Tomás Cipriano de Mosquera
Asimismo, se eligió a Mosquera para terminar el primer bienio de gobierno de los Estados Unidos de Colombia, hasta el 1° de abril de 1864. Mosquera fue ratificado en el cargo luego de la abolición de su antiguo cargo.En este tercer mandato, debió enfrentar una guerra con Ecuador, para lo cual comandó personalmente el ejército colombiano, logrando la victoria final en la Batalla de Cuaspud en diciembre de 1863. Esta victoria sobre el General Juan José Flores, también héroe de la independencia de la Nueva Granada, llevó al Congreso de la República a decretar una inédita ley de honores, mediante la cual lo nombraban 'Gran General de los Estados Unidos de Colombia'.
Tomás Cipriano de Mosquera
Con el fracaso de su tercer intento para reelegirse, viajó a París como embajador del gobierno de Murillo, donde aprovechó para visitar a su hermano Joaquín, que estaba allí sometiendose a un tratamiento médico, y a sus otros parientes, que vivían con Joaquín. En esa misma época pasó una temporada en Londres, ciudad en la cual publicó el libro "Compendio de geografía general política, física y especial de los Estados Unidos de Colombia, dedicado al Congreso General de la Unión".