エキソソーム複合体
真核細胞ではこれらの9個のユニットに加え、さらに2個のユニットが付随することが多い。その内の一つがRNase Rファミリーに属する加水分解リボヌクレアーゼRrp44である。Rrp44はエキソリボヌクレアーゼ、エンドリボヌクレアーゼ双方の活性を持つが、その機能はRrp44内の別々のドメインが担当する。酵母では、Rrp44は全てのエキソソーム複合体に付随しており、その活性に重要である。ヒト細胞にもこのタンパク質ホモログが存在するにもかかわらず、長い間それがヒトエキソソーム複合体に付随するという証拠は得られなかった。2010年になって、ヒトのRrp44ホモログが3つ発見され、そのうち2つが複合体に付随することが分かった。その内1つ(Dis3L1)は細胞質に、1つ(Dis3)は核に局在するため、 異なったRNA基質を分解する。
2つ目のタンパクは、酵母では"Rrp6"、ヒトでは"PM/Scl-100"とよばれる。Rrp44と同じく加水分解性エキソリボヌクレアーゼだが、このタンパクはRNase Dファミリーに属する。PM/Scl-100は核エキソソームの一部だが、細胞質エキソソームの構成要素とも成り得る。
細胞外高分子物質
菌体外多糖（きんたいがいたとう、エキソポリサッカライド、Exopolysaccharides）とは、微生物によって環境へと分泌され、かつ、糖残基を含む高分子量の重合体である。微生物は、細胞内多糖類や構造多糖類および細胞外多糖または菌体外多糖（EPS）を含む広いスペクトルの多機能多糖類を合成する。菌体外多糖は一般に、単糖類と非炭水化物の置換基（酢酸、ピルビン酸、コハク酸、リン酸など）で構成されている。組成が非常に多様であるため、菌体外多糖は食品業界や医薬品業界の様々な場面で多種多様に用いられている。多くの微生物のEPSは、現在使用されているゴムとほぼ同じ特性を有する。伝統的に使用される植物や藻類のゴムに置き換える計画がある。 また、新規産業的な意義を持つ新たな微生物EPSの発見と開発により著しく進歩している。