Prokaryota
La respiración anaerobia es diversa y arcaica, en lugar del oxígeno usa generalmente como aceptor una sustancia inorgánica como nitrato, azufre, sulfato, tiosulfato, CO, Fe, Mn, seleniato, arseniato, y rara vez una sustancia orgánica como fumarato, DMSO, TMAO o clorobenzoato. Según su respiración los procariontes pueden ser:Los organismos heterótrofos tienen generalmente metabolismo aerobio (que respiran oxígeno); y como la oxidación de la glucosa y otras sustancias libera mucha más energía que su utilización anaerobia, los seres aerobios pronto se convirtieron en los organismos dominantes en la Tierra por la mayor energía que se obtiene con este tipo de respiración.
Aerobio estricto
Un aerobio estricto es un organismo que requiere de oxígeno para su crecimiento. A través de la respiración celular, aquellos organismos usan el oxígeno para metabolizar sustancias como azúcares y grasas para producir energía. En este proceso, el oxígeno sirve como aceptor terminal de electrones en la cadena de transporte. La respiración aeróbica presenta la ventaja de producir más energía en forma de ATP que la fermentación o la respiración anaeróbica, pero los obliga a soportar niveles más altos de estrés oxidativo. Entre los organismos, casi todos los animales, la mayoría de los hongos y varias bacterias son aerobios estrictos. Entre los ejemplos de bacterias aerobias estrictas se encuentran Mycobacterium tuberculosis (acid-fast), "Pseudomonas aeruginosa" (Gram-negativa), "Bacillus" (Gram-positiva), y "Nocardia asteroides" (Gram-positiva). [Con la excepción de las levaduras, la mayoría de los hongos son aerobios esrictos y casi todas las algas son aerobios estrictos.