Perangkat lunak
Perangkat lunak atau peranti lunak (bahasa Inggris: "software") adalah istilah khusus untuk data yang diformat, dan disimpan secara digital, termasuk program komputer, dokumentasinya, dan berbagai informasi yang bisa dibaca, dan ditulis oleh komputer. Dengan kata lain, bagian sistem komputer yang tidak berwujud. Istilah ini menonjolkan perbedaan dengan perangkat keras komputer.
Biologi sistem
Sistems Biology Workbench (SWB) adalah sebuah kerangka peranti lunak ("framework software") yang berisi bermacam-macam "tools" biologi sistematik. "Tools" ini dapat berupa "tools" untuk membangun, menyunting, dan melihat jejaring biokimia, "tools" untuk simulasi, dan "tools" untuk melakukan impor terjemaham dari hasil pemodelan. Peranti lunak ini dapat dipakai untuk menerjemahkan satu komponen biologi sistematik ke komponen lainnya. Dengan adanya perangkat ini, ilmuwan tidak perlu lagi menggunakan berbagai peranti lunak untuk pemodelan, analisis, visualiasi, dan analisis data biologi sistematik.