Hipotesis OPV AIDS
Menurut hipotesis oral polio vaccine (OPVA) AIDS, pandemik AIDS berasal dari vaksin polio hidup yang disiapkan pada jaringan simpanse yang kemudian diberikan kepada lebih dari satu juta orang Afrika antara tahun 1957 hingga 1960. Populasi tersebut merupakan populasi pertama di dunia yang mengalami infeksi HIV-1 dan AIDS 5 tahun kemudian. Vaksin oral eksperimen, yang disebut CHAT-1, diklaim terkontaminasi simian immunodeficiency virus (SIV), grup virus yang endemik terhadap primata Afrika yang kemudian diterima oleh kalangan luas sebagai sumber dari HIV.
Kontroversi vaksin MMR
Pada tahun 2012, Cochrane Library menerbitkan tinjauan terhadap puluhan penelitian ilmiah yang melibatkan kurang lebih 14.700.00 anak. Mereka tidak menemukan bukti kredibel adanya kaitan MMR dengan autisme atau penyakit Crohn. Para penulisnya menyatakan, "susunan dan pelaporan hasil keamanan dalam penelitian vaksin MMR, baik pra- dan pasca-pemasaran, sangat tidak memadai". Meta-analisis bulan Juni 2014 yang melibatkan lebih dari 1,25 juta anak menemukan bahwa "vaksinasi tidak berkaitan dengan perkembangan autisme atau gangguan spektrum autisme. Selain itu, komponen vaksin (thimerosal atau merkuri) atau vaksin gabungan (MMR) tidak berkaitan dengan perkembangan autisme atau gangguan spektrum autisme." Pada Juli 2014, sebuah tinjauan sistematis menemukan "bukti kuat bahwa vaksin MMR tidak berkaitan dengan autisme".