Транскриптомные технологии
Транскрипто́мные техноло́гии () — методы, разработанные для изучения транскриптома (то есть совокупности всех РНК-транскриптов) организма. В состав транскриптома входят все транскрипты, которые присутствовали в клетке на момент . Исследуя транскриптом, можно установить, какие клеточные процессы были активны в тот или иной момент времени.
De novo сборка транскриптома
С развитием технологий секвенирования следующего поколения, получение фрагментов (ридов) стало на порядок дешевле, но размер фрагментов стал меньше. Для сборки из коротких прочтений было предложено использовать графы де Брёйна. Вершинами графа де Брёйна являются возможные "k"-меры (строки длины "k"), выделенные из исходных прочтений. Два "k"-мера, соединяются в графе ребром, если они являются префиксом и суффиксом "k+1"-мера, также представленного в исходных прочтениях. Ребром является "k+1"-мер.