Московский метрополитен
Состоит из 14 линий (четыре из которых впоследствии соединятся попарно; две линии временно соединены сейчас, организационно работая как один маршрут) общей протяжённостью 381 км в двухпутном исчислении, без учёта монорельса и МЦК. В Московском метрополитене 223 действующие станции и одна законсервированная, 44 станции признаны объектами культурного наследия, а более 40 являются памятниками архитектуры.
Московская железная дорога
В 2017 году начат переход к полигонным технологиям управления перевозками; согласно новой конфигурации на сети РЖД будет 6 полигонов (Московский, Северо-Западный, Волжский, Южный, Урало-Сибирский и Восточный), МЖД образует отдельный полигон, тесно интегрированный с Северо-Западным.В структуру Московской железной дороги после реформы ОАО «РЖД» по состоянию на 2016 входят 15 региональных дирекций:
Функционируют Технологический центр управления пригородным пассажирским комплексом (с 18 июня 2012), Московский региональный центр безопасности, Диспетчерский центр управления перевозками, Ситуационный центр по принятию оперативных решений, Центр управления содержанием инфраструктуры (ЦУСИ) и его отделы мониторинга. Имеется Центр научно-технической информации и библиотек.