Variante ómicron del SARS-CoV-2
La variante ómicron (también conocida por el identificador de linaje PANGO B.1.1.529, el identificador de clado GISAID GR/484A y el identificador de clado Nextstrain 21K) es una variante del SARS-CoV-2, causante de la enfermedad COVID-19. El primer caso se detectó en Botsuana el 9 de noviembre de 2021 a partir de una muestra recogida bajo los auspicios de la Red para la Vigilancia Genómica en Sudáfrica. El 26 de noviembre de 2021 la Organización Mundial de la Salud (OMS) la designó como una variante preocupante.
Pandemia de COVID-19 en Cuzco
A mediados de junio, el Ministro Ugarte sostuvo que tras el hallazgo de la variante delta (B.1.617.2), descubierta originalmente en la India y recientemente en el departamento de Arequipa, enviaría equipos médicos del MINSA especializados en la detección de mutaciones del coronavirus a las regiones de Moquegua, Cuzco y Puno. Más tarde, a finales del mes, el Director del Hospital Regional del Cusco, Jorge Galdós Tejada descartó la presencia de la variante india en el departamento, tras el tamizaje de un caso reportado como sospechoso. El funcionario precisó que el paciente había llegado desde Arequipa, y posteriormente fue hospitalizado hasta que se produjo su deceso, una semana antes de la toma de la muestra. En julio, el médico epidemiólogo Pablo Grajeda proyectó que ante la eventual llegada de una tercera ola ocasionada por la variante delta, el Cuzco sería la región más afectada del sector sur del país, con una estimación de 2 mil 900 fallecidos en el peor escenario. El 22 de agosto, se confirmó el primer caso de la variante delta en el distrito de Pimentel, Lambayeque. La GERESA de dicha región también especificó que el paciente se trataba de un ciudadano de 30 años que retornó de un viaje a la ciudad del Cuzco en compañía de su esposa y cuñada, lo que convirtió en ese entonces al departamento del Cuzco como un posible foco de transmisión de la variante de origen indio.En medio de la incertidumbre ocasionada por la prevalencia de una nueva variante del COVID-19 transmitiéndose en el territorio, la compañía cinematográfica "Paramount Pictures", por intermedio de la Comisión de Promoción del Perú para la Exportación y el Turismo (PromPerú) confirmó al Perú como uno de los escenarios para la grabación de la película de la nueva saga de "". Dos de las locaciones previstas para el rodaje da la cinta, eran el departamento de San Martín y Cuzco. La última región mencionada, incluía ubicaciones tales como la ciudad imperial y Machu Picchu. De esta manera, la presidenta ejecutiva de PromPerú, Amora Carbajal, resaltó que la elección de estos dos puntos del país «servirían como una estrategia para impulsar el turismo y la reactivación económica». Unos meses después, la actriz peruana-estadounidense Isabela Merced, protagonista de una de las películas de la franquicia cinematográfica, se refirió a la situación, manifestando «estar emocionada y contenta». Durante las grabaciones de "Transformers: El Despertar de las Bestias", uno de los personajes del filme, Optimus Prime fue objeto de burlas en redes sociales luego de protagonizar una escena en donde el vehículo tuvo dificultades al subir la Cuesta de Santa Ana, cerca del Centro Histórico de la ciudad. El incidente causó gracia entre los internautas quienes atribuyeron el traspié al mal de altura que genera la notable elevación del lugar. En octubre, la Cámara de Comercio y la Municipalidad Provincial del Cusco revelaron que las grabaciones de "Transformers: El Despertar de las Bestias" y "La Reina del Sur" generaron ingresos económicos valorizados en S/ 12 millones (aproximadamente US$ 3 millones).Los primeros indicios del comienzo de una tercera ola fueron expuestos por el Ministro de Salud, Hernando Cevallos, el 16 de agosto cuando anunció que se registraron un mayor número de contagiados con la variante B.1.617.2 en el territorio nacional. El 4 de septiembre, el Ministro de Salud anunció la identificación de la variante Mu (B.1.621) en quince regiones del país, en las que se encontraba el Cuzco teniendo un caso confirmado de dicha variante. El anuncio se dio mientras la OMS mantiene en vigilancia a la mutación procedente de Colombia. Al día siguiente, durante la supervisión de la sexta edición de la «Vacunatón» llevada a cabo en el departamento, el gobernador de la región reconoció que se habían registrado tres casos de la variante Delta en la circunscripción, hallándose uno en el distrito de Wánchaq, otro en San Sebastián y un último en Saylla. Según la Plataforma de Georreferenciación de Casos de la Variante de Preocupación B.1.6.17.2, proporcionada por el INS, respecto a la actualización correspondiente al 4 de septiembre, de los 3 casos, todos presentaron como síntomas; tos, fiebre, escalofríos, malestar general y cefalea. Dos tercios de los casos, mostraron tener anosmia. El 6 de septiembre, autoridades del GORE Cusco presentaron un plan de respuesta ante una posible tercera ola ocasionada por la COVID-19, que estaba comprendida por una serie de medidas que buscaban no saturar el sistema sanitario. Dos días más tarde, el recién asumido Gerente Regional de Salud, Javier Ramírez Escobar, confirmó la creación de un laboratorio en la región para el procesamiento genómico e identificar las variantes del SARS-CoV-2 que circulan en la macrorregión sur del Perú. Ese mismo día, el 8 de septiembre, el Gobernador del Cusco expuso ante la prensa la creación de un pasaporte COVID-19 que permitiría un conjunto de incentivos a los turistas quienes visiten el sitio y que cuenten con ambas dosis de la vacuna contra la enfermedad. En esa instancia, precisó que sería un modelo similar al que se han emitido en países extranjeros y que implicaría el libre acceso a distintos comercios. El 22 de septiembre, Escobar anunció la confirmación de cinco nuevos pacientes infectados con la variante delta, totalizando ocho casos a nivel regional. Uno de los casos procedía de Saylla, elevándose el total a dos en el distrito, ya que el primer infectado contagió a este contacto cercano, mientras que se halló otros cuatro en Wánchaq, ascendiendo la cifra a cinco. El Gerente Regional de Salud comunicó que el hallazgo masivo de nuevos casos en este último distrito se debía a que era un sector comercial de la Ciudad Imperial, además dijo que según las estimaciones realizadas, el departamento ingresaría a una tercera ola durante la tercera semana de octubre. Este anuncio se hizo juntamente cuando el INS declaró a la variante delta como la cepa predominante en la nación, desplazando así a Lambda (C.37) y Gamma. A finales de septiembre, Escobar confirmó que la variante delta era la tercera cepa predominante en la región, mientras que la variante oriunda de Brasil ocupaba el segundo lugar con 30 casos y la variante procedente del Perú, era la dominante con 170 casos. Según el INS hasta el 29 de dicho mes se registraron 15 casos, duplicándose la cifra inicial reportada hacía una semana en el departamento.A consecuencia de las festividades de fin de año, el Ministerio del Interior del Perú (MININTER) ordenó el despliegue de operativos policiales para inspeccionar e incluso ingresar a los domicilios en caso se lleven a cabo este tipo de reuniones que incitan a las concentraciones masivas de personas durante la emergencia sanitaria. El 26 de octubre, durante una reunión conformada por el Comité Provincial de Seguridad Ciudadana de Cusco (COPROSEC) en compañía de diversas autoridades de resguardo del orden, alcaldes provinciales y municipales se acordó ordenar el cierre de la Plaza de Armas y el Centro Comercial Real Plaza Cusco, debido a la aglomeración de gente y en especial, de menores de edad que generarían las locaciones frente a las fiestas que conmemoran Halloween y el Día de la Canción Criolla el 31 de octubre. La medida también aplicó a los cementerios de la ciudad, entre los que se encontraban La Almudena, San José de Huancaro y otros más, durante el 31 de octubre, 1 (Día de Todos los Santos) y 2 de noviembre. Por su parte, el Presidente del directorio de la Empresa Municipal de Festejos del Cusco (EMUFEC), Fernando Santoyo, pactó que en la Feria del Tanta Wawa y del Lechón próxima a realizarse en la Plaza San Francisco se prohibiría el consumo de bebidas alcohólicas.