Распад СССР
8 мая того же года Верховный Совет ЭССР принял закон о признании недействительным наименования «Эстонская Советская Социалистическая Республика». Также согласно этому закону было прекращено использование герба, флага и гимна Эстонской ССР в качестве государственных символов и восстановлено действие Конституции Эстонской Республики 1938 года (где в статье 1 указано, что Эстония является самостоятельной и независимой республикой), то есть фактически Эстония объявила о выходе из состава Союза ССР. Через 8 дней был принят закон об основах временного порядка управления Эстонией, согласно которому прекращалась подчиненность органов государственной власти, государственного управления, органов суда и прокуратуры республики соответствующим органам власти Союза ССР и они отделялись от соответствующей системы СССР. Было объявлено, что отношение между республикой и Союзом ССР отныне строяться на основе Тартуского мирного договора, заключенного между Эстонской Республикой и РСФСР 2 февраля 1920 года.
Эстонская Советская Социалистическая Республика
20 августа 1991 года решением Верховного Совета Эстонской ССР Эстонская Республика снова подтвердила свою независимость на основе государственной правопреемственности (т. н. «restitutio ad integrum»), то есть существующая в настоящий момент Эстонская Республика de jure считается тем же самым субъектом, что и Эстонская Республика, существовавшая с 1918 по 1940 год. Через две недели, 6 сентября, Государственный Совет СССР официально признал независимость Эстонии.С момента образования ЭССР и до 1945 года в республике сохранялось прежнее административное деление на уезды и волости, сохранившееся ещё с 1918 года.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 23 августа 1944 года город Печоры, Печорская, Слободская, Паниковская и Избарская волости Эстонской ССР, в которых преобладало русское население (всего 2330 квадратных километров), были переданы из Эстонской ССР в состав РСФСР и включены в одновременно образованную Псковскую область. На основании Указа от 24 ноября 1944 г. «О включении в состав Ленинградской области населённых пунктов, расположенных на восточном берегу реки Нарва» в состав Ленинградской области были переданы территории за рекой Нарвой, включая город Ивангород.