Hipotesis OPV AIDS
Menurut hipotesis oral polio vaccine (OPVA) AIDS, pandemik AIDS berasal dari vaksin polio hidup yang disiapkan pada jaringan simpanse yang kemudian diberikan kepada lebih dari satu juta orang Afrika antara tahun 1957 hingga 1960. Populasi tersebut merupakan populasi pertama di dunia yang mengalami infeksi HIV-1 dan AIDS 5 tahun kemudian. Vaksin oral eksperimen, yang disebut CHAT-1, diklaim terkontaminasi simian immunodeficiency virus (SIV), grup virus yang endemik terhadap primata Afrika yang kemudian diterima oleh kalangan luas sebagai sumber dari HIV.
HIV
Apabila beberapa virus HIV dengan subtipe yang berbeda menginfeksi satu individu yang sama, maka akan terjadi bentuk rekombinan sirkulasi "(circulating recombinant forms" - CRF) (). Bagian dari genom beberapa subtipe HIV yang berbeda akan bergabung dan membentuk satu genom utuh yang baru. Bentuk rekombinan yang pertama kali ditemukan adalah rekombinan AG dari Afrika tengah dan barat, kemudian rekombinan AGI dari Yunani dan Siprus, kemudian rekombinan AB dari Rusia dan AE dari Asia tenggara. Dari seluruh infeksi HIV yang terjadi di dunia, sebanyak 47% kasus disebabkan oleh subtipe C, 27% berupa CRF02_AG, 12,3% berupa subtipe B, 5.3% adalah subtipe D dan 3.2% merupakan CRF AE, sedangkan sisanya berasal dari subtipe dan CRF lain.