Kerusuhan Poso
Berbeda dengan milisi Islam, milisi Kristen sedikit sulit untuk diidentifikasi. Salah satu di antara beberapa kelompok milisi yang berhasil diidentifikasi adalah Brigade Manguni. Milisi ini berpusat di Manado, Sulawesi Utara dengan jumlah personel sekitar 700 orang. Dalam kerusuhan Poso, pasukan ini diduga berbasis di daerah Sepe dan Silanca, Lage. Brigade Manguni memiliki divisi di masing-masing daerah yang membawahi cabang satuan. Pada fase ketiga yang berlangsung pada bulan Mei 2000, muncul milisi dengan nama Laskar Kristus. Kelompok ini disebut-sebut terdiri dari tiga kelompok, yaitu pasukan Macan, pasukan Kelelawar, dan pasukan kipas ("sisiru").
Penyerangan bus Poso 2002
Pada 13 Juli 2002, serangan kedua terjadi di Jalan Raya Trans-Sulawesi saat sopir bus menemukan sebuah tas di tengah jalan dan meminta kondektur untuk memungutnya, memicu perangkat peledak: seorang pejalan kaki yang lewat dan berusia 18 tahun tewas, dan sedikitnya 4 orang terluka parah dalam ledakan itu Dalam serangan ketiga, pada 8 Agustus 2002, seorang turis Italia tewas dan setidaknya 4 warga Indonesia terluka ketika para penyerang tak dikenal menembakkan senjata otomatis ke bus lain.