Perburuan paus
Sejak penetapan moratorium oleh IWC, terjadi beberapa kasus penangkapan paus ilegal oleh negara-negara anggota IWC. Pada tahun 1994, IWC melaporkan bukti dari pengujian genetik daging dan lemak paus yang dijual di pasar terbuka di Jepang pada tahun 1993. Selain paus minke yang legal secara hukum untuk ditangkap, analisis menunjukkan bahwa sampel jaringan 10-25% berasal dari non minke, paus baleen, yang tidak diizinkan untuk ditangkap berdasarkan peraturan IWC. Penelitian lebih lanjut pada tahun 1995 dan 1996 menunjukkan penurunan jumlah yang signifikan bagi paus baleen non-minke menjadi 2,5%. Dalam sebuah makalah, secara terpisah Baker menyatakan bahwa banyak dari hewan-hewan ini menjadi gambaran bagaimana mereka tertangkap secara tidak sengaja oleh jebakan nelayan. Ia juga menyatakan bahwa pemantauan DNA daging paus diperlukan untuk melacak produk-produk dari paus secara memadai.
Paus-pilot sirip-pendek
Sifat paus-pilot sirip-pendek yang sangat sosial telah dimanfaatkan manusia untuk mendapatkan keuntungan dari spesies paus ini. Gerombolan paus digiring ke perairan dangkal atau ke pantai untuk dibantai. Di Samudera Pasifik, paus-pilot sirip-pendek telah diburu selama berabad-abad oleh para nelayan, untuk dipanen daging, lemak, dan minyaknya. Dalam periode 1985 hingga 1989, nelayan Jepang telah memburu 2.326 ekor paus-pilot sirip-pendek. Di kepulauan Karibia dan di Indonesia, paus ini biasa diburu secara langsung menggunakan tombak atau harpun. Pada abad ke-19, para pemburu paus dari benua Amerika memburu paus ini untuk melatih diri mereka dalam memburu paus sperma.