Tomás Cipriano de Mosquera
Asimismo, se eligió a Mosquera para terminar el primer bienio de gobierno de los Estados Unidos de Colombia, hasta el 1° de abril de 1864. Mosquera fue ratificado en el cargo luego de la abolición de su antiguo cargo.En este tercer mandato, debió enfrentar una guerra con Ecuador, para lo cual comandó personalmente el ejército colombiano, logrando la victoria final en la Batalla de Cuaspud en diciembre de 1863. Esta victoria sobre el General Juan José Flores, también héroe de la independencia de la Nueva Granada, llevó al Congreso de la República a decretar una inédita ley de honores, mediante la cual lo nombraban 'Gran General de los Estados Unidos de Colombia'.
Lino de Pombo
En 1828, Perú invadió la frontera con Ecuador, que aún formaba parte de la Gran Colombia. Esta situación fue aprovechada por José María Obando y José Hilario López para alzarse en armas contra Simón Bolívar, que se encontraba en medio del caos político derivado de la Conspiración Septembrina. En apoyo del Libertador, Pombo marchó hacia el sur del país con las tropas del General Tomás Cipriano de Mosquera para reprimir el levantamiento, objetivo que no fue alcanzado. Previendo la inminente captura de Mosquera, Pombo se lanza al bando enemigo y encara a sus cabecillas, con quienes negocia arriesgadamente mientras Mosquera se pone a salvo, logrando huir en dirección a La Plata.