Emilio Mola
Tras la muerte de Sanjurjo en Portugal, Francisco Franco fue nombrado jefe del Ejército de África, la unidad militar con que contaban los sublevados que más posibilidades tenía de romper el "statu quo" al que se había llegado. A los pocos días del comienzo de la guerra, Mola, como antiguo "director" de la sublevación que había fracasado, quedó como jefe máximo de la zona norte sublevada y de todas las fuerzas militares. Las fuerzas sublevadas en la zona norte se agruparon en torno al mando supremo de Mola, que fue nombrado comandante en jefe del nuevo Ejército del Norte sublevado. Por su parte, Franco logró cruzar el estrecho de Gibraltar, llegando, en una rapidísima campaña, a las afueras de Madrid. El 1 de octubre, debido a su reciente popularidad y éxitos militares, fue promovido por sus compañeros de la Junta de Defensa Nacional al cargo de jefe del Estado y generalísimo de los Ejércitos de Operaciones. Definitivamente, la dirección militar y política de la sublevación se le había escapado de las manos a Mola.
Nombramiento del general Franco como Jefe del Gobierno del Estado
El 1 de agosto de 1936 se produjo un incidente por el que Mola se granjeó la hostilidad de los generales monárquicos, lo que allanaría el camino hacia el mando único del general Franco. Ese día llegó a Burgos —según Hugh Thomas, a Pamplona—, en un lujoso coche conducido por su chófer, don Juan de Borbón, tercer hijo del rey Alfonso XIII en el exilio desde 1931, con la pretensión de alistarse en las filas del ejército sublevado —bajo el seudónimo de Juan López—. La reacción de Mola fue ordenar que lo devolvieran a la frontera, bajo la amenaza de que si volvía a entrar en España, le haría fusilar «con todos los honores que a su elevado rango correspondan». El 7 de agosto, dos días después del éxito del «convoy de la victoria», el general Franco instaló en Sevilla su Cuartel General. Escogió el espléndido palacio de los marqueses de Yanduri, lo que contrastaba con la modesta vivienda en la que vivía el "virrey" de Andalucía Queipo de Llano. Allí formó un embrión de Estado Mayor integrado por sus dos ayudantes, "Pacón" y el comandante Carlos Díaz Varela, el coronel Martín Moreno y los generales Alfredo Kindelán y José Millán Astray.