哺乳類
哺乳類の起源は古く、既に三畳紀後期の2億2500万年前には、最初の哺乳類といわれるアデロバシレウスが生息していた。そのルーツは、古生代に繁栄した単弓類 (Synapsida) のうち、キノドン類 (Cynodontia) である。単弓類は、爬虫類の双弓類 (Diapsida) とは石炭紀中期に分岐し、独自の進化をしていた。単弓類は、ペルム紀末の大量絶滅において壊滅的なダメージを受け、キノドン類などごくわずかな系統のみが三畳紀まで生き延びている。一時期再び勢力を挽回するものの、既に主竜類などの勢力も伸長し単弓類は既に地上の覇者ではなくなっていた。そして、三畳紀後期初頭の大絶滅を哺乳類とともに生き延びたのは、トリティロドン科のみであった。しかし彼らも白亜紀前期には姿を消している。また、同じく三畳紀には、すでに哺乳類の他のグループから分岐する形で単孔目が出現している。単孔目は現存するが、これは卵生であることや総排出腔をもつなどほかの哺乳類とは大きく異なる構造を持ち、もっとも原始的な哺乳類の形をとどめているとされる。
カール・エルンスト・フォン・ベーア
発生学において主にキャリアのはじめ数年間で自らを捧げ尽力した研究に、ベーアは、ケーニヒスベルクで発生学の研究を始め、1827年に卵細胞を発見した、 事実哺乳類および特に人間の卵細胞を捉えた。(Von einer Eizelle kann erst nach der Formulierung der Zellentheorie 1838/39 die Rede sein.) ベアは研究の成功を修め、何世紀にもわたる「哺乳類の卵細胞」の調査を完了した。彼は同じ年に、サンクトペテルブルク科学アカデミーへ送ったラテン語で書かれた手紙の中で彼の重要な発見について知られ、(『"De ovi mammalium et hominis genesi"』ライプチヒ1827)また、1828年にドイツでの論文(Commentar, in Heusingers Zeitschrift für organische Physik)も知られている。1828年、ベーアは最初に脊索として説明、 彼は脊椎動物と共通の特徴を述べた: 「この列は、軸の周りの胚における最初の一部を形成するだけでなく、また本体全体とすべて主要な系列の実際規模」 (so Baer 1828) 。この概念化構造は、目ざましくより多く実りある考えに人間の系統群関係の拡大を意味した。 ベーアは発生学的研究、2巻にわたる研究論文『"Über Entwickelungsgeschichte der Thiere"』(1828/1837)を発表した、 1876年、英国の訃報で、19世紀で最も重要な生物学の著作だったことを認めた。 ベーアは、一般的な具体的特性値の増々の発展を動物および人間における胚発生 () (Baer-Regel)が、哺乳動物と鳥類に加えて、
さらに爬虫類、両生動物、魚類および無脊椎動物でそれを示した。脊椎動物の特性に、最初に鳥、ひよこ鳥、そして最後に飼い鶏で、胚に関して示された。それはローレンツ・オーケン、ヨハン・フリードリヒ・メッケルその他多数が示されたように、分化増加のこの法則は、反復発生の認識に厳密に対照的である。異なる動物群の間の発展段階に対応、始めからすでに脊椎動物は、脊椎(すなわち脊索の登場)として出現する。たとえば、虫構造や軟体動物等は決して脊椎動物として示され無い。ベーアはのちにエルンスト・ヘッケルが発展させた生物発生原則によって、反復発生仮説の強い批判(vor allem im 5. Scholion der Entwicklungsgeschichte, 1. Bd.)にさらされた。