Kangin
Bulan Maret 2006, SM Entertainment merekrut anggota baru untuk generasi Super Junior berikutnya. Namun, terjadi perubahan rencana dan mengumumkan formasi tetap dari Super Junior. Bersamaan dengan ditambahkannya anggota ke-13 Kyuhyun, grup tersebut menghapuskan angka "05" dan secara resmi bernama Super Junior. Pada 7 Juni 2006, single pertama mereka "U" yang telah digubah ulang secara resmi dirilis, dan menjadi "single" tersukses mereka hingga dirilisnya "Sorry, Sorry" pada bulan Maret 2009.
Cho Kyuhyun
Kyuhyun menjadi bagian di beberapa sub-grup Super Junior antara lain Super Junior K.R.Y, SM The Ballad dan Super Junior M. Di Super Junior K.R.Y, Kyuhyun bersama Yesung dan Ryeowook membawakan lagu-lagu yang cenderung bergenre ballad dan menunjukkan kemampuan vokal mereka. Sementara di Super Junior M, genre lagu yang dibawakan tidak jauh berbeda dengan Super Junior, hanya saja berbahasa Mandarin. Kyuhyun menjadi salah satu dari 5 anggota asli Super Junior yang juga merupakan anggota Super Junior-M, bersama Hangeng, Siwon, Donghae, dan Ryeowook. Selain ikut bergabung dalam sub-grup Super Junior, Kyuhyun juga tergabung dalam S.M. The Ballad bersama artis SM lainnya mulai dari Jonghyun-Shinee, Jay-TRAX, dan Jino yang merupakan artis baru di SM.