Baja California
Más hacia el sur por la costa del Océano Pacífico, el clima también se hace desértico; pero no es tan extremoso y cálido como en la costa del Golfo de California. Los climas de transición (del "mediterráneo" al "desértico") se pueden encontrar desde San Quintín hasta El Rosario. Hacia el Este y cerca del Golfo, la vegetación es muy escasa y las temperaturas son muy altas en el verano. El clima desértico también se encuentra en todas las islas del Golfo de California. Algunos oasis se localizan en poblados como Cataviña, San Borja y Santa Gertrudis.
Desierto de Baja California
El clima es seco y subtropical. Aunque las lluvias son escasas, el Océano Pacífico ofrece algo de humedad y modera la temperatura en comparación con el desierto de Sonora, que se encuentra en la ladera este de la cordillera de la Independencia. La ecorregión del Desierto de Baja California se produce en la porción occidental de la península de Baja California, y ocupa la mayor parte de los estados mexicanos de Baja California Sur y Baja California. La elevación es variable, que van desde cadenas de montañas en la parte centro-occidental (1000-1500), los llanos de la elevación de la mediana (300-600), y grandes extensiones de dunas costeras.