Pertempuran Sekigahara
Pemerintah Toyotomi yang berhasil menjadi pemersatu Jepang menyangkal keberadaan pertentangan tajam antara faksi bersenjata bentukan pemerintah dan pihak birokrat yang terdiri dari pejabat tinggi pengatur kegiatan beragama, ekonomi dan pemerintahan. Faksi bersenjata terdiri dari komandan militer pro klan Toyotomi yang pernah diturunkan di garis depan perang penaklukan Joseon. Bentrokan langsung antar faksi bersenjata dan pihak birokrat dapat dicegah oleh Toyotomi Hideyoshi dan adik kandungnya yang bernama Toyotomi Hidenaga.
Klan Minamoto
Klan ini keturunan Pangeran Mochihito atau Pangeran Takakura (putra kedua kaisar ke-77, Kaisar Go-Shirakawa). Pangeran Mochihito memiliki adik laki-laki lain ibu. Adiknya ini bernama Kaisar Takakura dan dilahirkan dari ibu yang berasal dari klan Taira. Pangeran Mochihito menjadi tidak berhak atas tahta walaupun dirinya adalah putra mahkota karena pemerintahan dikuasai Taira no Kiyomori. Perlawanan terhadap klan Taira dilancarkan Pangeran Mochihito dengan dibantu Minamoto no Yorimasa, tetapi berakhir dengan tewasnya Pangeran Mochihito. Taira no Kiyomori merasa bersalah dan menutup-nutupi kejadian ini dengan memberikan nama klan Minamoto kepada Pangeran Mochihito. Setelah itu, Pangeran Mochihito yang berganti nama sebagai Minamoto no Mochimitsu diberitakan sedang menjalani hukuman buang.