Peptida antimikrobial
Terdapat berbagai tipe peptida antimikrobial. Tipe pertama, yaitu peptida anionik, peptida ini kaya akan asam glutamat dan asam aspartat. Contohnya yaitu Maximin H5 yang terdapat pada amfibi, dan Dermcidin pada manusia.
Peptida nonribosomal
Peptida nonribosomal merupakan kelas dari peptida metabolit sekunder yang dihasilkan oleh mikroorganisme, seperti bakteri dan cendawan. Peptida ini dibuat oleh nonribosomal peptide synthetases, yang berbeda dengan dogma sentral yang menyatakan peptida dibentuk menggunakan organel ribosom. Setiap enzim hanya mengodekan satu jenis asam amino dan peptida yang dihasilkan umumnya berbentuk sirkuler.