Депортация крымских татар
Однако максимальное испытания крымского татарского народа произошло во время масштабного голода в СССР 1946—1947 годов, во время которого погибло, по оценке М. Эллмана, около 1,5 миллиона человек, из которых до 16 тысяч крымских татар. Хотя в общем числе граждан СССР погибших от голода крымских татар было невелико, но для небольшого народа это были колоссальные потери. Оценки числа погибших в этот период сильно разнятся: от 15-25 %, по оценкам различных советских официальных органов, до 46 %, по оценкам активистов крымскотатарского движения, собиравших в 1960-е годы сведения о погибших. Так, по данным ОСП УзССР, только «за 6 месяцев 1944 года, то есть с момента прибытия в УзССР и до конца года, умерло 16 052 чел. (10,6 %)».
Чеченский конфликт
31 января 1944 г. в ходе Великой Отечественной войны Государственный комитет обороны СССР принял решение о принудительном переселении всех чеченцев и ингушей в Киргизскую и Казахскую ССР в целях стабилизации обстановки в Чечено-Ингушской АССР. Массовая депортация была проведена войсками НКВД под личным руководством Л. П. Берия. Начиная с 23 февраля 1944 г., за несколько недель в целом было выселено около 650 тыс. человек. Историк Н. Ф. Бугай указывает, что не менее 144 тыс. (ок. 24 %) из них погибли в процессе депортации и в течение первых четырёх лет нахождения в ссылке). Эти цифры не учитывают повышенную смертность среди высланных в следующие годы, а также более долгосрочные демографические последствия. В Киргизию и Казахстан вынуждены были позднее направиться и чеченцы и ингуши, которые на момент депортации находились на фронте.