Аль-Каида
ЦРУ подверглось критике за финансирование исламистских боевиков в Афганистане, поскольку из их состава впоследствии была создана Аль-Каида. Журналист и писатель, эксперт по исламскому терроризму писал в ответ на эту критику, что финансирование направлялось Гульбеддину Хекматияру, а будущий создатель и глава Аль-Каиды Усама бен Ладен на тот момент не представлял собой ничего серьёзного: его группировка едва превышала дюжину человек и сильно зависела от других исламистских организаций, таких как Египетский исламский джихад. В своей книге «„Аль-Каида“: Подлинная история радикального ислама» Берк утверждал, что:
Первое упоминание о чём-то, называвшемся «Аль-Каида», появилось в отчёте ЦРУ, составленном в 1996 г., упоминавшем, что приблизительно в 1985 г. бен Ладен… организовал Исламский Фронт Спасения, или «Аль-Каида», для поддержки моджахедов в Афганистане. Не ясно при этом, имел ли автор ввиду группу, действующую как «Аль-Каида» или называвшуюся «Аль-Каида»… Безусловно, никаких упоминаний «Аль-Каиды» нет в переписке между Госдепартаментом и его представителями в Пакистане.
Убийство Беназир Бхутто
В подтверждении своих слов пакистанские силовые структуры 29 декабря объявили о том, что за покушением на Бхутто стоит лидер пакистанского отделения движения «Талибан», связанный с «Аль-Каидой» Бейтулла Махсуд. «"За убийством стоит один из главарей „Аль-Каиды“ Байтулла Масуд. Разведка перехватила радиосообщение, посланное террористом. Он поздравлял своих сообщников с успешным проведением атаки"», — рассказал пресс-секретарь МВД Пакистана Джавед Икбаль Чима. Кроме того, на его пресс-конференции был показан видеоролик, который снял неназванный очевидец покушения на Бхутто. На экране видна рука с пистолетом, направленная в сторону Бхутто. Она несколько раз выстрелила в сторону женщины, прежде чем раздался взрыв. В ответ на это обвинение представитель группировки «Аль-Кайда» Маулви Омар сообщил, что «решительно отвергает» участие организации в теракте. Он объяснил, почему «Аль-Каида» не могла этого сделать: «У племенных жителей есть свои обычаи. Мы не атакуем женщин». На следующий день власти продемонстрировали снимки, на которых отчетливо видно, что в Бхутто стрелял молодой человек лет 25-ти в солнцезащитных очках. Он был одет по-европейски: в черный пиджак и белую рубашку. За его спиной стоял, как полагают, второй террорист, который и привел в действие взрывное устройство.