Collégiale Saint-Martin d'Étampes
Selon certains historiens anciens, Clovis lui-même serait le fondateur de l'église Saint-Martin. Elle a toujours abrité un autel paroissial, et constitue l'une des trois paroisses primitives d'Étampes, avec la collégiale Notre-Dame, près du "castrum", et l'église Saint-Pierre, dans le faubourg éloigné du même nom. Vers 1095, le roi Philippe acquiert des terres pour permettre la fondation de l'abbaye de Morigny, sur une actuelle commune voisine d'Étampes. Afin d'augmenter les revenus de l'abbaye, le roi lui donne l'église Saint-Martin en 1106. Elle est déjà une collégiale, avec un chapitre composé de douze chanoines, et présidé par un doyen et un chantre. L'on ignore l'histoire de ce chapitre jusqu'à cette date. Faisant prévaloir son ancienneté, il refuse la tutelle exercée par l'abbaye de Morigny, et les deux communautés s'opposent pendant plus de trente ans.
Abbaye Saint-Martin de Pontoise
Une communauté de moines s'établit d'abord autour d’une chapelle dédiée à saint Germain (chapelle qui sera remplacée au par la cathédrale Saint-Maclou de Pontoise). Philippe nomme le bénédictin Gautier ("ca" 1030-1099) pour premier abbé. Il vient de l'abbaye Saint-Pierre de Rebais fondée au par Ouen de Rouen, et c'est avec grande réticence et après trois fugues (dont les moines profitaient pour relâcher la discipline) et un appel au pape (refusé) qu'il finit par en accepter la charge. Il est battu et jeté au cachot pour ses dénonciations du laxisme des moines, mais fidèle à ses vœux il persiste dans sa tâche. En 1080 il reçoit des terres et les droits sur l'église paroissiale du bourg Saint-Martin, et déplace alors la communauté vers cette église, sur le plateau au-delà de la Viosne, près de la voie romaine. L’abbaye est dès lors nommée « Saint-Germain-et-Saint-Martin », rapidement abrégé en « Saint-Martin ».