Endogone
El nombre genérico se deriva de las palabras griegas "endo" (interior) y "gone" (órganos reproductivos).
Monodnaviria
La proteína Rep carece de homólogos con los organismos celulares, por lo que se puede buscar dentro del genoma de un organismo para identificar si el ADN viral se ha endogeneizado como parte del genoma del organismo. Entre los eucariotas, la endogeneización se observa con mayor frecuencia en plantas, pero también se observa en animales, hongos y varios protozoos. La endogenización puede ocurrir a través de varios medios, como la integrasa o las enzimas de transposición, o mediante la explotación de la maquinaria de recombinación de la célula huésped. La mayoría de los virus del dominio endogenizados se encuentran en regiones no codificantes del genoma del organismo, pero a veces los genes virales se expresan y el organismo puede utilizar la proteína Rep. Debido a que el ADN viral puede convertirse en parte del genoma de un organismo, esto representa un ejemplo de transferencia horizontal de genes entre organismos no relacionados que se puede utilizar para estudiar la historia evolutiva. Al comparar organismos relacionados, es posible estimar la edad aproximada de los virus de "Monodnaviria". Por ejemplo, la comparación de genomas animales ha demostrado que los circovirus y parvovirus integraron sus ácidos nucleicos en los genomas de sus huéspedes hace al menos 40-50 millones de años.