Фотосистема I
У цианобактерий и прохлорофитов фотосистема I способна образовывать тримеры. Это способствует увеличению спектра поглощения на больших глубинах, а также более эффективному перераспределению энергии возбуждения и защите от фотоповреждений. Следует отметить, что у эукариот фотосистема I утратила эту способность благодаря наличию субъединицы H, а также мутации в субъединице L. Вместо тримерезации у эукариот она при помощи субъединиц L и G взаимодействует с большими мембранными светособирающими комплексами, которых нет у прокариот.
Фотоингибирование
Фотосистема II повреждается светом независимо от его интенсивности. Квантовый выход повреждающей реакции в типичных листьях высших растений или в препаратах тилакоидной мембраны находится в диапазоне от 10 до 10 и не зависит от интенсивности света. Это означает, что повреждается примерно один комплекс фотосистемы II на каждые 10-100 миллионов захваченных фотонов. Из этих данных следует, что фотоингибирование происходит при любой интенсивности света и константа скорости фотоингибирования прямо пропорциональна его интенсивности. Некоторые результаты указывают на то, что тусклый свет вызывает даже более сильные повреждения, чем яркий свет.