Депортация чеченцев и ингушей
В качестве причин депортации официально назывались массовое сотрудничество с оккупантами, антисоветская деятельность и бандитизм. Однако вайнахи физически не могли сотрудничать с оккупантами ввиду отсутствия оккупации. Фашисты смогли захватить лишь незначительную часть Малгобекского района и довольно скоро были выбиты оттуда. Масштабы антисоветской деятельности и бандитизма в республике также не превышали аналогичных показателей в соседних регионах. Официальные данные были сфальсифицированы для оправдания действий власти. Реальные причины депортации не установлены до сих пор. Депортация народов, ликвидация их государственности и изменение границ были незаконными, поскольку не предусматривались никакими законными или подзаконными актами.
Депортация карачаевцев
Указом ПВС СССР № 115/13 от 12 октября 1943 года о ликвидации Карачаевской автономной области и об административном устройстве её территории, было постановлено всех карачаевцев проживающих на территории области, переселить в другие районы СССР, а Карачаевскую автономную область ликвидировать. Совету народных комиссаров СССР поручалось наделить карачаевцев в новых местах поселения землей и оказать им необходимую государственную помощь по хозяйственному устройству на месте. Микоян-Шахар был переименован в город Клухори.