Эукариоты
Важнейшая, основополагающая особенность эукариот связана с расположением генетического аппарата в клетке. Генетический аппарат всех эукариот находится в ядре и защищён ядерной оболочкой. ДНК эукариот линейная (у прокариот ДНК кольцевая и находится в особой области клетки — нуклеоиде, который не отделён мембраной от остальной цитоплазмы). Она связана с белками-гистонами и другими белками хромосом, которых нет у бактерий.
Институт молекулярной генетики РАН
Проводятся исследования в области эпигенетики. Изучаются молекулярно-генетические основы эффекта положения (В. А. Гвоздев) и влияния пространственной организации хроматина на экспрессию генов. Исследуются молекулярные механизмы РНК-интерференции, в частности, работа микроРНК и piРНК путей. Также изучается роль подвижных элементов в геноме дрозофилы и распространение подвижных элементов в природных популяциях бактерий. Проводятся исследования структуры и функции РНК-полимеразы бактерий. Осуществляются исследования функций генов с использованием методов генной инженерии, в том числе нокаута генов, проводится работа по генетике соматических клеток, включая эмбриональные стволовые клетки. Изучаются вопросы регуляции экспрессии генов мобильных элементов прокариот (К. В. Северинов).