Origen del hombre
"El origen del hombre" de 1871 (en inglés "The Descent of Man, and Selection in Relation to Sex") es el segundo libro sobre la teoría de la evolución de Darwin. Después de su libro de 1859, "El origen de las especies" escribió "El origen del hombre", donde aplica la teoría de la evolución de la selección natural a la evolución humana hace especial hincapié en la importancia de la selección sexual. Aborda otros aspectos sobre psicología evolutiva, ética evolutiva, diferencias entre las distintas razas de seres humanos así como el papel dominante de la mujer en la elección de compañeros de apareamiento. Al final del libro indica cual es la principal conclusión en relación al origen del hombre:
Teoría simbiogenética
En la formulación de la teoría simbiogénetica, Margulis consideró además que, al igual que las eucariotas surgieron como consecuencia de la interacción simbiogenetica de varias procariotas (bacterias), muchas de las características de los organismos y su especiación serían también el resultado de parecidas interacciones simbigenéticas en las cuales se produjo una transferencia genética horizontal; defendiendo que la simbiogénesis sería la principal fuente de novedad biológica. Esta teoría contradice abiertamente la actual teoría de la síntesis evolutiva moderna, actualmente aceptada como válida por la comunidad científica para explicar la evolución de la vida. Margulis objetó que la novedad biológica se debiera principalmente a errores (mutaciones aleatorias) en la replicación de ADN: