Холокост в Литве
С августа по декабрь на территории Литвы было убито от 130 до 140 тысяч евреев. Командир айнзатцкоманды 3 Карл Егер 1 декабря 1941 года составил подробный отчёт о массовых убийствах. Согласно отчёту, подразделением в тесном сотрудничестве с литовскими добровольцами был уничтожен 136 421 еврей (46 403 мужчины, 55 556 женщин и 34 464 ребёнка), а также 1064 коммуниста, 653 психически больных и 134 прочие жертвы.
Музей Рижского гетто
Вторая часть экспозиции посвящена проблематике Холокоста. В символическом плане она выполнена в виде длинного узкого прохода — слева проход обрамляют стенды с информацией и фотографиями, примыкающие к изгороди, которую опоясывает колючая проволока, а справа приводятся в ряд восстановленные в ходе многолетней кропотливой работы имена и фамилии более 70 000 человек, ставших жертвой Холокоста в республике. Значимым компонентом экспозиции является отображение крайне тенденциозной антибольшевистской и антисемитской пропаганды, свирепствовавшей в пронацистски ориентированных бумажных СМИ. Из примеров можно назвать антисемитские карикатуры на Сталина (!), а также коллективная фотография «пирующих» правителей Советской Латвии — микробиолога Августа Кирхенштейна, писателя-романиста Вилиса Лациса, первого секретаря ЦК КПЛ Яна Калнберзина и наркома внутренних дел Латвийской ССР Альфонса Новикса, которая контрастирует с фотографией истерзанных и расстрелянных тел латышей на внутреннем дворе Центральной тюрьмы Матиса. Также в экспозиции представлены изображения «евреев — сотрудников НКВД» (С. Шустина) и «евреев — инструкторов, обучающих латышского крестьянина обращаться с сельскохозяйственной техникой», а также плакаты и листовки, фотографии из гетто, снабжённые провокационными надписями и комментариями (фото из пронацистской газеты «Тевия» («Отчизна») с изображением евреев, спорящих по поводу очереди у магазина в Рижском гетто с провокационным комментарием под ней).