ユーゴスラビア
セルビアが主導するユーゴスラビア連邦軍とスロベニアとの間に十日間戦争、クロアチアとの間にクロアチア紛争が勃発し、ユーゴスラビア紛争が始まった。十日間戦争は極めて短期間で終結したものの、クロアチア紛争は長期化し泥沼状態に陥った。1992年4月には、3月のボスニア・ヘルツェゴビナの独立宣言をきっかけに、同国内で独立に反対するセルビア人と賛成派のクロアチア人・ボシュニャク人（ムスリム人）の対立が軍事衝突に発展し、ボスニア・ヘルツェゴビナ紛争が起こった。同国はセルビア人・クロアチア人・ボシュニャク人の混住がかなり進行していたため状況はさらに深刻で、セルビア、クロアチア両国が介入したこともあって戦闘は更に泥沼化した。
イリジャ
イリジャは、ボスニア・ヘルツェゴビナのほかの地域と同様に、オーストリア＝ハンガリー帝国の統治下の（、1878年 - 1918年）時代に工業化された。鉄道路線や駅が設けられ、ホテルが建ち、イリジャはボスニアにおいてサラエヴォに次いで重要な町となった。1900年代に入ってからも発展は続き、開発が進められた。
1990年までは、イリジャはセルビア人とボシュニャク人（「ムスリム人」）の混住する地域であり、1971年の国勢調査では人口の47.21%はセルビア人、31.58%はムスリム人であった。ボスニア・ヘルツェゴビナ紛争を経て、1995年に紛争を終結させた和平合意であるデイトン合意では、イリジャ自治体はボシュニャク人などが主体のボスニア・ヘルツェゴビナ連邦に属する部分と、セルビア人主体のスルプスカ共和国に属する部分に分割された。この時、イリジャの町はボスニア・ヘルツェゴビナ連邦に属するものとされ、ここに居住していたセルビア人の大部分は町を去り、多くの建物が破壊された。紛争後も町に留まったセルビア人らは、サラエヴォやセルビア人地域となった所から脱出してイリジャに流れ込んできたボシュニャク人らによって迫害を受けたり脅迫されたりした。1996年以降、イリジャには北大西洋条約機構（NATO）の平和維持部隊である和平履行部隊（IFOR、後にSFORやEUFOR）の司令部が置かれた。この間、テルメ（Terme）、スルビヤ（Srbija）、ボスナ（Bosna）、ヤドラン（Jadran）の各ホテルは封鎖され、NATOの司令部として使用された。司令部は2000年にブトミル地区に移された。今日の町は活気を取り戻しているが、住民の大部分はボシュニャク人となっている。紛争前にイリジャ自治体に属した地区のうち、和平合意によってスルプスカ共和国の領域となったヴォイコヴィチ（）およびグルリツァ（Grlica）の両地区はイストチナ・イリジャ（東イリジャ）自治体となっており、こちらはセルビア人が大部分を占めている。