Manuel Marulanda Vélez
Al igual que los demás bandos en el Conflicto armado interno en Colombia, las FARC-EP que Marulanda dirigía cometieron abusos contra otros combatientes y contra la población civil a lo largo de la guerra. Organizaciones no gubernamentales calculan que su responsabilidad correspondería a alrededor del 20 por ciento (de 15 a 25 según los diferentes momentos) de los asesinatos políticos anuales en el conflicto. A las FARC-EP también se las considera responsables de un alto número de detenciones de guerra, de reclutamientos de menores, de la colocación de minas antipersonales y de actos de terrorismo. Las FARC-EP están en la lista de organizaciones consideradas como terroristas por el Departamento de Estado de los Estados Unidos y en su equivalente dentro de la Unión Europea. Las Naciones Unidas han condenado varias de sus acciones como crímenes de guerra.
Computadores de Raúl Reyes
Piedad Córdoba desmintió que ella fuera alias "Teodora" y denunció que la policía colombiana estaría negociando con exmiembros de las FARC-EP para involucrarla. La senadora ha asegurado que sus gestiones humanitarias han sido públicas y con autorización del propio presidente de la república. El 22 de mayo de 2008, Córdoba dijo estar dispuesta a responder ante la Corte Suprema de Justicia de Colombia cualquier cargo en su contra por los presuntos nexos con las "Farc-política", después de que la Fiscalía General de la Nación compulsara copias para que se le investigue. Córdoba se refirió a la Farcpolítica como una "cortina de humo" para tergiversar la atención sobre la "Yidispolítica".