ワジリスタン紛争
2007年1月からイスラマバードにあるラール・マスジッドというモスクに神学生らが立てこもり、政府に対し、イスラム法の厳格な適用などを要求した。立てこもった神学生らと治安当局との間でにらみ合いとなり、膠着状態が続いていたが、7月3日にムシャラフ大統領は制圧作戦を開始し、7月12日に制圧された。多くの神学生らは投降の呼びかけに応じたが、最後まで抵抗を続けた者もおり、死者は102人に達した。
ラールマスジッドの神学生の多くは部族地域出身であり、ターリバーンの関係者らも含まれていたという。そのため、ラール・マスジッド事件後に、その報復と見られる治安部隊を狙った自爆テロが相次いだ。7月15日にはターリバーンは北ワジリスタン和平合意破棄を宣言し、戦闘が再開されることとなった。
アフガニスタン紛争 (1989年-2001年)
8月、パキスタンの北西辺境州（）でパキスタンの諜報機関ISIの支援によりムハンマド・オマルをリーダーとするターリバーンが結成された。ISIとサウジアラビアはアフガニスタンの混乱を収拾できないヘクマティヤールを見限り、ターリバーンによるアフガニスタン統一を支援するようになった。10月にターリバーンはパキスタンからアフガニスタンに通じるカイバル峠のルートを押さえた。11月にはヘクマティヤールの拠点であるカンダハールを占領し、以降はこの地を基盤とした。ヘクマティヤールの基盤はターリバーンと同じパシュトゥーン人であり、ヘクマティヤール派の兵士はターリバーンに吸収されつつあった。