Peperangan Utsmaniyah-Habsburg
Pada abad ke-16, Utsmaniyah menjadi ancaman besar terhadap bangsa-bangsa Eropa, dan kapal-kapal Barbary yang tunduk kepada Utsmaniyah menyapu daerah kekuasaan Republik Venesia di Yunani. Perang ini juga dipersulit dengan adanya Reformasi Protestan, pertikaian dinasti Habsburg dengan Perancis dan perang internal di negara-negara anggota Kekaisaran Romawi Suci. Selain itu, Kesultanan Utsmaniyah juga harus bersaing dengan Kekaisaran Persia dan Kesultanan Mameluk, yang keduanya akhirnya dikalahkan dan dijadikan wilayah Utsmaniyah.
Eyalet Morea
Warga Kristen Morea melawan Utsmaniyah dengan bantuan Rusia selama "Pemberontakan Orlov" pada tahun 1770. Namun, pemberontakan tersebut berhasil ditumpas secara kejam. Akibatnya, jumlah penduduk menurun selama waktu tersebut, sedangkan penduduk Muslim meningkat. Namun akhirnya, hak-hak istimewa diberikan kepada penduduk Katolik Ortodoks yang tertuang pada Perjanjian Kuchuk-Kainarji. Hak-hak khusus itu antara lain hak untuk berdagang di bawah bendera Rusia, yang menyebabkan penduduk lokal Yunani menikmati hasil perdagangan tersebut, ditambah dengan peningkatan kontak kebudayaan dengan Eropa Barat (Era Pencerahan Yunani Modern), dan terinspirasi oleh Revolusi Perancis, sehingga memicu Perang Kemerdekaan Yunani. Pemberontakan Morea awalnya ditumpas oleh Ibrahim Pasha dari Mesir pada tahun 1826. Namun, intervensi dari angkatan laut Britania, Perancis, dan Rusia dalam Pertempuran Navarino, memaksa pasukan Utsmaniyah dan Mesir untuk kabur dari Eyalet Morea pada 1 Oktober 1828. Akhirnya, Yunani merdeka dari Kekaisaran Utsmaniyah dengan adanya Perjanjian Adrianopel dan Eyalet Morea secara "de facto" bubar pada tahun 1829.