Abiogénesis
El concepto de un origen de la vida basado en principios naturales y no en relatos míticos o actos creativos ya aparece esbozado en varias culturas antiguas. Así, los filósofos presocráticos afirmaron que todos los seres, incluidos los vivos, surgían del arjé. Anaximandro (aprox. 610-546 a. C.) afirmaba que la vida se había desarrollado originalmente en el mar y que posteriormente esta se trasladó a la tierra, en tanto Empédocles (aprox. 490-430 a. C.) escribió sobre un origen no sobrenatural de los seres vivos. Posteriormente Lucrecio, siguiendo la doctrina epicúrea afirma en "De rerum natura", que todos los organismos surgen de Gea sin necesidad de intervención divina, y que solo los organismos más aptos han sobrevivido para tener descendencia. Aunque esta afirmación pudiera parecer una anticipación de la teoría de la selección natural, a diferencia de esta los epicúreos no admiten un origen común para todas las especies, sino más bien generaciones espontáneas para cada una de ellas. Estas ideas influyeron a varios filósofos a partir del renacimiento.
La fuente de la vida
En el siglo XXI se muestra a Tommy que planta una semilla del árbol sobre la tumba de Izzi simbolizando así la resurrección de la vida a través de la muerte. En la historia del siglo XVI, en lugar de matarlo, el sacerdote identifica a Tomás como el "Primer Padre", la deidad que se autosacrificó para crear el mundo. El sacerdote, a su vez, se presenta a sí mismo como un sacrificio, y Tomás le abre una herida en su garganta. Luego pasa a través de una puerta y encuentra el "Árbol de la Vida". Perfora el tronco con la daga maya, la savia se derrama en el suelo y una pequeña planta crece y florece en el lugar que cayó la daga. Tomando esto como una señal de rejuvenecimiento, Tomas aplica la savia a su herida abdominal y se sana. A continuación, bebe la savia sólo para derrumbarse con hojas y flores que llenan su cuerpo y es enterrado junto al "Árbol de la Vida". En el futuro se muestra a Tom pasando por el corazón de la nebulosa Xibalba y quedar en paz con el pensamiento de su muerte inminente, la estrella explota y el árbol florece una vez más.