Japon
Le shintoïsme est la principale religion du Japon, les Japonais sont ainsi traditionnellement animistes avec une pratique chamanique, comme en attestent l'usage de nombreuses amulettes, tant à la maison qu'en voyage. Les autres religions subissent souvent une réappropriation animiste de leurs dieux dans le panthéon personnel ou collectif des Japonais. La plupart des Japonais ne croient ainsi pas en une religion particulière et unique, mais font preuve de syncrétisme, notamment à l'égard du bouddhisme, mais aussi plus généralement à l'égard de l'ensemble des religions. Beaucoup de japonais pratiquent donc des rites de plusieurs religions au cours de leur vie. Une même personne peut aller invoquer les dieux au sanctuaire shintoïste à l'occasion du Nouvel An et tenter d'attirer leur attention avant les examens d'entrée à l'école ou à l'université. Raisonnant de manière confucianiste, elle souhaitera parfois un mariage à l'occidentale dans une église chrétienne après une cérémonie plus traditionnelle et aura des funérailles dans un temple bouddhiste. Ce syncrétisme se réflète dans les statistiques de pratiques religieuses du ministère des Affaires intérieures et des Communications japonais, qui comptabilisait en 2014 :
Îles Gotō
Un élément historique important est l'enracinement du christianisme au Japon dans les îles. Certains des habitants descendent de chrétiens de l'Église catholique ("Kakure Kirishitan"), qui sont venus à leur foi lors de l'introduction du christianisme au Japon par l'intermédiaire de missionnaires portugais à la fin du XVIe siècle. Ces Japonais ont été à maintes reprises persécutés et torturés par les shogunats japonais pour leurs croyances, jusqu'au début de la période Meiji. Jusqu'à récemment des Kirishitans Hanare y vivaient encore; la majorité d'entre eux sont soit retournés au catholicisme après sa légalisation au XIXe siècle, soit sont revenus à des pratiques antérieures. Les îles comptent de nombreuses églises catholiques, dont la plus ancienne et la plus célèbre est l'église Dōzaki, construite en 1868 et située à environ 6 kilomètres au nord du port de Fukue.