Эукариоты
Важнейшая, основополагающая особенность эукариот связана с расположением генетического аппарата в клетке. Генетический аппарат всех эукариот находится в ядре и защищён ядерной оболочкой. ДНК эукариот линейная (у прокариот ДНК кольцевая и находится в особой области клетки — нуклеоиде, который не отделён мембраной от остальной цитоплазмы). Она связана с белками-гистонами и другими белками хромосом, которых нет у бактерий.
Пластинчатые
Несмотря на относительную простоту строения, генетический материал "Trichoplax adhaerens" содержит множество генов, присущих животным с более высоким уровнем организации. Например, вторичная структура молекулы 16S рРНК у трихоплакса существенно сложнее, чем у любых представителей типа стрекающих (Cnidaria). Ядерная ДНК трихоплакса содержит гены белков (в особенности, транскрипционных факторов), необходимых для дифференцировки различных типов клеток, развития и функционирования нервной системы, обособления клеток зародышевой линии и других аспектов развития двусторонне-симметричного организма. В ней имеются гены Hox и и другие гомеобоксные гены: , Brachyury и . У трихоплакса также есть гены, кодирующие белки сигнальных путей - и Wnt, которые чрезвычайно важны для определения осей тела в ходе развития двусторонне-симметричного организма.