Complexité
La physique s'est longtemps attachée à l'étude des systèmes bien définis et bien catégorisés, par exemple : les propriétés spécifiques des solides/liquides/gaz, les cristaux, les milieux homogènes, etc. Alors que dans la nature, beaucoup de systèmes sont difficilement rangeables dans ces catégories. Le prix Nobel français Pierre-Gilles de Gennes a été un des premiers à "s'attaquer à des problèmes de transition ordre-désordre dans des matériaux aussi complexes que les polymères, les gels, les cristaux liquides et plus récemment la matière granulaire". Désormais, la physique de la matière molle ou celle du tas de sable ont acquis leur noblesse dans la hiérarchie des problèmes de la physique.
Matériaux philosophiques et scientifiques pour un matérialisme contemporain
La physique théorique est conduite à travailler sur et avec des notions "problématiques" telles que : cause, déterminisme, matière, temps, etc. Notions que la philosophie a investi en même temps que la théorie physique elle-même en tant qu'objet d'étude. Il y a une physique mais plusieurs épistémologies : le cas de la mécanique quantique est exemplaire. Sa précision et son pouvoir prédictif et ses interprétations sont débattues et donnent naissance à des "ontologies inconciliables".  Le matérialisme n'impose pas une ontologie "chosiste" et ne doit pas permettre les ontologies revigorant les conceptions idéalistes, ou antiréalistes qui ne pourront pas être intégrées dans le tableau général des objets désignables par les sciences aux niveaux d'intégration successifs de la matière.