Минералогический музей имени А. Е. Ферсмана
В 1716 году по приказу царя Петра I в Данциге была приобретена коллекция минералов (1195 образцов), которая положила начало Минеральному кабинету Кунсткамеры в Санкт-Петербурге.
Башкирский государственный художественный музей имени М. В. Нестерова
В 1913 году М. В. Нестеров, уроженец Уфы, подарил родному городу уникальную коллекцию работ русских живописцев второй половины XIX — начала XX столетия, а также около тридцати собственных картин. Коллекция включала работы таких известных мастеров, как Шишкин, Левитан, Ярошенко, Коровин, Бенуа, Поленов, Архипов и многих других. Для экспозиции уфимские власти предполагали выделить специальное помещение в строившемся Аксаковском Народном доме, однако строительство существенно затянулось из-за событий Первой мировой войны и революции 1917 года. Поэтому вплоть до 1919 года нестеровское собрание находилось на хранении в Москве.