Orden Franciscana
A partir de 1210 san Francisco de Asís tuvo su residencia habitual en la iglesia de Porciúncula, en Asís, Italia. Santa Clara, una joven muchacha noble de Asís, y su amiga Pacífica se hicieron seguidoras de san Francisco en 1212. Posteriormente, otras mujeres siguieron su ejemplo. La Segunda Orden de San Francisco fue fundada para las religiosas. El obispo Guido de Cortona les entregó a estas monjas la iglesia de San Damián en Asís. En 2011 había unas 20 000 monjas clarisas en 75 países.
Orden Franciscana Seglar
San Francisco de Asís fue un ejemplo para clérigos y laicos y muchos siguieron esa forma de vida. En 1209 san Francisco fundó su Primera Orden para hombres, con un estilo de vida apostólico, y en 1212 fundó la Segunda Orden para mujeres bajo el modelo de la vida contemplativa. En el año 1221 después del interés de laicos por la vida evangélica de Francisco de Asís, funda la Orden de Hermanos y Hermanas de la Penitencia (hoy llamada Orden Franciscana Seglar), dando como norma de vida el vivir el Evangelio, documentado en la Primera Carta a Todos los Fieles (considerada como la Protoregla de la OFS). Más adelante, en el mismo año 1221, el papa Honorio III aprobó el "Memorial del propósito de los hermanos y hermanas de penitencia que viven en sus propias casas", primera norma usada por la orden de penitencia franciscana. Fue aprobada canónicamente en 1223 y fue llamada Tercera Orden en 1230. El papa Nicolás IV con la bula "Supra Montem" del 18 de agosto de 1289 aprueba una nueva Reforma de la Regla.