Conflicto armado interno de Colombia entre 1990 y 2002
Los atentados contra Estados Unidos perpetrados el 11 de septiembre de 2001 por la red Al Qaeda, opacaron la guerra contra las drogas y la activaron contra el terrorismo. Gracias a la presión del Presidente George W. Bush, el Congreso de su país autorizó en julio de 2002, la extensión de los recursos del Plan Colombia a la lucha contra los grupos armados ilegales como parte de “una campaña unificada contra el tráfico de narcóticos y las organizaciones designadas como terroristas” (FARC-EP, ELN, AUC). Además, la designación de las FARC-EP como el grupo terrorista más peligroso del hemisferio y la presunción estadounidense de sus vínculos con la ETA, el IRA y Al Qaeda, la Unión Europea incluye a las FARC-EP y a las AUC en su lista de organizaciones terroristas. El 14 de octubre del 2002, el ELN publica un comunicado donde señala su participación en una serie de enfrentamientos los municipios de San Antonio del Chamí, El Cañón y Santa Cecilia, en el departamento de Risaralda, además de anunciar que organizaciones como el Ejército Revolucionario Guevarista (ERG), el Frente Aurelio Rodríguez de las FARC-EP participan en los combates. En el comunicado no señalan las bajas de ambos lados, pero si anuncian un paro armado en la vía Pereira-Quibdó.
Servicio Nacional de Fronteras
Debido a la nula presencia de las autoridades panameñas en sus fronteras con Colombia y Costa Rica en la década de los 90 y el enfoque de los gobiernos hacia temas de mayor relevancia del estado panameño, se descuidan las fronteras de Panamá, cosa que las organizaciones paramilitares y narcoguerrilleras como las FARC, aprovecharon rápidamente, y se dan los primeros ataques a los puestos policiales panameños de la frontera entre Panamá y Colombia, en la provincia de Darién. Tras estos ataques y la introducción de estas organizaciones paramilitares provenientes de Colombia en territorio panameño, hizo que el estado empezara a prestarle mas atención a sus fronteras, por lo que se fueron creando varias instituciones que buscaban tratar de afrontar la seguridad fronteriza de Panamá, tales como el Servicio Especial de Fronteras en el año 1993, la Unidad Táctica de Reconocimiento y Combate en el año 1997, el "DARKUN" en el año 2000 y la Dirección Nacional de Fronteras en 2005, sin embargo, estas instituciones no fueron muy eficaces, y las organizaciones paramilitares y narcoguerrilleras seguían introduciéndose en territorio Panameño.