Pengeboman atom Hiroshima dan Nagasaki
Pada tanggal , sehari setelah Hiroshima dihancurkan, Dr. Yoshio Nishina dan fisikawan atom lainnya tiba di sana dan menilai kerusakan dengan hati-hati. Mereka kembali ke Tokyo dan memberitahu kabinet pemerintah bahwa Hiroshima dihancurkan oleh bom atom. Laksamana Soemu Toyoda, Kepala Staf Umum Angkatan Laut, memperkirakan bahwa hanya satu atau dua bom yang disiapkan Amerika Serikat. Mereka memutuskan untuk siap-siap diserang lagi: "Kehancuran akan terus berdatangan, namun perang akan terus berjalan." Pemecah sandi Magic dari Amerika Serikat merekam pesan kabinet tersebut.
Hanford Site
Dua reaktor identik, reaktor D Reaktor dan F, diluncurkan secara online pada bulan Desember 1944 dan Februari 1945. Pada bulan April 1945, pengiriman plutonium menuju ke Los Alamos setiap lima hari, dan Hanford segera menyediakan cukup bahan untuk bom yang diuji di Trinity dan menjatuhkan Nagasaki. Sepanjang periode ini, Proyek Manhattan mempertahankan klasifikasi rahasia. Sampai berita tiba dari bom tersebut dijatuhkan di Hiroshima, kurang dari satu persen pekerja Hanford tahu bahwa mereka sedang mengerjakan proyek senjata nuklir.Jenderal Groves mencatat dalam memoarnya bahwa "Kami memastikan bahwa setiap anggota proyek memahami sepenuhnya bagiannya dalam usaha total, dan tidak lebih dari itu."