Hutan suaka alam
Pertanian berpindah yang dilakukan oleh petani di Kalimantan dan Nusa Tenggara pada awalnya hanya menyentuh hutan sekunder, yaitu hutan yang tumbuh kembali setelah ditinggalkan petani sebelumnya. Hutan sekunder cenderung lebih mudah dibuka karena vegetasinya tidak lebat. Namun seiring dengan meningkatnya jumlah petani, maka hutan lindung dan suaka alam menjadi tujuan dari petani yang mempraktikan sistem budi daya tersebut. Hingga akhir tahun 1990an, 39.7% luas lahan pertanian berpindah berada dalam kawasan hutan lindung dan suaka alam.
Kebakaran bawah
Kebakaran bawah adalah kebakaran yang terjadi di bawah permukaan tanah yang terjadi pada lahan gambut. Di Indonesia kebakaran bawah ini umum terjadi di Kalimantan dan Sumatra bagian timur, terutama di kawasan perhutanan dengan lahan gambut. Kebakaran bawah susah untuk diketahui dan susah dipadamkan dengan metode biasa. Diperkirakan lebih dari 100 kasus kebakaran bawah yang masih berlangsung di Kalimantan dan bagian Timur Sumatra sejak 1997. Hal yang menyulitkan, tidak semua kebakaran mengeluarkan asap yang bisa dilihat tanpa peralatan khusus (Infra merah). Juga letak kebakaran bisa beberapa meter di bawah tanah, tanpa suplai oksigen. Kebakaran di bawah tanah ini adalah salah satu penyebab kebakaran hutan (di atas tanah) yang terjadi secara rutin/berulang kali tiap tahun pada saat musim kering.