Депортация чеченцев и ингушей
В качестве причин депортации официально назывались массовое сотрудничество с оккупантами, антисоветская деятельность и бандитизм. Однако вайнахи физически не могли сотрудничать с оккупантами ввиду отсутствия оккупации. Фашисты смогли захватить лишь незначительную часть Малгобекского района и довольно скоро были выбиты оттуда. Масштабы антисоветской деятельности и бандитизма в республике также не превышали аналогичных показателей в соседних регионах. Официальные данные были сфальсифицированы для оправдания действий власти. Реальные причины депортации не установлены до сих пор. Депортация народов, ликвидация их государственности и изменение границ были незаконными, поскольку не предусматривались никакими законными или подзаконными актами.
Депортация карачаевцев
В январе 1943 года Карачаевская область была освобождена от немецких войск, что привело к возобновлению борьбы с антисоветскими повстанцами. Повстанцы Черекского района КБ АССР и Учкуланского района КАО организовали в январе открытое выступление против советской власти за сохранение установленного немцами «Нового порядка». Проведенными операциями в Черекском и Учкуланском районах повстанческие организации были частично ликвидированы.