Kabupaten Manokwari
Cagar alam ini memiliki 147 species burung dan berbagai jenis flora dan fauna lainnya. Terletak di sepanjang Jaziriah Wasior 142.173,94 km dengan luas 73.022 ha. Dari cagar alam ini dapat dinikmati panorama alam Teluk Wandamen dan Teluk Cenderawasih yang sangat indah. Dapat dicapai dengan pesawat udara jenis Cessna dan Twin Otter waktu tempuh ± 20 menit dari kota Manokwari. Bentuknya unik dibangun di atas tiang-tiang penyangga yang sangat banyak sehingga dinamakan rumah seribu kaki. Dindingnya terbuat dari kulit kayu sedangkan atapnya dari daun pandan penghuninya terdiri dari 4 sampai 5 keluarga (25-30 orang). Rumah-rumah tradisional Suku Arfak ini di pedalaman Manokwari, Kecamatan Kebar, Anggi dan Merday.
Subwilayah Mekong Raya
Ragam geografis wilayah dan berbagai zona iklim mendukung keanekaragaman hayati yang signifikan, dengan lebih dari seribu spesies baru ditemukan pada dekade pertama tahun 2000-an. Wilayah geografis ini merangkum 16 dari kawasan ekologi global WWF, dan merupakan habitat bagi sekitar 20.000 jenis tumbuhan, 1.300 spesies ikan, 1.200 spesies burung, 800 spesies reptil dan amfibi, serta 430 spesies mamalia. Spesies penting di wilayah ini termasuk badak jawa, pesut dan patin raksasa mekong (salah satu ikan air tawar terbesar).