Наруто
Главный герой серии, подросток Наруто Удзумаки, является носителем девятихвостого демона-лиса, запечатанного в его теле. За двенадцать лет до начала событий, излагаемых в манге, демон-лис напал на , родную деревню Наруто. Ради спасения Конохи Четвёртый Хокагэ, глава селения, пожертвовал жизнью, чтобы запечатать дух зверя внутри своего новорождённого сына Наруто. Хокагэ желал, чтобы люди считали Наруто героем, поскольку отныне он сдерживал мощь девятихвостого лиса, однако население деревни восприняло Наруто как демона во плоти и возненавидело его. Поскольку упоминать об атаке лиса было запрещено, Наруто узнал о своей необычности лишь случайно, годы спустя.
Манга делится на две части. В начале первой части Наруто с большим трудом завершает обучение и получает звание гэнина — начинающего ниндзя. Он и двое его одноклассников, Саскэ Утиха и Сакура Харуно, образуют команду под началом опытного сэнсэя Какаси Хатакэ. По мере развития сюжета Наруто находит новых друзей среди жителей деревни и овладевает новыми способностями, считая их необходимыми для того, чтобы в будущем исполнить свою мечту — стать Хокагэ. Вскоре Коноха подвергается атаке: беглый ниндзя и разыскиваемый преступник Оротимару вместе со своими приспешниками нападает на селение, убивая его главу — Третьего Хокагэ. Будучи в состоянии меняться телами с другими людьми, Оротимару желает заполучить тело Саскэ Утихи, считая его наследственные способности подходящими для себя, так как Саскэ является представителем клана Утиха, наиболее одарённого среди ниндзя. Саскэ добровольно уходит к Оротимару, полагая, что тот даст ему возможность стать сильнее и отомстить своему старшему брату Итати. До начала событий манги Итати уничтожил весь клан Утиха за исключением Саскэ, для которого месть превратилась в смысл жизни. Наруто, желая вернуть ушедшего Саскэ, покидает Коноху и посвящает себя тренировкам. Он занимается с легендарным ниндзя Дзирайей, бывшим товарищем Оротимару, чтобы подготовиться к следующей встрече и возможной битве с Саскэ.
Список отрицательных персонажей «Наруто»
Отправляется на Совет пяти Кагэ в качестве Шестого Хокагэ, где его почти выбирают председателем альянса пяти деревень ниндзя, цель которого борьба с Акацуки. Однако Ао, один из членов делегаций, с помощью бякугана узнаёт в чакре Дандзо чакру Сисуй Утихи и понимает, что Дандзо незаконным путём заполучил его сяринган. Воспользовавшись атакой Саскэ на совет он сбегает и лишается доверия остальных Кагэ. Кадзэкагэ Гаара считает, и трое других Кагэ с ним соглашаются, что Дандзо дискредитировал себя и они готовы вести дела с Какаси Хатакэ в качестве Шестого Хокагэ. Тоби, стоявший за атакой на Совет Кагэ, использует свой сяринган и сталкивает Саскэ и Дандзо лицом к лицу. В результате начавшегося боя выясняется, что рука Дандзо закована в железо, и запечатана, а под ней находится сразу десять имплантированных сяринганов. В ходе битвы он использует древесные техники Первого Хокагэ, что по мнению Тоби является результатом работы Оротимару над Дандзо, сочетая с техникой Идзанаги. Однако в итоге, израсходовав все возможности использования Идзанаги, погибает, взрывая себя, безуспешно надеясь задеть и запечатать в свой труп Саскэ. — сирота, живший в Конохе и работавший против этой деревни. Когда его обнаружили, он не помнил даже своего имени. Вскоре в приюте Кабуто встречается с Оротимару и Дандзо и становится синоби — шпионом «Анбу Нэ». После провальной миссии в Ивагакурэ Оротимару рассказывает Кабуто об истинных мотивах убийства его приемной матери, Ноно, и убеждает стать своим шпионом. Кабуто участвует в создании Отогакурэ, Деревни Звука, и становится двойным агентом Сасори и Оротимару, помогая тому собрать информацию о Акацуки, а вскоре начинает изучать способности жителей новой деревни.