Ngô Đình Diệm
Setelah dibunuhnya Ngô Đình Diệm, AS dapat tetap memengaruhi pemerintahan Vietnam Selatan, membantu pemilihan para pejabat yang mendukung kebijakan-kebijakan AS. Di antara banyak orang yang tahu tentang situasi politik di sekitar kematiannya (1963), pembunuhan Ngô Đình Diệm dianggap sebagai momen politik yang menentukan yang, menurut sebagian orang, pelan-pelan menyebabkan kekalahan Perang Vietnam 12 tahun kemudian (1975), namun, menurut yang lainnya lagi, mencegah Vietnam Selatan direbut pihak komunis 10 tahun lebih awal karena Diệm telah memutuskan untuk menyerah kepada ambisi-ambisi invasi Ho Chi Minh. Akibat dari kuatnya kehadiran Amerika setelah pembunuhan Diệm, terjadilah pergolakan intern di antara para pemimpin Vietnam Selatan, sementara tentara menemukan diri mereka dipaksa untuk memilih antara kepentingan-kepentingan komunis dan kepentingan-kepentingan Amerika. Pembunuhan ini juga memperkuat upaya-upaya Vietnam Utara untuk melukiskan Vietnam Selatan sebagai pendukung kolonisasi.
Serangan kimia Huế
Komunike Bersama tak diterapkan dan keadaan masih merenggang, terutama setelah keluarga Ngô memerintahkan Pasukan Khusus Vietnam Selatan menyerang pagoda-pagoda Buddha di sepanjang negara tersebut pada 21 Agustus. AS mengecam serangan tersebut, dan mulai memutus bantuan kepada Pasukan Khusus, yang secara efektif merupakan tentara keluarga Ngô pribadi, selain program pemerintahan lainnya sangat diidentifikasikan dengan klan pemerintahan tersebut. Menganggap hal semacam itu sebagai lampu hijau, dan mengetahui bahwa AS tak terlibat dalam pertahanan Diệm, tentara melancarkan sebuah kudeta sukses pada bulan November, mengakibatkan pembunuhan presiden. Pelengseran Diệm mengakibatkan ketidakstabilan politik, karena serangkaian junta militer dilengserkan satu per satu. Ini berujung pada pengikisan dalam keadaan militer saat komunis Viet Cong membuat raihan substansial melawan ARVN, menjanjikan AS untuk menyerahkan ratusan ribu pasukan penyerang pada tahun 1965, memuncaki Perang Vietnam.