U505 (潜水艦)
"U-505"を鹵獲し曳航して戻ったことは、（単に暗号表を押収した後に沈んだということよりも）ウルトラの機密を危険に晒すことになると考えられた。アメリカ海軍作戦部長のキング提督は、ギャラリー大佐を軍法会議にかけることを考えた。秘密を保持するためにUボートが鹵獲されたことを知る捕虜となった乗組員は、その他の戦争捕虜からは隔離され、赤十字社による面会も禁止された。後にドイツ海軍は乗組員の戦死を公示し、家族にもその旨を通知した。ドイツ人乗組員の最後の一人は、1947年まで帰国できなかった。
武洲丸
9月24日朝、武洲丸、相洲丸の2隻で編成された臨時ナカ502船団は、第89号駆潜特務艇と第200号駆潜特務艇の護衛で奄美大島から出航した。7.5ノットのゆっくりした速度で、26日午前に鹿児島到着予定であった。2晩目に入った25日午後9時2分頃、諏訪之瀬島北西13km付近の洋上を雷雨をついて航行していた武洲丸は、アメリカの潜水艦バーベルから雷撃された。バーベルの魚雷が命中した武洲丸は急速に浸水し、の地点で沈没した。相洲丸は爆雷で反撃しつつ離脱し、護衛艦が救助活動を行ったが収容されたのはわずかで、疎開者148人・便乗軍関係者18人・軍属船員11人・海軍警戒隊員5人の計182人が死亡した。なお、日本海軍は第453海軍航空隊と沖縄海軍航空隊古仁屋派遣隊の水上機を出動させて27日まで対潜掃討を行ったが、成果は無かった。