Denominasi Kristen
Karena relatif tidak dikenal di Barat, literatur mengenai Gereja-Gereja Timur terkadang memasukkan Gereja Asiria Timur sebagai bagian dari Persekutuan Ortodoks Oriental. Namun Gereja Asiria — setelah mengenal Kekristenan pada abad pertama — sebenarnya telah memelihara kemandirian gerejawi, teologis, dan budaya daripada semua Gereja Kristen lainnya sejak tahun 431.
Konsili Efesus
Agama Kristen sudah lama hadir di Kekaisaran Persia, kendati umatnya seringkali ditindas oleh warga mayoritas Majusi karena dicurigai sebagai simpatisan Romawi. Pada tahun 424, Gereja Persia menyatakan kemandiriannya, lepas dari Gereja Bizantin dan semua Gereja lain, demi menghindari tuduhan-tuduhan sebagai antek asing. Selepas skisma Nestorian, Gereja Persia kian lama kian mengeratkan hubungan dengan kaum bidah Nestorian. Langkah ini didukung oleh golongan penguasa Persia yang beragama Majusi. Doktrin Gereja Persia menjadi semakin berhaluan Nestorian pada dasawarsa-dasawarsa berikutnya, sehingga semakin memperlebar jurang pemisah antara umat Kristen di Kekaisaran Persia dan umat Kristen di Kekaisaran Romawi. Pada tahun 486, Barsauma, Uskup Metropolia Nisibis, di hadapan umum menerima pembimbing Nestorius, yakni Teodoros, Uskup Mopsuestia, sebagai pemimpin rohani. Ketika Perguruan Edesa di Mesopotamia ditutup pada tahun 489 oleh Kaisar Zeno karena ajaran-ajarannya yang berhaluan Nestorian, lokasinya dipindahkan ke kota Nisibis, tempat perguruan itu pertama kali berdiri. Perpindahan lokasi ini membuat perguruan ini sekali lagi dikenal dengan nama Perguruan Nisibis, dan mendorong kaum Nestorian untuk beramai-ramai hijrah ke Persia. Batrik Persia, Mar Babai I (497–502), mengukuhkan penerimaan Gereja Persia terhadap paham Nestorianisme yang kembali marak lantaran tingginya rasa hormat umat Kristen Persia pada Uskup Teodoros.