リッチモンド・ピータースバーグ方面作戦
リーは最終的に圧力に屈した。1865年3月25日には補給線が遂に切断されて本当の包囲戦が始まり、このためリーは1865年4月にはリッチモンドとピーターズバーグを放棄し、これは更なる撤退とアポマトックス・コートハウスにおける降伏に繋がった。ピーターズバーグ包囲戦は第一次世界大戦で常態化した塹壕戦の先例として軍事史の中で特筆される。また南北戦争の中でアフリカ系アメリカ人の兵士を最も大量に投入した戦いであり、彼らはクレーターの戦いやチャフィン農園の戦いなどで大きな犠牲を出した。
半島方面作戦
5月31日、ジョンストンは雨で脹れ上がったチカホミニー川に跨っている北軍の状態に付け込もうと考え、川の北にいる3個軍団からは孤立した形にある川の南の2個軍団（ハインツェルマンの第3軍団とキーズの第4軍団）を攻撃した。南軍の攻撃作戦は複雑で連係がうまく取れず、誤った動きになって攻撃が遅れたが、第4軍団を後退させ大きな損失を負わせることに成功した。両軍共に多くの部隊を投入したが、南軍は勝利を得るために必要な量の集中を成し得なかった。右翼には13個旅団がいたが、一度に4個旅団を越えて戦うことが無かった。北軍の陣地は第3軍団とサムナーの第2軍団からジョン・セジウィックの師団（サムナーの発案で川を渡った）の支援で、第4軍団が崩壊する前に落ち着けられた。ジョンストン将軍はこの戦闘中に重傷を負い、北バージニア軍の指揮は一時的にG・W・スミスに引き継がれた。ロバート・E・リー将軍が間もなく恒久的な指揮官となった。6月1日、南軍は多くの援軍を動員した北軍に対する攻撃を再開したが、ほとんど進展は無かった。両軍共にほぼ同じくらいの損失をだし、共に勝利を主張したが、どちらも大した成果は無かった。ジョージ・マクレランのリッチモンドに向けた前進は止まり、ジョンストン軍はリッチモンドの防御工作物の背後に退いた。