Bank of Japan
Seperti sebagian besar lembaga nasional Jepang lainnya, Bank of Japan didirikan setelah terjadinya Restorasi Meiji. Sebelum restorasi, para tuan tanah Jepang mengeluarkan mata uang mereka masing-masing, yaitu hansatsu, dengan kesetaraan yang tidak jelas satu sama lain, tetapi Undang-Undang Mata Uang Baru pada tahun 4 Meiji (1871) menyatakan bahwa yen adalah mata uang resmi baru.
Yen militer Jepang
Yen Militer Jepang (Mandarin dan Jepang: 日本軍用手票, juga 日本軍票) dikeluarkan untuk para prajurit Angkatan Darat Kekaisaran Jepang dan Angkatan Laut Kekaisaran Jepang sebagai bayaran. Pemerintah Kekaisaran Jepang pertama kali mulai mengeluarkan yen militer pada masa Perang Rusia-Jepang pada 1904.