東ティモール
その後の制憲議会選挙ではフレティリンが圧勝し、大統領にはシャナナ・グスマン、首相にはマリ・アルカティリが選出され、2002年5月20日に独立式典を行った。独立後、国連は国際連合東ティモール支援団 (UNMISET) を設立、独立後の国造りの支援を行った。この中で、日本の自衛隊も国連平和維持活動 (PKO) として派遣され、国連と協力して活動を行った。2005年には、国連の平和構築ミッション、UNOTIL（国連東ティモール事務所）が設立された。
シャナナ・グスマン
スハルト体制終焉後の1999年8月30日、東ティモールで国民投票が行われ圧倒的多数が独立を選択した。 インドネシア軍はこの結果を受けて組織的な破壊工作を開始したが、国際的圧力の結果、東ティモール多国籍軍 () が駐留するに至った。 その後グスマンも釈放され、2002年まで続いた国連暫定行政機構の高官に指名された。 この間、グスマンは東ティモールの統一と和平を訴え続け、一般的にも新しい国家の事実上のリーダーとみなされた。 2002年末に行われた大統領選挙ではフレティリンを除く 9 つの政党から支持を受けて、2002年5月20日に正式に独立した東ティモールの初代大統領に選ばれた。一方、初代首相には第一党であったフレティリンのマリ・アルカティリが就任した。