کشاورزی
خاک ورزی به معنای شکست خاک با ابزارهایی مانند گاوآهن یا کلوخ‌شکن جهت آماده‌سازی آن برای کاشت، ترکیب مواد مغذی یا کنترل آفات است. شدت خاک ورزی می‌تواند از حدود متعارف تا بدون خاک ورزی (حفاری مستقیم) متغیر باشد. خاکورزی می‌تواند با گرم کردن خاک، ترکیب کود و کنترل علف‌های هرز، بهره‌وری را افزایش دهد، اما خاک را مستعد فرسایش می‌کند، باعث تجزیه مواد آلی آزاد کننده CO می‌شود و فراوانی و تنوع ارگانیسم‌های خاکی را کاهش می‌دهد. کنترل آفات شامل مدیریت علف‌های هرز، حشرات، کنه‌ها و بیماری‌ها است. برای اینکار از روش‌های شیمیایی (سموم دفع آفات)، بیولوژیکی (کنترل بیولوژیک)، مکانیکی (خاکورزی) و فرهنگی استفاده می‌شود. روش‌های فرهنگی عبارتند از: تناوب زراعی، کاشت گیاهان پوشش دهنده، کشت مخلوط، کمپوست سازی، اجتناب و مقاومت می‌باشد. مدیریت تلفیقی آفات سعی دارد تا از همه این روش‌ها برای پایین نگه داشتن جمعیت آفات کمک بگیرد به گونه ای که ضرر اقتصادی قابل قبول بوده، و آفت کشها را به عنوان آخرین چاره توصیه می‌کند.
گیاهان تراریخته
در ایران تولید آزمایشگاهی برخی از محصولات تراریخته در مراکز علمی و دانشگاهی از حدود بیست و پنج سال قبل آغاز شده‌است. اولین محصول کشاورزی تراریخته، رقمی از برنج است که در برابر کرم ساقه‌خوار برنج "Chilo suppressalis" مقاومت نشان می‌دهد. محصولات دیگری نظیر سیب‌زمینی و پنبه نیز تولید شده‌اند و در حال طی کردن مراحل نهایی ارزیابی و اخذ مجوز رهاسازی هستند.منتقدین تراریخته‌ها معتقدند نوع کشت و تولید این محصولات، استفاده از سمومی مانند سم گلایفوسیت (با نام تجاری RoundUp) را افزایش داده‌اند. ورود این سموم به چرخهٔ غذایی انسان می‌تواند باعث ایجاد بیماری شود. همچنین گیاهان می‌توانند با تثبیت مقادیر زیادی از این سموم در خاک محل کشت خود باکتری‌های حیاتی تثبیت کننده عناصر خاک را از بین برده و منجر به از بین رفتن حاصل‌خیزی خاک شوند. هيچ يك از اين ادعاها از سوي منابع علمي تأييد نشد. علاوه بر اين، اگرچه ادعاها و هياهوي تبليغاتي شديدي از سوي منتقدان فناوري مهندسي ژنتيك، مبني بر سرطان‌زا بودن اين محصولات انجام شد، اما در نهايت مراجع علمي جهان، نظير مرجع ايمني غذايي اتحاديه اروپا، سازمان بهداشت جهاني و سازمان غذا و كشاورزي ملل متحد، رسماً اعلام كردند كه محصولات تراريخته داراي مجوز كه وارد بازار جهاني شده‌اند، فاقد هر گونه آثار سرطانزايي هستند. علاوه بر اين، بررسي‌هاي ديگري نشان داده‌اند كه با توجه به كاربرد بسيار كمتر آفت‌كش‌ها و يا قطع كامل مصرف‌ آنها در توليد اين محصولات، محصولات تراريخته از سالم‌ترين محصولات غذايي دنيا هستند و جنجال‌هاي تبليغاتي بر ضد آنها، فاقد پشتوانه علمي است. به نظر مي‌رسد، انگيزه‌هاي اقتصادي ناشي از تغيير گردش مالي توليد نهاده‌هايي مانند بذر، آفت‌كش و كود عامل اصلي محرك انتقاد بر عليه اين محصولات است.