Tomás Cipriano de Mosquera
Asimismo, se eligió a Mosquera para terminar el primer bienio de gobierno de los Estados Unidos de Colombia, hasta el 1° de abril de 1864. Mosquera fue ratificado en el cargo luego de la abolición de su antiguo cargo.En este tercer mandato, debió enfrentar una guerra con Ecuador, para lo cual comandó personalmente el ejército colombiano, logrando la victoria final en la Batalla de Cuaspud en diciembre de 1863. Esta victoria sobre el General Juan José Flores, también héroe de la independencia de la Nueva Granada, llevó al Congreso de la República a decretar una inédita ley de honores, mediante la cual lo nombraban 'Gran General de los Estados Unidos de Colombia'.
Agustín Codazzi
Habiendo llegado Codazzi a la Nueva Granada, un antiguo amigo suyo de las Guerras de Independencia, el general Tomás Cipriano de Mosquera, se puso inmediatamente en contacto con el. Debido al auge que por aquel entonces tomaba la acción de abrir un canal en el istmo de Panamá, Mosquera tenía en mente realizar una gran empresa científica que no solo incluyera la cartografía del istmo sino de toda la república, con su correspondiente descripción física, económica y demográfica, y ya que había conocido la obra de Codazzi en Venezuela pensaba que este podría hacer un trabajo similar al hecho en ese país, pero de mayores proporciones.