Protestanisme
Pengikut gerakan Protestan menyebut pengelompokan gereja-gereja menurut doktrin-doktrin landasan mereka sebagai "denominasi". Mereka merupakan nama bagian-bagian berbeda dalam suatu "Gereja" yang utuh. Kaum Protestan menolak doktrin Gereja Katolik Roma sebagai satu-satunya gereja yang benar. Sejumlah denominasi Kristen lebih ketat dibanding yang lain dan ada dasar-dasar ortodoksi yang dipertentangkan di antara denominasi-denominasi tersebut. Denominasi individual juga bermunculan menurut perbedaan teologi yang kadang sangat tidak kentara. Banyak juga denominasi yang sekadar merupakan ekspresi kedaerahan atau etnis terhadap kepercayaan yang sama, yang mengakui lima "sola" sebagai prinsip dasar utama iman Kristen. Kelompok Non-denominasional juga dimasukkan ke dalam golongan Protestan. Karena semua faktor ini, penghitungan yang pasti tidak dimungkinkan, tetapi diperkirakan ada sekitar 33.000 denominasi Protestan.
Reservatum ecclesiasticum
Asas ini terus ditentang oleh kaum Protestan. Setelah Matthias menjadi Kaisar Romawi Suci yang baru, kanselirnya Melchior Klesl ingin membubarkan persekutuan-persekutuan agama (Uni Protestan dan Liga Katolik) dan menyatukan semua orang di bawah kendali kaisar. Majelis Uni Protestan di Rothenburg ob der Tauber pada Maret 1613 menanggapinya dengan menyatakan bahwa mereka tidak akan bubar selama Liga Katolik masih berdiri dan mereka juga ingin agar aspirasi-aspirasi mereka dipenuhi, termasuk pencabutan "".