レオナルド・ダ・ヴィンチ
この時期に描かれたもうひとつの重要な絵画が『岩窟の聖母』で、ミラノの聖母無原罪の御宿り信心会からの依頼による作品である。『岩窟の聖母』は、ジョヴァンニ・アンブロージオ・デ・プレディス（）と弟エヴァンジェリスタが協力した作品で、既に完成していた祭壇を飾る大きな祭壇画として描かれた。レオナルドはこの作品を、聖アンナ、聖母マリア、幼児キリストの聖家族が、天使に守られてのエジプトへの逃避中に幼い洗礼者ヨハネと出会うという、聖書の正典ではありえない場面に設定した。さらに幼いヨハネはキリストを救世主と認め、祈りを捧げている情景が表現されている。崩れ落ちそうな岩と渦巻く川を背景にして、青白い顔をした美しい人々が、幼児キリストを愛情をこめて崇拝している場面が描かれている。『岩窟の聖母』は200cm × 120という比較的大規模な作品ではあるが、『東方三博士の礼拝』のような複雑な画面構成にはなっていない。『東方三博士の礼拝』にはおよそ15名の人物像と詳細な建築物が描かれているが、『岩窟の聖母』に描かれているのは4名の人物像と岩の洞窟だけである。『岩窟の聖母』は異なるヴァージョンで2点制作され、1点は聖母無原罪の御宿り信心会の礼拝堂に（現在ロンドンのナショナル・ギャラリーが所蔵しているヴァージョン）、もう1点はレオナルドの手元に留め置かれ、後にレオナルドと共にフランスへと持ち込まれている（現在パリのルーヴル美術館が所蔵するヴァージョン）。しかしながら聖母無原罪の御宿り信心会が正式に『岩窟の聖母』を入手、ないし制作代金を支払ったのは16世紀になってからのことだった。
ブラック家の祭壇画
左翼パネルには洗礼者ヨハネの上半身が描かれ、さらにその背景には洗礼を受けるキリストが描かれている。ヨハネの口もとから流れ出すように書かれているのは『ヨハネによる福音書』(1:29) の「見よ、世の罪を取り除く神の小羊」である。右翼パネルに詳細に表現された豪奢な衣装を身にまとって描かれているのはマグダラのマリアで、女性を描いたファン・デル・ウェイデンの作品の中でも傑作と見なされている。マグダラのマリアの上方に書かれている文言は、『ヨハネによる福音書』(12:3)の「その時、マリヤは高価で純粋なナルドの香油一斤を持ってきて、イエスの足にぬり」である。中央パネルの横幅は68cmで、両翼パネルのほぼ二倍の大きさである。中央に描かれたキリストの外貌は、ボーヌのホテル・デューが所蔵するファン・デル・ウェイデンの祭壇画『最後の審判』の中央パネルに描かれたキリストに酷似している。