Glikolisis
Di dalam usus, pemotongan karbohidrat dilakukan dengan bantuan enzim α-amilase. Enzim ini dihasilkan di pankreas dan memiliki aktivitas yang sama dengan enzim amilase yang ada di mulut. Secara garis besar, enzim ini akan memecah disakarida dan oligosakarida menjadi monosakarida. Enzim lain yang turut membantu pemecahan molekul kompleks karbohidrat di usus adalah maltase, sukrase, laktase, dan trehelase. Hasil dari pemotongan enzim-enzim ini adalah molekul karbohidrat sederhana (monosakarida), seperti glukosa. Senyawa ini kemudian diedarkan ke seluruh tubuh dan akan dikonversi menjadi asam lemak, asam amino, glikogen, dan lain-lain.
Proteolisis
Proteolisis adalah pemecahan protein menjadi polipeptida atau asam amino yang lebih kecil. Jika tidak dikatalis, hidrolisis ikatan peptida berlangsung sangat lambat dan bisa memakan ratusan tahun. Proteolisis biasanya dikatalis oleh enzim seluler yang disebut protease, tetapi bisa juga terjadi melalui pencernaan intra-molekuler. pH yang rendah atau suhu yang tinggi juga dapat mengakibatkan proteolisis tanpa memerlukan enzim.