Prefektur apostolik
Prefektur Apostolik adalah bentuk otoritas rendah untuk suatu wilayah pelayanan dalam Gereja Katolik Roma yang dibentuk di sebuah daerah misi dan di negara yang belum memiliki keuskupan. Prefektur apostolik dipimpin oleh seorang Prefek Apostolik, yang biasanya adalah seorang pastor dan bukan uskup. Kalau sebuah prefektur apostolik berkembang, statusnya akan ditingkatkan menjadi vikariat apostolik, dan akan dipimpin oleh orang berjabatan uskup sambil membentuk badan-badan institusi yang diperlukan untuk menjadi sebuah keuskupan penuh. Tahapannya adalah: misi, menjadi prefektur apostolik, menjadi vikariat apostolik, dan kemudian menjadi keuskupan.
Keuskupan Agung Tokyo
Apostolik Vikariat pertama di Jepang Utara adalah Mgr. Pierre Marie Osouf.Pada tanggal 17 April 1891, Vikariat Apostolik Jepang Utara dibagi menjadi Keuskupan Agung Tokyo dan Keuskupan Hakodate, dan Mgr. Osouf diangkat sebagai Uskup Agung Tokyo yang pertama.Pada tanggal 13 Agustus 1912, Keuskupan Agung Tokyo menyerahkan prefektur Toyama, Fukui dan Ishikawa ke wilayah Prefektur Apostolik Niigata yang baru didirikan, dan pada tanggal 18 Februari 1922, prefektur Aichi dan Gifu diserahkan ke wilayah Prefektur Apostolik yang baru didirikan Nagoya.Pada bulan November 1937, Tokyo dipercayakan kepada biarawan Jepang dan tinggal di Tokyo-to dan prefektur Chiba. Wilayah yang tersisa terpisah untuk membentuk Keuskupan Yokohama. Uskup Agung pertama yang dipilih di antara biarawan Jepang adalah Uskup Agung Petrus Tatsu Doi.