Estructura de las FARC-EP
Asimismo, Las FARC-EP tenían un alcance subregional, con proyección regional y a pesar de afrontar graves problemas para cumplir su objetivo de la toma del poder nacional estaba en capacidad de sobrevivir y perdurar en el tiempo como una amenaza para el Estado y sus Fuerzas Militares y de Policía. La estructura de las FARC-EP y sus diversos componentes mostraba una organización que ha sabido adaptarse a las dinámicas de la globalización, especialmente financiera y que logró en su momento hacerse con el control de uno de los negocios más lucrativos y difíciles de derrotar: el narcotráfico.
Fuerzas Armadas Revolucionarias de Colombia
Álvaro Uribe, inicia la implementación del "Plan Patriota", que implicó la intensificación del combate contra las FARC-EP, sosteniendo la tesis de que en Colombia no existe un conflicto armado sino una amenaza terrorista. Por su parte, las FARC-EP decidieron promover un regreso a la estrategia de guerra de guerrillas, para conservar su estructura, y evitar sufrir deserciones y operativos militares. Hacia 2002, el gobierno estimaba el número de guerrilleros de las FARC-EP en alrededor de 18 000 y, en 2005, entre 12 000 y 13 000. En 2008, el ejército estimaba que tendrían 8000 guerrilleros en sus filas. Las FARC-EP no solían mencionar cifras específicas, pero estiman que tendrían más de 20 000 hombres. Otras fuentes mencionan diferentes cifras. Se presentaron casos de falsos positivos (civiles asesinados y presentados como guerrilleros abatidos en combate). Las FARC-EP atentaron contra el Club El Nogal el 7 de febrero de 2003. y realizaron también el atentado con casa-bomba en Neiva el 14 de febrero de 2003. El 5 de mayo de 2003, asesinaron al gobernador de Antioquia, Guillermo Gaviria y a Gilberto Echeverri, secuestrados un año antes. También se registraron los atentados de la Zona Rosa de Bogotá y del Palacio de Justicia de Cali en 2008 entre otras acciones.