Pendudukan Indonesia di Timor Timur
Setelah pemungutan suara tahun 1999 untuk memilih kemerdekaan, kelompok paramiliter yang bekerja dengan militer Indonesia melakukan gelombang kekerasan di mana sebagian besar infrastruktur di Timor Timur hancur. Pasukan Internasional yang dipimpin oleh Australia di Timor Timor bertugas untuk memulihkan ketertiban. Setelah kepergian pasukan Indonesia dari Timor Timur, Pemerintahan Transisi Perserikatan Bangsa-Bangsa di Timor Timur mengelola wilayah tersebut selama dua tahun, membentuk Unit Kejahatan Berat untuk menyelidiki dan mengadili kejahatan yang dilakukan pada tahun 1999. Karena pengadilan Indonesia mengeluarkan pernyataan yang terbatas atas keterlibatan Indonesia di Timor Timur, banyak pengamat meminta pengadilan internasional untuk Timor Timur.
Kepulauan Hindia Timur
Lima negara memiliki zona ekonomi eksklusif (ZEE) yang mencakup satu atau beberapa laut milik sejumlah negara. Selain Laut Sulu, ZEE Filipina dan Malaysia juga meluas hingga Laut Sulawesi. ZEE Timor Timur sepenuhnya berada di Laut Sawu, Banda, dan Timor. ZEE Australia meluas hingga Laut Timor dan Arafura. ZEE Papua Nugini meluas hingga Laut Arafura dari pesisir ujung barat dayanya.