Spider-Woman (personaje de Ultimate Marvel)
Spider-Woman es un clon genéticamente modificado de Peter Parker cuyos cromosomas fueron manipulados para hacerlos biológicamente femeninos. Creado junto a Kaine para actuar como agentes de la CIA (nombre clave: Spider-Woman), conservan los recuerdos y el amor de Peter por Mary Jane Watson, viéndose a sí mismos como Peter Parker. La intención de sus creadores era borrar sus recuerdos e implantar otros nuevos, pero ambos escaparon antes de que el proceso pudiera llevarse a cabo.El Doctor Octopus se revela como el autor intelectual de los experimentos que los crearon. Los tres luchan juntos contra el Doctor Octopus y finalmente prevalecen. Peter se rinde a Nick Fury mientras los clones optan por huir.Al cierre de la historia, Spider-Woman decide comenzar una nueva vida aparte de Peter, se despide de él después de lo que llaman "el abrazo más incómodo de la historia", estableciendo una relación similar a la de un hermano.
Spider-Man
Las publicaciones de la década de 2000 muestran varios sucesos en la vida personal de Parker; por ejemplo, su separación de Mary Jane, la revelación de su identidad como Spider-Man ante su Tía May, el descubrimiento de que el Duende Verde tuvo un par de hijos con Gwen y un empleo como profesor en la misma universidad donde culminó sus estudios. Ahí conoce a Ezekiel Sims, un sujeto con poderes similares a los del héroe arácnido, quien le sugiere que tales habilidades podrían remontarse a un antiguo espíritu totémico. Eventualmente Spider-Man se integra a Los Nuevos Vengadores y se muda a la Torre Stark para trabajar como asistente de Iron Man, mientras retoma su antiguo empleo en "Daily Bugle". Como parte de los sucesos de la serie "Civil War", el hombre araña y otros superhéroes son obligados a revelar públicamente sus identidades debido a una iniciativa gubernamental. Las diferencias ideológicas con relación a esta medida conducen a un conflicto entre los héroes, primordialmente entre aquellos que avalan la iniciativa y los que la rechazan, encabezados por Iron Man y Capitán América, respectivamente. Tras ser herida de gravedad por Kingpin, Parker formaliza un pacto con Mefisto para salvar la vida de su tía May, a cambio de borrar todos sus recuerdos matrimoniales con Mary Jane y de los sucesos más recientes, incluidos los de "Civil War".