Stasiun Jakarta Kota
Yang pertama, nama "Beos" mengacu pada nama stasiun Batavia BOS "Bataviasche Oosterspoorweg Maatschapij" (Maskapai Angkutan Kereta Api Batavia Timur), yang berada pada lokasi yang sama sebelum dibongkar. Perusahaan ini adalah sebuah perusahaan kereta api swasta yang menghubungkan Batavia dengan Kedunggedeh. Versi lain, "Beos" berasal dari kata "Batavia En Omstreken", yang artinya "Batavia dan Sekitarnya", yang berasal dari fungsi stasiun sebagai pusat transportasi kereta api yang menghubungkan Kota Batavia dengan kota lain seperti "Bekassie" (Bekasi), "Buitenzorg" (Bogor), "Parijs van Java" (Bandung), "Karavam" (Karawang), dan lain-lain.
Jalur kereta api lintas Jakarta
Pembangunan jalur kereta api lainnya juga dilakukan oleh Bataviasche Oosterspoorweg Maatschappij (BOSM). BOSM adalah perusahaan kereta api swasta dan mendapat konsesi izin pembangunan jalur kereta api di lintas Batavia Timur. BOSM membangun segmen jalur kereta api Batavia–Karawang yang mulai beroperasi pada tahun 1887. Untuk menunjang operasional, BOSM mempunyai stasiun sendiri di Batavia, namanya Batavia BOSM.