Liste des îles d'Indonésie
Les plus grandes îles d'Indonésie sont Java, où habite près de la moitié de la population du pays, Sumatra, Bornéo (partagée avec la Malaisie et le Brunei), la Papouasie occidentale (ouest de la Nouvelle-Guinée) et Sulawesi.
Îles Raja Ampat
L'archipel indonésien des Raja Ampat (« les quatre rois ») est situé près de la côte nord-ouest de la Nouvelle-Guinée. Il est constitué de quelque , souvent montagneuses, dont les plus grandes sont Waigeo, Batanta, Salawati et Misool. Les trois premières se situent dans l'océan Pacifique, Misool se trouvant en mer de Seram. D'autre part, cette dernière mer abrite sur sa bordure nord les îles Raja et Kofiau. D'autres îles (dont Gag et l'archipel Fam) émergent en mer d'Halmahera. La superficie totale de l'archipel est d'environ .