Patagonia chilena
Según la división política del país, comprende la provincia de Palena y las regiones de Aysén y de Magallanes (sin el Territorio Chileno Antártico). Actualmente se prefiere diferenciar del territorio situado más al norte del golfo del Corcovado (región de los Lagos), limitando este con el territorio de la Patagonia chilena. No obstante, desde la geología, estudios demuestran la condición de conjunción y unidad geológica del macizo surpatagónico con el macizo norpatagónico, determinando, en consecuencia, el límite norte de la Patagonia en la falla de Huincul, incorporándose por ende, la Región de Los Ríos, y la Región de la Araucanía (Schilling et al, 2017).
Región de la Patagonia
La conducción política de la región reside en la asamblea de gobernadores, integrada por los gobernadores de las provincias firmantes. El tratado reconoce la existencia previa del Parlamento Patagónico, que fue creado el 1 de noviembre de 1991 como instancia de debate legislativo formado por todos los legisladores provinciales de las provincias patagónicas. El tratado no tiene la previsión de incorporación de nuevas provincias a la región. El tratado fundacional menciona la existencia de dos subregiones: Patagonia Norte y Patagonia Sur, sin especificar qué provincias integran cada una.