十兵衛暗殺剣
寛永元年（1624年）、遠乗り中の将軍・徳川家光の前に一人の侍が立ちはだかる。侍の名は幕屋大休、新陰流の開祖・上泉伊勢守の高弟・松田織部正の弟子であった。松田は小太刀をとっては柳生新陰流の祖石舟斎をも凌ぐと言われた達人だったが、豊臣家に仕えたため不遇のうちに世を去っていた。幕屋は松田から印可状を受けた自分こそが新陰流の正当な継承者であると主張、家光に同道していた将軍家剣術指南役・柳生十兵衛に挑戦する。家光は柳生の指南役としての面目を慮り、幕屋の主張を黙殺するが、その後幕屋は弟子を率いて柳生一門を挑発、これに乗せられた柳生の門弟たちは幕屋を襲撃して返り討ちに遭い、その他の門弟たちも惨殺されてしまう。
柳生心眼流
伊予史談会文庫所蔵の1827年（文政10年）頃に作成された剣術英名録『撃剣名家録』には、摂津国の麻田藩（某誌で「原文では「播州麻田藩」と記されているが摂州の誤り」とあるのは誤り。原文の摂州の崩し文字が読めなかっただけ。現在の大阪府豊中市あたり）の家中に柳生心眼流の剣術家がいたことが記されている。この伝承はのちに、広島県に伝えられ、少なくとも明治期に至るまで、同地で柔術などが多くの若者に教授された。現地には現在も奉納額が残されている。なお、この麻田藩の伝承はさきの小山左門の系統に連なるものと思われ、幕末期から明治にかけて活躍した後藤柳生斎は、江戸、大阪を中心に広くその技を伝えている。この流れは一名「後藤派柳生流」とも称せられ、合気道創始者・植芝盛平が堺で中井正勝よりこれを学び、その師と思われる坪井政之輔名義の、初段・中段が一つになった巻物を得ている（現在、合気会より一般公開された免状からは初段の表記だけが確認できる）。なお、当時大阪では坪井の他、後藤門下と思われる二人の師範がそれぞれ柳生流柔術（一部に剣術も。なお、さきの中井正勝は鏡新明智流の剣術家でもあった）を教授していたことが確認されている。