Мотив (молекулярная биология)
Характерными примерами регуляции транскрипции, осуществляемой с помощью белка, распознающего специальный мотив, являются:Одними из наиболее известных примеров регуляции трансляции при помощи мотив-распознающих регуляторов являются:Сила взаимодействия белка или РНК с ДНК мотивом зависит в первую очередь от последовательности данного мотива. Различают «сильные» мотивы, дающие сильное взаимодействие с белком или РНК и «слабые» мотивы, с которыми взаимодействие слабее. Практически всегда удаётся получить так называемую «консенсусную последовательность» («консенсус»), то есть такую последовательность, в каждой позиции которой стоит буква, наиболее часто встречающаяся в соответствующей позиции во последовательностях мотивов из разных организмов. Консенсусная последовательность принимается за самую сильную, каковой она почти всегда и является. Более слабые мотивы получаются из неё с помощью небольшого (чаще всего 1—3) числа замен.
Рецептор интерлейкина 21
Белок состоит из 538 аминокислот (после созревания и отщепления сигнального пептида — 519), молекулярная масса — 59,1 кДа. Зрелый гликозилированный белок имеют молекулярную массу 80-100 кДа. N-концевой внеклеточный домен содержит 2 фибронектиновых домена 2-го типа, WSXWS мотив, от 1 до 5 участков N-гликозилирования и 1 участок C-гликозилирования. WSXWS мотив необходим для правильного свёртывания белка и, соответственно, его внутриклеточной транспортировки и связывания с цитокином. Кроме этого, триптофан-214 в WSXWS мотиве является участком маннозилирования, что необходимо для сближения двух фибронектиновых доменов. Цитозольный фрагмент содержит Box 1 мотив, который участвует во взаимодействии с JAK1.