分類学
なお、広義の分類学では無生物も含めた事物（観念も含めて）を対象とする。歴史的には博物学にその起源があり、古くは、鉱物などもその対象としたが、それらの分野は分類学という形で発展することがなかった。以下の叙述では狭義の分類学（生物の分類学）についておこなう。
微生物生態学
以下の記述はR.M. Atlas and R. Bartha (1997)に拠る。
微生物生態学の対象は、分類学上の3つのドメイン（古細菌、真正細菌、真核生物）とウイルスを含む。