Perang Ōnin
Selama perang berlangsung beratus-ratus ribu prajurit berkumpul ke ibu kota. Perang berlangsung berkepanjangan selama 11 tahun walaupun para jenderal yang awalnya memimpin perang sudah lebih tewas. Ōuchi Masahiro mau kembali ke Provinsi Suo setelah mendapat jaminan dari Hino Tomiko untuk dapat terus menguasai wilayah kekuasaannya.Kalangan bangsawan dan rakyat yang terusir dari kota Kyoto akibat Perang Ōnin membuka lahan baru di daerah sekitar Kyoto, seperti di Yamashina, Uji, Ōtsu, Nara, dan Sakai. Seusai Perang Ōnin (1479), kondisi lingkungan dan keamanan Kyoto menjadi sangat buruk, epidemi, kebakaran, perampokan, dan kerusuhan sering sekali terjadi. Ditambah dengan kepulangan para daimyo dan pengikutnya ke provinsi asal mereka, pembangunan kembali kota Kyoto berlangsung sangat lambat. Akibat musibah yang sering menimpa Kyoto, kaisar berulang kali mengubah nama zaman (Chōkyō, Entoku, Meiō).
Operasi PX
Setelah perang, Operasi PX pertama kali dibahas dalam sebuah wawancara dengan mantan kapten Eno Yoshio, yang sangat terlibat dengan perencanaan serangan, oleh koran Sankei pada tanggal 14 Agustus 1977. Menurut Yoshio, "Ini adalah pertama kalinya saya mengatakan semua tentang Operasi PX karena operasi ini terkait dengan aturan perang dan hukum internasional. Rencana itu tidak termasuk dalam operasi aktual, tapi saya merasa bahwa hanya fakta mengenai perencanaannya yang menyebabkan kesalahpahaman internasional. Saya bahkan belum pernah membocorkan apa pun pada staf dari arsip sejarah perang di Badan Pertahanan Jepang, dan saya tidak merasa nyaman membicarakan hal ini bahkan sampai sekarang. Tapi pada saat itu, Jepang kalah dengan kondisi sangat buruk dan segala cara untuk menang menjadi tidak masalah."