Négation du génocide des Tutsi au Rwanda
La négation pure et simple considère qu'il n'y aurait eu au Rwanda que de simples massacres de masse, dont la quantité aurait été délibérément grossie par la propagande pro-FPR. Dans les procès devant le Tribunal pénal international pour le Rwanda (TPIR), plusieurs accusés ont tenté de contester l'existence d'un génocide au Rwanda. Conscient du temps perdu dans chaque procédure, le TPIR finit par instituer que le génocide n'avait plus besoin d'être prouvé. Le colonel Théoneste Bagosora déclara pour sa défense : « Moi, je ne crois pas au génocide. Au Rwanda en 1994, il y a eu des massacres excessifs auxquels il faut trouver une explication. ».
Hôtel Rwanda
Par ailleurs, ses détracteurs notent que le film contient des erreurs de dates, des événements oubliés, et des erreurs de contenus. Dans ses « repères historiques », le coup d'État de Juvénal Habyarimana en 1973 est passé sous silence. Le soutien militaire de la France à Habyarimana de 1990 à 1993 n'est pas explicite : on pourrait comprendre au travers du coup de fil de la Sabena à l'Élysée qu'il existe des liens entre les Français et certains Hutus génocidaires ou au pouvoir, bien que, dans le cadre du film, cela relève de la supposition. Les milices Interahamwe n'ont pas été créées par les Forces armées rwandaises, mais par le MRND parti du président Juvénal Habyarimana et ne veulent pas dire « ceux qui résistent encore », mais « ceux qui combattent ensemble ». La carte d'identité ethnique n'a pas été instituée en 1926 mais en 1931. Au moment du génocide, huit mois après et non pas un mois après, les accords d'Arusha n'étaient que partiellement appliqués et notamment le Premier ministre, Faustin Twagiramungu, et son gouvernement pressenti par ces accords, n'étaient toujours pas en place. « Les meurtres des Tutsi haut placés ont commencé le soir même ». Mais, dès les premières heures, des Tutsi du peuple ont été massacrés et pas seulement dans la capitale, également dans la région de Gisenyi dans le Nord-Ouest notamment. L'opération Turquoise date du et non pas du .