Variante ómicron del SARS-CoV-2
El 26 de noviembre, el Grupo Asesor Técnico de la OMS sobre la evolución del Virus SARS-CoV-2 declaró que el linaje PANGO B.1.1.529 era una variante preocupante y lo designó con la letra griega ómicron. La OMS omitió «nu» y «xi», las siguientes letras en el alfabeto griego, para evitar confusiones con la palabra inglesa "new" y evitar confusión y ofensa con el apellido chino Xi, que es el 296º apellido más común en China y el apellido del líder de dicho país. La Organización Mundial de la Salud reserva la designación «ómicron» para variantes preocupantes.
Pandemia de COVID-19 en Cuzco
Una tercera ola de contagios a nivel nacional comenzó a finales de 2021, asociada a la llegada de la variante ómicron al país el 19 de diciembre. No fue hasta el 4 de enero de 2022 cuando Hernando Cevallos oficializó el comienzo de un nuevo auge pandémico. Tras ello, varias regiones empezaron a tomar medidas a fin de detectar la cepa más contagiosa conocida de la enfermedad. Cuzco no fue la excepción y a comienzos del nuevo año, el GORE local inició las labores de preparación con relación a la tercera ola, impulsando la vacunación masiva de rezagados y personas aptas a recibir su dosis de refuerzo. Además, priorizaron la atención de los pacientes perjudicados por la enfermedad considerando el riesgo inminente que representaba la llegada de la variante al departamento. En simultáneo, la preocupación creció entre la población y autoridades, tras los últimos informes que publicaba la GERESA Cusco registrando un nuevo aumento en los casos diarios en comparación a meses anteriores, alcanzando cifras récord de más de quinientos infectados en las últimas veinticuatro horas. El 6 de enero de 2022, la GERESA local reforzó el diagnóstico temprano de casos COVID-19, ordenando la apertura de trece puntos de descarte para la toma de exámenes de COVID-19 en la provincia más populosa, Cuzco. Ese mismo día, el organismo confirmó la presencia de la cepa en un paciente de 22 años de acuerdo a un comunicado nocturno que emitieron. La información preliminar indicó que el enfermo, con domicilio en el distrito de San Jerónimo se encontraba recuperándose de la enfermedad sin padecer mayores problemas. Además, el titular de la institución, Javier Ramírez se pronunció al respecto, precisando que las brigadas de salud activaron el cerco epidemiológico con el objetivo de localizar a los contactos cercanos y directos del paciente índice. Para el término de la primera semana del 2022, Cuzco ya registraba índices de positividad que oscilaban entre el dieciséis al veintiún por ciento, percibiéndose así un acelerado incremento de casos. Ramírez señaló que de continuar la tendencia en escalada, la región podría superar la cifra del cincuenta porcentual en dicho indicador. Durante dos días consecutivos (9 y 10 de enero), el Cuzco alcanzó el millar de nuevos infectados en un día, superando el pico de contagios registrado en anteriores oleadas. Debido al desenfrenado crecimiento exponencial ocurrido en el departamento, los puntos de diagnóstico de COVID-19 de la provincia cuzqueña lucieron abarrotados de personas quienes argumentaban presentar síntomas de la enfermedad. Frente a la alta demanda, se inauguró un centro adicional de tamizaje para COVID-19 en el Estadio Inca Garcilaso de la Vega. Respecto a la crítica situación sanitaria, Jean Paul Benavente instó al gobierno de Pedro Castillo gestionar «una mejor política nacional de tratamiento contra la COVID-19 que alcance a todos los hogares peruanos». El 19 de enero, Darío Navarro, Director de la Oficina de Inteligencia Sanitaria de la GERESA Cusco, confirmó que la variante ómicron ya era la cepa predominante del virus en el departamento, desplazando así a delta. Para entonces, ómicron representaba del setenta y cinco al ochenta por ciento de los casos reportados en lo que va de transcurrido el 2022. En el caso de las pruebas remitidas semanalmente al INS para secuenciamiento genómico ocurrió un fenómeno similar; obteniendo desde un ochenta a ochenta y ocho por ciento de las muestras positivas a ómicron.El 4 de abril, la Región Policial Cusco informó a la ciudadanía que 3 mil 915 personas desacataron la orden de inmovilización social dispuesta por el gobierno, de las cuales 580 aún permanecían en calidad de detención. El Coronel Alejandro Castillo, jefe de la Región Policial Cusco hizo hincapié en que la población debe ser consciente de la situación para lograr enfrentar exitosamente la pandemia.