Manuel Marulanda Vélez
Al igual que los demás bandos en el Conflicto armado interno en Colombia, las FARC-EP que Marulanda dirigía cometieron abusos contra otros combatientes y contra la población civil a lo largo de la guerra. Organizaciones no gubernamentales calculan que su responsabilidad correspondería a alrededor del 20 por ciento (de 15 a 25 según los diferentes momentos) de los asesinatos políticos anuales en el conflicto. A las FARC-EP también se las considera responsables de un alto número de detenciones de guerra, de reclutamientos de menores, de la colocación de minas antipersonales y de actos de terrorismo. Las FARC-EP están en la lista de organizaciones consideradas como terroristas por el Departamento de Estado de los Estados Unidos y en su equivalente dentro de la Unión Europea. Las Naciones Unidas han condenado varias de sus acciones como crímenes de guerra.
Servicio Nacional de Fronteras
Debido a la nula presencia de las autoridades panameñas en sus fronteras con Colombia y Costa Rica en la década de los 90 y el enfoque de los gobiernos hacia temas de mayor relevancia del estado panameño, se descuidan las fronteras de Panamá, cosa que las organizaciones paramilitares y narcoguerrilleras como las FARC, aprovecharon rápidamente, y se dan los primeros ataques a los puestos policiales panameños de la frontera entre Panamá y Colombia, en la provincia de Darién. Tras estos ataques y la introducción de estas organizaciones paramilitares provenientes de Colombia en territorio panameño, hizo que el estado empezara a prestarle mas atención a sus fronteras, por lo que se fueron creando varias instituciones que buscaban tratar de afrontar la seguridad fronteriza de Panamá, tales como el Servicio Especial de Fronteras en el año 1993, la Unidad Táctica de Reconocimiento y Combate en el año 1997, el "DARKUN" en el año 2000 y la Dirección Nacional de Fronteras en 2005, sin embargo, estas instituciones no fueron muy eficaces, y las organizaciones paramilitares y narcoguerrilleras seguían introduciéndose en territorio Panameño.