Formación del Ejército del Norte
El 11 de septiembre de 1809 el nuevo virrey Baltasar Hidalgo de Cisneros había reducido aún más las milicias de Buenos Aires y había destinado el 4 de octubre a parte de ellas a sofocar las llamadas revoluciones de Chuquisaca y La Paz en el Alto Perú. La Primera Junta contaba con la infantería veterana que estaba representada por el Regimiento de Infantería de Buenos Aires ("El Fijo"), que se hallaba disminuido debido a que también algunas de sus compañías fueron enviadas por Cisneros al Alto Perú. La caballería estaba compuesta por el Regimiento de Dragones de Buenos Aires y el de Cuerpo de Blandengues de la Frontera. La artillería sólo contaba con algunas compañías del Real Cuerpo de Artillería distribuidas por el virreinato.
Charleston (Carolina del Sur)
Los cadetes de ambas instituciones continuaron ayudando al ejército confederado, ayudando a los reclutas, fabricando la munición, protegiendo depósitos y guardando a presos de la unión. En diciembre de 1864 la Ciudadela y el arsenal ordenaron a los cadetes unirse a las fuerzas confederadas en Tullifinny Creek, Carolina del Sur, donde se reengancharon a las batallas contra las unidades que avanzaban del ejército general de W. T. Sherman, sufriendo ocho muertes. La ciudad tomó el control de la fortaleza Sumter, convirtiéndose en el centro para el funcionamiento del bloqueo siendo el lugar de la primera guerra submarina cuando el 17 de febrero de 1864 el H.L. Hunley efectuó un ataque exitoso durante la noche contra el USS Housatonic. En 1865, las tropas de la unión se movieron en la ciudad, y tomaron el control de muchos sitios, tales como el arsenal, que el ejército confederado había tomado en el brote de la guerra. El departamento de guerra también confiscó los argumentos y los edificios de la academia militar de la Ciudadela, que fue utilizada como guarnición federal durante 17 años, hasta devolución al estado y la reapertura como universidad militar en 1882.