سیستم‌عامل ابررایانه
اگرچه اکثر ابر رایانه‌های مدرن از سیستم عامل لینوکس استفاده می‌کنند، هر سازنده تغییرات خاص خود را در مشتقات لینوکس مورد استفاده خود ایجاد کرده‌است و هیچ استاندارد صنعتی وجود ندارد، بخشی به این دلیل است که تفاوت در ساختارهای سخت‌افزاری مستلزم تغییراتی برای بهینه‌سازی سیستم عامل به هر طراحی سخت‌افزاری می‌باشد.
نقد لینوکس
در دهه‌های اخیر (از زمان تسلط بر مایکروسافت ویندوز) توسعه دهندگان سخت‌افزار اغلب تمایلی به ارائه مستندات فنی کامل برای محصولات خود ندارند، تا بتوانند درایورها را بنویسند. این بدان معناست که یک کاربر لینوکس برای اطمینان از عملکرد و سازگاری مجبور شده بود سخت‌افزارهایی را که سیستم ایجاد کرده بود، با دقت انتخاب کند. این مشکلات تا حد زیادی مرتفع شده‌است: سالها پیش، اگر می‌خواستید لینوکس را روی دستگاه نصب کنید، باید مطمئن شوید که هر قطعه سخت‌افزار را با دست انتخاب کرده‌اید یا نصب شما صد در صد کار نمی‌کند … این در حال حاضر اینقدر نیست. می‌توانید یک رایانه شخصی (یا لپ تاپ) بگیرید و به احتمال زیاد یک یا چند توزیع لینوکس برای نصب و کار تقریباً ۱۰۰٪ دریافت کنید. اما هنوز استثناهایی وجود دارد؛ به عنوان مثال، خواب زمستانی / تعلیق همچنان برای بسیاری از لپ تاپ‌ها مشکل به نظر می‌رسد، اگرچه مسیری طولانی طی شده‌است.