Правительствующий сенат
Первыми сенаторами были назначены девять человек: граф Иван Мусин-Пушкин, боярин Тихон Стрешнев, князь Пётр Голицын, князь Михаил Долгоруков, князь Григорий Племянников, князь Григорий Волконский, генерал-кригсцальмейстер Михаил Самарин, генерал-квартирмейстер Василий Апухтин и Назарий Мельницкий. Обер-секретарём был назначен Анисим Щукин.
Аппарат правительства Российской Федерации
19 октября 1905 года был образован Совет министров Российской империи для общего «управления и объединения действий главных начальников ведомств по предметам как законодательства, так и высшего государственного управления». Орган получил самостоятельный статус и право принятия ключевых решений, тогда как в предыдущем формате он был совещательным органом при Императоре и собирался по его распоряжению. Совет министров стал собираться еженедельно, результаты фиксировались в специальных журналах. Возглавлял Совет уже не император, а один из министров.