Conflicto armado interno de Colombia entre 1990 y 2002
Los atentados contra Estados Unidos perpetrados el 11 de septiembre de 2001 por la red Al Qaeda, opacaron la guerra contra las drogas y la activaron contra el terrorismo. Gracias a la presión del Presidente George W. Bush, el Congreso de su país autorizó en julio de 2002, la extensión de los recursos del Plan Colombia a la lucha contra los grupos armados ilegales como parte de “una campaña unificada contra el tráfico de narcóticos y las organizaciones designadas como terroristas” (FARC-EP, ELN, AUC). Además, la designación de las FARC-EP como el grupo terrorista más peligroso del hemisferio y la presunción estadounidense de sus vínculos con la ETA, el IRA y Al Qaeda, la Unión Europea incluye a las FARC-EP y a las AUC en su lista de organizaciones terroristas. El 14 de octubre del 2002, el ELN publica un comunicado donde señala su participación en una serie de enfrentamientos los municipios de San Antonio del Chamí, El Cañón y Santa Cecilia, en el departamento de Risaralda, además de anunciar que organizaciones como el Ejército Revolucionario Guevarista (ERG), el Frente Aurelio Rodríguez de las FARC-EP participan en los combates. En el comunicado no señalan las bajas de ambos lados, pero si anuncian un paro armado en la vía Pereira-Quibdó.
Fuerzas Armadas Revolucionarias de Colombia
Álvaro Uribe, inicia la implementación del "Plan Patriota", que implicó la intensificación del combate contra las FARC-EP, sosteniendo la tesis de que en Colombia no existe un conflicto armado sino una amenaza terrorista. Por su parte, las FARC-EP decidieron promover un regreso a la estrategia de guerra de guerrillas, para conservar su estructura, y evitar sufrir deserciones y operativos militares. Hacia 2002, el gobierno estimaba el número de guerrilleros de las FARC-EP en alrededor de 18 000 y, en 2005, entre 12 000 y 13 000. En 2008, el ejército estimaba que tendrían 8000 guerrilleros en sus filas. Las FARC-EP no solían mencionar cifras específicas, pero estiman que tendrían más de 20 000 hombres. Otras fuentes mencionan diferentes cifras. Se presentaron casos de falsos positivos (civiles asesinados y presentados como guerrilleros abatidos en combate). Las FARC-EP atentaron contra el Club El Nogal el 7 de febrero de 2003. y realizaron también el atentado con casa-bomba en Neiva el 14 de febrero de 2003. El 5 de mayo de 2003, asesinaron al gobernador de Antioquia, Guillermo Gaviria y a Gilberto Echeverri, secuestrados un año antes. También se registraron los atentados de la Zona Rosa de Bogotá y del Palacio de Justicia de Cali en 2008 entre otras acciones.