Эукариоты
Важнейшая, основополагающая особенность эукариот связана с расположением генетического аппарата в клетке. Генетический аппарат всех эукариот находится в ядре и защищён ядерной оболочкой. ДНК эукариот линейная (у прокариот ДНК кольцевая и находится в особой области клетки — нуклеоиде, который не отделён мембраной от остальной цитоплазмы). Она связана с белками-гистонами и другими белками хромосом, которых нет у бактерий.
Строение бактериальной клетки
Нуклеоид — зона неправильной формы в цитоплазме прокариотической (в том числе бактериальной) клетки, в которой находится геномная ДНК и ассоциированные с ней белки. На долю ДНК приходится около 60 % массы нуклеоида; помимо ДНК, нуклеоид содержит РНК и белки. В большинстве случаев геном бактерии представлен , которую также называют хромосомой. Как правило, бактериальная хромосома имеет длину около , она занимает до 20 % цитоплазмы и имеет объём около . Репликация геномной ДНК начинается от участка инициации ("oriC"), из которого две репликативные вилки движутся в противоположных направлениях и встречаются в сайте терминации ("Ter"), в котором далее происходит размыкание сцепленных дочерних хромосом.