Choi Siwon
Bulan Maret 2006, setelah SM Entertainment merekrut member baru Kyuhyun, grup ini menghilangkan "05" dan resmi bernama Super Junior. Single pertama bentuk baru grup ini "U" dirilis 7 Juni 2006,
Pada musim gugur 2007, Siwon bersama Super Junior merilis album kedua, "Don't Don", yang berhasil menjadi album terlaris kedua setelah SG Wannabe pada tahun tersebut.
Shindong
Pada tanggal 19 April 2007, hampir sebulan setelah single pertama Super Junior-T "Rokkugo!" dirilis, Shindong mengalami cidera serius akibat kecelakaan, bersama Leeteuk, Eunhyuk, Kyuhyun, dan dua manajernya, ketika kembali dari rekaman "Super Junior Kiss the Radio". Ketika mereka di highway, kedua ban kiri meledak saat pengemudinya menyalib dan van yang mereka tumpangi mirik ke arah pengemudi dan terseret sejauh 30 meter. Di saat yang sama van terbalik ke arah sebaliknya.