آلاینده‌های مواد غذایی
بر اساس اصول حاکم بر سیستم های ایمنی مواد غذایی، خطرات در مواد غذایی به سه دسته خطرات فیزیکی، میکروبی و شیمیایی گروه‌بندی می شوند. در ارزیابی خطرات دو پارامتر شدت خطر و احتمال وقوع خطر بررسی می گردند. آلاینده‌ها در فراورده‌های غذایی ترکیبات مضر برای سلامت انسان هستند که ممکن است از وسیله یا ماده بسته‌بندی، خط تولید، آب‌های آلوده، سوخت‌های فسیلی، اجزاء رادیواکتیو، متابولیت‌های سمی میکروارگانیسم‌ها، بقایای مواد شیمیایی به کار رفته در کشاورزی و ترکیبات دارویی اضافه شده به خوراک دام‌ها و طیور به ماده غذایی رخنه کنند.
اجزای زنده
همهٔ گونه‌ها کم و بیش به نحوی توسط عوامل زنده تحت تأثیر قرار دارند. به عنوان مثال، اگر تعداد جانوران شکارچی افزایش یابد، کل وب غذایی تحت تأثیر قرار خواهد گرفت (تعداد جمعیت موجودات در زنجیرهٔ غذایی پایین‌تر کاهش خواهد یافت). به همین گونه، وقتی موجوداتی مواد غذایی بیشتری برای خوردن دارند، آنها را سریعتر رشد می‌کنند و احتمال تکثیر بیشتری دارند، به طوری که اندازهٔ جمعیت به روشنی افزایش خواهد یافت. با این حال، پاتوژن‌ها و شیوع بیماری، به احتمال زیاد سبب کاهش در اندازهٔ جمعیت بوده‌اند. بیش‌ترین تغییرات ناگهانی در محیط را انسان ایجاد می‌کند (به عنوان مثال ساختن شهرها ساختمان‌ها و کارخانه‌ها، زباله و آلودن آب). این تغییرات به احتمال زیاد سبب کاهش در جمعیت هر گونه جان‌دار می‌شود، و این به خاطرِ ظهورِ ناگهانیِ عوامل آلاینده است.