Historia territorial del Perú
Producida la disolución de la Confederación, décadas más tarde el Perú tuvo que afrontar el conflicto bélico más importante de su historia, producido entre los años 1879 y 1883. Es conocida esta conflagración bélica como la Guerra del Pacífico o Guerra del Salitre, que enfrentó a la alianza conformada por Bolivia y Perú contra Chile. Derrotada la alianza, Perú perdió la soberanía sobre las provincias de Tarapacá, Arica y temporalmente la posesión parcial de las provincias de Tacna y Tarata. En 1925 Chile desocupó la provincia de Tarata. Recién en 1929, en virtud al Tratado de Lima, recuperó el departamento de Tacna, perdiéndose definitivamente la Provincia de Arica. Con la guerra del Pacífico, se cierran los conflictos bélicos del Perú en el siglo XIX.
Ocupación del Perú durante la Guerra del Pacífico
Como resultado de la batalla antes mencionada, ambos bandos sufrieron muchas bajas y las tropas peruanas pronto se retiraron a la cercana |Tarapacá. Sin embargo, el avance chileno continuó y se reanudó la lucha en la batalla homónima, donde las tropas defensoras se vieron victoriosas y las tropas chilenas se vieron obligadas a retirarse. La victoria, sin embargo, no tuvo efecto en la campaña general. Los aliados partieron de Tarapacá, retirándose por el noroeste hasta Arica en la costa, avanzando por la zona cercana a las montañas para evitar el ataque de la caballería chilena. Marcharon durante veinte días a costa de seis bajas. Por lo tanto, a pesar de la derrota, Chile aseguró la provincia de Tarapacá. Esta ocupación de las provincias del sur del país tuvo éxito en que Chile pudo llevar a cabo sus planes de usarlas como palanca contra el gobierno peruano durante la guerra, concediendo la mayor parte del territorio a Chile, mientras que Tacna, casi en en su totalidad, retornó al Perú