Romaniotes
La mayor parte de la población judía griega fue asesinada en el Holocausto después de que las potencias del Eje ocuparon Grecia durante la Segunda Guerra Mundial. La mayoría de los judíos griegos fueron deportados a los campos de concentración, donde fueron asesinados. Después de la guerra, los supervivientes emigraron principalmente a Israel, Estados Unidos y Europa Occidental. Hoy en día un total de solamente 4.500 a 6.000 judíos, tanto romaniotes como de ascendencia sefardita, permanecen en Grecia.
Trenes del Holocausto
Bulgaria se unió a las potencias del Eje en marzo de 1941 y participó en la invasión de Yugoslavia y Grecia. El gobierno búlgaro estableció campos de tránsito en Skopie, Blagóevgrad y Dupnitsa para los judíos de la antigua provincia serbia de Vardar Banovina y Tracia (la actual Macedonia del Norte y Grecia). Las "deportaciones al este" de 13,000 reclusos, principalmente al campo de exterminio de Treblinka, comenzaron el 22 de febrero de 1943, predominantemente en vagones de pasajeros. En cuatro días, unos 20 trenes partieron en condiciones de hacinamiento severas hacia Polonia, requiriendo que cada tren se detenga diariamente para arrojar los cuerpos de los judíos que murieron durante las últimas 24 horas en las que iban en el tren. En mayo de 1943, el gobierno búlgaro liderado por el rey Boris III expulsó a 20,000 judíos de Sofía y, al mismo tiempo, hizo planes para deportar a los judíos de Bulgaria a los campos, de conformidad con un acuerdo con Alemania.