Peptida antimikrobial
Dalam kompetisi sel bakteri dan sel yang terinfeksi dengan peptida antimikrobial, peptida antimikrobial lebih memilih berinteraksi dengan sel bakteri dibandingkan dengan sel mamalia yang membuat mereka mampu membunuh mikroorganisme tanpa membuat kerusakan berarti pada sel mamalia. Selektivitas adalah sifat yang sangat penting dari peptida antimikrobial dan dapat menjamin fungsi kerja mereka. Sesungguhnya, peptida antimikrobial cukup beracun jika berinteraksi pada sel mamalia, namun dengan adanya sifat selektivitas merupakan keuntungan berarti bagi sel mamalia.
Pola molekuler terkait patogen
PAMP mengaktifkan respons imun bawaan, melindungi inang dari infeksi, dengan mengidentifikasi beberapa molekul "nonself" yang dilestarikan. Bakterial lipopolisakarida (LPS), suatu endotoksin yang ditemukan pada membran sel bakteri gram negatif, dianggap sebagai kelas prototipe PAMP. LPS secara khusus dikenali oleh TLR4, sebuah reseptor pengenalan sistem imun bawaan. PAMP lainnya termasuk bakteri flagellin (dikenali oleh TLR5 ), asam lipoteikoat dari bakteri gram positif (dikenali oleh TLR2), peptidoglikan (dikenali oleh TLR2), dan asam nukleat varian biasanya terkait dengan virus, seperti unting ganda RNA (dsRNA), dikenali oleh TLR3 atau motif CpG yang tidak termetilasi, dikenali oleh TLR9. Meskipun istilah "PAMP" relatif baru, konsep bahwa molekul yang berasal dari mikroba harus dideteksi oleh reseptor dari organisme multisel telah ada selama beberapa dekade, dan referensi ke "reseptor endotoksin" ditemukan dalam banyak literatur yang lebih tua.