Perang Ōnin
Selama perang berlangsung beratus-ratus ribu prajurit berkumpul ke ibu kota. Perang berlangsung berkepanjangan selama 11 tahun walaupun para jenderal yang awalnya memimpin perang sudah lebih tewas. Ōuchi Masahiro mau kembali ke Provinsi Suo setelah mendapat jaminan dari Hino Tomiko untuk dapat terus menguasai wilayah kekuasaannya.Kalangan bangsawan dan rakyat yang terusir dari kota Kyoto akibat Perang Ōnin membuka lahan baru di daerah sekitar Kyoto, seperti di Yamashina, Uji, Ōtsu, Nara, dan Sakai. Seusai Perang Ōnin (1479), kondisi lingkungan dan keamanan Kyoto menjadi sangat buruk, epidemi, kebakaran, perampokan, dan kerusuhan sering sekali terjadi. Ditambah dengan kepulangan para daimyo dan pengikutnya ke provinsi asal mereka, pembangunan kembali kota Kyoto berlangsung sangat lambat. Akibat musibah yang sering menimpa Kyoto, kaisar berulang kali mengubah nama zaman (Chōkyō, Entoku, Meiō).
Panik 1857
Krisis ini dimulai pada September 1857 dan tidak berlangsung lama, tetapi ekonomi baru pulih hingga masa Perang Saudara Amerika pada tahun 1861. Tenggelamnya kapal akibat badai menjadi salah satu faktor pemicu Panik 1857, karena bank-bank di New York sedang menunggu pasokan emas yang benar-benar dibutuhkan. Bank-bank Amerika baru pulih setelah perang saudara. Setelah Ohio Life Insurance and Trust Company bangkrut, kepanikan menyebar dan bisnis-bisnis lain juga ikut bangkrut. Industri kereta api mengalami kemunduran dan ratusan orang dipecat.