Минералогический музей имени А. Е. Ферсмана
В 1716 году по приказу царя Петра I в Данциге была приобретена коллекция минералов (1195 образцов), которая положила начало Минеральному кабинету Кунсткамеры в Санкт-Петербурге.
Музей Чапских
В 1937 году музей приобрёл личный архив и библиотеку Богдана Гуттен-Чапского. В дальнейшем собрание музея пополнилось коллекцией средневековых монет Виктора Виттыга, пятью тысячами монет пястовского периода Зигмунта Закжевского, античных монет из собраний Францишка Пекосинского и Кароля Галамы, тевтонскими и курляндскими монетами Петра Уминского. Вся коллекция музея демонстрировалась до 1939 года, когда в связи с началом Второй мировой войны музей был закрыт, а коллекция музея находилась в запасниках Национального музея.