Ion
Jika suatu ion mengandung elektron bebas, ia disebut ion radikal. Seperti radikal tak bermuatan, ion radikal sangat reaktif. Ion poliatomik yang mengandung oksigen, seperti karbonat dan sulfat, disebut oksianion (). Ion molekular yang mengandung sekurang-kurangnya satu ikatan karbon-hidrogen disebut "ion organik". Jika muatan dalam ion organik secara formal terpusat pada suatu karbon, maka ia disebut "karbokation" (jika bermuatan positif) atau "karbanion" (jika bermuatan negatif).
Molekul
Sebuah molekul adalah gugusan yang secara elektris netral yang tersusun dari dua atau lebih atom yang saling berikatan melalui ikatan kimia. Molekul dibedakan dari ion berdasarkan ketiadaan muatan listrik. Namun, dalam fisika kuantum, kimia organik, dan biokimia, istilah "molekul" sering digunakan dengan agak longgar, juga digunakan untuk ion poliatomik.