Al-Jami' al-Aqsha
Selama berabad-abad, yang dimaksud dengan Masjid Al-Aqsha adalah keseluruhan kompleks tersebut, yang dianggap sebagai suatu wilayah yang suci. Perubahan penyebutan kemudian terjadi pada masa pemerintahan Kesultanan Utsmaniyah, di mana wilayah kompleks secara keseluruhan disebut sebagai "Al-Haram asy-Syarif"; sedangkan bangunan yang terletak di bagian selatan disebut sebagai Al-Jami' al-Aqsha, yaitu tempat Umar bin Khaththab pertama kali mendirikan masjid di antara reruntuhan. Hadits Imam Ahmad menyebutkan percakapan Umar bin Khattab dan Ka'ab al-Ahbar, di mana Ka'ab menyarankan untuk membangun masjid di belakang batu Ash-Shakhrah, sedangkan Umar menolak dan memilih tempat di sebelah selatan untuk membangun masjid dengan kiblat yang mengarah ke Ka'bah saja, sehingga posisi batu tersebut berada di belakangnya.
Al-Jami' al-Aqsha yang didirikan Umar bin Khattab tersebut, juga berbeda dengan Masjid Umar, yaitu sebuah masjid yang dibangun pada masa kekuasaan Dinasti Ayyubiyah pada abad ke-12, untuk mengenang pengambil-alihan Yerusalem oleh Umar bin Khattab yang mewakili umat Islam. Tradisi setempat menceritakan bahwa pada saat pengambil-alihan tersebut, Umar diundang oleh Patriark Sophonius untuk beribadah di dalam Gereja Makam Kudus, namun Umar memilih mengerjakan salat di luar, di dekat pintu masuk gereja. Masjid Umar terletak bersebrangan dengan Gereja Makam Kudus, di luar kompleks Masjid Al-Aqsha.
Gerbang Emas (Yerusalem)
Gerbang ini terletak di bagian sepertiga utara dari dinding timur Masjid Al-Aqsha. Bangunan gerbang yang sekarang ada ini mungkin dibangun di pada tahun 520-an Masehi, sebagai bagian dari program pembangunan Yustinianus I di Yerusalem, di atas reruntuhan gerbang pada tembok. Teori alternatif berpendapat bahwa gerbang itu dibangun pada akhir abad ke-7 oleh para pengrajin Bizantium yang dipekerjakan oleh Umayyah khalifs. Kekaisaran Ottoman Turki mengubah gerbang bertembok menjadi menara pengawas. Di lantai dasar suatu ruangan beratap dibagi oleh empat kolom ke dua lorong yang mengarah ke Pintu Rahmat, Bab al-Rahma, dan Pintu Taubat, Bab al-Taubah; ruangan di lantai atas memiliki dua atap kubah sebagai langit-langit.