Gereja Katolik Siro-Malankara
Pada 10 Februari 2005, Gereja Katolik Siro-Malankara ditingkatkan oleh Paus Yohanes Paulus II menjadi sebuah Gereja Keuskupan Agung Mayor, dengan mengangkat Uskup Agung Gereja ini menjadi Uskup Agung Mayor (disebut Katolikos oleh umat Katolik Siro-Malankara). Sebagai sebuah Gereja Keuskupan Agung Mayor, Gereja Siro-Malankara diberi status otonomi level tertinggi berdasarkan "Hukum Kanon Gereja-Gereja Timur", dipimpin oleh uskup agung mayor dan sinode umum yang beranggotakan seluruh uskup Gereja ini, serta tunduk pada pengawasan kepausan.
Gereja Katolik Siro-Malankara
Pada 1599, Uskup Agung Goa Aleixo de Menezes (1595-1617) memperhimpunkan Sinode Diamper dan memaksakan latinisasi atas Gereja Apostolik di India. Tindakan ini merupakan suatu serangan atas jati diri Gereja India. Akan tetapi ukhuwah masih terjalin sampai permulaan paruh kedua abad ke-17. Gereja Kristen St.Tomas sudah tidak tahan menerima penyangkalan atas otonominya. Penolakan awal perlahan-lahan menumbuhkan ketidakpuasan yang berakhir dengan pemberontakan pada 1653 yang dikenal sebagai Sumpah Salib Koonan. Demikianlah, Gereja umat Kristiani St. Tomas yang satu itu terbagi dua. Golongan mayoritas ragu memutuskan hubungan dengan Roma sehingga mereka tetap bersatu dengan Roma, namun di bawah hierarki Latin. Kelompok ini disebut Pazhayakûttukar, sedangkan golongan yang satunya lagi disebut Puthenkûttukar. Kelompok yang terakhir beberapa kali berusaha menjalin persekutuan dengan Roma tanpa melepaskan otonomi dan warisan ritualnya. Gagal menjalin kembali persekutuan dengan Roma, mereka akhirnya masuk dalam persekutuan dengan Gereja Suriah Yakobit di Antiokhia. Perkembangan ini bukanlah merupakan perlawanan terhadap Tahta Apostolik Roma, melainkan terhadap para misionaris Portugis dan kebijakan latinisasi mereka.