Operasi Downfall
Berbeda halnya dengan medan perang Eropa selama Perang Dunia II, Sekutu selama Perang Pasifik memiliki lebih dari satu jabatan "Panglima Tertinggi". Komando pasukan Sekutu dibagi menurut kawasan. Pada tahun 1945, misalnya, Chester Nimitz adalah Panglima Tertinggi Sekutu Kawasan Samudra Pasifik ("Allied Commander-in-Chief"), sementara Douglas MacArthur adalah Panglima Tertinggi Sekutu ("Supreme Allied Commander") Kawasan Pasifik Barat Daya. Sekutu merasa perlu mengangkat seorang panglima yang bertanggung jawab atas invasi ke Jepang. Angkatan Laut Amerika Serikat menginginkan Nimitz sebagai panglima, sedangkan Angkatan Darat Amerika Serikat menjagokan MacArthur. Persaingan kedua angkatan begitu serius sehingga rencana invasi terancam batal. Pihak Angkatan Laut akhirnya sebagian mengalah, dan MacArthur dijadikan Panglima Tertinggi untuk semua pasukan Sekutu, dengan syarat hanya bila diperlukan.
Prancis Vichy
Partisipasi tambahan pasukan Perancis Bebas dalam operasi Suriah kontroversial di kalangan Sekutu. Itu meningkatkan prospek Perancis menembaki orang Perancis, menimbulkan kekhawatiran perang saudara. Selain itu, diyakini bahwa Perancis Bebas dicerca besar-besaran di kalangan militer Vichy, dan bahwa pasukan Vichy di Suriah cenderung melawan Inggris jika mereka tidak disertai oleh unsur-unsur Perancis Bebas. Namun demikian, de Gaulle meyakinkan Churchill untuk mengizinkan pasukannya berpartisipasi, meskipun de Gaulle dipaksa untuk menyetujui proklamasi bersama Inggris dan Perancis Bebas yang menjanjikan bahwa Suriah dan Lebanon akan menjadi sepenuhnya mandiri pada akhir perang.