Atom
Atom tidak memiliki batasan luar yang jelas, sehingga dimensi atom biasanya dideskripsikan sebagai jarak antara dua inti atom ketika dua atom bergabung bersama dalam ikatan kimia. Jari-jari ini bervariasi tergantung pada jenis atom, jenis ikatan yang terlibat, jumlah atom di sekitarnya, dan spin atom. Pada tabel periodik unsur-unsur, jari-jari atom akan cenderung meningkat seiring dengan meningkatnya periode (atas ke bawah). Sebaliknya jari-jari atom akan cenderung meningkat seiring dengan menurunnya nomor golongan (kanan ke kiri). Oleh karena itu, atom yang terkecil adalah helium dengan jari-jari 32 pm, manakala yang terbesar adalah sesium dengan jari-jari 225 pm. Dimensi ini ribuan kali lebih kecil daripada gelombang cahaya (400–700 nm), sehingga atom tidak dapat dilihat menggunakan mikroskop optik biasa. Namun, atom dapat dipantau menggunakan mikroskop gaya atom.
Jari-jari van der Waals
Volume van der Waals, "V", juga disebut volume atom atau volume molekul, adalah sifat atom yang paling langsung berhubungan dengan jari-jari van der Waals. Ia adalah volume "yang terisi" oleh atom sendiri (atau molekul). Volume van der Waals dapat dihitung jika jari-jari van der Waals (dan, untuk molekul, jarak dan sudut antaratom) diketahui. Untuk atom tunggal berbentuk bola, ini adalah volume bola yang jari-jarinya adalah jari-jari van der Waals dari atom tersebut: