Kereta api Argo Wilis
Namun belakangan ini sampai dengan bulan Juni 2018, Argo Wilis menggunakan kereta yang bervariasi antara kereta eksekutif Argo buatan tahun 1995, 1996, 1998, dan 2002, maupun kereta lainnya, dan seringkali bertukar kereta dengan kereta api Argo Parahyangan.
Kereta api Malioboro Ekspres
Kereta api Malioboro Ekspres (Moleks) (bahasa Jawa: Hanacaraka, , "Sepur Malioboro Ekspres") adalah kereta api penumpang kelas Eksekutif Satwa dan Ekonomi AC Plus yang dioperasikan PT Kereta Api Indonesia (Persero) di Pulau Jawa dengan jurusan Malang Kota Baru-Yogyakarta Tugu via Madiun dan Blitar dan sebaliknya. Kereta api ini diambil dari nama jalan di Kota Yogyakarta yakni Jalan Malioboro. Kereta ini berhenti di Kepanjen, Wlingi, Blitar, Tulungagung, Kediri, Kertosono, Nganjuk, Madiun, Solo Balapan, Klaten, dan berakhir di Yogyakarta Tugu