Vagrant Story
Главный герой Эшли может бегать, прыгать, забираться на уступы; для преодоления некоторых препятствий необходимо переносить или толкать размещённые в подземельях ящики и каменные блоки, что добавляет в игровой процесс элементы головоломок и платформера. Единожды решённые головоломки можно решать заново, повторно посещая комнату с головоломкой.
Vagrant Story
Большая часть действия "Vagrant Story" происходит в подземельях, разделённых на множество комнат. Управление героем осуществляется в режиме от третьего лица, но в режиме паузы можно осмотреть окружение в режиме от первого лица. Вся игра, включая модели персонажей, выполнена в трёхмерной графике. Передвижение происходит в режиме реального времени, в правом нижнем углу экрана показывается схематичная карта текущей локации.