Estructura de las FARC-EP
Según el Gobierno de Colombia, gobiernos de otros países y el Departamento de Estado de los Estados Unidos, las FARC-EP poseían vínculos y conexiones con varios grupos u organizaciones terroristas y mafiosas que les permitían mantener acceso a redes de tráfico de armas, drogas, lavado de dinero, tráfico de personas, entre otras actividades delictivas. Por esto, las FARC-EP eran una organización que para el manejo de sus finanzas y el control del negocio de drogas ilícitas estaba profundamente vinculada con las redes dedicadas al transporte de drogas y grupos narcotraficantes, la importación de insumos químicos y el lavado de activos. Asimismo, por su propia naturaleza de organización terrorista, estaba relacionada con redes dedicadas al tráfico de armas que reciben por el armamento, dinero o droga. Por lo tanto, la vinculación de las FARC-EP con redes globalizadas era profunda como resultado del involucramiento de la organización con el control del tráfico de drogas.
Fuerzas Armadas Revolucionarias de Colombia
Álvaro Uribe, inicia la implementación del "Plan Patriota", que implicó la intensificación del combate contra las FARC-EP, sosteniendo la tesis de que en Colombia no existe un conflicto armado sino una amenaza terrorista. Por su parte, las FARC-EP decidieron promover un regreso a la estrategia de guerra de guerrillas, para conservar su estructura, y evitar sufrir deserciones y operativos militares. Hacia 2002, el gobierno estimaba el número de guerrilleros de las FARC-EP en alrededor de 18 000 y, en 2005, entre 12 000 y 13 000. En 2008, el ejército estimaba que tendrían 8000 guerrilleros en sus filas. Las FARC-EP no solían mencionar cifras específicas, pero estiman que tendrían más de 20 000 hombres. Otras fuentes mencionan diferentes cifras. Se presentaron casos de falsos positivos (civiles asesinados y presentados como guerrilleros abatidos en combate). Las FARC-EP atentaron contra el Club El Nogal el 7 de febrero de 2003. y realizaron también el atentado con casa-bomba en Neiva el 14 de febrero de 2003. El 5 de mayo de 2003, asesinaron al gobernador de Antioquia, Guillermo Gaviria y a Gilberto Echeverri, secuestrados un año antes. También se registraron los atentados de la Zona Rosa de Bogotá y del Palacio de Justicia de Cali en 2008 entre otras acciones.