प्रतिपिंड
अनुसंधान में, शुद्ध एंटीबॉडी का उपयोग कई अनुप्रयोगों में किया जाता है। आम तौर पर इनका सबसे अधिक प्रयोग इंट्रासेल्युलर और एक्स्ट्रासेल्युलर प्रोटीन को पहचानने तथा ढूंढने के लिए किया जाता है। एंटीबॉडी का उपयोग, कोशिका के प्रकारों में उनके द्वारा व्यक्त प्रोटीन द्वारा अंतर करने के लिए, फ्लो साइटोमीट्री में किया जाता है; विभिन्न प्रकार की कोशिकाएं अपनी सतह पर अलग अलग अणुओं के अलग अलग गुच्छों के (क्लस्टर) संयोजनों को व्यक्त करती हैं और अलग प्रकार के इंट्रासेल्युलर और स्रावित किये जाने वाले प्रोटीन का निर्माण करती हैं। इनका प्रयोग प्रतिरक्षक अवक्षेपण द्वारा कोशिका अपघटन में दूसरे अणुओं से प्रोटीनों या उनसे जुडी किसी भी चीज़ (सह-प्रतिरक्षक अवक्षेपण) को अलग करने के लिए, वेस्टर्न ब्लॉट विश्लेषण में इलेक्ट्रोफोरेसिस द्वारा अलग किये गये प्रोटीनों को पहचानने के लिए, तथा प्रतिपिंड ऊतक रसायन विज्ञान या इम्यूनोफ्लोरेसेंस में ऊत्तक के खण्डों में प्रोटीन अभिव्यक्ति को जांचने या सूक्ष्मदर्शी की सहायता से कोशिकाओं के अन्दर प्रोटीन को ढूंढने के लिए भी किया जा रहा है। एलिसा (ELISA) और एलीस्पॉट (ELISPOT) तकनीकों का प्रयोग करके एंटीबॉडी की सहायता से भी प्रोटीन ढूंढें और मापे जा सकते हैं।
रक्ताधान
आरएच समूह का प्रमुख महत्व भ्रूण और नवजात शिशु के रक्तलायी रोग में इसकी भूमिका है। जब एक आरएच निगेटिव मां एक पॉजिटिव भ्रूण धारण करती है, तो वह आरएच प्रतिजन (ऐन्टिजिन) के विरुद्ध प्रतिरक्षित हो सकती है। यह आमतौर पर गर्भावस्था के दौरान महत्वपूर्ण नहीं होता है, लेकिन बाद के गर्भधारणों में वह आरएच प्रतिजन (ऐन्टिजिन) के प्रति एक प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया विकसित कर सकती है। मां की प्रतिरक्षा प्रणाली अपरा (प्लैसेंटा) के द्वारा शिशु की लाल कोशिकाओं पर हमला कर सकती है। एचडीएफएन (HDFN) के हल्के मामले विकलांगता उत्पन्न कर सकते हैं, लेकिन कुछ गंभीर मामले घातक हो सकते हैं। आरएच-डी (Rh-D) एचडीएफएन में सबसे अधिक सामान्य रूप से शामिल लाल कोशिका वाला प्रतिजन है, लेकिन लाल कोशिका वाले अन्य प्रतिजन भी यह स्थिति पैदा कर सकते हैं। सुने हुए रक्त प्रकारों में "पॉजिटिव" या "निगेटिव" जैसे कि "ओ पॉजिटिव" आरएच-डी प्रतिजन होता है।