Peperangan Utsmaniyah-Habsburg
Pada abad ke-16, Utsmaniyah menjadi ancaman besar terhadap bangsa-bangsa Eropa, dan kapal-kapal Barbary yang tunduk kepada Utsmaniyah menyapu daerah kekuasaan Republik Venesia di Yunani. Perang ini juga dipersulit dengan adanya Reformasi Protestan, pertikaian dinasti Habsburg dengan Perancis dan perang internal di negara-negara anggota Kekaisaran Romawi Suci. Selain itu, Kesultanan Utsmaniyah juga harus bersaing dengan Kekaisaran Persia dan Kesultanan Mameluk, yang keduanya akhirnya dikalahkan dan dijadikan wilayah Utsmaniyah.
Kekaisaran Trebizond
Negara ini ditaklukan oleh Kesultanan Utsmaniyah pada tahun 1461. Pasca penaklukan, warisan demografisnya masih tetap ada, dan penduduk Ortodoks Yunani tetap tinggal di wilayah Trebizond hingga awal abad ke-20. Pada masa itu, sisa penduduk Ortodoks di wilayah tersebut dideportasi ke Yunani (dimulai tahun 1923) seperti yang ditentukan dalam pertukaran populasi Yunani dengan Turki.