Сталинские репрессии
28 августа 1941 года (через 2 месяца после начала Великой Отечественной войны) национальная автономия поволжских немцев была ликвидирована, а они сами депортированы на территорию Казахской ССР. В 1942—1944 годах были также проведены депортации представителей ряда других национальностей. В частности, были депортированы: ингерманландские финны, калмыки, чеченцы, ингуши, карачаевцы, балкарцы, крымские татары, ногайцы, турки-месхетинцы, понтийские греки. Официальной причиной депортации были массовое дезертирство, коллаборационизм и активная антисоветская вооружённая борьба значительной части этих народов.
Депортация карачаевцев
Несмотря на арест в конце 1941 и в начале 1942 года многих активных участников вскрытой повстанческой организации на территории Карачая и Кабардино-Балкарии, оперативно-чекистские мероприятия по окончательной ликвидации повстанческого подполья УНКВД Орджоникидзевского края проводились недостаточно решительно. Байрамуков Кады, Ислам Дудов, Гулиев Ташу и другие группировали вокруг себя «бандитско-дезертирский элемент» и совершали налёты. Только за первую половину 1942 года сотрудниками НКВД в крае «была выявлена 21 банда со 135 участниками». Перед летним наступлением в 1942 году немецких войск на Кавказ, разведка противника начала забрасывать своих агентов в Карачай.