リッチモンド・ピータースバーグ方面作戦
リーは最終的に圧力に屈した。1865年3月25日には補給線が遂に切断されて本当の包囲戦が始まり、このためリーは1865年4月にはリッチモンドとピーターズバーグを放棄し、これは更なる撤退とアポマトックス・コートハウスにおける降伏に繋がった。ピーターズバーグ包囲戦は第一次世界大戦で常態化した塹壕戦の先例として軍事史の中で特筆される。また南北戦争の中でアフリカ系アメリカ人の兵士を最も大量に投入した戦いであり、彼らはクレーターの戦いやチャフィン農園の戦いなどで大きな犠牲を出した。
アポマトックス方面作戦
リーはこの頃に全南軍の指揮官になった（南軍における彼の名声にも拘らず、ほぼ3年間北バージニア軍のみの指揮官だった）。リーの作戦はピーターズバーグを包囲する北軍から逃れ出て、南西方向に撤退し、リンチバーグで飢えた兵士を養い、さらに南へ向かうことだった。そこでノースカロライナ州にいるジョセフ・ジョンストンの軍隊と北バージニア軍が合流できれば、ジョンストン軍を追撃しているウィリアム・シャーマン少将の北軍を打ち破り、続いて全軍でグラント軍を叩くために戻る可能性が生まれるはずだった。この脱出行のために自軍を右翼側に動かした。