اسکی‌داک
متن‌های اسکی‌داک را می‌توان با هر ویرایشگری نوشت. همچنین متن در حالی که برای آدم‌ها هم خوانا است، می‌توان آن را به فرم‌هایی همچون HTML، PDF، TeX، ePub، ManPages، اسلایدها و غیره تبدیل کرد.
حاشیه‌نویسی اسنیپ
امروزه ابزارهای حاشیه‌نویسی SNP زیادی برای حاشیه‌نویسی تعداد زیادی داده NGS وجود دارد. عملکردها و روش‌های استفاده شده در این ابزارها در جدول زیر آمده‌است. ابزارهای حاشیه‌نویسی تغییرات از الگوریتم‌های یادگیری ماشین برای پیش‌بینی استفاده می‌کنند. ابزارهای مختلف از الگوریتم‌های مختلف استفاده می‌کنند. الگوریتم‌های معمول عبارتند از: