石徹白騒動
評定所における吟味の焦点は、まず石徹白騒動の最大の原因ともいえる、社人の共有財産であった白山中居神社の造営林や他の社人の持ち林を勝手に伐採したり、追放した社人の資産を私物化し、更に社人から新たに三分の一の年貢を取り立てるなどという石徹白豊前の数々の専横ぶりであった。もちろん500名を越える大勢の社人を石徹白から追放したことについても大きな問題とされた。
宇喜多秀家
宇喜多騒動の原因は、秀吉が没して世情が不安定な中、宇喜多家の執政であった重臣長船綱直や豪姫に付いて前田家からやって来た宇喜多家家臣としては新参者ながら秀家に重用された奉行人中村次郎兵衛らの専横に対する他の重臣達の不満といった家臣団の政治的内紛に加え、秀家の素行に問題があったことや、さらに宇喜多家では日蓮宗徒の家臣が多かったが、秀家は豪姫がキリシタンであったことから家臣団に対してキリシタンへ改宗するよう命令するに至ったためともいわれる。しかし、離反した従兄弟の坂崎直盛は敬虔なキリシタンであり、宇喜多家中でキリスト教入信を斡旋し、重臣の明石全登などを入信させたのは直盛本人である。これにより、キリスト教徒と日蓮宗徒との軋轢というのは考えにくく、また長船綱直は宇喜多家譜代の家臣であり、譜代家臣と前田家からの御付組との対立との構図も外れており、背景の詳細はよく分かっていない。