Museum Keraton Yogyakarta
Keraton Yogyakarta yang terletak di tengah kota Yogyakarta ini memiliki beberapa museum, yaitu Museum Lukisan, Museum Sri Sultan Hamengkubuwono IX, Museum Kereta, dan Museum Batik. Di samping itu, hampir seluruh bagian kraton digunakan sebagai tempat penyimpanan benda-benda budaya bernilai, termasuk replikanya. Di kompleks Pagelaran, misalnya, diperagakan berbagai pakaian prajurit dan pakaian adat keluarga keraton.
Museum ini dibuka untuk umum setiap hari kecuali pada saat terdapat upacara. Museum buka mulai jam 08.30 hingga 14.00 wib, kecuali hari Jumat yang buka hingga pukul 13.00 wib. Selain benda-benda budaya dan arsitektur, pengunjung juga dapat melihat pertunjukan seperti macapat, kerawitan, wayang kulit, serta wayang orang, yang dipentaskan di bangsal Sri Manganti, sekitar pukul 10.00-12.00.
Museum Istana Kepresidenan Yogyakarta
Museum Istana Kepresidenan Yogyakarta adalah sebuah museum yang terletak di Jalan Ahmad Yani, Ngupasan, Gondomanan, Kota Yogyakarta. Museum ini berada di ujung selatan kawasan pariwisata terkenal Malioboro dan di seberang Museum Benteng Vredeburg. Penduduk lokal menyebut museum ini dengan nama Gedung Agung. Di dalamnya terdapat beberapa bangunan yaitu gedung utama sebagai tempat pelantikan Gubernur dan Wakil Gubernur DIY serta acara resmi lainnya. Selain itu, terdapat juga beberapa wisma sebagai tempat penginapan tamu-tamu penting antara lain Wisma Negara, Wisma Sawojajar, Wisma Indraprasta, dan Wisma Saptapratala. Museum terbuka untuk umum pada hari Senin sampai Kamis. Pengunjung memasuki museum melalui pintu utara Gedung Agung lalu melewati pos pemeriksaan keamanan. Tidak terdapat pungutan biaya masuk, hanya saja pengunjung perlu melakukan reservasi terlebih dahulu.