مهندسی پزشکی
یکی از مهم‌ترین مباحث مطرح در زمینه پزشکی، بحث استفاده از لیزر در پزشکی (چه در تشخیص و چه در درمان) است. اصولاً لیزر از همان ابتدا با توجه به قابلیت‌های منحصر به فردی که داشت، به عنوان یک انتخاب خوب برای بهینه‌سازی عملکرد بسیاری از سامانه‌ها بکار گرفته شده. استفاده از لیزر برای تشخیص ضایعات چشمی یا نمایش فشار خون در نازک‌ترین مویرگ‌ها یا سوراخ کردن یا ایجاد کانال مصنوعی در قلب، سوزاندن و بریدن برخی ضایعات درونی یا تومورهای گوناگون و… روز به روز در حال افزایش است. بحث شبکه عصبی طبیعی و درمان انواع ضایعات عصبی مانند ضایعات نخاعی با کمک تحریکات الکتریکی و با کمک علم ژنتیک نیز از بحث‌های مهم و تازه رشته مهندسی پزشکی است.
اسکالپل لیزری
اسکالپل لیزری یا نیشتر لیزری مدلی از اسکالپل برای جراحی بوده که افزوده بر ایجاد برش بر روی بافت، همزمان از خونریزی جلوگیری کرده(بندایش خونریزی) و این فرایند به‌طور کلی توسط لیزر انجام می‌گیرد. جراحی با لیزر بر روی بافت نرم سبب تبخیر سطحی مایعات در آن ناحیه می‌شود. در چشم پزشکی، لیزر اگزایمر برای تغییر شکل قرنیه، روشی شناخته شده محسوب شده و به عنوان روش لازک، کاربرد دارد. سایر کاربردها: ختنه، جراحی مغز و اعصاب و جراحی عروقبرای استفاده از تحقیقات زیست‌شناسی یاخته، لیزر ویژه میکرو، می‌تواند جرمی کم‌تر از یک سلول را برش دهد.