Patagonia chilena
Según la división política del país, comprende la provincia de Palena y las regiones de Aysén y de Magallanes (sin el Territorio Chileno Antártico). Actualmente se prefiere diferenciar del territorio situado más al norte del golfo del Corcovado (región de los Lagos), limitando este con el territorio de la Patagonia chilena. No obstante, desde la geología, estudios demuestran la condición de conjunción y unidad geológica del macizo surpatagónico con el macizo norpatagónico, determinando, en consecuencia, el límite norte de la Patagonia en la falla de Huincul, incorporándose por ende, la Región de Los Ríos, y la Región de la Araucanía (Schilling et al, 2017).
Patagonia argentina
Históricamente la Patagonia argentina comprendió el territorio nacional llamado Gobernación de la Patagonia, sus límites contenían a La Pampa -una de las razones de la provincia para ser incluida- y todo el sur de la Provincia de Buenos Aires hasta el Cabo de Hornos. Poseía su capital en la actual Viedma y posteriormente se escindió de la Gobernación de La Pampa.