学部
医学部、歯学部、薬学部、獣医学部といった医学系の学部では教育期間は6年間となる。1・2年次は教養科目、3・4年次は専門科目というのは基本的に他の学部と同じである（近年の医学知識増加に対応して、一部の大学では1年時から専門科目を学び始める）。5・6年次には臨床の場での経験によって、より専門的な知識を身に付けると同時に、6年次には資格を得るのに必要な国家試験の対策にも勤しむこととなる。
さらに医学部、歯学部では資格を得た後に研修医として研修が医師法・歯科医師法によって義務付けられている。
日本の学校教育法以下においては、学部（学部以外の教育研究上の基本となる組織を含む）と、研究科（研究科以外の教育研究上の基本となる組織を含む）の双方については、個別に扱っている。しかし、現実的には独立研究科を除き、一体に教育研究が行われている。
進学課程 (医歯学部)
のちに文部省は方針を変更し、大学予科（旧制）や理学部乙（新制）の短期大学への切り替えを求めず、医学・歯学部進学課程の名称で修業年限を2年とする大学の設置を認めて進学課程に切り替わった。この制度改正の結果、2年制進学課程修了者は自動的に4年制専門課程へ進級することで医学部および歯学部は6年連続制となり、一般教養教育等を担当する教養部が医学・歯学進学課程の教育を担当する大学もあらわれた。東京大学は1962年から自動的に医学部に進学できる理科三類を設置したが、修了者が出る1963年までは理学部等の大学2年修了・卒業者を対象とする医学部入試を行い、のちに理科二類から進路振り分けによって10名程度を受け入れた。京都大学は1963年まで進学課程と大学2年修了者を対象とする医学部入試制度が並存した。