Еврейское агентство
29 ноября 1947 года Организация Объединённых Наций постановила разделить Палестину, и 14 мая 1948 года была провозглашена независимость государства Израиль.
Еврейское агентство с первого дня существования страны перестало взаимодействовать с силовыми ведомствами и сосредоточило всё внимание на приёме и обустройстве эмигрантов, а также на налаживании еврейского и сионистского образования в диаспоре.
В 1949 году Еврейское агентство перевезло в Израиль из лагерей Европы и Кипра 239 тысяч человек, переживших Холокост. В дальнейшем евреи, страдающие от насилия и преследований в арабских странах, были вынуждены оставлять своё имущество, дома и бежать. Агентство помогло 49,000 йеменских евреев репатриироваться в Израиль. В течение нескольких лет сотни тысяч еврейских беженцев из Северной Африки, Турции, Ирака, Ирана при помощи Еврейского агентства стали жителями Израиля. Только за 1948—1952 годы Израиль принял около 700,000 эмигрантов.
Еврейское агентство открывало школы для изучения иврита,предоставляло продовольствие, жилье, помогало осваивать нужные государству профессии. Жилья не хватало, и многие из вновь прибывших были размещены во временных строениях или транзитных лагерях.
В первые годы существования государства Еврейское агентство помогало открывать учреждения, связанные с культурой и экономикой: национальный театр и культурный центр, музеи, организации, занимающиеся сельским хозяйством. Было начато строительство 480 новых городов и поселений по всему Израилю. Агентство приняло активное участие в создании национальной авиакомпании.
В 1952 году Кнессет определил правовой статус Еврейского агентства в Израиле.
Было решено, что Всемирная еврейская организация и Еврейское агентство будут продолжать контролировать задачи, связанные с алией и абсорбцией, а государство возьмет под контроль все другие вопросы: безопасность, образование, занятость.
Еврейское агентство также отвечало за просвещение евреев за пределами Израиля. Израильтян отправляли за рубеж для создания школ диаспоры, лагерей и молодёжных организаций.
Императорское православное палестинское общество
14 мая 1948 года было провозглашено государство Израиль и сразу началась Первая арабо-израильская война. СССР одним из первых установил с Израилем дипломатические отношения. 20 мая был назначен уполномоченный по делам русского имущества на территории Израиля И. Л. Рабинович. Правительство Израиля признало собственностью СССР все здания и земли ППО и РДМ на территории, завоеванной Израилем в ходе войны. В ведении ППО на Святой Земле остались только те строения и земли, которые находились в Старом городе, Восточном Иерусалиме и на Западном берегу реки Иордан, то есть на территориях, присоединённых после арабо-израильской войны (1947—1949) к Иордании. Управляющим подворьями ППО в Иерусалиме до 1951 года остался полковник В. А. Самарский, проживавший на Сергиевском подворье. В том же 1951 году в Иерусалим прибыл уполномоченный представитель Российского палестинского общества М. П. Калугин, сотрудники которого разместились в восточном корпусе Сергиевского подворья в Иерусалиме и пребывали там вплоть до начала Шестидневной войны в 1967 году. На Александровском подворье в старом городе Иерусалима управляющим ППО до 1959 года являлся В. К. Антипов. В 1969 году управляющим Александровского подворья стал генерал Михаил Хрипунов, сохранявший свой пост до 1983 года. 3 ноября 2005 года было учреждено Иерусалимское отделение ИППО. С декабря 2008 года, как и в дореволюционные времена, в Иерусалиме стал действовать уполномоченный представитель ИППО, обязанности которого исполнял Павел Платонов (с 2008 по 2015 год). С 25 декабря 2015 года ИППО на территории Израиля представляет директор Императорского православного палестинского общества в государстве Израиль Игорь Ашурбейли. С февраля 2009 года штаб-квартира Иерусалимского отделения ИППО располагается на Сергиевском подворье в Иерусалиме.