レクイエム (モーツァルト)
このうち、モーツァルトが完成させることができたのは第1曲だけであり、第2曲第3曲等はほぼ出来ていたものの残りは未完のまま作曲途中にモーツァルトは世を去る。第2曲はフライシュテットラーとジュースマイヤーによってオーケストレーションが行われた。他に第3曲 - 第7曲、第9曲 - 第10曲の主要部分（四声の合唱部と主要な和声のスケッチ）と第8曲「涙の日（ラクリモーサ）」の8小節までがモーツァルトによって残され、それを基にジュースマイヤーが補筆完成を行っている。残りの第11曲以降についてはモーツァルトによる草稿は伝わっていないものの、フライシュテットラーやジュースマイヤーに対し何らかの指示がされた可能性はある。また、全曲の最後を飾る第14曲「聖体拝領唱」はモーツァルトの指示により（コンスタンツェの証言が残っている）第1曲「入祭唱」の一部および第2曲「キリエ」のフーガの歌詞を入れ替えたもので、これは当時のミサ曲の慣例でもあった。
ホルン協奏曲 (モーツァルト)
「ロンド」の楽章には2種類の譜面が残されている。一方は曲の構成は最後まで完成しているものの、独奏パート以外の伴奏の大部分が未完成であり、初稿と呼ばれる。もう一方は伴奏を含めてすべて完成しているもので、改訂稿と呼ばれる。従来の研究では、1782年に「アレグロ」が作曲され、同時に「ロンド（初稿）」も着手されたが未完で放置され、その後1787年に全面的に書き直す形で「ロンド（改訂稿）」が完成された、と考えられてきた。最近の研究では、そもそも「アレグロ」は1791年に書かれ、「ロンド（初稿）」も同時期に書かれたとされる。「ロンド（改訂稿）」については、モーツァルトの没後の1792年に弟子のフランツ・クサーヴァー・ジュースマイヤーが補筆完成させたものであると考えられている。これは現在ほぼ定説となっており、この説の普及と共に、改訂稿のロンドは「ジュスマイヤー版」と呼ばれることがある。