Furie iconoclaste
Durant cette période, la Réforme atteint les Pays-Bas. Chez les riches marchands d'Anvers, le protestantisme trouve écho face aux pratiques luthériennes des marchands allemands hanséatiques, peut-être en partie pour des raisons économiques. La propagation du protestantisme dans cette ville s'appuie sur la fondation en 1514 du cloître augustin dans le quartier de St. Andries. Luther, augustin lui-même, enseigna à certains de ses moines, et ses écrits sont publiés en 1518. Les premiers martyrs luthériens sont d'ailleurs d'Anvers. La Réforme aux Pays-Bas espagnols concerne donc la superposition de plusieurs vagues de réformes : l'arrivée des luthériens, suivie par un fort militantisme anabaptiste, puis celui des mennonites, et enfin le protestantisme de Calvin. Chacun de ces mouvements a son existence propre en parallèle de celle des autres.
Séminaire protestant de Strasbourg
Le Séminaire protestant est l'héritier de la Faculté de théologie protestante de Strasbourg, qui avait cessé d'exister durant la Révolution et du Collège Saint-Guillaume ("Collegium Wilhelmitanum") qui loge et forme les jeunes séminaristes depuis le . La nouvelle Université impériale ne devant plus avoir le caractère profondément luthérien de l'ancienne Université, les anciens professeurs de la Faculté ont demandé la création d'un établissement à part dans lequel on pourrait enseigner la théologie. En outre, les professeurs craignent la centralisation de l'enseignement supérieur annoncée par Napoléon Bonaparte. Cette création est annoncée dès 1802 dans les Articles organiques sur le culte protestant, mais son statut est clairement précisé le (30 floréal an XI) dans un décret consulaire :L'Académie protestante ouvre ses portes le . Tous les professeurs encore vivants de l'ancienne Université deviennent professeurs de la nouvelle académie. Il y a douze chaires à la création de l'Académie protestante, mais il a été convenu qu'à la mort des anciens professeurs le nombre serait réduit comme convenu à dix. Trois seulement sont des théologiens ; il s'agit de Jean Laurent Blessig, Isaac Haffner et Georges-Frédéric Weber, le plus âgé des trois. Au fur et à mesure, les chaires de droit et de médecine (auxquelles étaient dédiées des écoles spécifiques) disparaissent au profit de la théologie. Toutefois, l'enseignement littéraire et des sciences humaines (comme l'histoire et la philosophie) se maintient. Ainsi, l'Académie se divise rapidement en deux sections, maintenues jusqu'en 1872 : la première est plutôt préparatoire et aide les futurs théologiens à obtenir une solide culture générale, la seconde lui succède et est exclusivement tournée vers la théologie.