久保田藩
秋田・仙北地方は、戦国期には秋田氏・戸沢氏・六郷氏・小野寺氏などが治めていたが、関ヶ原の戦い後の慶長7年（1602年）に小野寺氏は改易、他は多くが常陸国へ転封となり、代わって佐竹氏が入封する事により近世大名支配が始まった。久保田入封以前の佐竹氏は常陸一国54万石の大身大名であったが、久保田藩の表高は当初明示されず、60年以上経った寛文4年（1664年）に計20万5,800石と決定された。そのため、常陸以来の膨大な家臣団を抱えて財政は慢性的に苦しい状態が続き、宝暦4年の藩札発行に起因する佐竹騒動を初め政の混乱や領民の一揆が多発した。
亀田藩
寛永5年（1628年）に吉隆が佐竹家の養子に入ったため、叔父の岩城但馬守宣隆（多賀谷宣家から改名）が2代藩主となって岩城家を継いだ。以降4代藩主岩城伊予守秀隆までは、佐竹家の男系血統であった。佐竹家は岩城家転封後の亀田藩の検地・城下建設などを全面的に支援したが、久保田藩で制定したキリシタン取締などの諸法度を亀田藩に対しても適用するなど、藩経営が安定してからも藩政への介入を続けたため、独立した大名であるにも関わらず実質的に支藩扱いを受けているとして、様々な争いが起きている。特に、久保田藩において年貢米輸送など水運の大幹線であった雄物川に、一部亀田藩領を通過する区間があり（現在の秋田市雄和新波・雄和向野）、亀田藩が川船に課税しようとした際は、激しい対立が起こった（大正寺論争）。これらに伴い、次第に亀田藩と久保田藩の間には相互不信が募っていくようになった。