Proteína de la espícula (coronavirus)
Las mutaciones de la proteína de la espícula suscitan preocupación porque pueden afectar la infectividad o la transmisibilidad, o facilitar el escape inmunológico . La mutación D 614 G ha surgido de forma independiente en múltiples linajes virales y se vuelve dominante entre los genomas secuenciados; puede tener ventajas en cuanto a infectividad y transmisibilidad posiblemente debido al aumento de la densidad de los picos en la superficie viral, aumentando la proporción de conformaciones competentes para la unión o mejorando la estabilidad. Las mutaciones en la posición E 484, particularmente E 484 K, se han asociado con escape inmunológico y unión reducida de anticuerpos. La variante ómicron del SARS-CoV-2 es notable por tener un número inusualmente alto de mutaciones en la proteína de la espícula.
Cluster 5
El 4 de noviembre de 2020, la Primera Ministra de Dinamarca, Mette Frederiksen, declaró que un coronavirus mutado se estaba transmitiendo a los humanos a través de visones, vinculado principalmente a granjas de visones en el norte de Jutlandia. Un informe del State Serum Institute (SSI) encontró que había habido 12 infecciones humanas (8 directamente asociadas con granjas de visones, 4 en la comunidad cercana) que involucraron esta mutación en el norte de Jutlandia (que se conoce como "cluster 5"), y su respuesta de anticuerpos fue más débil. Si bien el instituto declaró que la mutación no parecía ser más peligrosa que otros coronavirus, Kåre Mølbak y Tyra Grove Krause del SSI advirtieron que la mutación podría reducir potencialmente el efecto de las vacunas COVID-19 actualmente en desarrollo, aunque era poco probable que las volviera inútiles. SSI señaló que, si bien el cluster 5 era motivo de cierta preocupación, también les preocupaban las posibles mutaciones futuras que podrían aparecer en el visón, lo que llevó a su recomendación de cerrar todas las granjas del país.