肉質虫
ミトコンドリアは真核生物のほとんどすべてが持つ、重要な細胞小器官であり、酸素呼吸にかかわっているとされる。しかし、原生生物ではミトコンドリアに独特の形質のものが見られることが知られる。例えば、一般にミトコンドリア内膜のひだであるクリステは平板状であるが、ミドリムシやトリパノソーマのそれは先が膨らんだ団扇状になっており、この両者が近縁であることの証拠ともされる。
ミトコンドリア内膜
ミトコンドリア内膜の脂肪組成は、細菌の膜のものに似ている。この現象は、ミトコンドリアの起源を真核生物のホスト細胞に内在化した原核生物であるとする細胞内共生説によって説明できる。