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ウラジーミル・プーチンは1999年12月、エリツィンの突然の辞任を受けて首相から大統領代行に就任し、翌2000年3月の大統領選挙に勝利、ロシア連邦の2代目大統領に就任した。2005年3月の大統領選挙では得票率71%で再選を果たしたのち、2008年5月に大統領の座をドミートリー・メドヴェージェフに譲り、首相に就任した以降も国民からの人気が高く、政治的な影響力を保持した。2012年5月にはプーチンが第4代大統領に就任した。プーチンの経済政策の特徴は、エリツィン同様に市場経済重視の自由主義政策を推進する一方で、エリツィン時代に政治力を強めた新興財閥（オリガルヒ）を弾圧するといった、強権的な側面も併せ持っている。
ドミトリー・コザク
1999年、ロシア連邦政府に移り、プーチン首相の下、8月政府官房次長（内閣官房副長官）、次いで官房長官（閣僚待遇）に相次いで就任する。2000年ロシア大統領選挙では、プーチン選対に参加する。プーチンの事実上の政権構想となった「2010年までのロシア戦略発展計画」立案の作業班にも参加した。同年6月にロシア連邦大統領府副長官としてプーチン政権の中央集権化政策などの改革立案に関与。2003年10月、大統領府第一副長官に就任する。2004年ロシア大統領選挙直前の2004年2月にプーチンがミハイル・カシヤノフ首相を解任し、同年3月に第1次ミハイル・フラトコフ内閣が成立すると、コザクは官房長官に就任した。同年9月、南部連邦管区大統領全権代表に就任。連邦政府に新設された北カフカス政策を担当する連邦特別委員会の委員長も兼務することになった。コザクの任命の背景には、武力のみならず、経済面でのチェチェンを含むカフカス問題の包括的解決を目指すものと観測された。2007年9月、ヴィクトル・ズプコフ内閣の地域開発相に就任。2008年5月に成立した第2次ウラジーミル・プーチン内閣でも留任したが、同年10月にソチオリンピック専任の副首相に就任した。