Kaum Quaker
Undang-Undang dasar koloni Penn memberikan kebebasan berhati nurani bagi semua. Maka, sewaktu kekerasan dianggap perlu demi tegaknya hukum dan ketertiban, sikap antiperang kaum Quaker menimbulkan masalah—yang kian meruncing. Pada mulanya, Penn menyepelekan masalah ini dengan mengangkat wakil-wakil non-Quaker yang ia katakan akan “berlaku keras terhadapa tetangga-tetangga kita bila perlu”. Pada tahun 1689, kemungkinan pecahnya perang dengan Perancis semakin merongrong prinsip-prinsip Quaker.
Quake
Satu-satunya protagonis yang bertahan dalam "Operation Counterstrike" adalah Ranger, yang harus maju, memulai masing-masing dari empat episode dari sebuah pangkalan militer manusia yang dikuasai, sebelum berjuang memasuki dimensi lain, menjangkau mereka melalui Slipgate atau setara dunia mereka yang lain. Setelah melewati Slipgate, tujuan utama Ranger adalah mengumpulkan empat rune ajaib dari empat dimensi Quake; Inilah kunci untuk menghentikan musuh yang kemudian ditemukan sebagai Shub-Niggurath dan mengakhiri invasi ke Bumi.