Gereja Katolik Kaldea
Pada permulaan abad ke-20 para misionaris Gereja Ortodoks Rusia mendirikan dua keuskupan di Asiria Utara, dan banyak orang yang yakin bahwa orang-orang Rusia dapat lebih melindungi mereka daripada orang-orang Inggris dan Perancis. Dengan harapan akan dukungan orang-orang Rusia, Perang Dunia I dipandang sebagai waktu yang tepat untuk memberontak melawan Kerajaan Ottoman, yang dibalas dengan penyerangan atas orang-orang Asiria sebagai musuh militer. Pada 4 November 1914 Enver Pasha yang berkebangsaan Turki menyerukan Jihad, perang suci, melawan umat Kristiani. Kekalahan Rusia pada 1917 memupuskan harapan akan kemerdekaan politik. Seluruh Asiria Utara diserbu tentara Turki dan rakyat terpaksa mengungsi: banyak yang luput dari pembantaian akhirnya tewas karena kedinginan atau kelaparan. Bencana ini terutama mendera wilayah-wilayah Gereja Timur Asiria dan keuskupan-keuskupan Gereja Kaldea di Asiria Utara (Amid, Siirt dan Gazarta) hancur-lebur (dua orang Metropolitan Kaldea, Addai Scher dari Siirt dan Filipus Abraham dari Gazarta terbunuh pada 1915).
Nestorianisme
Gereja Timur Asiria menolak untuk menarik dukungan bagi Nestorius dan menolak untuk menyebutnya seorang bidaah, sehingga Gereja ini selanjutnya disebut "Gereja Nestorian" oleh Gereja Barat, untuk membedakannya dari Gereja-Gereja Timur kuno lainnya. Meskipun demikian, Gereja Timur Asiria sesungguhnya tidak menganggap doktrin Gerejanya adalah Nestorian, akan tetapi mengajarkan pandangan dari Babai Agung, bahwa Kristus memiliki dua "qnome" (esensi) yang tidak membaur dan manunggal abadi dalam satu "parsopa" (personalitas). Menurut beberapa interpretasi, asal mula keyakinan ini sebagian besar bersifat historis dan linguistik: sebagai contoh, Bahasa Yunani memiliki dua kata untuk 'pribadi', yang tidak diterjemahkan dengan tepat ke dalam Bahasa Syria, dan makna dari istilah-istilah tersebut bahkan tidak ditetapkan pada masa hidup Nestorius.