魔法少女
武内直子原作の『美少女戦士セーラームーン』（1992年-1997年）の成功は、アニメ版『赤ずきんチャチャ』（1994年）、『魔法騎士レイアース』（1994年）、『愛天使伝説ウェディングピーチ』（1995年）、『ナースエンジェルりりかSOS』（1995年）等の作品を生み出し、戦闘美少女（バトルヒロイン）系魔法少女作品は魔法少女の一ジャンルとなった。「バトル」「戦隊モノ（複数のメインヒロイン）」「恋愛」などの要素は後の作品に影響を与えている。これらの中には『魔女っ子戦隊 パステリオン』（1995年-1998年）のように、2000年以降に流行る異性装ものや男の娘ものの先駆け的作品も現れている。
少女向けアニメ
小中学生向け少女漫画雑誌『なかよし』や『りぼん』で掲載された一部作品も10代以上をターゲットと見据えて深夜帯やインターネット上でアニメ化され放送されたものもある。『なかよし』にはそれが多く、原作をアニメ化した作品では『さばげぶっ!』（2014年）・『美少女戦士セーラームーンCrystal』（2014年）・『カードキャプターさくら クリアカード編』（2018年）、アニメを漫画化した作品では『地獄少女』（2005 - 2006・2006 - 2007・2008 - 2009年）がある。また原作小説を漫画化した後にアニメ化され、一部がアニメと並行して「なかよしKC」でコミックス化された作品では『ゴーストハント』（2006 - 2008年）が該当する。『りぼん』では原作漫画が深夜帯にアニメ化されたケースはないが、『あにゃまる探偵キルミンずぅ』（2009年 - 2010年）が漫画化されている。なお『ちゃお』では原作漫画が深夜帯にアニメ化されたり、深夜アニメを漫画化したケースのいずれもない。1960年代から1996年頃までの長い間、このジャンルのアニメにおけるマーチャンダイジングは、玩具（電子ゲームを除く）、キャラクターの絵が入った文房具、食品などの関連商品の販促が主体であった。『セーラームーン』などの幼児から小学高学年を対象とした作品はもちろん、小学校中～高学年以上をメインターゲットとし年齢層が比較的高めであった『ママレード・ボーイ』、『ふしぎ遊戯』（1995 - 1996年に放映されたTVアニメ版）、『花より男子』（アニメ版）などの作品でも、そのほとんどが玩具会社・文具メーカーなどとタイアップをしていた。