Conflicto armado interno de Colombia entre 1990 y 2002
Los atentados contra Estados Unidos perpetrados el 11 de septiembre de 2001 por la red Al Qaeda, opacaron la guerra contra las drogas y la activaron contra el terrorismo. Gracias a la presión del Presidente George W. Bush, el Congreso de su país autorizó en julio de 2002, la extensión de los recursos del Plan Colombia a la lucha contra los grupos armados ilegales como parte de “una campaña unificada contra el tráfico de narcóticos y las organizaciones designadas como terroristas” (FARC-EP, ELN, AUC). Además, la designación de las FARC-EP como el grupo terrorista más peligroso del hemisferio y la presunción estadounidense de sus vínculos con la ETA, el IRA y Al Qaeda, la Unión Europea incluye a las FARC-EP y a las AUC en su lista de organizaciones terroristas. El 14 de octubre del 2002, el ELN publica un comunicado donde señala su participación en una serie de enfrentamientos los municipios de San Antonio del Chamí, El Cañón y Santa Cecilia, en el departamento de Risaralda, además de anunciar que organizaciones como el Ejército Revolucionario Guevarista (ERG), el Frente Aurelio Rodríguez de las FARC-EP participan en los combates. En el comunicado no señalan las bajas de ambos lados, pero si anuncian un paro armado en la vía Pereira-Quibdó.
Fuerzas Armadas Revolucionarias de Colombia
El 28 de marzo de 1984, tras una reunión de los líderes de los 27 frentes y del Estado Mayor, se establece un alto el fuego, como parte de los acuerdos firmados con el gobierno de Belisario Betancourt. Las FARC-EP formaron la Unión Patriótica (UP) junto a otros movimientos sociales y políticos del país. Las FARC-EP, como uno de sus actores principales, delegaba a varios líderes la función política, incluso se propuso a Jacobo Arenas como candidato presidencial después retirado por la situación de violencia. La UP tuvo éxito en las elecciones de 1986, por lo cual se volvió un objetivo militar de la guerra sucia. Según el informe del Centro Nacional de Memoria Histórica (CNMH) "Todo pasó frente a nuestros ojos. El genocidio de la Unión Patriótica 1984-2002." La violencia contra la Unión Patriótica dejó, por lo menos 4153 personas asesinadas, secuestradas o desaparecidas Esta violencia sistemática fue ejecutada por alianzas entre paramilitares, narcotraficantes, empresarios, funcionarios públicos Policía Nacional y Ejército Nacional lo cual llevaría a romper el proceso de paz y a la separación de las FARC-EP del experimento político de la Unión Patriótica. Estos asesinatos de los miembros de la UP fueron declarados en 2014 por la Fiscalía General de la Nación como delitos de lesa humanidad.