Kereta api Parahyangan
KA Parahyangan melakukan perjalanan terakhir Gambir-Bandung pada 26 April 2010, ditarik oleh lokomotif CC201 99 (CC201 92 09). Pada 27 April 2010, setelah lebih kurang 39 tahun melayani koridor Bandung dan Jakarta, KA Parahyangan dihentikan operasinya. Sebagai gantinya, PT KA Daop II Bandung meluncurkan Kereta api Argo Parahyangan dengan jumlah lima dan enam gerbong. Kereta tersebut awalnya merupakan rangkaian Argo Gede yang dimodifikasi dengan menambah 1-2 gerbong kelas bisnis dari KA Parahyangan. Selain itu, sisa gerbong Parahyangan pun dialihkan pada kereta baru yaitu kereta api Malabar rute Bandung-Malang PP, yang diluncurkan pada 30 April 2010.
Kereta api Parahyangan menggunakan rangkaian kereta eksekutif dan bisnis milik Dipo Bandung yang mana kereta-kereta ini rata-rata merupakan buatan tahun 1960-an sampai dengan 1980-an, baik untuk kelas bisnis dan eksekutifnya. Normalnya, kereta ini membawa 2-3 kereta eksekutif (K1) dan 3-5 kereta bisnis (K2) ditambah dengan kereta makan (KM2) dan kereta pembangkit (BP). Namun seringkali kereta api ini justru membawa kereta makan dan pembangkit kelas bisnis (KMP2/MP2).
Rangkaian tersebut merupakan susunan normal, pada musim liburan seringkali kereta api ini membawa rangkaian yang lebih panjang.
Stasiun Cirebon Prujakan
Pada awalnya, stasiun ini hanya terdiri atas bangunan dengan kanopi pada emperan peron jalur 1 (seperti layaknya stasiun barang), sementara emplasemennya merupakan emplasemen terbuka tanpa adanya atap "overkapping". Pada bulan Juli 2011 stasiun ini direnovasi, ditinggikan peronnya, ditambahkan kanopi, serta ditambah jalurnya dari yang semula lima jalur menjadi sembilan jalur kereta api: empat jalur menuju Tegal-Pekalongan-Semarang-Surabaya (jalur 1-4) dengan jalur 2 dan 3 sebagai sepur lurus, empat jalur lagi menuju Purwokerto-Kroya-Yogyakarta-Solo (jalur 6-9) dengan jalur 7 dan 8 sebagai sepur lurus, dan satu jalur khusus untuk kereta api barang (jalur 5). Stasiun ini adalah salah satu dari stasiun kereta api di Indonesia yang menyediakan fasilitas pemesanan tiket sistem kendara lewat/lantatur ("drive-thru"), selain Stasiun Gambir.Sawunggalih Tambahan, tujuan Jakarta dan tujuan Kutoarjo (terkadang ditambahkan kelas eksekutif)
Berikut ini adalah jadwal kereta api penumpang yang berhenti di Stasiun Cirebon Prujakan per 20 Desember 2018 (revisi Gapeka 2017).