Богородичный центр
Во всех официальных заявлениях Русской православной церкви, других общественных организаций, а также ряда государственных органов власти,
а также публикациях ряда исследователей, в сообщениях СМИ Богородичный центр характеризуется как обычная секта (от псевдохристианской до тоталитарной) и/или как «деструктивная религиозная организация».
Церковь объединения
По мнению известного исследователя сект и Председателя Экспертного совета по проведению государственной религиоведческой экспертизы при Министерстве юстиции Российской Федерации А. Л. Дворкина, бывшего члена организации кандидата исторических наук, доцента ТвГУ священника Л. Семёнова, комиссии Национальной Ассамблеи Франции, доктора политологических наук, ведущего эксперта Института стратегического анализа и прогноза при КРСУ К. Маликова, является сектой, по мнению доктора медицинских наук, профессора Государственного научного центра социальной и судебной психиатрии им. В. П. Сербского. Ф. В. Кондратьева и кандидата философских наук, доцента НИУ-ВШЭ и ННГУ им. Н. И. Лобачевского, эксперта по социальному воздействию Волкова Е. Н. — также деструктивным культом.