Genode
Los componentes de Genode utilizan y publican estados como datos estructurados serializados en XML, en contraste con los modelos de texto plano de los derivados de Unix. XML es criticado por sus características complejas, ineficaz representación y la relativa dificultad que plantea la edición manual de documentos XML. El entorno Genode usa XML de modo efectivo en todos sus componentes porque el programa genera e interpreta fácilmente XML, siendo también posible entenderlo y editarlo manualmente. El dialecto que utiliza Genode es un subconjunto simple del lenguaje XML, no obstante, algunos nuevos usuarios con frecuencia advierten de que la edición de XML resulta tediosa y proclive al error. Puesto que Genode no se basa en ninguna característica en especial de XML, el lenguaje de marcado de datos de Genode se podría sustituir por otros más simples tales como JSON o sexps. No obstante, no se han anunciado aun planes de migración.
Base de datos XML
Las bases de datos XML suelen interrogar mediante XQuery. XQuery incluye XPath como método de selección de nodos, pero de modo extendido que da capacidad de transformación. A veces los usuarios se refieren a su sintacis como FLWOR al poderse incluir en la pregunta las siguientes claúsulas: 'for', 'let', 'where', 'order by' y 'return'. Los fabricantes de SGBD relacionales -que tradicionalmente sólo proporcionan mecanismos SQL- ahora incluyen mecanismos híbridos SQL-XQuery. Esto permite interrogar los datos XML de manera análoga a los relacionales, en la misma sentencia. Esto permite combinar datos XML y relacionales.