Yerusalem
Baik orang Israel maupun Palestina mengklaim Yerusalem sebagai ibu kota mereka, sebab Israel mempertahankan lembaga-lembaga pemerintahan utamanya di sana dan Negara Palestina pada dasarnya memandang kota ini sebagai pusat kekuasaannya; bagaimanapun kedua klaim tersebut tidak ada satupun yang mendapat pengakuan luas secara internasional. Namun hingga kini pengelolaan kota Yerusalem dilakukan oleh Israel. Palestina, di sisi lain, memiliki tujuan untuk menjadikan Yerusalem Timur sebagai ibukota.
Sikhem
Sikhem (Sichem, Shkhem atau ShachmuSh-chea-mm, Ibrani: שְׁכֶם‎ / שְׁכָם, ' '; "Bahu", Tell Balatah (Balata al-Balad) modern, Tepi Barat, Kota Salim saat ini dan 2 km timur Nablus saat ini) adalah kota Kanaan yang disebutkan dalam Surat Amarna, dan kemudian menjadi kota Israel dalam wilayah suku Manasye. Sikhem merupakan ibukota pertama Kerajaan Israel.