Historia territorial del Perú
Producida la disolución de la Confederación, décadas más tarde el Perú tuvo que afrontar el conflicto bélico más importante de su historia, producido entre los años 1879 y 1883. Es conocida esta conflagración bélica como la Guerra del Pacífico o Guerra del Salitre, que enfrentó a la alianza conformada por Bolivia y Perú contra Chile. Derrotada la alianza, Perú perdió la soberanía sobre las provincias de Tarapacá, Arica y temporalmente la posesión parcial de las provincias de Tacna y Tarata. En 1925 Chile desocupó la provincia de Tarata. Recién en 1929, en virtud al Tratado de Lima, recuperó el departamento de Tacna, perdiéndose definitivamente la Provincia de Arica. Con la guerra del Pacífico, se cierran los conflictos bélicos del Perú en el siglo XIX.
James G. Blaine
Al mismo tiempo, esperaba negociar una paz en la guerra del Pacífico entre Bolivia, Chile y Perú. Se mostró a favor de una resolución que no daría lugar a que Perú perdiera territorio, pero Chile, que en 1881 había ocupado Lima, rechazó cualquier negociación en la que no obtuvieran nada. También buscó expandir la influencia estadounidense en otras áreas, solicitando la renegociación del Tratado Clayton-Bulwer para permitir que Estados Unidos construya un canal a través de Panamá sin la participación de los británicos, así como intentar reducir la participación británica en el Reino de Hawái. Sus planes para la participación de Estados Unidos en el mundo se extendían incluso más allá del hemisferio occidental, mientras buscaba tratados comerciales con la Corea de la Dinastía Joseon y el Reino de Imerina de la isla de Madagascar.