DNAFET
Transistor Efek-Medan DNA (DNAFET) adalah sebuah transistor efek-medan yang menggunakan efek-medan yang disebabkan oleh sebagian muatan molekul DNA untuk untuk membuatnya menjadi biosensor. Struktur DNAFET serupa dengan MOSFET dengan lapisan gerbang digantikan dengan molekul salah satu pilinan DNA untuk membuatnya menjadi reseptor permukaan. Ketika pilinan DNA komplementer berinteraksi dengan reseptor, penyebaran muatan didekat permukaan berubah, sehingga mengubah aliran arus yang melalui kanal semikonduktor.
Larikan DNAFET dapat digunakan untuk mendeteksi single nucleotide polymorphism dan untuk DNA sequencing. Kelebihan utama peranti ini daripada metode deteksi optik yang sering digunakan sekarang adalah kerjanya yang malar dan hampir tepat waktu. DNAFET sangat selektif karena hanya pilinan DNA tertentu yang dapat berinteraksi dengan lapisan reseptor.
Pengurutan DNA
Pada metode yang asli, urutan nukleotida DNA tertentu dapat disimpulkan dengan membuat secara paralel empat reaksi perpanjangan rantai menggunakan salah satu dari empat jenis basa pemutus rantai pada masing-masing reaksi. Fragmen-fragmen DNA yang kemudian terbentuk dideteksi dengan menandai ("labelling") "primer" yang digunakan dengan fosfor radioaktif sebelum reaksi sekuensing dilangsungkan. Keempat hasil reaksi tersebut kemudian dielektroforesis pada empat lajur yang saling bersebelahan pada gel poliakrilamida.
Hasil pengembangan metode ini menggunakan empat macam "primer" yang ditandai dengan pewarna berpendar ("fluorescent dye"). Hal ini memiliki kelebihan karena tidak menggunakan bahan radioaktif; selain menambah keamanan dan kecepatan, keempat hasil reaksi dapat dicampur dan dielektroforesis pada satu lajur pada gel. Metode ini dikenal sebagai metode "dye primer sequencing".