Zaman Nanboku-cho
Pada tahun 1336, shogun Ashikaga Takauji mendirikan Istana Utara (Hokuchō) di Kyoto dengan Kaisar Kōmyō sebagai kaisar. Sementara itu, Kaisar Godaigo mendirikan Istana Selatan (Nanchō) dalam pengungsian di Yoshino. Zaman Nanboku-cho berakhir ketika Istana Selatan bersatu dengan Istana Utara pada tahun 1392.
Kuil Buddha dan Shinto di Nikkō
Pada akhir abad ke-8 seorang biarawan Buddhas, Shodo, mendirikan bangunan pertama di lereng gunung suci Nikko, yang telah disembah sejak zaman dahulu. Pada akhir abad ke-12, Keshogunan Kamakura menempatkan dirinya di wilayah Kanto, memungkinkan Nikko untuk memperkuat posisinya lebih lanjut sebagai situs suci utama di Kanto. Namun, situs itu ditinggalkan karena gejolak masa Muromachi, pada abad ke-16. Tempat ini dipilih sebagai tempat untuk Toshogu, tempat ini terdiri dari beberapa bangunan didirikan untuk rumah makam Ieyasu, pendiri Keshogunan Tokugawa. Rezim ini masih berkuasa selama lebih dari 250 tahun dalam sejarah Jepang. Sejak periode ini, Nikko telah memainkan peran yang sangat penting sebagai simbol kedaulatan nasional, tidak hanya di mata pemerintah daerah tetapi juga dari pemimpin negara-negara tetangga yang mengirimkan utusan mereka untuk membayar upeti kepada Ieyasu, seorang tokoh yang didewakan pada zaman itu.