Кунсткамера
Первоначальная коллекция Кунсткамеры насчитывала более 2000 экспонатов и была куплена Петром I в 1717 году у её создателя Фредерика Рюйша, голландского анатома.Раздел включает три экспозиции, объединённые под условным названием «Музей М. В. Ломоносова». Экспозиция «Зал заседаний („Конференц-зал“) Петербургской академии наук» представляет повседневную деятельность первого научного учреждения России и биографию М. В. Ломоносова. Две другие экспозиции — «Астрономическая обсерватория Петербургской академии наук» и «Большой Готторпский Глобус-Планетарий» — освещают ранний период истории Кунсткамеры, когда в башне здания располагались Астрономическая обсерватория, служба точного времени и условная линия Петербургского меридиана.
Губар, Павел Викентьевич
Важной частью коллекции является собрание видов русских городов, в первую очередь — Санкт-Петербурга. Историю Петербурга в коллекции последовательно отражают: гуаши и акварели Ж. Б. де ла Траверса, гравюры Б. Патерсена и М. Дюбурга Петербурга конца XVIII века; гуаши И. В. Барта 1810-х годов; акварели Е. И. Есакова, К. Ф. Сабата, А. П. Брюллова, Г. Г. Чернецова Петербурга 1820-х годов; издания А. Плюшара «Виды Петербурга и пригородов» (1824, 1825, 1826), серия литографий Общества поощрения художников, работы А. Е. Мартынова и С. Ф. Галактионова; акварели B. C. Садовникова, И. И. Шарлеманя, литографии А. Дюрана, издательская серия И. Дациаро. Петербургская тема коллекции завершена печальными аккордами: «Петербург в 21 году» М. Добужинского — альбом из 12 литографий, изданный Комитетом популяризации художественных изданий и «Петербург. Руины и возрождение» П. А. Шиллинговского (1923) — изданный Полиграфическим отделом Академии художеств альбом (10 гравюр на дереве и 7 листов литографированного текста, тираж 500 экземпляров, ручная печать).