Osteoporosis
Estrogen membantu mempertahankan kepadatan tulang pada wanita dan sering diminum bersamaan dengan progesteron. Terapi sulih estrogen paling efektif dimulai dalam 4-6 tahun setelah menopause; tetapi jika baru dimulai lebih dari 6 tahun setelah menopause, masih bisa memperlambat kerapuhan tulang dan mengurangi risiko patah tulang. Raloksifen merupakan obat menyerupai estrogen yang baru, yang mungkin kurang efektif daripada estrogen dalam mencegah kerapuhan tulang, tetapi tidak memiliki efek terhadap payudara atau rahim. Untuk mencegah osteroporosis, bisfosfonat (contohnya alendronat), bisa digunakan sendiri atau bersamaan dengan terapi sulih hormon.
Hipogonadisme
Hipogonadisme hipergonadotropik atau kegagalan ovarium mungkin terjadi karena
kelainan kromosom, gangguan autoimun , infeksi ("mumps oophoritis"), dan iradiasi atau obat sitotoksik. Banyak kasus
hipogonadisme hipergonadotropik adalah idiopatik bahkan setelah penyelidikan
yang ekstensif. Para wanita yang mengalami amenore primer atau sekunder memiliki
estrogen endogen yang rendah dan kadar FSH yang sangat tinggi. Tidak ada
keuntungan dalam melakukan laparoskopi dan biopsi ovarium untuk mendeteksi
adanya mendeteksi adanya folikel pada sindrom ovarium resisten karena bersifat invasif
dan hasilnya masih meragukan.