.