Tokyo
Edo menjadi ibukota "de facto" di Jepang meskipun kaisar tinggal di Kyoto, ibu kota kerajaan. Setelah sekitar 263 tahun, pemerintah shogun digulingkan di bawah bendera pemulihan pemerintahan kaisar. Pada tahun 1869, ketika Kaisar Meiji pindah ke Edo di usia 17 tahun, Tokyo sudah menjadi pusat politik dan kebudayaan negara, kemudian dijadikan ibu kota kerajaan "de facto" oleh istana sementara bekas Istana Edo menjadi Istana Kerajaan. Kota Tokyo didirikan lalu tetap menjadi ibu kota negara sehingga status kotanya dicabut pada tahun 1943 untuk digabungkan dengan "Wilayah Metropolitan" Tokyo.
Provinsi Oki
Kepulauan Oki terdiri dari dua pulau besar dan beberapa pulau yang lebih kecil. Ibu kota terletak di lokasi yang sekarang dikenal sebagai kota Saigo, tetapi hanya sedikit peninggalan ibu kota lama yang berhasil ditemukan. Kuil resmi agama Shinto untuk provinsi Oki juga terletak di kota Saigo.