Аминокислоты
Аминокисло́ты ("аминокарбо́новые кисло́ты; АМК") — органические соединения, в молекуле которых одновременно содержатся карбоксильные и аминные группы. Основные химические элементы аминокислот - это углерод (C), водород (H), кислород (O), и азот (N), хотя другие элементы также встречаются в радикале определенных аминокислот. Известны около 500 встречающихся в природе аминокислот (хотя только 20 используются в генетическом коде).
Протеиназа K
Протеиназа К состоит из 384 аминокислот. Для ферментативной активности требует присутствие ионов Ca (1 - 5 mM). Протеиназы K содержит два сайта связывания ионов Ca, которые расположены вблизи активного центра, но не принимают непосредственного участия в каталитической реакции. 
Фермент расщепляет белки преимущественно по гидрофобным аминокислотам (алифатические, ароматические и другие гидрофобные аминокислоты). 
Белки полностью расщепляются при длительной инкубации или при высокой концентрации протеиназы К. 
После удаления ионов кальция стабильность фермента снижается, но протеолитическая активность остается. Удаление ионов Ca снижает каталитическую активность протеиназы К на 80%, но остаточной активности вполне достаточно для расщепления белков . 
Поэтому протеиназу К можно использовать для очистки нуклеиновых кислот в присутствии ЭДТА (ингибирующий магний-зависимых ДНКаз).