Variante ómicron del SARS-CoV-2
En España, en la semana del 6 al 12 de diciembre de 2021 se comprobó mediante secuenciación de muestras aleatoria del virus en contagiados que el 47.2 % de las muestras correspondían a la variante ómicron. Las muestras de ómicron en la semana del 29 de noviembre al 5 de diciembre de 2021 fueron del 3.4 %. De esta forma se sigue apuntando a las hipótesis iniciales de la mayor capacidad de propagación de esta variante respecto a la delta.
Variante ómicron del SARS-CoV-2
La variante tiene una gran cantidad de mutaciones, algunas de las cuales son preocupantes. Treinta y dos de estas mutaciones afectan a la proteína de la espícula. Dicha espícula es el principal objetivo antigénico de los anticuerpos generados por infecciones y de la mayoría de las vacunas administradas hasta 2021. Muchas de esas mutaciones no se habían observado en otras cepas. La variante se caracteriza por 30 cambios de aminoácidos, tres pequeñas supresiones y una pequeña inserción en la proteína de la espícula en comparación con el virus original, de los cuales 15 están ubicados en el dominio de unión al receptor (residuos 319-541). También lleva una serie de cambios y supresiones en otras regiones genómicas. Es de destacar que la variante tiene tres mutaciones en el sitio de división de la furina. El sitio de escisión de la furina aumenta la infectividad del SARS-CoV-2. Las mutaciones por región genómica son las siguientes: