Кунсткамера
Первоначальная коллекция Кунсткамеры насчитывала более 2000 экспонатов и была куплена Петром I в 1717 году у её создателя Фредерика Рюйша, голландского анатома.Раздел включает три экспозиции, объединённые под условным названием «Музей М. В. Ломоносова». Экспозиция «Зал заседаний („Конференц-зал“) Петербургской академии наук» представляет повседневную деятельность первого научного учреждения России и биографию М. В. Ломоносова. Две другие экспозиции — «Астрономическая обсерватория Петербургской академии наук» и «Большой Готторпский Глобус-Планетарий» — освещают ранний период истории Кунсткамеры, когда в башне здания располагались Астрономическая обсерватория, служба точного времени и условная линия Петербургского меридиана.
Музей Конде
Вернувшись во Францию в 1871 году, герцог, к тому времени член Академии, продолжил пополнение собрания. В 1876 году он приобрёл у герцога Сазерленда коллекцию французских портретов, собранную Александром Ленуаром и хранившуюся до той поры в Стаффорд Хаус в Лондоне. В неё входили произведения Франсуа Клуэ, Корнеля де Лиона, Пьера Миньяра и Филиппа де Шампеня. Три года спустя были приобретены картины из собрания Фредерика Райзена: работы старых итальянских мастеров, а также Пуссена, Жерара и Энгра. Наконец, в 1881 году, герцог приобрёл 311 портретов, приписываемых Франсуа Клуэ, которые первоначально составляли собрание Екатерины Медичи, а позднее принадлежали графу Карлайлу. Позднее герцог сосредоточился на приобретении отдельных произведений: в 1885 году были куплены «Три грации» Рафаэля, в 1890 «Сельский концерт» Коро, в 1891 году 40 миниатюр из «Часослова Этьена Шевалье» Жана Фуке в 1891 году, а в 1892 году «Агасфер выбирает Эсфирь» Филиппино Липпи.