Perang Ōnin
Selama perang berlangsung beratus-ratus ribu prajurit berkumpul ke ibu kota. Perang berlangsung berkepanjangan selama 11 tahun walaupun para jenderal yang awalnya memimpin perang sudah lebih tewas. Ōuchi Masahiro mau kembali ke Provinsi Suo setelah mendapat jaminan dari Hino Tomiko untuk dapat terus menguasai wilayah kekuasaannya.Kalangan bangsawan dan rakyat yang terusir dari kota Kyoto akibat Perang Ōnin membuka lahan baru di daerah sekitar Kyoto, seperti di Yamashina, Uji, Ōtsu, Nara, dan Sakai. Seusai Perang Ōnin (1479), kondisi lingkungan dan keamanan Kyoto menjadi sangat buruk, epidemi, kebakaran, perampokan, dan kerusuhan sering sekali terjadi. Ditambah dengan kepulangan para daimyo dan pengikutnya ke provinsi asal mereka, pembangunan kembali kota Kyoto berlangsung sangat lambat. Akibat musibah yang sering menimpa Kyoto, kaisar berulang kali mengubah nama zaman (Chōkyō, Entoku, Meiō).
Ashikaga Yoshihisa
Karena s"hōgun" Yoshimasa yang hampir berusia tiga puluh tahun tidak memiliki keturunan pada tahun 1464, dia mengangkat adik Ashikaga Yoshimi untuk menggantikannya. Namun, Yoshihisa lahir pada tahun berikutnya memulai perjuangan untuk suksesi antara saudara-saudara yang meletus ke dalam Perang Ōnin dimulai pada tahun 1467, awal periode Sengoku dalam sejarah Jepang. Di tengah permusuhan, Yoshimasa pensiun pada tahun 1473, melepaskan posisi Sei-i Taishōgun ke Yoshihisa.Beberapa peristiwa penting membentuk periode di mana Yoshihisa adalah "shōgun":Setelah perang Ōnin, Rokkaku Takayori, "daimyo" dari Provinsi Ōmi selatan, merebut tanah dan manor yang dimiliki oleh bangsawan dari istana kekaisaran, kuil, dan tempat pemujaan. Pada 1487, Yoshihisa memimpin kampanye (Rokkaku Tobatsu) melawan Takayori tetapi meninggal secara tak terduga, tanpa meninggalkan pewaris.