Caviidae는 일반적으로 히스트리코모르파 그라우어, 하이드, 리 데르키아 등...에 속합니다. 그러나 초기에는 기니피그와 Caviomorpha를 Rodentia로 분류해야 하는지에 대한 논쟁이 있었습니다. 그레이어, 하이드, 리는 다양한 분류군의 아미노산 서열에 대한 계통 발생학적 분석을 수행했습니다.

Caviidae usually is placed within Hystricomorpha Graur, Hide and Li DErchia et al.. However, in the early s a debate arose over whether or not guinea pigs and Caviomorpha should be classified in Rodentia. Graur, Hide, and Li performed phylogenetic analyses of amino acid sequences of various taxa.