प्रतिपिंड
अनुसंधान में, शुद्ध एंटीबॉडी का उपयोग कई अनुप्रयोगों में किया जाता है। आम तौर पर इनका सबसे अधिक प्रयोग इंट्रासेल्युलर और एक्स्ट्रासेल्युलर प्रोटीन को पहचानने तथा ढूंढने के लिए किया जाता है। एंटीबॉडी का उपयोग, कोशिका के प्रकारों में उनके द्वारा व्यक्त प्रोटीन द्वारा अंतर करने के लिए, फ्लो साइटोमीट्री में किया जाता है; विभिन्न प्रकार की कोशिकाएं अपनी सतह पर अलग अलग अणुओं के अलग अलग गुच्छों के (क्लस्टर) संयोजनों को व्यक्त करती हैं और अलग प्रकार के इंट्रासेल्युलर और स्रावित किये जाने वाले प्रोटीन का निर्माण करती हैं। इनका प्रयोग प्रतिरक्षक अवक्षेपण द्वारा कोशिका अपघटन में दूसरे अणुओं से प्रोटीनों या उनसे जुडी किसी भी चीज़ (सह-प्रतिरक्षक अवक्षेपण) को अलग करने के लिए, वेस्टर्न ब्लॉट विश्लेषण में इलेक्ट्रोफोरेसिस द्वारा अलग किये गये प्रोटीनों को पहचानने के लिए, तथा प्रतिपिंड ऊतक रसायन विज्ञान या इम्यूनोफ्लोरेसेंस में ऊत्तक के खण्डों में प्रोटीन अभिव्यक्ति को जांचने या सूक्ष्मदर्शी की सहायता से कोशिकाओं के अन्दर प्रोटीन को ढूंढने के लिए भी किया जा रहा है। एलिसा (ELISA) और एलीस्पॉट (ELISPOT) तकनीकों का प्रयोग करके एंटीबॉडी की सहायता से भी प्रोटीन ढूंढें और मापे जा सकते हैं।
रोगक्षमता की कृत्रिम प्रेरण
सिंथेटिक (पुनः संयोजक या सेल क्लोन) मानव इम्युनोग्लोबुलिन बनाया जा सकता है, सहित कई कारणों के लिए (सामग्री जैविक परिओं संदूषण का जोखिम) और अक्सर अधिक और अधिक उपयोग होने की संभावना है। हालांकि, वे निर्माण करने के लिए महंगे हैं और २००६ में बड़े पैमाने पर उत्पादन के रूप में नहीं हैं। भविष्य में यह हो सकता है कि एंटीबॉडी कृत्रिम रूप से डिजाइन हो विशिष्ट प्रतिजनों में फिट, फिर उन्हें बड़ी मात्रा में उपज कर के, अस्थायी रोगक्षमता लोगों में पैदा कर सकते हैं, एक विशेष रोगज़नक़ प्रदर्शन से पहले, जैसे जीवाणु, एक वायरस, या प्राइऑन. वर्तमान में, इस प्रक्रिया को समझने के लिए विज्ञान उपलब्ध है, यह तकनीक प्रदर्शन करने के लिए उपलब्ध नहीं है।