Kota Ternate
Hingga saat ini Perangkat Daerah Kota Ternate terdiri dari 17 Dinas, 9 Badan, 4 Kantor, 8 Bagian pada Sekretariat Daerah, serta Inspektorat dan Sekretariat DPRD. Kota Ternate mempunyai 7 (tujuh) wilayah kecamatan, yaitu Kecamatan Ternate Utara, Ternate Ternate Selatan, Pulau Ternate, Hiri, Moti, dan Kecamatan Pulau Batang dua, dan mempunyai 77 kelurahan yang siap melaksanakan tugas dan fungsi di bidang Pemerintahan, Pembangunan dan Pelayanan Kemasyarakatan.
Kabupaten Maluku Utara
Pada tanggal 20 Maret 1999, Kota Ternate ditetapkan menjadi kotamadya yang terpisah dari Kabupaten Maluku Utara. Tanggal 4 Oktober 1999, kabupaten Maluku Utara bersama dengan Kabupaten Halmahera Tengah menjadi bagia dari Provinsi Maluku Utara, yakni pemekaran dari Provinsi Maluku. Tanggal 25 Februari 2003, Kabupaten Maluku Utara dipecah menjadi empat kabupaten, yakni: