学士（医学）
なお、通常は大学の修学年限は4年であるが、医学部・歯学部・獣医学部・薬学部は6年制であり、6年の修学年限を修了することで卒業が認められ学位が授与される。その代わり、大学院の4年制博士課程（6年制学部に直接接続する博士課程）に進学する際は、博士前期課程(修士課程)を経ず、4年制博士課程に進学し、博士号の取得を目指すことが可能である。前述の通り、医学分野の修士号も存在しており、これは、主に、他学部卒業生が大学院で医学分野の専攻に進む場合に目指す学位として位置づけられている。なお、医学部医学科などの6年制課程の卒業者が、博士後期課程（医学部医学科などに接続する4年制博士課程とは異なる）に進学する際は、通例修士の学位が必要とされ、一般的に修士課程または博士前期課程などへの進学を要する。
東京農林学校
1888年に校則改正を行って、各学部に本科で農科、林科、獣医科が設置されるほか、農科、林科にそれぞれ別科が設置された。また、修学年限の構成を予科3年、本科3年の6年制に移行した。しかし1889年に再改正があり、学部制に戻し、また別科を乙科としている。さらに、時の農商務大臣井上馨の判断で、各学部の卒業生には農学士、林学士、獣医学士の各学士号が授与されることになる。また、同年に東京農林学校の既卒業生と旧駒場農学校の卒業生は「高等試験ヲ要セス其修メタル学科ニ関スル行政官試補ニ採用スルコトヲ得」とされて、実質帝国大学卒業者と同等の処遇を受けることになった。