Мозжечок
Хотя мозжечок и связан с корой головного мозга, его деятельность не контролируется сознанием.
Физиологические функции таламуса
Таламус также участвует во множестве нейронных информационных цепей, необходимых для управления двигательной подсистемой, и выполняет роль ключевого подкоркового центра регуляции движений, являясь подкорковым моторным центром «высшего порядка» по отношению к мозжечку и базальным ганглиям. Благодаря исследованиям анатомии мозга приматов, удалось выяснить характер многочисленных взаимосвязей ядер таламуса с мозжечком, базальными ганглиями и моторной (двигательной) корой. Это позволило выдвинуть предположение, что таламус выполняет функцию ключевого центра связи и передачи моторной информации по специализированным каналам от базальных ганглиев и мозжечка к моторной коре. При исследовании антисаккадных движений глаз у обезьян было обнаружено, что ядра таламуса участвуют в генерации антисаккадных движений глаз.