Vita ya wenyewe kwa wenyewe Burundi
Kwa kuongezea, Watutsi wa Rwanda Patriotic Front (RPF) waliishinda serikali ya Wahutu ya Rwanda mnamo Julai 1994, na kumaliza vita vya wenyewe kwa wenyewe Rwanda na mauaji ya kimbari. Vikosi vya kijeshi na vikosi vya serikali ya zamani ya Wahutu wa Rwanda (Ex-FAR / ALiR na Interahamwe) baadaye walitoroka kuvuka mpaka kuingia Zaire. Huko, waliunda tena nguvu zao wakazindua dharau dhidi ya RPF. CNDD-FDD ya Burundi na PALIPEHUTU-FNL, hivi karibuni walijiunga na vikundi vya Wahutu wa Rwanda ambavyo viliwasaidia katika kushambulia jeshi la Burundi. Hali hiyo ilisababisha kupungua kwa mamlaka ya serikali nchini Burundi, hivyo iliishtua sana serikali iliyoongozwa na RPF ya Rwanda. RPF ilihofia kwamba kuanguka kwa serikali ya Burundi kutaongoza sio tu kwa kuongezeka kwa uwezekano wa wakimbizi 500,000 wa Watutsi kuingia nchini Rwanda, lakini pia kutoa nafasi mpya kwa wapiganaji wa Wahutu wa Rwanda. Kwa hiyo, serikali ya Rwanda ilianza kutoa msaada kwa serikali ya Burundi kutoka 1995. Vikosi vya Rwanda vilivuka mpaka mara kwa mara, na kushambulia kambi za wakimbizi za Wahutu ambazo zilifanya vikosi vya waasi kwa kushirikiana na wanamgambo wa kijeshi wa Burundi na wa Watutsi.