Tritunggal
Formulasi awal lainnya, dan sudah lebih filosofis, mengenai Trinitas (tanpa menggunakan istilah tersebut) dikaitkan dengan seorang pengajar Gnostik bernama Valentinius (hidup 100 – 160) yang, menurut teolog abad ke-4 bernama Marcellus dari Ancyra, adalah "orang pertama yang merenungkan gagasan tentang tiga entitas subsisten (hipostasis), dalam sebuah karya yang ia beri judul "Tentang Ketiga Kodrat"". Eksegesis mazhab Valentinian yang sangat alegoris cenderung menafsirkan bagian-bagian kitab suci yang relevan sebagai penegasan suatu Keilahian yang, dengan cara tertentu, adalah rangkap tiga. Injil Filipus Valentinian, yang bertarikh sekitar masa Tertulianus, mendukung rumusan Trinitaris. Bagaimanapun, terlepas dari kemungkinan pengaruhnya pada doktrin yang kemudian terbentuk sepenuhnya, mazhab Valentinus ditolak dan dipandang sesat oleh kalangan Kristen ortodoks.
Skisma Acacius
Acacius menjawab tindakan tersebut dengan menyarang nama Paus Felix dari diptikhanya. Hanya para biarawan Acoemeti di Konstantinopel yang masih setia pada Roma, dan Acacius pun mengurung kepala biara mereka, Cyril, di penjara. Acacius sendiri meninggal pada 489, dan penerusnya, Flavitas (atau Fravitas, 489-90), mencoba berdamai dengan Roma, namun menolak menyerahkan komuni dengan kaum Monofisitis dan megnhilangkan nama Acacius dalam diptikhanya. Zeno meninggal pada 491; penerusnya, Anastasius I (491-518), mulai menjaga kebijakan Henotikon, namun secara berangsur-angsur mengadopsi Monofistisme. Setelah kematian Anastasius, penerusnya, Yustinus I, dengan segera berusaha mengakhiri skisma dengan Roma, sebuah tujuan yang dibagi dengan patriark baru Konstantinopel, Yohanes II. Persatuan tersebut terjadi secara formal pada Paskah, 24 Maret 519.