Romaniotes
La mayor parte de la población judía griega fue asesinada en el Holocausto después de que las potencias del Eje ocuparon Grecia durante la Segunda Guerra Mundial. La mayoría de los judíos griegos fueron deportados a los campos de concentración, donde fueron asesinados. Después de la guerra, los supervivientes emigraron principalmente a Israel, Estados Unidos y Europa Occidental. Hoy en día un total de solamente 4.500 a 6.000 judíos, tanto romaniotes como de ascendencia sefardita, permanecen en Grecia.
Holocausto en Eslovaquia
En los días posteriores al anuncio del Primer Premio de Viena, estallaron disturbios antisemitas en Bratislava; los periódicos justificaron los disturbios con el supuesto apoyo de los judíos a Hungría durante las negociaciones de la partición. Adolf Eichmann, un funcionario nazi que había sido enviado a Bratislava, fue coautor de un plan con Tiso y otros políticos del HSĽS para deportar a los judíos empobrecidos y extranjeros al territorio cedido a Hungría. Mientras tanto, los judíos con un patrimonio superior a 500.000 coronas checoslovacas (Kčs) fueron arrestados en un intento infructuoso de evitar la fuga de capitales.  Entre el 4 y el 7 de noviembre fueron deportados entre 4.000 y 7.600 judíos, en una operación caótica, similar a un pogromo, en la que participaron la Guardia Hlinka, la Freiwillige Schutzstaffel y el Partido Alemán. Entre los deportados había niños pequeños, ancianos y mujeres embarazadas. Pocos días después, Tiso canceló la operación; la mayoría de los judíos pudieron regresar a sus hogares en diciembre. Más de 800 fueron confinados en campos de tiendas improvisados en Veľký Kýr, Miloslavov y Šamorín, en la nueva frontera eslovaco-húngara, durante el invierno. Las deportaciones eslovacas se produjeron justo después de la deportación por parte de Alemania de miles de judíos polacos, atrajeron la crítica internacional, redujeron la inversión británica, aumentaron la dependencia del capital alemán y fueron un ensayo para las deportaciones de 1942. Al principio, muchos judíos creyeron que las medidas adoptadas contra ellos serían temporales. Sin embargo, algunos intentaron emigrar y llevarse sus bienes. Entre diciembre de 1938 y febrero de 1939, más de 2,25 millones de Kčs fueron transferidos ilegalmente a las tierras checas, los Países Bajos y el Reino Unido; otras cantidades fueron transferidas legalmente. Los funcionarios del gobierno eslovaco aprovecharon las circunstancias para comprar las propiedades de los emigrantes judíos ricos con un descuento significativo, un precursor de la transferencia de propiedades judías patrocinada por el estado como parte de la arianización. El interés por la emigración entre los judíos aumentó tras la invasión de Polonia, ya que los refugiados judíos de este país contaron las atrocidades cometidas allí. Aunque el gobierno eslovaco animó a los judíos a emigrar, se negó a permitir la exportación de divisas, lo que hizo que la mayoría de los intentos fueran infructuosos. Ningún país estaba dispuesto a aceptar refugiados judíos, y los estrictos límites impuestos por el Reino Unido a la emigración legal a la Palestina obligatoria impidieron que los judíos buscaran refugio allí. En 1940, Bratislava se convirtió en un centro para los agentes de Aliyah Bet que organizaban la inmigración ilegal a Palestina, uno de los cuales, Aron Grünhut, ayudó a emigrar a 1.365 judíos eslovacos, checos, húngaros y austriacos. A principios de 1941, era imposible seguir emigrando; incluso a los judíos que recibían visados válidos para Estados Unidos no se les permitían visados de tránsito por Alemania. El número total de emigrantes judíos eslovacos se ha estimado entre 5,000 y 6,000. Como 45.000 vivían en las zonas cedidas a Hungría, el censo de 1940 determinó que 89,000 judíos vivían en el Estado eslovaco, el 3.4 % de la población. La arianización en Eslovaquia, la confiscación de propiedades judías y la exclusión de los judíos de la economía, se justificaba con el estereotipo (reforzado por la propaganda del HSĽS) de que los judíos obtenían su riqueza oprimiendo a los eslovacos. Entre 1939 y 1942, el régimen del HSĽS recibió un amplio apoyo popular al prometer a los ciudadanos eslovacos que se enriquecerían con las propiedades confiscadas a los judíos y otras minorías. Podían ganar una importante cantidad de dinero; en 1940, los judíos registraron más de 4.322 millones de coronas eslovacas (Ks) en propiedades (el 38% de la riqueza nacional). El proceso también se describe como "eslovaquización", ya que el gobierno eslovaco tomó medidas para garantizar que los eslovacos étnicos, y no los alemanes u otras minorías, recibieran las propiedades judías robadas. Debido a la intervención del Partido Alemán y la Alemania nazi, los alemanes étnicos recibieron el 8,3 por ciento de la propiedad robada, pero la mayoría de los solicitantes alemanes fueron rechazados, lo que pone de manifiesto la libertad de acción del gobierno eslovaco.