Кунсткамера
Первоначальная коллекция Кунсткамеры насчитывала более 2000 экспонатов и была куплена Петром I в 1717 году у её создателя Фредерика Рюйша, голландского анатома.Раздел включает три экспозиции, объединённые под условным названием «Музей М. В. Ломоносова». Экспозиция «Зал заседаний („Конференц-зал“) Петербургской академии наук» представляет повседневную деятельность первого научного учреждения России и биографию М. В. Ломоносова. Две другие экспозиции — «Астрономическая обсерватория Петербургской академии наук» и «Большой Готторпский Глобус-Планетарий» — освещают ранний период истории Кунсткамеры, когда в башне здания располагались Астрономическая обсерватория, служба точного времени и условная линия Петербургского меридиана.
Музей отживающего культа
Инициатором создания музея выступило общество «Старый Петербург», образованное в 1921 году рядом известных архитекторов и учёных Петрограда. Председателем Совета общества стал директор Музея Петрограда архитектор Л. А. Ильин. В общество входили также А. Н. Бенуа, П. П. Вейнер, директор Института истории искусств В. П. Зубов, В. Я. Курбатов, П. Н. Столпянский, директор Эрмитажа С. Н. Тройницкий. Помимо Музея отживающего культа, по инициативе этого же общества в Ленинграде был создан Музей купеческого быта 40-60-х гг. XIX века.