Observatoire du Vatican
En 1578, le pape Grégoire XIII confie aux Jésuites astronomes et mathématiciens du Collège romain, la tâche de préparer la réforme de l'ancien calendrier (1582). Le premier observatoire astronomique est créé dans la Tour des vents du Vatican, en vue de fonder cette réforme sur de solides observations du mouvement des astres. Le calendrier grégorien, promulgué en 1582 par le pape Grégoire XIII, a été développé par le jésuite mathématicien Christopher Clavius à partir des données astronomiques. Cet observatoire au Vatican est en activité jusqu'à la mort du directeur, Gilii, en 1821, puis il est fermé. Ses instruments ont été transférés à l'Observatoire du Collège. Une troisième installation a lieu à l'Observatoire du Capitole, entre 1827 et 1870.
Observatoire de Lyon
La mise en place des instruments à Saint-Genis-Laval et les premières observations sont réalisées dès 1880, notamment par François Gonnessiat, Émile Marchand, Michel Luizet et Georges Le Cadet. En effet, Charles André défie rapidement l’autorité de Paris, qui veut lui imposer des astronomes formés à la capitale, en embauchant de jeunes étudiants lyonnais : Gonnessiat, responsable des observations méridiennes, est par exemple issu d’une modeste famille de l’Ain. Les premiers travaux du jeune observatoire concernent entre autres les étoiles doubles, les comètes, la surface du soleil, la météorologie, le champ magnétique terrestre et l’électricité atmosphérique.