Terrorismo de extrema izquierda
Las Fuerzas Armadas Revolucionarias de Colombia - Ejército del Pueblo (FARC-EP) fueron entre 1964 y 2016 una organización marxista-leninista en Colombia involucrada en atentados terroristas, bombas de cilindro de gas, asesinatos, minas terrestres, secuestros, extorsiones y tomas guerrilleras, así como acciones de guerrilla y militares convencionales. El Departamento de Estado de Estados Unidos incluyó a las FARC-EP en su lista de organizaciones terroristas extranjeras (hasta 2021), al igual que la Unión Europea (hasta 2017). Se financiaba principalmente a través de la extorsión, el secuestro y su participación en el tráfico ilegal de drogas. Las empresas que operan en áreas rurales, incluidos los intereses agrícolas, petroleros y mineros, debían pagar "vacunas" (pagos mensuales) que las "protegían" de ataques y secuestros posteriores. También realizaron bloqueos de carreteras o "pescas milagrosas" con secuestros masivos. Se estima que entre el 20 y el 30 por ciento de los combatientes de las FARC-EP eran menores entre 12 y 18 años, para un total de alrededor de 5000 niños víctimas de reclutamiento forzado.
Servicio Nacional de Fronteras
Debido a la nula presencia de las autoridades panameñas en sus fronteras con Colombia y Costa Rica en la década de los 90 y el enfoque de los gobiernos hacia temas de mayor relevancia del estado panameño, se descuidan las fronteras de Panamá, cosa que las organizaciones paramilitares y narcoguerrilleras como las FARC, aprovecharon rápidamente, y se dan los primeros ataques a los puestos policiales panameños de la frontera entre Panamá y Colombia, en la provincia de Darién. Tras estos ataques y la introducción de estas organizaciones paramilitares provenientes de Colombia en territorio panameño, hizo que el estado empezara a prestarle mas atención a sus fronteras, por lo que se fueron creando varias instituciones que buscaban tratar de afrontar la seguridad fronteriza de Panamá, tales como el Servicio Especial de Fronteras en el año 1993, la Unidad Táctica de Reconocimiento y Combate en el año 1997, el "DARKUN" en el año 2000 y la Dirección Nacional de Fronteras en 2005, sin embargo, estas instituciones no fueron muy eficaces, y las organizaciones paramilitares y narcoguerrilleras seguían introduciéndose en territorio Panameño.