Кунсткамера
Первоначальная коллекция Кунсткамеры насчитывала более 2000 экспонатов и была куплена Петром I в 1717 году у её создателя Фредерика Рюйша, голландского анатома.Раздел включает три экспозиции, объединённые под условным названием «Музей М. В. Ломоносова». Экспозиция «Зал заседаний („Конференц-зал“) Петербургской академии наук» представляет повседневную деятельность первого научного учреждения России и биографию М. В. Ломоносова. Две другие экспозиции — «Астрономическая обсерватория Петербургской академии наук» и «Большой Готторпский Глобус-Планетарий» — освещают ранний период истории Кунсткамеры, когда в башне здания располагались Астрономическая обсерватория, служба точного времени и условная линия Петербургского меридиана.
Рудно-петрографический музей ИГЕМ РАН
Петрографический музей основан в 1930 году академиком Ф. Ю. Левинсоном-Лессингом на базе Ленинградского Геологического музея им. Петра Великого АН СССР. Коллекции Рудно-петрографического музея ИГЕМ берут свое начало от Минерального кабинета Санкт-Петербургской Кунсткамеры.
Музей в составе Петрографического института перебазировался из Ленинграда в Москву и в 1934 году разместился в Старомонетном переулке, в доме 35.