アルカーイダ
ウサーマ・ビン＝ラーディンはアル＝カーイダの精神的指導者であり、財力を用いて初期の反米闘争の組織を起ち上げた。アル＝カーイダのナンバー2とされていたアイマン・ザワーヒリーはイスラーム神学者。
1986年、二人はサウジアラビアのジッダで初めて会ったとされる。組織作りや資金集め、組織の代表として声明などを出す役割はビン＝ラーディンが担い、テロに関する宗教的な理論面や作戦面は、学識のあるザワーヒリーが担っていたとされる。
2011年5月にビン＝ラーディンがアメリカ軍によって殺害されると、翌6月、アル＝カーイダは、ザワーヒリーが新たな指導者に選出されたと発表した。
ファトフ軍
アルカイダのイデオローグでサウジアラビア出身のアブドッラー・ムハイシニーは、ファトフ軍の創立に関わり、2015年3月時点でも指導的地位にあるとされる。ムハイシニーはイドリブ制圧後、「イドリブ首長国」の成立を宣言し、穏健な反体制派を市内から排除した。ムハイシニーはイドリブに「シャリーア学院」、「教宣センター」、「訓練基地」、「シャリーア法廷」などを設置し、市民への洗脳・圧迫を行っているとされる。また、その統治のあり様はISILの統治と変わりなく、「ラッカはイラク人であるバグダディー、イドリブはサウジ人であるムハイシニーが指揮しているという点以外まったく違いはない」とする見方もある。