学部
医学部、歯学部、薬学部、獣医学部といった医学系の学部では教育期間は6年間となる。1・2年次は教養科目、3・4年次は専門科目というのは基本的に他の学部と同じである（近年の医学知識増加に対応して、一部の大学では1年時から専門科目を学び始める）。5・6年次には臨床の場での経験によって、より専門的な知識を身に付けると同時に、6年次には資格を得るのに必要な国家試験の対策にも勤しむこととなる。
さらに医学部、歯学部では資格を得た後に研修医として研修が医師法・歯科医師法によって義務付けられている。
日本の学校教育法以下においては、学部（学部以外の教育研究上の基本となる組織を含む）と、研究科（研究科以外の教育研究上の基本となる組織を含む）の双方については、個別に扱っている。しかし、現実的には独立研究科を除き、一体に教育研究が行われている。
東京獣医畜産大学
東京高等獣医学校は戦後、学制改革によって新制の東京獣医畜産大学に移行したが、経営状態は長い間苦境に立たされており、かねてから関係の深かった日大との合併を模索する動きが発生した。一方の日本大学も、戦時中に農学部を神奈川県藤沢市に置いていたが、学生がなかなか集まらなかったことから、農学部の東京移転が提案されていた。財政難の解消を望む東京獣医大と、東京移転で農学部の学生募集を安定化させ、同時に獣医学分野を統合して教育・研究体制を強化することを考えた日本大学双方の思惑が一致し、両大学は合併についての合意に到達した。1951年（昭和26年）4月には農学部の一部が藤沢校地より獣医大に移転し、事実上の統合が始まったが、正式な大学統合は、同年11月に文部省からの認可が下るまで待たなければならなかった。そのため、1951年度入学生は日大と獣医大の両方から募集され、学生がどちらに入学したのかわからなくなるといった混乱も多少生じていた。1952年（昭和27年）3月、東京獣医大は教員・学生・同窓会がすべて日大に移される形で、廃止が認可された。