سیستم‌عامل ابررایانه
اگرچه اکثر ابر رایانه‌های مدرن از سیستم عامل لینوکس استفاده می‌کنند، هر سازنده تغییرات خاص خود را در مشتقات لینوکس مورد استفاده خود ایجاد کرده‌است و هیچ استاندارد صنعتی وجود ندارد، بخشی به این دلیل است که تفاوت در ساختارهای سخت‌افزاری مستلزم تغییراتی برای بهینه‌سازی سیستم عامل به هر طراحی سخت‌افزاری می‌باشد.
انتقاد از دسکتاپ لینوکس
لینوس توروالدز اظهار داشته‌است که وی قصد داشته‌است که هسته لینوکس در سیستم عامل‌های دسک تاپ مورد استفاده قرار گیرد. او استدلال می‌کند که اندروید به دلیل نصب از طریق تلفن‌های جدید بسیار مورد استفاده قرار می‌گیرد و برای به دست آوردن سهم بازار، توزیع‌های لینوکس برای رایانه‌های جدید لازم است.