Perang Ōnin
Selama perang berlangsung beratus-ratus ribu prajurit berkumpul ke ibu kota. Perang berlangsung berkepanjangan selama 11 tahun walaupun para jenderal yang awalnya memimpin perang sudah lebih tewas. Ōuchi Masahiro mau kembali ke Provinsi Suo setelah mendapat jaminan dari Hino Tomiko untuk dapat terus menguasai wilayah kekuasaannya.Kalangan bangsawan dan rakyat yang terusir dari kota Kyoto akibat Perang Ōnin membuka lahan baru di daerah sekitar Kyoto, seperti di Yamashina, Uji, Ōtsu, Nara, dan Sakai. Seusai Perang Ōnin (1479), kondisi lingkungan dan keamanan Kyoto menjadi sangat buruk, epidemi, kebakaran, perampokan, dan kerusuhan sering sekali terjadi. Ditambah dengan kepulangan para daimyo dan pengikutnya ke provinsi asal mereka, pembangunan kembali kota Kyoto berlangsung sangat lambat. Akibat musibah yang sering menimpa Kyoto, kaisar berulang kali mengubah nama zaman (Chōkyō, Entoku, Meiō).
Onna-bugeisha
Pada tahun 1868, selama Pertempuran Aizu, bagian dari Perang Boshin, Nakano Takeko, anggota klan Aizu, direkrut untuk menjadi pemimpin korps perempuan yang bertempur melawan serangan gencar 20.000 tentara Angkatan Darat Kekaisaran Jepang dari Domain Ōgaki. Sangat terampil di naginata, Takeko dan korpsnya sekitar 20 bergabung dengan 3000 samurai Aizu lainnya dalam pertempuran. Hōkai-ji di Aizubange, provinsi Fukushima berisi monumen yang didirikan untuk menghormatinya. Kurang dirayakan tetapi tidak kalah luar biasa akan menjadi upaya Yamamoto Yaeko, yang bertugas sebagai seorang tentara meriam yang membela Puri Aizuwakamatsu selama Pertempuran Aizu. Dia kemudian akan menjadi salah satu pemimpin sipil pertama untuk hak-hak wanita di Jepang.