Enzyme
Les enzymes jouent un rôle important dans l'appareil digestif humain, où des enzymes telles que les amylases et les peptidases interviennent en dégradant des biopolymères comme l'amidon et les protéines en petites molécules susceptibles d'être absorbées au niveau des intestins . Les macromolécules biologiques sont en effet trop grosses pour être absorbées directement, et ce sont leurs monomères qui sont absorbés. La digestion recouvre précisément ce processus de clivage des macromolécules en petites molécules. Des enzymes différentes sont nécessaires pour digérer des substances différentes. Chez les ruminants, qui sont herbivores, des microorganismes de l'intestin produisent une enzyme particulière, la cellulase, capable de cliver la cellulose de la paroi cellulaire des cellules végétales .
Diauxie
La diauxie se produit parce que les organismes utilisent des opérons ou de multiples ensembles de gènes pour contrôler différemment l'expression des enzymes nécessaires pour métaboliser les différents nutriments ou sucres qu'ils rencontrent. Si un organisme utilise son énergie et d’autres ressources (acides aminés par exemple) pour synthétiser les enzymes nécessaires à la métabolisation d’un sucre qui ne peut que soutenir un taux de croissance plus lent et n'utilise pas la totalité ou la quasi-totalité de ses ressources disponibles pour synthétiser les enzymes qui métabolisent un sucre différent permettant un taux de croissance plus rapide, un tel organisme aura un désavantage reproductif par rapport à ceux qui choisiront d'utiliser le sucre permettant une croissance plus rapide. Au fil de l'évolution, les organismes ont développé la capacité de réguler leurs mécanismes de contrôle génétique de manière à n'exprimer que ces gènes permettant le taux de croissance le plus rapide. Par exemple, lorsqu'elle est cultivée en présence de glucose et de maltose, la bactérie "Lactococcus lactis" produit des enzymes permettant de métaboliser le glucose en premier, modifiant ainsi l'expression de son gène pour utiliser le maltose uniquement après épuisement de la quantité de glucose disponible.