流罪
江戸時代には、追放よりも重い刑と規定されて「遠島」（えんとう）と称されており、江戸幕府では東日本の天領の流刑者を主に八丈島等の伊豆七島と佐渡島に流した（ロシアが蝦夷地への進出を図った19世紀には蝦夷地への流刑先変更が検討されたが、松前藩の反対で中止されている）。西国では天草諸島や五島列島などが流刑地となった。幕府はこのほか、改易した大名やお家騒動で処罰されたその重臣らを遠方の各藩預とする処分をしばしば下した。
久賀島
室町時代には倭寇の拠点となったが、島は宇久氏の統治下にあった。1566年（永禄9年）、ルイス・デ・アルメイダが五島へ布教したことで、久賀島でも深浦・市小木・蕨集落ではキリシタンが急増した。しかし、江戸時代に入ると福江藩領となり、禁教令もありキリスト教は一度途絶えることになる。田ノ浦に代官所が置かれ、宝暦年間（1751～63年）に代官所が久賀に移設し開拓が始まった。久賀島は江戸時代を通して流刑の地でもあり、罪人による開拓も進められた。1845年（弘化2年）には、番屋岳に異国船の来航を監視する番所が置かれた。