Proteína de la espícula (coronavirus)
Las mutaciones de la proteína de la espícula suscitan preocupación porque pueden afectar la infectividad o la transmisibilidad, o facilitar el escape inmunológico . La mutación D 614 G ha surgido de forma independiente en múltiples linajes virales y se vuelve dominante entre los genomas secuenciados; puede tener ventajas en cuanto a infectividad y transmisibilidad posiblemente debido al aumento de la densidad de los picos en la superficie viral, aumentando la proporción de conformaciones competentes para la unión o mejorando la estabilidad. Las mutaciones en la posición E 484, particularmente E 484 K, se han asociado con escape inmunológico y unión reducida de anticuerpos. La variante ómicron del SARS-CoV-2 es notable por tener un número inusualmente alto de mutaciones en la proteína de la espícula.
Variante preocupante
A fines de noviembre de 2021, el Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades había declarado cuatro variantes como "variantes preocupantes": beta, gamma, delta y B.1.1.529 (llamadas "omicron" después de que se actualizó la referencia); Mu, Lambda y AY.4.2 se nombraron Variantes de interés (VOI), mientras que había 9 Variantes bajo supervisión. 25 variantes se describieron como "desescaladas".