Kerusuhan Poso
Berbeda dengan milisi Islam, milisi Kristen sedikit sulit untuk diidentifikasi. Salah satu di antara beberapa kelompok milisi yang berhasil diidentifikasi adalah Brigade Manguni. Milisi ini berpusat di Manado, Sulawesi Utara dengan jumlah personel sekitar 700 orang. Dalam kerusuhan Poso, pasukan ini diduga berbasis di daerah Sepe dan Silanca, Lage. Brigade Manguni memiliki divisi di masing-masing daerah yang membawahi cabang satuan. Pada fase ketiga yang berlangsung pada bulan Mei 2000, muncul milisi dengan nama Laskar Kristus. Kelompok ini disebut-sebut terdiri dari tiga kelompok, yaitu pasukan Macan, pasukan Kelelawar, dan pasukan kipas ("sisiru").
Operasi Camar Maleo
Operasi Camar Maleo adalah operasi yang dilancarkan oleh Tentara Nasional Indonesia (TNI) dan Kepolisian Negara Republik Indonesia (Polri) pada awal tahun 2015 untuk menangkap kelompok teroris Santoso yang bersembunyi di wilayah pegunungan di Kabupaten Poso, Sulawesi Tengah. Operasi ini dilaksanakan secara bergelombang, dan Operasi Camar Maleo IV dimaksudkan sebagai operasi pamungkas. Operasi ini berhasil menangkan sekitar 28 anggota kelompok Santoso (termasuk dua orang pimpinan). Namun, operasi ini gagal menangkap Santoso. Operasi Camar Maleo kemudian digantikan oleh Operasi Tinombala pada tahun 2016.