Manuel Marulanda Vélez
Al igual que los demás bandos en el Conflicto armado interno en Colombia, las FARC-EP que Marulanda dirigía cometieron abusos contra otros combatientes y contra la población civil a lo largo de la guerra. Organizaciones no gubernamentales calculan que su responsabilidad correspondería a alrededor del 20 por ciento (de 15 a 25 según los diferentes momentos) de los asesinatos políticos anuales en el conflicto. A las FARC-EP también se las considera responsables de un alto número de detenciones de guerra, de reclutamientos de menores, de la colocación de minas antipersonales y de actos de terrorismo. Las FARC-EP están en la lista de organizaciones consideradas como terroristas por el Departamento de Estado de los Estados Unidos y en su equivalente dentro de la Unión Europea. Las Naciones Unidas han condenado varias de sus acciones como crímenes de guerra.
Bloque Sur de las FARC-EP
En abril de 2009, la Policía Nacional de Colombia le decomisó a integrantes del Frente 2 en Buesaco, 97,4 kilos de heroína, valorados en unos US$90 millones de dólares y que se calificó como el mayor cargamento de esa droga decomisado en la historia de Colombia, en ese momento. Decomiso de bienes del Bloque Sur por actividades ilegales.Los secuestros a congresistas del Huila, la familia Turbay Cote y el edificio de Miraflores, Gloria Polanco, Consuelo Gonzálezdel senador Luis Eladio Pérez, junto al entonces alcalde de Ipiales, Luis Alfredo Almeida, y a su conductor, del alcalde de Funes, Carlos Velasco, cuando en compañía de Mario Villota, concejal del mismo municipio asistía a una cita en una zona rural con las FARC-EP. El ingeniero Juan Antonio Giraldo Londoño secuestrado en 2010, Después de 39 días fue liberado. El secuestro por las FARC-EP constituye el Caso 001 de la Jurisdicción Especial para la Paz.San José de Fragua, Caquetá (1989) 4 muertos.