Proteína de la espícula (coronavirus)
Las mutaciones de la proteína de la espícula suscitan preocupación porque pueden afectar la infectividad o la transmisibilidad, o facilitar el escape inmunológico . La mutación D 614 G ha surgido de forma independiente en múltiples linajes virales y se vuelve dominante entre los genomas secuenciados; puede tener ventajas en cuanto a infectividad y transmisibilidad posiblemente debido al aumento de la densidad de los picos en la superficie viral, aumentando la proporción de conformaciones competentes para la unión o mejorando la estabilidad. Las mutaciones en la posición E 484, particularmente E 484 K, se han asociado con escape inmunológico y unión reducida de anticuerpos. La variante ómicron del SARS-CoV-2 es notable por tener un número inusualmente alto de mutaciones en la proteína de la espícula.
Virus Coxsackie B
Normalmente, los enterovirus solo producen infecciones agudas que desaparecen rápidamente debido a la respuesta inmunitaria adaptativa. Sin embargo, las mutaciones que los enterovirus de serotipo B como el virus Coxsackie B y los echovirus adquieren en el portador durante la fase aguda pueden transformar estos virus en la forma no citolítica (también conocida como no citopática o enterovirus defectivo). Esta forma es una cuasiespecie mutada del enterovirus que es capaz de causar una infección persistente en las mucosas humanas, que se ha observado en la miocarditis crónica o en la cardiomiopatía dilatada. En estas infecciones persistentes, el ARN vírico aparece a niveles muy bajos y algunos investigadores creen que es solo un resto debilitado de la infección aguda, aunque otros piensan que podría tener efectos patológicos.