Депортация чеченцев и ингушей
В качестве причин депортации официально назывались массовое сотрудничество с оккупантами, антисоветская деятельность и бандитизм. Однако вайнахи физически не могли сотрудничать с оккупантами ввиду отсутствия оккупации. Фашисты смогли захватить лишь незначительную часть Малгобекского района и довольно скоро были выбиты оттуда. Масштабы антисоветской деятельности и бандитизма в республике также не превышали аналогичных показателей в соседних регионах. Официальные данные были сфальсифицированы для оправдания действий власти. Реальные причины депортации не установлены до сих пор. Депортация народов, ликвидация их государственности и изменение границ были незаконными, поскольку не предусматривались никакими законными или подзаконными актами.
Депортация черкесов
По мнению же российского политолога Андрея Епифанцева, депортация была трагедией черкесского народа, но о геноциде говорить не приходится, так как поголовного уничтожения черкесов не было. Он считает, что депортация была естественным для любой имперской экспансии явлением и считалась во время ее совершения нормальным процессом, а ответственность за нее несут черкесская рабовладельческая знать и Османская империя, которые агитировали против принятия предложения имперских властей о переселении на равнинные территории; он также отмечает, что многие эмигрировавшие черкесы впоследствии просили у османских властей разрешения вернуться на Кавказ. Епифанцев, однако, признает, что речь все же идет о депортации и что в результате ее проведения Кавказ лишился 95% проживавших на его территории черкесов. Как полагает американский историк Майкл Эллман, Епифанцев тем самым открывает путь для возможного признания депортации черкесов преступлением против человечности. Епифанцев также отрицает, что резня армян в Османской империи была геноцидом.