Kangin
Bulan Maret 2006, SM Entertainment merekrut anggota baru untuk generasi Super Junior berikutnya. Namun, terjadi perubahan rencana dan mengumumkan formasi tetap dari Super Junior. Bersamaan dengan ditambahkannya anggota ke-13 Kyuhyun, grup tersebut menghapuskan angka "05" dan secara resmi bernama Super Junior. Pada 7 Juni 2006, single pertama mereka "U" yang telah digubah ulang secara resmi dirilis, dan menjadi "single" tersukses mereka hingga dirilisnya "Sorry, Sorry" pada bulan Maret 2009.
Super Junior-T
Pada awal Februari, SM Entertainment membuat pengumuman resmi tentang subgrup kedua Super Junior, Super Junior-T. Kelompok merilis singel "Rokuko" pada 23 Februari 2007 adan 25 Februari 2007, mereka resmi debut di "SBS Popular Songs", menampilkan "Rokuko" dan "First Express" dengan penyanyi trot terkenal, Bang Shilyi. Debut juga menandakan penampilan comeback Heechul setelah cedera dari kecelakaan mobil pada Agustus 2006.