Vita ya wenyewe kwa wenyewe Burundi
Vita ya wenyewe kwa wenyewe viliongezeka kwa nguvu. Waasi wa Wahutu walikua madarakani na kuwauwa Watu wapatao 300 katika shambulio kuu mnamo 20 Julai 1996. Kitendo cha kuongezeka kwa waasi wa Wahutu nchini Burundi kilisumbua serikali ya Rwanda, na kushawishi uamuzi wake wa kuzindua vita vya kwanza vya Kongo mwishoni mwa mwaka 1996 ili kumpindua Rais Mobutu wa Zaire. Kwa kufanya hivyo, Rwanda ilitarajia kuimaliza Zaire kama kimbilio la vikundi vingi vya waasi wa Wahutu; CNDD-FDD kwa mfano imeweka misingi mikubwa huko Uvira na Bukavu, mashariki mwa Zaire kutoka ilipoanzisha mashambulizi ndani ya Burundi. Ijapokuwa Rwanda ilimwangamiza Mobutu kwa muda wa miezi kadhaa akabadilishwa na Laurent-Désiré Kabila, waasi wa CNDD-FDD bado walifanikiwa kupanua shughuli zao mnamo 1997. Kuingiza Mkoa wa Bururi na Mkoa wa Makamba, kusini mwa Burundi, hata waliishambulia nyumba ya Rutovu, Buyoya mji na kitovu cha wasomi Watutsi wa Burundi wakati huo. Kwa kweli, angalau mambo ya serikali mpya ya Kongo chini ya mtoto wa Laurent-Désiré, Joseph Kabila yalikuja kusaidia waasi wa Burundi ifikapo mapema miaka ya 2000 kama vile Mobutu alivyofanya hapo awali.