Historia de la Argentina
Los militares golpistas fueron detenidos y enjuiciados. Perón y Lucero impulsaron en cambio optaron por aplicar sanciones moderadas. Menéndez fue condenado a 15 años de prisión; Rodolfo Larcher, Armando Repetto y Julio Alsogaray, fueron condenados seis años de reclusión; a cuatro años el capitán Alejandro Agustín Lanusse, Gustavo Martínez Zuviría, Víctor Salas y Costa Paz; fueron sancionados a tres años Manuel Raymúndez y Rómulo Menéndez y a un año Luis Prémoli, Ricardo Echeverry Boneo y Manuel Rojas Silveyra. Ninguno de ellos perdió su grado militar. Los sectores más duros del peronismo, liderados por Eva Perón, sostenían que los delitos cometidos -que incluían un homicidio-, debieron haber sido sancionados severamente, con pérdida de los grados militares y aplicación de la pena de muerte en los casos más graves. El historiador radical Félix Luna opinó que Perón aprovechó el intento del golpe para depurar las fuerzas armadas, desprendiéndose mediante su retiro de oficiales que no habían sido parte de la rebelión.
Historia de la Argentina entre 1943 y 1963
La Marina fue la gran derrotada, perdiendo el lugar prioritario que había ganado al interior de las Fuerzas Armadas a partir de 1955. Los tribunales militares condenaron a 139 oficiales, pero el mismo día de la condena fueron perdonados por el presidente Guido. El 90% de los almirantes y el 40% de los capitanes de navío perdieron sus cargos, y la fuerza fue reducida significativamente. El general Onganía y sus principales oficiales (Julio Alsogaray, Alejandro Agustín Lanusse, Roberto Marcelo Levingston, Alcides López Aufranc) fueron los grandes ganadores, recuperando la hegemonía del Ejército en las Fuerzas Armadas y procediendo a purgar el Ejército para crear un cuerpo unificado bajo la cadena de mandos, con amplia autonomía política, que sería decisivo en las dictaduras permanentes instaladas en 1966 y en 1976, así como la generalización del terrorismo de Estado en las dos décadas siguientes.