प्रतिपिंड
अनुसंधान में, शुद्ध एंटीबॉडी का उपयोग कई अनुप्रयोगों में किया जाता है। आम तौर पर इनका सबसे अधिक प्रयोग इंट्रासेल्युलर और एक्स्ट्रासेल्युलर प्रोटीन को पहचानने तथा ढूंढने के लिए किया जाता है। एंटीबॉडी का उपयोग, कोशिका के प्रकारों में उनके द्वारा व्यक्त प्रोटीन द्वारा अंतर करने के लिए, फ्लो साइटोमीट्री में किया जाता है; विभिन्न प्रकार की कोशिकाएं अपनी सतह पर अलग अलग अणुओं के अलग अलग गुच्छों के (क्लस्टर) संयोजनों को व्यक्त करती हैं और अलग प्रकार के इंट्रासेल्युलर और स्रावित किये जाने वाले प्रोटीन का निर्माण करती हैं। इनका प्रयोग प्रतिरक्षक अवक्षेपण द्वारा कोशिका अपघटन में दूसरे अणुओं से प्रोटीनों या उनसे जुडी किसी भी चीज़ (सह-प्रतिरक्षक अवक्षेपण) को अलग करने के लिए, वेस्टर्न ब्लॉट विश्लेषण में इलेक्ट्रोफोरेसिस द्वारा अलग किये गये प्रोटीनों को पहचानने के लिए, तथा प्रतिपिंड ऊतक रसायन विज्ञान या इम्यूनोफ्लोरेसेंस में ऊत्तक के खण्डों में प्रोटीन अभिव्यक्ति को जांचने या सूक्ष्मदर्शी की सहायता से कोशिकाओं के अन्दर प्रोटीन को ढूंढने के लिए भी किया जा रहा है। एलिसा (ELISA) और एलीस्पॉट (ELISPOT) तकनीकों का प्रयोग करके एंटीबॉडी की सहायता से भी प्रोटीन ढूंढें और मापे जा सकते हैं।
सरल परिसर्प
जो एंटीबॉडी प्रारंभिक संक्रमण के बाद एक प्रकार की एचएसवी (HSV) को विकसित करता है, वे उसी प्रकार के विषाणु से होने वाले पुनः संक्रमण की रोकथाम करता है - एचएसवी-1 (HSV-1) के कारण होने वाले ओरोफेसियल संक्रमण के इतिहास वाला व्यक्ति एचएसवी-1 (HSV-1) के कारण होने वाले परिसर्प बिसहरी या जनांगी संक्रमण को प्राप्त नहीं कर सकता है। एक मोनोगेमस युगल में, एक सेरोनिगेटिव महिला में एक सेरोपॉज़िटिव पुरुष साथी की तुलना में एचएसवी (HSV) संक्रमण के प्राप्त करने का प्रति वर्ष 30% से भी अधिक जोखिम होता है। यदि सबसे पहले एक मौखिक एचएसवी-1 (HSV-1) संक्रमण प्राप्त होता है, सेरोकन्वर्सन एक भावी जनानांगी एचएसवी-1 (HSV-1) संक्रमण के विरुद्ध रक्षात्मक एंटीबॉडी प्रदान करने के लिए 6 सप्ताह बाद हुआ होगा।