Dinasti Qing
Setelah kekalahan Tiongkok dalam perang Tiongkok-Jepang (1894-1895) Kaisar Guangxu (memerintah 1875 - 1908) akhirnya memutuskan untuk melakukan pembaharuan / reformasi. Reformasi Seratus Hari tahun 1898 yang disokong oleh kaisar Guangxu banyak ditentang oleh kalangan konservatif. Dibawah pimpinan Ibu Suri Cixi (janda kaisar Xianfeng, ibu angkat kaisar Guangxu), mereka mengadakan kudeta yang mengakibatkan dilucutinya kekuasaan kaisar Guangxu. Yuan Shikai, panglima militer yang tadinya diminta bantuan militernya oleh Kaisar Guangxu, memilih untuk memihak Ibu Suri Cixi sehingga menimbulkan dendam yang dalam pada kaisar Guangxu terhadapnya. Mulai saat itu, Ibu Suri Cixi yang sudah berhenti menjadi wali kaisar Guangxu kembali berkuasa dan reformasi pun terhenti. Pada tahun 1901 Ibu Suri Cixi mendukung pemberontakan Boxer untuk mengusir bangsa barat dan menyatakan perang terhadap 8 negara asing. Gabungan delapan negara berhasil merebut Beijing sehingga Ibu Suri dan Kaisar dan keluarga kerajaan harus lari ke Xi'an. Walaupun gabungan delapan negara pada awalnya menghendaki Ibu Suri Cixi dihukum mati, berkat diplomasi dari Li Hongzhang (panglima tentara Beiyang, yang sepeninggalnya menyerahkan tentara Beiyang di bawah pimpinan Yuan Shikai) ia selamat walaupun Tiongkok harus membayar ganti rugi yang sangat besar. Sekembalinya ke Beijing, Ibu Suri Cixi akhirnya setuju dengan reformasi, walaupun terlambat. Pihak kekaisaran Qing mengumumkan bahwa kekaisaran akan secara bertahap diubah menjadi monarki konstitusional, namun pihak nasionalis menganggap pemerintah Qing tidak mempunyai itikad baik untuk mengimplementasikannya.
Dinasti Qing di Asia Dalam
Dari 1640 untuk 1724, bagian besar dari daerah yang sekarang Qinghai berada di bawah kendali Khoshut Mongol, yang secara nominal diakui mereka setia kepada dinasti Qing. Namun, setelah Dzungaria invasi yang berakhir Khoshut Khanate di Tibet dan selanjutnya Qing penaklukan dari Tibet pada tahun 1720, Atas Mongol yang dipimpin oleh penguasa pangeran Lubsan Danzaan di Qinghai memberontak terhadap dinasti Qing di bawah Kaisar Yongzheng tahun 1723. Lubsan Danzaan juga membuat kontak dengan Dzungaria Khanate di Xinjiang sebelum pemberontakan. 200,000 Tibet dan Mongol di Qinghai menyerang Xining, meskipun Tibet Tengah tidak mendukung pemberontakan. Bahkan, Polhanas yang berbasis di Tibet Tengah diblokir pemberontak mundur dari Qing pembalasan. Cina komandan seperti Nian Gengyao dikirim untuk menekan pemberontakan. Akhirnya pemberontakan itu secara brutal ditekan, yang ditandai timbulnya langsung Qing aturan di Qinghai. Lubsan Danzaan melarikan diri ke Urumqi Khanate dan kemudian ditangkap oleh orang Manchu pada tahun 1755 selama Qianlong Kaisar's kampanye ke Xinjiang. Sebagian besar yang hadir hari Qinghai diletakkan di bawah kendali Menteri Xining Penanganan Urusan (Cina: 西寧辦事大臣, juga dikenal sebagai Xining Amban) yang terletak di Xining pada tahun 1724 oleh Qing, meskipun Xining itu sendiri diatur oleh Gansu provinsi selama periode tersebut. Hal ini berlangsung sampai akhir dinasti Qing.