Tarum
Tarum (dari bahasa Sunda), nila, atau indigo ("Indigofera", suku polong-polongan atau Fabaceae) merupakan tumbuhan penghasil warna biru alami. Orang Jawa menyebutnya sebagai "tom". Penggunaan zat pewarna pakaian ini terutama dilakukan dalam pembuatan batik atau tenun ikat tradisional dari Nusantara. Zat pewarna indigo, sebagai produk dari tumbuhan ini, juga merupakan komoditas dagang yang penting.
Padi
Kajian dengan bantuan teknik biologi molekular sekarang menunjukkan bahwa selain dua subspesies "O. sativa" yang utama, "indica" dan "japonica", terdapat pula subspesies minor tetapi bersifat adaptif tempatan, seperti "aus" (padi gogo dari Bangladesh), "royada" (padi pasang-surut/rawa dari Bangladesh), "ashina" (padi pasang-surut dari India), dan "aromatic" (padi wangi dari Asia Selatan dan Iran, termasuk padi basmati yang terkenal). Pengelompokan ini dilakukan menggunakan penanda RFLP dibantu dengan isozim. Kajian menggunakan penanda genetik SSR terhadap genom inti sel dan dua lokus pada genom kloroplas menunjukkan bahwa pembedaan "indica" dan "japonica" adalah mantap, tetapi "japonica" ternyata terbagi menjadi tiga kelompok khas: "temperate japonica" (""japonica" daerah sejuk" dari Cina, Korea, dan Jepang), "tropical japonica" (""japonica" daerah tropika" dari Nusantara), dan "aromatic". Subspesies "aus" merupakan kelompok yang terpisah.