自由席
しかし、これは1965年までは異例の措置であり、それまでは全車両座席指定であった（東海道新幹線も1964年の開業当時は全列車が全車指定席であった）。現在でも、特別急行料金には座席指定が含まれており、自由席用には自由席特別急行料金が別に設定されている。
シーサイドライナー (列車)
普通車のみの編成で、指定席が1両、自由席が3両であった。指定席は当初長崎寄りの先頭車（1号車）であったが、後に佐世保寄りの先頭車（4号車）に変更されている。車端部には展望席が設けられているが、「シーボルト」ではこの席は自由席扱いとされていた。